郭麗麗,戶雪敏,張升恒,李 穎,伏松平,范三紅,胡小平
(1.西北農(nóng)林科技大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,陜西楊凌 712100;2.農(nóng)業(yè)部西北黃土高原作物有害生物綜合治理重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 陜西楊凌 712100;3.天水市植物保護(hù)檢疫站,甘肅天水 741020;4.西北農(nóng)林科技大學(xué)生命學(xué)院,陜西楊凌 712100)
小麥條銹病是由條形柄銹菌(Pucciniastriiformisf. sp.tritici)引起的重要世界流行性病害,主要由氣傳性病原菌夏孢子隨氣流進(jìn)行傳播[1],其發(fā)生范圍廣,為害嚴(yán)重,大流行年份可造成小麥絕收[2]。對(duì)于氣傳性病害,監(jiān)測(cè)空氣中的病原菌孢子動(dòng)態(tài)對(duì)病害的及時(shí)防控至關(guān)重要。胡同樂(lè)等[3]通過(guò)對(duì)生長(zhǎng)季蘋(píng)果園空氣中蘋(píng)果斑點(diǎn)落葉病菌分生孢子捕捉發(fā)現(xiàn),6-7月份為整個(gè)生長(zhǎng)季中孢子飛散的高峰期。傅俊范等[4]對(duì)稻曲病病菌分生孢子監(jiān)測(cè)始見(jiàn)于7月下旬,飛散期為7-9月。利用孢子捕捉儀捕捉空氣中病原菌孢子的方法也在黃瓜霜霉病、番茄灰霉病及小麥白粉病等禾本科作物及蔬果病害研究中得到廣泛應(yīng)用[5-7]。對(duì)小麥條銹病的流行預(yù)測(cè),谷醫(yī)林等[8]只在2013-2015年3-6月運(yùn)用孢子捕捉儀對(duì)甘谷縣小麥條銹菌進(jìn)行監(jiān)測(cè),發(fā)現(xiàn)空氣中夏孢子的峰值出現(xiàn)在5-6月,但未對(duì)整個(gè)周年的夏孢子變化情況進(jìn)行研究。同時(shí),任何病原菌的發(fā)生程度及流行范圍都需要適宜的環(huán)境條件。宋晶晶等[9]發(fā)現(xiàn),空氣中小麥白粉菌的孢子量與溫度、相對(duì)濕度呈負(fù)相關(guān),與降雨量呈正相關(guān)。谷醫(yī)林等[8]發(fā)現(xiàn),小麥條銹菌夏孢子密度與溫度呈正相關(guān),而與相對(duì)濕度呈負(fù)相關(guān)。
隴南小麥條銹病流行區(qū),包括天水地區(qū)渭河流域、嘉陵江上游徽成盆地與四川接壤的白龍江流域,是中國(guó)小麥條銹菌的主要越夏地之一,能夠向我國(guó)東部麥區(qū)傳播菌源,具有至關(guān)重要的戰(zhàn)略地位[1]。因此,本研究通過(guò)監(jiān)測(cè)隴南小麥條銹菌夏孢子周年動(dòng)態(tài),并結(jié)合田間溫度、相對(duì)濕度及降雨分析影響該地區(qū)2018年3月-2019年3月的夏孢子循環(huán)規(guī)律的關(guān)鍵因子,以期為當(dāng)?shù)匦←溕a(chǎn)制定有效的防治策略,減少隴南夏孢子向東部大部分麥區(qū)的傳播。
2018年3月-2019年3月,在甘肅省天水市秦州區(qū)監(jiān)測(cè)點(diǎn)(34.2° N,105.4° E,海拔1 710 m)放置Burkard孢子捕捉儀(英國(guó)Burkard Manufacturing有限公司),通過(guò)進(jìn)氣口抽取空氣樣本,自動(dòng)將樣本儲(chǔ)存至1.5 mL離心管中(進(jìn)氣量為16.5 L·min-1),每周更換一次離心管。樣本于-80 ℃中保存,待提取DNA。
1.2.1 模擬樣本及DNA的提取
1.2.2 TaqMan RT-qPCR供試引物及體系優(yōu)化
根據(jù)小麥條銹菌延伸因子EF1的擴(kuò)增長(zhǎng)度來(lái)設(shè)計(jì)引物和特異性探針(表1)。以小麥條銹菌和常見(jiàn)病原菌葉銹菌、稈銹菌、赤霉菌和白粉菌的DNA為模板,按下述條件進(jìn)行TaqMan RT-qPCR(TaqMan Real-Time quantitative Polymerase Chain Reaction),驗(yàn)證引物的特異性。TaqMan RT-qPCR體系為:Taqman Environment Master Mix 2.0 (美國(guó)Life techonologies有限責(zé)任公司) 10 μL,探針和引物(上海英俊生物技術(shù)有限公司)各0.5 μL(250 nM),DNA模板5.9 μL,補(bǔ)ddH2O至20 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性10 min;95 ℃變性15 s,60 ℃退火1 min,共40個(gè)循環(huán)。在Light Cycler 480實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(瑞士羅氏診斷有限公司)上進(jìn)行。
