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    生防菌HFW217的鑒定及其對棉花枯萎病的防治效果

    2019-10-23 01:51:40丁建朋范瑛閣姚永生
    新疆農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年3期
    關(guān)鍵詞:生防菌枯萎病相似性

    丁建朋,范瑛閣,姚永生

    (塔里木大學(xué)植物科學(xué)學(xué)院,新疆阿拉爾,843300)

    0 引 言

    【研究意義】2017年新疆棉花種植面積196.3×104hm2,總產(chǎn)量408.2×104t,分別占全國的60.8%和74.4%[1-2]。由于大面積種植以及多年連作,棉花枯萎病發(fā)生日益嚴重,而長期借助多菌靈、百菌清等進行化學(xué)防治,致使病原菌抗藥性不斷提高,防控越來越困難,也對環(huán)境造成了污染[3-5],嚴重制約著新疆棉花的可持續(xù)發(fā)展。篩選對尖孢鐮刀菌具有拮抗作用的微生物,對棉花枯萎病的生物防治具有重要意義[6]?!厩叭搜芯窟M展】生物防治因其對環(huán)境友好、人畜安全性高及作用靶標專一性強等優(yōu)點,是目前生產(chǎn)中較為安全有效的防控措施,利用拮抗微生物進行生物防治符合保護生態(tài)環(huán)境的需求,為農(nóng)業(yè)有害生物綠色防控和可持續(xù)發(fā)展提供技術(shù)保障[7]。具有拮抗作用的微生物在維持土壤微生物群落結(jié)構(gòu)平衡中起著重要作用,已報道對尖孢鐮刀菌有拮抗作用的微生物主要有木霉菌Trichodermaspp.、解淀粉芽孢桿菌B.amyloliquefaciens和枯草芽孢桿菌Bacillussubtilis等[6,8-10],其中木霉菌防治棉花枯萎病取得了良好的防效?!颈狙芯壳腥朦c】應(yīng)用拮抗微生物對防治病害可有效減少農(nóng)藥對環(huán)境的污染,是極具潛力的發(fā)展方向[11-12]。研究分離篩選對棉花枯萎病有抑制作用的微生物,并進行鑒定?!緮M解決的關(guān)鍵問題】研究以一株南疆半沙漠化、半鹽堿化環(huán)境中分離的生防菌HFW217為目標,通過16S rDNA和生理生化方法,對其進行鑒定,并測定其對棉花枯萎病的溫室和田間藥效,可為防控棉花枯萎病的生物農(nóng)藥開發(fā)提供一定的理論基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材 料

    1.1.1 生防菌

    生防菌HFW217,從阿拉爾周邊長勢良好的棉田植株根際土壤中分離而來。

    1.1.2 試劑

    DNA Marker、Goldview I型核酸染料、Ezup柱式細菌基因組DNA抽提試劑盒及2×EsTaqMasterMix分別購自北京康為世紀生物科技有限公司、北京索萊寶科技有限公司和上海生工生物工程有限公司。

    1.1.3 引物

    細菌16S rDNA擴增參考采用通用引物27F/1492R;芽孢桿菌rpoB基因特異性引物按照引物設(shè)計原則以Genbank中6株標準芽孢桿菌rpoB基因組序列為參考,試驗引物序列(由上海生工生物工程有限公司合成)。表1

    表1 鑒定所需PCR引物序列

    Table 1 PCR primers used for species identification

    目標基因Target gene引物Primer核苷酸序列Nucleotide sequence 5’-3’16S rDNA27FAGAGTTTGATCCTGGCTC1492RCGGCTACCTTGTTACGACTTrpoBHr-fAGGTCAACTAGTTCAGTATGGACHr-rAAGAACCATAACCGGCAACTT

