孟詳喻,方程,李妙竹,田國祥,曾憲濤
· 循證理論與實踐 ·
生存資料的二次研究系列之四:預后相關系統(tǒng)評價/ Meta分析的文獻計量學研究
孟詳喻1,2,方程1,2,李妙竹3,田國祥4,曾憲濤1,2
預后指標在醫(yī)學研究及臨床實踐中都具有重要意義。預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析對預后方面的研究資料進行評價、匯總以形成能用于指導臨床實踐的高質量證據(jù)。為了探索預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析當前在全球范圍的研究現(xiàn)狀,本文通過檢索Scopus數(shù)據(jù)庫獲得2006~2015年間發(fā)表的預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析文獻,利用R軟件、tm程序包、ggplot2程序包以及VOSviewer軟件進行文獻計量學分析、簡單的文本挖掘及相關可視化展示。
預后;系統(tǒng)評價/Meta分析;文獻計量學;文本挖掘;可視化
系統(tǒng)評價/Meta分析是目前最為活躍的醫(yī)學二次研究類型[1]。預后指標在醫(yī)學研究及臨床實踐中都具有重要意義,預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析對預后方面的研究資料進行評價、匯總以形成能用于指導臨床實踐的高質量證據(jù)[2]。
通過文獻計量學研究對某一研究領域既往發(fā)表文獻的文獻分布、被引情況及合著情況等方面進行分析,有助于幫助研究者進一步了解相關領域的研究現(xiàn)狀,為后續(xù)研究提供思路與借鑒。為了探索預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析目前在全球范圍的研究現(xiàn)狀,本文通過檢索Scopus數(shù)據(jù)庫獲得2006~2015年間發(fā)表的預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析文獻,利用R軟件、tm程序包、ggplot2程序包以及VOSviewer軟件進行文獻計量學分析、標題信息的文本挖掘及相關可視化展示。
1.1數(shù)據(jù)收集 本研究選用Elsevier旗下的Scopus數(shù)據(jù)庫作為文獻來源。該數(shù)據(jù)庫為目前全球最大的同行評審文獻數(shù)據(jù)庫。將檢索時間范圍限定為2006至2015年,即目標文獻為過去10年間發(fā)表的相關文獻。為了獲得預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析,在檢索策略中限定文章標題包含“meta-analysis”或“systematic review”并且在標題或摘要中出現(xiàn)以“prognos”開頭的英文單詞(如prognosis、prognostic等)或“survival”,文獻類型設定為“article”或“review”即論著或綜述。研究領域限定為生命科學、醫(yī)學與健康科學等相關領域。使用的檢索式如下:((TITLE(meta-analysis) OR (TITLE(systematic) AND TITLE(review) ) AND (TITLE-ABS(prognos*) OR TITLE-ABS(survival)) AND DOCTYPE(ar OR re)AND SUBJAREA(BIOC OR IMMU OR NEUR OR PHAR OR PSYC OR MEDI OR NURS OR DENT OR HEAL) AND (PUBYEAR > 2005 AND PUBYEAR <2016)。
2.1總覽 經檢索,在2006~2015年的10年間,共有6,918篇預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析為Scopus收錄。其中有3,831篇(55.4%)文獻作為論著(Article)發(fā)表,3,087篇(44.6%)文獻作為綜述(Review)發(fā)表。在同一時期,為Scopus收錄的各類系統(tǒng)評價/Meta分析則有71,144篇,其中論著37,172篇(52.2%),綜述33,972篇(47.8%)。預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析占各類系統(tǒng)評價/Meta的比例為9.7%。以英文和中文發(fā)表的文獻占絕大多數(shù),分別為6,471篇(93.5%)與343篇(5.0%)。
