袁明美,姜 泓,馮雪松*
(1.中國醫(yī)科大學(xué) 藥學(xué)院,遼寧 沈陽 110122; 2.中國醫(yī)科大學(xué) 公共衛(wèi)生學(xué)院,遼寧 沈陽 110122)
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瓊脂糖珠富集β-actin蛋白實驗條件的優(yōu)化
袁明美1,姜泓2,馮雪松1*
(1.中國醫(yī)科大學(xué) 藥學(xué)院,遼寧 沈陽 110122;2.中國醫(yī)科大學(xué) 公共衛(wèi)生學(xué)院,遼寧 沈陽 110122)
摘要:研究不同反應(yīng)條件(樣品初始濃度、溫度、時間)下,protein A+G agarose對小鼠腦組織中β-actin蛋白富集的影響.結(jié)果在樣品初始濃度為0.5 g/L,4 ℃條件下偶聯(lián)反應(yīng)2 h,Protein A+G agarose對小鼠腦組織中β-actin蛋白的富集效果最好、并且穩(wěn)定性與重現(xiàn)性良好.
關(guān)鍵詞:瓊脂糖珠;β-actin蛋白;條件優(yōu)化;蛋白富集
蛋白質(zhì)是生命形態(tài)中最重要的分子,對其結(jié)構(gòu)、功能及含量進行研究時,常需將目的蛋白從組織或細胞等復(fù)雜生物體系中分離、純化出來[1].瓊脂糖珠作為載體介質(zhì)在蛋白質(zhì)的純化過程中起著重要的作用,其原理是以免疫沉淀(IP)技術(shù)的抗體與抗原間的特異性結(jié)合為基礎(chǔ)[2],將“靶蛋白-抗靶蛋白抗體-protein A或/和G agarose”的復(fù)合物從混合生物體系中沉淀、分離出來[3-4],經(jīng)變性后,通過與聚丙烯酰胺凝膠電泳等技術(shù)結(jié)合,對靶蛋白的分子量等特性進行定性或定量研究[5].但是“靶蛋白-抗靶蛋白抗體”與agarose偶聯(lián)的過程受到多種因素的影響,如樣品初始濃度、偶聯(lián)溫度和時間等[6].本研究以protein A+G agarose對小鼠腦勻漿液中β-actin的富集為例,初步探討樣品初始濃度、偶聯(lián)溫度及時間對protein A+G agarose與“β-actin抗原-抗體結(jié)合物”偶聯(lián)過程的影響.對于開發(fā)基于瓊脂糖珠的免疫沉淀技術(shù)用于蛋白檢測、純化以及蛋白-蛋白相互作用等研究有一定的參考價值和指導(dǎo)意義.
1實驗部分
1.1儀器與試劑
全自動化學(xué)發(fā)光圖像分析系統(tǒng)(上海天能科技有限公司);全波長掃描酶標儀(Bio Tek儀器公司);電泳儀(上海天能科技有限公司);四維旋轉(zhuǎn)混勻器(海門市其林貝爾儀器有限公司);超級恒溫混勻儀(杭州奧盛儀器有限公司);超聲波細胞粉碎機(寧波新芝生物科技股份有限公司);XW-80A旋渦混合器(上海精科實業(yè)有限公司);3K-18超速冷凍離心機(Sigma公司);干式恒溫器(杭州奧盛儀器有限公司);protein A+G agarose珠(日本Beyotime公司);鼠抗β-actin單克隆抗體(Proteintech公司);BCA蛋白定量測定試劑盒、細胞裂解液RIPA、胰蛋白酶抑制劑PMSF、辣根過氧化物酶標記山羊抗小鼠IgG均購自北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限公司;ECL化學(xué)發(fā)光檢測試劑盒(Buckinghamsire公司);其他試劑均為市售優(yōu)級純或分析純試劑.
1.2總蛋白樣品的制備
精密稱取小鼠腦組織適量,每100 mg腦組織中加入1 mL RIPA和PMSF的混合液(100∶1,體積比),冰浴下超聲勻漿6 min,然后冰浴下裂解2 h,4 ℃離心(12 000 r·min-1)20 min,吸取上清液,備用.
1.3腦組織中β-actin的提取及純化
取“1.2”項下濃度為0.5 g/L的上清液1 mL,加入10 μL濃度為1 g/L的β-actin抗體,4 ℃下?lián)u動(750 r·min-1)30 min,使之充分偶聯(lián)結(jié)合,加入protein A+G agarose 100 μL,4 ℃下?lián)u動(750 r·min-1)2 h,然后離心(2 500 r·min-1)5 min,分別得到上清液和“β-actin-抗β-actin抗體-protein A+G agarose”偶聯(lián)復(fù)合物,備用.