    1.1.4 供試棉花

    供試棉花:品種圍為新陸中54號。

    對照藥劑:80%多菌靈WP(石家莊亞潤科技發(fā)展有限公司生產(chǎn)),按照使用說明配制1 500倍液。

    1.1.5 發(fā)酵液與發(fā)酵液的制備

    生防菌發(fā)酵液為LB培養(yǎng)基不加瓊脂,將HFW217在發(fā)酵液中28℃,12/24 h光照培養(yǎng)24 h后,按1∶20的比例再次接種到發(fā)酵液中28℃,180 rpm/min,振蕩培養(yǎng)4 d備用。

    1.2 方 法

    1.2.1 生防菌HFW217的生理生化測定

    生防菌HFW217的生理生化鑒定包括培養(yǎng)性狀、生理和生化測定三個方面,利用掃描電鏡對菌株形態(tài)和大小進行測定,其它指標參考《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》[13]中記載的方法進行。

    1.2.2 生防菌HFW217的16S rDNA分子序列測定

    1.2.2.1 細菌基因組DNA提取

    改良酚氯仿法;從新鮮培養(yǎng)物中刮取足量的菌體于離心管中,加入200 μL 10×TE和20 μL 50 mg/mL溶菌酶溶解,于37 ℃ 180 rpm條件下恒溫搖床震蕩4 h,至酶解徹底。取出后加入20% SDS 50 μL、蛋白酶K(20 mg/mL)5 μL ,60℃條件下水浴2 h,取出后加入1/10體積CTAB/NaCl,并補加5 mol/LNaCl至終濃度0.5 mol/L,混勻后等體積加入氯仿/異戊醇,12 000 r/min離心10 min,取上清置新離心管加1/10體積的3 mol/LNaCl,再加2倍體積的預(yù)冷無水乙醇,于-20℃條件下沉淀DNA過夜,取出后12 000 r/min離心10 min,倒去上清,加入70%冰乙醇洗滌2~3次,干燥后加入100 μL 10×TE重新溶解,置于-20 ℃條件下保存。

    Ezup柱式法:方法采用改進的SDS-CTAB法。基因組DNA提取參照Ezup柱式細菌基因組DNA抽提試劑盒說明書操作進行,對提取后的基因組DNA用10×TE溶解后,置于-20℃條件下保存。

    1.2.2.2 聚合酶鏈式反應(yīng)(PCR)

    向無菌PCR管內(nèi)加入25 μL PCR mastermix,4 μL模板,上下游引物各2 μL,并補足ddH2O,制成50 μL PCR體系。PCR反應(yīng)設(shè)陽性對照PCR管1支,空白(陰性)對照1支,待測樣品2支。

    PCR擴增條件為:94℃預(yù)變性4 min,94℃變性1 min,52℃引物復(fù)性90 s,72℃延伸3 min,共進行35個重復(fù),最后72℃延伸10 min[19]。

    1.2.2.3 PCR結(jié)果的電泳檢測

    用1×TAE配置1%瓊脂糖凝膠,溶后待冷卻至不燙手時(約55℃)加入goldview II 染色劑至終濃度為0.5‰,制膠。將凝固完全的膠放入電泳槽,使電泳液高出凝膠約1 mm,進行點樣,點樣完成后于110 V恒壓電泳35 min,取出后置于凝膠成像系統(tǒng)下進行拍照。

    1.2.2.4 16S rDNA序列分析及系統(tǒng)發(fā)育樹繪制

    對PCR產(chǎn)物進行測序,利用BLAST軟件對測序獲得的16S rDNA序列與Genbank數(shù)據(jù)庫進行比對分析,并在Clustal X(1.8)程序中對相近序列進行多重序列匹配排列(Multiple alignments)分析,用Neighbor-Joining法構(gòu)建基于16S rDNA的系統(tǒng)發(fā)育樹。