2.2時間分布 預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析以及全部類型系統(tǒng)評價/Meta分析的文獻發(fā)表數(shù)量在2006~2015年期間的時間分布如圖1所示??梢钥闯?,二者的文獻數(shù)量均呈上升趨勢,且在2011~2014年期間增長最為迅速,而2015年則增速明顯放緩。預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析文獻占各類文獻百分比隨時間的變化情況如表1所示??梢钥闯觯?006~2013年間其百分比基本上以9%為中心波動(均值9.06%,標準差0.47%),而2014年則迅速增加至10.7%并在2015年輕微上升至10.9%。
2.3國家與機構分布 發(fā)文數(shù)量前十的國家依次為中國(2,106篇,30.4%)、美國(1,417篇,20.5%)、英國(950篇,13.7%)、加拿大(596篇,8.6%)、意大利(514篇,7.4%)、荷蘭(490篇,7.1%)、澳大利亞(386篇,5.6%)、德國(383篇,5.5%)、法國(244篇,3.5%)與西班牙(179篇,2.6%)。排名前十的國家總發(fā)文量為5,751篇,占文獻總量的83.1%??梢园l(fā)現(xiàn),除發(fā)文量排名第一的中國外,排名前十的其他國家均為歐美國家。
發(fā)文數(shù)量排名前十的一級機構及其發(fā)文量如表2所示,其中中國的研究機構占一半,四川大學發(fā)文量排名居首。發(fā)文數(shù)量不少于20篇的機構共有160個,這些機構共參與發(fā)表了4,299篇(62.1%)文獻。
2.4期刊分布 檢索獲得的文獻共涉及1,633種期刊,平均每種期刊發(fā)文4.2篇。發(fā)文量排名前十的期刊發(fā)文量如圖2所示,在這些期刊中共發(fā)表相關文獻1,052篇,占全部文獻的15.2%。發(fā)文量最大的期刊為《PLoS ONE》(360篇,5.2%),其發(fā)文量明顯高于位居第二的《中國循證醫(yī)學雜志》(98篇,1.4%)。在這十種期刊中,有5種期刊為腫瘤學專業(yè)期刊,1種胃腸病專業(yè)期刊,其余4種為綜合性期刊。絕大多數(shù)期刊(1,499種,91.8%)的發(fā)文量不超過10篇,超過半數(shù)的期刊(829種,50.8%)僅發(fā)表了1篇相關文獻。
表2 預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析的機構分布
2.5被引情況 檢索獲取的6,918篇文獻被引用次數(shù)總計為162,088次,篇均被引次數(shù)為23.4次。其中1,391篇(20.1%)文獻至今無被引記錄,有1,307篇(18.9%)文獻的被引次數(shù)≤3次。5,571篇有被引記錄的文獻的年均被引次數(shù)的均值為5.7次/年。被引次數(shù)排名前十的文獻[8-17]與年平均被引數(shù)排名前十的文獻[8,10,12,13,15,16,18-21]分別列于表3與表4中??梢园l(fā)現(xiàn),總被引次數(shù)與年均被引次數(shù)前十的文獻均為國外學者發(fā)表的研究。腫瘤相關研究的數(shù)目在二者中均居首,均為4篇[8,10,14,16,21]。此外,上述高被引文獻均發(fā)表于國際一流醫(yī)學期刊而無一發(fā)表于圖2中發(fā)文量前十的期刊。
圖2 預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析發(fā)文量前十的雜志
對中國學者發(fā)表的2,106篇文獻進行被引分析后發(fā)現(xiàn),這些文獻被引用次數(shù)總計為14,035次,篇均被引次數(shù)為6.7次。有738篇文獻尚無被引記錄,占比35.0%;有487篇文獻的被引次數(shù)≤3次,占比23.1%。1,368篇有被引記錄的文獻的年均被引次數(shù)的均值為3.1次/年。中國學者發(fā)表的文獻中年均被引次數(shù)前十者列于表5中[22-31]??梢园l(fā)現(xiàn),這些文獻研究主題均與腫瘤相關,且大多數(shù)涉及生物標記與腫瘤患者預后的關系[23-27,29-31]。
