基于GoWeb及PubMed分析醫(yī)學(xué)期刊研究熱點(diǎn)

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宋國營1） 常 春2） 蘇 楠3） 林江濤3）趙景輝1） 劉雪松1） 朱 瑤1） 熊 曾4）

1）中華醫(yī)學(xué)會雜志社《中華醫(yī)學(xué)雜志》編輯部，北京市東城區(qū)東四西大街42號 100710

2）北京大學(xué)第三醫(yī)院呼吸科，北京市海淀區(qū)花園北路49號 100191

3）中日友好醫(yī)院呼吸內(nèi)科，北京市朝陽區(qū)櫻花東路2號 100029

4）中南大學(xué)湘雅醫(yī)院放射科，湖南省長沙市開福區(qū)湘雅路87號 410008

醫(yī)學(xué)期刊編輯掌握學(xué)科領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)及發(fā)展趨勢，甄別及優(yōu)先發(fā)表學(xué)術(shù)影響力高、創(chuàng)新性好的研究論文，是提高醫(yī)學(xué)期刊影響力的重要措施[1-2]。使用互聯(lián)網(wǎng)計算機(jī)智能分析系統(tǒng)輔以人工閱讀的方式能揭示已有研究的整體特征及預(yù)測其發(fā)展趨勢，克服人工閱讀工作量過大且具有主觀性的缺點(diǎn)。常用獲取研究熱點(diǎn)的方法主要有MeSH主題詞分析[3]、數(shù)據(jù)庫分析[4-5]（如Essential Science IndicatorsTM數(shù)據(jù)庫、Web of Science數(shù)據(jù)庫等）、文獻(xiàn)檢索系統(tǒng)分析[6]（如PubMed、CNKI等）、生物醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎[7-8]（如GoWeb、Google學(xué)術(shù)）等文獻(xiàn)計量學(xué)方法，但其中一些方法較為復(fù)雜，部分需要付費(fèi)搜索。本研究利用全開放的數(shù)據(jù)源GoWeb及PubMed系統(tǒng)，將兩者結(jié)合，以哮喘機(jī)制研究為例，對醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)進(jìn)行回顧性分析，以期幫助責(zé)任編輯捕獲領(lǐng)域研究熱點(diǎn)及預(yù)測其發(fā)展趨勢，為醫(yī)學(xué)期刊編輯選稿、提高期刊學(xué)術(shù)影響力提供簡單易行的好方法。

1 數(shù)據(jù)來源與方法

1.1 數(shù)據(jù)來源

數(shù)據(jù)來自GoWeb生物醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎（網(wǎng)址http：//www.gopubmed.org）及 PubMed 文獻(xiàn)檢索服務(wù)系統(tǒng)（網(wǎng)址 http：//pubmed.cn/）。

1.2 研究方法

1.2.1 哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)篩選

登錄www.gopubmed.org后，在檢索輸入框中輸入“Asthma AND Mechanism”，自動生成檢索記錄，左側(cè)統(tǒng)計欄自動顯示名詞術(shù)語及其頻次、生成研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線。熱點(diǎn)即大多數(shù)研究者關(guān)注的研究內(nèi)容，反映在醫(yī)學(xué)期刊文獻(xiàn)中，就是某一名詞術(shù)語出現(xiàn)的頻次，頻次越高說明研究者越關(guān)注[7-8]?；诖耍斯び涗涱l次最高的10個名詞術(shù)語，觀察各名詞術(shù)語的研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線變化規(guī)律，閱讀近年來哮喘機(jī)制研究的權(quán)威綜述及指南，由1名哮喘機(jī)制研究的權(quán)威臨床專家及1名資深呼吸系統(tǒng)學(xué)術(shù)期刊編輯歸納哮喘機(jī)制的研究熱點(diǎn)。

1.2.2 驗(yàn)證初篩獲得的哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)準(zhǔn)確性

