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    基于DNA模板合成的銀簇建立“點(diǎn)亮型”熒光法檢測(cè)卡那霉素

    2019-09-27 09:22:56林碧霞蒙佩怡陳夢(mèng)玲吳峻宇冷江東黃月梅楊詩(shī)意
    分析測(cè)試學(xué)報(bào) 2019年9期
    關(guān)鍵詞:卡那霉素堿基熒光

    林碧霞,蒙佩怡,陳夢(mèng)玲,吳峻宇,冷江東,黃月梅,楊詩(shī)意,俞 英

    (華南師范大學(xué) 廣州市生物醫(yī)藥分析化學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 廣州 510006)

    卡那霉素是一種氨基糖苷類抗生素,被應(yīng)用于畜牧業(yè)中抗菌殺菌[1]。殘留在農(nóng)畜產(chǎn)品的卡那霉素有可能通過(guò)食物鏈進(jìn)入人體,從而對(duì)人體健康造成危害[2]。因此,建立卡那霉素的靈敏檢測(cè)方法具有重要意義。目前,卡那霉素的檢測(cè)方法包括色譜法[3]、酶聯(lián)免疫分析法[4]、電化學(xué)法[5]、拉曼光譜法[6]等。但上述方法大多存在操作繁瑣、檢測(cè)時(shí)間長(zhǎng)等缺點(diǎn)。熒光分析法因?yàn)榫哂袃?yōu)良的選擇性和靈敏度,且操作簡(jiǎn)單,被廣泛應(yīng)用于各種目標(biāo)物的分析檢測(cè)[7-9]。

    圖1 銀納米簇檢測(cè)卡那霉素的原理圖Fig.1 Detection principle of kanamycin by silver nanoclusters

    銀納米簇(AgNCs)作為一種新型熒光納米材料吸引了廣泛關(guān)注[10-11],尤其是以DNA為模板合成的銀納米簇,可以同時(shí)具備發(fā)光功能和識(shí)別功能,避免了以往熒光探針制備中復(fù)雜的熒光分子標(biāo)記過(guò)程和識(shí)別分子修飾過(guò)程[12-13]。目前以DNA為模板合成銀簇主要用于檢測(cè)目標(biāo)DNA[14-15]和大分子[16],較少用于小分子的檢測(cè),如Yang[17]等以miRNA的互補(bǔ)DNA為模板合成銀納米簇,并用于miRNA的檢測(cè);Cao[18]等以銀納米簇為熒光探針,建立了對(duì)人類免疫缺陷病毒(HIV)基因、乙型肝炎病毒(HBV)基因和人類T淋巴細(xì)胞病毒Ⅰ型(HTLV-Ⅰ)基因的檢測(cè)。

    本文基于DNA模板合成的銀納米簇建立了檢測(cè)卡那霉素的熒光方法,檢測(cè)原理如圖1所示:以DNA模板合成的銀簇?zé)晒夂苋?,?dāng)加入目標(biāo)物卡那霉素時(shí),由于DNA模板上的適配體序列識(shí)別卡那霉素,適配體形成了發(fā)夾結(jié)構(gòu),并使其G、C堿基靠近銀簇序列,同時(shí)DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的改變使大顆粒的銀納米粒子分散為小顆粒的銀簇,導(dǎo)致銀簇?zé)晒庠鰪?qiáng),根據(jù)該原理建立了“點(diǎn)亮型”熒光法檢測(cè)卡那霉素。

    1 實(shí)驗(yàn)部分

    1.1 試劑與儀器

    卡那霉素(純度94%)、鏈霉素(99%)、四環(huán)素(96%)、金霉素(99%)、多西環(huán)素(99%)、土霉素(95%)、環(huán)丙沙星(99%),均購(gòu)于上海阿拉丁試劑公司;硝酸銀、硼氫化鈉、檸檬酸、檸檬酸鈉(分析純,天津致遠(yuǎn)化學(xué)試劑公司);各種序列的DNA由上海生工合成,并經(jīng)高效液相色譜純化,其具體序列見(jiàn)表1,其中合成銀簇的DNA有5種不同序列(下劃線堿基序列),分別命名為AgDNA1、AgDNA2、AgDNA3、AgDNA4、AgDNA5,無(wú)下劃線堿基序列為卡那霉素的適配體序列,命名為kan1;實(shí)驗(yàn)所用水均為超純水;牛奶和蜂蜜樣品購(gòu)自當(dāng)?shù)厥袌?chǎng)。

