段明珠黃 貝梁 英張芳芳聶 品黃文樹,
(1. 集美大學水產(chǎn)學院, 廈門 361021; 2. 鰻鱺現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術教育部工程研究中心, 廈門 361021; 3. 中國科學院水生生物研究所, 武漢 430072; 4. 福建省海洋生物資源開發(fā)利用協(xié)同創(chuàng)新中心, 廈門 361021)
日本鰻鱺肝臟表達抗菌肽2基因的克隆與表達
段明珠1,2黃 貝1,2*梁 英1,2張芳芳1,2聶 品3黃文樹1,2,4
(1. 集美大學水產(chǎn)學院, 廈門 361021; 2. 鰻鱺現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術教育部工程研究中心, 廈門 361021; 3. 中國科學院水生生物研究所, 武漢 430072; 4. 福建省海洋生物資源開發(fā)利用協(xié)同創(chuàng)新中心, 廈門 361021)
為探討魚類抗菌肽基因的生物學功能, 研究應用RACE方法克隆獲得了日本鰻鱺 (Anguilla japonica) 肝臟表達抗菌肽2基因 (Liver-Expressed Antimicrobial Peptide 2, LEAP-2), 即AJLEAP-2的cDNA序列, 全長為450 bp, 開放閱讀框編碼89個氨基酸。其成熟肽含有LEAP-2保守基序“C-X5-C-X4-C-X4-C”。AJLEAP-2基因組結構與其他脊椎動物LEAP-2相同, 都包含有三個外顯子。利用熒光定量PCR檢測了AJLEAP-2在日本鰻鱺不同組織/器官中的表達, 發(fā)現(xiàn)其轉錄子在肝臟中表達量最高, 是內參基因 (β-actin) 的6倍; 其次是腸道, 但其表達量僅為肝臟的1/130。此外, 還檢測了AJLEAP-2在日本鰻鱺玻璃鰻(Glass eel)階段的轉錄表達水平, 結果顯示, 玻璃鰻中AJLEAP-2的轉錄表達量僅低于黑仔期的肝臟, 為黑仔鰻腸道表達量的2倍。LPS和遲緩愛德華菌 (Edwardsiella tarda) 刺激能顯著上調鰻鱺血液中AJLEAP-2的轉錄表達, 刺激16h后上調倍數(shù)最高, 分別為對照組的86倍和12倍。此外, LPS刺激72h和E. tarda 刺激8h后, 腸道中AJLEAP-2顯著上調表達(P<0.05), 為對照組的8倍。Poly I:C刺激24h后, 血液中AJLEAP-2轉錄表達顯著下調。結果表明, AJLEAP-2在日本鰻鱺抗細菌感染過程中起重要的作用。
抗菌肽; LEAP-2; 日本鰻鱺; 遲緩愛德華氏菌
抗菌肽 (Antimicrobial peptides) 是一類廣譜抗微生物多肽, 可抑制或殺死細菌、真菌、寄生蟲和病毒等。同時, 它也是生物體非特異性免疫系統(tǒng)的重要組成部分, 也稱宿主防御肽, 廣泛存在于動、植物和細菌等生物體[1]。其主要殺菌機理是通過破壞細菌細胞膜的完整性, 使細菌內容物泄漏, 進而殺死細菌[2]。與傳統(tǒng)抗生素相比, 抗菌肽具有不易產(chǎn)生耐藥性和無環(huán)境污染的特性, 被視為現(xiàn)有抗生素的潛在替代品, 近年來已成為研究與開發(fā)的熱點[3]。
肝臟表達抗菌肽2 ( Liver-Expressed Antimicrobial Peptide-2, LEAP-2 ) 是2003年Krause等[4]從人類血液中分離的一種新抗菌肽, 在中性pH時, 帶 +4電荷, pI9.2。其羧基端有4個半胱氨酸殘基,C1與C3、C2與C4各自形成二硫鍵, 因其是第二個在肝臟中發(fā)現(xiàn)的大量轉錄表達的抗菌肽, 故命名為LEAP-2。人類LEAP-2的cDNA全長為512 bp, 包含3個外顯子, 2個內含子, 基因編碼77個氨基酸, 包含信號肽, Prodomain域和成熟肽三部分。在血液中,LEAP-2被加工成幾種不同長度的多肽, 參與抗菌活動[4,5]。抗菌活性研究發(fā)現(xiàn), 巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium)等對重組表達和化學合成的LEAP-2都具有敏感性, 其抗菌活性與膜的親和性相關[6]。
