李潔 何小周 楊夢(mèng)婕 馬學(xué)軍 武桂珍
102206 北京,中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所
中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所(以下簡(jiǎn)稱病毒病所)擔(dān)負(fù)著研究新的實(shí)驗(yàn)方法,建立與制定標(biāo)準(zhǔn),技術(shù)指導(dǎo)全國(guó)病毒病防控工作等任務(wù)。有些實(shí)驗(yàn)方法需要提升到國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)、行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)高度。其中一些非標(biāo)方法(自制方法)相比于國(guó)標(biāo)方法、行標(biāo)方法具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。通過(guò)檢驗(yàn)檢測(cè)機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定工作(又稱實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)認(rèn)定),可以將這些成熟的方法通過(guò)資質(zhì)認(rèn)定的法定程序予以確認(rèn),進(jìn)而轉(zhuǎn)化成為本所標(biāo)準(zhǔn),使用該方法得到的檢測(cè)結(jié)果就具備了一定的法律效力[8,13]。
按照實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)認(rèn)定評(píng)審準(zhǔn)則的要求[1-4],對(duì)非標(biāo)方法進(jìn)行技術(shù)確認(rèn)的主要原則應(yīng)包含:(1)使用參考標(biāo)準(zhǔn)或標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)進(jìn)行比較;(2)與其他方法所得的結(jié)果進(jìn)行比較;(3)實(shí)驗(yàn)室間檢測(cè)結(jié)果的比對(duì);(4)對(duì)影響結(jié)果的因素作系統(tǒng)性評(píng)審;(5)根據(jù)對(duì)實(shí)驗(yàn)方法理論原理和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)的科學(xué)理解,對(duì)所得結(jié)果不確定度進(jìn)行評(píng)定。
非標(biāo)方法的確認(rèn)除其他程序完備外,一般需要有三個(gè)或以上的比對(duì)試驗(yàn),可以有以下幾種辦法:1)組織學(xué)術(shù)評(píng)審會(huì),邀請(qǐng)專家,通過(guò)學(xué)術(shù)評(píng)審確定方法的可行性、適應(yīng)性和有效性。2)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)方法確認(rèn)(in-house method validation):同一實(shí)驗(yàn)室內(nèi),在合理的時(shí)間間隔內(nèi),用一種方法在預(yù)定條件下對(duì)相同或不同測(cè)試樣品進(jìn)行的分析實(shí)驗(yàn)。亦可由本室不同人員通過(guò)留樣再測(cè),進(jìn)行不同批次的實(shí)驗(yàn)比對(duì)[5-7,11]。3)實(shí)驗(yàn)室間方法確認(rèn)(inter-laboratory method validation)是指在兩個(gè)或多個(gè)實(shí)驗(yàn)室之間實(shí)施的方法確認(rèn)。各實(shí)驗(yàn)室依照預(yù)定條件用相同方法對(duì)相同樣品進(jìn)行測(cè)定。包括在本所或外所不同的實(shí)驗(yàn)室對(duì)該方法進(jìn)行重復(fù),以實(shí)現(xiàn)在不同地點(diǎn)的實(shí)驗(yàn)比對(duì)[5-7,11]。4)與其他標(biāo)準(zhǔn)方法比對(duì)。5)與標(biāo)準(zhǔn)品檢測(cè)結(jié)果比對(duì)。結(jié)合資質(zhì)認(rèn)定《檢驗(yàn)檢測(cè)機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定評(píng)審準(zhǔn)則》(國(guó)認(rèn)實(shí)[2016]33號(hào))[3]和國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)《檢測(cè)或校準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室能力認(rèn)可準(zhǔn)則》ISO/IEC:17025的規(guī)則要求,本研究就比對(duì)方法進(jìn)行梳理[5-7]。需要說(shuō)明的是,下述介紹的各種比對(duì)結(jié)果評(píng)價(jià)中,要用到一個(gè)重要的參數(shù)是測(cè)量不確定度,而對(duì)于病毒學(xué)方法的的評(píng)價(jià)指標(biāo)主要是特異性,穩(wěn)定性和可靠性等,難以套用測(cè)量不確定度的計(jì)算公式,病毒學(xué)方法應(yīng)該依照資質(zhì)認(rèn)定的原則框架進(jìn)行比對(duì)試驗(yàn),但具體判定規(guī)則應(yīng)按照本專業(yè)規(guī)則和圖表進(jìn)行判定和表達(dá)。
