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    LPXTG基序蛋白lmo0160基因缺失對單增李斯特菌生物膜形成的影響

    2017-05-07 02:59:36張奇文凌晨馬勛薄新文杜冬冬錢凌霄李紅歡
    關(guān)鍵詞:李斯特同源菌液

    張奇文 ,凌晨 ,馬勛 *,薄新文 ,杜冬冬 ,錢凌霄 ,李紅歡

    (1石河子大學動物科技學院,新疆 石河子 832003;2新疆天康畜牧生物技術(shù)股份有限公司,新疆 烏魯木齊,830013;3省部共建綿羊遺傳改良與健康養(yǎng)殖國家重點實驗室/新疆農(nóng)墾科學院,新疆 石河子 832000)

    單增李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)是一種胞內(nèi)寄生革蘭氏陽性短桿菌,可寄生在蜱、蠅、昆蟲、魚及甲殼動物體內(nèi),是引起人和動物致病的重要食源性人畜共患病病原菌[1]。該菌具有較強的環(huán)境適應性,可在低溫、高鹽、酸堿等不利的環(huán)境條件下生長繁殖,可穿越機體三大屏障,引起菌血癥,并引發(fā)全身性感染,如敗血癥、腦膜腦炎、胎膜炎等[2-3],對新生兒、妊娠母畜和免疫功能不全者等易感動物的發(fā)病率和死亡率均較高[4]。該菌被世界衛(wèi)生組織列為僅次于大腸桿菌O157、沙門氏菌、志賀氏菌后的第四大重要的食源性致病菌[5]。

    生物膜(biofilm,BF),是指細菌粘附于生物或非生物表面,分泌多糖基質(zhì)、纖維蛋白、脂質(zhì)蛋白等,將其自身包繞其中而形成的大量細菌聚集膜樣物,是微生物生活時所采取的一種特殊生存狀態(tài)[6-7]。LM在適宜環(huán)境下可形成生物膜,為細菌提供有效庇護所,還能使細菌獲得抵抗逃避宿主防御能力和普通抗菌藥物。因其抗性強和難清除,從而造成較嚴重的危害[8]。生物膜多與李氏桿菌病有關(guān),傳統(tǒng)的食品加工原輔料富含營養(yǎng)物質(zhì),為LM生物膜的形成及生長創(chuàng)造有利條件[9],LM生物膜使其對消毒劑及光、熱、紫外線等的耐受性顯著增強,傳統(tǒng)的殺菌策略不能有效的處理生物膜,在臨床上形成持續(xù)感染,對人類公共衛(wèi)生和畜牧業(yè)發(fā)展造成嚴重危害。

    LM有一類表面蛋白,其前體蛋白C端含有保守基序LPXTG(Leu-Pro-X-Thr-Gly),這些蛋白由分選酶(SortaseA,SrtA)通過識別LPXTG保守基序,將蛋白共價結(jié)合到細胞壁肽聚糖上,呈現(xiàn)在細胞表面,在感染機體過程中發(fā)揮重要毒力作用[10]。LM基因組序列分析預測,有41個LPXTG保守基序蛋白,其中InlF[11],InlJ[12],LapB[13],Lmo1413[14],actA[15]等部分蛋白的功能已被研究。

    本研究通過對LPXTG基序表面蛋白Lmo0160的分子結(jié)構(gòu)特征及結(jié)構(gòu)域的初步分析,可推測Lmo0160的膠原蛋白結(jié)合結(jié)構(gòu)域可能在生物膜形成中發(fā)揮作用。因此,本研究通過SOE-PCR及同源重組技術(shù)構(gòu)建LM90SB2的Δlmo0160基因缺失株,并分析野生株和lmo0160基因缺失株生物膜形成能力的變化,為進一步了解LM生物膜及其致病性提供理論依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 菌株和質(zhì)粒

    LM90SB2分離株是新疆致綿羊腦炎單增李斯特菌分離株,由石河子大學動物科技學院實驗室分離、鑒定并保存,血清型為4b型;穿梭質(zhì)粒pKSV7載體由浙江大學動物科學學院分子微生物與食品安全衛(wèi)生實驗室保存惠贈;pMD19-T(Simple)載體購自大連寶生物 (Takara)公司;大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α購自北京全式金生物技術(shù)有限公司。