在魚類中, Zhang等[7]首先從虹鱒 (Oncorhynchus mykiss) 克隆獲得兩個LEAP-2, 即LEAP-2A和LEAP-2B,分析發(fā)現(xiàn)LEPA-2存在RXXR切割位點, 酶切后形成成熟肽, 并且LEAP-2A和LEAP-2B在肝臟中均高水平轉錄表達, 經(jīng)細菌刺激后, 腸和皮膚的轉錄表達量增加[7]。迄今, 已有包括斑點叉尾(Ictalurus punctatus)[8]、黃顙魚 (Pelteobagrus fulvidraco)、牙鲆 (Paralichthys olivaceous)[9]、斑馬魚 (Danio rerio)[10]、藍鯰 (Ictalurus furcatus)[8]、草魚 (Ctenopharynodon idellus)[11]、團頭魴 (Megalobrama amblycephala)[12]、鯉 (Cyprinus carpio )[13]、(Miichthys miiuy)[14]、大西洋鮭 (Salmo salar)、鯽 (Carassius auratus)[15]和大黃魚 (Larimichthys crocea)[16]等13種魚的LEAP-2基因被克隆鑒定。與哺乳動物LEAP-2主要表達于肝臟組織中不同, 魚類LEAP-2的組織表達模式差異較大。例如, 斑點叉尾LEAP-2在肝臟中的轉錄表達量遠低于其他組織/器官[8],而團頭魴LEAP-2 在中腸中轉錄表達水平最高, 其次是腦垂體[12]。此外, 硬骨魚類LEAP-2受外源刺激物誘導后, 轉錄表達模式具有一定的種屬特異性[12]。如滅活的嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)刺激4h后, 草魚肝臟中LEAP-2轉錄表達量上調倍數(shù)最高[11]。而滅活嗜水氣單胞菌刺激72h后,團頭魴肝臟中LEAP-2的轉錄表達才達到高峰。
鰻鱺是中國重要的養(yǎng)殖魚類, 近十年來, 鰻鱺養(yǎng)殖業(yè)穩(wěn)定發(fā)展, 2013年, 中國鰻鱺產(chǎn)量達到20.6萬噸, 主要集中在福建、廣東和江西三?。?7]。在鰻鱺養(yǎng)殖所發(fā)生的各種疾病中, 細菌性疾病危害最嚴重[18]。據(jù)調查測算, 2006年福建省養(yǎng)殖鰻鱺發(fā)生的疾病中, 細菌性疾病所占比例最高, 約為43%[19]。自2006年日本實施“肯定列表制度”, 對中國輸日鰻鱺的藥物殘留進行嚴格控制, 給中國養(yǎng)鰻業(yè)造成了巨大壓力。因此, 針對鰻鱺細菌性疾病的抗菌肽的研究開發(fā)顯得尤為迫切。本研究克隆鑒定了日本鰻鱺抗菌肽LEAP-2基因, 并利用熒光定量PCR技術研究了該基因在日本鰻鱺各組織/器官中的表達模式, 及外源刺激后基因表達的變化, 研究結果將有助于深入了解日本鰻鱺的抗菌機制, 豐富魚類先天免疫的理論。
1.1 實驗材料
日本鰻鱺[體質量(203±53) g] 購于福建省集美大學水產(chǎn)養(yǎng)殖基地, 養(yǎng)殖水溫 (28±2)℃;玻璃鰻[20][體長(6±2) cm]購于福建省莆田市。對日本鰻鱺(黑仔鰻)采集血液、鰓、心臟、肝臟、腸、胃、脾臟、頭腎、中腎、鰾和皮膚組織/器官, 玻璃鰻采集整條。黑仔鰻樣品采集及處理方法:用肝素鈉預處理的無菌注射器抽取鰻鱺血液2 mL, 800×g離心20min, 去上層溶液, 收集下層細胞, 加入1 mL Trizol?reagent (Invitrogen, 美國) 和6—7顆直徑3 mm玻璃珠, 組織勻漿(3000 r/min, 20s/次, 勻漿3次, Retsch MS100, 日本); 其他組織取約100 mg,同上加入玻璃珠及1 mL Trizol后, 勻漿。取整條玻璃鰻剪碎后, 同上加入玻璃珠及1 mL Trizol后, 勻漿。上述樣品于-80℃保存, 備用。
免疫刺激試驗: 設PBS對照組, LPS刺激組(1 mg/ 100 g魚, Sigma), Poly I:C刺激組(1 mg/100 g魚,Sigma), 遲緩愛德華氏菌刺激組(2×107cfu/100 g魚),免疫方法是腹腔注射。分別在注射后8h、16h、24h和72h采樣, 每組每個時間點隨機取鰻鱺8尾, 每尾魚分別采集上述11個組織/器官。
1.2 基因組DNA和總RNA的提取
