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    一株褐藻酸裂解酶高產(chǎn)菌的篩選及其酶學性質(zhì)研究

    2016-09-19 02:27:25陳洪基姜國良閆廣思
    中國釀造 2016年5期
    關鍵詞:褐藻寡糖單胞菌

    陳洪基,姜國良*,閆廣思

    (中國海洋大學海洋生命學院,山東青島266003)

    一株褐藻酸裂解酶高產(chǎn)菌的篩選及其酶學性質(zhì)研究

    陳洪基,姜國良*,閆廣思

    (中國海洋大學海洋生命學院,山東青島266003)

    從腐爛的海帶中篩選出一株褐藻酸裂解酶(A ly)高產(chǎn)菌,經(jīng)形態(tài)學分析、生理生化特征和分子水平鑒定,該菌為交替假單胞菌屬,命名為Pseudoalteromonas sp.EE258。利用硫酸銨沉淀、快流速DEAE-瓊脂糖凝膠(DEAE-sepharose Fast Flow)和丙烯葡聚糖凝膠(Sephacryl S-100)柱層析等方法,對Pseudoalteromonas sp.EE258產(chǎn)生的褐藻酸裂解酶A ly-EE258進行分離純化,十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)測定該酶的分子質(zhì)量為23 ku。酶學性質(zhì)研究顯示:該酶的最適反應溫度為40℃,最適反應pH值為7.0,在20℃以下時穩(wěn)定性較好,Ca2+和Ba2+能明顯提高酶的活性,F(xiàn)e2+、A l3+、Mg2+和乙二胺四乙酸(EDTA)抑制酶的活性。Aly-EE258能不同程度地裂解褐藻酸、聚古洛糖醛酸和聚甘露糖醛酸,其中聚甘露糖醛酸裂解后主要產(chǎn)生單一的低聚寡糖,在實際應用方面具有重要意義。

    交替假單胞菌屬;褐藻酸裂解酶;酶學性質(zhì)

    褐藻酸(alginate)是一種大分子線性多糖,β-D-甘露糖醛酸(β-D-mannose hyaluronic acid,M)和其C5差向異構(gòu)體α-L-古羅糖醛酸(α-L-guluronic acid,G)通過α-1,4-糖苷鍵結(jié)合形成3種褐藻酸分子:聚β-D-甘露糖醛酸(ploymannuronic acid,PolyM),聚α-L-古羅糖醛酸(poly gulonic hyaluronic acid,PolyG)和雜聚物(ploy mannuronic acid and gulonic hyaluronic acid,PolyMG)[1]。研究發(fā)現(xiàn),褐藻酸降解產(chǎn)物褐藻酸寡糖具有多種生物活性,包括促生長作用、增強免疫力抗腫瘤活性、誘導子活性、神經(jīng)保護作用等[2-3],因此其功能性寡糖的開發(fā)在國際上己成為一個研究熱點。

    褐藻酸裂解酶是一類多糖裂解酶,通過β-消去反應能夠降解大分子褐藻酸生成低分子量的褐藻酸寡糖或單糖[4],主要來源于海洋動物、海洋細菌及真菌等[5]。在碳水化合物活性酶數(shù)據(jù)庫中,目前研究的褐藻酸裂解酶分布在24個多糖裂解酶(polysaccharide lyase,PL)家族中的PL5、PL6、PL7、PL14、PL15、PL17和PL18家族中[6],其中,蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)得到解析的褐藻酸裂解酶已有10個。交替假單胞菌屬(Pseudoalteromonas sp.)是由GAUTHIER G等[7]發(fā)現(xiàn)并建立的一個海洋菌屬,廣泛存在于海洋污泥和海洋動植物表面,該菌屬只能從海洋環(huán)境中分離得到。目前,交替假單胞菌產(chǎn)內(nèi)切葡聚糖酶、κ-卡拉膠酶、甲殼素酶、右旋糖酐酶和幾丁質(zhì)酶等[8-10]的報道較多,但是產(chǎn)褐藻酸裂解酶方面的研究還較少。交替假單胞菌產(chǎn)生的褐藻酸裂解酶可以制備諸多生物活性的海藻寡糖,并且與其他菌屬產(chǎn)生的褐藻酸裂解酶性質(zhì)差異明顯,因此開展交替假單胞菌產(chǎn)褐藻酸裂解酶的研究具有很大的開發(fā)和應用價值。

