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    EPAS1基因SNPrs13419896多態(tài)性與HiHiLo低氧訓(xùn)練適應(yīng)效果關(guān)聯(lián)性研究

    2015-06-25 20:43:38汪洪波劉海平毛穎穎
    關(guān)鍵詞:單核苷酸多態(tài)性

    汪洪波 劉海平 毛穎穎

    摘要:目的:選取EPAS1基因序列第1內(nèi)含子序列上rs13419896 G/A單核苷酸多態(tài)(single nucleotide polymorphism, SNP)位點(diǎn),研究其與HiHiLo低氧訓(xùn)練后生理表型指標(biāo)關(guān)聯(lián)性,探尋預(yù)測低氧訓(xùn)練效果的遺傳學(xué)標(biāo)記。方法:選取35名北方漢族健康受試者(平均年齡19.54±2.55歲,平均身高177.94±4.27 cm,平均體重68.07±5.579 kg)在模擬海拔2 500 m高度(低氧環(huán)境O2濃度為15.4%)進(jìn)行4 周高住-高練-低訓(xùn)(living high-exercise high-training low, HiHiLo)。采用關(guān)聯(lián)研究方法(Association-Study),運(yùn)用聚合酶鏈反應(yīng)和基因測序?qū)嶒?yàn)技術(shù)分析EPAS1基因SNP rs13419896位點(diǎn),研究該位點(diǎn) 與4周HiHiLo低氧訓(xùn)練后最大攝氧量(maximal oxygen uptake,VO2max)、血紅蛋白(hemoglobin, Hb)、紅細(xì)胞數(shù)(red blood cell, RBC)等生理表型指標(biāo)變化的關(guān)聯(lián)性。結(jié)果:1)EPAS1基因SNP rs13419896位點(diǎn)中GG、GA、AA基因型頻率分別為40%、51.43%和8.57%,符合Hardy-weinberg遺傳平衡定律(x2=0.70,P=0.40)。2)4周低氧訓(xùn)練后,EPAS1基因SNPrs13419896基因型組間ΔVO2max、ΔrVO2max、ΔRBC及ΔHb均無顯著性差異。合并AA(AA基因型只有3例)與GA基因型統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),GA基因型受試者經(jīng)4周低氧訓(xùn)練后,VO2max絕對值、相對值增長幅度有好于GG基因型趨勢(76.17±245.31 ml/min vs -5.29±276.42 ml/min,P=0.09;1.22±3.37 ml/min·kg vs 0.13±4.18 ml/min·kg,P=0.09)。結(jié)論:平原人群4周 HiHiLo低氧訓(xùn)練后,EPAS1基因第1內(nèi)含子序列上SNP rs13419896多態(tài)位點(diǎn)與VO2max指標(biāo)變化可能存在著一定關(guān)聯(lián)性。

    關(guān)鍵詞:內(nèi)皮PAS結(jié)構(gòu);域蛋白1;高住-高練-低訓(xùn);單核苷酸多態(tài)性

    中圖分類號:G804.7 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號:1006-2076(2015)01-0075-05

    Abstract:Objective: This paper researched association between a single nucleotide polymorphisms rs13419896 (SNP rs13419896) in EPAS1 gene and physiological phenotype parameters response to hypoxia training. Methods: 35 healthy subjects completed 4 weeks living high-exercise high

