陳麗云
農(nóng)安衛(wèi)校附屬醫(yī)院
試析胃腸腫瘤標(biāo)志物診斷大腸癌之檢驗
陳麗云
農(nóng)安衛(wèi)校附屬醫(yī)院
信息技術(shù)和生命科學(xué)是當(dāng)代標(biāo)志性學(xué)科,數(shù)據(jù)挖掘,又稱為數(shù)據(jù)庫中知識發(fā)現(xiàn),醫(yī)學(xué)是與試驗和信息結(jié)合非常緊密的科學(xué),將有限的檢驗信息提煉為高效的診治信息,利用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)為數(shù)據(jù)挖掘工具,以項血清標(biāo)志物檢驗診斷大腸癌為例,檢驗報告客觀提供了檢測結(jié)果參考價值。
胃腸腫瘤;數(shù)據(jù)庫;血清標(biāo)志
我國在檢驗醫(yī)學(xué)教育、質(zhì)量保證等方面有了很大的發(fā)展,但值得思索的是在技術(shù)層面還有待進(jìn)步。利用數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)可以實現(xiàn)這一目標(biāo),評價和肯定檢驗項目的臨床價值,在技術(shù)上可以根據(jù)它的工作過程應(yīng)用于臨床實踐工作。它可以分為數(shù)據(jù)抽取、數(shù)據(jù)存儲和管理、數(shù)據(jù)展現(xiàn)。
從技術(shù)層面上來說,數(shù)據(jù)的抽取是數(shù)據(jù)進(jìn)入倉庫的入口。數(shù)據(jù)倉庫的組織管理方式在數(shù)據(jù)展現(xiàn)方面主要的方式有:查詢、報表、可視化、統(tǒng)計和挖掘。
診斷試驗含義是廣泛的,利用數(shù)據(jù)挖掘等方法,并行處理大量的數(shù)據(jù)。它包括各種化驗室檢查,詢問病史,從數(shù)據(jù)中得到關(guān)于數(shù)據(jù)關(guān)系,體檢所獲得的資料,使系統(tǒng)更便于管理和維護,得到各種影像診斷和儀器診斷等。
尤登指數(shù)又稱正確指數(shù),靈敏度又稱真陽性率,特異度又稱真陰性率,因此,尤登指數(shù)是指靈敏度和特異度之和減去1,靈敏度和特異度是矛盾的統(tǒng)一體,是綜合評價真實性指標(biāo),理想實驗應(yīng)為1。計算機動畫技術(shù)表現(xiàn)復(fù)雜數(shù)據(jù)及其相互關(guān)系。
準(zhǔn)確度:試驗的準(zhǔn)確度,也稱效率。反應(yīng)檢出患者的能力,是真陽性與真陰性人數(shù)之和占受試人數(shù)%,隨著診斷閡值的變化而變化,理想的實驗應(yīng)為1。
陽性預(yù)測值是另外一項指標(biāo),具體地說,它是指真陽性人數(shù)占實驗結(jié)果陽性人數(shù)的百分比,可用以描述診斷性試驗陽性時患病的機率。預(yù)測值又稱預(yù)告值,預(yù)示值,在不同患病率的人群中,一個診斷方法有其一定的特異度和靈敏度,陽性結(jié)果的預(yù)測值不同,應(yīng)用它篩檢或診斷患病率不同的人群時,患病率低時,陽性預(yù)測值很低。
重復(fù)做試驗時獲得相同結(jié)果的穩(wěn)定程度,我們稱這項指標(biāo)為可靠性。繪制ROC曲線以實驗靈敏度為縱坐標(biāo),隨機的數(shù)據(jù)集中識別有效的,依照連續(xù)分組測定的數(shù)據(jù),潛在有用的以及最終可理解的模式,利用曲線下的面積,根據(jù)數(shù)據(jù)挖掘的方法,評價不同檢驗項目或不同檢測方法,調(diào)節(jié)各處理單元間的連接權(quán)值,曲線下面積越大,其診斷價值越大。
選擇有代表性的聯(lián)合檢驗項目,通過醫(yī)院信息系統(tǒng)和檢驗醫(yī)學(xué)信息系統(tǒng),選取臨床診治具有指導(dǎo)意義的腫瘤標(biāo)志物,收集檢驗結(jié)果數(shù)據(jù),認(rèn)真詳細(xì)記錄檢驗結(jié)果相關(guān)信息,并進(jìn)行分類整理,主要是臨床診斷和治療信息。分析評價各組病例檢驗項目實際臨床價值,根據(jù)合適的方法,構(gòu)建ROC曲線,對聯(lián)合試驗項目進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,應(yīng)用診斷模型仿真預(yù)測值,采用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型等進(jìn)行處理,驗概率注釋檢驗報告的臨床實踐,然后根據(jù)實際情況隨訪統(tǒng)計,在患病率高的人群中篩查較有意義。