2.1人員比對(duì)在相同的環(huán)境條件下,采用相同的檢測(cè)方法、相同的檢測(cè)設(shè)備和設(shè)施,由不同的檢測(cè)人員對(duì)同一樣品進(jìn)行檢測(cè)的試驗(yàn)。以參與比對(duì)試驗(yàn)人員中具有較高準(zhǔn)確度一方的測(cè)定值作為參考值,比對(duì)試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行評(píng)價(jià)。
2.2方法比對(duì)在環(huán)境條件相同的前提下,由相同的人員采用不同的檢測(cè)方法對(duì)同一樣品進(jìn)行的檢測(cè),對(duì)試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行評(píng)價(jià)。
2.3儀器比對(duì)在相同的環(huán)境條件下、使用相同的方法、由相同的檢測(cè)人員采用不同的儀器設(shè)備對(duì)同一樣品進(jìn)行檢測(cè)的試驗(yàn)。
2.4留樣再測(cè)在盡可能相同的環(huán)境條件下,采用相同的檢測(cè)方法、相同的檢測(cè)設(shè)備和設(shè)施,由相同的檢測(cè)人員對(duì)已完成檢測(cè)的樣品在其留樣保存期間進(jìn)行再次檢測(cè)的試驗(yàn)。
以“RT-RAA法檢測(cè) EV71/ CA16等病毒”方法為例,說(shuō)明方法確認(rèn)研究的要素。結(jié)合具體方法的實(shí)際情況,對(duì)原方法做適當(dāng)驗(yàn)證,補(bǔ)充和修正。
按照《檢驗(yàn)檢測(cè)機(jī)構(gòu)資質(zhì)認(rèn)定評(píng)審準(zhǔn)則》(國(guó)認(rèn)實(shí)[2016]33號(hào))4.5.14要求。 按照病毒學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量體系文件《檢測(cè)方法控制程序》的要求,進(jìn)行比對(duì)試驗(yàn)驗(yàn)證,具體使用的方法是留樣再測(cè),人員比對(duì)。通過(guò)比對(duì)確認(rèn)該方法的敏感性、特異性、穩(wěn)定性,可靠性符合預(yù)期?!癛T-RAA法檢測(cè) EV71/CA16等病毒”方法采用了以下形式進(jìn)行比對(duì)試驗(yàn)驗(yàn)證:由不同檢測(cè)人員非同一日對(duì)留樣進(jìn)行3次實(shí)驗(yàn)操作,3次實(shí)驗(yàn)結(jié)果均為陰性對(duì)照無(wú)擴(kuò)增曲線出現(xiàn),陽(yáng)性對(duì)照和樣品有明顯的擴(kuò)增曲線,因此3次重復(fù)實(shí)驗(yàn)樣品結(jié)果均判讀為CA16。通過(guò)比對(duì)確認(rèn)該方法的特異性、穩(wěn)定性和可靠性符合預(yù)期。
調(diào)整后的“RT-RAA法檢測(cè) EV71/CA16等病毒”方法[8]從形式上提升為病毒病所所內(nèi)標(biāo)準(zhǔn);程序上符合了實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)認(rèn)定的方法確認(rèn)程序;內(nèi)容上增加了技術(shù)要求、結(jié)果分析、檢驗(yàn)規(guī)則、判定規(guī)則等條款。以下引用修改后的該標(biāo)準(zhǔn):
——————中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所《標(biāo)準(zhǔn)》。標(biāo)準(zhǔn)編號(hào):Q/IVDC024005-2017,標(biāo)準(zhǔn)名稱:《RT-RAA法檢測(cè) EV71/ CA16等病毒》,發(fā)布時(shí)間2017年12月25日。
前言
關(guān)于本標(biāo)準(zhǔn)的基本概況:手足口病是人腸道病毒引起的一種兒童常見傳染病。引發(fā)手足口的病毒以腸道病毒71型和柯薩奇病毒A16型為主。傳統(tǒng)的檢測(cè)方法如多重PCR法和定量PCR法對(duì)硬件設(shè)備和操作人員的技術(shù)要求較高,且成本也高,故建立該快速準(zhǔn)備易普及的檢測(cè)方法,對(duì)現(xiàn)場(chǎng)突發(fā)事件及實(shí)驗(yàn)室大量檢測(cè)任務(wù)具有重大意義。根據(jù)《中華人民共和國(guó)標(biāo)準(zhǔn)化法》、《中華人民共和國(guó)產(chǎn)品質(zhì)量法》特制訂本產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn)作為該檢測(cè)方法的質(zhì)量依據(jù)。
本標(biāo)準(zhǔn)由中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所中心實(shí)驗(yàn)室提出
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:馬學(xué)軍,王佶,楊夢(mèng)婕,何小周
本標(biāo)準(zhǔn)建立了EV71/CA16等病毒的等溫核酸擴(kuò)增方法,提高病原微生物快速檢測(cè)能力。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于經(jīng)過(guò)生物安全培訓(xùn)的操作人員進(jìn)行EV71/CA16等病毒感染病例標(biāo)本的檢測(cè)。
下列文件中的條款通過(guò)本標(biāo)準(zhǔn)的引用而成為本標(biāo)準(zhǔn)的條款。凡是不注日期的引用文件,其最新版本適用于本標(biāo)準(zhǔn)。
Use of a rapid reverse-transcription recombinase aided amplificationassay for respiratory syncytial virus detection. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease,chenChen,xuejunMa,et al. Available online 14 October 2017.
