周應(yīng)培,馮莉莉
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,湖南長沙410128;2.長沙道勤生物科技有限公司,湖南長沙410129)
試驗研究
泰萬菌素對大鼠胃菌群的影響
周應(yīng)培1,2,馮莉莉1,2
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院,湖南長沙410128;2.長沙道勤生物科技有限公司,湖南長沙410129)
為了解泰萬菌素對大鼠胃內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)的影響,試驗采用PCR-DGGE技術(shù)分離方法分析大、小劑量泰萬菌素作用下大鼠胃內(nèi)細菌的變化情況及其停藥后恢復(fù)狀態(tài)。結(jié)果顯示:泰萬菌素作用時,大鼠胃內(nèi)細菌數(shù)量減少,菌群多樣性降低,且在大劑量組效果顯著;停藥后僅有兩種細菌恢復(fù),大、小劑量組各有2種、4種細菌消失。泰萬菌素在某種程度上能抑制細菌的生長,但也可以間接促進某些細菌生長,總體而言泰萬菌素對大鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)的影響不大。
泰萬菌素;DGGE;胃;菌群結(jié)構(gòu)
胃在動物消化、吸收營養(yǎng)等方面具有重要意義,同時,胃內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)在維持胃正常功能方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。然而,近年來,由于抗生素的濫用,造成了消化道菌群結(jié)構(gòu)紊亂、細菌間的交互耐藥性等方面的問題。為此,英國伊科動物保健公司開發(fā)出比同類型大環(huán)內(nèi)酯類抗生素在抗菌譜、作用強度、毒副作用等方面更具優(yōu)勢的泰萬菌素,其作用機理是阻斷肽鏈延伸,導(dǎo)致細菌難以合成蛋白質(zhì),從而發(fā)揮殺滅有害菌的治療效果。但抗生素在殺滅有害菌的同時也可能抑殺有益菌,故探究泰萬菌素是否對消化道內(nèi)細菌產(chǎn)生嚴重傷害有一定意義,但目前國內(nèi)外對這方面的研究較少,本研究采用PCR-DGGE技術(shù)探討泰萬菌素對大鼠胃內(nèi)菌群的影響及用藥后細菌恢復(fù)力。
Wester大鼠18只,體重180±8 g,購自湖南斯萊克景達實驗動物有限公司。
泰萬菌素,購自湖南某生物科技股份有限公司;細菌基因組DNA提取試劑盒、DNA片段快速純化/回收試劑盒,購自天根生化科技(北京)有限公司;變性梯度凝膠電泳儀系統(tǒng)(DGGEK-2001),購自美國CBS公司。
1.3.1 試驗動物處理與試驗方法
將大鼠連續(xù)預(yù)飼7 d后,隨機分成3組(分別為對照組、小劑量組、大劑量組),每組6只。
以純凈水溶解泰萬菌素,使其濃度為11.6 mg/50mL和23.2mg/50mL,分別供大、小劑量試驗組自由飲用,連續(xù)3d。對照組自由飲用純凈水。第4 d后,兩試驗組停藥,改飲純凈水。
分別于投藥后的第4 d、11 d取樣,取樣方法是:每組隨機取鼠3只,無菌條件下分別取胃內(nèi)容物約2 g置入無菌離心管內(nèi),加入滅菌生理鹽水(300μL),然后300 r/min離心10min,移取上清液至另一干凈離心管,12 000 r/min,10min,棄上清,沉淀備用。
1.3.2 樣品細菌總DNA提取
取沉淀,加入緩沖液,蛋白酶k消化,按細菌基因組DNA提取試劑盒步驟提取細菌基因組DNA,操作見說明書。
1.3.3 細菌16S rDNA V3區(qū)擴增
以 細 菌 總 DNA 為 模 板 ,341F(5’-CCTACGGGAGGCAGCAG-3’)和 907R(5’-CCCCGTCAATTCATTTGAGTTT-3’)為引物,進行第一輪擴增。以上述PCR產(chǎn)物為模板,以341F-GC(5’-CGCCCGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGGGC CGGGGGGCCTACGGGAGGCAGCAG-3’) 和 518R(5’-ATTACCGCGGCTGCTGG-3’)為引物,進行第二輪擴增,產(chǎn)物即為細菌16S rDNA V3區(qū)。上述擴增體系為:細菌DNA模板2.0μL,上、游引物各1μL,TransTaqHiFiSuperMix 25 μL,補加 ddH2O 至50μL。擴增條件為:95℃ 5min;95℃ 30 s、66℃30 s、72.0 ℃ 12 s,32 個循環(huán);72.0 ℃ 7min。
取第二輪PCR產(chǎn)物5μL,于1.5%瓊脂糖凝膠中電泳30min,觀察結(jié)果。
1.3.4DGGE電泳及產(chǎn)物處理
取第二輪PCR產(chǎn)物10μL,點樣于預(yù)先制備好的變性凝膠點樣孔,在60℃、300 V電壓下預(yù)電泳10min,再電泳7.0 h。取出凝膠,EB染色20min,觀察,拍照,分析。
紫外光下切取DGGE膠中明亮、清晰的條帶,沖洗3次至滅菌EP管中,以DNA片段快速純化回收試劑盒純化回收DNA片段。產(chǎn)物與pMETeasy載體連接,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,陽性克隆,送至深圳華大基因科技服務(wù)有限公司測序。
