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      草莓KEA家族基因的克隆、鑒定及表達(dá)分析

      2019-09-10 07:22:44姜玉素李珍王慶蓮趙密珍宋志忠
      關(guān)鍵詞:生物信息學(xué)分析草莓

      姜玉素 李珍 王慶蓮 趙密珍 宋志忠

      摘要:K+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體(KEA)介導(dǎo)細(xì)胞中K+和H+的動(dòng)態(tài)平衡,在維持植物體內(nèi)的離子平衡、生長(zhǎng)發(fā)育和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中起重要作用,然而,相關(guān)研究主要體現(xiàn)在模式作物擬南芥中,果樹(shù)中KEA家族基因的功能依然未知。本研究以Yellow Wonder 5AF8草莓為材料,篩選并克隆KEA家族基因,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)鑒定和表達(dá)特征分析,為研究果樹(shù)K+/H+平衡及鉀素動(dòng)態(tài)平衡機(jī)制提供基因資源和理論依據(jù)。結(jié)果表明,在草莓基因組中檢索并克隆到5個(gè)KEA家族基因,命名為FreKEAI~FreKEA5,屬于典型的植物K+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體基因;編碼的蛋白質(zhì)與7種已報(bào)道的不同科屬植物的KEA家族蛋白在氨基酸水平上具有25.00%的一致性,并可分為2個(gè)亞族(Group I和Group II),其中,草莓FveKEA1和FveKEA2屬于Group I,只含有4個(gè)Motif基序,而FveKEA3~FveKEA5屬于Group II,含有7個(gè)Motif基序;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)表明草莓FveKEA2和FveKEA4分別與葡萄VvKEA2和蘋果MdoKEA6緊密聚在一起,草莓FveKEA1、FveKEA3和FveKEA5分別與葡萄VvKEA1、白楊PtrKEA4、桃PpeKEA4等相應(yīng)成員在遺傳距離上較近;草莓KEA家族蛋白主要定位于細(xì)胞質(zhì)膜,均含有12~14個(gè)跨膜區(qū),除FveKEA3外,均為穩(wěn)定蛋白,且只有FveKEA5含有信號(hào)肽;轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜分析結(jié)果揭示草莓KEA家族基因在多種組織或器官中均有表達(dá),實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果表明FreKEAI在5AF8草莓不同組織中的整體表達(dá)水平最高,在花瓣和未成熟果實(shí)中的表達(dá)量最為突出,其次是FveKEA4,而其他3個(gè)基因的整體表達(dá)水平相對(duì)較低。此外,在草莓KEA基因啟動(dòng)子區(qū)域鑒定到至少16種順式作用元件,且均含有光感應(yīng)、胚乳表達(dá)和脫落酸(ABA)響應(yīng)的作用元件。

      關(guān)鍵詞:草莓;K+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體;生物信息學(xué)分析;基因克隆與表達(dá)

      中圖分類號(hào):S668.4

      文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A

      文章編號(hào):1000-4440(2019)02-0391-09

      鉀離子(K+)是細(xì)胞中含量最為豐富的金屬陽(yáng)離子之一,控制著細(xì)胞基礎(chǔ)膜電位,調(diào)節(jié)細(xì)胞滲透平衡,在植物光合作用、蒸騰作用、氣孔開(kāi)關(guān)和信號(hào)傳導(dǎo)等多種生命活動(dòng)中起關(guān)鍵作用[1-2]。園藝研究中,鉀素營(yíng)養(yǎng)與果樹(shù)生長(zhǎng)發(fā)育、花開(kāi)放、果實(shí)品質(zhì)和產(chǎn)量等密切相關(guān)[3-7],但果樹(shù)鉀素營(yíng)養(yǎng)高效利用的分子基礎(chǔ)研究較少。