    本研究從腐爛的海帶中分離出了一株褐藻酸裂解酶高產(chǎn)菌,通過形態(tài)學、生理生化特征及16S rDNA序列分析進行了鑒定,并對純化得到的褐藻酸裂解酶酶學性質(zhì)進行了研究,以期為褐藻酸裂解酶的研究和應用提供參考。

    1 材料與方法

    1.1材料與試劑

    1.1.1樣品

    腐爛的海帶:采自山東榮成海帶養(yǎng)殖廠。

    1.1.2培養(yǎng)基

    初篩培養(yǎng)基:褐藻酸鈉5.0 g/L,(NH4)2SO45.0 g/L,K2HPO42.0 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g/L,MgSO4·7H2O 1.0 g/L,NaCl 25.0 g/L,瓊脂粉15.0 g/L,pH 7.5。

    斜面培養(yǎng)基:褐藻酸鈉5.0 g/L,蛋白胨5.0 g/L,酵母提取物1.0 g/L,K2HPO42.0 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g/L,MgSO4·7H2O 1.0g/L,NaCl25.0g/L,瓊脂粉15.0g/L,pH 7.5。

    復篩與發(fā)酵培養(yǎng)基:褐藻酸鈉5.0 g/L,蛋白胨5.0 g/L,酵母提取物1.0 g/L,K2HPO42.0 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01 g/L,MgSO4·7H2O 1.0 g/L,NaCl 25.0 g/L,pH 7.5。

    1.1.3化學試劑

    酵母粉:英國Oxoid公司;牛血清白蛋白、甲叉雙丙烯酰胺、考馬斯亮藍G-250、十二烷基磺酸鈉:美國Sigma-Aldrich公司;三羥甲基氨基甲烷(Tris base):美國Promega公司;其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

    1.2儀器與設備

    Unic2000可見分光光度計:尤尼柯儀器有限公司;CF16RXⅡ日立多用途離心機:日立工機有限公司;BS110S精密電子天平:德國Sartorius公司;DK-824電熱恒溫水浴鍋:上海精宏實驗儀器有限公司;DYY-6B穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀:北京六一儀器廠;YC-1層析實驗冷柜:北京博醫(yī)康實驗儀器有限公司;BS-100A自動部分收集器:上海青浦瀘西儀器廠。層析柱(1.6 cm×30 cm,1.6 cm×80 cm):江陰市創(chuàng)通層析設備有限公司。

    1.3實驗方法

    1.3.1酶活力和總蛋白含量的測定方法

    取1 m L酶樣品和2 m L 1%褐藻酸鈉溶液于試管中,40℃水浴反應30 m in,立即置于沸水浴10 m in終止反應。取1 m L反應液和3 m L 3,5-二硝基水楊酸(3,5-dinitrosalicylic acid,DNS)于25m L比色管中,置于沸水浴反應5 min,取出后置于冰水浴中迅速冷卻,用蒸餾水定容至25 m L,在波長550 nm處測定吸光度值[11]。褐藻酸裂解酶活定義:在上述實驗條件下,每分鐘產(chǎn)生1 μg還原性糖所需的酶量為一個酶活力單位(U)??偟鞍缀坎捎肂raford法測定[12]。相關計算公式如下:

    1.3.2菌株的篩選

    1.3.3菌種鑒定

    利用顯微鏡觀察優(yōu)選菌種形態(tài),參照《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》[13]中生理生化試驗方法,對優(yōu)選菌株進行初步鑒定。

