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    苦參熱應(yīng)激蛋白HSP17.8的體外表達及生物信息學(xué)分析

    2018-03-08 07:52:07趙德蕊胡雪瑞吳家文
    生物學(xué)雜志 2018年1期

    廖 怡, 趙德蕊, 胡雪瑞, 吳家文

    (1. 安徽中醫(yī)藥大學(xué) 研究生院,合肥 230012; 2. 安徽中醫(yī)藥大學(xué) 新安醫(yī)學(xué)教育部重點實驗室 科研實驗中心, 合肥 230038; 3. 安徽中醫(yī)藥大學(xué) 藥學(xué)院, 合肥 230012; 4. 安徽道地藥材品質(zhì)提升協(xié)同創(chuàng)新中心, 合肥 230038; 5. 安徽中醫(yī)藥科學(xué)院, 合肥 230038)

    當生物有機體受到環(huán)境中的應(yīng)激原(一般為熱刺激)刺激后,可以產(chǎn)生高度保守的防御性蛋白質(zhì),從而產(chǎn)生對抗外界逆境因素的保護性反應(yīng),這些防御性蛋白質(zhì)稱為熱應(yīng)激蛋白(heat stress proteins, HSPs),又名熱休克蛋白(heat shock proteins, HSPs)。一般根據(jù)相對分子質(zhì)量和同源程度將熱應(yīng)激蛋白分為HSP100家族、HSP90(83~90 ku)家族、HSP70(66~79 ku)家族、HSP60家族以及小分子HSP(15~30 ku)家族[1-2]。其中研究最深入的是HSP90和HSP70家族,他們具有高度保守性,在機體正常情況下低量表達,當遇到外界不利因素的刺激后,可以大量表達。

    熱應(yīng)激蛋白是進化上高度保守、功能上至關(guān)重要和在生物體內(nèi)與抗逆緊密相關(guān)的一類存在于整個生物界(從低等原核到高等動植物)的十分重要的蛋白質(zhì)[3]。

    對動物而言,高溫、低氧、創(chuàng)傷、重金屬離子等逆境因素可以誘導(dǎo)熱應(yīng)激蛋白的產(chǎn)生,以維護細胞生存和內(nèi)環(huán)境的穩(wěn)定。例如鮑恩東等[4]研究發(fā)現(xiàn)HSP70在急性熱應(yīng)激損傷的肉雞心肌纖維胞漿內(nèi)分布密集,說明HSP70的含量高低對心肌組織功能有影響且在心肌纖維內(nèi)行使重要生理功能。Yu等[5]發(fā)現(xiàn)用2-去氧葡萄糖飼養(yǎng)的老鼠因缺血而引起缺氧時,HSP70的表達量會提高,從而減輕因低氧對機體的損傷,起到保護作用。Wang等[6]發(fā)現(xiàn)注射HSP47-反義脫氧核苷酸對手術(shù)創(chuàng)傷的新生鼠可有效抑制HSP47的表達及皮膚I型膠原的累積,且有效減輕創(chuàng)面愈合所需的膠原纖維紊亂。表明HSP47-反義脫氧核苷酸可能具有抑制皮膚瘢痕形成的治療潛力。沈驊等[7]發(fā)現(xiàn)鯽魚肝臟內(nèi)HSP70的誘導(dǎo)表達受重金屬離子Cu2+、Zn2+濃度的影響顯著,表明HSP70可作為重金屬污染物生物標志物。

