焦 韋, 付 虹, 徐曉瑩, 高恩軍
(1.沈陽化工大學(xué)應(yīng)用化學(xué)學(xué)院,遼寧沈陽 110142;2.沈陽市無機(jī)分子基材料化學(xué)(國際)重點(diǎn)實驗室,遼寧沈陽 110142)
在過去幾年中,配合物的分子結(jié)構(gòu)和生物活性在無機(jī)化學(xué)領(lǐng)域受到人們更多的關(guān)注.鎳(Ⅱ)是一種常見的過渡金屬,一般具有2種配位形式:四配位和六配位[1-3].鎳(Ⅱ)的配位方式取決于配體結(jié)構(gòu)、溶劑和反應(yīng)條件,其中配體起決定性作用.它不僅可以確定分子結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,協(xié)調(diào)超分子的新穎聚集方式[4-5],還可與 DNA和各種生物活性相互作用[6-10].吡嗪是非常好的橋聯(lián)配體,金屬離子可通過它的軌道重疊達(dá)到相互間的電子偶合.因而吡嗪可看做一個潛在的磁交換媒介.羧酸配體也可做為橋聯(lián)基團(tuán)為金屬提供磁交換作用的途徑.然而對于同時將含有這2類基團(tuán)的吡嗪二羧酸類化合的研究并不常見.本文采用吡嗪-2,3-二羧酸為配體,合成新穎的配合物 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O 單晶,并通過2個吡嗪-2,3-二羧酸配體以氮原子和氧原子與鎳(Ⅱ)離子反式螯合配位.通過X-射線衍射結(jié)構(gòu)分析表明,鎳(Ⅱ)形成一個八面體幾何形狀,通過氫鍵的弱相互作用使整體結(jié)構(gòu)穩(wěn)定.應(yīng)用紫外光譜法和熒光光譜法,初步證實配合物與DNA相互間以插入作用為主.與此同時,又用凝膠電泳法測定配合物對pBR-322質(zhì)粒DNA的切割能力.
從商業(yè)來源所獲得的化學(xué)品試劑均為分析純,不經(jīng)進(jìn)一步純化,直接使用.通過Finnigan EA 1112元素分析儀,Nicolet 470紅外光譜儀,Bruker Smart 1000 CCDX射線晶體衍射儀,Shimadzu UV-240紫外-可見分光光度計,Perkin Elmer LS55熒光分光光度計以及JS-380A自動凝膠圖像分析儀對配合物的結(jié)構(gòu)、特性以及生物活性進(jìn)行初步研究.
將10 mL濃度為10 mmol/L的硝酸鎳水溶液與20 mL濃度為10 mmol/L的吡嗪-2,3-二羧酸水溶液混合,在連續(xù)攪拌下,用0.5 mol/L的KOH調(diào)節(jié)混合溶液pH值為6.3,攪拌8 h后pH值相對穩(wěn)定為7.52.將該溶液過濾至燒杯中,在室溫下放置16 d后有淡綠色晶體析出.
元素分析實測值(%,C12H8N4NiO10計算值):C 33.74(33.76);H 41.86(41.89);N 13.13(13.12).
紅外圖譜顯示(cm-1;s,強(qiáng)峰;m,中峰;w,弱峰):3 404(m);2 360(m);1 636(m);1 609(m);1 438(m);1 395(m);1 129(m);668(m).
選取尺寸為0.13 mm×0.05 mm×0.08 mm的配合物單晶.在BruckerSmart 1000 CCDX單晶衍射儀上,以經(jīng)過石墨單色器的Mo-Ka為靶源(λ =0.071 073 nm),在2.84°<2θ<26.02°范圍內(nèi)收集衍射數(shù)據(jù).在293 K下,以ω-2θ方式共收集了4 610個衍射數(shù)據(jù),其中獨(dú)立數(shù)據(jù)1 479個[R(int)=0.0218],-11≤ h ≤ 10,-9≤ k≤9,-12≤ l≤12,R 最終指數(shù)(I>2σ(I)):R1=0.036 9,wR2=0.092 8;R 指數(shù)(所有數(shù)據(jù)):R1=0.040 4,wR2=0.095 5.部分配合物鍵長鍵角如下:
配合物晶體結(jié)構(gòu)中主要的鍵長(nm)如下:Ni(1)—N(1):0.204(2)nm;Ni(1)—O(4):0.202(2)nm;Ni(1)—O(5):0.212(2)nm.
