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    GMPS,PR,CD40和p21對(duì)卵巢癌預(yù)后的預(yù)測(cè)價(jià)值(Prognostic values of GMPS,PR CD40,and p21 in ovarian cancer全譯)

    2019-07-11 07:50:28王萍張?jiān)隼?/span>馬予潔路君趙虎王水良譚建明李冰燕
    關(guān)鍵詞:卵巢癌基因差異

    王萍 張?jiān)隼?馬予潔 路君 趙虎 王水良 譚建明 李冰燕

    卵巢癌致死率在女性疾病中處于領(lǐng)先地位。上皮性卵巢癌約占所有類型卵巢癌的90%[1]并且在癌細(xì)胞已經(jīng)轉(zhuǎn)移到其他器官的晚期階段才被診斷出來[2]。比如,卵巢癌只占所有女性癌癥的2.5%,但是在女性癌癥死亡率中卻占了5%,其表明卵巢癌5年生存率很低[2]。然而,如果早期確診,5年生存率將會(huì)達(dá)到93%[3]。因此,早期腫瘤診斷和有效預(yù)后預(yù)測(cè)是提高卵巢癌患者生存的關(guān)鍵。為此,之前有研究已經(jīng)評(píng)估了生物標(biāo)記物以便及早診斷這種致命的疾病并預(yù)測(cè)生存或治療效果,或針對(duì)生物標(biāo)記基因開發(fā)新的卵巢癌治療靶點(diǎn)[2]。有一些研究也分析粘液性和透明卵巢細(xì)胞癌之間,低級(jí)別與低惡性潛能和高級(jí)別轉(zhuǎn)移性卵巢癌之間的差異基因表達(dá)模式[2-4]。有報(bào)道發(fā)現(xiàn)基因或基因表達(dá)的改變與卵巢癌的早期診斷或風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的生物標(biāo)志物相關(guān)聯(lián)[5-6]。然而,迄今為止,沒有可用于此目的有用(可靠)的分子及臨床標(biāo)記物[7]。目前使用基因表達(dá)譜尋找差異基因的方法多是比較卵巢癌與正常組織差異,這會(huì)導(dǎo)致獲取數(shù)據(jù)有限。早期前驅(qū)病變和卵巢癌之間的差異基因表達(dá)譜可用于卵巢癌的早期診斷、預(yù)測(cè)預(yù)后,并為治療靶標(biāo)的生物標(biāo)志物提供新的見解。

    本文根據(jù)Gamwell等[8]描述的方法建立并鑒定了小鼠上皮卵巢癌進(jìn)展的體外細(xì)胞模型。該細(xì)胞模型是從小鼠卵巢中分離卵巢表面上皮細(xì)胞(mouse ovarian surface epithelial cells,MOSECs)并在體外連續(xù)培養(yǎng)。這些MOSECs在體外可以發(fā)生自發(fā)的惡性轉(zhuǎn)化形成上皮卵巢癌細(xì)胞。在體外細(xì)胞培養(yǎng)和傳代期間,MOSECs顯示出形態(tài)變化和基因表達(dá)改變[8-11],這可能是模擬人卵巢癌發(fā)生的良好體外細(xì)胞模型。先前的研究表明,自發(fā)轉(zhuǎn)化的MOSECs具有HGSC腫瘤細(xì)胞所有特征。同時(shí)MOSE-I細(xì)胞具備癌前良性腫瘤所有特質(zhì),而MOSE-II細(xì)胞是惡性轉(zhuǎn)化細(xì)胞[10]。

    材料與方法

    一、試劑與儀器

    本研究的動(dòng)物方案經(jīng)福州總醫(yī)院動(dòng)物倫理委員會(huì)批準(zhǔn),并遵循美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院的監(jiān)管動(dòng)物護(hù)理指南。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物(上海斯萊克實(shí)驗(yàn)動(dòng)物有限公司),所述DMEM F12培養(yǎng)基(美國(guó)Thermo-Fisher Scientific 公司),4%熱滅活的胎牛血清(美國(guó)Gibco公司)。慶大霉素,青霉素和鏈霉素溶液(美國(guó)Invitrogen公司),EVOS XL成像系統(tǒng)(美國(guó)Thermo-Fisher Scientific 公司)。

