魏圓圓
摘 要 本文以內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫為對象,就其在植物中應(yīng)用進(jìn)展作一探討。另外,本文還剖析了內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫與膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子間所存在的關(guān)系,指出了在對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫途徑進(jìn)行研究中還沒有得到解決的問題,望能為深層化研究內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫與抗逆之間關(guān)系提供參考與依據(jù)。
關(guān)鍵詞 植物 內(nèi)質(zhì)網(wǎng) 脅迫應(yīng)答
中圖分類號:Q503 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A
在整個真核生物體系當(dāng)中,蛋白質(zhì)有著非常復(fù)雜的合成過程,而細(xì)胞質(zhì)當(dāng)中的核糖體為合成的核心場所。針對那些大分子蛋白,比如在整個細(xì)胞總蛋白中約占1/3的分泌蛋白,或者是膜蛋白等,需先進(jìn)內(nèi)質(zhì)網(wǎng),然后再根據(jù)實(shí)際需要,進(jìn)行修飾與折疊,只有蛋白質(zhì)經(jīng)過正確、規(guī)范化的折疊與修飾,方能向細(xì)胞器中轉(zhuǎn)換(如細(xì)胞核、線粒體等),并將其生物功能最大化發(fā)揮出來。針對蛋白質(zhì)整個折疊過程而言,不僅精細(xì)而且還比較復(fù)雜,易受外界影響,造成蛋白出現(xiàn)錯誤折疊,或者是難以折疊的情況。本文就植物內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫應(yīng)答研究及進(jìn)展作一探討。
1經(jīng)典未折疊蛋白的基本應(yīng)答途徑分析
1.1以IREl為介導(dǎo)的XBPmRNA非常規(guī)剪接途徑分析
在酵母中,IRE1乃是一個比較典型的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫感應(yīng)器,無論是在動物未折疊蛋白應(yīng)答中,還是在植物應(yīng)答中,均發(fā)揮著重要作用與地位。對于IRE1而言,其實(shí)為一個內(nèi)質(zhì)網(wǎng)駐留蛋白質(zhì),具有單次跨膜的特點(diǎn),其不僅擁有內(nèi)切核酸酶RNase活性,而且還有胞質(zhì)激酶活性。在整個內(nèi)質(zhì)網(wǎng)當(dāng)中,當(dāng)未折疊蛋白質(zhì)出現(xiàn)持續(xù)、不間斷累積時,對于此時的IRE1蛋白而言,其便會形成比較典型的多聚體,將IRE1所持有的蛋白激酶活性激活,且出現(xiàn)磷酸化,并使其內(nèi)切核酸酶活性得到進(jìn)一步激活;還需要指出的是,無論是動物XBP1,還是酵母HAC1,針對與之處于對應(yīng)狀態(tài)的mRNA,實(shí)施非常規(guī)剪切處理,將一些核苷酸切掉,并對原有的蛋白形式進(jìn)行重新編碼。針對此形式而言,其不僅擁有典型的轉(zhuǎn)錄激活活性,而且還擁有核定位信號,還可以進(jìn)入細(xì)胞核,對蛋白折疊相應(yīng)UPR基因進(jìn)行調(diào)節(jié),最終達(dá)到緩解內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫的目的。
1.2 ATF6-S2P水解的基本途徑
針對ATF6而言,其在整個哺乳動物體系中,實(shí)為一個bZIP家族跨膜轉(zhuǎn)錄因子(內(nèi)質(zhì)網(wǎng)II型),對于其N端來講,其多處于細(xì)胞質(zhì)當(dāng)中,在整個架構(gòu)當(dāng)中,其囊括有一個呈堿性狀態(tài)的亮氨酸拉鏈結(jié)構(gòu)域,而對于C端來講,其多處于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔。通常情況下,處于全長狀態(tài)的ATF6,會被BiP滯留,并且始終維持在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)當(dāng)中;還需要指出的是,基于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的影響及持續(xù)脅迫下,COPII會轉(zhuǎn)移ATF6,使其經(jīng)膜泡,而持續(xù)運(yùn)至高爾基體當(dāng)中,然后由2個蛋白酶(S1P與S2P),實(shí)施分步酶切操作,完成酶切后,其形式會發(fā)生改變,其中不存在跨膜域,此時,經(jīng)核定位信號,便會持續(xù)進(jìn)入到細(xì)胞核中,將下游UPR相應(yīng)基因表達(dá)予以激發(fā);針對此種酶切方式來講,也業(yè)內(nèi)又被稱作蛋白質(zhì)水解方式。