1.2.3 TaqMan RT-qPCR重復(fù)性評(píng)價(jià)及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
分別取上述5×105~5×100個(gè)· μL-1梯度模擬樣本的DNA模板,同時(shí)以Nuclease free water為陰性對(duì)照,按上述反應(yīng)體系和程序進(jìn)行TaqMan RT-qPCR。每個(gè)稀釋度重復(fù)3次,計(jì)算變異系數(shù),評(píng)價(jià)重復(fù)性。根據(jù)5×105~5×100個(gè)· μL-16個(gè)梯度的夏孢子濃度對(duì)數(shù)(x)和對(duì)應(yīng)的Ct(cycle threshold)值(y)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。
表1 TaqMan RT-qPCR設(shè)計(jì)的特異性引物和探針Table 1 Specific primers and probes designed by TaqMan RT-qPCR
計(jì)算全自動(dòng)小型氣象監(jiān)測(cè)儀(西安黃氏生物工程有限公司)記錄的相應(yīng)采樣時(shí)間段的日平均溫度、日平均相對(duì)濕度和累積降雨量。采用Pearson相關(guān)分析法分析氣象因素與田間捕捉的夏孢子濃度相關(guān)性。
試驗(yàn)數(shù)據(jù)采用Excel 2016繪制TaqMan RT-qPCR標(biāo)準(zhǔn)曲線;采用SAS計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)差和變異系數(shù);運(yùn)用SPSS軟件的Pearson分析法進(jìn)行相關(guān)性分析;使用Light Cycler 480實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)系統(tǒng)自帶軟件生成擴(kuò)增曲線。
提取小麥葉銹菌、稈銹菌、赤霉菌、白粉菌及條銹菌的DNA,用TaqMan RT-qPCR方法檢測(cè)引物特異性,結(jié)果顯示,所有反應(yīng)中僅有小麥條銹菌在14~35個(gè)循環(huán)時(shí)檢測(cè)到熒光擴(kuò)增曲線,而葉銹菌、稈銹菌、赤霉菌、白粉菌及水對(duì)照在循環(huán)數(shù)40時(shí)都未檢測(cè)到熒光擴(kuò)增曲線。結(jié)果表明,所建立的條銹菌TaqMan RT-qPCR檢測(cè)方法具有特異性(圖1)。
將濃度為5×105~5×100個(gè)· μL-1的夏孢子模擬樣品在同一條件下進(jìn)行TaqMan RT-qPCR,每個(gè)濃度重復(fù)3次,Ct值的平均值分別為20.40、23.30、26.81、29.21、31.44和34.84;變異系數(shù)依次為0.52%、0.33%、0.11%、0.37%、 0.50%和0.28%,均小于1%(表 2),說(shuō)明該檢測(cè)方法具有良好的重復(fù)性。
運(yùn)用TaqMan RT-qPCR方法對(duì)濃度為5×105~5×100個(gè)· μL-16個(gè)梯度夏孢子模擬樣品進(jìn)行定量,以不同梯度的夏孢子濃度對(duì)數(shù)為橫坐標(biāo),對(duì)應(yīng)的Ct值為縱坐標(biāo)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖 2)。標(biāo)準(zhǔn)曲線方程為y=-2.830 6x+37.572,決定系數(shù)(R2)為0.995 8。Ct平均值范圍為20.40~34.84,最低可檢測(cè)到5個(gè)夏孢子。
從隴南空氣中小麥條銹菌夏孢子的周年動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)中發(fā)現(xiàn),隨著時(shí)間的推移,夏孢子在4月11日、5月16日和6月6日出現(xiàn)了3個(gè)數(shù)量高峰,其中4月11日孢子密度達(dá)到最大值,為145 個(gè)·m-3(圖3)。但在小麥?zhǔn)崭?7月初)后至10月底,空氣中只能檢測(cè)到零星的夏孢子。11月初到翌年2月末,沒(méi)有捕捉到夏孢子。翌年3月,隨著氣溫的回升,在3月6日初次檢測(cè)到少量夏孢子,之后夏孢子數(shù)量呈明顯增加趨勢(shì),3月13日達(dá)45個(gè)·m-3。
圖1 小麥條銹菌特異性引物TaqMan RT-qPCR擴(kuò)增曲線
表2 夏孢子濃度梯度的TaqMan RT-qPCR結(jié)果及重復(fù)性分析Table 2 Repeatability analysis of TaqMan RT-qPCR at different urediniospores concentration