    二、方法

    (一)分離與培養(yǎng)MOSECs

    根據(jù)Gamwell等[8]和McCloskey等[10]描述的方案,分離MOSECs并在“MOSE培養(yǎng)基”中培養(yǎng)它們,所述培養(yǎng)基來自Thermo-Fisher Scientific Company的DMEM F12培養(yǎng)基,補(bǔ)充有4%熱滅活的胎牛血清,5 U/ml青霉素和5 μg/ml鏈霉素溶液,0.1 μg/ml慶大霉素,在 37 ℃,5%CO2下培養(yǎng)。根據(jù)先前的研究[9],具有自發(fā)惡性轉(zhuǎn)化表型的MOSECs維持在MOSE培養(yǎng)基中,其會(huì)經(jīng)歷2個(gè)階段,即早期階段(MOSE-Ⅰ;正常上皮細(xì)胞)和晚期階段(MOSE-Ⅱ;卵巢癌細(xì)胞的各種表型)。

    (二)MOSE-I和MOSE-II細(xì)胞的培養(yǎng)和特征鑒定

    為了誘導(dǎo)MOSECs的自發(fā)惡性轉(zhuǎn)化,本研究在MOSECs培養(yǎng)基中連續(xù)培養(yǎng)和傳代原代MOSECs。小于35代的MOSECs細(xì)胞命名為MOSE-Ⅰ細(xì)胞,MOSE-Ⅰ繼續(xù)培養(yǎng)超過35代命名為MOSE-Ⅱ細(xì)胞。使用0.05%胰蛋白酶消化并傳代細(xì)胞,用磷酸鹽緩沖鹽水(PBS)洗滌,制備單細(xì)胞懸液,然后將100個(gè)細(xì)胞接種到35 mm細(xì)胞培養(yǎng)皿中,培養(yǎng)14 d。然后使用結(jié)晶紫染色,拍照,計(jì)數(shù)。在軟瓊脂測(cè)定中,在60 mm細(xì)胞培養(yǎng)皿中1 : 1混合2×Ham's F-12:MOSE培養(yǎng)基與瓊脂糖制備基層瓊脂。然后將細(xì)胞懸浮液(2.5×104)與超純LMP瓊脂糖在37 ℃下混合,然后將其倒入瓊脂基層頂部,并在37 ℃下孵育14 d。使用EVOS XL成像系統(tǒng)拍攝細(xì)胞克隆,并使用Image J軟件定量。

    (三)新一代測(cè)序技術(shù)檢測(cè)MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞之間差異表達(dá)基因

    為了分析MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞之間差異表達(dá)的基因,對(duì)MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞進(jìn)行了新一代測(cè)序。根據(jù)測(cè)序商的方案,使用Trizol Reagent從MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞中分離提取總細(xì)胞RNA。在RNA定量和逆轉(zhuǎn)錄成cDNA后,本研究使用Illumina TruSeq文庫(kù)制備每種細(xì)胞類型的cDNA文庫(kù),然后使用Illumina HiSeq 2000 NGS平臺(tái)對(duì)MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞之間的差異表達(dá)基因進(jìn)行新一代測(cè)序。GEPIA是一個(gè)網(wǎng)絡(luò)工具(http://gepia.cancer-pku.cn/),用于分析腫瘤和非腫瘤組織之間的基因表達(dá),并提供交互式數(shù)據(jù)分析。本研究利用這個(gè)在線工具分析卵巢癌標(biāo)本和正常對(duì)照之間四種選定顯著差異表達(dá)基因(different expression genes,DEGs)(即 GMPS,PR,CD40和p21)的水平。

    (四)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,構(gòu)建成蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)