    1.2.3 生防菌HFW217溫室和田間防效測定

    溫室試驗在塔里木大學(xué)植保站溫室中進行。選取長勢一致的棉花苗在兩葉一心期接種棉花枯萎病菌,待棉花葉片出現(xiàn)零星病斑時開始噴藥。每隔7 d噴藥一次,共噴藥3次,在第一次噴藥之前和最后一次噴藥后7 d統(tǒng)計病情指數(shù)。調(diào)查分級標準和防治效果,計算方法參照參考文獻[14]。計算結(jié)果用DPS數(shù)據(jù)處理系統(tǒng)分析5%水平的差異顯著性。田間防效試驗設(shè)在塔里木大學(xué)植物保護試驗田,處理及數(shù)據(jù)分析參照溫室試驗。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 生防菌HFW217的生理生化測定

    2.1.1 菌落形態(tài)

    HFW217菌株在LB上的菌落形態(tài)顯示,菌落隆起有皺褶,淡黃色不透明,粘稠有臭味,無水溶性色素,單菌落形態(tài)為近圓形。圖1

    圖1 HFW217在LB培養(yǎng)基上的培養(yǎng)形狀

    Fig.1 Culture shape of HFW217 on LB medium

    圖2 HFW217掃描電鏡圖片

    Fig.2 Scanning electron microscopy picture of HFW217

    2.1.2 菌體形態(tài)與大小

    HFW217菌株的菌體形態(tài)為短桿狀,大小為(0.5~0.8)×(1.1~3.0)μm。圖2

    2.1.3 生理測定

    HFW217芽孢呈橢圓形,著生于菌體中部,無鞭毛,革蘭氏染色為陽性菌,可耐受45℃的高溫和15℃的低溫;HFW217在無鹽狀態(tài)以及11%鹽濃度下均可生長。HFW217在葡萄糖為碳源的培養(yǎng)基中生長優(yōu)于以甘露醇為碳源的培養(yǎng)基,在硝酸鉀、硝酸銨,草酸銨為氮源的培養(yǎng)基中均生長不良。表2,表3

    表2 HFW217生長溫度

    Table 2 Growth temperature of HFW217

    溫度Temperature/℃HFW21710﹣15﹢25﹢28﹢35﹢40﹢45﹢50﹣55﹣

    注:,陽性反應(yīng);-,陰性反應(yīng)

    Note:, positive reaction; -, negative reaction

    表3 HFW217的耐鹽性試驗

    Table 3 Salt tolerance test of HFW217

    NaCl的質(zhì)量分數(shù)Mass fraction of NaCl/(%)HFW2170﹢2﹢5﹢7﹢10﹢11﹢12﹣

    注:,陽性反應(yīng);-,陰性反應(yīng)

    Note:, positive reaction; -, negative reaction

    2.1.4 生化鑒定

    研究表明,硝酸鹽還原和過氧化氫酶均為陽性,葡萄糖發(fā)酵產(chǎn)酸,水解淀粉、明膠,pH 6.8和pH 5.7下均能生長,不產(chǎn)生吲哚,不水解卵磷脂,不形成二羥基丙酮,孢囊膨大,不能水解酪素,不能利用檸檬酸鹽,能發(fā)酵L-阿拉伯糖、D-木糖和甘露醇。

    結(jié)合《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》,HFW217與解淀粉芽胞桿菌的描述最相近,鑒定為解淀粉芽胞桿菌。表4

    表4 HFW217生化測定

    Table 4 Biochemical test results of HFW217

    特征 CharacteristicHFW217特征 CharacteristicHFW217細胞直徑>1.0 μmCell diameter>1.0 μm﹣卵黃卵磷脂Yolk lecithin﹣芽孢形狀Spore shape橢圓明膠液化Gelatin liquefaction﹢孢囊膨大Cyst enlargement﹢利用檸檬酸鹽Utilization of citrate﹣過氧化氫酶實驗Catalase experiment﹢L-阿拉伯糖L-pectinose﹢硝酸鹽還原Nitrate reduction﹢甘露醇Mannitol﹢產(chǎn)生吲哚Indole production﹣發(fā)酵D-葡萄糖Fermentation of D-glucose﹢脲酶實驗Urease experiment﹢D-木糖D- xylose﹢水解淀粉Hydrolyzes starch﹢生長PH: 6.8 營養(yǎng)肉湯Growing PH: 6.8 nutritional broth﹢酪素水解Casein hydrolysis﹣生長PH: 5.7 營養(yǎng)肉湯Growing PH: 5.7 nutritional broth﹢

