張福彥,陳 鋒,張建偉,楊保安,范家霖,陳曉杰,陳云堂,崔 龍
(1.河南省科學(xué)院同位素研究所有限責(zé)任公司/河南省核農(nóng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南鄭州 450015;2.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/河南省糧食作物協(xié)同創(chuàng)新中心,河南鄭州 450002)
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逆境脅迫下小麥脂肪氧化酶基因表達(dá)的qRT-PCR分析
張福彥1,2,陳 鋒2,張建偉1,楊保安1,范家霖1,陳曉杰1,陳云堂1,崔 龍1
(1.河南省科學(xué)院同位素研究所有限責(zé)任公司/河南省核農(nóng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南鄭州 450015;2.河南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/河南省糧食作物協(xié)同創(chuàng)新中心,河南鄭州 450002)
為探討小麥脂肪氧化酶基因在非生物脅迫過(guò)程中的生物學(xué)功能,采用qRT-PCR技術(shù),首先分析了 TaLox-B2和 TaLox-B3基因在小麥幼葉、莖、根以及成熟籽粒中的表達(dá)情況,其次分析了這2個(gè)基因在高鹽、低溫、高溫和干旱脅迫下葉片中的表達(dá)模式。結(jié)果表明,這2個(gè)基因在小麥根、莖、葉以及成熟籽粒中均有表達(dá),但 TaLox-B2基因主要在葉和成熟籽粒中表達(dá),而 TaLox-B3基因主要在根和葉中表達(dá)。在高鹽脅迫下,這2個(gè)基因的表達(dá)趨勢(shì)大體一致,類(lèi)似于正態(tài)分布,在3 h時(shí)達(dá)到峰值。在低溫逆境下, TaLox-B2基因的表達(dá)模式無(wú)明顯規(guī)律,而 TaLox-B3基因在0~6 h范圍內(nèi)呈上調(diào)表達(dá),之后開(kāi)始逐漸下降。在高溫逆境下,這2個(gè)基因在0~12 h范圍內(nèi)均呈下調(diào)表達(dá),但二者下調(diào)的趨勢(shì)明顯不同。在模擬干旱脅迫下,這2個(gè)基因相對(duì)表達(dá)量均較低,表達(dá)趨勢(shì)存在明顯差別,但二者的表達(dá)模式則無(wú)明顯規(guī)律。推測(cè)認(rèn)為, TaLox-B2和 TaLox-B3基因主要受鹽脅迫誘導(dǎo),且與PEG干旱脅迫之間沒(méi)有特定的關(guān)系,此外,溫度變化對(duì) TaLox-B2和 TaLox-B3基因表達(dá)量的影響較為明顯,但低溫和高溫的作用機(jī)制不同。
普通小麥;逆境脅迫;脂肪氧化酶基因;表達(dá)分析
面粉色澤是評(píng)價(jià)小麥品質(zhì)的重要指標(biāo)之一,對(duì)面粉或面制品的商品性具有重要影響[1]。面粉中八氫番茄紅素合成酶、多酚氧化酶、脂肪氧化酶等其他過(guò)氧化物酶通過(guò)對(duì)黃色素和類(lèi)胡蘿卜素等色素類(lèi)物質(zhì)的氧化降解,進(jìn)而對(duì)面粉或面制品色澤產(chǎn)生影響[2-4]。在小麥中,脂肪氧化酶(Lipoxygenase,Lox)含量雖然較低,但對(duì)面粉或面制品色澤等具有重要影響,現(xiàn)已成為小麥品質(zhì)育種的重要目標(biāo)之一。
小麥籽粒Lox活性可遺傳率較高,基因型是決定小麥Lox活性的最主要因素[5-6]。Hart和Langston[7]利用中國(guó)春缺體-四體代換系對(duì)硬粒小麥Lpx同工酶進(jìn)行定位,結(jié)果發(fā)現(xiàn), Lpx-A1、Lpx-B1和 Lpx-D1分別位于4AL、4BL和4DS染色體上,而 Lpx-A2、 Lpx-B2和 Lpx-D2分別位于5AL、5BL和5DL上,因而推測(cè)小麥Lox基因主要位于第4和第5同源群上。隨著大麥和硬粒小麥中Lox基因被克隆和定位[8-10],普通小麥中Lox基因的克隆、定位及與之緊密連鎖的分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)等也取得了一定的進(jìn)展。