    熒光光譜用日本日立F-4600型熒光光譜儀測(cè)定,激發(fā)和發(fā)射狹縫寬度均為10 nm,激發(fā)電壓為700 V,掃描速度為300 nm/min。紫外光譜(UV-Vis)用日本島津2700型紫外-可見(jiàn)分光光度計(jì)測(cè)定。透射電鏡譜圖(TEM)用日本電子JEM-2100HR 透射電子顯微鏡測(cè)定。

    表1 本實(shí)驗(yàn)使用的DNA序列Table 1 DNA sequences used in the experiment

    1.2 銀納米簇的合成

    銀納米簇的合成參考文獻(xiàn)[12]改進(jìn):用20 mmol/L檸檬酸緩沖溶液(pH 7.5)配制15 μmol/L的DNA溶液。將DNA溶液在95 ℃水浴中加熱5 min,再迅速放至冰水浴中保持1 h。取新制的90 μmol/L 硝酸銀溶液逐滴滴至上述配制的DNA溶液中,渦旋振蕩2 min后,于冰水浴中保持15 min。隨后,迅速加入90 μmol/L新鮮配制的硼氫化鈉溶液,渦旋振蕩4 min。此時(shí),反應(yīng)體系中DNA、硝酸銀和硼氫化鈉的濃度比為1∶6∶6。將混合溶液放置在4 ℃下避光反應(yīng)12 h,得到5 μmol/L的銀納米簇(以加入DNA的濃度計(jì)算)。

    1.3 卡那霉素檢測(cè)方法的建立

    在一系列比色管中依次加入30 μL 5 μmol/L的銀納米簇溶液、40 μL 20 mmol/L的檸檬酸緩沖液(pH 7.5)和30 μL不同濃度的卡那霉素標(biāo)準(zhǔn)溶液。渦旋混合均勻后于16 ℃搖床中反應(yīng)80 min。測(cè)定各反應(yīng)溶液的熒光強(qiáng)度,并以卡那霉素的濃度為橫坐標(biāo),熒光增強(qiáng)倍數(shù)(F/F0,F0、F分別為銀簇加入卡那霉素前后的熒光強(qiáng)度)為縱坐標(biāo),繪制銀簇測(cè)定卡那霉素的工作曲線。

    1.4 實(shí)際樣品的檢測(cè)

    取1 mL牛奶或蜂蜜,加入4 mL冰浴冷凍后的甲醇溶液,渦旋混合30 s后,置于冰水浴中靜置15 min,然后以10 000 r/min的轉(zhuǎn)速離心15 min。收集上清液并用0.22 μm 濾膜過(guò)濾,蒸干,重溶殘?jiān)⒂?.22 μm 濾膜再次過(guò)濾,最后稀釋定容至10 mL。

    取30 μL上述牛奶或蜂蜜樣品代替卡那霉素標(biāo)準(zhǔn)溶液,按“1.3”實(shí)驗(yàn)方法處理并進(jìn)行熒光強(qiáng)度測(cè)定,根據(jù)建立的工作曲線計(jì)算得到待測(cè)樣品溶液中卡那霉素的濃度。為了評(píng)價(jià)方法的準(zhǔn)確度,兩種樣品溶液分別加2.5、5.0、7.5 μmol/L卡那霉素標(biāo)準(zhǔn)溶液,測(cè)定加標(biāo)樣品溶液中卡那霉素的濃度,計(jì)算回收率與相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)。

    2 結(jié)果與討論

    2.1 DNA模板的優(yōu)化

    DNA模板包括兩部分的堿基序列,一部分用于合成銀納米簇,命名為AgDNA序列,另一部分用于識(shí)別目標(biāo)物卡那霉素,命名為kan1序列。對(duì)AgDNA序列進(jìn)行優(yōu)化,并探討其位置變化對(duì)熒光的影響。

