基因芯片在痘病毒對(duì)宿主基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的應(yīng)用

陳達(dá)香，郝文波，陳　瑜，陳慧芹，羅樹紅

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基因芯片在痘病毒對(duì)宿主基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的應(yīng)用

陳達(dá)香，郝文波，陳瑜，陳慧芹，羅樹紅

痘病毒(Poxvirus)是病毒顆粒最大的一類 DNA 病毒，結(jié)構(gòu)復(fù)雜；感染人和動(dòng)物后常引起局部或全身化膿性皮膚損害，給畜牧業(yè)帶來(lái)嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失同時(shí)也威脅著人類健康。痘病毒可通過多種策略調(diào)控宿主基因的轉(zhuǎn)錄進(jìn)而影響其免疫應(yīng)答?；蛐酒ㄟ^對(duì)宿主細(xì)胞在病毒感染前后基因表達(dá)譜的檢測(cè)，為病毒的致病機(jī)制及病毒感染對(duì)宿主的調(diào)控機(jī)制的研究提供了便利手段。本文綜述了有關(guān)基因芯片在痘病毒研究中的應(yīng)用。

痘病毒；基因芯片；基因表達(dá)譜

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痘病毒呈磚形或橢圓形，大小(300～450)nm×(170～260)nm[1]；有核心、側(cè)體和包膜，核心含有與蛋白結(jié)合的線型雙鏈病毒DNA，其基因組長(zhǎng)約為140 kb，在細(xì)胞質(zhì)中復(fù)制。痘病毒脊索亞科中正痘病毒屬 (Orthopoxvirus)和副痘病毒屬(Parapoxvirus)為人類的重要病原體，其中正痘病毒屬中天花病毒、牛痘病毒、痘苗病毒及猴痘病毒可引起人類疾病[2-3]，副痘病毒屬的病毒主要感染家畜，羊口瘡病毒感染人的病例也經(jīng)常有報(bào)道[4-8]。

痘病毒憑借其龐大的基因組所表達(dá)的多種免疫調(diào)節(jié)蛋白，通過病毒隱形(virostealth)、病毒轉(zhuǎn)導(dǎo)(virotransduction)以及病毒模擬(viromimicry)等多種不同的策略影響免疫細(xì)胞進(jìn)而調(diào)控免疫系統(tǒng)[9]。痘苗病毒及其他種屬的痘病毒在抗腫瘤、抗感染性疾病治療中發(fā)揮不可忽視的作用，其相應(yīng)的病毒制劑處于臨床試驗(yàn)階段，甚至有些已經(jīng)進(jìn)入臨床應(yīng)用，然而我們對(duì)于病毒對(duì)宿主細(xì)胞的作用機(jī)制卻知之甚少。宿主細(xì)胞在病毒感染后往往是一個(gè)或幾個(gè)功能基因群共同發(fā)揮作用，表達(dá)譜芯片為宿主細(xì)胞在某一特定時(shí)間點(diǎn)所有基因表達(dá)水平的監(jiān)測(cè)提供了便利手段，使人們對(duì)與細(xì)胞在某個(gè)階段的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)或?qū)δ炒碳さ姆磻?yīng)通路的變化有了更深的了解。

1　基因芯片

基因芯片技術(shù)(gene chip technology)具有高通量、高集成、微型化和自動(dòng)化等特點(diǎn)。自1995年Schena等[10]首次在《Nature》上發(fā)表基因芯片研究的論文以來(lái)其被廣泛應(yīng)用于臨床檢測(cè)和基礎(chǔ)研究。該技術(shù)是建立在雜交技術(shù)上的一種高效、快速核酸序列分析手段。將大量的基因探針有序地、高密度地排列在一塊1～2 cm2大小的玻璃片或纖維膜等支持物上，形成可與目的基因相互作用的固相表面，然后與標(biāo)記的樣品進(jìn)行雜交，通過檢測(cè)雜交信號(hào)的強(qiáng)度及分布來(lái)進(jìn)行分析。在一塊1 cm2大小的基因芯片上按照需要可以固定成千上萬(wàn)個(gè)探針分子，用以實(shí)現(xiàn)對(duì)千萬(wàn)個(gè)基因的同步檢測(cè)。主要包括4個(gè)主要步驟：芯片制備、樣品制備、雜交反應(yīng)和信號(hào)檢測(cè)以及結(jié)果分析。