Feng等[11]采用同源克隆的方法從普通小麥品種小偃54中克隆了位于4DS染色體上的 TaLox1基因和位于5DL染色體上的 TaLox2n基因,并對(duì)二者在成熟籽粒中的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn) TaLox1比 TaLox2n基因表達(dá)量更高,說(shuō)明 TaLox1基因?qū)π←溩蚜ox活性作用更為明顯[11]。之后,又利用同樣的方法從普通小麥中克隆出一個(gè)新Lox基因,命名為 TaLox3,將其定位在4A染色體上[12]。Geng等[13]利用電子克隆方法克隆得到普通小麥4B染色體上的 TaLox-B1基因,且發(fā)現(xiàn)了其至少含有2種等位變異類(lèi)型,分別命名為 TaLox-B1a和 TaLox-B1b,二者gDNA序列間存在單核苷酸多態(tài)性,根據(jù)該多態(tài)性開(kāi)發(fā)1對(duì)共顯性互補(bǔ)功能性分子標(biāo)記Lox16和Lox18。Garbus等[14]先后在普通小麥中克隆發(fā)現(xiàn)了與硬粒小麥中類(lèi)似的 Lpx-A1-like、 Lpx-B1.2和 Lpx-D1基因,并將其分別定位在4A、4B和4D染色體上。之后,Zhang等[15]采用電子克隆技術(shù)從普通小麥4BS染色體上克隆得到2個(gè)與Lox活性關(guān)系密切的新基因,命名為 TaLox-B2和 TaLox-B3,且發(fā)現(xiàn) TaLox-B2基因存在2種等位變異類(lèi)型,將其命名為 TaLox-B2a和 TaLox-B2b,同時(shí),根據(jù)三者基因的gDNA序列差異開(kāi)發(fā)了功能性分子標(biāo)記Lox-B23。盡管已有關(guān)于普通小麥籽粒Lox基因克隆、功能標(biāo)記開(kāi)發(fā)和檢測(cè)以及Lox活性分析等的相關(guān)報(bào)道,但有關(guān)小麥Lox基因在非生物脅迫過(guò)程中的生物學(xué)功能的報(bào)道很少。
本研究以小麥 β-actin基因?yàn)閷?duì)照,利用qRT-PCR技術(shù),先分析 TaLox-B2和 TaLox-B3基因在小麥幼葉、莖、根以及成熟籽粒中的表達(dá)情況,其次分析以上2個(gè)因基在高鹽、低溫、高溫和干旱脅迫下葉片中的表達(dá)模式,旨在為進(jìn)一步了解小麥籽粒脂肪氧化酶基因的生物學(xué)功能和分子遺傳基礎(chǔ)提供一定的幫助。
1.1試驗(yàn)材料及其處理
供試材料包括2014年河南省最新審定的小麥品種豫農(nóng)211、1997年河北省審定的小麥品種石4185及目前全國(guó)推廣面積最大的小麥品種矮抗58,均由河南農(nóng)業(yè)大學(xué)小麥育種研究室提供。挑選籽粒飽滿(mǎn)的小麥種子,經(jīng)雙氧水消毒后播種于培養(yǎng)皿中,置于人工氣候培養(yǎng)箱中,于光/暗周期為12 h/12 h、溫度為22~25 ℃的條件下培養(yǎng)。待幼苗長(zhǎng)至三葉一心期時(shí),分別取各小麥品種的幼葉、莖和根,同時(shí)將矮抗58幼苗分別在4 ℃低溫、42 ℃高溫、100 mmol·L-1NaCl以及20% PEG6000共4種逆境脅迫環(huán)境下分別處理0、1、3、6、12和24 h后取其葉片,于-80 ℃超低溫冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2試驗(yàn)方法
1.2.1總RNA的提取
分別取適量1.1中保存于-80 ℃超低溫冰箱中的小麥幼葉、莖和根,加入液氮后迅速研磨至粉末狀,采用Trizol法提取總RNA,具體操作步驟參照南海波[16]的方法進(jìn)行。同時(shí),參照胡群文等[17]提取小麥種子RNA的方法提取供試各小麥品種成熟種子RNA。
1.2.2cDNA第一鏈的合成
以提取的總RNA為模板,利用RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒[Prime Script○RRT reagent Kit With gDNA Eraser, 寶生物工程(大連)有限公司]進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA的第一鏈。
1.2.3特異性引物的設(shè)計(jì)
