馬麗娟,張慧敏,侯振安,閔 偉
(石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院農(nóng)業(yè)資源與環(huán)境系,新疆 石河子832000)
氮肥一般是作物生長(zhǎng)的限制性因素,在鹽漬化土壤中合理施用氮肥可有效降低鹽分對(duì)作物生長(zhǎng)的危害。硝化作用是土壤氮循環(huán)的重要環(huán)節(jié),在氮素形態(tài)轉(zhuǎn)化和氮循環(huán)過程中起著至關(guān)重要的作用,直接影響環(huán)境質(zhì)量和氮肥的利用效率[1]。氨氧化作用和亞硝酸氧化作用是硝化作用的兩個(gè)關(guān)鍵步驟,其中氨氧化作用是硝化作用的限速步驟,主要是在氨氧化古菌(AOA)和氨氧化細(xì)菌(AOB)的參與下完成[2]。隨著分子生物學(xué)的不斷發(fā)展,人們對(duì)于AOA 和AOB 的研究不斷深入。越來(lái)越多的學(xué)者關(guān)注不同環(huán)境條件對(duì)AOA、AOB 豐度[3]和群落結(jié)構(gòu)組成的影響[4],以及AOA和AOB對(duì)硝化作用的相對(duì)貢獻(xiàn)等[5]。
氨氧化微生物的生長(zhǎng)受土壤環(huán)境的影響。其中土壤鹽分是影響氨氧化微生物生長(zhǎng)和群落結(jié)構(gòu)的重要因素。有研究發(fā)現(xiàn)AOB和AOA的豐度與鹽度呈負(fù)相關(guān)[6],鹽分會(huì)抑制AOB 的生長(zhǎng),對(duì)AOA 豐度影響不顯著[7]。但是也有研究發(fā)現(xiàn)高鹽分可以促進(jìn)AOA 和AOB 的生長(zhǎng)[8]。Caffrey 等[9]研究也表明河口沉積物中AOA 豐度隨著鹽分的增加而增加,但鹽分對(duì)AOB 沒有影響。Mosier 等[10]研究發(fā)現(xiàn)AOB 豐度隨著土壤鹽度的增加而增加,在低鹽度條件下AOAamoA的基因豐度高于AOB 基因。此外,有研究發(fā)現(xiàn)在鹽堿地中AOBamoA基因豐度比AOAamoA基因豐度高兩個(gè)數(shù)量級(jí)[11]。以上研究結(jié)果表明鹽分對(duì)氨氧化微生物豐度的影響目前尚無(wú)定論。此外,鹽分在影響AOA 和AOB 豐度的同時(shí)也影響其群落結(jié)構(gòu)的改變。前人研究表明,在不同鹽分環(huán)境中AOA 的群落結(jié)構(gòu)會(huì)發(fā)生改變,AOB 的群落結(jié)構(gòu)多樣性和鹽分梯度無(wú)相關(guān)關(guān)系[12],而濕地土壤中鹽分可顯著改變AOA 和AOB 的群落結(jié)構(gòu)[13]。有研究表明AOB 的多樣性會(huì)隨著鹽分的增加而提高[14],但是Dang等[15]研究發(fā)現(xiàn)鹽分會(huì)降低AOB 的多樣性。鹽分是一個(gè)日益受到關(guān)注的環(huán)境因素,然而鹽分對(duì)土壤氨氧化微生物豐度和群落結(jié)構(gòu)影響的認(rèn)識(shí)仍然存在爭(zhēng)議。
新疆地處我國(guó)的西北部,屬于干旱地區(qū),淡水資源短缺問題尤為嚴(yán)重。但是該地區(qū)咸水資源比較豐富,在淡水資源短缺不斷加劇的背景下,合理利用咸水資源進(jìn)行灌溉已經(jīng)成為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中緩解淡水資源不足的較為經(jīng)濟(jì)、有效的手段。咸水灌溉一方面提供了作物生長(zhǎng)所需要的水分,緩解旱情;另一方面也將鹽分帶入土壤,改變土壤的理化性質(zhì),進(jìn)而影響土壤養(yǎng)分轉(zhuǎn)化和微生物生長(zhǎng)。AOA 和AOB 共同參與土壤硝化作用,然而,關(guān)于長(zhǎng)期咸水灌溉對(duì)AOB和AOA群落結(jié)構(gòu)的影響及其對(duì)土壤硝化作用的貢獻(xiàn)所知甚少。因此,了解土壤氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性對(duì)咸水灌溉引起的土壤鹽分變化的響應(yīng)具有重要意義。