劉裕峰,朱天輝,劉應高,譙天敏,李姝江,龍旭梅,韓 珊
(四川農(nóng)業(yè)大學 林學院,四川 成都 611130)
植物已進化出各種防御機制以對抗病原微生物,在被病原體感染后,植物調(diào)節(jié)大量防御相關基因的轉(zhuǎn)錄表達[1]。其中,一些編碼具有抗微生物特性的病原體相關蛋白,例如葡聚糖酶和幾丁質(zhì)酶,或參與抗微生物化合物(例如植物抗毒素)的生物合成的酶,從而有助于整體防御反應。其他基因編碼在引發(fā)植物防御反應的信號轉(zhuǎn)導途徑中起作用的蛋白質(zhì)。
在植物中,對防御相關基因的及時轉(zhuǎn)錄調(diào)控對于擊敗病原體至關重要。WRKY家族蛋白是參與植物防御反應途徑調(diào)節(jié)的轉(zhuǎn)錄因子[2]。WRKY轉(zhuǎn)錄因子構成信號網(wǎng)絡的組成部分,調(diào)節(jié)許多植物過程,如葉子衰老[3]、種子發(fā)育[4]和植物對各種脅迫的反應,如生物脅迫和非生物脅迫[5-6]。WRKY轉(zhuǎn)錄因子含有1個或2個保守的DNA結(jié)合區(qū)域,稱為WRKY結(jié)構域[7]。WRKY結(jié)構域長約60個氨基酸殘基,其N-末端含有高度保守的氨基酸基序WRKYGQK,C-末端含有非典型的鋅指結(jié)構基序[8]。鋅指結(jié)構是C-X4-5C-X22-23-H-X-H或C-X7-C-X23-H-X-C[9]。重要的是這2個基序?qū)τ赪RKY蛋白特異性結(jié)合稱為W-box的DNA序列基序(C/T)TGAC(C/T)至關重要[10],其發(fā)生在WRKY蛋白質(zhì)控制下的基因啟動子中。許多與防御有關的基因,包括PR基因,在其啟動子區(qū)域含有W-box[9]。病原體調(diào)節(jié)和/或水楊酸(SA)調(diào)節(jié)的擬南芥WRKY基因的啟動子基本上富含W-box[11],表明WRKY基因的防御調(diào)節(jié)表達涉及轉(zhuǎn)錄激活和通過自我調(diào)節(jié)機制介導的抑制。
使用遺傳學和分子生物學方法逐漸闡明了各種WRKY轉(zhuǎn)錄因子的功能。越來越多的證據(jù)表明它們參與調(diào)節(jié)植物防御反應[12]。例如,病原體感染或用激素處理迅速誘導幾種植物物種中的WRKY基因表達。在黃瓜中,有4個WRKY基因的表達在植株遭受鐮刀菌酸(FA)處理后受到差異調(diào)節(jié)[13]。在馬鈴薯中,過表達StWRKY1的品系顯示出對致病疫霉的抗性增強[14]。過量表達西蘭花BoWRKY6的突變體表現(xiàn)出對霜霉病(Hyaloperonosporaparasitica)的高度抗性[15]。香蕉MaWRKY18基因可能在香蕉與病原菌(Fusariumoxysporum)互作過程中介導抗病性[16]。除了防御反應,WRKY轉(zhuǎn)錄因子也參與調(diào)節(jié)某些非生物應激反應。例如,在寒冷脅迫下水稻OsWRKY71過表達株系中2種冷應答基因OsTGFR和WSI76的表達升高,表明OsWRKY71是耐寒性的正調(diào)節(jié)因子[17]。WRKY基因的功能在各種植物中廣泛研究。
板栗(CastaneamollissimaBL)屬殼斗科(Fagaceae)栗屬(Castanea)植物,世界重要的干果之一,具有較高的營養(yǎng)價值。然而,栗疫病(Cryphonectricaparasitica)的出現(xiàn),嚴重阻礙了其發(fā)展。通過基因工程的手段能夠提高板栗的抗病性,而WRKY轉(zhuǎn)錄因子在抗病過程中起著重要作用。目前為止,還未見到板栗WRKY基因的相關研究報道。本研究以板栗大紅袍為研究對象,從中分離了WRKY轉(zhuǎn)錄因子,并對其進行生物信息學和原核表達分析,旨在為該基因表達蛋白的純化、功能研究以及探討該基因在板栗抗病過程中的調(diào)控作用奠定基礎。