配合物晶體結(jié)構(gòu)中主要的鍵角(°)如下:N(1)—Ni(1)—O(4):79.26(8)°;N(1)—Ni(1)—O(5):91.08(8)°;O(4)—Ni(1)—O(5):90.28(8)°.
從晶體結(jié)構(gòu)(見圖1)可以看出,配合物Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O 是由 2個吡嗪-2,3-二羧酸為配體的單核配合物,Ni(Ⅱ)分別與2個Pyzdc配體上的羧酸氧和氮以及2個水分子中的氧形成八面體結(jié)構(gòu).該分子存在穿過Ni(Ⅱ)的中心對稱.配體的羧酸與其Ni(Ⅱ)的距離(Ni(1)—O(4))為0.202(2)nm.C(6)—O(3)的距離為0.126(4)nm、C(6)—O(4)的距離為0.125(4)nm,這兩個距離很相近,說明羧酸的3個原子O—C—O之間存在某種程度的共軛使C—O鍵長發(fā)生了平均化.從圖2可以看出,每個配合物之間通過C—O…H的氫鍵作用,形成穩(wěn)定的一維結(jié)構(gòu),其中 O(1)—H(5A)、O(2)—H(5A)的距離分別為0.206 nm、0.275 nm.與此同時,在圖3中可以看到,通過O(1)與H(5B)之間C—O…H的氫鍵作用,形成了二維空間結(jié)構(gòu).其中O(1)—H(5B)之間的距離為0.211 nm.
圖1 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O 的分子結(jié)構(gòu)Fig.1 Molecular structure of Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O
圖2 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O的一維鏈結(jié)構(gòu)Fig.2 One-dimensional chain structure of Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O
圖3 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O的二維鏈結(jié)構(gòu)Fig.3 Two-dimensional structure of Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O
DNA分子在波長為260 nm處具有典型的吸收峰,這是由核酸中有堿基共軛雙鍵存在.在波長為260 nm處,DNA雙螺旋分子的吸光度值比DNA分子中各堿基的吸光度值的和要小很多,這種現(xiàn)象被稱為“減色效應(yīng)”.這是由于DNA分子中各堿基平行、緊密的堆疊所引起的.
配合物與CT-DNA(CT-DNA是小牛胸腺DNA)相互作用的紫外光譜如圖4所示.由圖4可知,在波長為190~360 nm范圍內(nèi)有多個吸收峰.相同濃度 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O(2.0×10-5mol/L)摻入到不同濃度DNA后,對應(yīng)285 nm左右的吸光度值逐漸減小,表現(xiàn)為比較明顯的減色效應(yīng),DNA的最大吸收峰發(fā)生藍(lán)移現(xiàn)象.當(dāng)配合物與DNA堿基對以插入方式結(jié)合時,由于配體與堿基的π*空間和π電子軌道發(fā)生偶合現(xiàn)象,使能級發(fā)生變化,從而導(dǎo)致藍(lán)移現(xiàn)象的產(chǎn)生[11].上述紫外光譜的變化顯示配合物中較大的平面芳環(huán)配體Pyzdc與DNA以插入方式發(fā)生了非共價鍵作用.
圖4 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O 對CT-DNA的吸收光譜影響Fig.4 Absorption spectrum of the Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O in the absence and presence of increasing amounts DNA
溴化乙錠(EtBr)是非常重要的平面分子熒光探針[12].EtBr分子平行地嵌插入DNA分子內(nèi)部,由于EtBr本身具有一定的熒光,而DNA分子沒有熒光,當(dāng)EtBr插入DNA分子之后,增加了EtBr分子的平面剛性,淬滅現(xiàn)象減小,熒光明顯增強(qiáng).
