韓翠翠 劉立琨 王玉春 楊瑩 劉吉成 周忠光
(1. 齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院,齊齊哈爾 161006;2. 黑龍江中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,哈爾濱 150040;3. 齊齊哈爾醫(yī)學(xué)院醫(yī)藥科學(xué)研究院,齊齊哈爾 161006)
TOX高遷移率蛋白盒家族成員(TOX highmobility box protein group family member3,TOX3)基因?yàn)楦哌w移率蛋白(High mobility group,HMG)家族成員之一。2007年,Easton等[1]通過全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study,GWAS)發(fā)現(xiàn)其與乳腺癌易感性相關(guān)。隨后,在不同人群的GWAS研究中進(jìn)一步證實(shí)了TOX3與乳腺癌的發(fā)展存在強(qiáng)烈的相關(guān)性[2-14]。研究發(fā)現(xiàn)其在乳腺癌組織中通常過表達(dá),而在正常乳腺組織中低表達(dá)或表達(dá)缺失[15],且與臨床TNM分期分級(jí)密切相關(guān),與乳腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移也存在相關(guān)性[16]。但其在乳腺癌惡性病變進(jìn)程中所發(fā)揮的具體生物學(xué)功能尚不明確。因此,構(gòu)建穩(wěn)定沉默TOX3基因的乳腺癌細(xì)胞模型對(duì)于深入研究其在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程中的作用及機(jī)制則尤為重要。
本研究擬構(gòu)建TOX3 RNAi慢病毒表達(dá)載體,通過熒光顯微鏡觀察轉(zhuǎn)染效率,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR及Western blot檢測(cè)轉(zhuǎn)染后ZR-75-1細(xì)胞內(nèi)TOX3 mRNA及蛋白表達(dá)水平,構(gòu)建穩(wěn)定沉默TOX3基因的乳腺癌細(xì)胞模型,并初步探討干擾TOX3基因的表達(dá)對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖的影響,旨為進(jìn)一步深入研究TOX3基因在乳腺癌發(fā)展進(jìn)程中的生物學(xué)功能奠定實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
人乳腺癌ZR-75-1細(xì)胞、人腎上皮293T 細(xì)胞均購(gòu)于中科院上海細(xì)胞庫(kù);胎牛血清、1640培養(yǎng)基和DMEM培養(yǎng)基均購(gòu)自Gibco公司;慢病毒載體質(zhì)粒、包 裝 質(zhì) 粒(pGag/Pol、pRev、pVSV-G) 及 RNAi-Mate轉(zhuǎn)染試劑均購(gòu)于蘇州吉瑪基因股份有限公司;DNA內(nèi)切酶(BamHI、EcoRI)和T4 DNA連接酶購(gòu)自MBI Fermentas公司;DNA凝膠回收試劑盒購(gòu)自天根生化科技有限公司;中量抽提試劑盒購(gòu)自杭州愛思進(jìn)生物技術(shù)有限公司;嘌呤霉素購(gòu)自美國(guó)Sigma公司;PCR引物由生工生物工程(上海)有限公司合成,反轉(zhuǎn)錄試劑盒及實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒購(gòu)自日本TaKaRa公司,兔抗人TOX3單克隆抗體購(gòu)自Abcam公司;抗兔二抗購(gòu)自美國(guó)Cell Signaling公司。
1.2.1 靶向TOX3基因shRNA慢病毒表達(dá)載體的構(gòu)建 GenBank 搜索TOX3基因序列(NM_00108043-0.2),依據(jù)shRNA序列設(shè)計(jì)原則,設(shè)計(jì)合成3條干擾靶序列及1條陰性對(duì)照序列。退火合成雙鏈DNA,T4 DNA連接酶連接線性化LV3-shRNA載體;制備感受態(tài)細(xì)胞DH5α;挑取陽性克隆,抽提質(zhì)粒后進(jìn)行測(cè)序鑒定。靶向TOX3基因干擾序列,如表1所示。