1.3 PERK/ATF4-CHOP選擇翻譯性途徑分析
針對PERK來講,其實(shí)為一個能夠在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中定位,并且還含有跨膜域的一種激酶,針對C末端來講,其所處對象為胞質(zhì),而對于N末端來講,其方向所指的是內(nèi)質(zhì)網(wǎng)腔,從根本上來講,其擁有比較典型且具有獨(dú)特性的絲/蘇氨酸蛋白激酶活性,現(xiàn)階段,僅能在動物當(dāng)中被發(fā)現(xiàn)。針對翻譯起始因子eIF2來講,其內(nèi)部所含有的 亞基(eIF2 ),便會以一種獨(dú)特方式與GTP相結(jié)合,然后可以與tRNA融合在一起,對起始復(fù)合物進(jìn)行翻譯。如果內(nèi)質(zhì)網(wǎng)處于應(yīng)激狀態(tài),針對此時的PERK磷酸,其在化真核起始因子eIF2 位置上,在絲氨酸排位上,處于第51位。針對eIF2 來講,當(dāng)其已經(jīng)被磷酸化之后,便會對翻譯起始復(fù)合物當(dāng)中的GTP與GDP的交換進(jìn)行有效抑制,在此過程中,其會對蛋白質(zhì)相應(yīng)翻譯施加抑制,還會對其合成進(jìn)行相應(yīng)抑制,因而能夠較大程度減少進(jìn)入到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)當(dāng)中的蛋白。
2植物膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫應(yīng)答
2.1 AtbZIP28途徑分析
當(dāng)處于正常狀態(tài)下,針對擬南芥膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子(bZIP28)來講,經(jīng)跨膜域,實(shí)現(xiàn)在ER當(dāng)中的定位,當(dāng)感應(yīng)到脅迫后(內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫、高溫等),對于此時的bZIP28來講,其便會進(jìn)入高爾基體中,并且還會分別被絲氨酸蛋白酶當(dāng)中的S1P、S2P實(shí)施分步酶切處理,將跨膜域去掉;在實(shí)際操作中,通過對位信號進(jìn)行核定,并進(jìn)入到指定的細(xì)胞核中,并且還會對諸多與UPR之間存在關(guān)聯(lián)的基因進(jìn)行上調(diào),以此來更好的幫助蛋白折疊。在整個哺乳動物體系當(dāng)中,對于ATF6而言,其會被BiP長期滯留于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,基于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的影響、作用與脅迫下,COPII會借助于膜泡運(yùn)輸,把ATF6持續(xù)向高爾基體傳送。在植物當(dāng)中,大多經(jīng)過預(yù)測明確是??坑谝苿痈郀柣w(內(nèi)質(zhì)網(wǎng)出口位點(diǎn)),無需中間囊泡,便可以把內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白以一種合理方式向高爾基體轉(zhuǎn)運(yùn);雖然是這樣,許多報道指出,從內(nèi)質(zhì)網(wǎng)至高爾基體,在其整個轉(zhuǎn)運(yùn)過程相關(guān)于COPII裝置。
2.2 AtbZIP60/OsbZIP74途徑分析
針對擬南芥bZIP60(水稻bZIP74)來講,其在具體的活化方式上,不同于AtbZIP28。對于AtbZIP60/OsbZIP74所持有的mRNA來講,其可以根據(jù)實(shí)際需要,形成二級發(fā)夾結(jié)構(gòu),并且還會被IRE1識別出來,于mRNA水平上,開展非常規(guī)剪切操作。在整個內(nèi)質(zhì)網(wǎng)當(dāng)中,隨著未折疊蛋白質(zhì)的持續(xù)、不間斷積累,IRE1蛋白便會根據(jù)實(shí)際情況,形成多聚體,將IRE1所對應(yīng)的蛋白激酶活性激活,加速自體磷的持續(xù)酸化,從中推動內(nèi)切核酸酶活性的不斷激活,還需要指出的是,通過對bZIP60mRNA中所存在的雙莖環(huán)結(jié)構(gòu)激活,并將其中的23個核苷酸去除掉,勢必會造成閱讀框移碼,并且還會出現(xiàn)異?;慕K止密碼子,受此影響,其便會被重新編碼,成為一個并沒有跨膜域的單純性的蛋白形式。針對形式來講,其不僅擁有轉(zhuǎn)錄激活活性,而且還有核定位信號,可以根據(jù)實(shí)際需要,進(jìn)入到細(xì)胞核當(dāng)中,并對UPR基因表達(dá)實(shí)施上調(diào)處理,實(shí)現(xiàn)細(xì)胞的更好生存。針對植物當(dāng)中的IRE1蛋白來講,其與酵母與動物當(dāng)中的IRE1蛋白序列向比較,存在著比較高的同源性,但需要指出的是,針對與IRE1蛋白相對應(yīng)的剪接底物來講,其所持有的核苷酸序列,相比于酵母與動物的IRE1蛋白所持有的剪接底物核苷酸序列,存在著比較低的相似性。