    低氧訓(xùn)練作為提高耐力項(xiàng)目運(yùn)動(dòng)員運(yùn)動(dòng)能力的手段一直是體育界的研究熱點(diǎn)。近十幾年來,低氧訓(xùn)練的有效性已被國內(nèi)外學(xué)者所認(rèn)同。但由于個(gè)體對低氧環(huán)境適應(yīng)的生理反應(yīng)差異性,會(huì)產(chǎn)生不同的低氧訓(xùn)練適應(yīng)效果[1]。Friedmann B等的研究證實(shí),低氧訓(xùn)練后運(yùn)動(dòng)員紅細(xì)胞生成增多存在顯著的個(gè)體間差異[2]。大量研究表明,由于低氧訓(xùn)練適應(yīng)的生理反應(yīng)差異性,會(huì)導(dǎo)致個(gè)體低氧訓(xùn)練效果的差異性,且產(chǎn)生不同低氧訓(xùn)練效果差異性與遺傳學(xué)因素有著密切關(guān)聯(lián)[3-5]。SCIENCE雜志2010年報(bào)道,人類對低氧環(huán)境適應(yīng)與遺傳因素有著高度緊密關(guān)聯(lián)[6]。

    內(nèi)皮PAS結(jié)構(gòu)域蛋白1(endothelial PAS domain protein 1, EPAS1) 又稱低氧誘導(dǎo)因子-2α(hypoxia inducible factor-2α, HIF2α)。EPAS1在哺乳動(dòng)物各種組織的內(nèi)皮細(xì)胞中廣泛表達(dá),是慢性缺氧過程中的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子[7-8]。低氧環(huán)境下,機(jī)體內(nèi)EPAS1蛋白的穩(wěn)定性、表達(dá)量明顯增加[9],并通過識(shí)別靶基因,如促紅細(xì)胞生成素基因(erythropoietin, EPO)、血管內(nèi)皮生長因子基因(vascular endothelial growth factor, VEGF)、血管內(nèi)皮生長因子受體基因(vascular endothelial growth factor receptor, VEGFR)、乳酸脫氫酶基因-A(lactate dehydrogenase-A, LDHA)的核心序列5`-TACGTGCT-3`與低氧反應(yīng)元件(hypoxia reaction element, HRE)結(jié)合,誘導(dǎo)靶基因的轉(zhuǎn)錄,介導(dǎo)細(xì)胞對缺氧應(yīng)答,在蛋白水平發(fā)揮其低氧適應(yīng)的調(diào)節(jié)作用[10]。Yi 等在研究影響藏族與漢族人群低氧適應(yīng)遺傳因素差異中發(fā)現(xiàn),眾多低氧反應(yīng)基因頻率都有差異,其中EPAS1 差別最大,并提示EPAS1 參與了藏族的高原低氧適應(yīng)過程[11]。同時(shí),Beall 等采用Illumina Veracode 平臺(tái)以及610-Quad SNP 分型芯片分析藏族基因組SNP 變化情況發(fā)現(xiàn),與藏族低氧適應(yīng)相關(guān)聯(lián)的EPAS1基因多態(tài)位點(diǎn)大多位于該基因的內(nèi)含子序列上,最遠(yuǎn)的SNP 位點(diǎn)位于基因下游235kb 處[12]。

    鑒于此,本研究選取EPAS1基因第1內(nèi)含子序列上一重要單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(single nucleotide polymorphism, SNP)rs13419896[13],研究其與4周高住-高訓(xùn)-低氧(Living high-exercise high-training low, HiHiLo)低氧訓(xùn)練后生理表型指標(biāo)變化的關(guān)聯(lián)性,探究影響低氧訓(xùn)練期間生理表型指標(biāo)敏感變化的遺傳學(xué)標(biāo)記。

    1 研究方法

    1.1 受試對象

    本研究選取35名健康受試者(男性23名,女性12名),平均年齡19.54±2.55歲,平均身高177.94±4.27 cm,平均體重68.07±5.579 kg,均系中國北方漢族健康人群,無低氧暴露經(jīng)歷。