DNA提取: 取日本鰻鱺肌肉100 mg, 參照 Mini-BEST Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.4.0 (TaKaRa, 日本)試劑盒提取基因組DNA。RNA提取: 取解凍后的組織樣品200 μL, 根據(jù)Trizol?reagent試劑盒說明書提取總RNA, 每尾魚的不同組織/器官作為獨立樣品提取RNA。瓊脂糖凝膠電泳法檢測總RNA/DNA的完整性, 利用分光光度計(Thermo, NanoDrop 2000, 美國)檢測RNA或DNA的濃度及純度。
1.3 cDNA第一鏈的合成
基因克隆: 取肝臟總RNA, 經(jīng)RNase-free DNase I (New England Biolabs Inc, 美國) 處理后, 反轉錄(SMARTerTMRACE cDNA Amplification Kit,Clontech, 美國)合成第一鏈, 制備肝臟3′和5′RACE模板。
Real-time PCR擴增模板制備: 取4 μg總RNA用GoScripTMReverse Transcription System (Promega,美國) 反轉錄試劑盒反轉錄, 產(chǎn)物用TE buffer稀釋,于-20℃保存, 備用。
1.4 AJLEAP-2全長cDNA的克隆和序列測定
通過分析日本鰻鱺肝臟和腎臟cDNA文庫, 獲得一條與鯉LEAP-2相似性為65%的EST序列, 根據(jù)EST序列設計引物(Primer Premier 6.0 軟件) (表1),按照SMARTer試劑盒的說明書進行巢式PCR, 獲得5′和3′末端基因片段。利用所獲得的5′和3′末端序列, 設計引物AJLEAP-2_FL_F和AJLEAP-2_FL_R(表 1) 進行PCR擴增和全長cDNA驗證[21]。PCR產(chǎn)物于1.2%瓊脂糖膠上電泳, 回收 (E.Z.N.A?Gel Extraction Kit, OMEGA, 美國), 連接到pMD19-T載體(TaKaRa, 日本), 并熱激轉化至大腸桿菌Escherich coliDH5α中。經(jīng)PCR檢測陽性克隆后測序驗證。
表 1 所用引物序列Tab. 1 Primers used in the present study
1.5 AJLEAP-2基因組序列擴增
用擴增cDNA全長的引物(AJLEAP-2_FL_F和AJLEAP-2_FL_R, 表1), 以肌肉基因組DNA為模板,進行PCR擴增 (LA試劑盒, TaKaRa, 日本), 反應體系25 μL: 基因組DNA 1 μL, 上下游引物(10 μmol/L)各1 μL, LA Taq DNA 聚合酶(5 U/μL) 0.25 μL,10×LA PCR Buffer II (Mg2+Plus) (TaKaRa, 日本)2.5 μL, dNTP Mixture (2.5 mmol/L) 4 μL, 反應條件為: 94℃預變性3min; 94℃變性30s, 64℃退火30s,72℃延伸2min, 35個循環(huán); 72℃ 10min。
1.6 AJLEAP-2在日本鰻鱺不同組織器官表達量分析
熒光定量PCR采用Lightcycler 480 SYBR Green I 試劑盒 (Roche, 德國) 在Ligthcycler 480 II PCR儀 (Roche, 德國) 上進行。PCR反應體系: cDNA模板4 μL, 正向引物 (qAJLEAP-2F, 跨內含子, 10 μmol/L 0.5 μL),反向引物 (qAJLEAP-2R,10 μmol/L) 0.5 μL, LightCycler 480 SYSR Green I Master (2×) 10 μL, 補充水至20 μL。反應條件:95℃變性20s, 58℃退火20s, 72℃延伸25s, 40個循環(huán)。熒光信號采集溫度為81℃。反應結束后分析擴增產(chǎn)物的溶解曲線, 以判定擴增產(chǎn)物的特異性。以β-actin作為內參比基因。梯度稀釋已知拷貝數(shù)AJLEAP-2和β-actin質粒樣品, 與組織/器官樣品同時進行PCR擴增, 繪制標準曲線, 計算各自基因的擴增效率。