本研究在已連續(xù)開展10 年咸水滴灌試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,通過熒光定量PCR 方法測(cè)定AOA 和AOB 的豐度,采用高通量測(cè)序分析AOA和AOB群落結(jié)構(gòu)多樣性。我們假設(shè)經(jīng)過長(zhǎng)期咸水滴灌會(huì)改變AOA和AOB的群落結(jié)構(gòu),降低AOA和AOB豐度并抑制硝化作用。因此,本研究的目的是比較不同灌溉水鹽度對(duì)氨氧化微生物豐度和群落結(jié)構(gòu)的影響,評(píng)價(jià)AOA 和AOB 對(duì)于硝化作用的貢獻(xiàn),并探討分析土壤理化性質(zhì)與氨氧化微生物豐度和群落結(jié)構(gòu)間的關(guān)系。
試驗(yàn)區(qū)位于石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院試驗(yàn)站(44°18′N,86°02′E)內(nèi),平均海拔450.8 m。試驗(yàn)區(qū)屬于典型溫帶干旱大陸性氣候,多年平均氣溫為6.5~7.2 ℃,無(wú)霜期為168~171 d,年日照時(shí)數(shù)為2721~2818 h,年蒸發(fā)量1660 mm,年平均降水量為210 mm。試驗(yàn)區(qū)土壤類型為石灰性沖積土。0~30 cm 土層基礎(chǔ)理化性質(zhì)(2009年試驗(yàn)開始前)如下:電導(dǎo)率(EC)為0.13 dS·m-1,pH 值7.9,速效磷25.9 mg·kg-1,速效鉀253 mg·kg-1,全氮1.1 g·kg-1,有機(jī)質(zhì)16.8 g·kg-1。供試作物為棉花(Gossypium hirsutumL. cv Xinluzao No. 52),通常在4月中旬種植,9月中旬收獲。
試驗(yàn)區(qū)在2009—2017 年已經(jīng)連續(xù)開展9 年的不同鹽度灌溉水滴灌田間試驗(yàn)。依據(jù)灌溉水鹽度設(shè)置了3 個(gè)處理,每個(gè)處理3 次重復(fù),共9 個(gè)小區(qū),每個(gè)試驗(yàn)小區(qū)面積25 m2,采用完全隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)。3個(gè)處理的灌溉水鹽度分別為0.35、4.61、8.04 dS·m-1(分別用FW、BW 和SW 表示),試驗(yàn)中FW 取自當(dāng)?shù)厣顚拥叵滤?,BW 和SW 處理灌溉水鹽分是通過在淡水中加入等量的NaCl 和CaCl2(質(zhì)量比1∶1)配制而成。氮肥(尿素N≥46.4%)施用量為N360 kg·hm-2,此氮肥用量為當(dāng)?shù)孛藁ù筇锷a(chǎn)推薦用量。2018 年試驗(yàn)開始前3種灌溉水鹽度處理土壤基本理化性見表1。
棉花種植采用覆膜栽培,一膜兩管4 行,行距配置為(30+60+30)cm,播種密度22.2 萬(wàn)株·hm-2。2018年棉花于4 月20 日播種,為保證出苗,播種后滴淡水45 mm。棉花生長(zhǎng)期間灌水9次,6月中旬開始至8月下旬結(jié)束,灌溉周期為7~10 d,每次灌水45~60 mm,總灌溉量450 mm,磷肥(重過磷酸鈣,P2O5≥44.0%)施用量為P2O5105 kg·hm-2,鉀肥(硫酸鉀,K2O≥51.0%)施用量K2O 60 kg·hm-2,全部作基肥在播種前一次性施入。試驗(yàn)中氮肥全部作追肥,2018 年氮肥分別在6月27 日(第二水)、7 月4 日(第三水)、7 月12 日(第四水)、7 月19 日(第五水)和7 月25 日(第六水)通過滴灌系統(tǒng)分五次隨水施用。其他栽培管理措施參照當(dāng)?shù)卮筇锷a(chǎn)。