表1 針對(duì)TOX3基因的3個(gè)干擾靶序列
1.2.2 慢病毒包裝 將293T細(xì)胞培養(yǎng)于含有10%FBS、100 IU/mL青霉素和100 μg/mL鏈霉素的DMEM 培養(yǎng)基中,置于37℃、5% CO2飽和濕度培養(yǎng)箱中常規(guī)培養(yǎng)。待其生長(zhǎng)到80%左右融合時(shí),將空質(zhì)粒pGLV3/H1/GFP-Puro、重組質(zhì)粒pGLV3/H1/GFPPuro-shTOX3、和包裝質(zhì)粒pGag/Pol、pRev、pVSV-G按比例加入裝有1.5 mL無血清培養(yǎng)基的離心管中,混勻。另將轉(zhuǎn)染試劑RNAi-Mate加入裝有1.5 mL無血清的培養(yǎng)基中,混勻。室溫放置5 min后,將兩管試劑混勻。室溫放置20-25 min后,去除培養(yǎng)皿中的舊培養(yǎng)液,加入新的無血清培養(yǎng)液,將混合液加入細(xì)胞培養(yǎng)液中,于細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)4-6 h。除去轉(zhuǎn)染液,加入含血清DMEM培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)72 h。吸取細(xì)胞上清液到離心管中,低速離心,0.45 μm過濾,在4℃ 20 000 r/min條件下超速離心2 h,收集濃縮液。
1.2.3 病毒滴度檢測(cè) 在檢測(cè)病毒滴度前1 d,以3×104個(gè)/孔的細(xì)胞密度將293T細(xì)胞接種于96孔板中。常規(guī)培養(yǎng)24 h后,用含有10%FBS的培養(yǎng)基將10 μL慢病毒原液10倍稀釋4個(gè)梯度。吸棄96孔板內(nèi)的舊培養(yǎng)液,加入稀釋好的病毒液,每孔100 μL,于培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24 h后,將病毒液吸出,每孔加入完全培養(yǎng)基100 μL,繼續(xù)培養(yǎng)72 h。于熒光顯微鏡下計(jì)數(shù)表達(dá)綠色熒光細(xì)胞的數(shù)目。并結(jié)合相應(yīng)的稀釋倍數(shù)計(jì)算病毒滴度。
1.2.4 轉(zhuǎn)染ZR-75-1細(xì)胞并建立穩(wěn)定的細(xì)胞系 取生長(zhǎng)狀態(tài)良好的ZR-75-1細(xì)胞,以5×104個(gè)細(xì)胞/孔的細(xì)胞密度接種于24孔板內(nèi),加入500 μL完全培養(yǎng)基,過夜。將慢病毒液按照預(yù)實(shí)驗(yàn)得到的合適的感染參數(shù)(Multiplicity of infection,MOI)加入到含有聚凝胺的400 μL培養(yǎng)基中,使聚凝胺的終濃度為5 μg/mL。同時(shí)設(shè)立空白對(duì)照組(未轉(zhuǎn)染的ZR-75-1細(xì)胞)、陰性對(duì)照LV3-NC組(轉(zhuǎn)染空載體)、TOX3-shRNA-1組、TOX3-shRNA-2組和TOX3-shRNA-3組。12 h后棄掉含有病毒液的培養(yǎng)基,加入完全培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)48 h。棄掉舊培養(yǎng)基,加入含有嘌呤霉素2 μg/mL的篩選培養(yǎng)基(經(jīng)預(yù)實(shí)驗(yàn)確定ZR-75-1細(xì)胞的最小死亡濃度為2 μg/mL),每2-3 d更換篩選培養(yǎng)基,連續(xù)培養(yǎng)7 d,隨后更換為濃度為1 μg/mL的篩選培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)。獲得具有抗性的轉(zhuǎn)染細(xì)胞,熒光顯微鏡下觀察表達(dá)GFP細(xì)胞的比例。篩選出穩(wěn)定轉(zhuǎn)染的抗性陽性克隆,擴(kuò)大培養(yǎng)。所建立的細(xì)胞分別命名為TOX3-shRNA-1、TOX3-shRNA-2、TOX3-shRNA-3和LV3-NC。