不同組織/器官中AJLEAP-2的轉錄表達譜, 是以不同組織/器官中(AJLEAP-2表達量)/(β-actin表達量)的1000倍來表示。不同免疫源刺激實驗組的AJLEAP-2相對表達量的倍數(shù)變化, 是以相應時間點的相同組織的PBS對照組靶基因表達量為基準計算所得。
1.7 序列生物信息學分析
利用NCBI網(wǎng)站中的Blast (http://blast.ncbi. nlm.nih.gov/Blast.cgi) 進行序列比對; 利用ExPASy的翻譯工具(http://web.expasy.org/translate/) 獲得LEAP-2的氨基酸序列; ExPASy (http://web.expasy. org/compute_pi/)預測分子量和pI值; 用SignalP 4.1 Server程序 (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)分析信號肽; 用Pfam程序(http://pfam.xfam.org/)分析結構域; SWISS-MODEL程序(http://swissmodel. expasy.org/) 預測LEAP-2基因的三級結構。利用ClustalX-2.1軟件進行氨基酸序列的多重比對; 應用MEAG5.0軟件, 采用鄰位相接法 (NJ法) 構建了系統(tǒng)發(fā)育樹?;蚪M數(shù)據(jù)來源于Ensembl網(wǎng)站(http:// asia.ensembl.org/index.html)。
1.8 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析
數(shù)據(jù)結果用Excel軟件進行計算, 用單因素變量方差分析法 (ANOVA) 分析免疫原刺激樣品間AJLEAP-2表達量差異, 利用 Dunnettt-Test (2-sided)進行多重比對。所有數(shù)據(jù)均用平均值±標準誤差(SEM) 的方式表示, P<0.05 表示差異顯著, P<0.01表示差異極顯著。利用GraphPad.Prism.v5.0軟件進行作圖。
2.1 日本鰻鱺AJLEAP-2基因序列分析
通過RACE 和PCR的方法克隆獲得日本鰻鱺LEAP-2 (AJLEAP-2) 的全長cDNA 序列(GenBank登錄號: KP893812)。AJLEAP-2 cDNA全長450 bp,包括5′ UTR 60 bp、開放閱讀框(ORF) 270 bp和3′UTR 120 bp, 其中3′ UTR中有保守的終止信號(AATAAA)。推導的AJLEAP-2前體肽分子量為9.66 kD, pI為9.33。該前體肽包括三個部分: N-端26氨基酸殘基為信號肽部分; 隨后22個氨基酸殘基為原結構域 (Prodomain),該結構域的C-末端含有成熟肽切割位點(RXXR); C-末端的41個氨基酸殘基為成熟肽 (其分子量為4.78 kD, pI 8.86), 含有哺乳動物和魚類LEAP2高度保守的4個半胱氨酸殘基,其基序為-C-X5-C-X4-C-X4-C-,其中C65與C76、 C71與C81可能形成二硫鍵。
高等脊椎動物 (哺乳類和鳥類) LEAP-2原前體肽 (Proprepeptide) 為76—77肽, 其中信號肽部分含22個氨基酸殘基, 成熟肽為40肽, pI為9.37; 兩棲類LEAP-2的前體肽為80肽, 信號肽為24肽, 成熟肽為40肽, pI為9.58; 而魚類LEAP-2的前體肽較為多樣,總長度為78—102個氨基酸殘基, 成熟肽包含37—46個氨基酸殘基, 成熟肽的pI 6.79—9.2。根據(jù)信號肽、Prodomain及成熟肽的長度和等電點不同,魚類的LEAP-2可以區(qū)分為三型, 即A、B、C型: 高等脊椎動物和硬骨魚C型LEAP-2成熟肽的長度小于或等于40個氨基酸殘基, 而硬骨魚A、B型的均大于40個氨基酸殘基(表 2); 高等脊椎動物和硬骨魚的C型LEAP-2的Prodomain區(qū)長度小于18個氨基酸, 而硬骨魚的A和B型的較大, 一般大于22個氨基酸 (表 2); 哺乳類、鳥類、兩棲類和大多數(shù)的硬骨魚C型的成熟肽pI大于9, 硬骨魚A型的pI為7—9, 而硬骨魚B型的pI (除虹鱒為8.94) 均小于7 (表 2)。
表 2 各物種LEAP-2基因的GenBank登錄號及序列信息Tab. 2 GenBank accession number and sequence information for LEAP-2 genes in vertebrates