利用DNAMAN Version 6.0進(jìn)行序列分析,采用Primier Primer 5.0設(shè)計(jì)特異性引物。根據(jù)Zhang等[15]新克隆的小麥籽粒 TaLox-B2和 TaLox-B3基因的gDNA序列設(shè)計(jì)2對(duì)特異性引物L(fēng)ox-P2和Lox-P3;以小麥中穩(wěn)定表達(dá)的肌動(dòng)蛋白基因 β-actin(GI:48927671)序列設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物WAC,作為內(nèi)參。引物合成均在生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行,具體引物序列信息見(jiàn)表1。
1.2.4表達(dá)分析
RT-PCR反應(yīng)在美國(guó)伯樂(lè)iQ5實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀中進(jìn)行。3次生物學(xué)重復(fù)。qRT-PCR反應(yīng)體系:cDNA 2 μL,10 pmol·L-1的上下游引物各0.5 μL,SYBR Premix ExTaqII(2×)[寶生物工程(大連)有限公司]10 μL,ddH2O 7 μL。qRT-PCR反應(yīng)程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性10 s,64 ℃退火45 s,72 ℃延伸20 s,40個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,10 ℃保存。反應(yīng)結(jié)束后,取5 μL PCR產(chǎn)物進(jìn)行2.0%瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠(EB)染色,UV掃描成像后確認(rèn)是否與擴(kuò)增曲線(xiàn)結(jié)果吻合。最后,采用2-△△Ct法[18]計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)量。
表1 RT-PCR特異性引物序列信息Table 1 Specific primer sequence for RT-PCR
2.1 TaLox-B2和 TaLox-B3基因在小麥不同器官中的表達(dá)
利用RT-PCR分析 TaLox-B2和 TaLox-B3基因在矮抗58、石4185和豫農(nóng)211小麥品種的不同器官中的表達(dá),結(jié)果(圖1)表明, TaLox-B2基因在石4185、矮抗58以及豫農(nóng)211的不同器官中均表達(dá),且在葉中表達(dá)水平明顯高于根、莖和成熟籽粒,成熟籽粒中的表達(dá)水平略高于根、莖,而根中表達(dá)水平最低(圖1A)。 TaLox-B3基因在石4185和豫農(nóng)211的不同器官中均不表達(dá),而在矮抗58的不同器官中均表達(dá),且在根中表達(dá)水平明顯高于葉、莖和成熟籽粒,在葉中的表達(dá)水平略高于成熟籽粒和莖,而在莖中表達(dá)水平最低(圖1B)。由此可見(jiàn),小麥 TaLox-B2基因的表達(dá)強(qiáng)度依次為葉>成熟籽粒>莖>根,而 TaLox-B3基因的表達(dá)強(qiáng)度依次為根>葉>成熟籽粒>莖。
2.2 TaLox-B2和 TaLox-B3基因在脅迫處理下的特異性表達(dá)
利用RT-PCR分析經(jīng)高鹽、低溫、高溫和干旱脅迫處理后的矮抗58葉片中 TaLox-B2和 TaLox-B3基因的表達(dá)情況,結(jié)果如圖2~5所示。
在4 ℃低溫條件下, TaLox-B2基因在0~1 h
圖1 TaLox-B2和 TaLox-B3基因在普通小麥品種不同器官中的相對(duì)表達(dá)水平
迅速上調(diào)表達(dá),在1 h時(shí)達(dá)到最大,約為起始表達(dá)量的1.5倍,此后表達(dá)量下降,在3 h時(shí)表達(dá)量接近起始水平,之后又開(kāi)始上升,在6 h時(shí)達(dá)到峰值,此時(shí)約為起始表達(dá)量的1.1倍,之后又開(kāi)始平緩下降,24 h時(shí) TaLox-B2的相對(duì)表達(dá)量較弱; TaLox-B3基因在0~6 h迅速上調(diào)表達(dá),在6 h時(shí)達(dá)到最大,此時(shí)約為起始表達(dá)量的2.6倍,之后表達(dá)量逐漸下降,24 h時(shí)其表達(dá)量達(dá)到最低,此時(shí)與 TaLox-B2的相對(duì)表達(dá)水平非常接近(圖2)。