    注:,陽性反應(yīng);﹣,陰性反應(yīng)

    Note: +, positive reaction; -, negative reaction

    2.2 HFW217的基因檢測

    2.2.1 HFW217的PCR擴增產(chǎn)物電泳檢測

    經(jīng)電泳檢測16S rDNA大小在1 400~1 600 bp(圖3a),對上海生工測序結(jié)果讀圖和拼接后得16S rDNA序列1 455 bp。采用芽孢桿菌特異性rpoB引物擴增在500~600 bp范圍內(nèi)有擴增產(chǎn)物(圖3b),對上海生工測序結(jié)果讀圖后得rpoB基因序列557 bp。圖3

    2.2.2 16S rDNA序列比對與同源性

    HFW217菌株16S rDNA基因序列與47株芽孢桿菌科細菌相似性在91%以上。相似性在92.36%~99.72%的有43株,均為芽孢桿菌屬;2株為枝芽孢桿菌屬,相似性為93%;1株為耐鹽短桿菌,相似性為98.90%;株為乳桿菌屬,相似性為91.67%。序列相似性大于95%和97%的菌株除一株耐鹽短桿菌外,其余均為芽孢桿菌屬細菌。16S rDNA基因序列相似性位列前三的分別為甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌、解淀粉芽孢桿菌和西姆芽孢桿菌。列出序列相似性>95%的結(jié)果。表5

    圖3 PCR擴增產(chǎn)物的電泳結(jié)果(1%瓊脂糖凝膠)

    Fig.3 The result of electrophoresis for PCR amplification products with 1% agarose gel

    表5 HFW217菌株16S rDNA序列比對

    Table 5 The alignment for 16S rDNA of strain HFW217

    序號Rank名稱Name菌株編號Strain登錄號Accession相似性Similarity(%)1Bacillus methylotrophicusCBMB205(T)EU194 89799.722Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarumFZB42(T)CP000 56099.453Bacillus siamensisKCTC13 613(T)AJVF01 000 04399.384Bacillus amyloliquefaciens subsp. amyloliquefaciensDSM7(T)FN597 64499.115Bacillus subtilis subsp. subtilisNCIB3 610(T)ABQL01 000 00199.116Brevibacterium halotoleransDSM8 802(T)AM747 81298.907Bacillus atrophaeusJCM9 070(T)AB021 18198.908Bacillus vallismortisDV1-F-3(T)JH600 27398.839Bacillus mojavensisRO-H-1(T)JH600 28098.8310Bacillus subtilis subsp. spizizeniiNRRLB-23 049(T)CP002 90598.7611Bacillus licheniformisATCC14 580(T)AE017 33397.5912Bacillus aerius24K(T)AJ831 84397.3813Bacillus stratosphericus41KF2a(T)AJ831 84196.8414Bacillus aerophilus28K(T)AJ831 84496.8415Bacillus pumilusATCC7061(T)ABRX01 000 00796.5616Bacillus vietnamensis15-1(T)AB099 70895.6417Bacillus aquimarisTF-12(T)AF483 62595.3218Bacillus acidicola105-2(T)AF547 20995.1119Bacillus marisflaviTF-11(T)AF483 62495.0520Bacillus shackletoniiLMG18 435(T)AJ250 31895.04

    2.2.3 rpoB基因的序列比對與同源性

    HFW217菌株rpoB基因序列比對相似性大于91%的有101株,其中97%的菌株提示為芽孢桿菌屬?;蛳嗨菩源笥?7%的菌株除2例提示為枝芽孢桿菌屬,相似性在99.4%~99.6%以外,其它顯示均為芽孢桿菌屬菌株,其中解淀粉芽孢桿菌及其亞種、枯草芽孢桿菌、萎縮芽孢桿菌出現(xiàn)較多。序列相似性100%的9株菌株中8株為解淀粉芽孢桿菌及其亞種,1株為芽孢桿菌屬,其分類學(xué)尚不明確。