      CPAs(Cation proton antiporters)定位于細(xì)胞質(zhì)膜液泡膜和線粒體、葉綠體、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等細(xì)胞器膜,是一類廣泛存在于植物、動(dòng)物、真菌和細(xì)菌的陽(yáng)離子_質(zhì)子逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體,可將細(xì)胞中的K+、Na+、Li+等陽(yáng)離子排出,并引起細(xì)胞內(nèi)H+的內(nèi)流和積累[8-9],維持細(xì)胞K+和H+的動(dòng)態(tài)平衡。植物中,CPAs介導(dǎo)細(xì)胞中離子和pH的穩(wěn)態(tài),在維持植物體內(nèi)的滲透平衡、生長(zhǎng)發(fā)育和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中起重要作用[8-16]。植物CPAs被分為2個(gè)亞族:CPA1和CPA2,其中,CPA1亞族主要是NHX(Na+/H+ exchanger)轉(zhuǎn)運(yùn)體,CPA2亞族包括KEA(K+ efflux antiporter,K+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體)和CHX(Cation/H+ exchanger)轉(zhuǎn)運(yùn)體[8-10]。近20年,NHX和CHX的研究報(bào)道相對(duì)較多,有關(guān)KEA亞族的研究最為稀少,主要體現(xiàn)在模式作物擬南芥中,Maser等在2011年最早揭示擬南芥中有6個(gè)At-KEA轉(zhuǎn)運(yùn)體基因[11],但所有AtKEA基因的功能至今依然沒(méi)有完全被解析。最近研究結(jié)果表明:擬南芥AtKEA轉(zhuǎn)運(yùn)體定位于維管組織、保衛(wèi)細(xì)胞和花萼等不同組織部位[12],擬南芥AtKEA1-3轉(zhuǎn)運(yùn)體在光合作用、pH調(diào)控及葉綠體滲透調(diào)節(jié)等方面起關(guān)鍵作用,并在轉(zhuǎn)錄水平受外界滲透脅迫、鹽脅迫和ABA脅迫的調(diào)控[13-16]。

      果樹(shù)中KEA家族基因的功能依然未知,僅見(jiàn)于梨KEA家族基因的克隆及生物信息學(xué)分析[17]。草莓[Fragaria resca]是一種全球重要的水果,隨著基因組序列的公布,迅速成為最具研究潛力的園藝作物之一[18]。本研究從草莓中克隆并鑒定了5個(gè)KEA家族基因,并通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析組織特異性表達(dá)特征,為研究果樹(shù)鉀素營(yíng)養(yǎng)與離子動(dòng)態(tài)平衡提供理論依據(jù)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料及取樣

      供試材料為江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院草莓資源圃中的草莓Yellow Wonder 5AF8,于2018年3月采樣。所取樣品依次為盛花期草莓植株的根、葉片、花瓣、花藥和草莓發(fā)育不同時(shí)期的果實(shí)(參照Fait等[19]描述,即:小綠果、白果轉(zhuǎn)色果、成熟果)。

      1.2 草莓KEA基因克隆

      以6個(gè)擬南芥KEA家族基因(TAIR數(shù)據(jù)庫(kù),http://www.arabidopsis.org/browse/'genefamily/index.jsp)編碼的氨基酸序列為參考,在Phytozome strawberry genome database(http://www.phytozome.net)中檢索草莓基因組中可能的KEA家族基因。檢索結(jié)果在Pfam(http://pfam.xfam.org/search)在線服務(wù)器預(yù)測(cè)功能結(jié)構(gòu)域。根據(jù)Phytozome獲得的草莓KEA基因CDS序列(coding sequence),分別設(shè)計(jì)引物,利用Prime STARTM HS DNA聚合酶(TaKaRa,大連)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,測(cè)序驗(yàn)證后,用于特異性表達(dá)引物設(shè)計(jì)。

      1.3 草莓KEA家族基因生物信息學(xué)分析

      在草莓基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得KEA家族各基因的CDS編碼區(qū)序列及基因組DNA序列,然后通過(guò)Gene structure display(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/index.php)在線服務(wù)器進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)分析,利用在線軟件TMpredict(http://ch.embnet.org/sofware/TMPRED_form.html)分析草莓KEA家族蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)域,使用在線服務(wù)器MEME(v4.8.1)(http://meme-suite.org/tools/meme)預(yù)測(cè)草莓KEA家族蛋白的保守結(jié)構(gòu)域,使用在線工具ProtParam(http://expasy.org/tools/protparam.html)評(píng)估KEA蛋白成員的理論等電點(diǎn)、分子量、穩(wěn)定性等理化性質(zhì),利用在線軟件SignalP4.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-4.0/)預(yù)測(cè)KEA家族蛋白的信號(hào)肽情況,利用PSORT在線服務(wù)器(http://psort.hgc.jp/form.html)預(yù)測(cè)草莓KEA家族蛋白的亞細(xì)胞定位,利用Phyre2在線服務(wù)器(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)分析草莓KEA家族蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu),利用ClustalX 2.0軟件對(duì)5個(gè)草莓KEA轉(zhuǎn)運(yùn)體與梨(12個(gè))、蘋果(7個(gè))、桃(5個(gè))、葡萄(4個(gè))、橙(5個(gè))、楊樹(shù)(4個(gè))等已知物種的同源KEA轉(zhuǎn)運(yùn)體進(jìn)行氨基酸序列比對(duì)分析[16],用分子進(jìn)化遺傳分析軟件MEGA7.0中的鄰接法(Neighbor-joining)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。利用Kang等建立的草莓不同發(fā)育階段的表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù)Strawber-ry Genomic Resources(http://bioinformatics.towson.edu/strawberry/)[18]獲得草莓KEA家族基因在不同組織的表達(dá)譜信息。為分析草莓KEA家族基因的啟動(dòng)子區(qū)域,在Phytozome草莓基因組數(shù)據(jù)庫(kù)檢索目的基因CDS區(qū)域起始密碼子ATG的上游1.5kb左右片段的啟動(dòng)子區(qū)域,并通過(guò)PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/ht-ml/)在線網(wǎng)站分析草莓KEA啟動(dòng)子序列中是否含有的cis-順式作用元件。

