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    煙草C3HC4型鋅指蛋白的原核表達(dá)及轉(zhuǎn)基因植株功能研究

    2014-07-12 05:42:56伍文憲楊秀芬劉勇邱德文
    生物技術(shù)通報 2014年7期
    關(guān)鍵詞:鋅指原核拷貝

    伍文憲 楊秀芬 劉勇 邱德文

    (1. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,北京 100081;2. 四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,成都 610066)

    鋅指蛋白是真核生物基因組中最豐富的一類轉(zhuǎn)錄因子,最初于1983年被發(fā)現(xiàn)存在于非洲爪蟾卵母細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄因子TFIIIA中[1],鋅指結(jié)構(gòu)由多個半胱氨酸或(和)組氨酸組成,通過鋅離子來維持結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。鋅指蛋白通過與目的基因的DNA或RNA結(jié)合,或與其他蛋白之間的相互作用來調(diào)控基因表達(dá)。根據(jù)半胱氨酸(C)和組氨酸(H)殘基數(shù)及在蛋白中的位置,可將含鋅指結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子分為C2H2、C2C2、C3H、C3HC4(Zinc finger)和C3HC5(LIM finger)5個亞類[2],C3HC4鋅指蛋白具有較為簡單的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)[3],由能結(jié)合兩個離子的4對雙配體構(gòu)成,不僅能結(jié)合DNA,還能與RNA,蛋白質(zhì)和脂質(zhì)結(jié)合[4]。C3HC4鋅指蛋白參與基因轉(zhuǎn)錄與重組,細(xì)胞間信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等各種生命過程,也能在蛋白間互作以及泛素化進(jìn)程中發(fā)揮重要作用,許多C3HC4鋅指蛋白本身就是E3泛素化連接酶,介導(dǎo)泛素化目標(biāo)蛋白的轉(zhuǎn)移[5]。

    植物C3HC4型鋅指蛋白基因的研究多集中在擬南芥與水稻[6]。為人們所熟知的擬南芥C3HC4型鋅指蛋白有AtCOP1(參與光反應(yīng))、AtCIP8(參與光形態(tài)建成)[7]、AtTED3(參與光信號傳導(dǎo))[8]、AtRMA1(參與分泌途徑)[9]、AtXB3(參與根的發(fā)育)[10]、AtSDIR1(抗逆反應(yīng))[11]等。在水稻中,研究比較深入的C3HC4型鋅指蛋白大多與光形態(tài)建成有關(guān),主要包括OsCOP1、OsCOIN1、OsXB3.1和OsRHC1[7]。目前,尚無對煙草中C3HC4型鋅指蛋白的研究報道,本研究以誘導(dǎo)植物抗性的蛋白激發(fā)子Hrip1為誘餌蛋白,從煙草cDNA文庫中首次獲得本生煙C3HC4型鋅指蛋白基因NbZFP1,建立該蛋白大腸桿菌體外重組表達(dá)系統(tǒng),獲得轉(zhuǎn)基因煙草植株并分析轉(zhuǎn)化株的表型特征和抗病功能,以期為進(jìn)一步研究煙草C3HC4型RING鋅指蛋白在生長發(fā)育以及蛋白激發(fā)子誘導(dǎo)植物抗性分子機(jī)制中的功能奠定基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 植物材料 本生煙種子由本實(shí)驗(yàn)室保藏。

    1.1.2 載體和菌株 原核表達(dá)載體pGEX-6P-2與pMAL-C2X、植物表達(dá)載體pBI121、農(nóng)桿菌菌株GV3101均由本實(shí)驗(yàn)室保存,TMV-GFP病毒由清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院劉玉樂教授提供,大腸桿菌感受態(tài)BL21購自北京全式金公司。

    1.1.3 儀器與試劑 蛋白純化儀AKTA explorer 900(Amersham公司);地高辛分子檢測試劑盒(Roche公司);植物組織RNA提取試劑盒(北京全式金公司);mRNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒(北京全式金公司);各化學(xué)試劑均購自AMRESCO公司。

    1.2 方法

    1.2.1 總RNA提取及cDNA第一鏈的合成 采用植物組織RNA提取試劑提取本生煙總RNA,取2 μg mRNA用于cDNA第一鏈的合成(具體方法參見北京全式金公司反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書)。