    對植物而言,當外界環(huán)境溫度比正常生長溫度高10℃左右時,植物體內(nèi)就會有熱應(yīng)激蛋白的產(chǎn)生。植物熱應(yīng)激蛋白對植物在逆境脅迫下引起的傷害具有很大的減緩作用,是植物短期適應(yīng)逆境的必需組成成分,相關(guān)逆境因素如高溫、冷凍、干旱等均能誘發(fā)HSPs產(chǎn)生。陳忠等[8]發(fā)現(xiàn)高溫誘導(dǎo)豌豆幼苗中熱激蛋白Hpc60的產(chǎn)生對抗壞血酸過氧化物酶具有保護作用,表明高溫下植物產(chǎn)生的熱應(yīng)激蛋白可以對機體重要的酶或蛋白質(zhì)起保護作用從而使植物獲得耐熱性。近年的研究表明,在低溫刺激下,也能誘導(dǎo)HSPs的產(chǎn)生,例如HSPs和植物耐冷性的直接關(guān)系由Collins等[9]首先證實。雖然冷熱應(yīng)激在植物體內(nèi)屬于不同的反應(yīng)過程,但這兩種逆境都可以誘導(dǎo)熱應(yīng)激蛋白的表達。Coca等[10]研究發(fā)現(xiàn)向日葵受水分脅迫時小分子熱應(yīng)激蛋白HSPl7.6和HSPl7.9基因高表達,且體內(nèi)水分喪失程度與其mRNA表達水平呈正性相關(guān)。

    以上研究均表明應(yīng)激蛋白的產(chǎn)生與生物外界逆境密切相關(guān),研究應(yīng)激蛋白對探索降低逆境對動植物的傷害和研究動植物體內(nèi)重要的抗逆機制有著非常重要的理論和實踐意義。

    中藥苦參(SophoraflavescentsAit)是一種有著悠久歷史的豆科槐屬植物。具有清熱燥濕,殺蟲和利尿作用,在臨床上,它主要用于熱痢,便血,黃疸尿閉,赤白帶下,外陰腫脹瘙癢,濕疹,外治滴蟲性陰道炎[11]。據(jù)報道,苦參具有多種藥理活性,如抗腫瘤[12],抗菌,抗炎和鎮(zhèn)痛作用[13]。

    本研究中,作者以苦參為研究對象首次克隆了苦參小分子量的應(yīng)激蛋白hsp17.8的編碼序列,在大腸桿菌內(nèi)實現(xiàn)了體外表達,并進一步對其理化性質(zhì)、進化關(guān)系及結(jié)構(gòu)特點等進行了分析。

    1 材料

    1.1 植物材料、菌株與載體

    新鮮苦參組織取自安徽中醫(yī)藥大學(xué)藥物園,由楊青山老師鑒定;大腸桿菌E.coliDH5α、表達載體pET22b(+)由中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)生命科學(xué)院施蘊渝教授惠贈;大腸桿菌E.coliBL21(DE3)、擴增載體pMD19-T Vector分別購自北京索萊寶科技有限公司、TaKaRa公司。

    1.2 各種酶、試劑及試劑盒

    rTaqDNA聚合酶、限制性核酸內(nèi)切酶NdeⅠ、XhoⅠ、T4 DNA連接酶,DL2000 DNA Marker、異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(isopropyl-β-D-1-thiogalactoside, IPTG),蛋白Marker均購自TaKaRa公司。RNA提取試劑盒[E.Z.N.A Plant RNA Kit (50)]為OMEGA產(chǎn)品、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit)購自Thermo公司、質(zhì)粒小抽試劑盒[AxyPrepTMPlasmid miniprep Kit (50 prep)]和膠回收試劑盒[AxyPrepTMDNA Gel Extraction Kit (50 prep)]購自Axygen Scientific公司。

    2 方法

    2.1 苦參RNA的提取及cDNA的合成

    從-80℃超低溫冰箱取新鮮苦參葉片在液氮中充分研磨成粉末,用RNA提取試劑盒提取苦參總RNA,將提取的總RNA取2 μL用DEPC水稀釋1000倍,在酶標儀(Microplate Reader)上測定260 nm、280 nm處的吸光度值(即光密度值OD), 計算剛剛提取的苦參總RNA濃度,并分析其純度;核酸電泳用來檢測苦參總RNA 的完整性。按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒的說明書將經(jīng)檢測了的純度高完整性好的RNA用來合成cDNA。合成的cDNA保存于-20℃冰箱,用于后續(xù)PCR擴增。