利用AJLEAP-2_FL_F和AJLEAP-2_FL_R引物對日本鰻鱺基因組進行LA-PCR擴增, 獲得AJLEAP-2基因組序列, GenBank登錄號為: KR013137。用Spidey軟件對基因組序列與cDNA序列進行比對,結果顯示, AJLEAP-2的開放閱讀框包含三個外顯子 (69、161和40 bp)和兩個內含子(868和110 bp),內含子1屬于0相位, 內含子2屬于2相位, 內含子剪切符合GT-AG規(guī)則。信號肽部分由外顯子1及外顯子2的部分序列共同編碼, 成熟肽部分由外顯子2的部分序列和外顯子3共同編碼。基因組結構比對分析結果顯示, 脊椎動物LEAP-2基因的基因結構保守, 外顯子大小相近。哺乳類和大多數(shù)硬骨魚類的內含子相位相同, 內含子1均是為0相位(除雞為1),內含子2均為2相位(除石首科的大黃魚和鮸為0)(表 3)。脊椎動物LEAP-2的四個保守半胱氨酸的編碼高度保守, 前3個半胱氨酸由外顯子2編碼, 第4個半胱氨酸由外顯子3編碼, 除爪蟾為前2個半胱氨酸由外顯子2編碼, 后2個半胱氨酸由外顯子3編碼。
2.2 LEAP-2的多重比對及系統(tǒng)發(fā)育樹構建分析
選取哺乳類、鳥類、兩棲類和硬骨魚類等17個代表性物種的21條LEAP-2的全長氨基酸序列進行多重比對。結果顯示, 所有脊椎動物LEAP-2的原前體肽包括信號肽、Prodomain區(qū)和成熟肽三個部分。哺乳類、鳥類、兩棲類和硬骨魚C型LEAP-2氨基酸全長、信號肽、Prodomain區(qū)和成熟肽長度均小于硬骨魚A、B亞型。Prodomain區(qū)內都有保守基序為“RXXR”, 它是成熟肽的切割位點, 硬骨魚類LEAP-2A (包括AJLEAP-2基因) 的蛋白酶水解位點基序均為“RXAR”, LEAP-2B (除虹鱒LEAP-2B為RRTR) 為“RKXR”, LEAP-2C型為“RATKR”序列(表 2)。在成熟肽的N端包含有6個高度保守的氨基酸序列: 高等脊椎動物為“M/ITPFWR”, 硬骨魚類LEAP-2A(包括AJLEAP-2)為“MTPLWR”, LEAP-2B(除虹鱒LEAP-2B為MTPLWR)為“MSPLWR”, 而LEAP-2C少一個氨基酸“M”為“SLLWR”。
相似性分析結果顯示日本鰻鱺AJLEAP-2的氨基酸序列與哺乳動物、鳥類、兩棲類及其他魚類的相似度12%—57.2%,其中與虹鱒的相似度最高為57.2%。
用MEAG 5.0軟件對9個物種的15條LEAP-2成熟肽序列構建進化樹。結果顯示, 哺乳類、鳥類和兩棲類的LEAP-2聚為一支, 硬骨魚聚成另一支。其中硬骨魚LEAP-2的A、B、C型又分別聚在不同的小分支中, 其中本研究的AJLEAP-2與虹鱒、斑馬魚、鯉和大黃魚LEAP-2A亞型聚為一支, 魚類LEAP-2B亞型與LEAP-2A型進化關系接近, 2B先聚為一小支 (虹鱒LEAP-2B與魚類LEAP-2A聚為一支)后與LEAP-2A聚為一支, 魚類LEAP-2C亞型聚為一支, 三種亞型最后聚為一大支后, 而高等脊椎動物LEAP-2聚為另一大支 (圖 1)。
2.3 日本鰻鱺LEAP-2三級結構預測
表 3 日本鰻鱺LEAP-2與其他脊椎動物LEAP-2基因組結構比較Tab. 3 Comparison of the genomic organization of AJLEAP-2 gene with its counterparts from other vertebrates
通過最佳模型的搜索發(fā)現(xiàn),AJLEAP-2蛋白序列最匹配的模板是人類LEAP-2 (PDB 2l1q.1.A), 用SWISS-MODEL預測日本鰻鱺LEAP-2蛋白的三級結構(圖 2)。結果顯示, 日本鰻鱺LEAP-2與人類LEAP-2蛋白結構相似, 包括由兩對二硫鍵組成的緊密中心和無序的N端、C端組成一個穩(wěn)定的結構。
圖 1 脊椎動物AJLEAP-2基因系統(tǒng)發(fā)育分析Fig. 1 Phylogenetic analysis of AJLEAP-2 mature peptide amino acid sequences from vertebrate
2.4 AJLEAP-2基因的組織特異性表達
