□ 王志越 呂秋艷 褚添 宋景紅 劉海濤 莊國(guó)良 曹殿起 付慧英 北京市門(mén)頭溝區(qū)疾病預(yù)防控制中心
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門(mén)頭溝區(qū)腹瀉病例來(lái)源副溶血性弧菌和沙門(mén)氏菌主動(dòng)監(jiān)測(cè)、溯源和分子分型研究
□ 王志越 呂秋艷 褚添 宋景紅 劉海濤 莊國(guó)良 曹殿起 付慧英 北京市門(mén)頭溝區(qū)疾病預(yù)防控制中心
摘 要:依托北京市食源性疾病主動(dòng)監(jiān)測(cè)體系,開(kāi)展了解北京市門(mén)頭溝區(qū)食源性疾病腹瀉病例來(lái)源的副溶血性弧菌、沙門(mén)氏菌分子特征和血清學(xué)分型。2014年4月~2015年3月,對(duì)北京門(mén)頭溝區(qū)食源性疾病監(jiān)測(cè)分離到的副溶血弧菌和沙門(mén)氏菌進(jìn)行PFEG分子分型和圖譜分析。11株副溶血弧菌經(jīng)PFEG分型后,得到10個(gè)不同的帶型,帶型間相似度在0%~84.6%之間;21株沙門(mén)氏菌獲得16種帶型,帶型間相似度在20.8%~88.9%之間菌株,部分菌株具有高度同源性,但總體遺傳特證多樣。門(mén)頭溝區(qū)食源性疾病病例的部分副溶血弧菌和沙門(mén)氏菌的分子分型具有一定的相似度,菌株分子特征呈現(xiàn)遺傳多樣性,說(shuō)明建立門(mén)頭溝區(qū)食源性疾病病原菌分子分型圖譜庫(kù),對(duì)于食物中毒快速檢測(cè)、診斷及溯源具有重大意義。
關(guān)鍵詞:食源性疾病 腹瀉 副溶血弧菌 沙門(mén)氏菌 分子分型
食源性疾病作為全球主要的公共衛(wèi)生問(wèn)題之一,其危害程度和導(dǎo)致的損失呈現(xiàn)逐年遞增的趨勢(shì),食品中侵染的致病生物因子是食源性疾病暴發(fā)的主要病原和誘因。我國(guó)食源性疾病的發(fā)生往往是由細(xì)菌性微生物引起,傷寒沙門(mén)氏菌(Salmonella typhosa)、副溶血性弧菌(Vibrio parahemolyticus)和志賀氏菌(Shigella spp)是主要的3類(lèi)食源性致病菌[1]。副溶血弧菌(Vi. parahemolyticus)作為一種嗜鹽性弧菌,已成為我國(guó)最主要的食源性水產(chǎn)品致病菌[2],也是近20年來(lái)我國(guó)食源性疾病暴發(fā)的最常見(jiàn)的病原菌[3]。同時(shí),沙門(mén)氏菌病也是世界范圍主要的的食源性疾病之一,主要是攝入沙門(mén)氏菌污染的肉、蛋、奶等動(dòng)物源性食品而導(dǎo)致食源性疾病的暴發(fā),患者多表現(xiàn)為腹瀉、發(fā)熱、腹痛或痙孿、嘔吐、頭痛和惡心等典型癥狀[4]。副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌頻繁導(dǎo)致食源性疾病的暴發(fā),凸顯了食源性疾病來(lái)源的副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌的主動(dòng)監(jiān)測(cè)以及分子分型和溯源防控的重要性。
食源性致病菌分子溯源通過(guò)對(duì)病人中食源性致病菌分離株進(jìn)行分子分型和比對(duì)分析,開(kāi)展分布調(diào)查和追蹤溯源,能夠早期發(fā)現(xiàn)和識(shí)別聚集性病例和暴發(fā)線索,對(duì)于食源性致病菌監(jiān)測(cè),傳染源追蹤、傳播途徑調(diào)查和識(shí)別等暴發(fā)調(diào)查以及防控措施制定實(shí)施有著非常重要的意義。本文針對(duì)門(mén)頭溝區(qū)食源性疾病主動(dòng)監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院診斷病例為監(jiān)測(cè)對(duì)象,采集符合食源性疾病病例病人的大便樣本,進(jìn)行副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌的監(jiān)測(cè)和分子分型溯源,對(duì)于全面了解門(mén)頭溝區(qū)副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌的分子流行病學(xué)特點(diǎn),及時(shí)識(shí)別聚集性病例和暴發(fā)線索,制定合理的控制預(yù)防措施,提供科學(xué)依據(jù)。