2.6參考文獻 在納入的6,918篇預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析文獻中共引用了289,757篇次的參考文獻,篇均參考文獻數(shù)量為41.9篇。被引量排名前五的參考文獻的基本信息列于表6中[32-36]??梢钥闯?,這些高被引的參考文獻中有3篇經典的Meta分析方法學文獻,涉及隨機效應模型[32]、異質性評價[33]和發(fā)表偏倚檢驗[35];而另外兩篇則為介紹如何提取原始數(shù)據(jù)尤其是時間-事件資料以用于后續(xù)Meta分析的方法學文獻[37,38]。
2.7研究者及合著網(wǎng)絡 共有25,123名研究者參與了全部6,918篇文獻的研究工作,篇均作者數(shù)為3.6名。發(fā)文最多的學者為蘭州大學的楊克虎教授,共發(fā)文45篇。將發(fā)文數(shù)量不低于10篇的135名作者所構成的合著網(wǎng)絡進行聚類與可視化展示(圖3)。圖3中的每一個節(jié)點代表一名研究者,兩節(jié)點之間的連線代表兩名研究者間的合著關系。節(jié)點的大小與相應研究者的發(fā)文數(shù)量成正比,連線寬度與合著次數(shù)呈正比。根據(jù)135名作者的合著情況,聚類分析將其劃分為24個亞組,基本上每一個亞組對應一個合作緊密的研究團隊,在圖3中以不同的顏色進行標示??梢钥闯觯谥袊鴮W者內部,即便不同的研究團隊間基本上都有著較為緊密的合作,但中國學者與國外學者的合作則很少。而國外學者的合著關系僅限于研究團隊內部,不同團隊之間的聯(lián)系則很少。
表3 總被引次數(shù)排名前十文獻的基本信息
表4 年均被引次數(shù)排名前十文獻的基本信息
表5 中國學者發(fā)表的文獻中年均被引次數(shù)排名前十文獻的基本信息
2.8標題信息的文本挖掘 對6198篇納入文獻的標題所構成的語料庫進行文本挖掘。基于預處理后的語料庫構建得到文本數(shù)量6,918個、詞條數(shù)7,916條、稀疏度99.87%、最大詞條長度43字節(jié)的文本-詞條矩陣。出現(xiàn)頻率前五的詞條依次為“meta-analysis”(4,135次)、“systematic review”(3,894次)、“cancer”(2,305次)、“patients”(1,389次)和“prognostic”(840次)。出現(xiàn)頻率不超過20次的詞條總計7,406條,占全部詞條的93.6%。50.7%的詞條僅出現(xiàn)一次。經關聯(lián)分析確定與“cancer”相關程度最高的詞條為“l(fā)ung”(相關系數(shù)r=0.35),相關度靠前的詞條還有“breast”(r=0.32)、“non-smallcell”(r=0.32)、“advanced”(r=0.24)、“colorectal”(r=0.23)、“gastric”(r=0.22)、“chemotherapy”(r=0.20)、“prostate”(r=0.17)及“expression (r=0.16)”等。對出現(xiàn)頻率前100的詞條繪制術語云(圖4)。為了方便展示,在術語云中將“meta-analysis”與“systematic review”分別簡化為“meta”與“sysrev”。術語云中詞條的字體大小與其出現(xiàn)頻率成正比。對出現(xiàn)頻率前100的詞條進行分層聚類分析并繪制樹狀圖(圖5)。綜合圖4與圖5的內容,讀者能夠對該領域的熱點研究主題分布有快速和初步的認識。
表6 被引數(shù)排名前五的參考文獻的基本信息
圖3 發(fā)文量不低于10篇的作者的合著網(wǎng)絡及聚類圖
圖4 納入文獻標題中出現(xiàn)頻率前100詞條的術語云
預后指標在醫(yī)學研究及臨床實踐中都具有重要意義,預后相關的系統(tǒng)評價/Meta分析對預后方面的研究資料進行評價、匯總以形成能用于指導臨床實踐的高質量證據(jù)。在本系列的前幾篇文章中,介紹了預后相關二次研究的基本概念[2]以及生存曲線合并[33]與時間-事件IPD重構[34]等基礎方法學內容。本文首次以預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析為主題進行了文獻計量學分析,并進行了文本挖掘與相關可視化展示。