    1.1.2 培養(yǎng)基與試劑

    質(zhì)粒小提取試劑盒、細菌基因組DNA提取試劑盒等購自天根生化科技有限公司(北京);瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒購自北京諾維森生物科技有限公司;DNA Marker、Pfu DNA 高保真聚合酶、dNTPs等購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;2×PCR Mix購自上海東盛公司;限制性內(nèi)切酶 (BamHⅠ和PstⅠ)、T4 DNA連接酶等購自Promega生物技術(shù)有限公司 (上海);氨芐青霉素、氯霉素等購自美國Sigma公司;腦心浸液培養(yǎng)基(brain heart infusion broth,BHI)、胰蛋白胨、酵母浸粉等購自北京陸橋技術(shù)股份有限公司。

    1.2 方法

    1.2.1 引物設(shè)計與合成

    參照GenBank中參考菌株F2365和EGD-e的序列(ID:AE017262和 AL601824),應用 Primer 5.0軟件設(shè)計用于擴增lmo0160基因上下游同源臂片段、驗證缺失株以及LM的特異性引物,在lmo0160-F1和lmo0160-R2的 5’端分別引入 BamHⅠ和 PstⅠ(斜體下劃線部分)和保護性堿基(斜體部分)(表1),由上海生工有限公司合成。

    表1 構(gòu)建LM90SB2 lmo0160基因缺失株特異性引物Tab.1 Specific primers for construction of lmo0160 gene deletion strain of LM90SB2

    1.2.2 lmo0160基因上下游同源臂的擴增

    用細菌基因組DNA提取試劑盒提取LM90SB2的基因組 DNA,用 lmo0160-F1、lmo0160-R1、lmo0160-F2和lmo0160-R2分別擴增上、下游同源臂片段;25 μL 反 應 體 系 :10×PCR Buffer2.5 μL,PfuDNA 高保真聚合酶 1 μL,dNTPs 1 μL,DNA 模板2 μL,上下游引物各 1 μL,ddH2O 16.5 μL。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠后,用膠回收試劑盒回收。

    1.2.3 lmo0160基因缺失片段的擴增、克隆及測序

    以上下游同源臂為模板,采用20 μL反應體系:10×PCR Buffer 2 μL,dNTPs 2.5 μL,上下游同源臂各 3 μL,TapDNA 聚合酶 0.5 μL,ddH2O 9 μL。反應條件:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s,61 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,12個循環(huán);72 ℃ 10 min。然后加入lmo0160-F1和 lmo0160-R2引物各 0.5 μL擴增 30個循環(huán)。PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒回收后,與pMD19-T(Simple)載體連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞中。挑取單菌落擴大培養(yǎng)提取質(zhì)粒,通過 PCR(lmo0160-F1和 lmo0160-R2)和BamHⅠ、PstⅠ雙酶切鑒定后篩選出陽性克隆菌,送北京六合華大基因科技有限公司測序。將測序正確的陽性克隆菌命名為pMD19-T-Δlmo0160。

    1.2.4 pKSV7重組穿梭質(zhì)粒的構(gòu)建

    分別將pMD19-T-Δlmo0160和pKSV7穿梭質(zhì)粒用BamH Ⅰ和PstⅠ置于37℃水浴中雙酶切,酶切3 h后,加入 4 μL 10×Loading buffer終止酶切反應,經(jīng)凝膠電泳驗證正確后切膠回收目的條帶,利用T4 DNA連接酶將酶切后的 lmo0160片段連入pKSV7載體;然后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞中,經(jīng)菌液 PCR(lmo0160-F1和 lmo0160-R2)和雙酶切驗證成功后,送北京六合華大基因科技有限公司測序。

    1.2.5 電轉(zhuǎn)后陽性轉(zhuǎn)化子篩選與鑒定

    參照文獻[16]制備單增李斯特菌LM90SB2感受態(tài)細胞。取10 μL pKSV7-Δlmo0160重組穿梭質(zhì)粒加入100μL LM90SB2感受態(tài)細胞中,并將其混勻后加到處理好的電轉(zhuǎn)杯中,冰浴10 min,電轉(zhuǎn)化(2.5 kV,5 ms)后,加入 1 mL BHI(含 0.5 mol/L蔗糖)液體培養(yǎng)基,冰浴30 min后轉(zhuǎn)置30℃恒溫培養(yǎng)箱靜置3 h,8000 r/min離心5 min,棄上清,剩余菌體涂布于BHI瓊脂平板 (含10 μg/mL氯霉素),30 ℃培養(yǎng)48 h,挑取單菌落置30℃過夜培養(yǎng),通過菌液PCR(lmo0160-F1和lmo0160-R2)篩選出陽性轉(zhuǎn)化子。

