沈喜 朱景紅 浦銅良 易靜 向云 張華 馮虎元
摘要:近年高校的發(fā)展中,實踐教學(xué)的加強(qiáng)和綜合素質(zhì)的培養(yǎng)已經(jīng)成為當(dāng)前大學(xué)教育改革的重點。分子生物學(xué)作為一門實踐性較強(qiáng)的學(xué)科,廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)的各個領(lǐng)域。通過對實驗設(shè)計、實驗材料、實驗報告等各方面的優(yōu)化改進(jìn),將基礎(chǔ)實驗與科研應(yīng)用和專業(yè)發(fā)展前沿緊密結(jié)合。在提高學(xué)生學(xué)習(xí)興趣的同時,培養(yǎng)學(xué)生的科研思維,促進(jìn)學(xué)生發(fā)揮主觀能動性,不斷提高實踐和創(chuàng)新能力,這也為學(xué)生后續(xù)的工作和科研打下了扎實的基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:實驗教學(xué);分子生物學(xué)實驗;優(yōu)化設(shè)計;綜合能力
中圖分類號:G642.0 ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A ? ? 文章編號:1674-9324(2015)24-0251-02
分子生物學(xué)是一門實驗性很強(qiáng)的自然學(xué)科,從分子水平闡述生命活動的規(guī)律、揭示生命的本質(zhì),逐步廣泛地應(yīng)用于生命學(xué)科的各個領(lǐng)域。從實踐意義上來說,其實驗教學(xué)對提高學(xué)生的綜合素質(zhì)、培養(yǎng)創(chuàng)新精神與實踐能力有著理論教學(xué)不可替代的特殊作用。這就對高校教師如何從基礎(chǔ)教學(xué)入手,有效引導(dǎo)學(xué)生運用基礎(chǔ)理論知識,不斷提高發(fā)掘、探索和解決科學(xué)問題的能力提出了更高的要求。
下面,就以本實驗教學(xué)中心分子生物學(xué)實驗中一個經(jīng)典的實驗——“western blotting檢測人血清IgG”為例來探討如何優(yōu)化實驗設(shè)計,達(dá)到提高學(xué)生學(xué)習(xí)興趣、培養(yǎng)科研思維的目的。
一、實驗中待優(yōu)化的問題
Western Blotting(蛋白質(zhì)免疫印跡法)是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的一種實驗方法,經(jīng)常用來定性地研究目的蛋白的分子量,或者定量檢測目的基因蛋白水平的表達(dá)[1]。
在本實驗的課程安排中,采用Western Blotting技術(shù)來定性地研究人類血清的主要抗體成分——IgG的相對分子質(zhì)量。雖然經(jīng)過幾年的實踐,該實驗效果良好,但是發(fā)現(xiàn)實驗設(shè)計中仍存在以下值得優(yōu)化的問題:第一,通過實驗只能獲得目的蛋白IgG的相對分子量;由于實驗內(nèi)容未深入到定量實驗,無法了解免疫球蛋白在人體不同免疫狀態(tài)下表達(dá)量的差異,一則不符合科學(xué)研究的思路,二來沒有打開提出問題的空間以提高學(xué)生分析實驗結(jié)果的能力。第二,采用普通Marker電泳,當(dāng)電泳結(jié)束后通過染色、脫色PAGE膠才能顯出各標(biāo)準(zhǔn)蛋白條帶,并且凝膠中的條帶無法直接轉(zhuǎn)移到NC膜上。所以,計算目的蛋白的分子量是根據(jù)A圖按照標(biāo)準(zhǔn)分子量蛋白的各相對遷移率畫出蛋白質(zhì)的標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖1),根據(jù)B圖免疫印跡結(jié)果求得目的蛋白分子量的相對遷移率,然后帶入A圖的標(biāo)準(zhǔn)曲線,最終求得目的蛋白的相對分子量。但是由于A圖PAGE膠和B圖NC膜的膨脹系數(shù)不同,學(xué)生計算過程中經(jīng)常因蛋白遷移率的測量誤差,導(dǎo)致求得的目的蛋白相對分子量存在系統(tǒng)誤差。