2018 年(試驗(yàn)第10 年)在棉花蕾鈴期,最后一次施肥結(jié)束后第3 d(7 月28 日)用直徑2.5 cm 土鉆在每個(gè)小區(qū)的棉花行內(nèi),按S 型線路隨機(jī)采集3 個(gè)耕層土壤樣品,采集深度為0~20 cm。每個(gè)小區(qū)3個(gè)重復(fù),土樣混合均勻并去除其中的雜物、細(xì)根。將一部分土樣過2 mm 篩后分成兩部分,一部分用于測(cè)定土壤理化性質(zhì)和土壤潛在硝化勢(shì),一部分用于氨氧化微生物豐度和多樣性的檢測(cè)。用于提取DNA 的土壤樣品保存于-80 ℃條件下。
1.3.1 土壤理化性質(zhì)和潛在硝化勢(shì)測(cè)定
土壤含水量采用烘干法測(cè)定;土壤鹽度和pH 值采用MP521 Lab pH/ Conductivity Meter 型電導(dǎo)率儀測(cè)定,測(cè)定鹽度水土比為5∶1[16],測(cè)定pH 值水土比為2.5∶1[17];土壤NO-3-N 和NH+4-N 使用2 mol·L-1KCl 浸提后使用流動(dòng)分析儀測(cè)定(Smart Chem140,Analytik Jena AG)[18];土壤有機(jī)碳(SOC)使用K2Cr2O7-H2SO4外加熱法測(cè)定[16];土壤全氮(TN)使用半微量凱氏定氮法測(cè)定[16]。
表1 2018年試驗(yàn)開始前3種灌溉水鹽度處理土壤理化性質(zhì)Table 1 Physicochemical properties of the soils under three water salinity treatments prior to the beginning of the experiment in 2018
土壤潛在硝化勢(shì)測(cè)定采用Kurola 等[19]測(cè)定方法,準(zhǔn)確稱取5 g 新鮮土壤樣品于50 mL 離心管中振蕩培養(yǎng)24 h后,使用2 mol·L-1KCl浸提并通過比色法測(cè)定土壤浸提液中的濃度,潛在硝化勢(shì)(PNR)以μg()·g-1·h-(1干土)表征。
土壤潛在硝化勢(shì)計(jì)算公式如下:
式中:c為從標(biāo)曲上查得的顯色液濃度,mg·mL-1;V為顯色液的體積,mL;ts為分取倍數(shù),m為烘干樣品質(zhì)量;24為24 h。
1.3.2 DNA提取
稱取新鮮土壤樣品0.3 g,使用Power SoilTMDNA Isolation Kit(Mo Blo Laboratories,Inc,USA)試劑盒,按照操作說(shuō)明書提取DNA 樣品,并將提取的土壤總DNA在-80 ℃下保存。
1.3.3qPCR測(cè)定
使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR 儀檢測(cè)目標(biāo)基因豐度,qPCR 的 反 應(yīng) 體 系 為20 μL,其 中 包 括10 μL 2×SYBR?GreenqPCR Master Mix(Applied Biosystems,F(xiàn)oster City,CA,USA),前后引物各1 μL,2 μL DNA 模板(約2 ng·μL-1)和6 μL ddH2O。AOAamoA基因擴(kuò)增 引 物 是Arch-amoAF(5′ - STAATGGTCTGGCTTAGACG-3′)和Arch-amoAR(5′ -GCGGCCATCCATC TGTATGT-3′)[20]。AOBamoA基因擴(kuò)增引物是amoA-1F(5-GGGG TTTCTACTGGTGGT)和amoA-2R(5′-CCCCTCKGSAAAGCCTTCTTC-3′)[21]。PCR 反應(yīng)體系如下:95 ℃5 min,接著40 個(gè)循環(huán),95 ℃10 s,55 ℃20 s,72 ℃30 s。
1.3.4 高通量測(cè)序
