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    CTX-M型超廣譜β-內(nèi)酰胺酶研究進展

    2019-01-07 00:28:53劉保光栗俞程汪保英苗明三許二平
    河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年12期
    關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)座子內(nèi)酰胺酶水解

    劉保光,栗俞程,汪保英,白 明,苗明三,許二平

    (1.河南中醫(yī)藥大學(xué) 科研實驗中心,河南 鄭州 450046;2.河南省仲景方藥現(xiàn)代研究重點實驗室,河南 鄭州 450046)

    近年來,隨著獸用抗菌藥的廣泛應(yīng)用,細菌耐藥問題變得日趨嚴峻,已成為全球性難以解決的問題。超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBLs)能夠水解含β-內(nèi)酰胺環(huán)類的抗生素,可被β-內(nèi)酰胺酶抑制劑抑制,其自身大多由質(zhì)粒介導(dǎo),同時是革蘭氏陰性菌對β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥最主要的機制,具有廣泛的水解酶活性[1]。產(chǎn)ESBLs的臨床菌株,不僅對β-內(nèi)酰胺環(huán)類藥物耐藥,而且還對氨基糖苷類、氟喹諾酮類藥物、多西環(huán)素、氟苯尼考等耐藥[2],表現(xiàn)出多重耐藥特性。

    CTX-M型ESBLs是一類對頭孢噻肟具有強大水解能力的酶。前人研究發(fā)現(xiàn),CTX-M型ESBLs耐藥基因可以通過質(zhì)粒、整合子、轉(zhuǎn)座子等可移動元件,在質(zhì)粒與染色體間,或從一個質(zhì)粒到另一個質(zhì)粒,或從一種細菌到另一種細菌進行轉(zhuǎn)移,具有復(fù)雜的遺傳傳播背景[3-5]。為此,針對近些年有關(guān)CTX-M型ESBLs的研究進展進行了綜述,以期為CTX-M型ESBLs菌株感染的防控和遺傳背景的深入研究提供參考。

    1 CTX-M型ESBLs的發(fā)現(xiàn)

    BAUERNFEIND等[6]于1989年首次發(fā)現(xiàn)了耐頭孢噻肟的1株大腸桿菌分離菌株(命名為CTX-M-1)。隨后,阿根廷學(xué)者于1990年從1株耐頭孢噻肟的沙門氏菌中檢測到CTX-M-2型ESBLs[7],CNIADKOWSKI等[8]在腸桿菌科細菌中發(fā)現(xiàn)了CTX-M-3型ESBLs。相繼檢出CTX-M型ESBLs感染菌株,使CTX-M型ESBLs菌株在眾多國家、地區(qū)的各種臨床菌株中得以流行,引起了人們對該型酶的很大關(guān)注,并迅速組成了一個穩(wěn)定增長的ESBLs成員[9-10]。

    2 CTX-M型ESBLs的種類

    目前,已發(fā)現(xiàn)的CTX-M型ESBLs已達上百余種(http://www.lahey.org/studies),呈現(xiàn)出快速增長的趨勢。而CTX-M型ESBLs的攜帶菌,主要是變形桿菌、大腸桿菌、肺炎克雷伯菌等革蘭氏陰性細菌,臨床發(fā)現(xiàn)CTX-M型ESBLs對頭孢噻肟具有較強的水解活性。依據(jù)基因同源性的不同,將CTX-M型酶分組 :①CTX-M-1系列,包含12種酶;②CTX-M-2系列,包含8種酶;③CTX-M-8系列,僅包括這1種酶;④CTX-M-9系列,共11種酶;⑤CTX-M-25系列,包括CTX-M-25和CTX-M-26這2種酶[11]。

    3 CTX-M型ESBLs的生化特性與產(chǎn)耐藥性

    CTX-M型ESBLs最主要的特征表現(xiàn)在大多數(shù)的CTX-M型ESBLs菌株對頭孢噻肟的水解能力遠高于對頭孢他啶的水解能力。頭孢他啶對產(chǎn)CTX-M型ESBLs菌株的最小中抑菌濃度(MIC)介于0.5~2.0 μg/mL,而頭孢噻肟的MIC介于8~256 μg/mL[12]??梢?,針對產(chǎn)CTX-M型ESBLs菌株,頭孢噻肟的水解率較頭孢他啶高出很多。因此,通過檢測頭孢他啶水解活性的高低,可以初步判斷出大多數(shù)CTX-M型ESBLs與TEM、SHV型的不同,以此進行初步分型。