圖2 4 ℃低溫條件下矮抗58葉片中 TaLox-B2和TaLox-B3基因的表達(dá)
42 ℃高溫條件下, TaLox-B2基因呈下調(diào)表達(dá)趨勢(shì),在0~1 h平緩下降,之后開(kāi)始急劇下降,在12 h時(shí)達(dá)到最低,此時(shí)約為起始表達(dá)量的1/20,之后又開(kāi)始緩慢上升,24 h時(shí)約達(dá)到最低表達(dá)量時(shí)的4倍; TaLox-B3基因也呈下調(diào)表達(dá)趨勢(shì),在0~12 h平緩下降,在12 h時(shí)達(dá)到最低,此時(shí)約為起始表達(dá)量的1/10,之后又開(kāi)始緩慢上升,24 h時(shí)達(dá)到最低表達(dá)量時(shí)的2.2倍(圖3)。
圖3 42 ℃高溫條件下矮抗58葉片中 TaLox-B2和TaLox-B3基因的表達(dá)
在100 mmol·L-1NaCl處理?xiàng)l件下, TaLox-B2基因在0~3 h平緩上升,在3 h時(shí)達(dá)到最高,此時(shí)約為起始表達(dá)量的2.4倍,之后開(kāi)始緩慢下降,但到12 h以后下降速度減慢,基本處于一個(gè)穩(wěn)定的狀態(tài); TaLox-B3基因在0~3 h急劇上升,在3 h時(shí)達(dá)到最高,此時(shí)約為起始表達(dá)量的5倍,之后開(kāi)始下降,在12 h時(shí)達(dá)到最低,此時(shí)相對(duì)表達(dá)量與起始表達(dá)量相當(dāng),但略低于起始表達(dá)量,此后又開(kāi)始緩慢上升,在24 h時(shí)的相對(duì)表達(dá)量約為起始表達(dá)量的1.4倍(圖4)。
在20% PEG6000脅迫條件下, TaLox-B2基因在0~3 h平緩上升,在3 h時(shí)達(dá)到一個(gè)峰值,之后開(kāi)始下降,在12 h時(shí)達(dá)到另外一個(gè)峰值,之后開(kāi)始急劇下降,在24 h時(shí)的相對(duì)表達(dá)量約為起始表達(dá)量的1/3倍; TaLox-B3基因在0~1 h呈下調(diào)表達(dá),之后開(kāi)始上升,且在3 h和12 h分別有一個(gè)峰值,在24 h時(shí)的相對(duì)表達(dá)量約為起始表達(dá)量的1/4倍(圖5)。
圖4 100 mmol·L-1 NaCl脅迫條件下矮抗58葉片中 TaLox-B2和TaLox-B3基因的表達(dá)
圖5 干旱脅迫條件下矮抗58葉片中 TaLox-B2和TaLox-B3基因的表達(dá)
脂肪氧化酶廣泛存在于各種植物中,植物在受到外源傷害或病原菌侵染時(shí)Lox表達(dá)增強(qiáng),而Lox的催化產(chǎn)物脂氫過(guò)氧化物及其次生產(chǎn)物可以降解為傳遞生物脅迫和非生物脅迫信息的信號(hào)因子,以增強(qiáng)對(duì)昆蟲(chóng)和真菌病害的敏感性,進(jìn)而對(duì)植物起到一定的保護(hù)作用[19]。目前,脂肪氧化酶在擬南芥、馬鈴薯、大麥、水稻以及大豆等植物中關(guān)于生理基礎(chǔ)和分子生物學(xué)方面的研究較為深入。Hildebrand等[20]研究認(rèn)為,大豆葉片中的Lox與反應(yīng)底物是分開(kāi)的,但在其受到逆境脅迫,并產(chǎn)生組織損傷后,Lox能與底物進(jìn)行結(jié)合,脂肪氧化酶蛋白及其活性會(huì)急劇增加,并形成新的脂肪氧化酶同工酶。而Shukle等[21]發(fā)現(xiàn)從大豆中提取的脂肪氧化酶可以有效的阻止煙草天蛾幼蟲(chóng)的生長(zhǎng)發(fā)育,因此他們認(rèn)為脂肪氧化酶在大豆植物體內(nèi)能直接起到抵御有害生物危害的功能。Royo等[22]從馬鈴薯中克隆出與逆境脅迫相關(guān)的 Lox1、 Lox2和 Lox3基因,研究發(fā)現(xiàn) Lox1在塊莖和根中特異性表達(dá), Lox3基因則在葉片和根中表達(dá),而 Lox2只在葉片中表達(dá),說(shuō)明Lox基因具有特定的組織表達(dá)特異性;對(duì)馬鈴薯葉片進(jìn)行傷害處理后,研究發(fā)現(xiàn) Lox3基因的表達(dá)量在0.5 h后迅速增強(qiáng),而 Lox2基因的表達(dá)量在24 h內(nèi)呈遞增趨勢(shì),從而說(shuō)明了植物體內(nèi)不同的Lox基因在應(yīng)對(duì)逆境生物脅迫時(shí)扮演著不同的角色。