    1.2.2NbZFP1的克隆與序列測定 以從煙草cDNA文庫中獲得的一段約200 bp的序列為信息探針,搜索本生煙SGN mRNA序列庫,同源比較,設(shè)計一對特異性PCR引物:F-NbZFP1:5'-CG GGATCCATGTCACTTTCTGGTCGT-3',R-NbZFP1:5'-GCGTCGACTCAGGTTTTCAGCCCTGT-3'(引物由北京華大公司合成)。PCR程序擴(kuò)增目的基因:94℃預(yù)變性2 min;94℃變性30 s,55℃復(fù)性30 s,72℃延伸1 min,30個循環(huán);最后72℃延伸10 min。目的條帶經(jīng)膠回收純化后連接到pEASY-Blunt-Zero載體中,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞Trans5α,測序由北京華大公司完成。

    1.2.3NbZFP1原核表達(dá)重組質(zhì)粒的構(gòu)建 質(zhì)粒提取、雙酶切、連接及轉(zhuǎn)化等參照試劑說明書和相關(guān)的分子生物方法[12],簡要操作步驟如下:提取原核表達(dá)載體pGEX-6P-2、pMAL-C2X以及測序正確的pEASY-Blunt-Zero-NbZFP1轉(zhuǎn)化子質(zhì)粒,用限制性內(nèi)切酶BamH I和SalI雙酶切并回收載體片段及目的基因片段NbZFP1,22℃連接15 min后轉(zhuǎn)化至表達(dá)宿主菌E. coliBL21(DE3)中,過夜培養(yǎng),待長出單菌落,挑取單菌落為模板進(jìn)行菌落PCR,篩選出陽性轉(zhuǎn)化子后送測序,將驗(yàn)證無誤的轉(zhuǎn)化子分別命名為pGEX-6P-2-NbZFP1和pMAL-C2X-NbZFP1。

    1.2.4NbZFP1蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)和檢測 挑取pGEX-6P-2-NbZFP1、pMAL-C2X-NbZFP1、pGEX-6P-2空載體和pMAL-C2X空載體單菌落,分別接種于50 mL含Amp(終濃度為100 μg/mL)的液體LB培養(yǎng)基中,37℃ 220 r/min振蕩培養(yǎng)6-7 h,按1∶100 的比例稀釋到1 L含Amp(100 μg/mL)新鮮液體LB培養(yǎng)基中,37℃ 220 r/min振蕩培養(yǎng)4 h,溫度調(diào)至16℃,轉(zhuǎn)速調(diào)至200 r/min,待溫度降至16℃后,加入終濃度為0.1 mmol/L IPTG誘導(dǎo)培養(yǎng)過夜,次日將菌液分別轉(zhuǎn)入離心桶中,4℃,5 000 r/min 離心15 min,棄上清,向沉淀中加入40-50 mL pH8.0的Tris緩沖液重懸,之后進(jìn)行超聲破碎處理,待超聲波破碎完全,4℃,12 000 r/min離心50 min,取上清,用相應(yīng)的預(yù)裝親和層析柱初步純化,收集洗脫液以及穿透液,洗脫液經(jīng)脫鹽后,用蛋白純化儀AKTA explorer 900離子交換層析,收集各個洗脫峰。各個樣品通過變性聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)進(jìn)行分析。SDSPAGE試劑的配制及方法參照文獻(xiàn)[13] 。

    1.2.5 目標(biāo)基因轉(zhuǎn)化煙草 利用Primer 5.0軟件設(shè)計1對特異性引物5'-CGATGTCACTTTCTGGTCGT-3'(下劃線為BamH I酶切位點(diǎn))和5'-GCTCAGGTTTTCAGCCCTGT-3'(下劃線為SalI酶切位點(diǎn))擴(kuò)增NbZFP1的開放閱讀框,連接至pEASY-Blunt-Zero載體中,之后用BamH I和SalI雙酶切,同時雙酶切載體pBI121,然后用T4 DNA連接酶連接獲得融合載體pBI121-NbZFP1,用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤浸染法[14]將融合載體pBI121-NbZFP1轉(zhuǎn)化到野生型本生煙中,葉盤置于培養(yǎng)基(MS+0.1 mg/mL NAA+1 mg/mL BA+3%蔗糖+0.375% phytagel,pH5.7)2℃暗培養(yǎng)2 d,將葉盤轉(zhuǎn)移至分化培養(yǎng)基(MS+0.1 mg/mL NAA+1 mg/mL BA+3%蔗糖+500 mg/mL頭孢霉素+100 mg/mL卡那霉素+0.375%phytagel,pH5.7),光照培養(yǎng)一個月左右,保持28-30℃,每10 d更換一次分化培養(yǎng)基,待分化出小苗后,將苗轉(zhuǎn)移至生根培養(yǎng)基(MS+0.1 mg/mL NAA+3%蔗糖+250 mg/mL頭孢霉素+80 mg/mL卡那霉素+0.375% phytagel,pH5.7),最終獲得轉(zhuǎn)基因煙草。