    2.2.4 16S rDNA基因系統(tǒng)發(fā)育樹

    研究表明,從遺傳進化關(guān)系上,HFW217與解淀粉芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌、甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌等共屬一個進化分支。經(jīng)1 000次重復(fù)檢驗中,一致的分支數(shù)值均不足70[11],不能從16S rDNA角度判斷HFW217具體為解淀粉芽孢桿菌、甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌等其中哪一種。對HFW217菌株16S進化樹中出現(xiàn)的菌株分別進行分子鐘檢驗,發(fā)現(xiàn)與HFW217菌株16S rDNA基因處于同一進化分支上的各菌株經(jīng)χ2檢驗P>0.05,均能接受具有相同分子進化速率的假說。圖4

    2.2.5 rpoB基因系統(tǒng)發(fā)育樹

    從NCBI數(shù)據(jù)庫下載的同源性高于97%的菌株rpoB基因,構(gòu)建Neighbour-Joining Tree。HFW217與解淀粉芽孢桿菌處于同一進化分支,并且與兩株解淀粉芽孢桿菌普魯蘭酶亞種Bacillusamyloliquefacienssubsp.plantarum具有相同的進化距離。與HFW217同樣具有相同進化距離的一株枯草芽孢桿菌916菌株,從分子進化角度也靠近解淀粉芽孢桿菌。結(jié)合兩個進化樹分析,菌株HFW217可能與當(dāng)前農(nóng)業(yè)生防已廣泛應(yīng)用的解淀粉芽孢桿菌FZB42菌株[11]有更近的物種關(guān)系。在對HFW217與其rpoB基因進化樹中出現(xiàn)的菌株進行分子鐘檢驗,其中唯一差異位點數(shù)最少的為與HFW217處于同一進化分支的三株菌株,經(jīng)χ2檢驗可以接受HFW217與解淀粉芽孢桿菌、甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌具有相同分子進化速率的假設(shè)。其中經(jīng)檢驗得HFW217與解淀粉芽孢桿菌UCMB5113和FZB42在卡方檢驗中P=1接受具有相同分子速率的假設(shè)。圖5

    圖4 HFW217菌株16S rDNA基因系統(tǒng)發(fā)育樹(臨位連接法)

    Fig.4 Phylogeny tree for 16S rDNA of strain HFW217 (Neighbour-joining)

    圖5 HFW217菌株rpoB基因系統(tǒng)發(fā)育樹(臨位連接法)

    Fig.5 Phylogeny tree for rpoB gene of strain HFW217 (Neighbour-joining)

    2.3 生防菌HFW217對棉花枯萎病的溫室和田間防效

    研究表明,菌株HFW217對棉花枯萎病的預(yù)防效果可達81.80%,治療效果為74.62%,預(yù)防效果高于發(fā)病后的治療效果;而田間試驗菌株HFW217對棉花枯萎病的預(yù)防效果80.97%,治療效果為73.18%,預(yù)防效果也高于發(fā)病后的治療效果。與對照藥劑多菌靈相比,生防菌HFW217的預(yù)防效果和治療效果均較為顯著。表6,表7

    表6 生防菌HFW217對棉花枯萎病的溫室防治效果

    Table 6 The biological control efficacy of the strain A13 against cotton Fusarium wilt in greenhouse

    處理Treatment預(yù)防 Prevention治療 ControlHFW217多菌靈Carbendazim無菌水Sterilized waterHFW217多菌靈Carbendazim無菌水Sterilized water處理前病指Pre-treatment disease index---15.3315.3515.47處理后病指Post-treatment disease finger13.8817.3676.2821.6524.4185.79防治效果Control efficiency81.80a77.24b-74.62c66.75d-