為證實(shí)所歸納哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)的準(zhǔn)確性，本研究從期刊引用報告（Journal Citation Report，JCR）找出2014年度影響因子大于5的呼吸系統(tǒng)國際權(quán)威期刊，在PubMed中檢索各期刊2011—2015年關(guān)于哮喘機(jī)制的文獻(xiàn)，檢索式：Asthma[Mesh Terms]AND Mechanism AND期刊[ISSN]AND 2011/01/01—2016/01/01，下載題錄。由2名主治醫(yī)師以上從事哮喘研究的呼吸內(nèi)科醫(yī)師及2名學(xué)術(shù)期刊編輯人工閱讀標(biāo)題和摘要理解文獻(xiàn)所表述的內(nèi)容，提煉研究內(nèi)容，閱讀人員先獨(dú)立判斷，不一致時協(xié)商獲得一致，計算各研究內(nèi)容比重，分析研究內(nèi)容的年分布特征，總結(jié)規(guī)律。

1.2.3 預(yù)測哮喘機(jī)制研究發(fā)展趨勢

因?yàn)榻陙硇碌难芯績?nèi)容可能因?yàn)檠芯繒r間不長，發(fā)表文章累積篇數(shù)不多，所以相關(guān)術(shù)語頻次較小，而未被涵蓋在初步歸納的研究熱點(diǎn)范圍內(nèi)。但這些研究內(nèi)容也應(yīng)引起研究者的關(guān)注，很可能是今后研究的發(fā)展趨勢。故本研究針對未涵蓋在初步歸納的研究熱點(diǎn)范圍內(nèi)的研究內(nèi)容進(jìn)一步行GoWeb分析[7]，根據(jù)檢索獲得的相關(guān)文獻(xiàn)量、研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線預(yù)測哮喘機(jī)制研究發(fā)展趨勢。

2 結(jié)果與分析

2.1 哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)相關(guān)術(shù)語及其頻次、逐年變化規(guī)律

利用GoWeb生物醫(yī)學(xué)專業(yè)搜索引擎獲得哮喘機(jī)制研究相關(guān)期刊文獻(xiàn)5473條檢索記錄。利用GoWeb獲得的發(fā)表頻次最高的10個名詞術(shù)語及其頻次 分別為：Eosinophils（907）、Nebulizers and Vaporizers（874）、Allergens（873）、Inhalation（863）、Immunoglobulin E（845）、Mast Cells（472）、Ovalbumin（447）、Bronchoconstriction（443）、Bronchoalveolar Lavage Fluid（433）、Bronchial Hyperreactivity（419）。各術(shù)語相關(guān)研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線如圖1，對應(yīng)的中文名詞術(shù)語分別為嗜酸性粒細(xì)胞（圖1A）、霧化器和汽化器（圖1B）、過敏原（圖1C）、吸入（圖1D）、免疫球蛋白E（圖1E）、肥大細(xì)胞（圖1F）、卵清蛋白（圖1G）、氣道重建（圖1H）、支氣管肺泡灌洗液（圖 1I）、氣道高反應(yīng)（圖1J）。這10個名詞術(shù)語中霧化器和汽化器、卵清蛋白、吸入、支氣管肺泡灌洗液均屬于檢查治療手段、動物模型造模工具及致病途徑，氣道高反應(yīng)是誘因，以上5個術(shù)語均不屬于哮喘機(jī)制研究范疇內(nèi)，而嗜酸性粒細(xì)胞、過敏原、免疫球蛋白E、肥大細(xì)胞這4個術(shù)語均屬于免疫學(xué)發(fā)病機(jī)制，氣道重建是哮喘發(fā)病的另一重要機(jī)制。因此從獲取的熱點(diǎn)關(guān)聯(lián)術(shù)語和各術(shù)語相關(guān)研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線可以歸納出哮喘機(jī)制的研究熱點(diǎn)主要集中在免疫學(xué)及氣道重塑上。