    使用GO分析對(duì)這些DEGs進(jìn)行生物信息學(xué)分析,以注釋這些DEGs的獨(dú)特生物學(xué)功能。然后再使用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)一步分析了它們參與的信號(hào)通路。使用Fisher檢驗(yàn)生成GO術(shù)語(yǔ)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,并使用P值與錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率(FDR)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)校正。在使用GO術(shù)語(yǔ)和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)這些DEGs進(jìn)行生物信息學(xué)分析后,根據(jù)先前的報(bào)告使用STRING將這些DEGs構(gòu)建到PPI網(wǎng)絡(luò)中[12]。該網(wǎng)絡(luò)資源包含用于全面預(yù)測(cè)已知蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用的生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。將DEGs上傳到STRING數(shù)據(jù)庫(kù),然后網(wǎng)站為這些DEGs生成PPI。本研究使用P< 0.05的組合分?jǐn)?shù)作為截止標(biāo)準(zhǔn),以識(shí)別任何給定的蛋白質(zhì)與另一個(gè)蛋白質(zhì)相互作用,然后根據(jù)Saito等[13]之前的研究將這個(gè)PPI導(dǎo)入Cytoscape軟件,從而進(jìn)一步構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),其中通過計(jì)算連接到其他蛋白質(zhì)與非連接蛋白質(zhì)的程度來揭示中樞節(jié)點(diǎn)(具有重要生物學(xué)功能的關(guān)鍵蛋白質(zhì))。

    (五)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)和cBioPortal

    TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)用于存儲(chǔ)30種不同人類癌癥的差異表達(dá)基因和臨床病理學(xué)數(shù)據(jù)[14]。本研究檢索了浸潤(rùn)卵巢癌數(shù)據(jù)集,其中包括606例卵巢癌與311例正常組織的DEGs數(shù)據(jù)。然后,將DEGs數(shù)據(jù)放入 cBioPortal(www.cbioportal.org),這是一個(gè)幫助探索,可視化和分析DEG數(shù)據(jù)的Web資源。根據(jù)cBioPortal的在線說明計(jì)算這些DEGs對(duì)總生存期(OS)和無病生存期(DFS)的貢獻(xiàn)。此外,根據(jù)之前的研究,使用Kaplan-Meier Plotter在線工具(www.kmplot.com)生成了 GMPS,PR,Cd40和p21 mRNA水平表達(dá)并分析其卵巢癌患者的Kaplan-Meier曲線[15]。該網(wǎng)站包括4 142例卵巢癌患者的基因表達(dá)和存活數(shù)據(jù)。使用Kaplan-Meier曲線和對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)以及風(fēng)險(xiǎn)比的95%置信區(qū)間,分析了GMPS,PR,CD40和p21的高表達(dá)與低表達(dá)對(duì)卵巢癌患者的無復(fù)發(fā)生存期(RFS)影響。

    三、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法

    使用SAS9.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。細(xì)胞克隆形成率均使用表示。兩樣本之間的差異性分析使用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。以P< 0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    結(jié) 果

    一、 MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞的表型

    MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞的表型不同。MOSE-Ⅰ細(xì)胞的早期細(xì)胞增長(zhǎng)緩慢,而MOSE-Ⅱ的生長(zhǎng)速率增加。形態(tài)學(xué)上,MOSE-Ⅰ細(xì)胞在倒置顯微鏡下開始失去上皮“鵝卵石”樣外觀(圖1a、b)。MOSE-Ⅱ失去上皮“鵝卵石”樣形態(tài)并轉(zhuǎn)變?yōu)殚g充質(zhì)長(zhǎng)梭形(圖1a、b)。在瓊脂實(shí)驗(yàn)中,MOSE-Ⅱ細(xì)胞能夠在軟瓊脂中形成克隆,而MOSE-Ⅰ則不能(圖1c、b、d)。本研究還使用平板克隆形成實(shí)驗(yàn)測(cè)定評(píng)估了MOSECs的增殖能力,并發(fā)現(xiàn)MOSE-Ⅱ形成的克隆比MOSE-Ⅰ細(xì)胞形成的更大(圖1f、g、h、i)。

    二、對(duì)MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞之間差異表達(dá)基因的分析

    使用MOSE-Ⅰ和Ⅱ的細(xì)胞模型,并用Illumina HiSeq 2000 NGS平臺(tái)對(duì)DEGs進(jìn)行了分析。在第5代(P5),P15和P25分別隨機(jī)選擇MOSE-Ⅰ細(xì)胞,而在P50,P70和P90分別選擇MOSE-Ⅱ細(xì)胞。其中,檢測(cè)和分析了14 218個(gè)基因。發(fā)現(xiàn)總共263個(gè)DEGs,其中包括的182個(gè)上調(diào)的和81個(gè)下調(diào)(圖2)。上調(diào) DEGs的截點(diǎn)值是 log2 FC>2和P< 0.05,而下調(diào)的 DEGs是 log2 FC < -2,P< 0.05(表1)。

