南京農(nóng)大構(gòu)建世界首個植物重復基因數(shù)據(jù)庫

日前，南京農(nóng)業(yè)大學園藝學院教授張紹鈴團隊系統(tǒng)鑒定了141種植物基因組中不同類型重復基因，構(gòu)建了世界首個植物重復基因數(shù)據(jù)庫，揭示重復基因進化的普遍規(guī)律。

以往研究發(fā)現(xiàn)，有的植物有復制自己基因的功能，即通過不同類型復制方式產(chǎn)生一個與原基因序列相同的新基因?；驈椭飘a(chǎn)生的兩個同源基因稱為重復基因或“姊妹基因”。近年來，越來越多的植物基因組被破譯，目前已經(jīng)完成全基因組測序的植物超過200種，但仍缺乏一個具有廣泛適用性的鑒定不同種類植物重復基因的方法。

該團隊通過大規(guī)模收集整合國內(nèi)外植物基因組數(shù)據(jù)資源，構(gòu)建了世界首個植物重復基因數(shù)據(jù)庫，目前已收錄141種完成基因組測序的植物，包含大豆、水稻、小麥、玉米等大宗糧食作物，以及梨、桃、葡萄、蔬菜、花卉等園藝作物，并將拓展為植物相關(guān)的所有類別。該數(shù)據(jù)庫將為深入研究重復基因的進化機制提供寶貴的數(shù)據(jù)資源。