    優(yōu)選菌株分子生物學鑒定:利用細菌基因組脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)抽提試劑盒提取目的菌株的基因組DNA,設計細菌通用引物1:5′-AGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,引物2:5′-GGTTA CCTTGTTACGACTT-3′,以細菌基因組DNA為模板進行PCR擴增。PCR產(chǎn)物經(jīng)膠回收后連接到PMD 18-T載體上,測序。將獲得的16S rDNA序列在美國國家生物技術(shù)信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)利用局部序列排比檢索基本工具(basic local alignment search tool,BLAST)工具進行同源性比對,將比對結(jié)果導入MEGA6.0,選用鄰接(neighbor-joining,NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[14]。

    1.3.4酶的分離純化

    菌株EE258接種到發(fā)酵培養(yǎng)基中,25℃、160 r/min培養(yǎng)48 h,使酶活力達到最高。發(fā)酵液4℃、10 000×g離心10 m in,上清即為粗酶液。粗酶液進行硫酸銨分級鹽析,使硫酸銨飽和度依次達到20%、35%、50%、65%、80%和95%,溶液在冰水浴中緩慢攪拌過夜,離心(4℃、10 000×g離心10 min)后的沉淀用0.05 mol/L Tris-HCl緩沖液(pH 7.5)溶解,測定不同飽和度下的酶活力,收集活性較高的部分。采用截留分子質(zhì)量為10 ku的超濾濃縮管多次離心(4℃、4 000×g離心10 min)脫鹽,在滲出液中加入BaCl2溶液,若無沉淀生成證明(NH4)2SO4已被除去。

    脫鹽后的粗酶液上樣于DEAE-Sepharose FastFlow凝膠柱,用3~4倍柱床體積的初始緩沖液平衡后,用0~0.5 mol/L NaCl洗脫,調(diào)節(jié)恒流泵流速為30 m L/min,每管收集5 m L。測定每管蛋白濃度及褐藻酸裂解酶活力,建立陰離子交換層析洗脫曲線圖。

    收集陰離子交換層析后的酶活峰較高的部分,濃縮至2 m L,上Sephacryl S-100過濾層析柱,用初始緩沖液洗脫,流速30 m L/min,每管收集5 m L。收集酶活峰,十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)凝膠電泳測定蛋白的純度和分子質(zhì)量。

    1.3.5酶學性質(zhì)研究

    (1)酶的最適溫度:在pH值為7.5的條件下,以最大酶活力為100%,測定褐藻酸裂解酶在5~65℃(溫度梯度為5℃)范圍內(nèi)的相對酶活,確定酶反應的最適溫度。

    全固態(tài)離子選擇性電極因為不含內(nèi)充液,極易微型化、陣列化和制備成一次性的紙質(zhì)電極和塑料柔性電極,受到越來越多研究人員的關注。

    (2)酶的最適pH:在最適溫度的條件下,以酶活力最高者為100%,分別于pH值為5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0的緩沖液體系中測定酶的活力,確定酶反應的最適pH。

    (3)酶溫度穩(wěn)定性:取適量的酶在5℃、20℃、30℃、40℃、50℃條件下保溫不同時間(0.5 h、1.0 h、1.5 h、2.0 h)后,以未處理酶的酶活力為100%,在最適溫度和pH條件下測定剩余酶活力,考察酶的穩(wěn)定性。

    (4)金屬離子對酶活性的影響:在酶反應體系中分別加入等體積的金屬離子K+、Ca2+、Na+、Fe2+、Al3+、Mg2+、Ba2+、M n2+和乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA),使金屬離子的終濃度為10 mmol/L,以不加金屬離子的對照組酶活力為100%,在上述最適溫度和pH條件下測定酶活。

    (5)NaCl濃度對酶活性的影響:在酶反應體系中加入NaCl,使終濃度為0.2 mol/L、0.4 mol/L、0.6 mol/L、0.8 mol/L、1.0 mol/L、1.5 mol/L、2.0 mol/L,以不加NaCl的對照組酶活力為100%,在上述最適溫度和pH條件下測定酶活。