采用高通量測(cè)序技術(shù)測(cè)定AOA和AOB群落結(jié)構(gòu)組成。PCR擴(kuò)增引物與qPCR相同。PCR擴(kuò)增體系為25 μL,其中包括2 μL DNA 模板,前后引物各1 μL,5 μL 5×PCR buffer,2 μL(2.5 mmol·L-1)dNTP,5 μL 5×Q5High GC Enhancer buffer,0.25 μL(0.02U·μL-1)Q5 High - Fidelity DNA polymerase(NEB)和8.75 μL ddH2O。反應(yīng)體系如下:98 ℃5 min,接著35 個(gè)循環(huán),98 ℃30 s,55 ℃30 s,72 ℃45 s,最后72 ℃5 min。PCR 產(chǎn) 物 使 用Agencourt AMPure Beads(Beckman Coulter,Indianapolis,IN)純化,并用PicoGreen dsDNA Assay kits(Invitrogen,Carlsbad,CA,USA)質(zhì)量化,各樣品等量混合后,在上海派森諾生物科技股份有限公司(上海,中國(guó))使用Illumina MiSeq 平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序,每個(gè)處理重復(fù)3次。
使用SPSS 軟件(Version SPSS 21.0)進(jìn)行數(shù)據(jù)方差分析和相關(guān)性分析,顯著水平為0.05;各處理間差異比較采用LSD 法(P<0.05);高通量測(cè)序結(jié)果使用UCHIME 軟件(Version 4.2),鑒定并去除嵌合體序列,得到最終有效數(shù)據(jù)。使用QIIME 軟件(Version 1.8.0)對(duì)序列在97%的相似度水平下進(jìn)行聚類并獲得OTUs數(shù),基于OTUs數(shù)得到不同分類水平上的物種豐度,再利用R 語(yǔ)言(Version 3.2.0)繪制成樣品各分類學(xué)水平下的群落結(jié)構(gòu)圖。使用Mothur(Version 1.30.1)軟件分析樣品α 多樣性指數(shù)(ACE,Chao1,辛普森指數(shù),香農(nóng)指數(shù)),分析時(shí)將樣品所含序列數(shù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化并在97%相似度水平下,對(duì)各樣品α 多樣性指數(shù)值統(tǒng)計(jì)?;贕alaxy 平臺(tái)進(jìn)行LEfSe 分析[Line discriminant analysis(LDA)Effect Size],LDA 值>4。RDA 分析(Redundancy analysis)使用R 語(yǔ)言Vegan 包進(jìn)行分析和作圖。
灌溉水鹽度顯著影響土壤理化性質(zhì)(表2)。與FW處理相比,BW 和SW 處理土壤鹽分、含水量和含量顯著增加,而pH 值、SOC、TN含量顯著降低(P<0.05,下同)。BW 和SW 處理含量較FW 處理降低13.5%和30.8%。相反,BW 和SW 處理含量較FW處理增加10.4%和15.2%。
表2 不同灌溉水鹽度處理土壤理化性質(zhì)Table 2 Soil physicochemical properties as affected by different irrigation water salinity treatments
BW 和SW 處理顯著降低土壤潛在硝化勢(shì)(PNR)見圖1,F(xiàn)W 處理PNR 分別較BW 和SW 處理高18.1%和37.3%。
圖1 不同灌溉水鹽度處理土壤潛在硝化勢(shì)Figure 1 Soil potential nitrification rate as affected by different irrigation water salinity treatments
BW 和SW 處理顯著降低土壤AOA 和AOB 豐度(表3)。不同處理土壤AOAamoA基因豐度在2.18×106~3.57×106copies·g-1(干土),AOBamoA基因豐度在1.94×105~3.15×105copies·g-1(干土)。與FW 處理相比,BW 和SW 處理AOA 和AOB 豐度分別較FW 處理 降 低28.4%、39.0% 和23.3%、38.4%。BW 處 理AOA/AOB顯著低于FW和SW處理,而SW和FW處理之間無(wú)顯著差異。
AOA 和AOB 對(duì)PNR 的相對(duì)貢獻(xiàn)如圖2 所示。AOA豐度與PNR呈極顯著正相關(guān)關(guān)系(R2=0.922 8,P<0.001)。相似地,AOB豐度也與PNR呈極顯著正相關(guān)關(guān)系(R2=0.948 9,P<0.001)。說(shuō)明PNR 的變化與AOA和AOB豐度存在高度的相關(guān)性。