    2.2 引物設(shè)計與合成

    根據(jù)華大基因公司測序的苦參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從中篩選出hsp,利用Primer 5.0軟件設(shè)計出一對特異性的PCR引物來獲得hsp17.8的編碼序列。引物序列為H1:5′-CATATGATGGGAAAGGCACGCACCATTGG GGT-3′(下劃線為NdeⅠ的酶切位點),H2:5′-CTCGAGCTGCCTGGAATTGGAAGATTGGTTTCC-3′(下劃線為XhoⅠ的酶切位點),引物由上海生工生物公司合成。

    2.3 PCR擴增目的基因hsp17.8

    以合成的cDNA為模板,設(shè)計的H1、H2為引物對hsp17.8進行PCR擴增。25 μL反應(yīng)體系:ddH2O 16 μL,10×PCR Buffer 2.5 μL,dNTP Mixture 1 μL,引物H1和H2 (5 μmol/ L)各1 μL,cDNA 2 μL,rTaqDNA聚合酶(5 U/μL) 1.5 μL。PCR條件為:94℃預(yù)變性3 min;94℃變性30 s,40℃退火30 s,72℃延伸1 min,共10個循環(huán);接著94℃變性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸1 min,共25個循環(huán);循環(huán)結(jié)束后在72℃下再延伸10 min。用核酸電泳對PCR擴增產(chǎn)物進行鑒定。

    2.4 pMD19T-hsp17.8擴增質(zhì)粒的構(gòu)建

    在紫外燈下用干凈的手術(shù)刀切下核酸膠中的目的DNA亮帶,此條帶用膠回收試劑盒純化(純化結(jié)果用核酸電泳檢測),然后在16℃水浴下連接到pMD19-T Vector,連接體系:回收純化的DNA 11 μL,10×T4 DNA Ligase Buffer 1.5 μL,pMD19-T Vector 1.5 μL和T4 DNA Ligase 1 μL。用42℃,90 s熱激法將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到實驗室新制備的感受態(tài)細胞E.coliDH5α,先預(yù)培養(yǎng)1.5 h再涂布于Amp+的LB平板。次日,挑單克隆擴大培養(yǎng)。對菌液進行PCR鑒定,PCR體系和條件同上。同時用質(zhì)粒小抽試劑盒制備重組質(zhì)粒,為接下來的NdeⅠ和XhoⅠ雙酶切做準備,雙酶切在37℃水浴下進行,體系為:Plasmid DNA 30 μL,10×H Buffer 3.8 μL,NdeⅠ 2 μL,XhoⅠ 2 μL。用核酸電泳檢測是否出現(xiàn)目的條帶。陽性菌液送上海生工生物技術(shù)有限公司測序。

    2.5 pET22b-hsp17.8表達質(zhì)粒的構(gòu)建

    將陽性重組擴增載體pMD19T-hsp17.8雙酶切后的帶有酶切位點的目的片段切割回收純化,與經(jīng)NdeⅠ和XhoⅠ雙酶切的表達載體 pET22b(+)于16℃連接過夜。連接體系為:回收純化的帶有酶切位點的DNA 9.5 μL,10×T4 DNA Ligase Buffer 1.5 μL,pET22b(+) 3 μL和T4 DNA Ligase 1.2 μL。轉(zhuǎn)化、挑單克隆、菌液PCR鑒定、質(zhì)粒抽提、NdeⅠ/XhoⅠ雙酶切鑒定操作同上。用核酸電泳檢測是否出現(xiàn)目的條帶。陽性克隆送測序分析(上海生工生物技術(shù)有限公司)。