1.1菌株來(lái)源
1.1.1監(jiān)測(cè)點(diǎn)設(shè)置
選取北京市門(mén)頭溝區(qū)醫(yī)院、京煤集團(tuán)總醫(yī)院作為食源性疾病來(lái)源的副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌的主動(dòng)監(jiān)測(cè)點(diǎn),診斷醫(yī)生根據(jù)病例定義篩選病人進(jìn)行監(jiān)測(cè)樣本的采集,北京市門(mén)頭溝疾控中心微生物檢驗(yàn)科負(fù)責(zé)副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌的檢測(cè)、鑒定,分子分型由北京市疾控中心完成。
1.1.2病例定義[5]
由食品或懷疑由食品引起的,以腹瀉癥狀為主訴的就診病例。腹瀉是指每日排便3次或3次以上,且糞便性狀異常,如稀便、水樣便、粘液便或膿血便等。
1.1.3樣本采集
采集監(jiān)測(cè)病例新鮮糞便1~2g置于無(wú)菌塑料便盒中(如采樣困難,可采用無(wú)菌棉拭子以直腸內(nèi)采集糞便后,置Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基,室溫保存運(yùn)送,忌冰箱冷藏),2~8℃、4h內(nèi)檢測(cè)。2014年4月~2015年3月,共完成350件樣本的采集和監(jiān)測(cè)。
1.1.4主要設(shè)備與試劑
弧菌顯色培養(yǎng)基、沙門(mén)氏菌顯色培養(yǎng)基(鄭州人福博賽生物技術(shù)有限公司);3%氯化鈉堿性蛋白胨水、3%氯化鈉三糖鐵瓊脂、嗜鹽性試驗(yàn)培養(yǎng)基(0%、3%、6%、8%,北京陸橋技術(shù)有限公司);API 20E生化鑒定條、濁度儀(Densimat),梅里埃公司;Seakem Gold瓊脂糖,美國(guó)Cambrex BioScience Rockland;蛋白酶K,德國(guó)Merck;限制性內(nèi)切酶XbaⅠ,北京六合通經(jīng)貿(mào)有限公司;脈沖場(chǎng)凝膠電泳儀及配套設(shè)備、凝膠成像系統(tǒng)均購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad;試驗(yàn)用去離子水系統(tǒng)。
1.2方法
1.2.1檢測(cè)方法
參照文獻(xiàn)[5]規(guī)定的要求,參照GB 4789規(guī)定的方法進(jìn)行病例大便樣本的副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌的檢測(cè)、鑒定。
1.2.2PFGE分型及聚類(lèi)分析
參照國(guó)際食源性致病菌分子分型監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)PulseNet以及2014年食源性疾病監(jiān)測(cè)工作手冊(cè)中副溶血弧菌和沙門(mén)氏菌的PFGE分型的標(biāo)準(zhǔn)操程序進(jìn)行[6]。副溶血弧菌主要步驟:膠塊內(nèi)染色體DNA的酶切使用內(nèi)切酶NotⅠ酶切(標(biāo)準(zhǔn)菌株H9812使用XbaⅠ酶切),在CHEE MAPPER脈沖場(chǎng)電泳儀(美國(guó)Bio-Rad公司)上電泳(溫度14℃、起始轉(zhuǎn)換時(shí)間為10s,終止轉(zhuǎn)換時(shí)間為35.03s)18h。