根據(jù)本研究的分析結果,預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析的發(fā)文數(shù)量在過去10年間呈上升趨勢,其增長情況與全部系統(tǒng)評價/Meta分析的增長情況基本一致,其在全部系統(tǒng)評價/Meta分析中所占的比例在過去兩年有較為顯著的上升。我國學者發(fā)表的預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析的發(fā)文量位居各國榜首,占比近1/3。排名前十的其他國家則全部為歐美國家。發(fā)文量排名前十的研究機構中超過半數(shù)的機構來自我國??梢娢覈鴮W者在該領域的研究發(fā)表數(shù)量上具有較大的優(yōu)勢。就期刊分布而言,我們可以明顯地看出,預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析文獻集中發(fā)表于少數(shù)特定雜志的現(xiàn)象非常明顯。其中我國期刊《中國循證醫(yī)學雜志》發(fā)文量近百篇,僅次于《PLoS ONE》位居第二。就單個學者發(fā)文量而言,我國學者楊克虎教授位居榜首。
文獻的被引情況是反映其學術影響力最為直接和重要的指標。通過對比我們可以發(fā)現(xiàn),我國學者發(fā)表文獻的篇均被引次數(shù)及有被引記錄文獻的年均被引次數(shù)均值均明顯低于所有預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析的相關指標,可見我國在該領域雖然研究發(fā)表數(shù)量大但研究成果的影響力較小。
的分析結果提示在該領域最有影響力的文獻為Meta分析方法學經典文獻以及介紹如何提取生存資料用于Meta分析的方法學文獻。
發(fā)文量10篇及以上學者所構成的合著網(wǎng)絡提示中國不同的研究團隊之間存在著緊密的合作關系,而國外的不同團隊間聯(lián)系很少;中國學者與國外學者之間的聯(lián)系也非常少。我們推測造成這一現(xiàn)象的原因在于,系統(tǒng)評價/Meta分析引入我國的時間相對較晚,率先掌握了系統(tǒng)評價/Meta分析理念與方法學的循證醫(yī)學專家是開展系統(tǒng)評價/Meta分析的主力軍,這部分人具有相似的學術背景,雖然就職于不同的研究機構但其相互之間的聯(lián)系卻是十分緊密的;而歐美國家的情況與我國存在較大差異,循證醫(yī)學在歐美已經有了數(shù)十年的發(fā)展,其理念與方法學已經十分普及,不同學術背景的研究者與研究機構均有能力獨立完成系統(tǒng)評價/Meta分析研究。
圖5 出現(xiàn)頻率前100的詞條的分層聚類樹狀圖
標題信息文本挖掘的結果顯示,該領域內最熱門的研究方向為惡性腫瘤,其中肺癌(尤其是非小細胞肺癌)、乳腺癌、晚期癌癥、結直腸癌、胃癌及化療等主題最受關注。發(fā)文量前十的期刊中半數(shù)是腫瘤學專業(yè)期刊以及高被引文獻中有許多腫瘤學相關文獻[8,10,14,16,21]也從側面印證了這一發(fā)現(xiàn)。
綜上所述,預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析是系統(tǒng)評價/Meta分析中具有一定地位的重要類型,其發(fā)文數(shù)量在過去十年呈持續(xù)上升趨勢。我國學者在該領域的文獻發(fā)表數(shù)量位居世界前列,但影響力相對欠缺,需要在今后的研究工作中提升研究質量,加強與國際一流研究機構之間的合作,力爭發(fā)表于國際一流期刊以增強學術影響。就研究主題而言,該領域內最熱門的研究方向為惡性腫瘤,這印證了預后分析在腫瘤學臨床研究中的重要地位。
參 考 文 獻
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本文編輯:姚雪莉
Bibliometric analysis on prognosis-related systematic reviews/Meta-analyses
MENG Xiang-yu*, FANG Cheng, LI Miao-zhu, TIAN Guo-xiang, ZENG Xian-tao.*Center for Evidence-Based and Translational Medicine,Zhongnan Hospital, Wuhan University, Wuhan 430071, China.