1.3.5 數(shù)據(jù)處理
將測序序列與GenBank上已登錄序列進行Blast比對,尋找相似度最高的同源性序列。用Quantity One v4.6.2構(gòu)建DGGE電泳譜圖進行分析。
上述樣品經(jīng)二輪擴增,產(chǎn)物大小約為200bp,與預(yù)計大小一致,見圖1。
圖1 大鼠胃內(nèi)細菌16S rDNA V3區(qū)擴增片段
用上述擴增的細菌16S rRNA V3區(qū)產(chǎn)物進行DGGE電泳,結(jié)果見圖2。
圖2 大鼠胃細菌菌群DGGE電泳圖
從圖2可見:大鼠飲用泰萬菌素后,細菌種類有所減少,如小劑量組A2、A6、A8等條帶消失,大劑量組A2、A3、A4等條帶消失;細菌數(shù)目下降,如小劑量組A5、A7條帶亮度降低,大劑量組A10條帶亮度減弱;有新的細菌出現(xiàn),如小劑量組A9、A13條帶出現(xiàn),大劑量組A9條帶出現(xiàn)。停藥后,相對于用藥期:細菌數(shù)目下降,如小劑量時的A1、A12、A13等條帶消失,大劑量時的A9、A12消失;而用藥時消失的細菌部分恢復(fù),如停藥后A2、A10條帶重新出現(xiàn)。停藥后細菌種類沒有恢復(fù)到原來狀態(tài),但有恢復(fù)趨勢。
本實驗切取13條DGGE優(yōu)勢條帶,純化、回收,經(jīng)測序、比對后,選擇與之最相近菌種,結(jié)果見表1。
表1 DGGE回收條帶序列比對結(jié)果
從表1中可見:胃內(nèi)存在細菌有乳酸菌、糞芽孢桿菌、志賀氏桿菌、產(chǎn)氣莢膜梭菌和巴氏梭菌等桿菌屬和梭菌屬,其相似度大97%以上。
結(jié)合圖2和表1,用藥后條帶發(fā)生了明顯的變化,一些細菌豐度降低,另一些細菌豐度升高,胃內(nèi)細菌多樣性降低,這一現(xiàn)象在高濃度作用時更顯著。停藥后細菌短時間內(nèi)未恢復(fù)到原來狀態(tài),但有恢復(fù)傾向。這與陳鳳[1](2015)研究:口服抗生素后腸道菌群發(fā)生改變,停藥3周后腸道菌群恢復(fù)到原來狀態(tài)結(jié)果相近。
泰萬菌素導(dǎo)致胃內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)不同程度的改變,其潛在影響因素可能有如下幾種:
(1)泰萬菌素的抗菌作用,大環(huán)內(nèi)酯類抗生素對需氧革蘭陽性菌、部分革蘭陰性菌有很好的抑殺作用[2]。同時,一些抗生素可抑制消化道內(nèi)有害菌的生長,如諾氟沙星可干擾致病菌DNA復(fù)制來抑制致病菌生長。
(2)胃內(nèi)細菌形成相互競爭,相互制約的關(guān)系,當(dāng)一種細菌減少或消失時,另外一種細菌可能因為獲得其生態(tài)位或失去制約而瘋長。如:朱小翠認為,芽孢桿菌(Bacillus)能參與生物奪氧,降低腸道內(nèi)局部的氧分壓,維持腸道環(huán)境的穩(wěn)定,抑制某些細菌的生長[3]。
(3)胃內(nèi)微生態(tài)改變,在泰萬菌素的作用下胃內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)改變,引起其微生態(tài)發(fā)生變化。新的條件更適于一些細菌的生長,而不利于另外一些菌的生長。
(4)泰萬菌素在胃內(nèi)的吸收效果,胃由于胃酸的作用,同時大環(huán)內(nèi)酯類抗生素為弱堿性[4],泰萬菌素在胃內(nèi)可能由于被中和而導(dǎo)致藥物濃度無法抑制某些細菌生長。
(5)腸道菌群的代謝功能,陳懷俠[5](2007)等采用液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)對阿托品在大鼠腸道菌群中的代謝產(chǎn)物進行了研究,發(fā)現(xiàn)了9種阿托品腸道菌群代謝產(chǎn)物,如脫水阿托品、脫品和脫品酸。藥物進入消化道后,可通過消化道內(nèi)細菌的代謝活化使之具備強大的藥理活性[6],從而發(fā)揮更好療效,對某些細菌抑制作用加強。
無論是胃內(nèi)細菌增多或減少,結(jié)果表明泰萬菌素作用下,對胃腸道產(chǎn)生了一定影響,但未造成不可逆損傷,且停藥后胃內(nèi)菌群結(jié)構(gòu)有恢復(fù)到原來狀態(tài)的趨勢。這預(yù)示著在養(yǎng)殖生產(chǎn)上合理使用泰萬菌素是安全的,但若過量使用可能會導(dǎo)致腸道菌群失衡,產(chǎn)生耐藥性細菌,故用藥時應(yīng)謹慎。
本實驗采用的DGGE技術(shù)克服了微生物難培養(yǎng)或不可培養(yǎng)兩方面的局限,不僅具有可大量檢測、能與其他方法結(jié)合使用等優(yōu)點,其在揭示自然界微生物多樣性方面具有獨特的優(yōu)越性。
[1]陳鳳.口服抗生素改變大鼠腸道菌群和大腦海馬腦源性神經(jīng)營養(yǎng)因子的表達及其恢復(fù)[D].遼寧:大連醫(yī)科大學(xué),2015:13.
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S859.796
A
1006-4907(2017)04-0033-03
10.3969/j.issn.1006-4907.2017.04.017
2017-07-17
周應(yīng)培(1981~),男,漢族,湖南寧鄉(xiāng)人,助理獸醫(yī)師,主要從事動物疫病的防控和研究,E-mail:779977588@.com。