    此外,CTX-M型ESBLs的菌株對β-內(nèi)酰胺酶抑制劑是敏感的。在臨床試驗中,針對大多數(shù)產(chǎn)TEM、SHV型ESBLs菌株,舒巴坦的抑制活性沒有克拉維酸強。分析其原因,這主要在于Arg-244位點能較好地與克拉維酸結(jié)合,該位點是TEM和SHV型ESBLs的重要位點。CTX-M型ESBLs菌株的Arg-276位點與Arg-244位點的結(jié)構(gòu)有一定的差異[13],這在一定程度上決定了β-內(nèi)酰胺酶抑制劑發(fā)揮作用的差異。

    氨基酸Asn-104-Glu突變后,CTX-M-14型酶對頭孢噻肟的水解能力大大降低,而對第一、二代頭孢類藥物的水解能力影響不明顯[14]。此外,根據(jù)已上傳的蛋白質(zhì)序列發(fā)現(xiàn),在CTX-M型ESBLs菌株中普遍存在Ser237位點,由此可見,Ser237位點在影響產(chǎn)CTX-M型ESBLs菌株的水解活性方面發(fā)揮了重要的作用。BOYD等[15]研究表明,CTX-M型ESBLs第167、240位的氨基酸位點,與頭孢他啶的水解活性能力有密切關(guān)系,這2個氨基酸位點能夠促進CTX-M型ESBLs與頭孢他啶的結(jié)合,使頭孢他啶的水解活性高于頭孢噻肟。

    4 CTX-M型ESBLs的流行病學(xué)

    大腸桿菌和肺炎克雷伯菌是產(chǎn)CTX-M型ESBLs菌株中最常見的細菌。自CTX-M-1型ESBLs首次報道以來,現(xiàn)今許多國家已發(fā)現(xiàn)產(chǎn)CTX-M型ESBLs菌株。在產(chǎn)ESBLs的腸桿菌科細菌中,CTX-M-2和CTX-M-3型ESBLs菌株占了重要比例[16]。在不同的國家和地區(qū),攜帶ESBLs菌株的分離率及基因亞型種類也有較大差異,CTX-M-15型在印度、尼日利亞多見[17],而CTX-M-9和CTX-M-14型在西班牙多見,我國臺灣地區(qū)主要以CTX-M-3、CTX-M-14型為常見基因亞型[18-19]。

    杜向黨等[20]發(fā)現(xiàn),河南地區(qū)雞、豬源大腸桿菌CTX-M型ESBLs的產(chǎn)生率較高, 以CTX-M-2型和CTX-M-9型為主。近年來,我國的浙江、北京、廣州等地區(qū)的流行菌株主要以產(chǎn)CTX-M型ESBLs菌株為主,多數(shù)同時與產(chǎn)TEM型廣譜酶共存。在檢測的30株虎源大腸桿菌中,產(chǎn)ESBLs的菌株有21株,陽性率高達70%,而CTX-M型基因的檢出率為50%[21]。趙鳳菊等[22]研究發(fā)現(xiàn),遼寧地區(qū)的產(chǎn)ESBLs豬源大腸桿菌的檢出率較高,TEM型和TEM+CTX-M型為主要流行的基因型。可見,各地產(chǎn)CTX-M型ESBLs的菌株存在一定差異。

    5 CTX-M型ESBLs基因可在質(zhì)粒間、質(zhì)粒和染色體之間轉(zhuǎn)移

    CTX-M型ESBLs編碼基因通常位于質(zhì)粒上,大多情況下與TEM-1共同存在于1個質(zhì)粒上。此外,TEM-2、SHV及OXA-1型的基因還可能存在這個質(zhì)粒上,質(zhì)粒的大小介于在7~160 kb,這提示了這些質(zhì)粒可攜帶多個或多類耐藥基因[23]。體外試驗發(fā)現(xiàn),CTX-M型ESBLs的質(zhì)粒通??赏ㄟ^接合傳遞的方式傳播,這可能是CTX-M型ESBLs菌株容易傳播流行的原因。從產(chǎn)CTX-M-17型菌株中提取的質(zhì)粒較小,在10 kb以下,不具有接合基因的功能,為非接合型質(zhì)粒[24]。然而,這種較小的非自我傳播的特殊質(zhì)粒,也可以進行傳播,它主要是通過轉(zhuǎn)化的形式來實現(xiàn)。在波蘭腸桿菌科的7種不同細菌中均發(fā)現(xiàn)了具有相同耐藥性的CTX-M-3型的質(zhì)粒[25]。