二、優(yōu)化措施
針對以上問題以及提高學(xué)生實驗興趣的目的,我們對該實驗采取了以下優(yōu)化手段。
(一)實驗性質(zhì)的優(yōu)化
改變過去僅僅采用單一正常人血清作為樣本,計算目的蛋白相對分子量的定性實驗性質(zhì),而是進(jìn)一步以正常人血清為對照,采用各種病例樣本材料,定量分析不同病理狀態(tài)下目的蛋白的表達(dá)含量的變化,將實驗性質(zhì)優(yōu)化為定量實驗(圖2)。
①標(biāo)準(zhǔn)蛋白樣品;②正常人血清樣品;③急性肺炎患者血清樣品;④急性淋巴性白血病患者血清樣品。
(二)實驗材料的優(yōu)化
換用預(yù)染Marker:預(yù)染Marker在電泳分離過程中,各標(biāo)準(zhǔn)蛋白的條帶直接顯色,可以讓學(xué)生觀察到條帶逐漸分離的過程,形象而直觀。另外,預(yù)染Marker的條帶可以直接轉(zhuǎn)移到NC膜上,當(dāng)獲得目的蛋白的免疫印跡條帶后,可以在同一張NC膜上進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制和目的蛋白相對分子量的計算,減少了系統(tǒng)誤差,使蛋白質(zhì)分子量的計算更為準(zhǔn)確。
(三)實驗報告形式的改進(jìn)
以論文的形式書寫實驗報告:本實驗面向大二學(xué)生,他們習(xí)慣了實驗報告的書寫模式,要求他們學(xué)習(xí)按照論文的格式,查閱中文文獻(xiàn),了解“western-blotting”這項技術(shù)在研究蛋白性質(zhì)和功能方面的應(yīng)用,在實踐中獲得的結(jié)果如何處理分析,并通過文獻(xiàn)引用來支持自己的分析,有理有據(jù)。
三、優(yōu)化效果
(一)實驗性質(zhì)的優(yōu)化,將一個定性實驗深入到定性加定量的實驗
與科研課題相結(jié)合的實驗技術(shù)教學(xué)新模式,可以增加實驗技術(shù)教學(xué)的實用性、多樣性和先進(jìn)性[2]。最初的實驗設(shè)計是通過聚丙烯酰胺凝膠電泳制作蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)曲線,測得人血清IgG的相對分子量,但還沒有充分發(fā)揮“western-blotting”這項技術(shù)的作用。在科研工作中,經(jīng)常采用本項技術(shù)研究同一種蛋白質(zhì)在生命體不同時期、不同誘導(dǎo)或脅迫條件、不同免疫等條件下表達(dá)含量的變化,所以實驗設(shè)計加入不同病理狀態(tài)的血清樣本,有助于幫助學(xué)生進(jìn)一步了解本項實驗技術(shù)的用途,加強(qiáng)基本實驗技能的訓(xùn)練。
(二)因勢利導(dǎo),誘發(fā)學(xué)生發(fā)掘和提出問題,加深實驗印象
愛因斯坦指出:“提出一個問題往往比解決一個問題更重要?!痹诳茖W(xué)研究中,往往解決一個問題也許僅需要實驗技能而已,而能夠提出新的問題,才會演變成探索與創(chuàng)新的動力。為了誘導(dǎo)學(xué)生提出問題、加強(qiáng)實驗原理的理解和實驗安全操作意識,我們在選擇實驗樣本的時候,使用了肺炎患者的血清。第一時間讓學(xué)生提出了疑問:使用這種具有一定傳染性疾病患者的血清為實驗材料,會有傳染危險嗎?吸引學(xué)生關(guān)注SDS-PAGE實驗樣品煮沸變性的處理方法。這種處理材料的方法不僅高溫滅活了細(xì)菌,并且在還原劑巰基乙醇的作用下,使蛋白質(zhì)三、四級結(jié)構(gòu)被破壞,蛋白質(zhì)活性喪失,完整的蛋白質(zhì)被解聚為亞基或多肽鏈。這樣就進(jìn)一步幫助學(xué)生理解了變性和非變性蛋白電泳在科研中的不同應(yīng)用。