1.2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)ZR-75-1細(xì)胞TOX3mRNA的表達(dá) 應(yīng)用Trizol提取各組細(xì)胞總RNA,將其逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀檢測(cè)TOX3 mRNA的表達(dá)。PCR反應(yīng)引物如下:β-actin:上游引物 :5′-CTGGGACGACATGGAGAAAA-3′,下游引物:5′-AAGGAAGGCTGGAAGAGTGC-3′;TOX3:上游引物 :5′-TATGCCTCACACATCTCCTTCA-3′,下游引物 :5′-ATGGCTCTGTTGGCTTCATC-3′。PCR 反應(yīng)條件為第一步:95℃ 30 s,1個(gè)循環(huán);第二步:變性:95℃ 5 s;退火:60℃ 31 s,40個(gè)循環(huán)。
1.2.6 Western blot檢測(cè)ZR-75-1細(xì)胞TOX3蛋白的表達(dá) 收集各組細(xì)胞,應(yīng)用RIPA強(qiáng)效裂解液提取各組細(xì)胞總蛋白,采用BCA法檢測(cè)蛋白濃度并定量。取20 μg蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳,轉(zhuǎn)膜,采用BSA封閉液4℃封閉過夜。加入兔抗人TOX3單克隆抗體(1∶2 000),小鼠抗人GAPDH多克隆抗體(1∶3 000),室溫孵育3 h,TBST洗膜,HRP標(biāo)記的山羊抗兔二抗(1∶3 000),馬抗小鼠二抗(1∶3 000)室溫孵育2 h,TBST洗膜,ECL顯影,曝光。
1.2.7 MTT法檢測(cè)TOX3對(duì)細(xì)胞增殖能力的影響 將各組細(xì)胞以3×103個(gè)/孔細(xì)胞密度接種于96孔板中,每組設(shè)5個(gè)復(fù)孔,常規(guī)培養(yǎng)過夜。次日棄掉舊培養(yǎng)基,每孔加入200 μL新鮮培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)。于檢測(cè)當(dāng)日加入20 μL MTT溶液,37℃孵育4 h。終止培養(yǎng),小心吸出上清液,每孔加入DMSO 150 μL,室溫震蕩使結(jié)晶充分溶解。于570 nm波長(zhǎng)處,應(yīng)用酶標(biāo)儀檢測(cè)各孔吸光度值。以時(shí)間為橫坐標(biāo),測(cè)得的吸光度值為縱坐標(biāo),繪制第0天至第7天各組細(xì)胞的生長(zhǎng)曲線。
1.2.8 平板單克隆形成實(shí)驗(yàn) 將各組細(xì)胞接種于6孔板內(nèi),使細(xì)胞密度為3 000個(gè)/孔。視細(xì)胞生長(zhǎng)情況每3-4 d換液一次,連續(xù)培養(yǎng)14 d后,除去舊培養(yǎng)基,PBS清洗。加入冰甲醇固定10 min。再用PBS洗2次。加入0.1%結(jié)晶紫染色10 min,PBS洗去結(jié)晶紫。計(jì)細(xì)胞數(shù)大于50個(gè)的集落數(shù),采用凝膠成像分析系統(tǒng)拍照,計(jì)算集落形成率。集落形成率(%)=計(jì)數(shù)細(xì)胞集落數(shù)/細(xì)胞總數(shù)集×100%。
抽提3組重組載體質(zhì)粒,經(jīng)測(cè)序鑒定結(jié)果(圖1)顯示,各組質(zhì)粒序列正確。
病毒滴度檢測(cè)結(jié)果(圖2)顯示,經(jīng)病毒包裝重組質(zhì)粒 TOX3-shRNA-1,TOX3-shRNA-2,TOX3-shRNA-3的病毒滴度分別為3×108TU/mL,4×108TU/mL和2×108TU/mL。
經(jīng)嘌呤霉素篩選后,熒光顯微鏡下觀察表達(dá)GFP的細(xì)胞比例。結(jié)果(圖3)顯示LV3-NC組、TOX3-shRNA-1組、TOX3-shRNA-2組 和TOX3-shRNA-3組GFP表達(dá)均約達(dá)到95%以上。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果(圖4)顯示,與空白對(duì)照組比較,空載體LV3-NC組TOX3 mRNA的相對(duì)表達(dá)無明顯差異(P>0.05),而與空載體LV3-NC對(duì)照組比較,不同的TOX3-shRNA干擾序列均顯示出明顯的干擾效果(P<0.05),其中TOX3-shRNA-3組的mRNA表達(dá)水平最低,干擾效率最高。