    PALUCHA等[26]從臨床分離的大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)存在第二染色體插入的CTX-M型基因。在波蘭華沙檢測出2種性質(zhì)截然不同的質(zhì)粒上都攜帶CTX-M-3型基因[27]。我國在大腸桿菌和陰溝腸桿菌的質(zhì)粒和染色體上同時檢出CTX-M型ESBLs基因[28]??梢?,CTX-M型基因能夠移動,且移動能力很強,可使CTX-M型基因能夠在質(zhì)粒與質(zhì)粒間及質(zhì)粒和染色體間進行互相傳遞,從而達到快速散播的目的。

    6 CTX-M型ESBLs的轉(zhuǎn)位因子及基因轉(zhuǎn)移的遺傳環(huán)境

    臨床中攜帶的絕大部分CTX-M型ESBLs基因,主要是由可接合的能夠轉(zhuǎn)移的質(zhì)粒所攜帶的,與之相關(guān)的轉(zhuǎn)位因子,如插入序列ISEcp1、IS903、轉(zhuǎn)座子及整合子等,目前還不明確。一些攜帶有ESBLs基因亞型(如CTX-M-2、CTX-M-3、CTX-M-9、CTX-M-15型等)的基因能夠定位在轉(zhuǎn)座子、整合子等可轉(zhuǎn)移的元件上[29]。此外,位于CTX-M型基因上游的ISEcp1移動元件對耐藥基因的傳播發(fā)揮了重要的作用[30]。

    6.1 ISEcp1、IS903插入序列

    SINGH等[31]研究發(fā)現(xiàn),產(chǎn)CTX-M型ESBLs基因的轉(zhuǎn)移和表達與插入序列的性質(zhì)有密切的關(guān)系。ECKERT等[32]研究發(fā)現(xiàn),在大腸桿菌、肺炎克雷伯菌、沙門氏菌等多種細菌中發(fā)現(xiàn)了ISEcp1插入序列,屬于IS1380成員。CASELLA等[33]發(fā)現(xiàn),插入序列ISEcp1在CTX-M型ESBLs基因的上游較為常見,CTX-M-14型基因的上游都存在ISEcp1,而其他CTX-M型的基因上游也大多存在ISEcp1。FERNANDEZ等[34]研究發(fā)現(xiàn),ISEcp1序列常常位于CTX-M基因的上游,在特定情況下,可以提供CTX-M表達所需要的啟動子。LARTIGUE等[35]研究發(fā)現(xiàn),插入序列ISEcp1可以重復(fù)出現(xiàn)在攜帶CTX-M-l、2、3、9、13、14、15、17、19、21型基因上游的42~266 bp位置。其后發(fā)現(xiàn)CTX-M-14型和CTX-M-1型5的上游存在ISEcp1,同時發(fā)現(xiàn)在CTX-M-15型基因的下游也存在ISEcp1序列,這就闡釋了CTX-M型基因的移動是一個較為復(fù)雜的過程[36]。

    此外,DIESTRA等[37]發(fā)現(xiàn),產(chǎn)CTX-M-14型基因的上游和下游分別存在插入序列ISEcp1和IS903,這與HU等[38]報道的CTX-M-14型基因的上下游分別出現(xiàn)插入序列ISEcp1、IS903相吻合。LARTIGUE等[39]發(fā)現(xiàn),產(chǎn)CTX-M-14型基因的上游和下游也分別出現(xiàn)插入序列ISEcp1和IS903??梢?,2個序列在CTX-M-14型基因的傳播中具有重要的作用,能夠使之進行大量傳播,這揭示了CTX-M型ESBLs基因在腸桿菌科細菌中能夠廣泛傳播。