    2.1.1 合成銀簇的優(yōu)化由于AgDNA序列不同時(shí),合成銀簇的熒光性能會(huì)不同,造成對(duì)目標(biāo)物檢測(cè)靈敏度也不同,因此很有必要對(duì)合成銀簇序列進(jìn)行優(yōu)化。目前文獻(xiàn)報(bào)道的常用于合成銀簇的序列包括CCC TTT AAC CCC、CCT CCT TCC TCC、CCC TAA CTC CCC、CCC TTA ATC CCC、ACC CAC CCA,分別命名為AgDNA1、AgDNA2、AgDNA3、AgDNA4、AgDNA5序列。保持DNA模板中卡那霉素適配體序列相同,均為kan1序列,且在DNA模板的3′端,改變合成銀簇的序列分別為上述5種序列,得到AgDNA1-kan1,AgDNA2-kan1,AgDNA3-kan1,AgDNA4-kan1,AgDNA5-kan1 5種不同的DNA模板(具體序列見(jiàn)表1)。用該5種模板按相同合成方法分別合成銀簇,然后加入卡那霉素,測(cè)定5種DNA模板合成的銀簇加入卡那霉素前后的熒光變化情況。如圖2所示,合成銀簇的激發(fā)峰和發(fā)射峰位置和強(qiáng)度均會(huì)隨銀簇序列的改變而改變。此外,5種DNA模板合成的銀簇加入卡那霉素后熒光均能發(fā)生不同程度的增強(qiáng),熒光增強(qiáng)倍數(shù)從大到小依次是AgDNA4-kan1> AgDNA2-kan1>AgDNA1-kan1 >AgDNA5-kan1 >AgDNA3-kan1。由于用AgDNA4-kan1作為模板合成的銀簇加入卡那霉素時(shí)熒光增強(qiáng)最明顯,靈敏度最高,因此實(shí)驗(yàn)選取AgDNA4序列為最佳合成銀簇序列。

    圖3 DNA模板中合成銀簇序列位置的優(yōu)化Fig.3 Optimization of sequences position for silver nanoclusters in DNA templates

    2.1.2 合成銀簇序列位置的優(yōu)化為了探究DNA模板中合成銀簇序列的位置是否會(huì)影響合成銀簇檢測(cè)目標(biāo)物的靈敏度,設(shè)計(jì)3種銀簇序列位置不同的DNA模板:AgDNA4-kan1,kan1-AgDNA4,AgDNA4-kan1-AgDNA4(具體序列見(jiàn)表1)。該3種DNA模板中,卡那霉素適配體序列部分相同,均為kan1序列,合成銀簇序列均為AgDNA4序列,其分別在DNA模板的5′端、3′端以及同時(shí)存在于5′端和3′端。用該3種模板按相同方法分別合成銀簇,然后加入卡那霉素,測(cè)定3種DNA模板合成的銀簇加入卡那霉素前后的熒光變化情況。如圖3所示,當(dāng)合成銀簇序列在DNA模板的5′端時(shí),合成銀簇加入卡那霉素后熒光增強(qiáng)最為明顯,因此,選取DNA模板中合成銀簇序列在5′端為最優(yōu)。

    2.2 銀簇合成條件的優(yōu)化

    對(duì)合成銀納米簇時(shí)緩沖溶液的pH值、反應(yīng)物濃度、反應(yīng)溫度和反應(yīng)時(shí)間進(jìn)行考察,以增加加入目標(biāo)物卡那霉素后熒光的增強(qiáng)程度,提高檢測(cè)靈敏度。結(jié)果顯示,當(dāng)pH值在7.5~8.5時(shí),熒光增強(qiáng)程度最大,實(shí)驗(yàn)選取pH 7.5為最佳pH值(圖4A)。當(dāng)DNA、硝酸銀和硼氫化鈉三者的濃度比為1∶6∶6時(shí)(圖4B),合成溫度為4 ℃,合成時(shí)間為12 h時(shí),熒光增強(qiáng)程度達(dá)到最大。因此實(shí)驗(yàn)選取銀簇合成的最佳條件為pH 7.5,DNA、硝酸銀、硼氫化鈉三者濃度比為1∶6∶6,在4 ℃反應(yīng)12 h。