利用Real-time PCR檢測日本鰻鱺(黑仔鰻)的肝臟、腸、皮膚、心臟、血液、胃、頭腎、中腎、鰾、脾臟、鰓等11個組織/ 器官AJLEAP-2的轉錄表達水平, 結果顯示, AJLEAP-2在所檢測的不同組織/器官中均有轉錄表達; 其中肝臟中的表達量最高,其平均表達量是β-actin的6倍; 其次是腸, 但其表達量僅為肝臟的1/130, 在血液, 皮膚等中表達量也相對較高。此外, 我們還檢測了玻璃鰻的AJLEAP-2基因的轉錄表達水平。結果顯示, AJLEAP-2在玻璃鰻中的表達量雖然不及黑仔鰻期的肝臟表達量,但比黑仔鰻期的其他組織/器官表達量都高, 約為腸道表達量的2倍 (圖 3)。
2.5 免疫刺激后AJLEAP-2的基因表達變化
與對照組相比, LPS刺激后16h, 血液中AJLEAP-2轉錄表達量上調了86倍 (P<0.05), 在腸中, 刺激后72h顯著性上調8倍 (P<0.05), 而肝臟則在24h顯著性下調 (P<0.05)(圖 4A)。Poly I:C刺激后, 血液中AJLEAP-2基因早期無顯著變化, 到24h和72h顯著性下調 (P<0.05), 而腸和肝臟中的AJLEAP-2無顯著性差異 (P>0.05)(圖 4B)。遲緩愛德華氏菌刺激后,血液中的AJLEAP-2在16h顯著性上調12倍 (P<0.05), 而在24h和72h均顯著下調 (P<0.05)。腸中的AJLEAP-2在被檢測的時間點均上調, 在8h具有顯著性差異 (P<0.05), 上調8倍。肝臟中的AJLEAP-2在被檢測的時間點均無顯著性差異(P>0.05)(圖4C)。
LEAP-2是一種富含半胱氨酸的陽離子抗菌肽,首次從人類血液的超濾液中純化獲得, 后被發(fā)現(xiàn)在肝臟中大量表達[4],在脊椎動物抗細菌免疫應答的過程中起十分重要的作用[11,19,23]。本研究克隆了日本鰻鱺的LEAP-2基因全長cDNA序列, 在解析其基因結構的基礎上, 對其表達模式進行了研究。
圖 2 日本鰻鱺LEAP-2蛋白三級結構預測Fig. 2 Predicted tertiary structure of Anguilla japonica LEAP-2
雖然氨基酸序列相似性分析結果顯示AJLEAP-2與高等脊椎動物LEAP-2基因的相似性較低(12%—23%), 但是, 其與其他硬骨魚類LEAP-2基因的相似性較高 (54.6%—57.2%)。此外, 基因結構分析結果顯示, 日本鰻鱺LEAP-2基因結構與已報道脊椎動物LEAP-2的結構類似, 由3個外顯子和2個內含子組成, 且硬骨魚類LEAP-2基因的外顯子大小相近, 表明其在魚類的進化中保持較高的保守性。
圖 3 AJLEAP-2基因在健康黑仔鰻期不同組織/器官和玻璃鰻中相對表達量Fig. 3 Tissue expression of AJLEAP-2 in glass eels and different tissues/organs from Japanese eel elver
Li等[16]通過系統(tǒng)進化分析, 將魚類LEAP-2分為三個亞型, 即LEAP-2A、LEAP-2B和LEAP-2C。本研究對A、B、C三型進行分析, 結果發(fā)現(xiàn)三種類型在基因長度, 特征序列, 成熟肽等電點等方面具有差別, 其中A型和B型除成熟肽等電點外, 其他特征較為接近, 而C型基因長度, 特征序列, 成熟肽等電點等都與高等脊椎動物的LEAP-2特征相近, 進化系統(tǒng)進化分析結果顯示A型和B型同源關系較近, C型與兩者關系較遠。因此, 結合系統(tǒng)進化分析、氨基酸序列比對及等電點分析, 我們認為本研究所克隆獲得的AJLEAP-2為A型, Zhang等[7]所報道的虹鱒LEAP-2B成熟肽的特征序列和等電點等特征更接近于其他硬骨魚類的LEAP-2A。
圖 4 LPS(A)、PolyI:C(B)和愛德華氏菌(C)刺激后AJLEAP-2表達量變化分析Fig. 4 Differential expression of AJLEAP-2 in Anguilla japonica after being intraperitoneal injected with LPS(A), Poly I:C (B) or Edwardsiella tarda (C)