圖1 TOX3-shRNA干擾質(zhì)粒測(cè)序圖譜
圖2 重組慢病毒轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞后GFP的表達(dá)(×40)
圖3 經(jīng)嘌呤霉素篩選后ZR-75-1細(xì)胞的GFP表達(dá)(×40)
蛋白檢測(cè)結(jié)果(圖5)顯示,與空白對(duì)照組比較,空載體LV3-NC組TOX3蛋白的相對(duì)表達(dá)無明顯差異(P>0.05)。與空載體LV3-NC對(duì)照組比較,不同干擾序列TOX3蛋白的表達(dá)水平均明顯降低(P<0.05),其中 TOX3-shRNA-3組 TOX3蛋白水平最低,與實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果一致。因此,在后續(xù)實(shí)驗(yàn)中我們選取TOX3-shRNA-3組細(xì)胞作為研究TOX3基因?qū)θ橄侔┘?xì)胞增殖活性影響的細(xì)胞模型。
圖4 轉(zhuǎn)染ZR-75-1細(xì)胞后TOX3 mRNA的相對(duì)表達(dá)
圖5 轉(zhuǎn)染后各組細(xì)胞TOX3蛋白的相對(duì)表達(dá)
圖6 干擾TOX3基因?qū)R-75-1細(xì)胞增殖的影響
圖7 干擾TOX3對(duì)ZR-75-1細(xì)胞單克隆形成的影響
穩(wěn)定干擾TOX3基因的表達(dá)后,采用MTT實(shí)驗(yàn)觀察0-7 d干擾TOX3基因?qū)R-75-1細(xì)胞增殖的影響。實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖6)顯示:與空白對(duì)照組比較,陰性對(duì)照組細(xì)胞增殖活性沒有顯著變化。與陰性對(duì)照組比較,隨著時(shí)間的推移TOX3-shRNA-3組細(xì)胞的增殖能力明顯下降。平板單克隆實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖7)顯示,與陰性對(duì)照組比較,干擾TOX3基因后,細(xì)胞的集落形成率明顯降低,單克隆形成能力減弱。
乳腺癌疾病已成為女性死亡的重要原因,目前尚未完全闡明其發(fā)病機(jī)制。研究認(rèn)為其惡性表征相關(guān)基因的異??赡転槠浒l(fā)病機(jī)制之一。TOX3屬于HMG家族成員之一,此家族蛋白在調(diào)控基因表達(dá)及細(xì)胞增殖分化等方面均起重要作用。近年研究發(fā)現(xiàn)TOX3與乳腺癌易感性相關(guān)[1]。隨后,在不同人群的GWAS研究也中進(jìn)一步證實(shí)了TOX3與乳腺癌的危險(xiǎn)性存在強(qiáng)烈相關(guān)性[2-14]。此外,研究發(fā)現(xiàn),與ER陰性乳腺癌相比,位于TOX3基因上的多態(tài)性位點(diǎn)與ER陽性乳腺癌具有更強(qiáng)的相關(guān)性[4,15]。在ER陽性,HER2陰性乳腺癌患者中,TOX3基因的rs3803662多態(tài)性位點(diǎn)可作為絕經(jīng)前和絕經(jīng)后婦女乳腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)測(cè)因子之一[16],但TOX3基因在乳腺癌發(fā)展中的作用機(jī)制尚不清楚,相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道也較少。研究發(fā)現(xiàn)乳腺癌組織中TOX3蛋白的表達(dá)量明顯高于正常組織,且其表達(dá)水平與臨床TNM分期和分級(jí)具有明顯相關(guān)性[17],在生存期較短的乳腺癌患者中,TOX3的mRNA表達(dá)水平較高,且其表達(dá)水平與乳腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)[18]。此外,Smid等[19]研究發(fā)現(xiàn)TNRC9(TOX3)基因在乳腺癌患者骨中高表達(dá),認(rèn)為TOX3可能是乳腺癌骨轉(zhuǎn)移相關(guān)基因。研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)過表達(dá)TOX3基因可促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移,并可通過下調(diào)BRCA1的表達(dá)增強(qiáng)乳腺癌細(xì)胞侵襲能力;干擾TOX3基因后,成瘤率明顯降低,且形成的腫瘤也明顯減?。?0]。因此,TOX3在乳腺癌的發(fā)展進(jìn)程中發(fā)揮重要作用,對(duì)乳腺癌的發(fā)展可能是一個(gè)危險(xiǎn)因素。