    2.3 銀簇的表征

    通過(guò)紫外吸收光譜、熒光光譜、透射電鏡等方法,考察了合成銀簇的光學(xué)性能和形貌特征。圖5A紫外吸收光譜圖中,DNA在260 nm處有明顯吸收,合成后的銀簇保持了DNA在260 nm處的吸收,但在420 nm多了銀納米粒子(AgNPs)的表面等離子體共振峰。400~650 nm的放大圖則顯示,在555 nm處增加了銀納米簇的吸收峰。圖5B熒光光譜圖中,合成前的DNA無(wú)特征激發(fā)和發(fā)射峰,合成后銀簇在565 nm處有明顯的激發(fā)峰,這與合成銀簇在555 nm有紫外吸收相符。在該波長(zhǎng)激發(fā)下,可觀察到624 nm處呈現(xiàn)發(fā)射峰。為了表征合成銀簇的形貌和粒徑情況,對(duì)其進(jìn)行了透射電鏡分析(圖5C),結(jié)果顯示,合成銀簇的分散性良好、大小均一。用高分辨透射電子顯微鏡對(duì)其進(jìn)行表征,可看到銀簇尺寸約為5 nm,并呈現(xiàn)明顯的晶格條紋。為了探討銀簇的穩(wěn)定性能,對(duì)銀簇的抗光漂白性能進(jìn)行考察,結(jié)果顯示,銀簇在565 nm激發(fā)波長(zhǎng)的持續(xù)照射下,1 h后熒光強(qiáng)度仍保持90%以上,表明合成的銀簇穩(wěn)定性較好。

    圖5 銀納米簇的表征Fig.5 Characterization of silver nanoclustersA.UV absorption spectra;B.fluorescence spectra;C.TEM image;insert:HRTEM image of silver nanoclusters

    2.4 銀簇檢測(cè)卡那霉素的機(jī)理

    對(duì)銀簇加入卡那霉素前后的熒光及紫外吸收光譜圖進(jìn)行掃描(圖6),以考察銀簇檢測(cè)卡那霉素的機(jī)理。結(jié)果顯示,銀簇中加入卡那霉素時(shí),銀簇在565 nm的熒光峰位置未改變,但熒光強(qiáng)度明顯增強(qiáng)(圖6A)。在365 nm的紫外燈下觀察加入卡那霉素前后的熒光顏色變化(圖6插圖),可以清晰看到加入卡那霉素前幾乎無(wú)熒光,而加入卡那霉素后溶液呈現(xiàn)明顯的橙色熒光。這與加入卡那霉素前銀簇的熒光很弱,而加入卡那霉素后熒光增強(qiáng)的熒光光譜相符合。同時(shí),由于合成的銀簇?zé)晒夂苋酰欣诮档捅尘案蓴_,提高檢測(cè)靈敏度。

    圖6B顯示,加入卡那霉素前,銀簇在420 nm和555 nm有吸收峰,分別對(duì)應(yīng)銀納米粒子和銀簇的吸收。隨著卡那霉素加入濃度的增加,420 nm處吸收峰的強(qiáng)度逐漸下降并向銀簇的吸收波長(zhǎng)移動(dòng),同時(shí)555 nm處吸收峰的強(qiáng)度逐漸增強(qiáng),這與加入卡那霉素后熒光增強(qiáng)一致。由于卡那霉素適配體序列的3′端有部分G堿基和C堿基(見(jiàn)表1),有文獻(xiàn)報(bào)道G堿基和C堿基可以增強(qiáng)銀簇的熒光[19-21],因此可推斷加入卡那霉素后,DNA模板上的適配體序列識(shí)別卡那霉素,構(gòu)型由原來(lái)的松散狀態(tài)轉(zhuǎn)為發(fā)夾型,使適配體上更多G堿基和C堿基靠近銀簇,從而導(dǎo)致銀簇的熒光增強(qiáng)[12,22]。同時(shí)由于卡那霉素引起DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)變化可能使銀納米粒子分散,形成小粒徑的銀簇[23],導(dǎo)致銀納米粒子的數(shù)量減少,其在420 nm處的吸收下降,同時(shí)銀簇增多,其紫外吸收和熒光強(qiáng)度均增強(qiáng)。綜上,卡那霉素對(duì)銀簇的熒光增強(qiáng)可以歸為兩個(gè)原因:一是更多G堿基和C堿基靠近銀簇,提高銀簇?zé)晒?二是銀納米粒子分散成小粒徑的銀簇,導(dǎo)致銀簇?cái)?shù)量增多。

