王堯 崔亞洲 周小燕 韓金祥
1.山東中醫(yī)藥大學(xué) 2011級 博士研究生 山東 濟(jì)南 250355
2.山東省醫(yī)藥生物技術(shù)研究中心 國家衛(wèi)生部醫(yī)藥生物技術(shù)重點實驗室 山東省罕見病重點實驗室,山東 濟(jì)南 250062
軟骨發(fā)育不全(achondroplasia,ACH,MIM:100800),又稱為胎兒型軟骨營養(yǎng)障礙(chondrodystrophia fetalis),或稱軟骨營養(yǎng)障礙性侏儒(chondrodystrophic dwarfism),是一種常染色體顯性遺傳病,外顯率為100%。這種疾病是由于軟骨內(nèi)成骨缺陷而膜性化骨正常造成的,國內(nèi)外都非常罕見,據(jù)國外研究機(jī)構(gòu)統(tǒng)計,全球發(fā)病率大概為1/77000~1/15000[1]。在這些患者中80%~90%的新生兒為散發(fā)病例,由基因突變產(chǎn)生,10%~20%則是家系遺傳導(dǎo)致。軟骨發(fā)育不全患者的臨床表現(xiàn)具有共同的特征[2-4]:四肢短小,頭大、前額突出、塌鼻梁,肘關(guān)節(jié)不能伸直,雙腿呈“O”型,伴有鴨步,隨著年齡增長變得越來越明顯;軀干部位發(fā)育正常,肋骨短,胸骨短而寬,空廓扁平,一般智力及其體力發(fā)育正常,并且性功能良好;手指方面短而粗大,呈現(xiàn)“三叉戟”狀態(tài),大拇指一組,食指跟中指為一組,無名指與小拇指為一組;脊柱主要表現(xiàn)為胸腰段后凸和椎管狹窄畸形。
成纖維生長因子受體3(fibroblast growth factor receptor 3,FGFR3)是一種發(fā)育調(diào)節(jié)的單次跨膜受體,參與和調(diào)控軟骨和長骨發(fā)育的多個階段,如軟骨細(xì)胞的增生及軟骨基質(zhì)的鈣化,是目前世界公認(rèn)引起軟骨發(fā)育不全的最主要的致病基因,其熱點區(qū)域位于第10外顯子。97%以上突變位點又集中在1138位核苷酸,其中95%為G>A的堿基轉(zhuǎn)換,其余為G>C的顛換。兩種突變都導(dǎo)致FGFR3第380位甘氨酸由精氨酸取代(G380R),從而引起FGFR3蛋白功能表達(dá)異常,影響了軟骨細(xì)胞的增生和鈣化,使軟骨發(fā)育生長受到阻礙停滯從而導(dǎo)致軟骨發(fā)育不全疾病的產(chǎn)生[5-9]。本研究主要通過毛細(xì)管測序方法對軟骨發(fā)育不全患者進(jìn)行基因篩查,以確定患者是否為軟骨發(fā)育不全。
1.1 研究對象 本實驗中以9例初步診斷為軟骨發(fā)育不全的患者及其他們的父母為研究對象,共27人。其中9例患者的年齡大多在2~5歲,身高大約在60~80cm,臨床癥狀較為典型,例如四肢短小,頭大、前額突出、塌鼻梁,肘關(guān)節(jié)不能伸直,雙腿呈“O”型,并且具有典型的“三叉手”?;颊叩母改妇鶠檎H?,沒有發(fā)病癥狀。上述參與實驗的人員均獲得并簽署了知情同意書,提供自己的DNA為研究樣本。
1.2 研究方法
1.2.1 血液DNA提?。何覀兂槿∩鲜龌颊呒捌涓改傅耐庵莒o脈血液2~3ml(EDTA抗凝混勻),采用OMEGA公司Blood DNA Midi Kit從血液中提取DNA,用紫外分光光度計對DNA進(jìn)行檢測,A260/A280約為1.82。
1.2.2 引物序列設(shè)計:本實驗依據(jù)NCBI提供的FGFR3基因序列,使用primer premier 5.0設(shè)計外顯子10的PCR擴(kuò)增所需要的引物,引物序列及退火溫度如表1所示
1.2.3 PCR擴(kuò)增:本實驗使用的PCR擴(kuò)增試劑盒是TAKALA公司的PCR Amplification Kit。每個反應(yīng)的總體積為25μl,其中反應(yīng)體系內(nèi)包括DNA模板50~200 ng,上游引物與下游引物各1μmol/L,dNTP各200μmol/L,MgCl2 1.5 mmol/L,10×PCR緩沖液2.5μl,Taq DNA聚合酶1U,其余用水補齊。熱循環(huán)儀使用的是PTC-200常規(guī)PCR儀,反應(yīng)條件如下:95℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸30s,循環(huán)35個周期,最后72℃延伸10min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,將擴(kuò)增產(chǎn)物放入1%的瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳跑膠,觀察PCR擴(kuò)增結(jié)果。擴(kuò)增片段大小為341bp。電泳結(jié)果如圖1所示。
圖1 9例軟骨發(fā)育不全患者PCR擴(kuò)增電泳圖
圖2 上述序列為反向引物測序峰圖。箭頭所示位點為患者FGFR3外顯子10的c.1138位點G>A。
圖3 上述序列為反向引物測序峰圖。箭頭所示位點為患者FGFR3外顯子10的c.1138位點G>A。
圖4 上述序列為反向引物測序峰圖。箭頭所示位點為正常家屬FGFR3外顯子10的c.1138位點。