    1.2 研究方案

    所有受試者進(jìn)行4周高住-高訓(xùn)-低氧(Living high-exercise high-training low, HiHiLo)方案。具體包括:每天在氧濃度為15.4%常壓低氧環(huán)境(相當(dāng)于海拔2 500 m高度,低氧制造設(shè)備:Hypoxic Tent System TM”和“CAT Hatch TM”,美國)休息和睡眠,低氧暴露時(shí)間≥10 h/天(pm 8:00-am 6:00),白天在海拔50 m的常氧環(huán)境下生活、訓(xùn)練,并且在低氧實(shí)驗(yàn)期間,每周進(jìn)行3次、每次30分鐘的低氧環(huán)境下蹬功率自行車定量負(fù)荷運(yùn)動(dòng)(以基礎(chǔ)70%VO.2max強(qiáng)度為運(yùn)動(dòng)負(fù)荷,功率自行車轉(zhuǎn)速為60轉(zhuǎn)/分)。

    生理表型指標(biāo)測試:低氧實(shí)驗(yàn)前后分別進(jìn)行1次最大攝氧量(maximal oxygen uptake,VO.2max)、血象指標(biāo)(hematological parameters)、低氧定量負(fù)荷實(shí)驗(yàn)下血氧飽和度(oxygen saturation, SpO.2)的測試。VO.2max測試采用遞增負(fù)荷實(shí)驗(yàn)進(jìn)行(MedGraphicsVO.2000便攜式氣體代謝分析儀,美國),起始負(fù)荷60 W,功率車轉(zhuǎn)速為60 RPM,每3分鐘遞增30 W,直至力竭,VO.2max判定標(biāo)準(zhǔn)以心率超過180 b/min,呼吸商超過1.1,VO.2不再增加,受試者不能保持蹬車頻率等因素綜合確定;血象指標(biāo)測試要求受試者晨起后,空腹取靜脈血0.5 ml,采用BECKMAN STKS型全自動(dòng)血細(xì)胞分析儀(日本)進(jìn)行測試分析,主要包括紅細(xì)胞(RBC)、血紅蛋白(Hb)等。

    基因多態(tài)性分析:取靜脈血2 ml,2% EDTA抗凝,用promega公司全血總DNA提取專用試劑盒提取受試者DNA。EPAS1基因內(nèi)含子序列上SNP rs13419896多態(tài)性分析,依據(jù)人類EPAS1基因序列,用Primer 5. 0設(shè)計(jì)引物,引物由上海生工生物工程有限公司合成,上引物:5CTTCAGAGCAAATCAGAGGT 3,下引物:5CTCGCACCCAGATGACA 3。該位點(diǎn)應(yīng)用LifePro Thermal Cycler PCR儀(中國)進(jìn)行擴(kuò)增(20μLPCR反應(yīng)體系擴(kuò)增,包括:10×PCR 2μL, 25 mM MgCl2 1.2 μL,dNTP各10 mM 1μL,上、下引物各10 pmol 0.5 μL,Taq酶2U,模板100 ng。各種藥品均為上海生工產(chǎn)品。擴(kuò)增方案是:(1)94℃預(yù)變性5 min;(2)94 °C變性40 s,50°C退火40 s,72°C延伸40 s,35個(gè)循環(huán);(3)72°C延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物為460 bp 片段。擴(kuò)增PCR產(chǎn)物由上海生工公司測序,進(jìn)行基因分型。

    1.3 數(shù)據(jù)處理

    數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)學(xué)處理采用SPSS 11.5軟件統(tǒng)計(jì)包(SPSS software for Windows 11.5 package)完成,所有數(shù)據(jù)以[AKX-]±SD表示。采用卡方檢驗(yàn)(chi-square test)驗(yàn)證受試者人群的基因型頻率是否符合Hardy-weinberg遺傳平衡定律;低氧訓(xùn)練前后生理指標(biāo)數(shù)據(jù)先用K-S檢驗(yàn)是否符合正態(tài)分布,如符合進(jìn)行下面統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:低氧訓(xùn)練前基因型之間的生理指標(biāo)差異,采用單因素方差分析處理,基因型之間生理指標(biāo)的變化量采用協(xié)方差處理,以低氧訓(xùn)練前的初始值作為協(xié)變量進(jìn)行分析。顯著水平設(shè)為P<0.05。