      1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析

      分別采集草莓5AF8不同部位的組織材料,液氮冷凍后-80C冰箱保存,通過(guò)MiniBESTPlantRNA Extraction Kit(TaKaRa,大連)提取樣品的總RNA,并利用PrimeScriptTM RT reagent Kit 反轉(zhuǎn)錄試劑盒(TaKaRa,大連)合成第一鏈cDNA作為模板,用于實(shí)時(shí)熒光定量PCR。利用NCBI/Primer-BLAST在線服務(wù)器,設(shè)計(jì)草莓KEA基因的特異性表達(dá)引物(表1),以草莓Ubiquitin(GenBank No.MH114011)為目的基因,通過(guò)ABI 7500實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀檢測(cè)KEA基因在草莓植株不同組織的表達(dá)特征。熒光染料使用SY BR Green(TaKa-Ra,大連),反應(yīng)體系參照說(shuō)明書,反應(yīng)程序?yàn)椋?5C預(yù)變性30s;95°C變性5s,609C退火34s(40個(gè)循環(huán));最后72 C延伸10s。每個(gè)樣品進(jìn)行3次重復(fù),不同樣品在實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀獲得相應(yīng)的Ct值,經(jīng)內(nèi)參基因Actin 均一化處理后,采用2-△OC’法計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)量[20]。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 草莓KEA家族基因的篩選與克隆

      以6個(gè)擬南芥KEA家族基因的氨基酸序列為參考,在Phytozome strawberry genome database(http://www.phytozome.net)草莓基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索到5個(gè)KEA家族基因,檢索結(jié)果在Pfam在線服務(wù)器預(yù)測(cè)到K/H交換結(jié)構(gòu)域(K/H exchanger domain)(PF00999)和TrkA-N domain(PF02254)功能結(jié)構(gòu)域,均屬于典型的KEA家族蛋白。檢索獲得各基因的堿基序列后,以CDS序列起始密碼子ATG和終止密碼子TAG所在位置20 bp左右的序列作為上下游引物,以5AF8草莓幼葉RNA反轉(zhuǎn)錄獲得的cDNA為模板,PCR擴(kuò)增各個(gè)候選基因的CDS序列,分別連接到pGEM-T載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)菌株DH5a,篩選陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子送北京擎科生物技術(shù)有限公司測(cè)序。經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證后,獲得草莓5AF8的KEA家族各基因的CDS序列及相應(yīng)翻譯得到的氨基酸序列,獲得的草莓KEA家族基因分別命名為FveKEAI~FveKEA5。

      2.2 7種不同科屬植物KEA家族成員的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)