脊椎動物的LEAP-2基因在各組織/器官中廣泛表達, 且主要表達于肝臟中[16]。人類LEAP-2在肝、腎、十二指腸、空腸等組織/器官中表達[4]。豬LEAP-2主要表達于肝臟, 在腎和腸也有表達[24]。雞LEAP-2表達于肝、小腸、肺、和腎臟[22]。多數(shù)硬骨魚LEAP-2也是在肝臟中表達量最高[7,11,13,14]。但也有例外, 如斑點叉尾LEAP-2A在肝臟中的表達量遠遠低于其他組織/器官[8], 鯉LEAP-2A在脾臟中表達量最高[13], 大黃魚LEAP-2A和LEAP-2C亞型均在腸中表達量最高, 其次才為肝臟[16]。在本研究中,AJLEAP-2主要表達于肝臟, 其次在腸、心臟、皮膚、血液、胃、頭腎、中腎、鰾、脾臟和鰓。這些結果表明魚類LEAP-2基因的表達模式具有種屬特異性[12]。有研究表明, LEAP-2參與了魚類早期發(fā)育過程中的免疫應答。如草魚LEAP-2在16細胞期和團頭魴LEAP-2受精卵發(fā)育開始高表達, 隨后表達量開始降低, 孵化后LEAP-2又重新高表達[11,12]。本研究發(fā)現(xiàn)在日本鰻鱺玻璃鰻時期, AJLEAP-2高表達, 說明LEAP-2參與了日本鰻鱺幼體時期的先天免疫反應。
已有的研究表明, 細菌或其成分(如LPS)刺激能夠顯著誘導LEAP-2的表達。滅活嗜水氣單胞菌刺激可顯著上調草魚肝臟、脾臟、腦和鰓組織中LEAP-2基因的表達[11]。腹腔注射鰻弧菌6h后, 鯉肝臟、脾臟、頭腎、皮膚、鰓和前腸組織中LEAP-2基因顯著上調表達[13]。大黃魚感染溶藻弧菌后,其肝臟組織中LEAP-2A基因快速上調表達[16]。本研究發(fā)現(xiàn), LPS和遲緩愛德華菌刺激能顯著上調日本鰻鱺血液中AJLEAP-2基因的表達, 刺激16h上調倍數(shù)最高, 分別為對照組的86倍和12倍。此外LPS刺激72h和E. tarda 刺激8h后, 腸AJLEAP-2顯著上調表達, 為對照組的5—8倍。而Poly I:C刺激后,AJLEAP-2在肝臟和腸中表達無顯著變化, 且在刺激24h后血液中AJLEAP-2表達量顯著下調, 表明AJLEAP-2基因主要參與魚類抗細菌免疫應答。
綜上所述, 本研究克隆獲得了日本鰻鱺LEAP-2基因。結合其基因結構、分子特性和系統(tǒng)進化分析, 推斷該分子為硬骨魚類LEAP-2A亞型。此外,本研究檢測了LPS、遲緩愛德華菌和Poly I:C刺激后, 日本鰻鱺LEAP-2基因的表達模式, 結果進一步證實了該基因主要參與魚類的抗細菌免疫應答。
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MOLECULAR CLONING AND EXPRESSION ANALYSIS OF A LIVER
EXPRESSED ANTIMICROBIAL PEPTIDE-2 IN JAPANESE EEL, ANGUILLA JAPONICA
DUAN Ming-Zhu1,2, HUANG Bei1,2, LIANG Ying1,2, ZHANG Fang-Fang1,2, NIE Pin3and HUANG Wen-Shu1,2,4
(1. Fishery College, Jimei University, Xiamen 361021, China; 2. Engineering Research Center of the Modern Technology for Eel Industry, Ministry of Education PRC, Xiamen 361021, China; 3. Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430072, China; 4. Fujian Collaborative Innovation Center for Exploitation and Utilization of Marine Biological Resources,Xiamen 361021, China)