    2.5 銀簇檢測(cè)卡那霉素的條件優(yōu)化與工作曲線

    由于卡那霉素可以增強(qiáng)銀簇的熒光,因此可將銀簇作為熒光探針建立“點(diǎn)亮型”熒光法檢測(cè)卡那霉素的含量。首先對(duì)檢測(cè)過(guò)程中銀簇與卡那霉素的反應(yīng)溫度與時(shí)間進(jìn)行優(yōu)化。圖7A和B顯示最佳反應(yīng)溫度和時(shí)間分別為16 ℃和80 min。在優(yōu)化最佳反應(yīng)溫度和反應(yīng)時(shí)間下,考察銀簇檢測(cè)不同濃度(0、0.075、0.1、0.5、1.0、2.0、3.0、4.0、5.0、7.0、8.0、9.0 μmol/L)卡那霉素的響應(yīng)信號(hào)。圖7C顯示,隨著卡那霉素加入濃度的增加,銀簇的熒光逐漸增強(qiáng),且在0.075~8.0 μmol/L濃度范圍內(nèi),銀簇?zé)晒庠鰪?qiáng)比值(F/F0)與卡那霉素的濃度(C,μmol/L)呈線性關(guān)系,其線性方程為F/F0=0.616 8C+ 0.927 6,相關(guān)系數(shù)為0.995 8,檢出限(LOQ,S/N=3)為36 nmol/L??敲顾卦谝恍┦称啡缗D?、蜂蜜樣品的限量標(biāo)準(zhǔn)為150 μg/L[24],換算約為258 nmol/L,而本方法的檢出限明顯小于卡那霉素在這些樣品中的限量標(biāo)準(zhǔn),說(shuō)明本方法能滿足限量標(biāo)準(zhǔn)的需求。

    圖7 銀簇檢測(cè)卡那霉素Fig.7 Detection of kanamycin by silver nanoclustersA.optimization of temperature;B.optimization of time;C.fluorescence spectra of silver nanoclusters with kanamycin at various concentrations

    2.6 銀簇檢測(cè)卡那霉素的穩(wěn)定性與選擇性

    圖8 銀簇檢測(cè)卡那霉素方法的選擇性Fig.8 Selectivity of the detection method for kanamycin by silver nanoclusterconcentration of antibiotics:8 μmol/L

    為了探究銀簇檢測(cè)卡那霉素方法的穩(wěn)定性,選取加入卡那霉素的濃度分別為0.75、5.0、7.0 μmol/L,對(duì)日內(nèi)、日間相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)進(jìn)行分析。每個(gè)濃度測(cè)定5 d,每天測(cè)定3次,計(jì)算得到的日內(nèi)RSD小于6.0%,日間RSD小于6.9%,說(shuō)明該方法檢測(cè)卡那霉素具有較好的穩(wěn)定性。

    為了考察銀簇檢測(cè)卡那霉素的選擇性,分別選取金霉素、四環(huán)素、多西環(huán)素、土霉素、環(huán)丙沙星、鏈霉素6種常見(jiàn)抗生素,按檢測(cè)卡那霉素的方法加入銀簇中,并測(cè)定加入前后銀簇?zé)晒鈴?qiáng)度的比值,結(jié)果顯示,當(dāng)加入8 μmol/L各種抗生素時(shí),卡那霉素的加入使熒光明顯增加約6.3倍,鏈霉素增加約2倍,而其他抗生素對(duì)銀簇?zé)晒鈴?qiáng)度的影響很小。鏈霉素能增加熒光強(qiáng)度是因?yàn)殒溍顾嘏c卡那霉素均為氨基糖苷類抗生素,分子結(jié)構(gòu)非常接近,對(duì)卡那霉素適配體的識(shí)別會(huì)有干擾。但與卡那霉素對(duì)銀簇?zé)晒獾脑鰪?qiáng)程度相比,鏈霉素的熒光增強(qiáng)小很多。該方法對(duì)卡那霉素具有很好的選擇性。