通過對胃腸腫瘤標(biāo)志物數(shù)據(jù)的整理,采用數(shù)理統(tǒng)計等方法將確診大腸癌的數(shù)據(jù)分別提煉出來,對組合檢驗結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)處理,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,以胃腸腫瘤標(biāo)志物診斷大腸癌為例,計算出靈敏度和特異度,從技術(shù)層面畫出ROC圖形,在應(yīng)用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)后,選擇最佳數(shù)學(xué)模型,進(jìn)行篩查診斷,要求最少有五組連續(xù)分組測定數(shù)據(jù),ROC曲線下的面積大小顯而易見,在診斷性試驗中,對篩查和診斷大腸癌都有更好的效果,并開辟一條檢驗醫(yī)學(xué)臨床實踐,這對臨床實踐有很好的幫助。
檢驗組合共計2000份。
分組為:健康對照組、大腸癌組、其他疾病組。
所有研究對象抽取空腹靜脈血3ml。利用檢驗科信息管理系統(tǒng)分類統(tǒng)計,采用目前最先進(jìn)的標(biāo)記免疫測定技術(shù)。以Microsoft-Excel形式導(dǎo)出,方法具有敏感,快速和穩(wěn)定的特點。
采用基于誤差反傳原理多層前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)。各組經(jīng)過篩查模型或診斷模型仿真預(yù)測,計算各個標(biāo)本胃腸腫瘤標(biāo)志物檢驗結(jié)果,分別存入大腸癌篩查、癌診斷ROC數(shù)據(jù)集。
通過全息條形碼實驗室信息系統(tǒng),建立的人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)診斷模型,輸入篩查模型得到ANN計算值,得出診斷預(yù)測值(驗后概率)的計算公式,體檢標(biāo)本查閱篩查模型的ROC數(shù)據(jù)集,得出本地區(qū)大腸癌的患病率,之后定期隨訪和不斷修正ROC數(shù)據(jù)集,其臨床實踐方法可存儲于檢驗醫(yī)師工作站共享。
腫瘤標(biāo)志物是指存在于腫瘤細(xì)胞內(nèi)的物質(zhì),研究中引起腫瘤標(biāo)志物假陽性有很多因素,隨著腫瘤研究深入,腫瘤標(biāo)志物增多,如常見的大腸癌的血清標(biāo)志物。腫瘤的發(fā)現(xiàn)有賴于腫瘤標(biāo)志物的輔助檢查,胃腸腫瘤發(fā)病因素主要與生活習(xí)慣有關(guān)。如高脂飲食、缺少運動、在血吸蟲疫區(qū)的不潔生活方式等。
檢驗醫(yī)學(xué)是一個為臨床服務(wù)的二級學(xué)科,但如何運用好的技術(shù)提供臨床依據(jù),提高臨床對疾病的診斷效率,意義重大。
人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)簡稱神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),是腫瘤標(biāo)志物檢測技術(shù)的發(fā)展,能對腫瘤標(biāo)志物進(jìn)行多次訓(xùn)練,并通過它自身的特點,得出最佳臨界值,經(jīng)過計算機相應(yīng)處理后,對此臨界值進(jìn)行ROC曲線分析,能夠最終使聯(lián)合試驗提高診斷效率。目前發(fā)現(xiàn)腫瘤標(biāo)志物的方法有很多,但隨著醫(yī)學(xué)信息化的建設(shè),證實了這種方法預(yù)測胃腸癌的敏感性要比其它技術(shù)高的多,即人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的診斷效率最高。對疾病的診斷有很大幫助,在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域良好的應(yīng)用前景。
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