錢雯婕 袁青鋒 魏紅英
摘要 介紹了一種利用棉花種子通用DNA快速提取方法以及多重PCR技術(shù)實現(xiàn)其純度快速檢測的技術(shù)。由于該技術(shù)具備準確、高效、成本低,以及便于推廣應用的特點,實現(xiàn)了棉花種子純度的快速檢測。
關(guān)鍵詞 棉花種子;PCR;快速檢測
中圖分類號 S562 文獻標識碼 A 文章編號 1007-5739(2016)07-0056-01
棉花是我國重要經(jīng)濟作物之一,對我國農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的發(fā)展發(fā)揮了重要促進作用。自我國成功加入WTO組織之后,棉花出口量逐年遞增,對其產(chǎn)量、品質(zhì)均提出了更高的要求。棉花的種子是棉花生產(chǎn)的基礎(chǔ),種子純度是衡量質(zhì)量的主要標準,棉種質(zhì)量的高低是決定該品種能否在生產(chǎn)上推廣、應用的前提,也是棉種生產(chǎn)及其推廣應用的生命線[1-2]。種子純度作為衡量棉花種子的重要指標之一,不僅影響著企業(yè)對于棉種的購銷,也是企業(yè)能否穩(wěn)健發(fā)展的根本。如何及時準確地鑒定出棉種的純度,一直是棉種行業(yè)質(zhì)量監(jiān)控的重點和難點。純度鑒定是判定種子質(zhì)量最復雜的檢驗過程。種子純度檢測的方法有很多,傳統(tǒng)鑒定方法為等到種子下一個生長季節(jié)或者到海南省通過種植鑒定,該方法的缺點在于費時費力,且成本較高,無法滿足現(xiàn)代化種子經(jīng)營的步伐[3-4]。隨著DNA標記技術(shù)的逐步成熟,目前已成為鑒定棉花雜家種子純度鑒定方法的補充或有效替代[5-6]。
哈密地處亞歐大陸腹地,位于西風帶控制之下,常年干燥少雨,溫差大,光照時間長,熱量豐富,屬于典型的大陸性半干旱氣候,對棉花等種植業(yè)的發(fā)展極為有利,在新疆棉花氣候資源區(qū)劃上屬宜棉區(qū)。得天獨厚的自然條件,吸引了諸多內(nèi)地廠家來此繁育棉花。在雜交棉花的制種方面,目前多通過人工去雄授粉方法進行,其缺點表現(xiàn)為難免會出現(xiàn)一部分自交現(xiàn)象,導致該現(xiàn)象的誘因有多種:首先是人工去雄不到位,即由于天氣或勞動力等因素所限,導致去雄不徹底;其次是種子純度不高,部分種子經(jīng)銷商在利益驅(qū)使下,在種子中摻雜假種子,嚴重影響種子純度;最后,由于棉花自身具備一定天然異交率,容易造成品種混亂。對于棉花生產(chǎn)來說,如果不能有效鑒定棉種的純度,將嚴重影響棉花產(chǎn)量及品質(zhì)。因此,如果能夠探索出一種精準、高效、經(jīng)濟的棉種純度檢測技術(shù),可對雜交棉的種植及推廣起到積極的促進作用[7-8]。
本文通過將棉花種子DNA快速提取方法和通用多重PCR技術(shù)結(jié)合起來,實現(xiàn)提高棉花種子純度鑒定效率的同時,也極大地提升新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團第十三師農(nóng)業(yè)科學研究所科研技術(shù)服務能力,對促進哈密地區(qū)及十三師現(xiàn)代化農(nóng)業(yè)健康、持續(xù)發(fā)展有著重要的意義?,F(xiàn)將棉花種子純度快速檢測技術(shù)研究的具體實施方案介紹如下。
1 引物設(shè)計
根據(jù)Cotton Microsatellite Database(CMD)已公布的序列,以及兩端序列的保守性,設(shè)計多對引物。在設(shè)計引物的過程中,要充分考慮引物的差異性、Tm值、長度、GC含量等。
2 DNA提取方法
本試驗采用改良的CTAB法提、SDS法、試劑盒快速提取法分別提取棉花種仁和子葉DNA。通過瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA的完整性,分光光度法測定DNA濃度和純度,篩選出最優(yōu)的提取部位和提取方法。建立一種基于PCR的棉花種子DNA快速提取方法,并經(jīng)過多組試驗,深入研究提取方法所涉及因素(如提取液體積、濃度、提取時間等)對DNA完整性以及PCR產(chǎn)物的影響,以及不同公司的Mix以及DNA模板量存在差異性的情況下對PCR產(chǎn)物的影響,最終研究出一種基于PCR的棉花種子DNA快速提取方法。
3 多重PCR技術(shù)
通過深入研究多重PCR技術(shù),多方面、多維度對引物設(shè)計、PCR擴增體系以及PCR擴增程序進行深入思考,并對其技術(shù)可行性進行縝密論證,最終建立起一套通用多重PCR技術(shù)。
4 擴增產(chǎn)物的PAGE與銀染檢測
經(jīng)過PCR擴增完成并且經(jīng)過變性以后,再利用變性聚丙烯酰胺凝膠進行電泳分離,隨后進行銀染檢測,再根據(jù)聚丙烯酰胺凝膠電泳的帶型統(tǒng)計母本自交粒帶型數(shù)量、待測樣品目標帶型數(shù)量,以及雜粒帶型數(shù)量,最終計算出待測樣品的純度,亦可根據(jù)其他PCR產(chǎn)物檢測儀器的參數(shù)計算待測樣品純度[9-11]。
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