電泳結(jié)束后,1% 的EB染色30min,脫色90min后,使用Gel Doc EQ拍攝圖像。沙門(mén)氏菌的主要步驟:細(xì)菌懸液濃度用VITEK濁度儀調(diào)至4.0~4.2麥?zhǔn)蠞岫?;?00μL菌懸液加等量的膠制備膠塊;使用XbaⅠ限制性內(nèi)切酶(40U),37℃酶切3h;緩沖液為0.5×TBE;電泳電壓為6V/cm;電泳參數(shù)為2.2s~63.8s,19h;膠塊電泳后使用GelRed染色,純水脫色,讀取電泳圖譜。用BioNumerics軟件對(duì)電泳圖像進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,構(gòu)建聚類(lèi)樹(shù)狀圖。聚類(lèi)圖類(lèi)型根據(jù)非加權(quán)配對(duì)算術(shù)平均法構(gòu)建,條帶位置差異容許度設(shè)為1.5%。
2.1菌株的基本情況
2014年4月~2015年3月,北京市門(mén)頭溝區(qū)350例主動(dòng)監(jiān)測(cè)病例樣本中,共檢測(cè)出副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌食源性致病菌32株,食源性致病菌陽(yáng)性檢出率為9.14%。其中,11例樣本副溶血弧菌陽(yáng)性檢出,病例陽(yáng)性副溶血弧菌檢出率為3.14%,在TCBS上呈現(xiàn)典型菌落特征;沙門(mén)氏菌陽(yáng)性檢出21例,檢出率為6%,生化鑒定符合沙門(mén)氏菌特征。說(shuō)明門(mén)頭溝區(qū)食源性致病菌中副溶血弧菌、沙門(mén)氏菌為主要致病菌。
2.2PFGE分型結(jié)果
2.2.1副溶血弧菌的分子分型
分離得到的11株陽(yáng)性菌株的DNA片段能得到較好的分離,經(jīng)PFGE分型后得到10株電泳圖譜,F(xiàn)R-bjmtg0117未得到明顯的條帶忽略不計(jì),BioNumerics軟件對(duì)電泳圖譜進(jìn)行數(shù)據(jù)分析結(jié)果見(jiàn)圖1。在74.9%的相似水平,菌株mtgQ-2014-016-FR、mtgQ-2015-0042-FR、mtgQ-2014-081-FR、mtgQ-2014-095-FR分離條帶相似度較高,尤其mtgQ-2014-016-FR、mtgQ-2015-0042-FR的相似度84.6%,說(shuō)明其可能來(lái)自同一污染源的菌株,從流行病學(xué)的角度考慮,菌株mtgQ-2014-016-FR、和菌株mtgQ-2015-0042-FR導(dǎo)致的食源性疾病可能來(lái)自同一菌株所致。菌株FR-bjmtg17-3、FR-bjmtg17-4的條帶分布也存在較高的相似度,達(dá)到了80%,其他各菌株P(guān)FGE 圖譜條帶差異較大,說(shuō)明2014~2015年mtgQ-2014-016-FR、和FR-bjmtg17-3帶型是門(mén)頭溝區(qū)食源性疾病的副溶血弧菌優(yōu)勢(shì)帶型。
獲得副溶血弧菌的PFGE圖譜可以作為北京市門(mén)頭溝區(qū)2014~2015年的副溶血弧菌代表菌株的PFGE圖譜數(shù)據(jù)庫(kù),用于副溶血弧菌導(dǎo)致的食源性疾病的溯源、傳播途徑調(diào)查和識(shí)別以及預(yù)防控制措施的制定實(shí)施。
2.2.2沙門(mén)氏菌的分子分型
圖1 11株副溶血弧菌PFGE分型后的聚類(lèi)樹(shù)狀圖
21株沙門(mén)菌通過(guò)PFGE分型后,共分為16個(gè)帶型,每個(gè)帶型包含1~5株菌,2個(gè)帶型包含菌株>1,分別為2和5株菌株,其他帶型均包含1株菌株(圖2)。菌株2014mtgQ-116、mtgj-2014-055、mtgj2014-106、mtgQ2015-0011、mtgQ2015-18為同一個(gè)帶型,而菌株mtgQ-2014-088和mtgQ-2014-088/#1帶型相同;說(shuō)明其病原具有同源性,可能為同一污染源和病原,往往是食源性疾病聚集暴發(fā)的因子。16種分子分型條帶的相似度為20.8%~88.9%,菌株mtgQ-2015-36和mtgQ2014-118條帶相似度達(dá)到了90.9%,菌株mtgj-2014-120與mtgQ-2015-017條帶相似度為89.7%,且跨年度菌株,說(shuō)明門(mén)頭溝區(qū)沙門(mén)氏菌病人病原相同,污染源相近;菌株mtgQ-2014-088 mtgQ-2014-088/#1、mtgQ-2014-125相似度為88.9%;且為同年度分離獲得,說(shuō)明可能為聚集暴發(fā)病例或感染后處置不徹底形成延續(xù)病例。