各處理AOA 和AOB 的amoA基因的測(cè)序數(shù)在79 812~80 076(表4),覆蓋度在0.997 1~0.999 7。在97%的相似度水平下,AOA 和AOB 序列分別可劃分為661~664 和130~140 OTUs。BW 和SW 處理顯著降低AOB 群落OTUs,但對(duì)AOA 無(wú)影響。ACE 和Chao1指數(shù)通常用來(lái)衡量群落中含OTU 數(shù)目的指數(shù),ACE和Chao1 指數(shù)越大,表明群落的豐富度越高。辛普森和香農(nóng)指數(shù)用于衡量物種多樣性,受樣品群落中物種豐度和物種均勻度的影響,一般香農(nóng)指數(shù)值越大,辛普森指數(shù)值越小,說(shuō)明樣品的物種多樣性越高。灌溉水鹽度對(duì)豐富度指數(shù)(ACE 和Chao1)無(wú)顯著影響。與FW 處理相比,BW 和SW 處理顯著增加AOA 香農(nóng)指數(shù),且辛普森指數(shù)顯著降低。SW 處理顯著降低AOB 香農(nóng)指數(shù),且顯著增加辛普森指數(shù)。BW 處理對(duì)AOB多樣性指數(shù)無(wú)顯著影響。
表3 不同灌溉水鹽度處理AOA和AOB豐度Table 3 Abundance of AOA and AOB as affected by different irrigation water salinity treatments
圖2 AOA(a)和AOB(a)豐度與土壤潛在硝化勢(shì)的相關(guān)性Figure 2 Correlations between AOA(a)and AOB(b)abundance and potential nitrification rate of soil
土壤理化性質(zhì)與AOA、AOB 的豐度,多樣性指數(shù),土壤潛在硝化勢(shì)之間相關(guān)關(guān)系見表5。土壤潛在硝化勢(shì),AOA、AOB 豐度,AOA 群落辛普森指數(shù)與pH、、SOC、TN呈顯著正相關(guān),但是和EC、SWC、呈顯著負(fù)相關(guān)。AOA的香農(nóng)指數(shù)與EC、SWC、呈顯著正相關(guān),而與pH、SOC、TN 呈顯著負(fù)相關(guān)。AOB的辛普森指數(shù)與EC、SWC、呈顯著正相關(guān),而與、SOC、TN 呈顯著負(fù)相關(guān)。AOB 的香農(nóng)指數(shù)與、SOC、TN 呈顯著正相關(guān),而僅與EC呈顯著負(fù)相關(guān)。
表4 不同灌溉水鹽度處理AOA和AOB α多樣性Table 4 α diversity properties of AOA and AOB as affected by different irrigation water salinity treatments
表5 土壤理化性質(zhì)與潛在硝化勢(shì),AOA、AOB豐度,多樣性指數(shù)間相關(guān)性分析Table 5 Correlations among soil physicochemical properties,potential nitrification rates,AOA and AOB abundance and diversity under different water salinity treatments
高通量測(cè)序結(jié)果顯示,綱水平上,AOA 群落由CandidatusNitrosocaldus、CandidatusNitrososphaera、Betaproteobacteria、Marine archaeal group 1、Unknown組成(圖3a)。除Unknown,CandidatusNitrosocaldus(0.6%~1%)相對(duì)豐度較高。CandidatusNitrosocaldus屬于自養(yǎng)和需氧氨氧化古菌,常出現(xiàn)在中性或微堿性陸地地?zé)岘h(huán)境中。不同灌溉水鹽度對(duì)AOA 群落影響不一致,例如,Betaproteobacteria 和Marine archaeal group 1對(duì)灌溉水鹽度較為敏感,BW 和SW 處理中Betaproteobacteria 相對(duì)豐度顯著低于FW 處理,而Marine archaeal group 1 顯著高于FW 處理;SW 處理CandidatusNitrosocaldus顯著高于FW和BW處理。