    表7 生防菌HFW217對棉花枯萎病的田間防治效果

    Table 7 The biological control efficacy of the strain A13 against cotton Fusarium wilt in field

    處理Treatment預(yù)防 Prevention治療 ControlHFW217多菌靈Carbendazim無菌水Sterilized waterHFW217多菌靈Carbendazim無菌水Sterilized water處理前病指Pre-treatment disease index---16.3616.8316.71處理后病指Post-treatment disease finger15.6721.7782.3623.3125.8988.34防治效果Control efficiency80.97a73.57b-73.18b70.97c-

    3 討 論

    結(jié)合生理生化和16S rDNA以及rpoB基因序列比對和遺傳進化分析,認為菌株HFW217屬于解淀粉芽孢桿菌,從基因水平分析,HFW217的親緣關(guān)系上可能與解淀粉芽孢桿菌普魯蘭酶亞種的親緣關(guān)系最近。通過生理試驗測定,發(fā)現(xiàn)這株解淀粉芽孢桿菌能夠在鹽濃度為11%和45℃培養(yǎng)條件下生長,比較符合HFW217來源于南疆鹽堿土壤的生活環(huán)境,也比較容易在南疆田間環(huán)境發(fā)揮生防作用。通過溫室和田間試驗分析,HFW217對棉花枯萎病防效顯著。

    與解淀粉芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌及甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌等多個芽孢桿菌相比,菌株HFW217的16S基因序列相似性極高,在分類學(xué)上很難將其區(qū)分。與耐鹽短桿菌在基因序列上也存在很高的相似性,通過早期對菌株HFW217的形態(tài)學(xué)和生理生化的研究發(fā)現(xiàn)HFW217是一株產(chǎn)芽孢革蘭陽性細菌,可以與不產(chǎn)芽孢的耐鹽短桿菌區(qū)分開。HFW217菌株的rpoB基因較16S rDNA序列相似性更高,最高達到100%,從rpoB基因進化距離估算和進化樹分析,菌株HFW217 與解淀粉芽孢桿菌具有穩(wěn)定一致的分子進化關(guān)系[15]。雖然從NCBI數(shù)據(jù)庫中下載的BucillussubtilisStr.916在NCBI數(shù)據(jù)庫分類為枯草芽孢桿菌,但綜合rpoB基因進化樹結(jié)果可以看出,枯草芽孢桿菌916菌株分子進化關(guān)系也更靠近解淀粉芽孢桿菌,這與歐洲數(shù)據(jù)庫(ezGenome)提示的分類學(xué)關(guān)系一致。從rpoB基因進化情況還可以判斷,HFW217與甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌相比具有更長的進化距離,從進化角度可以排除HFW217為甲基營養(yǎng)型芽孢桿菌。其他在兩種基因比較和進化分析選擇中并未同時出現(xiàn)的菌種和菌株無法更詳細判斷種間進化關(guān)系遠近。

    對于芽孢桿菌近緣種間鑒定僅從序列的相似性較難判斷親緣關(guān)系,必要時需要結(jié)合形態(tài)學(xué)的觀察,如該例鑒定中對耐鹽短桿菌的排除。其次,16S rDNA基因序列在對芽孢桿菌屬內(nèi)近緣種間關(guān)系的判斷并不如rpoB基因?qū)@種近緣種關(guān)系判斷具有更大的貢獻,這與基因分子中種的基因獨特性相關(guān)。從進化的估計來看,16S rDNA序列過于保守,序列系統(tǒng)發(fā)育樹分支冗余,在親緣較近的種,如解淀粉芽孢桿菌、枯草芽孢桿菌等表現(xiàn)出的進化距離相同,給種的鑒定增加了較多不確定性。相比16S rDNA基因,rpoB基因雖然具有更大基因分子獨特性,但難以尋找如16S rDNA擴增使用的通用引物,需要針對特定屬或若干種進行引物設(shè)計。