圖5為配合物與HeLa-DNA作用的熒光光譜圖.由圖5可知,隨著配合物濃度的增加,DNA-Et-Br體系熒光強(qiáng)度逐漸減弱,并且濃度越大,熒光猝滅現(xiàn)象愈明顯.由斯特恩-沃爾默(Stern-Volmer)方程[13]:I0/I=1+Ksqr,其中 r是配合物與DNA濃度的比值,I0和I分別表示不存在和存在淬滅體時的熒光強(qiáng)度,Ksq是斯特恩-沃爾默(Stern-Volmer)淬滅常數(shù).由圖6可計算出該混合物的Ksq=0.190 4.實驗結(jié)果表明:當(dāng)DNA分子加入到配合物中,發(fā)生了π-π堆砌作用,這是由于配合物[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O中較大的疏水平面芳環(huán)(Pyzdc)插入到了DNA堿基對中.
圖5 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O 對DNA-EtBr體系熒光強(qiáng)度的影響Fig.5 Emission spectrum of EB bound to DNA in the presence of Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O
圖6 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O的Stern-volmer圖Fig.6 Stern-volmer quenching plots of the Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O
在外電場作用下,帶電顆粒如不處于等電狀態(tài),將向著與其所帶電荷電性相反的電極移動.電泳時,樣品在電槽中外電場的作用下發(fā)生移動,超螺旋帶(FormⅠ)分子質(zhì)量較小,在電場的作用下遷移速率較大;開環(huán)帶(FormⅡ)分子質(zhì)量最大,在電場的作用下遷移速率最小,而線性帶(FormⅢ)處于兩者之間.實驗中,隨著配合物濃度增加,F(xiàn)ormⅠ解旋慢慢轉(zhuǎn)化為FormⅡ,同時DNA會發(fā)生一定降解[14-17].
配合物與pBR322-DNA(0.01 g/L)作用相同時間后斷裂結(jié)果如圖7所示.隨著配合物濃度的增加(Lane 0是純的DNA,Lane 1~3為配合物與DNA在有氧條件下反應(yīng)2 h的電泳圖像,配合物濃度分別為 3.3、6.6、13.2 μmol/L),其對pBR322-DNA切割能力越來越大,即FormⅠ逐漸減少,解旋慢慢轉(zhuǎn)化FormⅡ,即FormⅡ越來越多,但無線性帶FormⅢ出現(xiàn).因此可以看出該配合物對pBR322質(zhì)粒DNA具有一定的切割能力,這與紫外吸收光譜、熒光光譜實驗中得到的結(jié)論相吻合.
圖7 Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O與質(zhì)粒pBR322-DNA電泳切割圖Fig.7 Cleavage of pBR322-DNA in the presence of Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O
(1)Ni[Pyzdc(COO)COOH]2·2H2O 單晶為八面體構(gòu)型,2個吡嗪-2,3-二羧酸配體以氮原子和氧原子與鎳(Ⅱ)離子反式螯合配位,2個H2O分子則以氧原子與鎳(Ⅱ)離子軸向配位,形成八面體配合物.
(2)配合物分子之間通過氫鍵弱相互作用形成新穎的超分子結(jié)構(gòu).紫外光譜和熒光光譜的測定均表明配合物與DNA之間發(fā)生了插入作用.在配合物對pBR322-DNA的切割能力測定中可以看出該配合物對pBR322質(zhì)粒DNA具有一定的切割能力,這與紫外吸收光譜、熒光光譜實驗中得到的結(jié)論相吻合.
[1] Zhang Y,Zhang Y M,Liu X G,et al.Synthesis and Crystal Structure of the Copper Complex{[Cu(CH3COO)2(bbtz)](H2O)2}n[J].Chinese Journal of Structure Chemistry,2005,24(10):1129-1132.
[2] Datta A,Karan N K,Mitra S,et al.Synthesis and Structural Characterization of a(N,N'-bis[2(S)-pyrrolidylmethyl]-propane-1,3-diamine)Nickel(Ⅱ)Complex[J].Journal of Chemistry Crystal,2003,33(7):579-583.
[3] Gillon B,Mathoniere C,Ruiz E,et al.Spin Densities in a Ferromagnetic Bimetallic Chain Compound:Polarized Neutron Diffraction and DFT Calculations[J].Journal of America Chemistry Society,2002,124(48):14433-14441.