AOB 屬水平上群落主要由Nitrosospira、Nitrosomonas、Nitrosovibrio和Unknown 組成(圖3b),Nitrosospira(52.9%~59.4%)相對(duì)豐度較高。Nitrosospira屬于氨氧化細(xì)菌中的一類,參與氨氧化過程對(duì)亞硝酸鹽的親和力較高,可高效利用底物。Nitrosomonas隨著灌溉水鹽度的增加相對(duì)豐度顯著降低,SW 處理中沒有檢測(cè)到Nitrosomonas的存在。BW 處理中Nitrosospira相對(duì)豐度顯著低于FW和SW處理。
使用LEfSe(LDA>4.0,P<0.05)進(jìn)行不同處理間群落比較分析,得到不同灌溉水鹽度條件下氨氧化微生物群落顯著差異種群(圖4)。AOA僅有1個(gè)差異物種(圖4a),出現(xiàn)在SW 處理,說(shuō)明AOA種群相對(duì)穩(wěn)定,高鹽度灌溉水刺激CandidatusNitrosocaldus 生長(zhǎng),AOB 共有5 個(gè)顯著差異物種(圖4b),5 個(gè)差異種群均來(lái)自BW 處理,說(shuō)明中等鹽度灌溉水可刺激Bacteria,Proteobacteria、Nitrosomonadaceae、Betaproteobacteria、Nitrosomonadales的生長(zhǎng)。
利用RDA 分析AOA 和AOB 群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)的關(guān)系,AOA 群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)間的關(guān)系見圖5a,軸1 的解釋度為54.8%,軸2 的解釋度為26.9%。AOA 群落結(jié)構(gòu)與(解釋度59.1%,P=0.002)、pH 值(解釋度23.2%,P=0.032)、土壤鹽分(解釋度10.4%,P=0.042)存在顯著相關(guān)關(guān)系。對(duì)于AOB,軸1 解釋度為57.5%,軸2 解釋度為31.2%(圖5b)。AOB 群落結(jié)構(gòu)僅與(解釋度33.3%,P=0.04)、pH 值(解釋度47.7%,P=0.012)呈顯著相關(guān)關(guān)系,與其他土壤理化性質(zhì)無(wú)顯著相關(guān)關(guān)系。
圖3 不同灌溉水鹽度處理氨氧化微生物群落結(jié)構(gòu)Figure 3 Community structure of AOA and AOB as affected by different irrigation water salinity treatments
圖4 不同灌溉水鹽度處理AOA(a)和AOB(b)群落LEfSe分析Figure 4 LEfSe analysis of AOA(a)and AOB(b)communities under different irrigation water salinity treatments
淡水資源短缺是限制農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的重要因素,合理利用咸水灌溉已成為緩解干旱區(qū)淡水資源不足的重要手段。然而,長(zhǎng)期咸水灌溉會(huì)導(dǎo)致鹽分在土壤中的積累,影響土壤理化性質(zhì)和養(yǎng)分的循環(huán)轉(zhuǎn)化,特別是氮素轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵過程[22]。本研究結(jié)果表明微咸水、咸水灌溉使土壤鹽分、含水量、含量顯著增加,而pH 值、有機(jī)質(zhì)、含量顯著降低。土壤含水量增加是因?yàn)辂}水灌溉土壤蒸散率降低[23]。pH值降低可能是因?yàn)橥寥乐新入x子的積累,導(dǎo)致土壤pH 值下降[24]。有機(jī)質(zhì)的降低是因?yàn)辂}漬土壤中植物生物量減少導(dǎo)致有機(jī)物輸入量下降[25]。另外,微咸水、咸水處理,土壤含量增加,而含量呈現(xiàn)相反的趨勢(shì),可能是土壤鹽度的增加抑制了土壤的硝化作用[26]。