    2 結(jié)果

    2.1 EPAS1基因SNPrs13419896分析

    EPAS1基因內(nèi)含子序列上SNPrs13419896位點(diǎn)分析結(jié)果見表1、圖1。SNPrs13419896位點(diǎn)中GG、GA、AA基因型頻率分別為40%、51.43%和8.57%,其中G、A等位基因頻率分別為65.71%、34.29%; SNPrs13419896經(jīng)卡方檢驗(yàn)(x2=0.70,P=0.40),符合Hardy-weinberg遺傳平衡定律,表明所選人群具有群體代表性。

    2.2 EPAS1基因SNPrs13419896與VO2max和血象指標(biāo)關(guān)聯(lián)結(jié)果

    低氧訓(xùn)練前,EPAS1基因SNPrs13419896多態(tài)位點(diǎn)各基因型組間的生理表型指標(biāo)VO.2max、rVO.2max、RBC及Hb 經(jīng)單因素方差分析顯示無統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性差異(表2)。

    4周低氧訓(xùn)練后,EPAS1基因SNPrs13419896的各基因型組間與生理表型指標(biāo)變化量分析結(jié)果見表2。結(jié)果顯示,SNPrs13419896基因型組間ΔVO.2max、ΔrVO.2max、ΔRBC及ΔHb均無顯著性差異。鑒于AA基因型只有3例,故將此基因型與其性質(zhì)相近GA基因型合并后統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn)(見圖2),GA基因型受試者經(jīng)4周低氧訓(xùn)練后,VO2max絕對值、相對值增長幅度有好于GG基因型趨勢(76.17±245.31 ml/min vs -5.29±276.42 ml/min,P=0.09;1.22±3.37 ml/min·kg vs 0.13±4.18 ml/min·kg,P=0.09)。

    3 討論

    EPAS1是HIF家族一重要成員,對哺乳動(dòng)物低氧適應(yīng)過程中發(fā)揮著重要調(diào)節(jié)作用。人類EPAS1基因全長約120 kb,位于第2號染色體(2p16-21),包含15 個(gè)外顯子和14 個(gè)內(nèi)含子,cDNA 開放閱讀框2607 bp,編碼869個(gè)氨基酸,約為96.5 kD。本研究選取該基因序列第1內(nèi)含子上SNPrs13419896位點(diǎn)研究其與低氧訓(xùn)練過程中生理適應(yīng)效果關(guān)聯(lián)性。

    從本研究對SNPrs13419896位點(diǎn)分析發(fā)現(xiàn),GG、GA、AA基因型頻率分別為40%、51.43%和8.57%,即AA基因型較少(僅為3例),這與NCBI的SNP數(shù)據(jù)庫中漢族人群基因型分布頻率基本一致。EPAS1基因SNPrs13419896的研究對于揭示人類適應(yīng)低氧環(huán)境的遺傳因素是非常重要的。已有研究證實(shí),低氧適應(yīng)良好的夏爾巴和中國藏族人群,通過長期進(jìn)化,其EPAS1基因SNPrs13419896中A等位基因頻率分別為77.2%和79%,明顯高于歐洲人群(0.009%)、日本人(33.6%)和中國北方漢族人群(30.3%)[13],柯金坤等研究顯示,對低氧環(huán)境適應(yīng)能力越好的藏族人群,SNPrs13419896位點(diǎn)中AA基因型、A等位基因頻率越高[14]。提示我們,是否具有SNPrs13419896位點(diǎn)A等位基因的平原人群進(jìn)行低氧訓(xùn)練后會(huì)產(chǎn)生較好的生理適應(yīng)效果呢,值得研究。