板栗(大紅袍)幼苗來自四川農(nóng)業(yè)大學林學院;pMD19-T載體、反轉(zhuǎn)錄試劑盒購于TaKaRa公司(大連);DNA凝膠回收純化試劑盒購于索萊寶科技有限公司(北京);質(zhì)粒提取試劑盒購于天根生化科技有限公司(北京);感受態(tài)細胞DH5α及BL21(DE3)購于全式金生物技術有限公司(北京);BamH Ⅰ、XhoⅠ限制性內(nèi)切酶、T4DNA連接酶購于NEB有限公司(北京);pET-28a載體由四川農(nóng)業(yè)大學林木病理實驗室提供。
取100 mg健康板栗幼葉,經(jīng)液氮充分研磨后,使用多糖多酚植物總RNA提取試劑盒提取總RNA,提取的RNA通過紫外分光光度法測定其濃度和純度;板栗cDNA的合成參照TaKaRa公司反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書。
參照板栗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(http://www.fagaceae.org/)和NCBI中其他樹種WRKY基因保守序列設計特異性引物CmWRKY-F1:5′-ATGGATACCAAA GAAGCAGAGAG-3′,CmWRKY-R1:5′-TCATCGTCGC TTGTCTTTACTT-3′。擴增反應程序為:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸2 min, 40個循環(huán)。使用DNA膠回收試劑盒純化回收目的片段,回收片段與pMD19-T載體16 ℃過夜連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,于Amp/X-gal/LB平板上進行藍白斑篩選,隨機挑取經(jīng)PCR鑒定后的陽性克隆菌液,送上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司測序。
通過Blast進行基因序列同源性比對分析;分別運用ProtParam和ProtScale分析其編碼蛋白的理化性質(zhì)和疏水性;利用ScanProsite分析編碼蛋白的功能位點及功能域;通過SPOMA和SWISS-MODEL對蛋白的二級結(jié)構和三級結(jié)構進行預測;分別使用TMHMM Server v. 2.0和SignalP 4.1 Server預測編碼蛋白的跨膜區(qū)和信號肽;利用MEGA 6.05繪制系統(tǒng)進化樹。
根據(jù)板栗CmWRKY基因序列設計1對引物CmWRKY-F2:5′-CGGGATCCATGGCTTTCCGGCCTCT AT-3′(下劃線為BamHⅠ酶切位點),CmWRKY-R2:5′-CCGCTCGAGTCAAGGGCATTCTTTCTCA-3′(下劃線為XhoⅠ酶切位點)。以pMD19T-CmWRKY質(zhì)粒為模板,進行PCR擴增,反應程序同1.3。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,純化回收目的片段。使用BamH Ⅰ和XhoⅠ內(nèi)切酶分別酶切目的片段與pET-28a載體,酶切產(chǎn)物回收后16 ℃連接12 h。重組質(zhì)粒pET28a-CmWRKY轉(zhuǎn)化BL21(DE3)感受態(tài)細胞,經(jīng)卡那抗性篩選后,挑取單菌落于LB液體培養(yǎng)基擴增培養(yǎng)后進行PCR鑒定,提取陽性菌液質(zhì)粒,經(jīng)BamH Ⅰ 和XhoⅠ 雙酶切鑒定后,送上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司測序。
將pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)單菌落接種于LB液體培養(yǎng)基(含Kan,100 μg/mL)中,于37 ℃、180 r/min振蕩培養(yǎng)12 h。菌液擴增培養(yǎng)(V/V,1∶100),當菌液OD600值約為0.6~0.8時,進行蛋白的誘導表達。以終濃度為0.2,0.4,0.6,0.8,1.0 mmol/L IPTG誘導6 h,收集1 mL菌液進行SDS-PAGE電泳檢測,篩選最優(yōu)IPTG誘導濃度;以上述最優(yōu)IPTG濃度分別進行2,4,6,8,10 h不同時間長度的誘導,篩選最優(yōu)誘導時間長度;最后,分別以25,30,37 ℃進行誘導表達,篩選最優(yōu)誘導溫度。以上述最優(yōu)條件誘導表達CmWRKY蛋白,吸取1 mL菌液,12 000 r/min室溫離心10 min收集菌體,加入60 μL PBS Buffer(pH值7.4)重懸后,再次加入適量溶菌酶,利用液氮反復凍融6~8次,12 000 r/min 4 ℃離心20 min。分別收集上清和沉淀(用8 mol/L尿素4 ℃螯合30 min)。加入20 μL 4×Protein sds-page loading Buffer混勻,煮沸10 min,冷卻后12 000 r/min 4 ℃離心10 min,取10 μL上清進行蛋白電泳檢測。
以板栗幼苗葉片cDNA為模板進行PCR擴增,核酸電泳檢測顯示,在約1 500 bp位置處可見1條清晰的條帶(圖1)。該條帶純化回收后,與pMD19-T載體連接,轉(zhuǎn)化產(chǎn)物經(jīng)過菌落PCR篩選陽性克隆,將鑒定的陽性克隆進行測序。測序結(jié)果通過生物信息學驗證,發(fā)現(xiàn)獲得1 437 bp的CmWRKY基因片段。
M. DL2000;1. 以cDNA為模板的PCR產(chǎn)物。M. DL2000; 1. PCR product of cDNA.
DNAMAN序列分析表明,該基因的開放閱讀框(ORF)為1 437 bp,編碼479個氨基酸(圖2),將其核苷酸序列提交GenBank,基因登錄號:KY312850.1。BlastN比對結(jié)果顯示,該序列與巴旦木(Prunuspersica)等植物的WRKY基因一致性均在80%以上,其中與西班牙栓皮櫟(Quercussuber)WRKY基因一致性最高,達到97%,表明CmWRKY基因?qū)儆诎謇鮓RKY基因家族成員。
使用在線工具ExPASy ProtParam對CmWRKY蛋白質(zhì)序列進行相關信息分析,結(jié)果表明:CmWRKY蛋白分子式為C2242H3589N675O734S12,分子質(zhì)量為52.128 96 ku;理論等電點為9.15;在組成CmWRKY蛋白的所有氨基酸中,丙氨酸(Ala)比例最高,占總氨基酸量的7.1%,蛋氨酸(Met)和色氨酸(Trp)比例最低,均為總氨基酸量的0.6%;其含有53個負電性氨基酸殘基(Asp+Glu),66個正電性氨基酸殘基(Arg+Lys);脂肪族氨基酸指數(shù)60.17,總平均疏水指數(shù)-0.872,屬于親水性蛋白。在線工具Motif發(fā)現(xiàn),CmWRKY蛋白序列含有2個WRKY保守結(jié)構域,2個C2H2鋅指結(jié)構域(C-X4-C-X22-23-H-X-H),屬于WRKY家族的第Ⅰ組(圖2),BlastP分析進一步表明其屬于WRKY家族(圖3)。利用Clustal X1.81和ESPript 3.0軟件對CmWRKY及與其具有較高一致性的同源基因進行氨基酸序列上的比對分析,結(jié)果如圖4所示,CmWRKY與西班牙栓皮櫟(Quercussuber)、核桃(Juglansregia)、哥倫比亞錦葵(Herraniaumbratica)及可可樹(Theobromacacao)WRKY功能區(qū)域的氨基酸序列高度保守,C2H2鋅指結(jié)構域也較為保守,推測CmWRKY與其高度同源的基因在調(diào)控特定的基因中發(fā)揮著相似的功能。
灰色區(qū)域.WRKY轉(zhuǎn)錄因子的特征序列WRKYGQK;下劃線.鋅指結(jié)構域C2H2,其中C和H殘基用方框標出;*.終止密碼子。The grey region. Characteristic sequence WRKYGQK of the WRKY transcription factor; The underlined portion zinc finger domain C2H2, wherein the C and H residues are indicated by boxes; *.The stop codon.