1.2.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物純化及其測序:將擴(kuò)增好的PCR產(chǎn)物用純化試劑盒進(jìn)行純化,去除產(chǎn)物中的非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物及其引物二聚體等雜質(zhì),本實驗使用的試劑盒是QIAGEN公司QIAquick PCR Purification Kit。將純化好的產(chǎn)物送去華大基因測序部,使用ABI公司的3730XL測序儀對純化產(chǎn)物進(jìn)行測序。
對FGFR3外顯子10測序分析 通過對9例患者及其父母進(jìn)行FGFR3外顯子10測序,我們重點分析了1138位點核苷酸及1123位點核苷酸突變情況。其中9例初步診斷為軟骨發(fā)育不全患者的測序圖譜中,在1138位點處均出現(xiàn)了雜合峰圖(c.1138 G>A),而1123位點沒有雜合峰圖,表明這些病人確實是軟骨發(fā)育不全患者。而在患者的父母測序峰圖中,1138位點核苷酸及1123位點核苷酸均沒有發(fā)現(xiàn)雜合峰圖,表明患者父母均為正常。這結(jié)果提示在中國的人群中FGFR3外顯子10的1138位點核苷酸突變也是導(dǎo)致軟骨發(fā)育不全疾病產(chǎn)生的原因[10]。在這9對家庭中,患者都屬于散發(fā)病例,沒有出現(xiàn)家族遺傳性,這與先前文獻(xiàn)報道的70%~80%軟骨發(fā)育不全患者屬于散發(fā)病例基本一致[11-12]。此外,這些病例中都為c.1138 G>A,沒有出現(xiàn)c.1138 G>C,這也與國外報道基本一致[11-12]。圖2和圖3是其中兩個患者的基因測序峰圖,圖4為其中一個患者家屬的測序峰圖。
軟骨發(fā)育不全是一種罕見的常染色體顯性遺傳疾病,外顯率為100%,發(fā)病率為1/77000~1/15000[1],由基因突變產(chǎn)生。成纖維生長因子受體3(FGFR3)是引起軟骨發(fā)育不全的最重要的致病基因,其本質(zhì)是酪氨酸激酶受體,由細(xì)胞外糖基化配體結(jié)合區(qū)、疏水跨膜區(qū)和細(xì)胞內(nèi)酪氨酸激酶催化區(qū)3部分組成[13]。Shiang等[14]1994年通過聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)結(jié)合單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)和限制性內(nèi)切酶酶解的方法對軟骨發(fā)育不全患者進(jìn)行基因篩查發(fā)現(xiàn)患者FGFR3基因都有突變,而且突變位置都位于FGFR3疏水跨膜區(qū),提示疏水跨膜區(qū)可能是影響軟骨發(fā)育的熱點區(qū)域。Perez-Custro等[15]進(jìn)一步對FGFR3基因進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)該基因長約15Kb,共有19個外顯子以及18個內(nèi)含子,其中引起軟骨發(fā)育不全的突變位點在第10號外顯子上,恰巧此外顯子編碼FGFR3基因的疏水跨膜區(qū),進(jìn)一步明確該基因突變位點與疏水跨膜區(qū)有密切聯(lián)系。
FGFR3基因主要由兩處堿基位點突變來引起軟骨發(fā)育不全,分別是:c.1138 G>A和c.1138 G>C,屬于單堿基突變。這兩種堿基突變的結(jié)果導(dǎo)致編碼的第380位氨基酸由甘氨酸(Gly)轉(zhuǎn)變成精氨酸(Arg),使蛋白質(zhì)功能發(fā)生改變,從而引起軟骨發(fā)育不全。其中97%軟骨發(fā)育不全患者都是由這兩種堿基突變造成,又以c.1138 G>A為主要突變方式,所占比例達(dá)到95%以上。本研究中,我們在9例散發(fā)的軟骨發(fā)育不全患者上檢測到FGFR3基因第10外顯子G380R突變,結(jié)果支持G380R是ACH最常見的突變這一結(jié)論,并且證明這種高度一致性的突變在中國ACH患者中也存在[10]。9名患者的G380R突變都是由于FGFR3基因1138位核苷酸G>A轉(zhuǎn)換所致,未檢測到G>C顛換,與西方國家、日本報道的研究結(jié)果相似[16-17]。除此之外,1995年瑞典和日本的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了第三處堿基突變位點,他們在一例散發(fā)和一例家系中分別發(fā)現(xiàn)了c.1123 G>T,導(dǎo)致編碼的第375位氨基酸由甘氨酸(Gly)轉(zhuǎn)變成半胱氨酸(Cys),但此類突變發(fā)生的概率很低,占所有突變比例的1%~2%[18-19],在本實驗中所有患者及其父母在這個位點均沒有發(fā)現(xiàn)此類型突變。
本實驗采用毛細(xì)管測序方法檢測患者FGFR3基因突變,這種方法是目前最直接,最有效的檢測基因突變方法之一。由于引起此疾病的熱點突變都集中在FGFR3的外顯子10中,因而可以通過這種方法對患者及其疑似患者做基因水平診斷,從而可以準(zhǔn)確的判定患者是否如軟骨發(fā)育不全,加以針對性救治。除此之外,毛細(xì)管測序還可以應(yīng)用于產(chǎn)前診斷及胎兒檢查,以判定胎兒是否為軟骨發(fā)育不全患者。在未來,通過對基因測序的方式來診斷軟骨發(fā)育不全必定有著較為廣泛的應(yīng)用前景。
1.Baujat G,Legeai-Mallet L,Finidori G,et al.Achondroplasia.Best Pract Res Clin Rheumatol,2008,22(1):3-18.