RNA干擾是近年用于研究特定基因功能的常用技術(shù),其可精確沉默或敲除特定基因,對(duì)基因的抑制作用強(qiáng)且特異性高,為基因的功能學(xué)研究提供了有效的研究方法[21]。RNA干擾常用的表達(dá)載體主要有慢病毒、腺病毒和質(zhì)粒,其中慢病毒載體能夠?qū)⒛康幕蚋咝У恼系剿拗骷?xì)胞的基因組內(nèi),使目的基因在傳代的過程中仍可長(zhǎng)期穩(wěn)定表達(dá),其應(yīng)用范圍較廣,轉(zhuǎn)染效率高,不產(chǎn)生化學(xué)轉(zhuǎn)染等方法引起的細(xì)胞損傷反應(yīng),是目前進(jìn)行基因功能研究和基因治療的有力工具。研究者應(yīng)用慢病毒表達(dá)載體構(gòu)建穩(wěn)定過表達(dá)TOX3基因的乳腺癌MDA-MB-231細(xì)胞系,結(jié)果表達(dá)GFP細(xì)胞的數(shù)目達(dá)95%以上,且轉(zhuǎn)染后MDA-MB-231細(xì)胞內(nèi)TOX3的表達(dá)明顯升高[22]。在RNAi實(shí)驗(yàn)中,能否抑制目的基因的表達(dá),靶序列的設(shè)計(jì)非常重要。研究者通過設(shè)計(jì)合成3條FUT8基因的shRNA干擾靶序列,經(jīng)退火,線性化連接,構(gòu)建FUT8基因的RNAi慢病毒表達(dá)載體,并將其轉(zhuǎn)染到乳腺癌MCF-7細(xì)胞中,轉(zhuǎn)染效率達(dá)90%,各干擾組FUT8 mRNA和蛋白的表達(dá)均明顯降低,其中pGC-shFUT8-2 序列的干擾效率最高,且發(fā)現(xiàn)干擾FUT8基因后,MCF-7細(xì)胞增殖能力下降[23]。在本研究中,根據(jù)GeneBank中提供的TOX3基因序列,針對(duì)基因不同位點(diǎn),按照設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)合成3條shRNA靶序列,并將其連接到LV3-shRNA中,進(jìn)行重組克隆,經(jīng)測(cè)序驗(yàn)證,序列正確,成功構(gòu)建了shRNA表達(dá)載體。我們將構(gòu)建好的TOX3-shRNA表達(dá)載體,經(jīng)病毒包裝,采用慢病毒載體轉(zhuǎn)染自身高表達(dá)TOX3基因的人乳腺癌細(xì)胞系ZR-75-1,通過嘌呤霉素篩選后,熒光顯微鏡下觀察表達(dá)綠色熒光蛋白的細(xì)胞數(shù)目可達(dá)95%以上,獲得穩(wěn)定轉(zhuǎn)染TOX3基因的細(xì)胞系ZR-75-1。通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR和Western blot進(jìn)一步驗(yàn)證干擾效果,篩選出干擾效果最好的靶序列TOX3-shRNA-3,成功獲得了穩(wěn)定沉默TOX3基因的乳腺癌細(xì)胞系ZR-75-1,并將其確定為后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究細(xì)胞模型。MTT實(shí)驗(yàn)和平板克隆實(shí)驗(yàn)初步探討干擾TOX3基因的表達(dá)對(duì)乳腺癌細(xì)胞增殖的影響。研究發(fā)現(xiàn)干擾TOX3可使ZR-75-1細(xì)胞的增殖能力下降,單克隆形成能力減弱,而TOX3基因的其他生物學(xué)功能及調(diào)控機(jī)制仍需進(jìn)一步研究。
本研究成功構(gòu)建TOX3基因的RNAi慢病毒載體,并獲得穩(wěn)定沉默TOX3基因的乳腺癌ZR-75-1細(xì)胞系,初步發(fā)現(xiàn)沉默TOX3后ZR-75-1細(xì)胞的增殖能力下降。