    1.2.6 同源重組及l(fā)mo0160基因缺失株的鑒定

    將上述鑒定的陽性轉(zhuǎn)化子接種于BHI液體培養(yǎng)基,在溫度(42℃)和氯霉素抗性(10 μg/mL)的雙重壓力下進行同源重組。傳代培養(yǎng)25代后,挑單菌落,菌液PCR篩選出有氯霉素抗性的單交換重組菌。然后在無氯霉素抗性BHI液體培養(yǎng)基中30℃培養(yǎng),以丟失抗性質(zhì)粒。通過影印接種于抗氯霉素和不抗氯霉素BHI板篩選出無抗性的缺失株,再經(jīng)驗證引物和LM特異性引物PCR進一步鑒定。最終得到正確基因缺失株LM90SB2-Δlmo0160。

    1.2.7 缺失株生長曲線

    挑取LM90SB2、LM90SB2-Δlmo0160單菌落接種于BHI液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)至OD600nm≈0.4,以1∶100的比例分別接種于20 mL BHI液體培養(yǎng)基中,37℃恒溫細菌振蕩培養(yǎng)箱(180 r/min)培養(yǎng),每 2 h取 200 μL菌液加入 96孔板中測定 600 nm波長處的光密度值(OD600nm),根據(jù)不同時間點的OD600nm值,繪制生長曲線。設(shè)置平行組,重復3次。

    1.2.8 結(jié)晶紫染色法觀察生物膜形態(tài)

    將 LM90SB2、LM90SB2-Δlmo0160 菌液以 1∶100的比例分別接種于新鮮配制BHI液體培養(yǎng)基中,使其 OD600nm≈0.2(約 109CFU/mL),取 8 mL 菌液分別加入放置有8個無菌蓋玻片的90 mm無菌培養(yǎng)皿中,37 ℃培養(yǎng),分別于 8、12、24和 48 h,無菌取出2個蓋玻片于平皿中,加5 mL PBS輕輕晃動,去除懸浮和粘附不牢固的細菌,置55℃干燥箱中干燥30 min,加入1%結(jié)晶紫于室溫染色30 min,棄結(jié)晶紫染液,用PSB洗滌5次,室溫下干燥30 min,重復3次。置于顯微鏡下觀察生物被膜的形態(tài),拍照并記錄。

    1.2.9 結(jié)晶紫染色法測定生物膜形成能力

    取200 μL OD600nm≈0.2菌液加入到 96孔微孔板中,每個樣品分3組,每組設(shè)置12個平行重復,并封閉微孔板周圍,37℃靜置培養(yǎng),分別于 8、12、24和48 h;棄孔中培養(yǎng)基,加入200 μL PBS洗滌3次,去除浮游菌體,55℃干燥箱中干燥30 min,然后每個孔中分別加入150 μL 1%結(jié)晶紫溶液,在室溫下染色 30 min,棄染色液,再用 200 μL PBS洗滌5次,55℃干燥箱中干燥30 min;再加入150 μL 95%乙醇脫色30 min,用酶標儀測定其OD570nm值,重復3次。

    1.2.10 數(shù)據(jù)處理

    利用Graphpad軟件繪制折線圖和柱形圖,lmo0160基因缺失菌株和野生菌株的生長曲線和生物被膜定量數(shù)據(jù)分析均采用T檢驗法進行比較。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 lmo0160基因上下游同源臂融合

    以 lmo0160-F1 和 lmo0160-R1、lmo0160-F2 和lmo0160-R2為引物分別擴增上、下游同源臂,經(jīng)凝膠電泳分別得到479 bp單一目的條帶(圖1)。SOE-PCR融合上、下游同源臂,lmo0160-F1和lmo0160-R2為引物PCR擴增上下游同源臂融合片段,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳得到大小約為958 bp(圖2)。經(jīng)測序、序列比對分析表明上下游同源臂已成功融合。