2.Carter EM,Davis JG,Raggio CL.Advances in understanding etiology of achondroplasia and review of management.Curr Opin Pediatr,2007,19(1): 32-37.
3.鐘玉敏,朱銘,陳樹寶等.永存第五對主動脈弓[J].罕少疾病雜志,2000,7(1): 1-2.
4.王成林,林貴.罕見病少見病的診斷與治療[M].北京: 人民衛(wèi)生出版社,1999,215-216.
5.Richette P,Bardin T,Stheneur C.Achondroplasia: from genotype to phe-notype.JointBone Spine,2008,75(2):125-130.
6.Hung CC,Lee CN,Chang CH,et al.Genotyping of the G138A mutationof the FGFR3 gene in patientswith achondroplasia using high-resolutionmelting analysis.Clin Biol,2008,41(3):162-166.
7.Patil SJ,Banerjee M,Phadke SR,et al.Mutation analysis in indian chil-dren with achondroplasiautility ofmolecular diagnosis.Indian J Pediatr,2009,76(2):147-149.
8.Reddy PL,Grewal RP.The G1138A mutation rate in the fibroblast growthfactor receptor3 (FGFR3)gene is increased in cells carrying the t(4;14)translocation.Genet Mol Res,2009,8(2): 435-439.
9.Zhang SR,Zhou XQ,Ren X,et al.Ser217Cys mutation in the Ig II do-main of FGFR3 in a Chinese familywith autosomal dominant achondroplasia.Chin Med J,2007,120(11): 1017-1019.
10.麻宏偉,姜俊,呂峻峰等.FGFR3基因突變分析在產(chǎn)前診斷及短肢畸形胎兒中的應(yīng)用.中國實用兒科雜志,2005,20:242-243.
11.Bellus GA,Hefferon TW,Ortiz de Luna RI,et al.Achondroplasia is defined by recurrent G380R mutations of FGFR3.Am J Hum Genet,1995,56(2):368-373.
12.Ornitz DM,Marie PJ.FGF signaling pathways in endochondral and intramembranous bone developmentand human genetic disease.Genes Dev,2002,16(12): 1446-1465.
13.Benoist-Lasselin C,Gibbs L,Heuertz S,et al.Human immortalized chondrocytes carrying heterozygous FGFR3mutations: An in vitromodel to study chondrodysplasias.FEBS Letters.2007; 581:2593-2598.
14.Shiang R,Thompson LM,Zhu YZ,et al.Mutations in the transmembrane of FGFR3 causes the most common genetic form of dwarfism,achondroplasia.Cell,1994,78(2):335.
15.Perez-Castro AV,Wilson J,Altherr MR.Genomic organi-zation of the human fibroblast growth factor receptor 3 (FGFR3)gene and comparative sequence analysis with the mottse FGFR3 gene.Genomics,1997,41:10.
16.Lazarus JE,Hegde A,Andrade AC,et al.Fibroblast growth factor expression in the postnatal growth plate.Bone.2007; 40: 577-586.
17.Baca KE,Abdullah MA,Ting BL,et al.Surgical decompression for lumbar stenosis in pediatric achondroplasia.J Pediatr Orthop.2010; 30:449-454.
18.Ikegawa S,Fukushima Y,Isomura M,et al.Mutation of the fibroblast growth factor receptor 3 gene in one familial and six sporadic cases of achondroplas in Japanese patients.Hum Genet,1995,96:309-311.
19.Superti-Furga A,Eich G,Bucher HU,et a1.A glycine 375 to cysteine substitution in the transmembrane domain of the fibroblast growth factor receptor 3 in a newborn with achondroplasia.Eur J Pediatr,1995,154:215-219.