    三、關(guān)于DEGs的GO,KEGG和PPI網(wǎng)絡(luò)的生物信息分析

    GO分析表明這些DEGs在細(xì)胞生物學(xué)中形成了幾個(gè)重要分子功能,生物過程與細(xì)胞組分,如這些基因參與細(xì)胞增殖的正調(diào)節(jié),RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子的轉(zhuǎn)錄正調(diào)節(jié)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(圖3b)。KEGG信號(hào)通路富集顯示這些DEGs形成的中樞基因富集在與卵巢癌相關(guān)的PI3K-Akt信號(hào)通路中(圖3a),上述特征都與卵巢癌發(fā)展正相關(guān)[16-18]。此外,這些DEGs形成的PPI網(wǎng)絡(luò),如圖4所示。此網(wǎng)絡(luò)中有35個(gè)中樞節(jié)點(diǎn)基因其中包括27個(gè)上調(diào)基因和8個(gè)下調(diào)基因(表2)。

    圖1 MOSE-I和MOSE-II細(xì)胞的特征

    四、DEGs形成的核心基因的表達(dá)與卵巢癌患者的總體存活率的關(guān)聯(lián)性

    本研究使用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中數(shù)據(jù)將這些DEGs形成的中樞基因的表達(dá)與卵巢癌患者的OS和DFS相關(guān)聯(lián)。首先評(píng)估了來自263例浸潤(rùn)性卵巢癌患者的182個(gè)組織樣本中,發(fā)現(xiàn)35個(gè)核心基因中有 4個(gè)(GMPS,PR,CD40和p21)基因在卵巢癌組織中的改變率超過10%(圖5a)。然后,繪制了Kaplan-Meier曲線,并進(jìn)行了對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn),將它們與患者的OS和DFS相關(guān)聯(lián)。本研究結(jié)果顯示GMPS,PR,CD40和p21 mRNA的異常表達(dá)與患者中較差的OS相關(guān)(圖5b),但與患者中的DFS無關(guān)(圖5c)。

    實(shí)際上,這4個(gè)基因在卵巢癌與正常組織中均差異表達(dá)。GMPS在卵巢癌組織中高表達(dá)(圖6a),其與患者中RFS相關(guān)(圖6e)。相反,在卵巢癌組織中PR,CD40和p21 mRNA的表達(dá)降低(圖6b、c、d),這與不良的 RFS 相關(guān)(圖6f、g、h)。

    討 論

    本研究分析了惡變前的MOSE-Ⅰ和高度惡化的MOSE-Ⅱ細(xì)胞之間的DEGs,發(fā)現(xiàn)了182個(gè)上調(diào)的和81個(gè)下調(diào)的DEGs。生物信息學(xué)分析表明,這些DEGs能正調(diào)節(jié)細(xì)胞增殖,RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子的基因轉(zhuǎn)錄和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),而KEGG通路數(shù)據(jù)顯示這些DEGs可能與癌癥中PI3K-Akt信號(hào)通路有關(guān)。此外,這些DEGs的PPI網(wǎng)絡(luò)分析確定了35個(gè)中樞基因(27個(gè)上調(diào)基因和8個(gè)下調(diào)基因),其中4個(gè)與卵巢癌患者的總體存活率相關(guān)。此外這4個(gè)基因在卵巢癌組織與正常組織中均差異表達(dá)。具體而言,GMPS在卵巢癌組織中高表達(dá),其與RFS相關(guān),而PR、CD40和p21 mRNA的在卵巢癌組織中的表達(dá)降低,這與RFS不良相關(guān)??傊?,本研究分析并鑒定了4個(gè)DEGs,其可以預(yù)測(cè)卵巢癌患者的總體存活率和無復(fù)發(fā)存活率。然而本研究結(jié)果在臨床使用之前還需要進(jìn)一步的前瞻性臨床研究驗(yàn)證。