      將草莓(薔薇科)、桃(薔薇科)、梨(薔薇科)、蘋果(薔薇科)、葡萄(葡萄科)、橙(蕓香科)、白楊(楊柳科)等7種不同科屬物種的KEA家族基因(表2),通過(guò)ClustalX 2.0進(jìn)行氨基酸水平的多重序列比對(duì)。結(jié)果表明,供試物種的KEA家族基因之間具有較高的同源性,同源關(guān)系較近的兩者之間的序列一致性均高于66.05%;7種植物42個(gè)KEA家族成員在氨基酸水平依然具有25.00%的一致性,在核苷酸水平具有25.60%的一致性;5個(gè)草莓KEA家族成員在氨基酸水平具有41.88%的一致性(圖1),在核苷酸水平具有40.97%的一致性。利用MEGA 7.0建立系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果表明,7種植物KEA家族成員可分為2個(gè)亞族,Group I和Group II,其中,草莓FveKEAI和FveKEA2屬于Group I,而FveKEA3、FreKEA4和FveKEA5屬于Group II(圖1和表3)。此外,7種植物KEA家族基因在遺傳進(jìn)化關(guān)系上有差異,草莓和薔薇科植物(蘋果和桃)、葡萄科葡萄、楊柳科白楊在遺傳距離上是較近的,其中,草莓FveKEA2和FreKEA4分別與葡萄VoKEA2和蘋果MdoKEA6緊密聚在一起,草莓FreKEAI、FveKEA3和FveKEA5分別與葡萄VvKEAI、白楊PtrKEA4桃Ppe-KEA4等相應(yīng)成員在遺傳距離上較近(圖1)。身為蕓香科植物,橙KEA成員則聚集在一起,與白楊PtrKEAI和PtrKEA2在遺傳距離上較近,且均屬于Group I亞族(圖1)。

      2.3 草莓KEA基因及編碼蛋白質(zhì)特征分析

      草莓KEA家族基因主要定位于1號(hào)(FveKEA5)、2號(hào)(FveKEA2和FrveKEA3)和7號(hào)(FveKEAI和FveKEA4)染色體上,含有至少27個(gè)長(zhǎng)度不一的內(nèi)含子,其中FreKEA3基因擁有最多(34個(gè))的內(nèi)含子數(shù)目(表3);FreKEAI基因CDS編碼區(qū)最長(zhǎng),其次是FveKEA3,F(xiàn)veKEA5最短,其編碼氨基酸數(shù)目和分子量與CDS長(zhǎng)度成正比(表2);保守基序分析結(jié)果表明草莓FveKEA1含有4個(gè)Motif基序(Motif4 ~Motif7),F(xiàn)veKEA2蛋白含有4個(gè)Motif基序(Motif2、Motif4、Motif6和Motif7),而FveKEA3、FveKEA4和FveKEA5均含有7個(gè)Motif基序,即Motif1~Motif7(圖2和表3)。蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析結(jié)果表明草莓FveKEA1、FveKEA2和FveKEA5擁有相似的三級(jí)結(jié)構(gòu),暗示這3個(gè)蛋白質(zhì)可能擁有相近的功能,而FveKEA3和FveKEA4則分別擁有獨(dú)特而差異明顯的三級(jí)結(jié)構(gòu)(圖2)。

      此外,F(xiàn)veKEA4的等電點(diǎn)(PI)>7.00,其他草莓KEA家族蛋白的等電點(diǎn)均小于7.00,表明FveKEA4含有的堿性氨基酸較多,而其他4個(gè)成員的酸性氨基酸較多;草莓KEA家族蛋白均含有12~14個(gè)跨膜區(qū),且只有FveKEA5具有信號(hào)肽,位于第22~23氨基酸區(qū)域;此外,F(xiàn)veKEA3蛋白的不穩(wěn)定指數(shù)>40,為不穩(wěn)定蛋白,而其他4個(gè)成員均小于40,為穩(wěn)定蛋白(表3)。

      2.4 草莓KEA基因啟動(dòng)子順式作用元件分析

      cis-順式作用元件預(yù)測(cè)結(jié)果表明,草莓KEA家族基因啟動(dòng)子區(qū)域鑒定到至少16種順式作用元件,包括營(yíng)養(yǎng)和發(fā)育、激素響應(yīng)、脅迫響應(yīng)、晝夜規(guī)律等不同生命過(guò)程的調(diào)控元件(表4)。其中,3種(光感應(yīng)、胚乳表達(dá)和脫落酸ABA響應(yīng))轉(zhuǎn)錄元件在全部5個(gè)FreKEA基因的啟動(dòng)子中均能預(yù)測(cè)到,茉莉酮酸甲酯(除FveKEA2基因)和赤霉素(除FveKEA5基因)響應(yīng)作用元件在4個(gè)基因的啟動(dòng)子區(qū)域能檢測(cè)到,水楊酸響應(yīng)、熱脅迫、厭氧感應(yīng)、干旱誘導(dǎo)、低溫感應(yīng)和生長(zhǎng)素響應(yīng)相關(guān)的順式作用元件均在不同的3個(gè)FrveKEA基因的啟動(dòng)子區(qū)域出現(xiàn),防御與脅迫、晝夜規(guī)律和真菌激發(fā)子響應(yīng)相關(guān)的順式作用元件均能在不同的2個(gè)FveKEA基因的啟動(dòng)子區(qū)域出現(xiàn),此外,玉米蛋白代謝(FveKEA2)和乙烯響應(yīng)(FveKEA3)相關(guān)的順式作用元件分別在一個(gè)FreKEA基因的啟動(dòng)子區(qū)域鑒定到(表4)。