2　基因芯片在痘病毒研究中的應(yīng)用

2.1正痘病毒痘苗病毒(vaccinia virus，VACV)是第一個(gè)在世界上廣泛應(yīng)用的病毒疫苗，成功的根除了人類天花病毒，給人類帶來(lái)了福音。由于該病毒的安全性、哺乳動(dòng)物的廣泛感染性以及其載體能夠插入并表達(dá)較大的外源基因等特性，使其在溶瘤以及抗病毒研究中進(jìn)入高峰，臨床前期試驗(yàn)和臨床試驗(yàn)表明其具有很強(qiáng)且特異的免疫原性和安全性，并取得不錯(cuò)的療效[11-16]。減毒痘苗病毒(modified vaccinia virus Ankara, MVA)成為了多種病原體和腫瘤治療的重要載體，激活一些與腫瘤抑制、免疫刺激或藥物激活酶等相關(guān)基因，在多種疾病治療中發(fā)揮著不可忽略的作用。但是其在人體內(nèi)具體的作用機(jī)制還需要進(jìn)行深入研究。

Sandra Royo等[17]通過對(duì)減毒和未減毒的痘苗病毒株感染人巨噬細(xì)胞后宿主基因表達(dá)譜變化的研究發(fā)現(xiàn)MVA能有效的引發(fā)細(xì)胞凋亡和IFN-β的分泌，并且激活固有免疫。Jennifer Reinboth等[18]用減毒的痘苗病毒VACV GLV-1h68和3株野生型病毒株在感染黑色素瘤細(xì)胞后2、6、10、24和48 h對(duì)病毒基因和宿主基因表達(dá)譜進(jìn)行檢測(cè)，證明了病毒的復(fù)制、早期基因的表達(dá)和相應(yīng)的宿主反應(yīng)存在相關(guān)性，推測(cè)宿主組分可能參與病毒的早期復(fù)制。Daniel Bourquain等[19]檢測(cè)了猴痘、牛痘和痘苗病毒感染后6 h Hela細(xì)胞基因表達(dá)譜的變化，盡管這3種病毒有密切的親緣關(guān)系，感染后宿主細(xì)胞基因表達(dá)譜有相似之處, 但參與免疫調(diào)控的基因還是有顯著的病毒種屬特異性變化。最為明顯是在牛痘和猴痘病毒感染后介導(dǎo)參與白細(xì)胞遷移和活化的基因表達(dá)，但痘苗病毒卻不能。感染后宿主細(xì)胞水平發(fā)生的不同變化可能是特定宿主受到牛痘病毒、猴痘病毒或痘苗病毒感染后表現(xiàn)出不同的個(gè)體差異的原因。