    表1 MOSE-I和MOSE-II細(xì)胞之間的差異表達(dá)基因

    圖2 使用火山圖表示所有差異表達(dá)基因(DEGs)

    這種卵巢癌體外惡性轉(zhuǎn)化的細(xì)胞模型是用于鑒定基因改變和藥物效應(yīng)測(cè)試的有用工具。在該系統(tǒng)中,體外培養(yǎng)的MOSECs可以自發(fā)地惡性轉(zhuǎn)化為卵巢癌細(xì)胞[10]。形態(tài)學(xué)上,MOSE-Ⅱ細(xì)胞失去了正常的上皮細(xì)胞“鵝卵石”特征,能夠形成軟瓊脂集落以及基因改變。當(dāng)將MOSE-Ⅱ細(xì)胞注射到免疫缺陷動(dòng)物的腹膜腔中時(shí),在小鼠腹膜腔中形成腫瘤轉(zhuǎn)移和血性腹水[19-20],這是典型的人晚期卵巢癌患者的表現(xiàn)[21]。2014年McCloskey等[10]發(fā)現(xiàn),MOSE-Ⅱ的差異表達(dá)基因與人類高級(jí)別漿液性卵巢癌(human high-grade serous ovarian cancer,HGSC)腫瘤樣本及其卵巢癌細(xì)胞系的差異基因一致。免疫組化分析后的HGSC腫瘤組織證實(shí)MOSE-Ⅱ可作為HGSC的同源模型。MOSE-Ⅱ似乎比卵巢癌細(xì)胞系更具攻擊性,體外克隆形成效率增加,體內(nèi)腫瘤發(fā)作更快[10]。因此,這種細(xì)胞模型可用于未來的卵巢癌預(yù)防和治療研究[22]。本研究使用該模型系統(tǒng)分析了MOSE-Ⅰ和MOSE-Ⅱ細(xì)胞之間的DEGs,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)分析確定35個(gè)中樞節(jié)點(diǎn)的其中9個(gè)基因參與PI3K-Akt信號(hào)通路。這證實(shí)了先前研究結(jié)論,表明PI3K-Akt為卵巢癌的潛在治療靶點(diǎn)[17]。PIK3CA突變或在高達(dá)30%的卵巢癌患者中擴(kuò)增,而PTEN在40%的患者中表達(dá)喪失[16,23]。此外,這35個(gè)中樞基因中的6個(gè)是Rap1信號(hào)通路的一部分,之前的一項(xiàng)研究報(bào)道它們與漿液性卵巢癌轉(zhuǎn)移相關(guān)[24]。