    圖1 lmo0160基因上下游同源臂PCR擴增結(jié)果Fig.1 Homologous arms amplified of lmo0160 gene by PCR

    圖2 lmo0160重疊延伸PCR擴增結(jié)果Fig.2 Products amplification of lmo0160 by SOE-PCR

    2.2 重組穿梭質(zhì)粒 pKSV7-Δlmo0160構(gòu)建及鑒定

    Δlmo0160與pMD19-T(Simple)載體連接后,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α中,經(jīng)PCR鑒定為陽性的菌液,提取質(zhì)粒經(jīng)雙酶切鑒定得到2692和958 bp 2個條帶(圖3),將測序正確重組質(zhì)粒命名為pMD19-T-Δlmo0160。將同步雙酶切膠回收后的Δlmo0160與pKSV7載體連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α中,PCR篩選出陽性菌液,提取質(zhì)粒雙酶切鑒定得到6900和958 bp 2個條帶(圖4),表明重組穿梭質(zhì)粒pKSV7-Δlmo0160成功構(gòu)建。

    圖3 pMD19-T-Δlmo0160雙酶切鑒定Fig.3 Identification of pMD19-T-Δlmo0160 by double enzyme digestion

    圖4 pKSV7-Δlmo0160雙酶切鑒定Fig.4 Identification of pKSV7-Δlmo0160 by double enzyme digestion

    2.3 LM90SB2-Δlmo0160缺失株篩選及鑒定

    經(jīng)電轉(zhuǎn)化將pKSV7-Δlmo0160重組載體導入單增李斯特菌感受態(tài)細胞內(nèi),增菌后,挑取單菌落進行PCR(lmo0160-A和lmo0160-B)鑒定,篩選出的陽性轉(zhuǎn)化子可擴增得到2841和1133 bp目的條帶(圖5A);含pKSV7-Δlmo0160質(zhì)粒的LM90SB2菌株,在溫度和氯霉素抗性雙重壓力下發(fā)生同源重組,可獲得無氯霉素抗性和不含pKSV7和lmo0160基因的LM90SB2-Δlmo0160菌株,經(jīng) PCR擴增得到 1條1133 bp目的條帶,表明成功構(gòu)建了LM90SB2-Δlmo 0160缺失株 (圖5B);37℃無抗性傳代培養(yǎng)25代,菌液PCR檢測顯示:缺失株只能擴增出1133 bp單一條帶,野生株只能擴增出2841 bp單一條帶,結(jié)果表明缺失條帶穩(wěn)定存在,即得到了穩(wěn)定遺傳的lmo0160基因缺失株(圖5C)。

    圖5 LM90SB2-Δlmo0160重組菌PCR檢測Fig.5 Identification of recombinant bacteria LM90SB2-Δlmo0160 by PCR

    2.4 缺失株生長曲線

    將LM90SB2和LM90SB2-Δlmo0160分別置于37℃條件下培養(yǎng),以測定的OD600nm值為縱坐標,時間為橫坐標繪制其生長曲線。

    圖6 LM90SB2和LM90SB2-Δlmo0160的生長曲線Fig.6 Growth curves of LM90SB2 and LM90SB2-Δlmo0160

    由圖6可知,培養(yǎng)4 h后,LM90SB2-Δlmo0160生長顯著低于LM90SB2,隨著時間的推移,OD600nm值差別更加明顯(P<0.01),說明lmo0160基因很可能是LM正常生長過程中必需的基因,結(jié)果顯示lmo0160基因的缺失對細菌本身的生長活力造成一定影響。

    2.5 lmo0160基因缺失生物膜形態(tài)學觀察

    顯微鏡下觀察細菌生物膜的形態(tài)。8和12 h生物膜均為網(wǎng)格結(jié)構(gòu),但LM90SB2-Δlmo0160菌的聚集程度低于 LM90SB2(圖 7A、B、E、F);24 h 時LM90SB2-Δlmo0160網(wǎng)格結(jié)構(gòu)較LM90SB2松散 (圖7C、G);48 h 時與 LM90SB2-Δlmo0160 相比,LM90SB2形成高度致密的生物膜(圖7D、H)??梢妉mo0160基因的缺失對LM90SB2形成生物膜的時間和形態(tài)有一定程度的影響。