    1.2.6 轉(zhuǎn)基因煙草的分子鑒定 用植物組織基因組DNA試劑盒(北京全式金公司)提取長勢較好的T0代轉(zhuǎn)基因煙草基因組DNA,以pBI121載體上一段1 000 bp左右特異性高的序列設(shè)計引物,PCR鑒定陽性植株。將陽性煙草植株做Southern雜交試驗(yàn),Southern鑒定按試劑盒說明書進(jìn)行。

    1.2.7 株高及節(jié)間長的測定 溫室培養(yǎng)T0代陽性轉(zhuǎn)基因煙草,獲得T1代種子,分別在溫室中培養(yǎng)野生型本生煙與T1代轉(zhuǎn)基因本生煙,待長至四葉期后每隔10 d測量株高及節(jié)間長。

    1.2.8 轉(zhuǎn)基因煙草抗病性測定 分別選取培養(yǎng)20 d左右的T1代轉(zhuǎn)基因煙草和野生型煙草,在煙草中部葉片上用棉棒涂抹含TMV-GFP的PBS緩沖液,重復(fù)3次。3 d后在紫外燈下觀察發(fā)病情況[15]。

    2 結(jié)果

    2.1 NbZFP1的克隆

    利用設(shè)計的特異性PCR引物,從本生煙的cDNA中擴(kuò)增了一條576 bp產(chǎn)物,命名為NbZFP1。同時將其克隆到平末端載體pEASY-Blunt-Zero中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans5α,獲得的轉(zhuǎn)化子經(jīng)菌落PCR及測序后,經(jīng)序列比對與數(shù)據(jù)庫中序列完全一致。

    2.2 NbZFP1的原核表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建

    原核表達(dá)載體pGEX-6P-2在其多克隆位點(diǎn)上游有一個谷胱甘肽-s-轉(zhuǎn)移酶編碼序列,目的基因在不改變閱讀框架的條件下插入多克隆位點(diǎn)(MCS),在轉(zhuǎn)化大腸桿菌后經(jīng)過異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)的誘導(dǎo)及相應(yīng)條件的優(yōu)化,就可表達(dá)出與谷胱甘肽-s-轉(zhuǎn)移酶融合的蛋白。將之前構(gòu)建好的克隆子用BamH I和SalI雙酶切并回收目的條帶后,與同樣使用BamH I和SalI雙酶切過的表達(dá)載體pGEX-6P-2連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21,通過菌落PCR及測序驗(yàn)證陽性轉(zhuǎn)化子。

    原核表達(dá)載體pMAL-C2X在其多克隆位點(diǎn)上游有一個麥芽糖結(jié)合蛋白編碼序列,設(shè)計引物時在反向引物添加6個組氨酸密碼子,這樣在誘導(dǎo)表達(dá)時C末端含6個His標(biāo)簽,可以用His親和層析柱純化。pMAL-C2X載體可以較高幅度的提高目標(biāo)蛋白的可溶性。pMAL-C2X-NbZFP1的構(gòu)建與pGEX-6P-2-NbZFP1一致。