    表2 在所有差異基因中,點(diǎn)度中心值大于5的核心基因

    此外,GO分析顯示這些DEGs參與正向調(diào)控細(xì)胞增殖,這是癌癥六個(gè)基本標(biāo)志之一:生長(zhǎng)信號(hào)的自給自足[25]。實(shí)際上,細(xì)胞增殖的正向調(diào)節(jié)是癌癥發(fā)生和發(fā)展的基礎(chǔ)。在當(dāng)前研究中鑒定出的每一種生物學(xué)途徑都可以促進(jìn)或?qū)⒄<?xì)胞轉(zhuǎn)化為癌細(xì)胞[26]。本研究確定了4個(gè)基因特征來預(yù)測(cè)卵巢癌患者的總體存活率。GMPS是鳥苷5'-單磷酸合酶,是將黃嘌呤核苷一磷酸轉(zhuǎn)化為鳥苷一磷酸的酶。因此,GMPS在正常細(xì)胞增殖和腫瘤發(fā)生中重要的核苷酸生物合成酶。Reddy的數(shù)據(jù)顯示,TRIM21與USP7會(huì)聯(lián)合GMPS形成了一種分子級(jí)聯(lián)反應(yīng),可控制DNA損傷或核苷酸缺失時(shí)p53的穩(wěn)定性。因此,GMPS是一種促進(jìn)細(xì)胞生長(zhǎng)和DNA復(fù)制的經(jīng)典生物合成酶,也是p53限制細(xì)胞增殖的關(guān)鍵[27]。我們發(fā)現(xiàn)與非腫瘤組織相比,GMPS在卵巢癌組織中高表達(dá),并且GMPS表達(dá)與患者的RFS相關(guān)尚未有相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道。GMPS是肝癌細(xì)胞中重要的p53抑制靶點(diǎn)[28],這進(jìn)一步表明了GMPS在腫瘤發(fā)生中的重要性。PR作為核受體,其功能是調(diào)節(jié)激素響應(yīng)組織的發(fā)育和循環(huán),例如乳腺和生殖道。之前的研究表明PR表達(dá)作為預(yù)測(cè)子宮內(nèi)膜樣和高級(jí)別漿液性卵巢癌預(yù)后較好的生物標(biāo)志物[29-32],它會(huì)在卵巢癌的晚期缺失表達(dá)[33]。實(shí)際上,本研究也證實(shí)了以前的數(shù)據(jù):孕酮和孕激素對(duì)卵巢癌的發(fā)生具有保護(hù)作用,PR的表達(dá)是卵巢癌患者無進(jìn)展生存期延長(zhǎng)有利的預(yù)后標(biāo)志物[34-36]。CD40是跨膜糖蛋白和腫瘤壞死因子受體超家族的成員,其可介導(dǎo)多種免疫和炎癥反應(yīng)[37]。CD40經(jīng)常在不同的免疫細(xì)胞、內(nèi)皮細(xì)胞和上皮細(xì)胞中表達(dá)。CD40與CD40配體的結(jié)合會(huì)出現(xiàn)在人體的各種生理和病理過程[37-38]。CD40配體增強(qiáng)了上皮卵巢癌細(xì)胞對(duì)順鉑治療的敏感性[39]。CD40在卵巢癌細(xì)胞系和腫瘤樣品中高表達(dá),但在正常卵巢組織中不表達(dá)[40]。本研究中,與MOSE-Ⅰ細(xì)胞相比,MOSE-Ⅱ細(xì)胞中CD40表達(dá)升高;然而,卵巢癌組織中CD40表達(dá)降低,這與先前研究的結(jié)果相反[40]。因此,需要進(jìn)一步研究以確定這種差異的原因。p21也稱為CDKN1A是細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑1A,其功能是通過抑制Cdks調(diào)節(jié)的細(xì)胞生長(zhǎng)停滯,這是細(xì)胞周期從G1期轉(zhuǎn)變?yōu)镾期的關(guān)鍵[41]。通過與增殖細(xì)胞核抗原(PCNA)的相互作用,p21能夠抑制DNA復(fù)制[18]。p21在正常組織中高表達(dá),但在卵巢癌組織中減少,這與患者的更好的存活率相關(guān),與先前的研究一致[42]。實(shí)際上,之前的研究表明吡啶衍生物誘導(dǎo)的卵巢癌細(xì)胞衰老是通過p21激活而發(fā)生的[43]。然而,其他研究報(bào)道CDKN1A/p21表達(dá)促進(jìn)乳腺癌并介導(dǎo)其耐藥性[44-45]。臨床研究表明。p21高表達(dá)與胃癌和食管癌預(yù)后不良有關(guān)[46-47]。因此,需要進(jìn)一步研究以澄清這種差異。

    圖3 DEGs形成的中樞基因的功能和通路富集分析

    圖4 差異表達(dá)基因形成的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)

    圖5 前四個(gè)核心基因的鑒定與卵巢癌患者的存活率的關(guān)聯(lián)性

    圖6 GMPS,PR,CD40和p21在卵巢癌和正常組織之間的差異表達(dá)以及與卵巢癌患者的無復(fù)發(fā)存活率的關(guān)系

    當(dāng)然,本研究確實(shí)存在一些局限性。例如,只是描述了卵巢癌中差異表達(dá)的基因,并將它們與卵巢癌的預(yù)后相關(guān)聯(lián),進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,將其中四種基因與卵巢癌進(jìn)展聯(lián)系起來;在對(duì)卵巢癌發(fā)生和進(jìn)展中的生物學(xué)功能和作用還沒有更多的研究。此外,在臨床應(yīng)用之前,還需要對(duì)卵巢癌中的這些DEGs進(jìn)行進(jìn)一步的驗(yàn)證。

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