    (6)底物特異性及酶解產(chǎn)物:分別配制1%的褐藻酸鈉、PolyM和PolyG底物,加入褐藻酸裂解酶進行反應,用薄層層析(thin layer chromatography,TLC)法分析酶解產(chǎn)物。

    2 結(jié)果與分析

    2.1菌種篩選

    從取自腐爛海帶的材料中,經(jīng)稀釋涂布,分離能在以褐藻酸鈉為唯一碳源的培養(yǎng)基中生長的菌株,初篩得到18株具有褐藻酸降解能力的菌株,結(jié)果見圖1a。由圖1a可知,大多數(shù)菌株可以產(chǎn)生透明圈,透明圈的大小可以初步反應菌株的產(chǎn)酶能力。挑取有明顯透明圈的菌株接種于復篩培養(yǎng)基中,測定酶活活性,結(jié)果見圖1b。由圖1b可知,編號為EE258、EE2510和EE2519菌株的酶活較高,相對酶活分別為100%、87.63%和83.87%。通過初篩及復篩,選取能在平板上形成顯著透明圈和酶活最高的菌株EE258,進行后續(xù)研究。

    圖1 初篩和復篩結(jié)果Fig.1 Results of primary and secondary screening

    2.2菌株EE258菌落及個體形態(tài)特征

    對復篩菌株EE258進行革蘭氏染色,在顯微鏡下觀察其個體形態(tài),結(jié)果見圖2。菌株EE258在固體培養(yǎng)基上的菌落呈圓形,乳白色,無光澤,表面扁平,邊緣粗糙。由圖2可知,菌株EE258呈桿狀,為革蘭氏陰性菌。

    圖2 菌株EE258個體形態(tài)Fig.2 Morphology of strain EE258

    2.3菌株EE258生理生化特征

    EE258不能在厭氧條件下生長,為好氧菌,能在4~35℃生長。菌株EE258能在pH7.0~10.0的條件下生長,最適pH值為7.5。NaCl不是菌株EE258生長必需的物質(zhì),耐受NaCl的鹽度為0~12%,最適NaCl的濃度為7%。過氧化氫酶和氧化酶反應為陽性,可以利用棉子糖、D-葡萄糖、乳糖、蔗糖、阿拉伯糖和鼠李糖等作為碳源,而不能利用其它碳源。根據(jù)形態(tài)特征和生理生化特征,初步將菌株EE258鑒定為交替假單胞菌屬的細菌。

    2.4菌株EE258的分子生物學鑒定

    通過提取細菌基因組、設計16S rDNA通用引物、PCR擴增,PCR產(chǎn)物利用瓊脂糖凝膠電泳檢測(見圖3)。由圖3可知,在1 000~2 000 bp之間形成一條亮帶,說明PCR產(chǎn)物純度很高。

    圖3 PCR擴增產(chǎn)物電泳圖Fig.3 Elec trophoresis of strain EE258 PCR amp lification products

    菌株EE258的16S rDNA序列長度為1 410 bp,將序列(GenBank登錄號:KT807786)與GenBank數(shù)據(jù)庫中已知的基因序列進行同源性比較,發(fā)現(xiàn)菌株與多株交替假單胞菌屬細菌的16S rDNA基因序列同源性高達99%。由分類地位的系統(tǒng)發(fā)育樹(見圖4)可知,菌株EE258與Pseudoal-teromonas arctica NSP519的親緣關系最相近,由此可鑒定該菌為交替假單胞菌屬(Pseudoalteromonas sp.),命名為Pseudoalteromonas sp.EE258。

    圖4 菌株EE258基于16S rDNA序列同源性構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.4 Phylogenetic tree of strain EE258 based on 16S rDNA sequence homology