      2.5 草莓KEA蛋白亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)及KEA基因表達(dá)譜分析

      亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果表明草莓FveKEA蛋白主要定位于細(xì)胞質(zhì)膜,其次是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜(FveKEA2除外)和液泡膜(FveKEA2和FveKEA5 除外),F(xiàn)veKEA2在葉綠體和線粒體等細(xì)胞器的膜上也有檢測(cè)到,F(xiàn)veKEA3也定位于核膜上(表5)。

      草莓表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù)Strawberry genomic resources檢索結(jié)果表明,草莓FveKEA基因在心皮、花藥、果皮、胚、去胚種子、胚珠、子房、花粉、幼苗、花柱、種皮、花粉粒、花瓣、花被和花托等多種組織中均能檢測(cè)到(圖3);FveKEAI和FveKEA4的表達(dá)量相對(duì)較高,其中,F(xiàn)veKEAI主要在花粉粒、花瓣、花被和花托中表達(dá),其次是花藥和幼苗,F(xiàn)veKEA2主要在幼苗中表達(dá),在花粉中表達(dá)量極低,F(xiàn)veKEA3主要在子房中表達(dá),F(xiàn)reKEA4主要在花柱、種皮和花藥中表達(dá),F(xiàn)veKEA5表達(dá)量較低,在種皮、花粉和胚中均少量表達(dá)(圖3)。

      2.6 草莓KEA家族基因組織特異性表達(dá)分析

      熒光定量PCR分析結(jié)果表明:FveKEAI~FveKEA5在草莓5AF8不同組織中的表達(dá)量有差異,F(xiàn)veKEAI在不同組織中的整體表達(dá)水平最高(特別是花瓣中),其次是FveKEA4,其他3個(gè)基因在草莓不同組織中的表達(dá)水平較為接近,均顯著低于FveKEAI和FveKEA4,與表達(dá)譜分析結(jié)果基本一致(圖4);在不同組織中,F(xiàn)veKEAI在花瓣和未成熟果實(shí)(包括綠果期、白果期和轉(zhuǎn)色期)中的表達(dá)量最高,其次是花藥,花柱中最低;FveKEA2在葉片的表達(dá)量最高,其次是根部,在花柱和花藥中的表達(dá)量最低;FveKEA3在不同組織中的表達(dá)量沒(méi)有顯著差異;FveKEA4在花柱和花藥等花器官中的表達(dá)水平最高,顯著高于其他組織;FveKEA5在花柱、花藥和未成熟果實(shí)(綠果期、白果期及轉(zhuǎn)色期)中的表達(dá)水平較高,顯著高于其他組織(圖4)。

      3 討論

      植物鉀素營(yíng)養(yǎng)研究中,KEA轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白是一類維持體內(nèi)K+/H+動(dòng)態(tài)平衡并參與滲透調(diào)節(jié)和pH穩(wěn)定的逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體。有關(guān)K+吸收、轉(zhuǎn)運(yùn)、卸載和分配的研究較為詳盡[21],而對(duì)同時(shí)轉(zhuǎn)運(yùn)K+和H+的KEA轉(zhuǎn)運(yùn)體的研究較少。然而,相關(guān)報(bào)道主要集中在模式作物擬南芥,果樹(shù)作物KEA轉(zhuǎn)運(yùn)體的具體功能依然未知。