脂肪氧化酶在普通小麥抗逆境方面的研究也取得一定的研究進(jìn)展。Ocampo等[23]通過(guò)研究小麥Lox活性與小麥植株抗病性的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)當(dāng)小麥植株受到病原體侵染時(shí),植物組織中Lox活性迅速提高,并刺激產(chǎn)生相應(yīng)的創(chuàng)傷素、植物二烯酸以及脫落酸等來(lái)阻止病原體進(jìn)一步入侵。張榮平等[24]在模擬干旱和高溫條件下研究冬小麥不同品種胚根脂氧合酶(Lox)活性變化,發(fā)現(xiàn)抗旱-抗熱性強(qiáng)的小麥品種胚根中Lox活性只有較小幅度的上升,而抗旱-抗熱性弱的品種Lox活性則有較大幅度的上升。說(shuō)明植物體內(nèi)Lox活性含量的變化情況與植物所在外界環(huán)境密切相關(guān)。本研究對(duì)控制小麥籽粒Lox活性主效基因 TaLox-B2和 TaLox-B3的表達(dá)模式以及對(duì)各種脅迫的響應(yīng)進(jìn)行研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn),低溫和NaCl脅迫時(shí) TaLox-B2和 TaLox-B3基因的表達(dá)量在短時(shí)間內(nèi)迅速上升,以增強(qiáng)植物對(duì)外界環(huán)境的敏感性,進(jìn)而對(duì)小麥植株起到保護(hù)作用,這與Ocampo等[23]和張榮平等[24]的研究結(jié)果基本一致;而在高溫脅迫時(shí), TaLox-B2和 TaLox-B3基因的表達(dá)量呈下降趨勢(shì),這與低溫和NaCl脅迫時(shí)的Lox基因的作用機(jī)制明顯不同,需進(jìn)一步深入研究;干旱脅迫時(shí), TaLox-B2和 TaLox-B3基因的表達(dá)量均較低,且沒(méi)有明顯規(guī)律,表明二者的表達(dá)可以與滲透脅迫無(wú)關(guān),主要是離子脅迫誘導(dǎo)其表達(dá)。
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Expression Analysis of Wheat Lipoxygenase Genes at Different Stress Conditions by Quantitative Real-Time PCR
ZHANG Fuyan1,2,CHEN Feng2,ZHANG Jianwei1,YANG Baoan1,FAN Jialin1,CHEN Xiaojie1,CHEN Yuntang1,CUI Long1
(1.Isotope Institute Co.,Ltd,Henan Academy of Sciences/Henan Key Laboratory of Nuclear Agricultural Sciences,Zhengzhou,Henan 450015,China; 2.Agronomy College,Henan Agricultural University/Collaborative Innovation Center of Food Crops in Henan Province,Zhengzhou,Henan 450002,China)
To explore the biology function of wheat lipoxygenase genes under abiotic stress,we used the quantitative real-time PCR to deduce the expression profiling of TaLox-B2 and TaLox-B3 genes in roots,stems,leaves and mature seeds of wheat and the expression analysis of TaLox-B2 and TaLox-B3 genes in leaves under salt-stress treatment (100 mmol·L-1NaCl),low temperature-stress treatment (4 ℃),high temperature-stress treatment(42 ℃) and