土壤潛在硝化勢(shì)可直接反映土壤硝化活性。本研究結(jié)果表明長(zhǎng)期微咸水和咸水灌溉顯著抑制土壤潛在硝化勢(shì)。這與He 等[27]研究相似,其研究結(jié)果顯示土壤潛在硝化勢(shì)隨土壤鹽度的增加而顯著降低。然而,也有研究表明適度鹽分可提高土壤潛在硝化速率,而高鹽度抑制土壤潛在硝化速率[28],這可能是因?yàn)橐恍﹨⑴c硝化作用的微生物具有一定的耐鹽性,在一定鹽度范圍內(nèi)可促進(jìn)硝化作用微生物的生長(zhǎng),提高硝化速率[29]。
AOA 和AOB 是參與硝化作用的關(guān)鍵微生物,鹽分是影響其生長(zhǎng)的重要因素[30],本研究發(fā)現(xiàn)隨著灌溉水鹽度的增加,AOA 和AOB 豐度均顯著降低。Jin等[31]研究也發(fā)現(xiàn),較高的鹽分會(huì)抑制AOB生長(zhǎng)。然而也有研究發(fā)現(xiàn)鹽分對(duì)AOA 豐度無(wú)顯著影響[32],或者中等鹽度可以刺激AOA 生長(zhǎng)[33]。前人研究表明新疆堿性土壤中AOB 豐度高于AOA,是主導(dǎo)微生物類型[34]。但本研究表明AOA 豐度高于AOB,可能是微咸水和咸水灌溉后土壤鹽分成為影響AOA、AOB 生長(zhǎng)和活性的主導(dǎo)因素。Bernhard 等[35]也得到相似的研究結(jié)果。但也有研究發(fā)現(xiàn)河口區(qū)AOB 豐度高于AOA[36],甚至鹽分越高AOB 豐度高于AOA 的幅度越大[37]。這些矛盾的結(jié)果可能是AOA 和AOB 屬于兩類微生物群體,不同環(huán)境條件下,AOA 和AOB 對(duì)于鹽分的響應(yīng)是不同的。另外自然環(huán)境復(fù)雜多變,可能是多種因素綜合作用下共同影響AOA和AOB活性[38]。
圖5 AOA(a)和AOB(b)群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)間RDA分析Figure 5 Redundancy analysis(RDA)of correlations between soil physicochemical properties and the community structure of AOA(a)and AOB(b)
咸水、微咸水灌溉改變了AOA 和AOB 的群落結(jié)構(gòu)。本研究表明AOA 群落多樣性高于AOB,在含有鹽分的河口區(qū)和海岸區(qū)環(huán)境中也出現(xiàn)相似的結(jié)果[27,39]。不同灌溉水鹽度對(duì)AOA 和AOB 群落多樣性的影響是不一致的。對(duì)于AOA 來(lái)說(shuō),隨著灌溉水鹽度的增加,群落辛普森指數(shù)顯著降低,而香農(nóng)指數(shù)顯著增加。而對(duì)于AOB 來(lái)說(shuō),咸水灌溉顯著增加AOB群落辛普森指數(shù),而降低香農(nóng)指數(shù)。說(shuō)明,在該環(huán)境條件下AOA 群落結(jié)構(gòu)對(duì)于鹽分的變化更為敏感。Gao 等[40]研究也表明鹽分越高AOA 多樣性越高,而AOB 群落多樣性在中等鹽度時(shí)最高,在高鹽度時(shí)最低。也有研究發(fā)現(xiàn)在紅樹林沉積物中鹽分與AOB 群落香農(nóng)指數(shù)呈正相關(guān)關(guān)系,與辛普森指數(shù)呈負(fù)相關(guān)關(guān)系,而AOA 群落多樣性對(duì)鹽分變化不敏感[41]。說(shuō)明不同土壤環(huán)境下鹽分對(duì)AOA和AOB的群落結(jié)構(gòu)影響存在差異。
