煙草電壓依賴陰離子通道NtVDAC1.1的電子克隆及生物信息學(xué)分析

武兆云　張小全　楊鐵釗　王紅

摘要：為研究電壓依賴陰離子通道（VDAC）基因在煙草根系分泌有機(jī)酸的作用，進(jìn)而為了解該基因的功能和應(yīng)用提供基礎(chǔ)，以擬南芥AtVDAC1（NM_110994）為搜索序列，應(yīng)用電子克隆技術(shù)得到一條煙草VDAC基因全長cDNA，命名為AtVDAC1.1。生物信息學(xué)分析表明該基因全長為1018 bp，有著完整的開放閱讀框，編碼276個氨基酸。進(jìn)化關(guān)系及同源性分析表明，NtVDAc1.1與其他物種的VDAc有著較高的相似性，其中與茄科植物馬鈴薯三個膜孔蛋白有著很高的一致性（0.768～0.902）。功能分析顯示，NtVDAC1.1為膜孔蛋白，參與了陰離子的轉(zhuǎn)運、陰離子轉(zhuǎn)運調(diào)節(jié)和跨膜運輸。二級和四級結(jié)構(gòu)分析均表明，NtVDAC1.1含有a-螺旋和B-折疊。氨基酸位點分析表明，該蛋白具有多種類型的修飾位點，其中的磷酸化位點說明該基因與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)有關(guān)，對陰離子通道活性具有調(diào)節(jié)作用。

關(guān)鍵詞：煙草；電壓依賴陰離子通道；基因克??；生物信息學(xué)分析

中圖分類號：S572：Q781 文獻(xiàn)標(biāo)識號：A 文章編號：1001-4942（2015）11-0005-07endprint