    2.6 重組表達菌的誘導(dǎo)表達

    將重組表達質(zhì)粒pET22b-hsp17.8轉(zhuǎn)化E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細胞,挑取克隆于37℃,220 r/min振蕩培養(yǎng)過夜。將震蕩過夜培養(yǎng)的原核表達菌取3 mL接種到200 mL含Amp+的LB液體培養(yǎng)基里,37℃、220 r/min震蕩培養(yǎng)至OD600=0.6左右時,加入IPTG使其終濃度為0、0.1、0.5和1 mmol/L(其中0 mmol/L為不添加 IPTG的對照組),將其分別在3個溫度(16℃、25℃和37℃)下誘導(dǎo)表達24 h、8 h和6 h,轉(zhuǎn)速為150 r/min。由于大腸桿菌在16℃、24h,25℃、8 h和37℃、6 h均達到生長穩(wěn)定期,延長時間蛋白質(zhì)表達量不再增加,所以我們選擇了這些參數(shù)作為誘導(dǎo)蛋白產(chǎn)生的條件;高濃度的IPTG有毒性,會殺死細胞,且會增加外源蛋白表達速度,容易造成包涵體的形成,所以一般選擇IPTG終濃度為0.1~1 mmol/L,我們選擇了IPTG最小終濃度0.1 mmol/L和最大終濃度1 mmol/L以及它們的中間濃度0.5 mmol/L作為實驗組,以0 mmol/L為對照組,對熱應(yīng)激蛋白的表達量做了比較。誘導(dǎo)結(jié)束后,8000 r/min 離心25 min收集菌體,用30 mL PBS(含500 mmol/L NaCl)/300 μL PMSF混勻收集的細菌,樣品放置冰上保持低溫,超聲(超聲1 s,停頓3 s,破碎次數(shù)共120次)將細菌完全破碎裂解。13 000 r/min離心30 min收集上清。樣品分別加入相應(yīng)量的5×SDS-PAGE蛋白上樣緩沖液,95℃煮沸5 min,進行后續(xù)的Western blot檢測。

    2.7 Western blot

    制備15%分離膠和5%濃縮膠,加樣,75V電泳30 min后切換115 V電泳90 min,電泳結(jié)束后切膠,轉(zhuǎn)膜、封閉、附一抗His-Tag 抗體 (1/1000)過夜、洗膜、附二抗anti-mouse IgG HRP(1/2500)、洗膜、曝光。

    2.8 生物信息學(xué)分析

    首先用在線翻譯工具(https://www.bioinformatics.org/sms2/translate.html)對hsp17.8進行基因序列翻譯,接下來用在線軟件(http://web.expasy.org/protparam/)對HSP17.8蛋白的等電點、分子質(zhì)量等物理化學(xué)性質(zhì)進行預(yù)測。HSP17.8蛋白的潛在功能位點使用Motif scan (http://hits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scan/)進行預(yù)測。使用SMART BLAST (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/smartblast/smartBlast.cgi)工具對HSP17.8進行同源序列的搜索,基于BLAST搜索結(jié)果用BoxShade Server (http://www.ch.embnet.org/software/BOX_form.html)、Clustalx1.83和MEGA5.0軟件對HSP17.8進行同源蛋白的比對及進化樹分析。利用在線蛋白折疊識別工具PHYRE2 (http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)對HSP17.8的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測和模擬,用PyMOL program軟件對HSP17.8蛋白的3D模型進行繪制。

    3 結(jié)果與分析

    3.1 苦參RNA的提取鑒定

    從新鮮苦參葉片中提取的RNA經(jīng)超純水稀釋1000倍,在酶標儀上測定其OD在260 nm和280 nm處的值,計算OD260/OD280的比值為1.92,結(jié)果在1.8和2.0之間,說明提取的RNA純度較好;同時對新提取的苦參總RNA進行核酸電泳檢測,紫外燈下顯示所提RNA有3條可見的明亮條帶,說明苦參RNA的完整性較好。雙重檢測的RNA基本無降解,可以用來合成cDNA (圖未顯示)。

    3.2 目的基因hsp17.8的PCR鑒定

    以合成的苦參cDNA為模板,H1、H2為引物,用rTaqDNA聚合酶做兩步PCR。PCR結(jié)果如圖1-A所示,凝膠上有分子質(zhì)量在500 bp左右的明亮條帶,表明得到了預(yù)期大小的hsp17.8目的條帶。