NYVAC(New York vaccinia virus)也是一種減毒的痘苗病毒衍生物，其作為載體能夠表達(dá)廣泛物種來(lái)源的抗原。通過臨床前期試驗(yàn)和臨床試驗(yàn)對(duì)病毒與宿主的相互作用及免疫學(xué)研究，表明高度減毒的痘苗病毒是多種病原體和腫瘤治療的候選載體[20]。Susana Guerra等[21]使用基因芯片研究NYVAC在感染HeLa細(xì)胞后宿主細(xì)胞表達(dá)譜的變化，其中368個(gè)基因表達(dá)具有差異性，與免疫反應(yīng)有關(guān)的上調(diào)基因包括編碼白介素-1 受體2(IL-1R2)，ISG-15，CD-80和 TNFSF7。NYVAC上調(diào)幾個(gè)凋亡級(jí)聯(lián)中間體，例如細(xì)胞凋亡蛋白酶-9，因此推測(cè)其可能具備介導(dǎo)凋亡的能力。NYVAC感染也能介導(dǎo)NF-κB1、NF-κB2的表達(dá)，進(jìn)一步促進(jìn)NF-κB靶基因表達(dá)，在感染期間，若K1L基因表達(dá)能夠阻止NF-κB的激活。2007年，他們檢測(cè)了減毒痘苗病毒MVA和 NYVAC對(duì)人類未成熟的單個(gè)核來(lái)源的樹突細(xì)胞(immature monocyte-derived dendritic cells，IMDDC)感染后6 h的IMDDC基因表達(dá)譜的變化，2種病毒載體均能上調(diào)細(xì)胞因子、細(xì)胞因子受體、趨化因子、趨化因子受體和抗原提呈相關(guān)基因的表達(dá)[22]。較NYVAC感染樣本相比，MVA 感染樣本的IL-12β，TNF-α的mRNA水平更高。轉(zhuǎn)錄因子NF-κB/Rel 和 STAT在這2種病毒感染后的樣本的表達(dá)譜相似，然而OASL、MDA5和 IRIG-I只在MVA感染后的樣本中表達(dá)水平上升。同時(shí)在MVA感染后，I型IFN，IL-6和T細(xì)胞樣受體通路被激活。研究表明這2種病毒載體作為病毒疫苗都有一定的作用。Susana Guerra等[23]通過攜帶HIV病毒蛋白的痘苗病毒載體感染人IMDDC發(fā)現(xiàn)HIV病毒蛋白能介導(dǎo)宿主細(xì)胞因子，細(xì)胞因子受體，趨化因子，趨化因子受體和參與抗原提呈分子的表達(dá)。該研究首次探究了攜帶HIV病毒蛋白的牛痘載體對(duì)樹突細(xì)胞基因表達(dá)譜的變化，鑒定了一些調(diào)控基因的生物學(xué)作用，為以痘苗病毒為載體的HIV疫苗的后續(xù)研究奠定了基礎(chǔ)。Delaloye J等[24]通過基因芯片研究發(fā)現(xiàn)缺失I和(或) II型 IFN結(jié)合蛋白基因的攜帶HIV-1病毒蛋白的痘苗載體NYVAC-C-ΔB19R、NYVAC-C-ΔB8RB19R使得宿主細(xì)胞IFNs和干擾素刺激基因大量表達(dá)，很大程度的激活炎性復(fù)合物，IL-1β 和 促炎細(xì)胞因子基因上調(diào)。2種IFN結(jié)合蛋白都缺失時(shí)可以提高病毒載體的免疫原性，使NYVAC痘病毒成為更富吸引力的HIV疫苗的候選載體。

天花病毒的高致死率及高傳染性等特點(diǎn)，使它成為最危險(xiǎn)的生物劑之一。Kathleen H. Rubins等[25]使用芯片在天花病毒(variola strains,VV)感染食蟹猴后檢測(cè)不同的時(shí)間點(diǎn)其外周血單個(gè)核細(xì)胞的基因表達(dá)譜變化，發(fā)現(xiàn)天花病毒感染可以引起外周血基因表達(dá)模式發(fā)生改變，該變化顯著但比較短暫。對(duì)與IFN反應(yīng)、細(xì)胞增殖和免疫球蛋白相關(guān)的基因表達(dá)譜、病毒劑量依賴的基因表達(dá)譜以及天花病毒對(duì)細(xì)胞免疫反應(yīng)調(diào)控的研究，發(fā)現(xiàn)在天花病毒引起嚴(yán)重的全身性感染時(shí)TNF-α和NF-κB激活的相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平并沒有上升，可能是天花病毒基因產(chǎn)物作用而引起的。2008年，他們研制了針對(duì)牛痘病毒和猴痘病毒感染后病毒基因表達(dá)譜芯片，在感染人單個(gè)核細(xì)胞、原代人成纖維細(xì)胞和海拉細(xì)胞早期(感染后1～2 h)，參與DNA復(fù)制、RNA轉(zhuǎn)錄和調(diào)控宿主免疫因子的病毒基因的表達(dá)增加，在感染后4～8 h，這些基因表達(dá)水平可高達(dá)138倍。感染晚期(感染后4 h及以上)，編碼結(jié)構(gòu)蛋白和主要病毒組分的基因表達(dá)升高，并且早期轉(zhuǎn)錄因子被包裝入病毒顆粒中。這2種病毒的基因表達(dá)譜基本相似，一半的基因在早期表達(dá)，另一半在晚期表達(dá)，早期表達(dá)基因在晚期的表達(dá)水平穩(wěn)定，在感染后24 h病毒基因基本上都表達(dá)，能檢測(cè)到。發(fā)現(xiàn)這2種病毒基因在感染后的表達(dá)反應(yīng)具有獨(dú)特的暫時(shí)調(diào)控和種屬特異性基因表達(dá)的特征，為天花病毒感染期間總基因表達(dá)譜變化提供了參考[26]。該研究為天花病毒的診斷、治療和預(yù)防提供了新的思路。