[4] Noro S,Kitaura R,Kondo M,et al.Framework Engineering by Anions and Porous Functionalities of Cu(Ⅱ)/4,4'-bpy Coordination Polymers[J].Journal of America Chemistry Society,2002,124(11):2568-2572.
[5] Devereux M,McCann M,Shea D O,et al.Synthesis,Antimicrobial Activity and Chemotherapeutic Potential of Inorganic Derivatives of 2-(4'-thiazolyl)benzimidazole[thiabendazole]:X-ray Crystal Structures of[Cu(TBZH)2Cl]Cl·H2O·EtOH and TBZH2NO3(TBZH=thiabendazole)[J].Journal of Inorganic Biochemistry,2004,98(6):1023-1031.
[6] Chikira M,Tomizawa Y,F(xiàn)ukita D,et al.DNA-fiber EPR Study of the Orientation of Cu(Ⅱ)Complexes of 1,10-phenanthroline and Its Derivatives Bound to DNA:Mono(phenanthroline)-copper(Ⅱ)and Its Ternary Complexes with Amino Acids[J].Journal of Inorganic Biochemistry,2002,89(3/4):163-173.
[7] Santra B K,Reddy P A N,Neelakanta G,et al.Oxidative Cleavage of DNA by a Dipyridoquinoxaline Copper(Ⅱ)Complex in the Presence of Ascorbic Acid[J].Journal of Inorganic Biochemistry,2002,89(3/4):191-196.
[8] Song Y M,Wang Z H,Lu X Q,et al.Study on the Interactions between CuL2and Morin with DNA[J].Journal of Inorganic Biochemistry,2002,91(3):470-474.
[9] Lemoine P,Viossat B,Morgant G,et al.Synthesis,Crystal Structure,EPR Properties,and Anti-convulsant Activities of Binuclear and Mononuclear 1,10-phenanthroline and Salicylate Ternary Copper(Ⅱ)Complexes[J].Journal of Inorganic Biochemistry,2002,89(1/2):18-28.
[10] Chaviara A T,Cox P J,Repana K H,et al.Copper(Ⅱ)Schiff Base Coordination Compounds of Dien with Heterocyclic Aldehydes and 2-amino-5-methylthiazole:Synthesis,Characterization,Antiproliferative and Antibacterial Studies.Crystal Structure of CudienOOCl2[J].Journal of Inorganic Biochemistry,2004,98(8):1271-1283.
[11]徐宏,鄧洪,胡紅雨,等.多吡啶釕(Ⅱ)配合物的合成及其與RNA相互作用的光譜學(xué)研究[J].高等學(xué)?;瘜W(xué)學(xué)報,2003,24(1):25-27.
[12] Chao H,Mei W J,Huang Q W.DNA Binding Studies ofRuthenium(Ⅱ)ComplexesContaining Asymmetric Tridentate Ligands[J].Journal of Inor-ganic Biochemistry,2002,92(3/4):165-170.
[13] Lakowicz J R,Weber G.Quenching of Fluorescence by Oxygen.A Probe for Structural Fluctuations in Macromolecules[J].Biochemistry,1973,12(21):4161-4170.
[14] Wang X L,Chao H,Li H,et al.DNA Interactions of Cobalt(Ⅲ)Mixed-polypyridyl Omplexes Containing Asymmetric Ligands[J].Journal of Inorganic Biochemistry,2004,98(6):1143-1150.
[15] Holder A A,Swavey S,Brewer K J.Design Aspects for the Development of Mixed-metal Supramolecular Complexes Capable of Visible Light Induced Photocleavage of DNA[J].Inorganic Chemistry,2004,43(1):303-308.
[16] Qian J,Gu W,Liu H,et al.The First Dinuclear Copper(Ⅱ)and Cleavage Reactions by Designed Analogues of Co(Ⅲ)-bleomycin:the Metalated Core is the Primary Determinant of Sequence Specificity[J].Inorganic Chemistry,1996,35(9):2637-2643.
[17] Barton J K,Raphael A L.Photoactivated Stereospecific Cleavage of Double-helical DNA by Cobalt(Ⅲ)Complexes[J].Journal of America Chemistry Society,1984,106(8):2466-2468.