1.4β-actin蛋白的洗脫
取“1.3”項下的偶聯(lián)復(fù)合物,加入1 mL結(jié)合洗滌液,混勻,離心(2 500 r·min-1)5 min,棄去上層清液,重復(fù)3次.然后加入100 μL 1×SDS蛋白電泳上樣緩沖液,重懸偶聯(lián)復(fù)合物,100 ℃加熱5 min,放置室溫,離心(2 500 r·min-1)5 min,取上清液,備用.
1.5不同提純條件對β-actin蛋白提取量的影響
1.5.1樣品初始濃度的影響
將“1.2”項下的樣品溶液稀釋成濃度為0.1、0.2、0.5、1和2 g/L的樣品溶液,平行做2份,按“1.3”和“1.4”項下方法操作.
1.5.2溫度的影響
取“1.2”項下濃度為0.5 g/L的樣品溶液,在4 ℃和25 ℃條件下,按“1.3”和“1.4”項下方法操作.
1.5.3吸附時間的影響
取“1.2”項下濃度為0.5 g/L的樣品溶液,protein A+G agarose與“β-actin-抗β-actin抗體”分別結(jié)合0.5 、1 、2 、4 和12 h.再按“1.3”和1.4“項下方法操作.
1.6β-actin含量測定
1.6.1Western blot測定β-actin的含量
取1.5項下上清液10 μL,進行SDS-PAGE電泳,轉(zhuǎn)印至PVDF膜,5%脫脂奶粉室溫封閉2 h,4 ℃過夜孵育一抗β-actin抗體(1∶8 000).洗膜后,加入辣根過氧化物酶標記的羊抗鼠IgG(1∶5 000),室溫輕搖2 h,充分洗膜后,化學(xué)發(fā)光,膠片曝光顯影,掃描灰度值[7].
1.6.2BCA法測定β-actin的含量
采用BCA試劑盒,按照試劑盒的方法測定protein A+G agarose吸附前后腦組織勻漿液中蛋白含量.protein A+G agarose吸附β-actin的量按下式計算[8]:
式中:Q:protein A+G agarose吸附量(g/g);m為protein A+G agarose的質(zhì)量(mg);C0、C1分別為吸附前和吸附后蛋白濃度(g/L);V0、V1分別為吸附前和吸附后的體積(mL).
2結(jié)果與討論
2.1樣品初始濃度對β-actin蛋白提取量的影響
圖1為樣品初始濃度對β-actin蛋白提取量的影響.圖1(a)和(b)為western blot的實驗結(jié)果,由圖1(b)可見,Western blot檢測β-actin蛋白灰度值分析結(jié)果表明,當濃度小于0.5 g/L時,β-actin吸附量隨樣品濃度的增加而增多,變化趨勢比較明顯;當濃度大于0.5 g/L時,隨濃度增加而增多的趨勢漸趨平緩,說明protein A+G agarose偶聯(lián)β-actin蛋白的量達到飽和,這可能與protein A+G agarose比表面積的限制有關(guān).同時,通過圖1(a)Western blot條帶的深淺也可直觀的證明這一點.圖1(c)為BCA法檢測β-actin蛋白含量的結(jié)果,變化趨勢與Western blot含量測定結(jié)果一致.結(jié)果表明在樣品濃度達到0.5 g/L時,protein A+G agarose偶聯(lián)β-actin蛋白的量達到飽和.
2.2偶聯(lián)溫度對β-actin蛋白提取量的影響
圖2是偶聯(lián)溫度對protein A+G agarose偶聯(lián)β-actin蛋白量的影響.圖2(a)和(b)為western blot的實驗結(jié)果,由圖2(b)可知,在4 ℃條件下,protein A+G agarose提取得到的β-actin蛋白的灰度值比25 ℃時高,并且圖2(a)的Western blot條帶的深淺也可直觀的證明這一點.圖2(c)為BCA法檢測β-actin蛋白含量的結(jié)果,變化趨勢與Western blot含量測定結(jié)果一致.結(jié)果表明,4 ℃條件下,有益于protein A+G agarose提取到更多的β-actin蛋白.
此外,我們的實驗還考察了在37 ℃條件下,protein A+G agarose對β-actin蛋白的提取情況(結(jié)果未列入本文),結(jié)果發(fā)現(xiàn)隨溫度升高,protein A+G agarose對β-actin蛋白的提取量逐漸降低,以4 ℃條件下提取效果最好.其主要原因與生物樣品中存在著能降解蛋白質(zhì)的酶有關(guān).在溫度較高時,酶的活性不易被酶抑制劑所抑制,進而導(dǎo)致蛋白降解,出現(xiàn)偶聯(lián)蛋白量減少的情況.在較高溫度下,即使分子的布朗運動增加,加大了protein A+G agarose與β-actin蛋白碰撞的機會而增加吸附偶聯(lián)量,也無法抵消整體蛋白量降低所導(dǎo)致的吸附偶聯(lián)量降低.4 ℃反應(yīng)條件下,酶的活性可以較好的被抑制,同時四維旋轉(zhuǎn)混懸(750 rpm/min)孵育并不會降低protein A+G agarose與β-actin蛋白接觸的機會,結(jié)果表明有較好的吸附偶聯(lián)效果.