Lianghua Bin等[27]通過基因芯片研究發(fā)現(xiàn)抑制S100A11的表達(dá)使IFN-γ受體和IL-10R2表達(dá)下調(diào)從而消弱了角質(zhì)細(xì)胞對(duì)牛痘病毒復(fù)制的控制。Eric Bartee等[28]發(fā)現(xiàn)通過檢測(cè)痘病毒感染的人成纖維細(xì)胞表達(dá)譜的變化發(fā)現(xiàn)TNF和IFN-β能夠介導(dǎo)一種新的協(xié)同抗病毒效應(yīng)。Messaoudi等[29]通過不同程度飲酒后恒河猴對(duì)MVA反應(yīng)的研究，發(fā)現(xiàn)適度飲酒有利于疫苗效應(yīng)的發(fā)揮，過度飲酒則起抑制作用。

2.2副痘病毒經(jīng)滅活的羊口瘡病毒預(yù)處理的豬、轉(zhuǎn)基因小鼠和大鼠模型分別具備抗生殖器皰疹病毒、HBV和單純皰疹病毒的效應(yīng)[30], Astrid Friebe等[31]進(jìn)一步驗(yàn)證了具備抗病毒效應(yīng)的ORFV的活性組分很可能是病毒蛋白，經(jīng)含648個(gè)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、凋亡、免疫反應(yīng)、腫瘤、細(xì)胞與細(xì)胞及細(xì)胞與基質(zhì)粘附素相關(guān)基因cDNA芯片檢測(cè)ORFV及其具有抗病毒活性的重組病毒(VACV/ORFV)介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)的變化，研究發(fā)現(xiàn)ORFV及其具有抗病毒活性的重組病毒所介導(dǎo)的基因表達(dá)譜相似，但是在相應(yīng)的cDNA的表達(dá)量上存在差異。信號(hào)通路分析顯示ORFV的多個(gè)蛋白能夠激活相似的細(xì)胞信號(hào)通路，調(diào)控抗原提呈細(xì)胞，產(chǎn)生很強(qiáng)的以Th1細(xì)胞為主的免疫反應(yīng)，同時(shí)其介導(dǎo)的免疫抑制機(jī)制平衡其免疫反應(yīng)。因此ORFV可能成為抗病毒治療的潛在制劑。

D.G.Diel等[32]利用表達(dá)譜芯片研究ORFV024蛋白在病毒感染期間發(fā)揮的潛在功能，OV-IA82 024和OV-IA82野生株感染羊鼻甲原代細(xì)胞后2 h和4 h后檢測(cè)宿主細(xì)胞基因表達(dá)譜的變化，發(fā)現(xiàn)OV-IA82 024感染后宿主細(xì)胞的一些趨化因子及促炎因子基因表達(dá)水平上升，這些基因多數(shù)都是NF-κB家族的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的靶基因，如CCL20, CXCL1,CXCL2, IL-6, IL-8, NFκBIA 和 PTGS2。進(jìn)一步研究驗(yàn)證了ORFV024是NF-κB信號(hào)通路又一調(diào)節(jié)抑制劑，基因芯片為該新發(fā)現(xiàn)奠定了重要基礎(chǔ)。

2.3其他Kristy Offerman等[33]研究了結(jié)節(jié)性皮膚病病毒(Lumpy Skin Disease virus,LSDV), 金絲雀痘病毒(Canarypox virus,CNPV), 雞痘病毒(Fowlpox virus,FWPV), MVA和兩種新型南非禽痘病毒(鴿痘病毒(Feral Pigeonpox virus,FeP2) 與企鵝痘病毒(Penguinpox virus,PEPV))注入小鼠靜脈后24 h脾臟細(xì)胞基因表達(dá)譜變化，這6種病毒介導(dǎo)了不同的宿主反應(yīng)，其中LSDV介導(dǎo)的IFN反應(yīng)最強(qiáng)。與其他4種病毒相比，F(xiàn)eP2和PEPV所介導(dǎo)的宿主轉(zhuǎn)錄組變化最小。CNPV和FWPV 介導(dǎo)2個(gè)免疫球蛋白基因Ighg和Ighg3(IgG3)上調(diào)，并且CNPV還介導(dǎo)Ighm (IgM)的表達(dá)。144例臨床試驗(yàn)[34]表明HIV-1特異性 IgG3 抗體與HIV-1感染呈負(fù)相關(guān)。因此，這2種禽痘病毒可能成為臨床上刺激IgG3抗體產(chǎn)生的工具?；蛐酒诙徊《狙芯恐械膽?yīng)用總結(jié)如表1。