Liver Expressed Antimicrobial Peptide 2 (LEAP-2), a cysteine-rich cationic antimicrobial peptide, plays a vital role in the host innate immune system. In the present study, the AJLEAP-2 gene was cloned from Japanese eel (Anguilla japonica) by RACE. The length of AJLEAP-2 cDNA was 450 bp including a 270 bp ORF that encodes a putative 89-peptide. The peptide contained the conserved motif MTPFWR and the characteristic motif C-X5-C-X4-C-X4-C of LEAP-2. AJLEAP-2 has three exons similar to the counterpart from other vertebrates. The expression of AJLEAP-2 from tissue/organs of Japanese eel elver indicated the highest expression in liver that was five times higher than that of β-actin, and then in intestine that was only 1/130 the amount in liver. Additionally, AJLEAP-2 was highly expressed in glass eel, which was almost twice the amount in elver intestine. LPS and Edwardsiella tarda increased the expression of AJLEAP-2 in blood and reached the peak level at 16h post challenge increasing 86 folds and 12 folds, respectively. Both LPS and E. tarda significantly up-regulated the expression of AJLEAP-2 in intestine. Meanwhile, the transcript level of AJLEAP-2 in blood was significantly down-regulated at 24h challenged with Poly I:C. These results suggest that AJLEAP-2 may play an important role in innate immunity of Japanese eel against bacterial infection.
Anguilla japonica; LEAP-2; Antimicrobial peptide; Edwardsiella tarda
10.7541/2016.35
Q344+.1
A
1000-3207(2016)02-0252-09
2015-06-07;
2015-08-18
國家自然科學基金(31172438和U1205123); 福建省自然科學基金(2012J06008, 201311180002和2014J05042); 教育部留學回國人員科研啟動金資助 [Supported by the National Natural Science Foundation of China (Nos. 31172438 and U1205123), the Natural Science Foundation of Fujian Province (Nos. 2012J06008, 201311180002 and 2014J05042) and the Projects-sponsored by SRF,for ROCS, SEM]
段明珠(1989-), 女, 湖北黃岡人; 碩士; 主要研究方向為魚類免疫學。E-mail: dmzstiver@sina.cn; 黃貝(1982—), 男, 江西萍鄉(xiāng)人; 博士; 主要研究方向為魚類免疫學。E-mail: huangbei@jmu.edu.cn *共同第一作者
黃文樹, 男, 博士; E-mail: wshuang@jmu.edu.cn