    2.7 實(shí)際樣品的檢測(cè)

    選取牛奶和蜂蜜作為實(shí)際樣品,對(duì)實(shí)際樣品進(jìn)行加標(biāo)處理并檢測(cè)卡那霉素的含量,以評(píng)價(jià)該“點(diǎn)亮型”熒光方法在實(shí)際樣品測(cè)定中的效果。結(jié)果如表2所示,牛奶和蜂蜜樣品均未檢出,分別進(jìn)行0.2、2.5、5.0、7.5 μmol·L-1濃度水平的加標(biāo),測(cè)得回收率為92.4%~112%,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)為3.6%~8.0%。結(jié)果表明該方法具有良好的檢測(cè)準(zhǔn)確度和精密度,適用于實(shí)際樣品中卡那霉素的檢測(cè)。

    2.8 與其他檢測(cè)方法的比較

    將本方法與近年報(bào)道的卡那霉素?zé)晒鈾z測(cè)方法進(jìn)行比較(見(jiàn)表3)。從表中可看出,有機(jī)熒光分子、半導(dǎo)體無(wú)機(jī)量子點(diǎn)、碳族量子點(diǎn)均可作為發(fā)光元件來(lái)建立卡那霉素的熒光分析方法。本方法的靈敏度比用噻唑橙、熒光素二聚體、鉑復(fù)合物、碳點(diǎn)作為發(fā)光元件所建立的熒光方法的靈敏度好。此外,本方法雖比用羅丹明B、熒光素、CdTe作為發(fā)光元件所建立的方法的檢出限高,但本方法的線性范圍更寬,且毒性更低。

    表2 實(shí)際樣品中卡那霉素的測(cè)定(n=3)Table 2 Determination of kanamycin in actual samples (n=3)

    *no detected

    表3 卡那霉素?zé)晒鈾z測(cè)方法的比較Table 3 Comparison of fluorescent methods for kanamycin

    圖9 可視化半定量檢測(cè)卡那霉素Fig.9 Visual semi-quantitative determination of kanamycinconcentrations of kanamycin( from left to right):0,1.5,3.0,6.0,9.0,12,15,18,21 μmol/L

    2.9 可視化半定量檢測(cè)卡那霉素

    對(duì)銀簇中加入卡那霉素后體系的熒光顏色進(jìn)行探討。從圖9中可看出,在紫外燈下,隨著卡那霉素濃度的增加,檢測(cè)體系的顏色由幾乎無(wú)熒光逐漸變?yōu)槌壬珶晒?,且顏色不斷加深。因此可以根?jù)檢測(cè)體系在紫外燈下的熒光深淺對(duì)卡那霉素進(jìn)行可視化半定量檢測(cè)。該方法無(wú)需專業(yè)儀器,只需便攜式的紫外燈即可完成,從而為卡那霉素的現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)提供了有效方法。

    3 結(jié) 論

    本文對(duì)DNA模板中銀簇序列和位置進(jìn)行設(shè)計(jì),并優(yōu)化了合成銀簇的pH值、溫度、時(shí)間等條件。當(dāng)加入卡那霉素時(shí),DNA模板上的適配體序列識(shí)別卡那霉素形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),使更多的G、C堿基靠近銀簇序列,同時(shí)由于卡那霉素引起DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的變化使銀納米粒子粒徑變小,導(dǎo)致銀簇?zé)晒庠鰪?qiáng)。增強(qiáng)的熒光比值與卡那霉素濃度呈良好的線性關(guān)系,據(jù)此建立“點(diǎn)亮型”熒光方法檢測(cè)卡那霉素。對(duì)牛奶和蜂蜜樣品進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)效果良好。此外,隨著卡那霉素加入濃度的增加,銀簇的橙色熒光不斷加深,據(jù)此可對(duì)卡那霉素進(jìn)行可視化半定量檢測(cè),從而為卡那霉素的現(xiàn)場(chǎng)檢測(cè)提供了新方法。

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