    3.3 pMD19T-hsp17.8擴增質(zhì)粒的鑒定

    將核酸膠上的hsp17.8目的條帶切割下來純化濃縮,與pMD19-T Vector連接,轉(zhuǎn)化入實驗室新制備感受態(tài)細胞E.coliDH5α培養(yǎng),用菌液PCR和NdeⅠ、XhoⅠ雙酶切對培養(yǎng)的重組菌進行雙重鑒定,結(jié)果如圖1-B和1-C所示,在分子質(zhì)量500 bp左右處均出現(xiàn)清楚的目的條帶,說明pMD19T-hsp17.8擴增質(zhì)粒構(gòu)建成功。生工生物技術(shù)有限公司測序結(jié)果比對顯示此序列與苦參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)里的序列(TR2941)完全匹配。

    3.4 pET22b-hsp17.8表達質(zhì)粒的鑒定

    將經(jīng)過NdeⅠ、XhoⅠ雙酶切的pET22b(+)和同樣經(jīng)過NdeⅠ、XhoⅠ雙酶切的目的基因用T4 DNA Ligase進行連接,轉(zhuǎn)化入實驗室新制備的感受態(tài)細胞E.coliDH5α,取單個克隆進行菌液PCR和NdeⅠ、XhoⅠ雙酶切雙重鑒定,結(jié)果如圖1-D和1-E所示,在分子質(zhì)量500 bp左右處也均出現(xiàn)清楚的目的條帶,說明pET22b-hsp17.8表達質(zhì)粒構(gòu)建成功。經(jīng)生工生物技術(shù)有限公司再次測序,結(jié)果顯示此序列與上次測序結(jié)果完全匹配。

    圖1 hsp17.8的克隆與重組載體的構(gòu)建

    A:hsp17.8的PCR擴增;B:含有pMD19T-hsp17.8重組質(zhì)粒的菌液PCR;C:pMD19T-hsp17.8重組質(zhì)粒的雙酶切結(jié)果;D:含有pET22b-hsp17.8重組質(zhì)粒的菌液PCR;E:pET22b-hsp17.8重組質(zhì)粒的雙酶切結(jié)果。箭頭示意目的條帶

    3.5 Western blot結(jié)果分析

    將上述重組表達質(zhì)粒pET22b-hsp17.8轉(zhuǎn)入E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細胞。在不同溫度、時間下用不同濃度的IPTG誘導(dǎo)表達,其蛋白表達情況通過Western blot檢測,檢測結(jié)果如圖2-A所示,在分子質(zhì)量約17.8 ku處有明顯的條帶,與理論分子質(zhì)量值相符,蛋白在上清中的表達量遠遠高于沉淀中的表達量(沉淀蛋白表達圖片未顯示),說明此蛋白為可溶性蛋白?;赪estern blot檢測結(jié)果,用GraphPad Prism 6.0軟件對HSP17.8表達量進行繪圖分析,如圖2-B顯示,在溫度為16℃、IPTG終濃度為1 mmol/L,25℃、IPTG終濃度為0.5 mmol/L和37℃、IPTG終濃度為0.1 mmol/L條件下,HSP17.8蛋白表達量比較高,但總體比較結(jié)果是:在25℃、0.5 mmol/L IPTG條件下,苦參HSP17.8蛋白的表達量最高(*表示),因此25℃、終濃度為0.5 mmol/L IPTG是HSP17.8的最佳體外表達條件。

    圖2 熱應(yīng)激蛋白HSP17.8的誘導(dǎo)表達情況及表達量的分析

    A:Western blot結(jié)果(M為蛋白Marker;1、2、3、4代表在16℃下IPTG終濃度為0、0.1、0.5和1 mmol/L時的蛋白表達情況;5、6、7和8代表在25℃下IPTG終濃度為0、0.1、0.5和1 mmol/L時的蛋白表達情況;9、10、11和12代表在37℃下IPTG終濃度為0、0.1、0.5和1 mmol/L時的蛋白表達情況)。B:HSP17.8蛋白表達量的分析(*標示了最高表達量)