圖3 CmWRKY蛋白保守功能域Fig.3 The conserved domains of WRKY protein
圖4 CmWRKY與其他植物WRKY蛋白質(zhì)序列多重對比Fig.4 Multiple alignment of the deduced protein of CmWRKY with other plant WRKY proteins
在線軟件SignalP 4.1 Server對CmWRKY蛋白的氨基酸序列進行分析,發(fā)現(xiàn)CmWRKY蛋白不含信號肽,不屬于分泌型蛋白。通過TMHMM Server v.2.0預測CmWRKY蛋白跨膜區(qū)域,結(jié)果表明,該蛋白不含跨膜區(qū)域。利用SOPMA軟件分析,發(fā)現(xiàn)CmWRKY蛋白二級結(jié)構中,不規(guī)則卷曲結(jié)構(Random coil)所占比例最大,為73.01%;α-螺旋(Alpha helix)次之,為12.55%;延伸鏈結(jié)構(Extended strand)比例為11.09%;β-轉(zhuǎn)角(Beta turn)最少,僅為3.35%(圖5)。CmWRKY蛋白的三級結(jié)構分析表明,該轉(zhuǎn)錄因子的WRKY結(jié)夠域與AtWRKY1非常相似[18](圖6),推測CmWRKY蛋白可能具有與AtWRKY1相類似的調(diào)控功能。同時,其結(jié)構域主要由4個β-折疊組成,依次為β-折疊1:WRKYGQK;β-折疊2:RSYYKC;β-折疊3:KKKVER;β-折疊4:AEIVYK。
最長豎線.α-螺旋;第2長豎線.延伸鏈;第3長豎線.β-轉(zhuǎn)角;最短豎線.無規(guī)則卷曲;橫向數(shù)值.氨基酸位置。The longest vertical bars.α-helix; The second longest vertical bars. Extended strand; The third longest vertical bars. Beta turn; The shortest vertical bars. Random coil; The horizontal numbers .The position of amino acid.
β-折疊1.WRKYGQK;β-折疊2.RSYYKC;β-折疊3.KKKVER;β-折疊4.AEIVYK。β-strand1. WRKYGQK; β-strand2.RSYYKC; β-strand3.KKKVER; β-strand4.AEIVYK.
為了解CmWRKY蛋白和其他植物WRKY蛋白之間的進化關系,利用系統(tǒng)進化分析軟件Mega 6.05,通過鄰接法(Neighbor-Joining)方法構建CmWRKY與NCBI數(shù)據(jù)庫中29種植物WRKY的系統(tǒng)進化樹(圖7)。系統(tǒng)進化樹分析結(jié)果顯示,薔薇目(Rosales)、金虎尾目(Malpighiales)、錦葵目(Malvales)、無患子目(Sapindales)-(蕓香科,Rutaceae)、殼斗目(Fagales)-(殼斗科,F(xiàn)agaceae)植物分別聚集在一起;其中,薔薇目下的榆科(Ulmaceae)、薔薇科(Rosaceae)及豆科(Fabaceae)植物又分別聚集在一起,相比豆科植物,榆科植物與薔薇科植物親緣關系更近;金虎尾目下的大戟科(Euphorbiaceae)植物聚集在一起。同時,葡萄(Vitisvinifera)和獼猴桃(Actinidiachinensis)由于均為藤本植物而聚集在一個分支。這些結(jié)果都符合植物的生物進化規(guī)律。
板栗與同為殼斗科的西班牙栓皮櫟親緣關系最近,其次為核桃,與蕓香科植物親緣關系也較近。這與CmWRKY和它們之間的氨基酸序列同源性較高相符合。
圖7 Neighbor-joining(NJ)方法構建CmWRKY蛋白與其他植物WRKY蛋白的系統(tǒng)進化樹Fig.7 Phylogenetic tree between CmWRKY protein and other plant WRKY protein by Neighbor-Joining(NJ)method
帶酶切位點的板栗CmWRKY基因片段和pET-28a載體經(jīng)BamH Ⅰ和XhoⅠ酶切后,回收酶切產(chǎn)物,產(chǎn)物通過T4DNA連接酶構建重組表達載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)。提取陽性菌液重組質(zhì)粒,通過雙酶切鑒定可見預期大小的片段(圖8)。測序結(jié)果進一步表明,pET28a-CmWRKY原核表達載體構建成功。
M.DL5000;1.重組質(zhì)粒pET28a-CmWRKY雙酶切產(chǎn)物;2.重組質(zhì)粒pET28a-CmWRKY。M.DL5000; 1.Double enzyme product of pET28a-CmWRKY; 2.pET28a-CmWRKY plasmid.