    本研究通過平原人群4周低氧訓(xùn)練后生理表型指標(biāo)變化與EPAS1基因SNPrs13419896關(guān)聯(lián)研究并未發(fā)現(xiàn)SNPrs13419896各基因型試者低氧訓(xùn)練后VO.2max、RBC及Hb變化差異性,但通過合并性質(zhì)相近的AA基因型(AA基因型例數(shù)僅為3例)和GA基因型進(jìn)一步分析低氧訓(xùn)練后基因型組間生理表型指標(biāo)變化發(fā)現(xiàn),GA基因型受試者低氧訓(xùn)練后,VO.2max絕對值、相對值與訓(xùn)練前相比分別提高2.2%和2.4%,而GG基因型受試者低氧訓(xùn)練后,VO.2max絕對值降低0.2%,相對值僅提高0.3%,GA基因型受試者低氧訓(xùn)練后,在VO.2max改善程度表現(xiàn)出優(yōu)于GG基因型的趨勢,但在Hb和RBC指標(biāo)變化上未發(fā)現(xiàn)基因型組間差異性。從EPAS1生物學(xué)功能分析,低氧環(huán)境下,EPAS1蛋白結(jié)構(gòu)上的氧依賴降解區(qū)(oxygen dependent degradation, ODD)不能被脯氨酸羥化酶識(shí)別并羥化,使其不能與VHL泛素2蛋白酶復(fù)合體結(jié)合,導(dǎo)致EPAS1經(jīng)蛋白水解酶而降解的途徑被抑制,從而使EPAS1蛋白穩(wěn)定增強(qiáng)、含量增加,充分發(fā)揮其誘導(dǎo)靶基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)及其生物學(xué)功能[15]。EPAS1通過識(shí)別靶基因核心序列5-TACGTGCT-3與其HRE結(jié)合,誘導(dǎo)靶基因的轉(zhuǎn)錄。在EPAS1眾多靶基因中,其對VEGF及血管內(nèi)皮生長因子受體的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)尤為明顯。研究發(fā)現(xiàn),與HIF-1α相比,EPAS1(HIF-2α)與VEGF的結(jié)合更容易,同時(shí)在表達(dá)豐富的血管內(nèi)皮中,與VEGF 的表達(dá)非常一致[16],同時(shí),通過誘導(dǎo)表達(dá)其他一系列與血管生成相關(guān)的基因,如VEGF受體(Flk-1 )以及Dll4 和Notch 信號途徑,誘導(dǎo)血管生成,并發(fā)揮著對血管的穩(wěn)定和正常功能的作用[17]。當(dāng)平原人群進(jìn)入低氧環(huán)境中,EPAS1在骨骼肌中的表達(dá)量同樣明顯提高[18]。由此推測平原人進(jìn)行低氧訓(xùn)練過程中,SNPrs13419896位點(diǎn)的GA基因型或攜帶A等位基因受試者骨骼肌中EPAS1表達(dá)量較多,從而促進(jìn)骨骼肌毛細(xì)血管增生,增加了骨骼肌細(xì)胞氧的運(yùn)輸量,導(dǎo)致VO2max明顯改善。

    此外,從EPAS1基因SNPrs13419896位點(diǎn)與紅細(xì)胞生成關(guān)聯(lián)研究發(fā)現(xiàn)[19],高原紅細(xì)胞增多癥人群和高原健康人群間SNPrs13419896位點(diǎn)基因型、等位基因頻率無顯著性差異,提示,該位點(diǎn)可能與低氧環(huán)境適應(yīng)過程中血象指標(biāo)改善無明顯關(guān)聯(lián),這與本研究結(jié)果是一致的。

    4 結(jié)論

    平原人群4周 HiHiLo低氧訓(xùn)練后,EPAS1基因第1內(nèi)含子序列上SNPrs13419896多態(tài)位點(diǎn)與VO.2max指標(biāo)變化可能存在著一定關(guān)聯(lián)性,表現(xiàn)為A等位基因攜帶者具有一定優(yōu)勢;該位點(diǎn)與血象指標(biāo)變化無關(guān)聯(lián)。

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