分離21株沙門(mén)氏菌,PFGE獲得16中帶型圖譜,可以作為門(mén)頭溝區(qū)的食源性致病菌沙門(mén)氏菌的圖譜而構(gòu)建圖譜庫(kù),為今后門(mén)頭溝區(qū)食源性致病菌沙門(mén)氏菌的食源性疾病主動(dòng)監(jiān)測(cè)、分子溯源、傳播途徑調(diào)查和識(shí)別以及預(yù)防控制措施的制定實(shí)施,提供依據(jù)。
圖2 21株沙門(mén)氏菌PFGE分型后的聚類(lèi)樹(shù)狀圖
當(dāng)前,病原微生物污染防控是食品安全的剛性需求,微生物污染是食品不合格和造成食物中毒的主要原因,食源性副溶血弧菌和沙門(mén)氏菌是食源性疾病暴發(fā)的主要因素之一。而PFGE分子分型方法被認(rèn)為是細(xì)菌分子分型最可靠的手段,能夠快速進(jìn)行致病菌的比對(duì)和溯源。FGE結(jié)果進(jìn)行比較,追溯致病食品源頭[7]。本研究依托北京市食源性疾病主動(dòng)監(jiān)測(cè)體系,獲得11株副溶血弧菌和21株沙門(mén)氏菌陽(yáng)性菌株,均來(lái)自門(mén)頭溝區(qū)食源性疾病主動(dòng)監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院,由食品或懷疑由食品引起的,獲得PFEG圖譜說(shuō)明,副溶血弧菌具有10種帶型,沙門(mén)氏菌16種帶型。副溶血弧菌的mtgQ-2014-016-FR、mtgQ-2015-0042-FR、mtgQ-2014-081-FR、mtgQ-2014-095-FR菌株條帶相似度較高;FR-bjmtg17-3、FR-bjmtg17-4的條帶也具有較高的同源性;其他菌株條帶差異較大。沙門(mén)氏菌菌株16種分子分型條帶的相似度為20.8%~88.9%,菌株mtgQ-2015-36和mtgQ2014-118條帶相似度達(dá)到了90.9%,菌株mtgj-2014-120與mtgQ-2015-017條帶相似度為89.7%。
11株副溶血弧菌和21株沙門(mén)氏菌的圖譜聚類(lèi)分析顯示,門(mén)頭溝區(qū)食源性副溶血弧菌和沙門(mén)氏菌的遺傳呈現(xiàn)多態(tài)性,菌株間的親緣關(guān)系較復(fù)雜,且與樣本采集時(shí)間有關(guān)聯(lián),與文獻(xiàn)報(bào)道較一致[8,9]。部分食源性疾病病例分得到的副溶血弧菌和沙門(mén)氏菌陽(yáng)性菌株的PFGE圖譜歸屬于同一群,在遺傳學(xué)為親緣較近菌株,圖譜條帶的差異為菌株發(fā)生了單個(gè)遺傳[10]。北京門(mén)頭溝區(qū)食源性致病菌監(jiān)測(cè)顯示,食品中副溶血弧菌檢出率最高為22.22%,污染生食動(dòng)物性水產(chǎn)品[11],沙門(mén)氏菌也是食品污染主要致病菌[4]。故本研究結(jié)果獲得的PFEG圖譜,能夠?yàn)殚T(mén)頭溝區(qū)食源性疾病沙門(mén)氏菌和副溶血弧菌分子分型數(shù)據(jù)庫(kù)建立奠定良好的基礎(chǔ),有助于開(kāi)展沙門(mén)氏菌、副溶血弧菌的主動(dòng)監(jiān)測(cè)、暴發(fā)調(diào)查、傳染源追蹤和分子溯源,對(duì)于預(yù)防和控制食源性副溶血弧菌導(dǎo)致的食源性疾病具有重大現(xiàn)實(shí)意義。
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