為進一步CmWRKY蛋白的功能研究提供試驗基礎,對該蛋白進行原核誘導表達。
IPTG濃度對CmWRKY蛋白表達的影響。選擇0.2,0.4,0.6,0.8,1.0 mmol/L 5個不同的IPTG濃度,在37 ℃下誘導6 h,經(jīng)SDS-PAGE電泳分析顯示(圖9-A),在各IPTG濃度下均能誘導表達出一條預期大小的融合蛋白,分子質(zhì)量約為56 ku(CmWRKY蛋白52 ku+His-tag標簽蛋白4 ku),且對照組均無目的蛋白表達,但不同IPTG濃度間表達量無明顯差異。以0.2 mmol/L IPTG作為最優(yōu)誘導濃度。
誘導時間對CmWRKY蛋白表達的影響。pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)分別誘導2,4,6,8,10 h。結(jié)果顯示,不同誘導時間長度對該蛋白的表達量影響較為明顯,隨時間的增加,CmWRKY蛋白的表達量逐漸增加,在10 h蛋白的表達量達到最大(圖9-B)。因此,選擇誘導10 h作為最優(yōu)誘導時間。
誘導溫度對CmWRKY蛋白表達的影響。pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)加入0.2 mmol/L IPTG分別在25,30,37 ℃下誘導10 h。結(jié)果顯示(圖9-C),25 ℃誘導條件下幾乎無目的蛋白產(chǎn)生;30 ℃誘導條件下有目的蛋白產(chǎn)生且主要以可溶性蛋白的形式存在;37 ℃條件下誘導的目的蛋白可溶性量較少,主要以包涵體的形式存在。因此,選擇30 ℃作為pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)最優(yōu)誘導溫度。
M. 蛋白質(zhì)分子量標準;A. IPTG誘導濃度的優(yōu)化:1. pET28a-BL21(DE3)未誘導;2. pET28a-BL21(DE3)誘導(0.6 mmol/L IPTG)6 h; 3-8. 終濃度為0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0 mmol/L IPTG;B. 誘導時間的優(yōu)化:1. pET28a-BL21(DE3)未誘導;2. pET28a-BL21(DE3)誘導(0.2 mmol/L IPTG)6 h;3-8. 誘導0,2,4,6,8,10 h;C. 誘導溫度的優(yōu)化:1. pET28a-BL21(DE3)未誘導;2. pET28a-BL21(DE3)誘導(0.2 mmol/L IPTG)10 h;3. 未誘導;4. 25 ℃誘導上清;5. 25 ℃誘導沉淀;6. 30 ℃誘導上清;7. 30 ℃誘導沉淀;8. 37 ℃誘導上清;9. 37 ℃誘導沉淀。
M. Protein Marker; A. Optimization of IPTG induced concentration: 1. pET28a-BL21(DE3)without IPTG induction; 2. pET28a-BL21(DE3)was induced for 6 h(0.6 mmol/L IPTG); 3-8. pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced by 0, 0.2, 0.4, 0.6, 0.8, 1.0 mmol/L IPTG; B. Optimization of induction time: 1. pET28a-BL21(DE3)without IPTG induction; 2.pET28a-BL21(DE3)was induced for 6 h(0.2 mmol/L IPTG); 3-8. pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced for 0, 2, 4, 6, 8, 10 h; C. Optimization of induction temperature: 1. pET28a-BL21(DE3)without IPTG induction; 2. pET28a-BL21(DE3)was induced for 10 h(0.2 mmol/L IPTG); 3.pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)without IPTG induction; 4.Supernatant of pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced at 25 ℃; 5.Precipitate of pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced at 25 ℃; 6.Supernatant of pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced at 30 ℃; 7.Precipitate of pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced at 30 ℃; 8.Supernatant of pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced at 37 ℃; 9.Precipitate of pET28a-CmWRKY-BL21(DE3)was induced at 37 ℃.