3　基因芯片的優(yōu)勢(shì)與不足

快速、穩(wěn)定、高效是基因芯片突出的優(yōu)勢(shì)，但是也存在很多不足之處。只要標(biāo)記的樣品結(jié)合到探針陣列上后就會(huì)發(fā)出陽(yáng)性信號(hào)，這種結(jié)合是否為正常配對(duì)或正常配對(duì)與錯(cuò)配兼而有之，該方法本身不能提供足夠的信息進(jìn)行分辨。該方法只能檢測(cè)已知序列的基因，對(duì)于發(fā)生突變的序列及新基因不能準(zhǔn)確辨認(rèn)。隨著測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，高通量測(cè)序越來(lái)越普遍，它可以彌補(bǔ)基因芯片的不足，但是也存在自身的問題。這兩項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)與不足見表2。

表1基因芯片在痘病毒研究中新發(fā)現(xiàn)

Tab.1The latest studies on poxvirus using gene microarray

屬Genus種Species劑量Dose宿主細(xì)胞Hostcells動(dòng)物模型Animalmodels新發(fā)現(xiàn)Thelateststudies參考文獻(xiàn)References正痘病毒屬Orthpoxvirus痘苗病毒株(MVA、ANK,、WR、NYBH、NYVAC或CopV)VACAstrains(MVA,ANK,WR,NYBH,NYVACorCopV)0.1PFU/細(xì)胞0.1PFU/cell人巨噬細(xì)胞Humanmacrophages—MVA能有效的引發(fā)細(xì)胞凋亡和IFN-β的分泌,并且激活固有免疫M(jìn)VAinducedapoptosisandthereleaseofIFN-βaswellasactivatedtheinnateimmunity[17]痘苗病毒VACV0.01PFU/細(xì)胞0.01PFU/cell人黑色素瘤細(xì)胞Humanmelanomacells—宿主組分可能參與病毒的早期復(fù)制Somehostcomponentsmayin-volveinviralearlyreplication[18]牛痘病毒、猴痘病毒和痘苗病毒Cowpoxvirus,mon-keypoxvirusorVACV5PFU/細(xì)胞5PFU/cell海拉細(xì)胞Helacells—牛痘和猴痘病毒感染后介導(dǎo)參與白細(xì)胞遷移和活化的基因表達(dá)Aninductionofgenesinvolvedinleukocytemigrationandac-tivationincowpoxandmon-keypoxvirus-infectedcells[19]痘苗病毒株(NY-VAC)VACAstains(NY-VAC)5PFU/細(xì)胞5PFU/cell海拉細(xì)胞HeLacells—NYVAC感染后促進(jìn)凋亡基因和NF-κB-反應(yīng)性基因的表達(dá)NYVACinfectionstimulatedtheexpressionofapoptoticgenesandNF-κBtargetgenes[21]痘苗病毒株(MVA和NYVAC)VACAstains(MVAandNYVAC)5PFU/細(xì)胞5PFU/cell人未成熟單個(gè)核來(lái)源的樹突細(xì)胞IMDDC—兩種病毒均能促進(jìn)免疫功能相關(guān)基因表達(dá),可成為潛在疫苗載體Bothviruscanpromotetheex-pressionofimmune-relatedgenesandarepromisingpoten-tialrecombinantvaccines[22]痘苗病毒株(MVA和MVA-B)VACAstains(MVAandMVA-B)10PFU/細(xì)胞10PFU/cell人未成熟單個(gè)核來(lái)源的樹突細(xì)胞IMDDC—MVA-B具備成為HIV/AID疫苗的潛質(zhì)MVA-BcanbeacandidatevaccineagainstHIV/AIDS[23]痘苗載體(NYVAC-C-ΔB19R和NYVAC-C-ΔB8RB19R)vaccinevector(NY-VAC-C-ΔB19RandNYVAC-C-ΔB8RB19R)5PFU/細(xì)胞5PFU/cell人單個(gè)核細(xì)胞或THP-1HumanmonocytesorTHP-1—IL-1和I型IFN能夠提高缺失了I和II型IFN結(jié)合蛋白的痘苗載體IINYVAC-C-ΔB8RB19R免疫原性IL-1andtypeIIFNenhancedtheimmunogenicityoftheIINYVAC-C-ΔB8RB19vaccinevectorwithdualdeletionsoftypeIandtypeIIinterferon-bindingproteins[24]表1(續(xù))屬Genus種Species劑量Dose宿主細(xì)胞Hostcells動(dòng)物模型Animalmodels新發(fā)現(xiàn)Thelateststudies參考文獻(xiàn)References