    由于芽孢桿菌產(chǎn)芽孢的特性,這成為研究之前其他形態(tài)學(xué)和生理生化研究工作區(qū)分芽孢桿菌與非芽孢桿菌的主要依據(jù),而生理生化和形態(tài)學(xué)研究并不能直接具體確定芽孢桿菌屬具體的種,這主要與芽孢桿菌近緣種具有極相似的生理生化特性相關(guān)。研究方法中16S rDNA基因的研究為選擇特異性的引物提供了主要參考依據(jù),而單獨對于芽孢桿菌16S rDNA在芽孢桿菌近緣種中的鑒定貢獻并不明顯。研究原計劃從16S rDNA、rpoB、gyrB三個基因著手開展鑒定工作并比較三個不同基因區(qū)段對于細菌鑒定的貢獻,但gyrB基因的擴增一直未能設(shè)計篩選出合適的引物,從國內(nèi)外研究的比較中可以得出gyrB基因?qū)τ诩毦b定的敏感性可能不如rpoB基因,但從芽孢桿菌已知菌株gyrB基因區(qū)域中單核苷酸多態(tài)性較豐富的表現(xiàn),gyrB基因可能在芽孢桿菌近緣種的鑒定中具有較大貢獻。gyrB基因和rpoB基因利用其單核苷酸多態(tài)性的特性在鑒定工作中的貢獻在國內(nèi)外其他臨床微生物的研究中貢獻也有體現(xiàn),如諾卡氏菌種[16]。進化分析對基因序列的比對分析使用的MEGA6.06較MEGA5.0除了繼承之前的算法以外,在進化距離估計和相關(guān)性的分析提供更多的便利以及引入科學(xué)統(tǒng)計學(xué)算法直觀呈現(xiàn)統(tǒng)計學(xué)相關(guān)性分析結(jié)果比較同一進化分支和不同進化分支的關(guān)系[17]。

    解淀粉芽孢桿菌對多種植物病害都有一定的抑制作用,是一類重要具有生物防治作用的芽孢桿菌,例如對香蕉枯萎病[18]、油菜核盤菌[19]、尖孢鐮刀菌[6]、草莓蛇病菌[20]、大花惠蘭根腐病[21]、辣椒疫霉[22]、水稻細菌性條斑病[23]、馬鈴薯枯萎病菌和炭疽病菌[24]、大豆根腐病[25]、炭疽病[26]等都有不同程度的抑制作用。目前,解淀粉芽孢桿菌作為農(nóng)藥中的殺菌劑已在生產(chǎn)中應(yīng)用,陜西加倫多生產(chǎn)的10億活芽孢/克可濕性粉劑被登記用于防治水稻稻瘟病[27-28]。研究中,解淀粉芽孢桿菌對棉花枯萎病的溫室和田間防效顯著,與以往研究不同的是,解淀粉芽孢桿菌HFW217從南疆半沙漠化、半鹽堿化生態(tài)環(huán)境中分離而來,能夠耐受新疆干旱、鹽堿和寒冷等自然條件,具有抗逆特性。

    4 結(jié) 論

    與多個芽孢桿菌相比,HFW217菌株的16S rDNA基因序列與43株芽孢桿菌科細菌相似性92.36%~99.72%;而16S rDNA進化關(guān)系上,菌株HFW217與枯草芽孢桿菌、西姆芽孢桿菌等在分類學(xué)上也很難區(qū)分。HFW217菌株的rpoB基因較16S rDNA序列相似性更高,序列相似性100%的9株菌株中8株為解淀粉芽孢桿菌及其亞種,1株為芽孢桿菌屬。采用16S rDNA、rpoB基因序列和生理生化結(jié)合的方法對HFW217進行鑒定,其結(jié)果是該生防菌是解淀粉芽孢桿菌B.amloliquefaciens。菌株HFW217在溫室和田間對棉花枯萎病的預(yù)防效果為81.80%和80.97%,防治效果分別為77.62%和73.18%,均明顯高于對照藥劑,具有潛在的應(yīng)用價值。

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