圖9 重組表達質(zhì)粒pET28a-CmWRKY誘導條件的優(yōu)化
Fig.9 Optimization of induction condition of pET28a-CmWRKYplasmid
植物中WRKY蛋白基于存在的WRKY結(jié)構域的數(shù)量和鋅指的類型,WRKY蛋白質(zhì)已被分類為Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ組,具有2個WRKY結(jié)構域的WRKY蛋白質(zhì)屬于第Ⅰ組,具有一個WRKY結(jié)構域的蛋白質(zhì)基于鋅指基序的特征屬于第Ⅱ組或第Ⅲ組[19]。通過氨基酸序列分析,本研究所克隆的CmWRKY蛋白具有2個WRKY結(jié)構域和2個鋅指結(jié)構,屬于第Ⅰ組。CmWRKY三級結(jié)構以AtWRKY1蛋白為模板同源建模獲得,Duan等[18]發(fā)現(xiàn)在AtWRKY1中,轉(zhuǎn)錄因子AtWRKY1與DNA的結(jié)合能力是由β2與β3之間的β折疊區(qū)域決定的,推測其與擬南芥AtWRKY1蛋白具有相似的功能。Agarwal等[20]研究發(fā)現(xiàn),WRKY結(jié)構域由4條β-折疊組成,鋅配位Cys/His殘基形成鋅結(jié)合口袋,而本研究獲得的CmWRKY三級結(jié)構,也由4條β-折疊組成,與其研究結(jié)果一致。系統(tǒng)進化分析表明,CmWRKY蛋白與其他物種間的WRKY蛋白同源性較高,與同為殼斗科的西班牙栓皮櫟親緣關系最近,其次為核桃,聚集為一個分支。西班牙栓皮櫟QcWRKY蛋白功能未見相關報道,核桃JrWRKY4參與低溫脅迫反應[21],推測CmWRKY可能也參與低溫脅迫的生理過程。
為進一步研究板栗CmWRKY蛋白的生物學功能,利用基因工程技術構建了pET28a-CmWRKY原核表達載體,轉(zhuǎn)入BL21(DE3)后進行原核表達,獲得了分子質(zhì)量約為56 ku的目的蛋白,比預測分子質(zhì)量略大,主要是由于His-tag標簽序列造成的[22]。大腸桿菌作為常用的原核表達系統(tǒng),除了選擇合適的載體和表達菌株之外,IPTG濃度、誘導時間及誘導溫度等培養(yǎng)條件對其蛋白表達也具有較大的影響[10]。本研究也從這3個方面對CmWRKY蛋白的誘導表達進行優(yōu)化,以期獲得最大量的目的蛋白。SDS-PAGE分析顯示,不同IPTG濃度下均能誘導表達出預期大小的融合蛋白,且不同誘導濃度間表達量并無差異,而低濃度IPTG誘導有助于可獲得較多的可溶性蛋白[10],因此,選擇低濃度IPTG(0.2 mmol/L)誘導。隨著誘導時間的增加,CmWRKY蛋白表達量 逐漸增加,在10 h時表達量達到最大。本研究發(fā)現(xiàn),CmWRKY蛋白在較高溫度(37 ℃)誘導下,主要以包涵體的形式存在。研究表明,高溫條件下,蛋白表達過快,不能正常折疊,容易形成包涵體[23]。但在較低溫度(25 ℃)誘導下,幾乎無目的蛋白產(chǎn)生,可能是溫度過低的原因。而在30 ℃誘導溫度下,CmWRKY蛋白主要以可溶性蛋白的形式存在。因此,利用大腸桿菌表達系統(tǒng),在30 ℃,0.2 mmol/L IPTG誘導表達菌株10 h能獲得最大量的可溶性CmWRKY蛋白。
本研究成功從板栗中克隆了一個CmWRKY基因,其氨基酸序列中含有2個WRKY保守結(jié)構域和2個C2H2鋅指結(jié)構域,屬于WRKY家族的第Ⅰ組。利用多種生物信息學軟件分析了CmWRKY基因的同源性、蛋白質(zhì)結(jié)構、系統(tǒng)進化等相關信息。初步探索了CmWRKY基因的原核表達情況,為其蛋白功能研究奠定了基礎,也為揭示該基因在板栗抗病過程的分子調(diào)控打下基礎。