    圖7 LM90SB2和LM90SB2-Δlmo0160形成的生物膜(×400)Fig.7 Formation of biofilm by LM90SB2 and LM90SB2-Δlmo0160(×400)

    2.6 lmo0160基因缺失生物膜形成能力測定

    以測定時間為橫坐標,OD570nm值為縱坐標繪制柱狀圖,8 h和 12 h時,LM90SB2和 LM90SB2-Δlmo0160生物膜生成能力有差異但不顯著 (P>0.05);24 h時,LM90SB2-Δlmo0160形成生物膜的能力明顯低于 LM90SB2,差異顯著(P<0.05);48 h 時,LM90SB2形成生物膜能力明顯高于 LM90SB2-Δlmo0160,差異極顯著(P<0.001)。隨著培養(yǎng)時間的延長,lmo0160基因缺失對生物膜形成的影響越明顯。

    圖8 LM90SB2和LM90SB2-Δlmo0160的生物膜形成能力Fig.8 The biofilm-forming capability of LM90SB2 and LM90SB2-Δlmo0160

    3 討論

    LM致病過程不僅毒力因子 (如內(nèi)化素,Act A,李氏桿菌溶血素O,磷酸脂酶C,蛋白Cwh A和金屬蛋白酶等)起關(guān)鍵作用[6,9],生物膜也發(fā)揮重要的作用[17]。生物膜是細菌通過分泌胞外基質(zhì)粘附于生物或非生物表面,并嵌入其所分泌的胞外多聚物中而形成具有一定立體結(jié)構(gòu)的微生物聚集群體[18]。在適宜環(huán)境下,LM均可在表面形成生物膜,形成生物膜的菌體在胞外基質(zhì)的保護下可以增強其耐藥性,阻礙臨床抗菌藥物治療以及引起宿主免疫反應。

    有研究報道[3,10],SrtA特異識別含有LPXTG保守基序的表面蛋白并將這類蛋白通過蛋白修飾定位到細胞壁上,SrtA基因的缺失導致細菌細胞壁成分的改變,從而對細菌的生長增殖產(chǎn)生一定影響。Lmo0160蛋白屬于LPXTG保守基序的表面蛋白,生長曲線測定試驗發(fā)現(xiàn)lmo0160基因的缺失使得細菌自身的生長繁殖能力顯著降低 (P<0.01),說明lmo0160基因?qū)毦陨淼纳L繁殖能力有一定的調(diào)控作用,也提示lmo0160基因可能是細菌生長繁殖中起關(guān)鍵作用的調(diào)控因素。

    細菌生物膜是機體對抗不利環(huán)境的一種自我保護機制,一旦形成后極難去除并增強其耐藥性,易造成一些疾病呈現(xiàn)持續(xù)性感染并發(fā)展為慢性炎癥[19]。細菌生物膜形成的動態(tài)過程一般為五階段[20]:浮游細菌可逆性地吸附于生物或非生物表面 (此階段是抗菌藥物發(fā)揮藥效的最佳時間);細菌對表面的吸附轉(zhuǎn)變?yōu)椴豢赡娴倪^程,并開始分泌多種表面聚合物(生物膜活性的關(guān)鍵);早期生物膜結(jié)構(gòu)即微菌落的形成;形成成熟的生物膜 (圓柱形視覺可見的空腔結(jié)構(gòu));生物膜中細菌被釋放到環(huán)境中再次變成浮游菌狀態(tài)。本試驗通過缺失lmo0160基因研究LM90SB2生物膜的生成能力,在顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn),基因缺失株形成成熟生物膜的時間比LM90SB2明顯延后,且生物膜密度和完整性明顯不如LM90SB2。在570 nm波長下測定生物膜生成量,早期階段8和12 h,有影響但不顯著(P>0.05);后期24和48 h缺失株生物膜生成能力顯著和極顯著低于LM90SB2(24 h時,P<0.05;48 h 時P<0.001)。這表明 LM90SB2 形成生物膜的能力在一定程度上直接或間接受到lmo0160基因表達的影響。

    總之,本試驗成功構(gòu)建了單增李斯特菌lmo0160基因缺失株 LM90SB2-Δlmo0160,并發(fā)現(xiàn) lmo0160基因?qū)M90SB2生長增殖和生物膜具有一定的調(diào)控作用,為進一步闡明LM毒力因子的致病機理奠定了理論基礎(chǔ)。

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