2.2 驗(yàn)證哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)的準(zhǔn)確性

2014年度影響因子大于5的呼吸系統(tǒng)國際權(quán)威期刊共5本，其名稱及影響因子分別為：Am JResp Crit Care（12.996）、Lancet Respir Med（9.629）、Thorax（8.290）、 Eur Respir J（7.636）、 Chest（7.483）。在PubMed中檢索出各期刊2011—2015年關(guān)于哮喘機(jī)制的文獻(xiàn)共23篇（表1），23篇文獻(xiàn)中免疫學(xué)機(jī)制研究為10篇，占43.5%，氣道重建7篇，占30.4%，其他研究共6篇，占26.1%。23篇文獻(xiàn)按研究熱點(diǎn)年度分布特征見表2。結(jié)果顯示2012年及以前，免疫學(xué)在哮喘機(jī)制研究中占優(yōu)，明顯多于氣道重建，2013年后氣道重建文獻(xiàn)占比逐年提高，與免疫學(xué)基本相當(dāng)，2015年僅檢索到1篇哮喘機(jī)制文獻(xiàn)，為氣道重塑相關(guān)研究。免疫學(xué)研究集中于細(xì)胞因子及輔助T細(xì)胞分化，共7篇，占70%；氣道重塑研究集中于平滑肌細(xì)胞及成纖維細(xì)胞分化，共6篇，占85.7%；其他包括：表觀遺傳學(xué)3篇、血管生成1篇、神經(jīng)內(nèi)分泌失衡1篇、吞噬功能1篇。

表1 影響因子（2014年）＞5的呼吸專業(yè)SCI期刊2011—2015年發(fā)表哮喘機(jī)制論文情況

2.3 基于GoWeb預(yù)測哮喘機(jī)制研究發(fā)展趨勢

本研究針對表觀遺傳學(xué)、血管生成、神經(jīng)內(nèi)分泌失衡、吞噬功能4項研究內(nèi)容進(jìn)一步行GoWeb分析，以表觀遺傳學(xué)為例，在檢索框內(nèi)輸入“Asthma AND Mechanism AND epigenetics”，檢索結(jié)果及相關(guān)文獻(xiàn)的逐年變化趨勢顯示：表觀遺傳學(xué)16篇，其中DNA甲基化有7篇，組蛋白乙?；?篇，micro-RNA 2篇，文獻(xiàn)均集中于2010年后，且快速上升（圖2A）；同理獲得血管生成文獻(xiàn)22篇，其中12篇集中于VEGF-α，從1999年開始研究，一直處于平臺期（圖2B）；神經(jīng)內(nèi)分泌失衡25篇，1970年開始研究，2000年達(dá)研究高峰，后逐年下降（圖2C）；吞噬功能11篇，1989年開始研究，后逐年下降（圖2D）。研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線顯示表觀遺傳學(xué)有望成為哮喘機(jī)制研究的新熱點(diǎn)。

3 結(jié)論與討論

圖1 哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)術(shù)語研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線

GoWeb是一個有效的文獻(xiàn)挖掘工具，其工作原理為：GoWeb將檢索提問提交給 Yahoo（http：∥www.yahoo.com），從Yahoo接收檢索結(jié)果，從中提取基因本體特征GO和醫(yī)學(xué)主題詞表MeSH形成一個臨時的等級分類表，并統(tǒng)計每個分類目錄對應(yīng)的檢索結(jié)果數(shù)量，對檢索者起到了快速導(dǎo)航作用，使其對檢索到的結(jié)果有一個大概的了解，并能很快找到自己需要的檢索結(jié)果[9]。盡管Goweb是一現(xiàn)有圖書情報分析工具，但現(xiàn)有文獻(xiàn)主要集中于對這一工具的原理、使用范圍進(jìn)行簡單介紹。本研究旨在將該工具功能遷移到科技期刊編輯領(lǐng)域，指導(dǎo)醫(yī)學(xué)編輯更好地把握有關(guān)領(lǐng)域研究熱點(diǎn)，提高學(xué)術(shù)期刊學(xué)術(shù)影響力。本研究將兩個開放免費(fèi)的GoWeb與PubMed數(shù)據(jù)源結(jié)合使用，以哮喘機(jī)制研究為例，利用GoWeb自動生成高頻次名詞術(shù)語及其年發(fā)表分布特征，初步歸納研究熱點(diǎn)，再利用PubMed檢索國際權(quán)威期刊發(fā)表的相關(guān)論文年度分布特征來評價初步歸納研究熱點(diǎn)的準(zhǔn)確性，最后對未涵蓋在初步歸納的研究熱點(diǎn)范圍內(nèi)的研究進(jìn)一步行GoWeb分析，預(yù)測研究發(fā)展趨勢，幫助醫(yī)學(xué)期刊責(zé)任編輯歸納領(lǐng)域研究熱點(diǎn)及預(yù)測其發(fā)展趨勢。目前本研究采用的這一研究體系尚未見報道。與現(xiàn)有其他研究體系相比，本研究采用的方法，數(shù)據(jù)源完全開放免費(fèi)，熱點(diǎn)挖掘過程簡單實(shí)用，結(jié)果可靠，可以重復(fù)，實(shí)用性強(qiáng)。