(a)western blot圖片
(b)western blot灰度值
(c)BCA法測定的蛋白量圖1 樣品初始濃度對β-actin蛋白提取量的影響Fig.1 Effect of the initial sample concentration on the amount of β-actin protein extraction
2.3偶聯(lián)時間對β-actin蛋白提取量的影響
圖3是偶聯(lián)時間對protein A+G agarose偶聯(lián)吸附β-actin蛋白量的影響.圖3(a)和(b)為western blot的實驗結(jié)果,結(jié)果表明,protein A+G agarose與β-actin蛋白在4 ℃條件下反應(yīng)2 h,提取β-actin蛋白的量達到峰值,但隨著時間延長提取量逐漸降低.并且圖3(a)的Western blot條帶的深淺也可直觀的證明這一點.圖3(c)為BCA法檢測β-actin蛋白含量的結(jié)果,變化趨勢與Western blot含量測定結(jié)果一致.其主要原因是,agarose是細菌蛋白質(zhì)的“protein A/G”的載體,而且尺寸很小,其對蛋白的吸附偶聯(lián)主要發(fā)生在外表面,利用“protein A/G”特異性地結(jié)合到抗體(免疫球蛋白)的Fc片段,不存在內(nèi)擴散現(xiàn)象,故不存在太大的時間依賴性.相反,時間越長生物樣品中蛋白降解越嚴重,從而使吸附偶聯(lián)效率降低.
(a)western blot圖片
(b)western blot灰度值
(c)BCA法測定的蛋白量圖2 反應(yīng)溫度對吸附總蛋白量和β-actin蛋白的影響Fig.2 Effect of reaction temperature on the amount of β-actin protein extraction
2.4重復(fù)驗證實驗結(jié)果
在優(yōu)化的樣品初始濃度、偶聯(lián)溫度和時間下,使用初始濃度為0.5 g/L的樣品,protein A+G agarose與“β-actin-抗β-actin抗體”復(fù)合物在4 ℃條件下偶聯(lián)反應(yīng)2 h,平行做3份樣品.由表1可知,灰度值與蛋白含量結(jié)果的RSD≤ 8.08%.說明在優(yōu)化的條件下,可以保證使用protein A+G agarose富集β-actin蛋白具有良好的穩(wěn)定性和重現(xiàn)性.
(a)western blot圖片
(b)western blot灰度值
(c)BCA法測定的蛋白量圖3 反應(yīng)時間對吸附總蛋白量和β-actin蛋白的影響Fig.3 Effect of reaction time on the amount of β-actin protein extraction
123均值RSD/%灰度值529.726516.531574.788540.3485.65蛋白量(g/L)2.4832.1622.5072.3848.08
3結(jié)論
在4 ℃反應(yīng)2 h條件下,瓊脂糖珠對蛋白有較好的富集作用,建立的protein A+G agarose富集β-actin蛋白的方法具有良好的穩(wěn)定性和重現(xiàn)性.
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[責(zé)任編輯:任鐵鋼]
收稿日期:2015-12-15.
基金項目:國家自然科學(xué)基金項目(81473417).
作者簡介:袁明美(1991-),女,碩士生,主要從事化學(xué)生物分析及作用機制研究.*通訊聯(lián)系人,Email:voncedar@126.com.
中圖分類號:R286.02
文獻標志碼:A
文章編號:1008-1011(2016)03-0345-04
Optimization of experimental conditions on agarose beads enrichingβ-actin protein
YUAN Mingmei1,JIANG Hong2,F(xiàn)ENG Xuesong1*
(1.Collegeofpharmacy,ChinaMedicalUniversity,Shenyang110122,Liaoning,China;2.CollegeofPublicHealth,ChinaMedicalUniversity,Shenyang110122,Liaoning,China)
Abstract:The effects of different reaction conditions (initial sample concentration, temperature and time) on the amount of mice brain β-actin enriched by protein A + G agarose were studied. Results showed that 0.5 mg/mL of the initial concentration, and reaction of 2 h at 4 ℃ were the optimal experimental conditions. Protein A + G agarose could enrich the most β-actin in mice brain.The methods showed good stability and reproducibility.
Keywords:agarose beads;β-actin protein;optimization conditions;protein enrichment