    ISEcp1插入序列,又稱為轉(zhuǎn)座單元,它是CTX-M型基因的重要傳播載體。JIANG等[40]研究發(fā)現(xiàn),常見的轉(zhuǎn)座單元ISEcp1-CTX-M-IS903-iroN,IS903和iroN在CTX-M型基因的下游。LIU等[41]研究發(fā)現(xiàn),ISEcp1轉(zhuǎn)座單元中CTX-M型基因的表達水平與ISEcp1中的啟動子(P1)有密切的關(guān)系。WANG等[42]研究發(fā)現(xiàn),只有79、80、127 bp間距的單元具有P2活性。把二者進行對比,P1活性較強,它在促進下游基因的表達中占主導(dǎo)地位[43]。

    6.2 整合子

    整合子廣泛存在于革蘭氏陰性菌中。大多Ⅰ、Ⅱ類整合子與耐藥有關(guān)[44]。SABATE等[45]研究發(fā)現(xiàn),在Ⅰ類整合子(如InS21,In35和In60)中發(fā)現(xiàn)了產(chǎn)CTX-M-9和CTX-M-2型的基因。這些整合子,結(jié)構(gòu)上包含有5′CS和部分或全部3′CS的副本。而對于整合子InS21,產(chǎn)CTX-M-2型的基因位于ORF513的下游,且在3′端保守序列內(nèi),它是一種非尋常整合子[46]。而對于In60,產(chǎn)CTX-M-9型的基因也位于ORF513的下游,也屬非尋常整合子。

    6.3 轉(zhuǎn)座子

    轉(zhuǎn)座子是一個能夠復(fù)制、移動的單元,存在于染色體DNA上,包含簡單式和復(fù)合式。一般來說,簡單轉(zhuǎn)座子就是插入序列;而復(fù)合式轉(zhuǎn)座予是一類帶有某些特殊功能基因(如腸毒素基因、耐藥基因、結(jié)構(gòu)基因等)的轉(zhuǎn)座子。在臨床試驗中,大部分CTX-M型基因是由轉(zhuǎn)座子來調(diào)控的,這就加劇了細菌耐藥性的傳播[47]。耐藥質(zhì)粒是導(dǎo)致細菌產(chǎn)生耐藥性的一個至關(guān)重要的因素,而質(zhì)粒上的耐藥基因,可通過耐藥質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化、接合等方式進行水平傳播,在一定程度上加劇了細菌耐藥性。馬帥等[48]研究發(fā)現(xiàn),產(chǎn)ESBLs菌株的同一質(zhì)粒可以攜帶多種耐藥基因,這些質(zhì)粒可介導(dǎo)菌株的多重耐藥特性,分離株的耐藥性與耐藥質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。

    7 CTX-M型ESBLs的基因突變

    7.1 CTX-M型ESBLs的殘基

    細菌攜帶的CTX-M型ESBLs基因在發(fā)生不斷的突變,就是為了適應(yīng)更多更新的抗菌藥物。一些常見的殘基如下。

    殘基77:第77位殘基發(fā)生了A77→V的變化,雖然位于活性中心的遠端,也能夠?qū)Ξa(chǎn)CTX-M型β-內(nèi)酰胺酶起到一定的催化作用,具有一定的溫度耐受性。如CTX-M-55型在CTX-M-15基礎(chǔ)上發(fā)生了A77→V突變,結(jié)果就表現(xiàn)出了對溫度變化有一定的耐受性[49]。

    殘基109:經(jīng)T109→A突變導(dǎo)致的,細菌攜帶的CTX-M-14型基因在109位的氨基酸是丙氨酸(Ala),而CTX-M-140型是由CTX-M-14型突變而來,研究發(fā)現(xiàn),109位的丙氨酸(Ala)對含CTX-M-14型基因水解頭孢菌素起到了非常重要的作用[50]。

    殘基169:第169位殘基位于A類β-內(nèi)酰胺酶上,與酶對羧基、氨基、青霉素、頭孢他啶的作用有很大的關(guān)系。

    殘基237和276:研究人員用點突變技術(shù)發(fā)現(xiàn),突變后細菌對頭孢噻肟的水解作用減弱。因此,推測Ser237和Arg276殘基對頭孢噻肟的水解作用具有特殊的增強作用[51]。