(三)合理選用實驗材料,研討式教學(xué),使實驗設(shè)計符合科研思維
實驗教學(xué)對于提高學(xué)生動手操作能力、獨立思考能力和分析、解決實際問題的能力等方面都具有重要的促進(jìn)作用[3]。通過生物學(xué)實驗培養(yǎng)學(xué)生掌握實驗基本操作僅僅是基礎(chǔ),而通過實驗現(xiàn)象和實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn)問題、科學(xué)合理地解釋問題是重要的目的。所以在實驗材料的選取中,首先,應(yīng)設(shè)置正常人的樣本為陽性對照,幫助學(xué)生建立生物實驗設(shè)置對照的重要觀念。其次,選擇不同的病例樣本,以免疫印跡的結(jié)果與陽性對照作對比,引導(dǎo)學(xué)生驗證在感染狀態(tài)和免疫缺陷條件下同一種免疫球蛋白表達(dá)量的變化。最后,細(xì)化樣本亞型的設(shè)置,進(jìn)一步引導(dǎo)學(xué)生研究感染不同時期的表達(dá)量有何變化,不同亞型白血病的表達(dá)量有何差異,等等問題,初步培養(yǎng)學(xué)生應(yīng)用實驗技術(shù)來解決科學(xué)問題的方法,并鞏固和加深了解生理學(xué)、免疫學(xué)等相關(guān)學(xué)科的知識。
(四)引導(dǎo)學(xué)生通過查閱文獻(xiàn)解釋問題,逐步培養(yǎng)論文寫作能力
在以論文形式撰寫實驗報告的過程中,引導(dǎo)學(xué)生分析和論述自己實驗結(jié)果所說明的問題。實驗報告作為多元化考核與評價的一種實施方式,除完成正常的思考題之外,還要求寫出自己對實驗的體會與反思[4]。學(xué)生通過回顧和反思提出了一系列問題,例如只用IgG重鏈做一抗可以計算出整個蛋白質(zhì)的分子量嗎?并且通過各小組間實驗結(jié)果的差異以及查閱文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)由于肺炎患者B淋巴細(xì)胞功能較亢進(jìn),合成的免疫球蛋白增多,而急性淋巴性白血病患者紅細(xì)胞免疫功能受到損害,B淋巴細(xì)胞銳減,等等因素可以判斷血樣不同的采樣時期及患病亞型。通過論文中發(fā)現(xiàn)和解決的問題,使學(xué)生產(chǎn)生成就感,也強(qiáng)烈地激發(fā)了學(xué)生的科研興趣。
綜上所述,基礎(chǔ)實驗的設(shè)計本著學(xué)生堅實地掌握實驗的理論知識、熟練掌握基本實驗技術(shù)操作的目的,通過優(yōu)化基礎(chǔ)實驗的設(shè)計,充分提高學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣,并與科研前沿相結(jié)合,培養(yǎng)學(xué)生通過基礎(chǔ)實驗將理論與實踐相結(jié)合,用科研思維去發(fā)現(xiàn)問題并通過實驗結(jié)果分析問題的能力,已經(jīng)成為實驗設(shè)計的重要思路。
參考文獻(xiàn):
[1]沈喜,易靜.基礎(chǔ)分子生物學(xué)實驗教程[M].蘭州大學(xué)出版社,2014.
[2]崔銀秋,林鳳,祿家輝,周慧,騰利榮.建立與科研課題結(jié)合的分子生物學(xué)實驗教學(xué)新模式[J].實驗室研究與探索,2009,28(11).
[3]宋永臣,楊明軍,劉衛(wèi)國,王正.本科生專業(yè)實驗教學(xué)研究探索[J].實驗室研究與探索,2014,33(2).
[4]汪朝陽,祝鳳榮,張向陽,周合兵,黃荔,張德明,馮彬,王輝.實驗報告在多元化考核與評價中的功能[J].實驗室科學(xué)與技術(shù),2008,6(5).