drought-stress treatment(20% PEG6000). The results showed that TaLox-B2 and TaLox-B3 genes could express in various tissues of wheat,including roots,stems,leaves and mature seeds. The expression of TaLox-B2 was mainly in the leaves and mature seeds,while TaLox-B3 was expressed primarily in the roots and leaves. The expression trends of TaLox-B2 and TaLox-B3 were similar to normal distribution and reached a peak at 3 h under high salinity. TaLox-B2 gene did not show a significant trendline under low temperature-stress treatment. The expression of TaLox-B3 gene was up-regulated at low temperature from 0 h to 6 h,and began to gradually decline afterwards. The expression of TaLox-B2 and TaLox-B3 genes were down-regulated at high temperature-stress treatment from 0 h to 12 h.However,the TaLox-B2 and TaLox-B3 genes showed obviously different trendlines. TaLox-B2 and TaLox-B3 genes showed obviously different expression profiles,respectively,and their expression levels were very low,while there were no clear expression tendency were observed under the treatment of PEG6000. To summarize, TaLox-B2 and TaLox-B3 were mainly induced by salt-stress,but no specific relationship with PEG drought stress was found. In addition,the expression of TaLox-B2 and TaLox-B3 genes have more obvious influence on the temperature changes,but the mechanism of the effect of the low temperature and high temperature are different.
TriticumaestivumL.; Stress; Lipoxygenase genes; Expression analysis
2016-03-09
2016-05-06
河南省基礎(chǔ)與前沿技術(shù)研究計(jì)劃資助項(xiàng)目(162300410169;152300410141);河南省小麥產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專(zhuān)項(xiàng)資金項(xiàng)目(Z2010-01-04);鄭州市重大科技攻關(guān)項(xiàng)目(121PZDGG071)
E-mail:zhangfuyan704@163.com
張建偉(E-mail:zjw10308@163.com);楊保安(E-mail:yangcorn@163.com)
S512.1;S330
A
1009-1041(2016)09-1153-06
網(wǎng)絡(luò)出版時(shí)間:2016-08-31
網(wǎng)絡(luò)出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/61.1359.S.20160831.1649.010.html