    殘基240:第240堿基主要是發(fā)生了D240→G突變。

    7.2 產(chǎn)CTX-M型ESBLs的嵌合突變體

    最近幾年來,因相互發(fā)生嵌合作用出現(xiàn)了一些新的突變體,如CTX-M-14型和CTX-M-15型的嵌合體CTX-M-64型、CTX-M-123型、CTX-M-132型和CTX-M-137型是在CTX-M-14型和CTX-M-15型的基礎(chǔ)上發(fā)生突變的。而在CTX-M-123型基礎(chǔ)上,通過若干個堿基突變或替換,這就衍變成了CTX-M-64型β-內(nèi)酰胺酶,但它對頭孢類藥物的作用強于CTX-M-123型。與CTX-M-14型相比,而CTX-M-64型對頭孢類藥物的水解能力較強,同時也對酶抑制劑如克拉維酸、舒巴坦卻表現(xiàn)出了一定的增加作用[52]。此外,CTX-M-14型和CTX-M-15型的嵌合體還有CTX-M-137型[53]。

    8 CTX-M型ESBLs菌株的流行原因及治療措施

    CTX-M型ESBLs的流行傳播機制,主要包含水平傳播和垂直傳播兩種形式。而水平傳播主要是針對耐藥基因來說的,通常是耐藥基因在質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子、噬菌體、整合子等相關(guān)可移動元件的協(xié)助下來完成的,這也是引起臨床耐藥菌暴發(fā)和流行的主要原因,使得ESBLs的菌株能夠通過一定的形式轉(zhuǎn)移或傳遞給敏感的非產(chǎn)ESBLs型的菌株,這給臨床的防控帶來了一定的難度。

    8.1 CTX-M型ESBLs菌株的流行原因

    產(chǎn)ESBLs臨床菌株,其所在的質(zhì)粒不僅攜帶β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥基因,而且還同時存在其他耐藥基因如氟喹諾酮類、氨基糖苷類、磺胺類藥物的耐藥基因,在這種情形下,就不可避免地出現(xiàn)了多重耐藥,鑒于此,在臨床中應(yīng)及時地去檢測產(chǎn)ESBLs菌株,協(xié)同相關(guān)藥物的耐藥表型,去判斷是否為多重耐藥菌株,這對于指導(dǎo)臨床用藥具有重要意義。再者,CTX-M型基因的本身理論特性在一定程度上也加劇了CTX-M型ESBLs菌株的廣泛流行,其原因主要體現(xiàn)在以下兩個方面:第一,這主要是在于CTX-M型耐藥基因大多存在于可接合轉(zhuǎn)移的質(zhì)粒上,為流行傳播提供了前提條件;第二,該移動質(zhì)粒上攜帶的不同遺傳元件(如插入序列、轉(zhuǎn)座子和整合子等)在參與CTX-M型基因傳播與表達中也起到了一定的不容忽視的作用。因此,在多種因素共同作用下,導(dǎo)致了菌株的耐藥性傳播越來越嚴重,目前,已達到一發(fā)不可收拾的地步,全世界耐藥性問題變得日趨嚴峻。

    另外,長期加量、濫用藥物尤其是β-內(nèi)酰胺類藥物在一定程度上對動物機體產(chǎn)生了很大的危害,不僅會導(dǎo)致機體內(nèi)的腸道菌群失調(diào)、紊亂甚至產(chǎn)生多重耐藥性,而且還嚴重影響公共衛(wèi)生的安全。臨床中長期加量、濫用藥物,而機體內(nèi)代謝、吸收是有一定限度的,甚至有些藥物不可能被完全吸收,導(dǎo)致其在體內(nèi)蓄積,日積月累,蓄積的藥物量增加。同時,因長期、大劑量使用藥物,機體內(nèi)不可避免地會出現(xiàn)耐藥基因,這在一定程度上降低了藥物的臨床療效,此外,還伴有一定的毒副作用。由于惡性循環(huán)的作用,機體內(nèi)存在的耐藥基因通過多種途徑,可擴散、傳播到環(huán)境(水、土壤、食品中等)中,進一步將耐藥范圍擴大,形成惡性循環(huán)式的全球性耐藥問題。