    2.3 NbZFP1的原核表達(dá)檢測

    將構(gòu)建好的含有NbZFP1基因的原核表達(dá)載體pGEX-6P-2-NbZFP1、pMAL-C2X-NbZFP1和空白對照質(zhì)粒pGEX-6P-2、pMAL-C2X分別轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),經(jīng)IPTG誘導(dǎo)后,表達(dá)產(chǎn)物經(jīng)親和層析,離子交換層析純化后,進(jìn)行SDS-PAGE凝膠電泳分析,經(jīng)考馬斯亮藍(lán)染色成像。由于所克隆的基因約為576 bp,所以編碼蛋白分子量約為24 kD,表達(dá)載體pGEX-6P-2上的GST蛋白約26 kD,因此pGEX-6P-2-NbZFP1融合蛋白的分子量約為50 kD。而pMAL-C2X上的MBP標(biāo)簽蛋白約為45 kD,因此pMAL-C2X-NbZFP1融合蛋白的分子量為69 kD。SDS-PAGE結(jié)果(圖1,圖2)顯示,在預(yù)計的大小處有明顯的深染蛋白條帶,而空載對照只分別在25 kD和45 kD有條帶,說明已成功構(gòu)建了pGEX-6P-2-NbZFP1以及pMAL-C2X-NbZFP1基因原核表達(dá)載體,并在大腸桿菌中成功表達(dá)。

    圖1 pGEX-6P-2-NbZFP1表達(dá)產(chǎn)物SDS-PAGE分析

    圖2 pMAL-C2X-NbZFP1表達(dá)產(chǎn)物SDS-PAGE分析

    2.4 轉(zhuǎn)NbZFP1基因的煙草植株獲得

    將攜帶NbZFP1基因的過表達(dá)載體pBI-121-NbZFP1通過電擊法轉(zhuǎn)化至農(nóng)桿菌GV3101中,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤轉(zhuǎn)化法,侵染本生煙葉片,再經(jīng)共培養(yǎng)、分化培養(yǎng)后,將分化出的抗性苗剪下轉(zhuǎn)移至生根培養(yǎng)基中,4周左右得到生根的抗性苗。

    選取野生型本生煙植株和在抗性培養(yǎng)基上生根的轉(zhuǎn)基因本生煙株系,用植物基因組DNA提取試劑盒提取煙草葉片基因組DNA。選取pBI121載體上特性較高的約1 000 bp的片段設(shè)計引物,結(jié)果(圖3)顯示,在18個煙草轉(zhuǎn)化株系中,8個轉(zhuǎn)化株系能穩(wěn)定擴(kuò)增出pBI121載體上一段1 000 bp左右特異性條帶,與陽性對照大小一致,初步說明NbZFP1基因已成功轉(zhuǎn)化煙草。

    圖3 T0代轉(zhuǎn)基因煙草基因組DNA PCR擴(kuò)增結(jié)果

    隨機(jī)挑選的3個PCR陽性的T0代植株用于Southern blot,均檢測到目的基因的整合,一個株系為單拷貝,兩個株系為多拷貝,而在非轉(zhuǎn)基因?qū)φ罩袥]有檢測到雜交條帶,說明NbZFP1已成功整合到煙草基因組(圖4)。

    圖4 轉(zhuǎn)基因植株的Southern雜交鑒定結(jié)果

    2.5 NbZFP1對三生煙表型及抗病性的影響

    將單拷貝的T1代轉(zhuǎn)基因種子及野生型煙草種子分別培養(yǎng)于1/2MS培養(yǎng)基,生長1周左右,將幼苗移栽至土中,待四葉期后,每隔10 d分別測量野生型和轉(zhuǎn)基因煙草株高及節(jié)間長,直至第60天。結(jié)果(圖5-圖7)顯示,單拷貝T1代轉(zhuǎn)基因煙草植株相對野生型有明顯矮化,株型緊湊,節(jié)間縮短。利用TMV-GFP接種于煙草后,通過TMV-GFP熒光強(qiáng)度分析判斷抗病能力的方法,將TMV-GFP分別接種于轉(zhuǎn)基因和野生型煙草中部葉面大小一致的葉片上,重復(fù)3次。3 d后在紫外燈下觀察,發(fā)現(xiàn)野生型煙草葉片上綠色熒光強(qiáng)度高于轉(zhuǎn)基因植株(圖8),說明單拷貝的轉(zhuǎn)NbZFP1基因植株抗病性強(qiáng)于野生型植株。