    3.6 生物信息學(xué)分析

    3.6.1 HSP17.8蛋白的物理化學(xué)性質(zhì)分析

    將HSP17.8編碼序列用在線工具(The Sequence Manipulation Suite)翻譯成氨基酸,再將氨基酸序列通過ProtParam (ExPaSy)軟件分析得到HSP17.8蛋白的分子質(zhì)量、分子式、等電點、電荷性等一系列物理化學(xué)性質(zhì),結(jié)果如下表1所示。此蛋白的不穩(wěn)定性指數(shù)為26.44 (小于40),說明此蛋白很穩(wěn)定,不容易降解;它的總平均親水性為-0.066,屬于負值,說明此蛋白為親水性蛋白,與Western blot結(jié)果顯示一致,即為可溶性蛋白。

    3.6.2 HSP17.8蛋白的潛在功能位點預(yù)測

    Motif Scan分析HSP17.8蛋白的氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)一個3-磷酸甘油醛脫氫酶、輔酶結(jié)合域、3個蛋白激酶C磷酸化位點、2個N-蛋白質(zhì)豆蔻?;稽c、3個酪蛋白激酶II磷酸化位點和3個N-糖基化位點,具體位置見表2;且K3-K157氨基酸序列與兩個應(yīng)激蛋白非常相似,E值分別為3e-19和9.3e-19,遠遠小于10-6,說明此蛋白與應(yīng)激蛋白同源性非常高,應(yīng)該屬于應(yīng)激蛋白家族中的一員。

    表1 HSP17.8蛋白的物理化學(xué)性質(zhì)

    3.6.3 HSP17.8同源序列比對及進化樹構(gòu)建

    通過SMART BLAST在線軟件分析,根據(jù)蛋白的同源性在NCBI數(shù)據(jù)庫中搜索到HSP17.8蛋白相似度最高的13個同源蛋白,它們的序列號分別為大豆(Glycinemax),NP_001237890.1;羽扇豆(Lupinusangustifolius),XP_019459376.1;木豆(Cajanuscajan),XP_020234148.1;豇豆(Vignaradiatavar.radiate),XP_014504733.1;野生大豆(Glycinesoja),KHN39491.1;蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula),XP_003616191.1;赤豆(Vignaangularis),XP_017430444.1;赤豆(Vignaangularis),XP_017430443.1;菜豆(Phaseolusvulgaris),XP_007141947.1;地三葉草(Trifoliumsubterraneum),GAU36776.1;蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula),XP_013454197.1;百脈根(Lotusjaponicas),AFK43932.1;大豆(Glycinemax),KRH72936.1。發(fā)現(xiàn)苦參HSP17.8與各種豆類的HSP同源性較高,這與苦參屬于豆科植物是一致的。用在線軟件BoxShade Server 和Clustalx1.83對HSP17.8及其相似度最高的13個同源蛋白進行比對,如圖3-A所示。使用MEGA5.0軟件的鄰接法(Neighbor-joining Method, NJ),步長值(Bootstrap values)設(shè)為1000的重復(fù)性對HSP17.8及其13個同源蛋白進行進化樹分析,如圖3-B所示,苦參的HSP17.8與羽扇豆的應(yīng)激蛋白在同一個子分支中,相似度達到了90%,說明苦參與羽扇豆的應(yīng)激蛋白同源性最高,兩物種之間的親緣關(guān)系最近。

    3.6.4 苦參HSP17.8的二級結(jié)構(gòu)分析及三級結(jié)構(gòu)模擬

    通過PHYRE2在線軟件,以得分最高的d1mjha為模板,獲得了HSP17.8蛋白的二級結(jié)構(gòu)信息及三維結(jié)構(gòu)模型(圖4),氨基酸序列覆蓋率為86% (覆蓋HSP17.8的142個氨基酸殘基,它們分別為1M、4A-45A、63L-161S),序列一致性為28%,可信度為99%。圖4-A結(jié)果顯示HSP17.8具有4個α螺旋(15A-27N、62P-93T、109E-114E、140S-148N)、5個β折疊(6T-10A、Q34-40V、97V-105G、121D-124V、153V-156V)。用三級結(jié)構(gòu)繪圖軟件PyMOL對HSP17.8蛋白的3D結(jié)構(gòu)進行繪制,如圖4-B所示,可以看出HSP17.8蛋白富含α螺旋和β折疊,α螺旋和β折疊依次出現(xiàn),形成了β1-α1-β2-α2-β3-α3-β4-α4-β5的折疊方式,5個β折疊相同方向,被α螺旋包裹在內(nèi)部,構(gòu)成了蛋白質(zhì)立體結(jié)構(gòu)的內(nèi)部框架。