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本標(biāo)準(zhǔn)。
重組酶介導(dǎo)等溫核酸擴(kuò)增技術(shù)(Recombinase Aided Amplification,RAA)是一種利用重組酶、單鏈結(jié)合蛋白、DNA聚合酶在39 ℃等溫條件下對(duì)核酸進(jìn)行擴(kuò)增的技術(shù),使用該技術(shù)在短時(shí)間內(nèi)即可將目的基因擴(kuò)增放大到幾百萬(wàn)倍,達(dá)到可以用儀器檢測(cè)到的水平。
逆轉(zhuǎn)錄(Reverse Transcription,RT)提取組織或細(xì)胞中的總RNA,以其中的mRNA為模板,利用引物和逆轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成cDNA。
柯薩奇病毒A組16型(Coxsackievirus A16,CA16)是一種腸道病毒,導(dǎo)致手足口病的主要病原體之一。
腸道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)是一種腸道病毒,引起嬰幼兒手足口病主要病原體之一。
4.1 試劑耗材及主要儀器設(shè)備
Qiagen QIAamp Viral RNA Mini Kit(catalog #52904);RT-RAA核酸擴(kuò)增試劑盒(熒光法);DEPC處理水(無(wú)RNA酶和DNA酶);1.5 ml離心管,0.2 ml PCR反應(yīng)管;200 μl、100 μl、10 μl帶濾芯的TIP;奇天基因熒光基因檢測(cè)儀(QT-RAA-F7200);
RAA 8連管混勻儀(RAA-B3208);恒溫核酸擴(kuò)增儀(RAA-F1620)。
4.2 操作步驟
4.2.1 病毒核酸提取(具體操作見試劑盒說(shuō)明書)
4.2.2 開啟熒光基因檢測(cè)儀,溫度調(diào)節(jié)至39 ℃
4.2.3 按反應(yīng)體系配制表配制反應(yīng)體系(單個(gè)樣品/反應(yīng));混勻并離心;
4.2.4 將混合好的上述溶液加入到反應(yīng)干粉管;向反應(yīng)干粉管的蓋子上加入2.5 μl醋酸鎂;向上述溶液中加入2 μl樣本RNA,充分混勻并離心收集;
組分用量(μl)反應(yīng)緩沖液25正向引物(10μmol/L)21反向引物(10μmol/L)21探針(10μmol/L)06雙蒸水157
4.2.5 將反應(yīng)管放入熒光基因檢測(cè)儀反應(yīng)30 min進(jìn)行擴(kuò)增,并實(shí)時(shí)觀察結(jié)果。反應(yīng)程序:39 ℃,30 min;
空白對(duì)照和陰性對(duì)照均無(wú)擴(kuò)增曲線出現(xiàn),陽(yáng)性品有明顯的擴(kuò)增曲線。
需滿足以下質(zhì)量控制要求,檢驗(yàn)有效:空白對(duì)照陰性,陰性對(duì)照陰性,陽(yáng)性對(duì)照陽(yáng)性。
從擴(kuò)增曲線判斷,有明顯擴(kuò)增曲線的樣品判定為EV71或者CA16陽(yáng)性。
綜上所述,通過(guò)建立、驗(yàn)證與確認(rèn)方法,以及對(duì)“RT-RAA法檢測(cè) EV71/ CA16等病毒”方法的實(shí)證研究,探索了病毒學(xué)實(shí)驗(yàn)室基于實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)認(rèn)定條件下非標(biāo)方法建立、確認(rèn)、驗(yàn)證、核查等一系列問(wèn)題,同時(shí)嘗試將非標(biāo)方法進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化改造,以拓展非標(biāo)方法的使用范圍,提升其嚴(yán)謹(jǐn)性,為病毒學(xué)實(shí)驗(yàn)室非標(biāo)方法的確立與標(biāo)準(zhǔn)化提供了具體的實(shí)證樣本。
利益沖突:無(wú)
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