雖然灌溉水鹽度對(duì)AOA 群落OTUs 無(wú)顯著影響,但是AOA 群落對(duì)于不同灌溉水鹽度的響應(yīng)是不同的。通常AOA 的耐受性較強(qiáng),對(duì)環(huán)境的改變不敏感[42]。本研究結(jié)果表明在綱水平上,除Unknown 外,CandidatusNitrosocaldus 是主要微生物種群,咸水灌溉顯著增加CandidatusNitrosocaldus 相對(duì)豐度,說(shuō)明其對(duì)鹽分具有較強(qiáng)的耐受性。另外也有可能是CandidatusNitrosocaldus 一些物種可將尿素直接作為生長(zhǎng)的能量來(lái)源[43],因此獲得能量來(lái)源的途徑較多,利于其完成整個(gè)硝化作用。本研究中隨著灌溉水鹽度的增加Marine archaeal group 1 相對(duì)豐度顯著增加,說(shuō)明鹽分激發(fā)了AOA 耐鹽種群的生長(zhǎng)。原因可能是Marine archaeal group 1 主要在海洋環(huán)境中出現(xiàn),對(duì)于鹽分具有較好的適應(yīng)性[44]。在AOB 屬水平上,Nitrosospira是優(yōu)勢(shì)微生物種群,且咸水灌溉Nitrosospira相對(duì)豐度高于微咸水灌溉。另外,Nitrosomonas相對(duì)豐度隨著灌溉水鹽度的增加而顯著降低,SW 處理中沒有檢測(cè)到Nitrosomonas的存在。這與前人研究一致,即Nitrosospira在高鹽環(huán)境富集,而Nitrosomonas在低鹽或者中鹽環(huán)境中富集[45]。
LEfSe分析結(jié)果表明AOA 群落結(jié)構(gòu)較為穩(wěn)定,只有咸水灌溉時(shí)刺激了CandidatusNitrosocaldus 生長(zhǎng)。而AOB 群落對(duì)于鹽分的響應(yīng)較為敏感,微咸水灌溉出現(xiàn)5 個(gè)顯著高于其他處理的差異物種,這再一次印證了我們推測(cè)的微咸水灌溉條件下AOB 較為活躍,是參與硝化作用的主導(dǎo)微生物種群,而咸水灌溉條件下AOA可能是主導(dǎo)微生物種群。
咸水灌溉抑制氨氧化微生物的生長(zhǎng),改變其群落結(jié)構(gòu),然而土壤的環(huán)境條件復(fù)雜,AOA 和AOB 對(duì)潛在硝化作用的貢獻(xiàn)高度依賴于土壤初始環(huán)境[46],經(jīng)過10年咸水灌溉,土壤理化性質(zhì)發(fā)生顯著改變,環(huán)境因素的改變也影響著氨氧化微生物群落的變化。RDA 結(jié)果表明,除鹽分以外解釋AOA 群落結(jié)構(gòu)總變異量的59.1%(P=0.002),解釋AOB 群落總變異的33.3%(P=0.04),說(shuō)明咸水、微咸水灌溉條件下是影響AOA和AOB群落結(jié)構(gòu)的主要因素之一。但是也有研究表明,土壤僅與AOB 群落變化存在顯著相關(guān)關(guān)系[47]。這可能是由于土壤養(yǎng)分條件不同,長(zhǎng)期咸水灌溉土壤氮素水平顯著低于淡水灌溉,AOA一般在較苛刻的環(huán)境(低氮、強(qiáng)酸性和高溫)中生長(zhǎng)更為活躍,表達(dá)功能活性更強(qiáng)[48]。此外,土壤pH 是影響AOA 和AOB 群落變化的主要因素,pH 對(duì)AOB 群落(解釋度47.7%,P=0.012)的影響要大于AOA(解釋度23.2%,P=0.032)。這可能是因?yàn)锳OA 細(xì)胞具滲透膜,可維持細(xì)胞內(nèi)pH 接近中性[49],而本研究中pH 變化范圍較小,AOB 群落對(duì)于pH 變化響應(yīng)比AOA 更敏感。然而,有學(xué)者研究表明一般堿性土壤中硝化作用主導(dǎo)微生物類型是AOB,而與AOA 關(guān)系不大[50]。不一致的結(jié)果說(shuō)明鹽分是影響農(nóng)田土壤氨氧化微生物生態(tài)位變化的主導(dǎo)因素。然而本試驗(yàn)還不能具體分析出AOA 和AOB 分別對(duì)硝化作用的貢獻(xiàn)率,這仍然需要后續(xù)進(jìn)行深入研究。