    8.2 CTX-M型ESBLs菌株的治療措施

    我國動物源CTX-M型ESBLs的菌株的分離率呈現(xiàn)增長趨勢。在臨床實踐中,通過開展藥物敏感性試驗,選用較為敏感的藥物去治療相關(guān)動物疾病的感染。目前,碳青霉烯類抗生素如亞胺培南、美羅培南,本身具有特殊的空間結(jié)構(gòu)特征,不容易被β-內(nèi)酰胺酶降解,可治療產(chǎn)ESBLs菌株的感染。目前,在臨床實踐中,抗菌活性最強、應(yīng)用最為廣泛的是美羅培南、亞胺培南。目前,針對產(chǎn)ESBLs菌株的感染,根據(jù)臨床實踐經(jīng)歷,選用β-內(nèi)酰胺類和β-內(nèi)酰胺酶抑制劑聯(lián)用、頭孢菌素類及碳青霉烯類抗生素去治療較為合適。在其他類抗生素方面,氨基糖苷類和氟喹諾酮類抗生素可用來治療產(chǎn)CTX-M型ESBLs菌株的感染,具有一定的敏感性,但由于氟喹諾酮類抗生素對軟骨發(fā)育有影響及氨基糖苷類抗生素的耳、腎毒性作用,在臨床實踐應(yīng)用中受到一定的限制。

    為有效控制細菌產(chǎn)生ESBLs和治療產(chǎn)酶菌株的感染,第一,應(yīng)當(dāng)減少臨床中抗生素的使用頻次及注意合理科學(xué)用藥,在一定程度上減少攜帶產(chǎn)CTX-M型的菌株[54];第二,目前已有β-內(nèi)酰胺酶抑制劑(如棒酸、他唑巴坦、舒巴坦等)應(yīng)用于臨床,可考慮聯(lián)合應(yīng)用β-內(nèi)酰胺酶抑制劑;第三,加大研發(fā)力度,研制更多的中藥、新藥應(yīng)用于臨床[55];第四,政府及監(jiān)管部門應(yīng)加強對感染菌、敏感程度的監(jiān)測力度,在一定程度上降低或減少耐藥菌株的出現(xiàn)。目前,隨著CTX-M型ESBLs多重耐藥菌株的出現(xiàn),積極尋找新型、更加有效降低細菌耐藥性的方案顯得十分有必要。

    9 小結(jié)

    近年來,臨床中攜帶CTX-M型β-內(nèi)酰胺酶基因菌株顯示出愈發(fā)流行的趨勢。當(dāng)前,伴隨著科學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,新型檢測技術(shù)層出不窮,如脈沖場凝膠電泳、MLST、RAPD等新型分型技術(shù)被廣泛應(yīng)用于基因檢測與基因分子分型中[56]。了解不同地區(qū)產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶的流行趨勢,有效掌握CTX-M型β-內(nèi)酰胺酶的亞型及分類特點,然后適當(dāng)選用不同的抗菌藥物進行治療是很有必要的,對臨床指導(dǎo)合理用藥具有重要現(xiàn)實意義。

    總之,隨著對CTX-M型ESBLs的不斷認識,且耐藥性是一個世界性熱點問題,在臨床實踐中,應(yīng)重視ESBLs菌株的臨床檢測和加強該酶型的監(jiān)測力度。不同類型ESBLs基因的獲得和傳播,在一定程度上,與相關(guān)的整合子、轉(zhuǎn)座子和接合性質(zhì)粒等可移動遺傳元件有著很大的關(guān)聯(lián),而這些元件可以在不同菌株間進行快速的傳播和轉(zhuǎn)移,這就導(dǎo)致了攜帶的ESBLs基因檢出率高。一些可移動的遺傳元件可以快速有效地傳遞ESBLs基因,而且各種可移動遺傳元件之間可能也會發(fā)生相互作用、相互影響,這些都會使對可移動遺傳元件的研究變得更為復(fù)雜。鑒于此,可移動遺傳元件對ESBLs基因、其他基因傳播的影響及其傳播擴散機制還需要進行深入細致研究。

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