表2基因芯片與二代測(cè)序的優(yōu)劣勢(shì)

Tab.2The advantages and disadvantages between microarray and the next generation sequencing

種類Category優(yōu)勢(shì)Advantages不足Disadvantages芯片Microarray技術(shù)成熟Maturetechnology“封閉系統(tǒng)”:只能檢測(cè)已知序列(或有限的變異)"Closedsystem":onlydetectknownse-quencesorlimitedvariation積累了龐大的公共數(shù)據(jù)庫(kù)Accumulationofenormouscommondata-base短序列及高度同源序列檢測(cè)存在技術(shù)上的困難Technologicaldifficultlytodetectshortsequenceandhighlyhomologousse-quences分析軟件相對(duì)成熟,便于分析Relativelymaturesoftwareforanalysis假陽(yáng)性率高Highfalsepositiverate穩(wěn)定性好Goodstability線性范圍較小narrowlinearrange高通量,耗時(shí)少Highthroughputandsavetime單樣本成本相對(duì)較低Relativelowcostforsinglesample測(cè)序Sequencing"開放系統(tǒng)":發(fā)現(xiàn)和尋找新信息的能力強(qiáng)"Opensystem":powerfulabilitytodiscoverandexplorenewinformation生物信息學(xué)分析難度較大,需要專業(yè)技術(shù)人員進(jìn)行Withgreatdifficultyinthebioinforma-ticsanalysisandneedprofessionalstaff準(zhǔn)確性和靈敏度高Highaccuracyandsensitivity分析軟件不成熟,下游分析軟件匱乏Immatureanalysissoftwareandlackdownstreamsupportingsoftware獲得信息量更大Largeamountsofoutput費(fèi)時(shí)費(fèi)力Wastetimeandenergy單堿基成本低Lowcostofsinglebase操作復(fù)雜Complexoperations線性范圍更大Greaterlinearrange

4　展　望

到目前為止，基因芯片仍然是研究病毒引起宿主基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的重要手段之一。利用基因芯片，從分子水平上了解疾病的發(fā)生發(fā)展，能夠使研究人員在短時(shí)間內(nèi)發(fā)現(xiàn)疾病的發(fā)生機(jī)制，為臨床疾病診斷、新藥的篩選、臨床用藥提供指導(dǎo)。隨著高通量測(cè)序的不斷發(fā)展，其優(yōu)勢(shì)不斷凸顯，研究者根據(jù)研究目的選擇合適的研究手段，盡可能利用二者的優(yōu)勢(shì)，使其最大程度地為人類研究提供便利。

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Application of gene microarray on host cell gene transcription regulated by poxvirus

CHEN Da-xiang, HAO Wen-bo, CHEN Yü, CHEN Hui-qin, LUO Shu-hong

(InstituteofAntibodyEngineering,CollegeofBiotechnology,SouthernMedicalUniversity,Guangzhou510515,China)

Poxvirus is the largest DNA virus, containing complicated structure. It can cause local or systemic purulent damage to skin after infection of humans or animals. Furthermore, it brings about serious economic loss to livestock and threatens human health. Poxvirus could regulate and controlle host cell gene transcription by a variety of strategies, which in turn affect the host immune response. Gene microarray provides a convenient mean for studying the pathogenic mechanism of virus and regulatory mechanism of the host by detection of the host cell gene expression profile before or after the poxvirus infection. This paper reviews the related application of gene microarray on the poxvirus research.

poxvirus; gene microarray; gene expression profile

Luo Shu-hong, Email: sluo815@gmail.com

羅樹紅，Email:sluo815@gmail.com

南方醫(yī)科大學(xué)生物技術(shù)學(xué)院抗體工程研究所，廣州510515

R373.1

A

1002-2694(2016)06-0569-07

2015-12-03；

2016-04-03

DOI：10.3969/j.issn.1002-2694.2016.06.012

國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31170147)資助