2.3 NAC062途徑分析
針對真核的分泌系統(tǒng)來講,其主要由疏水區(qū)域、囊泡、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、高爾基體與質(zhì)膜構(gòu)成。針對NAC062來講,其在整個植物特異轉(zhuǎn)錄因子NAC家族當(dāng)中,乃是其核心成員,針對其C-末端而言,其存在著比較典型的疏水跨膜域。針對內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)劑TM來講,其能夠?qū)AC062實(shí)施誘導(dǎo),使其表達(dá)上調(diào),而針對此種上調(diào)而言,其在整個bzip60突變體當(dāng)中,已經(jīng)被全部抑制,但需要指出的是,如若其在bzip28突變體當(dāng)中,則受到的影響較?。唤?jīng)酵母單雜交試驗(yàn)以及EMSA實(shí)驗(yàn)得知,針對bZIP60而言,其能夠與NAC062啟動子直接結(jié)合。當(dāng)處于正常狀態(tài)下,NAC062能夠在質(zhì)膜上實(shí)現(xiàn)定位,并且在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的作用與脅迫下,會被一種未知方式進(jìn)行活化處理,從質(zhì)膜向細(xì)胞核轉(zhuǎn)移,而針對已經(jīng)活化的NAC062,其能夠與UPR基因所對應(yīng)的啟動子相結(jié)合,對促細(xì)胞生存基因?qū)嵤┱{(diào)控。
3植物細(xì)胞死亡因子與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫應(yīng)答
3.1異三聚體G蛋白
針對擬南芥異源三聚體G蛋白來講,當(dāng)其持續(xù)被脅迫信號進(jìn)行誘導(dǎo)時,其在整個程序性細(xì)胞死亡當(dāng)中發(fā)揮著重要作用。針對異三聚體G蛋白來講,其主要由3中亞基組成,分別為 、 與 ,針對G 來講嗎,其擁有GTPase活性。有研究指出,在與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅存在關(guān)聯(lián)的程序性細(xì)胞死亡中,異三聚體G蛋白均有一定參與。在整個擬南芥當(dāng)中,當(dāng)將G 敲除之后,如果培養(yǎng)基中含有內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)劑,那么其相比于對照野生型和G ,有更好的生長價值,由此表明,在植物中,暗示G (AGB1)能夠一定程度加速細(xì)胞死亡,但在報道其作用機(jī)制方面卻并不多?,F(xiàn)實(shí)當(dāng)中,有報道指出,當(dāng)敲除G 后,針對突變體而言,其相比于野生型對照,在具體的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫誘導(dǎo)劑上,會變得更為的敏感,AGB1具有穩(wěn)定與促進(jìn)細(xì)胞生存的作用,但針對其作用機(jī)制而言,仍需開展深入研究。
3.2 Metacaspase
在整個哺乳動物體系當(dāng)中,caspase在細(xì)胞凋亡發(fā)揮著關(guān)鍵作用。而在植物細(xì)胞當(dāng)中,并無細(xì)胞凋亡情況出現(xiàn)。針對植物當(dāng)中的Metacaspase而言,其盡管無caspase活性,但是,其被當(dāng)作與動物細(xì)胞凋亡當(dāng)中的caspase同源。在擬南芥當(dāng)中,其共有metacaspase9個,其中,針對metacaspase-8而言,有研究指出,其受UVC、過氧化氫影響,已經(jīng)出現(xiàn)大幅度上調(diào),并將細(xì)胞死亡途徑激活。除此之外,無論是在植物木質(zhì)部形成方面,還是在重金屬脅迫上,均能檢測到相關(guān)于PCD類的caspase活性。
4結(jié)語
綜上,針對蛋白折疊而言,其乃是真核細(xì)胞基礎(chǔ)生物學(xué)的整個過程表現(xiàn)。對于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)而言,其實(shí)為真核細(xì)胞的核心細(xì)胞器,全部分泌蛋白以及諸多膜蛋白,均需基于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中來加工,只有這樣方能向其他細(xì)胞器轉(zhuǎn)運(yùn),然后分泌至細(xì)胞外,實(shí)現(xiàn)生物學(xué)功能的最大化發(fā)揮。隨著膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子bZIP28、bZIP60的被發(fā)現(xiàn),其為植物內(nèi)質(zhì)網(wǎng)脅迫領(lǐng)域的深入研究,開辟了新思路、新途徑。
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