    2.5褐藻酸裂解酶的分離純化

    褐藻酸裂解酶粗酶液經(jīng)過硫酸銨分級鹽析、DEAE-sepharose Fast Flow離子交換層析及Sephacryl S-100凝膠過濾,一系列的純化操作,分離純化結(jié)果見表1。由表1可知,經(jīng)過純化后,褐藻酸裂解酶的比活力由48.26 U/mg提升至384.12 U/mg,純化倍數(shù)約7.96,回收率為20.22%。SDS-PAGE凝膠電泳(見圖5)顯示純化后的褐藻酸裂解酶為一條帶,分子質(zhì)量大小約為23 ku,命名為A ly-EE258。

    表1 Pseudoalterom onas sp.EE258產(chǎn)褐藻酸裂解酶的純化結(jié)果Table 1 Purification results of alginate lyase from Pseudoa lterom onas sp.EE258

    圖5 褐藻酸裂解酶的SDS-PAGE凝膠電泳圖Fig.5 Gel electrophoresis o f alginate lyase analysis by SDS-PAGE

    2.6A ly-EE258的酶學性質(zhì)分析

    2.6.1Aly-EE258酶反應最適溫度和熱穩(wěn)定性

    純化后的酶與褐藻酸溶液混合,在不同溫度下(5~65℃)反應,以最高酶活為100%測定相對酶活,結(jié)果見圖6。結(jié)果表明,該酶的最適作用溫度為40℃,當溫度>60℃時,幾乎沒有酶活。

    圖6 溫度對Aly-EE258酶活的影響Fig.6 Effect of tem perature on the enzyme activity of Aly-EE258

    將A ly-EE258酶液于5℃、20℃、30℃、40℃、50℃保溫一定時間,并分別于0.5 h、1.0 h、1.5 h和2.0 h后取樣測量剩余酶活力,計算相對酶活力,結(jié)果見圖7。由圖7可知,酶液在5~20℃下保溫,酶活損失較少,2.0 h后剩余酶活在70%以上;即使在較高溫度下,仍可保持較高的酶活(50℃條件下酶保溫2.0 h,酶活力約為42%)。在低于20℃范圍內(nèi),酶穩(wěn)定性較好。

    圖7 Aly-EE258酶的熱穩(wěn)定性Fig.7 Thermostability of Aly-EE258

    2.6.2Aly-EE258酶反應最適pH

    圖8 pH值對Aly-EE258酶活的影響Fig.8 Effect of pH on the enzyme activity of Aly-EE258

    將酶液與不同pH的緩沖溶液混合,溶液的pH范圍為5.0~10.0,以最高酶活為100%,測定酶活力,結(jié)果如圖8所示。由圖8可知,酶反應的最適pH值為7.0,在pH 6.5~7.5酶活力都較高,與文獻報道的褐藻酸裂解酶的最適pH值6.0~8.0一致[15]。

    2.6.3金屬離子對Aly-EE258酶活性的影響

    在酶與底物的反應體系中,加入不同的金屬離子,使其終濃度為10 mmol/L,以不加金屬離子酶液的酶活為100%,得到相對酶活結(jié)果見圖9。由圖9可知,多種金屬離子對Aly-EE258酶的活性都有較大的影響,其中,Ca2+、Ba2+對酶有明顯的激活作用,以Ca2+的激活能力最好;金屬離子Fe2+、A l3+、M g2+會抑制Aly-EE258酶的活性;金屬離子螯合劑EDTA可以強烈抑制純化的A ly-EE258酶活性,表明該純化酶是一種金屬蛋白酶。

    圖9 金屬離子對Aly-EE258酶活的影響Fig.9 Effect of me tal ions on the enzym e activity of Aly-EE258