ZENG Xian-tao, E-mail: zengxiantao1128@163.com
Prognostic indices are of major importance and significance in medical research and clinical practice. Prognosis-related systematic reviews/Meta-analyses evaluate and summarize relevant study findings,generating high quality clinically applicable evidence. In order to examine the current scientific landscape of prognosis-related systematic reviews/Meta-analyses worldwide, we performed this bibliometric analysis with text mining and visualization. Relevant literature published during 2006-2015 was used as the source material, which was obtained by searching the Scopus database. The R software, tm package, ggplot2 package and VOSviewer were used as software tools.
Prognosis; Systematic reviews/Meta-analyses; Bibliometrics; Text mining; Visualization
· 循證理論與實踐 ·
R4
A
1674-4055(2016)04-0386-06
1430071 武漢,武漢大學中南醫(yī)院循證與轉化醫(yī)學中心;2430071 武漢,武漢大學循證與轉化醫(yī)學中心;3北卡羅來納州,美國杜克大學人群健康衰老研究中心;4100700 北京,北京軍區(qū)總醫(yī)院干四科
曾憲濤,E-mail:zengxiantao1128@163.com
10.3969/j.issn.1674-4055.2016.04.02
此外,檢索該數(shù)據(jù)庫收錄的同一時間段內發(fā)表的全部系統(tǒng)評價/Meta分析,檢索式為((TITLE(meta-analysis) OR (TITLE(systematic)AND TITLE(review)) AND DOCTYPE(ar OR re)AND SUBJAREA(BIOC OR IMMU OR NEUR ORPHAR OR PSYC OR MEDI OR NURS OR DENT OR HEAL) AND (PUBYEAR > 2005 AND PUBYEAR <2016),將其作為后續(xù)時間分布的參照。檢索日期為2016年1月31日。
1.2文獻計量學分析 對檢索獲取的預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析文獻數(shù)量與全部類型的系統(tǒng)評價/Meta分析文獻數(shù)量繪制時間分布圖。對預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析文獻的國家、機構與期刊分布進行描述。計算納入文獻的總被引次數(shù)及篇均被引次數(shù)。對高被引文獻計算年均被引次數(shù),即總被引數(shù)除以自發(fā)表以來經歷的年數(shù),將其作為評價文獻影響力的指標,并根據(jù)這一指標確定影響力排名前十的文獻。對納入文獻的參考文獻進行分析,找出被引量排名前五的參考文獻。對發(fā)表文獻不低于10篇的作者所構成的合著網(wǎng)絡進行可視化展示。合著關系的定義為某文獻的作者間兩兩互為合著關系。使用R軟件3.2.1[3]、tm程序包[4]、ggplot2程序包[5]與VOSviewer1.6.3軟件[6]進行文獻計量學分析與相關可視化展示。
1.3文本挖掘 以全部納入文獻的標題信息作為語料庫進行文本挖掘分析。對頻率較高的詞條繪制術語云,進行分層聚類分析并繪制樹狀圖[7]。所用軟件為R軟件3.2.1[3]、tm程序包[4]及ggplot2程序包[5]。
圖1發(fā)文量的時間分布圖
表1預后相關系統(tǒng)評價/Meta分析在全部系統(tǒng)評價/Meta分析中占比隨時間變化情況
年份百分比(%)20069.0 20079.8 20088.2 20099.2 20108.7 20119.2 20129.1 20139.3 201410.7 201510.9