    表2 HSP17.8蛋白的潛在功能位點

    圖3苦參HSP17.8的同源蛋白比對及進化樹分析

    Fig 3 Homologous alignment and phylogenic tree of HSP17.8

    A:HSP17.8與13個同源性最高的蛋白比對圖。B:HSP17.8的進化關(guān)系圖(0.02表示遺傳距離;枝干數(shù)字表示分支支持率)

    4 討論

    植物小分子熱激蛋白(small heat shock proteins, sHSP)在植物受到逆境脅迫下表達量明顯增加,提高了植物對各種逆境因子脅迫的防御能力,是一類重要的脅迫誘導(dǎo)蛋白[14],被認為是植物抗逆過程中的第一道防線[15]。劉箭等[16]利用Northern雜交法發(fā)現(xiàn)高溫脅迫下,番茄花藥中細胞質(zhì)和線粒體sHSP基因轉(zhuǎn)錄明顯,認為sHSP基礎(chǔ)含量的增加可減緩快速升溫對熱敏性花藥的傷害。Lund等[17]研究結(jié)果表明,在熱激誘導(dǎo)下玉米線粒體小分子HSP22相比大分子HSP70含量發(fā)生了明顯變化,認為線粒體小分子熱應(yīng)激蛋白HSP22在分子水平、蛋白質(zhì)水平和細胞器水平上對植物主要起保護功能,直接影響植物線粒體耐熱性。Sun等[18]研究發(fā)現(xiàn)過表達的At-HSP17.6A能夠提高擬南芥的耐鹽性和抗旱性,說明sHSP對逆境生理研究有著重要意義。

    圖4 HSP17.8的二級結(jié)構(gòu)及空間構(gòu)型圖

    A:苦參HSP17.8的二級結(jié)構(gòu)圖(1、2、3、4分別代表預(yù)測的HSP17.8二級結(jié)構(gòu)、HSP17.8的氨基酸序列、模板d1mjha的氨基酸序列、模板d1mjha的已知二級結(jié)構(gòu);綠色螺旋狀為α螺旋,淺藍色箭頭為β折疊)。B:苦參HSP17.8的3D模型圖(黃色箭頭表示β折疊;紅色螺旋表示α螺旋;綠色為無規(guī)卷曲;N-terminal為HSP17.8蛋白的氨基末端;C-terminal為HSP17.8蛋白的羧基末端)

    基于sHSP的重要的生物學(xué)功能及其巨大的應(yīng)用潛力,作者利用分子生物學(xué)手段首次從苦參中克隆了長度為498 bp的熱應(yīng)激蛋白小分子家族HSP17.8基因,其編碼166個氨基酸,GenBank登錄號為MF101468,并成功在體外誘導(dǎo)其表達,該蛋白分子質(zhì)量約為17.8 ku,等電點為8.55,是穩(wěn)定親水性蛋白。我們進一步篩選了其最佳的體外誘導(dǎo)表達條件,分析了該蛋白的理化性質(zhì)、進化關(guān)系以及空間結(jié)構(gòu)特點等,發(fā)現(xiàn)該蛋白與羽扇豆的應(yīng)激蛋白同源性達到了90%,親緣關(guān)系最近,這與苦參是豆科植物是一致的。本研究為今后探索植物小分子熱激蛋白的誘導(dǎo)機理、結(jié)構(gòu)功能以及在植物體內(nèi)的抗逆機制奠定了基礎(chǔ)。

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