      基因組測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展,為果樹(shù)作物的科學(xué)研究提供了基因資源。本研究從薔薇科植物中克隆并鑒定了5個(gè)FveKEA轉(zhuǎn)運(yùn)體基因,與薔薇科桃和蕓香科橙中KEA基因成員數(shù)目一致,與葡萄科葡萄和楊柳科白楊接近,而遠(yuǎn)低于同屬薔薇科果樹(shù)的梨和蘋果,表明,同一家族基因成員的數(shù)目在同一科屬的不同作物之間差異較大,而在相同科屬的不同作物之間可能相同或相近,暗示基因功能的多樣性或差異性。此外,不同物種KEA家族成員在遺傳進(jìn)化關(guān)系上存在差異,草莓和同屬薔薇科植物(蘋果和桃)在遺傳距離上較近,而蕓香科植物橙KEA成員則集中聚集在-起,與薔薇科和葡萄科果樹(shù)作物KEA進(jìn)化關(guān)系較遠(yuǎn)。在5個(gè)草莓KEA轉(zhuǎn)運(yùn)體中,F(xiàn)veKEA1和FveKEA2同屬于Group I,且具有相似的Motif和高級(jí)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),暗示進(jìn)化關(guān)系上相近的(同一亞族)且具有類似蛋白質(zhì)Motif基序的2個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)體之間可能具有相似的功能,而FveKEA3、FveKEA4和FveKEA5同屬于GroupII,且具有7個(gè)相同的Motif,但在高級(jí)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)上差異很大,暗示遺傳關(guān)系相近的成員可能在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中發(fā)生了不同功能的演變。

      Kunz等報(bào)道擬南芥AtKEA1~AtKEA3主要定位于細(xì)胞質(zhì)膜_上[13-14,16],本研究中亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)結(jié)果表明草莓FveKEA1~FveKEA5主要分布在細(xì)胞質(zhì)膜上,與Kunz等報(bào)道相一致。Han等[12]報(bào)道指出擬南芥AtKEAI和AtKEA3主要在地上部表達(dá),而其他4個(gè)成員基因在植物全身均有表達(dá);Chen等[2]報(bào)道GmKEA家族基因在大豆不同組織中均有表達(dá),且差異顯著。本研究熒光定量PCR結(jié)果表明草莓KEA家族基因在試驗(yàn)草莓根部、葉片、花器官和不同發(fā)育期果實(shí)等多種組織中均有表達(dá),且與轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜分析結(jié)果相一致。Zhou等[18]報(bào)道梨KEA家族基因在花粉形成不同時(shí)期的表達(dá)量極低,但沒(méi)有研究其在其他組織中的表達(dá)特征,與之相應(yīng)的是,草莓KEA家族基因在盛開(kāi)期花粉中的表達(dá)量相對(duì)較低,與之不同的是,草莓KEA家族基因在花藥中均有表達(dá),F(xiàn)veKEAI和FveKEA4較為顯著。特別是,F(xiàn)veKEAI在草莓不同檢測(cè)組織中的整體表達(dá)水平最高,在花瓣和未成熟果實(shí)中尤為突出,推測(cè)FveKEAI可能是在花開(kāi)放和草莓幼果發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用的K+/H+逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體。果實(shí)成熟是一個(gè)復(fù)雜的生物學(xué)過(guò)程,伴隨各種代謝產(chǎn)物的積累和轉(zhuǎn)化,而在成熟期草莓果實(shí)中,除FrveKEA4外,其他4個(gè)基因的表達(dá)水平顯著下降,推測(cè)這些基因編碼的KEA逆向轉(zhuǎn)運(yùn)體的功能在果實(shí)成熟時(shí)期發(fā)揮的較少,所需的K+較少,有可能將胞內(nèi)的K+外排或者向其他組織(如韌皮部或葉片)轉(zhuǎn)移,這與同為鉀離子轉(zhuǎn)運(yùn)體的KT/HAK/KU家族轉(zhuǎn)運(yùn)體類似[23]。

      此外,在草莓FveKEAI~FveKEA5啟動(dòng)子區(qū)域鑒定到多種順式作用元件,且均含有光感應(yīng)、胚乳特異表達(dá)和ABA響應(yīng)的作用元件,說(shuō)明多種順式作用元件易與草莓KEA啟動(dòng)區(qū)的關(guān)鍵元件相結(jié)合進(jìn)而調(diào)控KEA家族基因的表達(dá)水平。特別地,擬南芥[17]和大豆21中KEA家族基因在轉(zhuǎn)錄水平易受ABA處理的調(diào)控,本研究中草莓KEA基因啟動(dòng)子區(qū)域均含有ABA響應(yīng)的作用元件,暗示該家族基因有類似的滲透響應(yīng)和調(diào)節(jié)的作用,這為進(jìn)一步研究草莓KEA轉(zhuǎn)運(yùn)體的功能及其調(diào)控機(jī)理提供了理論支持。

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