圖2 小麥條銹病夏孢子數(shù)量與Ct值之間的關(guān)系
相關(guān)性分析表明,隴南空氣中冬小麥銹菌夏孢子密度與空氣相對(duì)濕度呈極顯著負(fù)相關(guān) (r=-0.449,P=0.009),且夏孢子的密度高峰值集中在空氣相對(duì)濕度50%~80%范圍內(nèi)(圖4),而夏孢子密度與平均溫度和累積降雨量無(wú)顯著相關(guān)性(r分別為-0.003和0.107,P值分別為0.494和0.298),說(shuō)明相對(duì)濕度對(duì)條銹菌夏孢子的擴(kuò)散影響較大。降雨減少會(huì)降低空氣中的夏孢子數(shù)量,如4月11日前的累積降雨量為23.0 mm,5月16日的累積降雨量為12.6 mm,夏孢子密度從145個(gè)·m-3減少到13個(gè)·m-3;降雨量過(guò)大時(shí),空氣中的夏孢子數(shù)量會(huì)隨雨水沖刷而減少,如6月下旬到7月上旬,出現(xiàn)2次暴雨,捕捉到的夏孢子數(shù)明顯減少。12月至翌年2月,沒(méi)有捕捉到夏孢子(圖4)。
圖3 2018年隴南小麥條銹菌夏孢子動(dòng)態(tài)變化規(guī)律
圖4 氣象因子對(duì)條銹菌夏孢子濃度的影響
隴南地區(qū)是我國(guó)條銹病的“常發(fā)易變區(qū)”,明確隴南地區(qū)條銹菌夏孢子的周年流行動(dòng)態(tài),對(duì)病害的防控有一定的指導(dǎo)作用??茖W(xué)有效的預(yù)測(cè)田間小麥條銹病的流行動(dòng)態(tài),需要以準(zhǔn)確的初始菌源量為前提。已有利用孢子捕捉儀與實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)方法監(jiān)測(cè)病原菌數(shù)量動(dòng)態(tài)變化來(lái)預(yù)測(cè)田間病害發(fā)生情況的報(bào)道,如桃褐腐病、大豆銹病、甜菜霜霉病、菠菜霜霉病、小麥赤霉病等[10-14]。李勇等[15]開(kāi)發(fā)了TaqMan RT-qPCR檢測(cè)小麥條銹病菌的方法,檢測(cè)靈敏度達(dá)10個(gè)夏孢子。本研究應(yīng)用TaqMan RT-qPCR方法建立了小麥條銹菌夏孢子數(shù)量與Ct值之間的關(guān)系,檢測(cè)靈敏度為5個(gè)夏孢子。
隴南地區(qū)有復(fù)雜的自然環(huán)境和生態(tài)條件,且小麥在800~2 400 m高度范圍呈垂直分布,條銹菌在該區(qū)既能越夏、又能越冬,可就地完成周年循環(huán),有利于菌源積累[16]。本研究對(duì)隴南小麥條銹菌夏孢子進(jìn)行周年監(jiān)測(cè),發(fā)現(xiàn)11月至翌年2月未檢測(cè)到條銹菌夏孢子,推測(cè)是因?yàn)樵摰貐^(qū)周?chē)亩←湻N植時(shí)間為9月26日,較往年播期晚10天;天水市植保站工作人員在11月13日調(diào)查15塊田地(約20畝)秋苗發(fā)病情況時(shí),僅有2塊麥田各有1片病葉,發(fā)病程度為近幾年最輕;2018年12月至翌年2月雨雪少,積雪覆蓋時(shí)間短。賈明貴等[17]研究結(jié)果表明,1989年在天水地區(qū)降雪遲,雨雪少(16.5 mm),在高山區(qū)(海拔為1 700 m以上)未發(fā)現(xiàn)有條銹菌越冬。2019年3月6日初次捕捉到夏孢子,3月13日夏孢子數(shù)量明顯增加,推測(cè)夏孢子可能來(lái)源于1 300 m~1 600 m半山區(qū)越冬菌源基地向高山區(qū)擴(kuò)展的夏孢子[16],或隨東風(fēng)或東南風(fēng)自冬麥區(qū)傳向此地[18]。
病害的發(fā)生和流行不僅需要合適的寄主和病原,環(huán)境因素也發(fā)揮著關(guān)鍵性作用[19]。前人研究證明,春季降雨是影響小麥條銹病發(fā)生和流行的重要因素,對(duì)條銹菌夏孢子的擴(kuò)散有潛在的促進(jìn)作用,夏季降雨是限制越夏菌源的重要因素[2]。本研究發(fā)現(xiàn),降雨與孢子密度呈正相關(guān)。谷醫(yī)林[8]證明空氣中孢子密度與相對(duì)濕度呈負(fù)相關(guān),且在濕度處于60%左右的水平時(shí),孢子密度出現(xiàn)最大值。本研究中,2018年天水市秦州區(qū)監(jiān)測(cè)點(diǎn)的夏孢子密度高峰值集中在空氣相對(duì)濕度的50%~80%范圍內(nèi),且與相對(duì)濕度呈極顯著負(fù) 相關(guān)。
綜上所述,本研究基于孢子捕捉儀和TaqMan-qPCR定量方法,明確了隴南條銹菌夏孢子的周年變化規(guī)律,同時(shí)分析了溫度、相對(duì)濕度和降雨對(duì)隴南小麥條銹菌夏孢子動(dòng)態(tài)的影響,為后期構(gòu)建基于條銹菌夏孢子數(shù)量和氣象因子的預(yù)測(cè)模型奠定基礎(chǔ),同時(shí)也為我國(guó)小麥條銹病的早期防治提供理論依據(jù)和參考價(jià)值。