表2 23篇文獻(xiàn)按研究熱點(diǎn)年度分布情況

圖2 相關(guān)研究論文年度分布曲線及相關(guān)研究興趣年度曲線

本研究從獲取的熱點(diǎn)關(guān)聯(lián)術(shù)語及各術(shù)語研究論文年度分布曲線、相關(guān)研究興趣年度曲線，整體歸納出哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)主要集中在免疫學(xué)及氣道重塑。依據(jù)關(guān)聯(lián)術(shù)語查閱文獻(xiàn)獲知[10-11]：哮喘是T淋巴細(xì)胞介導(dǎo)的肺內(nèi)的炎癥反應(yīng)，Thl/Th2比例失衡是哮喘的免疫學(xué)發(fā)病機(jī)制，其中Th2細(xì)胞數(shù)目增多和功能亢進(jìn)是導(dǎo)致哮喘發(fā)生的重要原因，各種細(xì)胞因子刺激初始CD4+T細(xì)胞向Th2細(xì)胞分化中發(fā)揮重要的作用。因此研究樹突狀細(xì)胞、T淋巴細(xì)胞、Thl、Th2細(xì)胞及釋放的各種細(xì)胞因子在支氣管炎癥反應(yīng)的作用及維持Thl/Th2比例平衡是免疫學(xué)機(jī)制的研究熱點(diǎn)。氣道重塑主要表現(xiàn)為炎癥細(xì)胞浸潤和腺體增生肥大，細(xì)胞外基質(zhì)沉積、基底膜增厚及氣道平滑肌增厚，同時伴有非特異性的氣道高反應(yīng)，被認(rèn)為是難治性哮喘重要的病理基礎(chǔ)。

一般來說，能發(fā)表在專業(yè)領(lǐng)域頂級核心期刊的文獻(xiàn)代表了該領(lǐng)域的最熱點(diǎn)最前沿的研究。本研究通過具有醫(yī)學(xué)知識背景者人工閱讀這些文獻(xiàn)來判斷本研究分析結(jié)果在文獻(xiàn)中的涵蓋率，驗(yàn)證了上述熱點(diǎn)分析的準(zhǔn)確性，說明通過GoWeb挖掘的哮喘機(jī)制研究熱點(diǎn)準(zhǔn)確性較高。本研究針對未涵蓋在初步歸納的研究熱點(diǎn)范圍內(nèi)的內(nèi)容進(jìn)一步行GoWeb分析發(fā)現(xiàn)表觀遺傳學(xué)有望成為哮喘機(jī)制研究的新熱點(diǎn)。

使用醫(yī)學(xué)知識挖掘系統(tǒng)指導(dǎo)醫(yī)學(xué)編輯緊跟相關(guān)領(lǐng)域研究熱點(diǎn)，組織發(fā)表高質(zhì)量的學(xué)術(shù)論文是本研究最大的創(chuàng)新點(diǎn)。本研究所述方法僅是一個醫(yī)學(xué)知識挖掘系統(tǒng)的使用。另外，本研究選擇的研究對象較具體，僅僅集中在呼吸系統(tǒng)領(lǐng)域中一個具體的研究主題——哮喘機(jī)制，如果選擇更高一級別的學(xué)科領(lǐng)域進(jìn)行分析，將極大地增加分析的工作量，但原理、方法、實(shí)施過程是一樣的。本研究提供的方法，可以對感興趣的任意學(xué)科領(lǐng)域進(jìn)行分析。整體看來，本研究結(jié)果具有較好的準(zhǔn)確率，將GoWeb與PubMed結(jié)合能很好地幫助責(zé)任編輯捕獲領(lǐng)域研究熱點(diǎn)及預(yù)測其發(fā)展趨勢，為科學(xué)研究的熱點(diǎn)挖掘提供了較好的技術(shù)平臺，為醫(yī)學(xué)期刊編輯掌握相關(guān)學(xué)科領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)及發(fā)展趨勢、提高醫(yī)學(xué)期刊學(xué)術(shù)影響力提供了簡單有效且可行的方法。

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