    2.6.4NaCl濃度對A ly-EE258酶活性的影響

    將純酶液置于不同濃度的NaCl溶液中,以在無NaCl條件下的酶活為對照,測定酶活力,結(jié)果見圖10。由圖10可知,該純化酶在NaCl加入后酶活力有較大程度的提高,其最適的NaCl濃度為0.4 mol/L,在此條件下Aly-EE258酶活性提高了39.5%。且該酶在NaCl濃度<1.2 mol/L的高鹽條件下的酶活力均高于無NaCl條件的酶活。以上結(jié)果表明Aly-EE258酶具有較強的耐鹽性,在鹽濃度變化較大的環(huán)境下仍然保持較高的酶活。

    圖10 NaC l濃度對Aly-EE258酶活的影響Fig.10 Effect of NaCl concentration on the enzyme activity of Aly-EE258

    2.6.5底物特異性和產(chǎn)物分析

    薄層層析結(jié)果(見圖11)表明,褐藻酸鈉、PolyM和PolyG酶解后產(chǎn)生不同聚合度的褐藻酸寡糖,然而都沒有單糖生成,說明Aly-EE258為內(nèi)切型褐藻酸裂解酶。其中PolyM的酶解產(chǎn)物主要為單一寡糖,在寡糖分離純化技術(shù)上可以節(jié)約大量的成本。

    圖11 褐藻酸鈉、PolyM和PolyG酶解產(chǎn)物的薄層層析Fig.11 TLC analysis of enzymatic hydrolysate of alginate,PolyM and PolyG

    3 結(jié)論

    本研究從腐爛的海帶中分離出一株高產(chǎn)褐藻酸裂解酶菌株,經(jīng)形態(tài)學、生理生化特征和分子水平鑒定,該菌為交替假單胞菌屬,命名為Pseudoalteromonas sp.EE258。褐藻酸裂解酶Aly-EE258的最適反應溫度為40℃,最適反應pH為7.0,在20℃以下時酶的穩(wěn)定性較高,Ca2+、Ba2+對酶有明顯的激活作用,F(xiàn)e2+、Al3+、Mg2+會抑制酶的活性。褐藻酸鈉、PolyM和PolyG均能被A ly-EE258裂解成低聚寡糖,PolyM經(jīng)裂解主要產(chǎn)生單一寡糖。綜上所述,褐藻酸裂解酶Aly-EE258有良好的開發(fā)和應用前景。

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    Screening of a high-yield alginate lyase producing strain and its enzymatic properties

    CHEN Hongji,JIANG Guoliang*,YAN Guangsi
    (College of Marine Life Sciences,Ocean University of China,Qingdao 266003,China)

    A high-yield alginate lyase(A ly)producing strain was screened from rotten kelp.According to morphological analysis,physiological and biochemical characteristics and molecular identification,the strain was identified as Pseudoalteromonas sp.EE258.The A ly-EE258 from Pseudoalterom onas sp.EE258 was separated and purified by ammonium sulfate precipitation,DEAE-sepharose Fast Flow and Sephacryl S-100 column chromatography.The molecular mass of the purified enzyme was about 23 ku by sodium dodecyl sulfate polyacrylam ide gel electrophoresis(SDS-PAGE). The enzymology properties study showed that the optimum reaction temperature and pH of the enzyme was 40℃and 7.0,respectively.The enzyme had good stability at below 20℃.The enzyme activity was significantly promoted by Ca2+and Ba2+,but inhibited by Fe2+,A l3+,Mg2+and EDTA.The A ly-EE258 could degrade alginate,poly gulonic hyaluronic acid(PolyG)and ploymannuronic acid(PolyM)inordinately.PolyM could be mainly degraded into single oligosaccharide,which had great significance in practical application.

    Pseudoalterom onas sp.;alginate lyase;enzymatic properties

    S968.42

    0254-5071(2016)05-0025-06

    10.11882/j.issn.0254-5071.2016.05.006

    2016-01-31

    國家自然科學基金(No.31101876);山東省自然科學基金(No.20102RE29047)

    陳洪基(1989-),男,碩士研究生,研究方向為資源生態(tài)學。

    姜國良(1963-),男,教授,本科,研究方向為海洋生物材料與活性物質(zhì)方面的研究。

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