    3 討論

    圖5 T1代單拷貝轉(zhuǎn)基因煙草與野生型煙草平均節(jié)間長比較

    圖6 T1代單拷貝轉(zhuǎn)基因煙草與野生型煙草不同時間株高比較

    圖7 T1代單拷貝轉(zhuǎn)基因煙草與野生型煙草

    鋅指蛋白普遍存在于植物中,它們在調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育及非生物應(yīng)答等多種重要的生命過程中起著不可替代的作用。目前,在植物中對鋅指蛋白家族的研究主要集中在C2H2型,對C3HC4型的研究比較少,尤其是對煙草C3HC4行鋅指蛋白的研究未見報道。本實(shí)驗(yàn)室利用酵母雙雜交技術(shù)篩選蛋白激發(fā)子Hrip1互作過程中,首次從煙草cDNA文庫中篩選到了一個C3HC4型鋅指蛋白,通過病毒介導(dǎo)的基因沉默(VIGS)技術(shù)發(fā)現(xiàn)該蛋白能影響煙草果實(shí)發(fā)育(另文發(fā)表)。本研究構(gòu)建了本生煙NbZFP1基因的原核表達(dá)載體,獲得了在大腸桿菌中大量表達(dá)不同標(biāo)簽的融合蛋白,同時利用親和層析、離子交換層析以及分子篩技術(shù)分離純化了不同NbZFP1融合蛋白,為進(jìn)一步研究該蛋白影響煙草果實(shí)發(fā)育的作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ),同時為今后利用不同技術(shù)研究蛋白互作,如GST-Pull down、免疫共沉淀、Biacore等提供了純化的蛋白樣品。

    圖8 TMV-GFP侵染野生型及轉(zhuǎn)基因煙草后葉片情況

    利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)基因方法將NbZFP1基因在煙草植株中過表達(dá),結(jié)果發(fā)現(xiàn)單拷貝的T1代轉(zhuǎn)基因煙草植株表現(xiàn)出株型緊湊、節(jié)間縮短。這個結(jié)果與其他植物中所報道的鋅指蛋白功能上有相似之處,如矮牽牛中鋅指蛋白EPF家族基因,以及擬南芥中鋅指蛋白SUPERMAN、NNT 控制其生殖發(fā)育[16-18],水稻鋅指蛋白基因PROG1在株型發(fā)育調(diào)控和馴化中起重要作用[19],水稻鋅指蛋白基因OsZRL沉默后能對根系及植株的生長具有促進(jìn)作用[20]。在前人研究報道的基礎(chǔ)上,猜測NbZFP1可能是作為轉(zhuǎn)錄因子通過某種機(jī)制參與到生長素信號傳導(dǎo)或生長素/細(xì)胞分裂素信號傳導(dǎo),從而影響煙草的生長發(fā)育,本研究得到的單拷貝轉(zhuǎn)基因植株為下一步研究該蛋白的分子機(jī)制提供了試驗(yàn)材料。

    在擬南芥中,含有類LSD1(組蛋白賴氨酸特異性脫甲基酶)鋅指結(jié)構(gòu)域的LSD1相關(guān)蛋白參與抗病反應(yīng)和細(xì)胞程序性死亡,在水稻中,編碼鋅指蛋白的OsLOL2基因通過調(diào)節(jié)PR蛋白含量參與調(diào)控水稻的生長和抗?。?1]。推測本試驗(yàn)轉(zhuǎn)NbZFP1基因煙草可能也是通過上調(diào)PR基因達(dá)到抗病性增強(qiáng)目的。為此,作者將在下一步試驗(yàn)中驗(yàn)證NbZFP1基因是否參與相應(yīng)PR基因的表達(dá)。

    4 結(jié)論

    本研究以蛋白激發(fā)子Hrip1為誘餌蛋白,從煙草cDNA文庫中首次獲得本生煙C3HC4型鋅指蛋白,命名為NbZFP1。將該蛋白基因構(gòu)建于原核表達(dá)載體pGEX-6P-2及pMAL-C2X上并分別轉(zhuǎn)化至大腸桿菌中,經(jīng)誘導(dǎo)表達(dá)得到大量可溶性重組蛋白,通過親和層析技術(shù)、離子交換層析等純化技術(shù)獲得了純度較高、性質(zhì)穩(wěn)定的GST-NbZFP1、MBP-NbZFP1蛋白。構(gòu)建植物表達(dá)體系,將NbZFP1基因轉(zhuǎn)化本生煙,經(jīng)Southern blot檢測獲得了單拷貝轉(zhuǎn)NbZFP1基因本生煙株系。與野生型煙草植株相比,T1代單拷貝轉(zhuǎn)基因植株株型緊湊、節(jié)間縮短、莖干粗壯。同時,NbZFP1基因過表達(dá)可以顯著提高植株對TMV的抗病性。

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