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    香蕉枯萎病拮抗放線菌1-g-59的篩選與鑒定

    2013-09-14 12:47:50劉小玉周登博譚昕高祝芬陳波黃霄張錫炎
    生物技術(shù)通報 2013年8期
    關(guān)鍵詞:放線菌枯萎病發(fā)酵液

    劉小玉 周登博 譚昕 高祝芬 陳波 黃霄 張錫炎

    香蕉枯萎病又稱黃葉病、巴拿馬病,是由尖孢鐮刀菌古巴專化型(Fusarium oxysporiumf. sp. cubense)侵染香蕉植株引起的一種毀滅性土傳維管束病害,近年來在中國香蕉主產(chǎn)區(qū)持續(xù)爆發(fā),嚴重制約著我國香蕉產(chǎn)業(yè)的發(fā)展[1-3]。其病原菌有4個生理小種[4],其中4號生理小種(Fusarium oxysporium f. sp. cubense 4,F(xiàn)OC4)侵染范圍最廣,幾乎危害所有的香蕉品種,我國香蕉品種多為巴西蕉,受FOC 4威脅最大,因此防治香蕉枯萎病迫在眉睫。據(jù)報道,目前對該病防治的主要途徑包括輪作、選用抗病品種[5]、化學防治[6]及生物防治等。目前推廣的抗病品種屬中抗品種,并不能完全控制枯萎病的發(fā)生,且農(nóng)藝性狀不佳,品質(zhì)較差,如臺灣1號、GCTCV-215等;使用化學藥劑,不僅會殺滅土壤中的有益菌類,且長期使用,對環(huán)境污染影響較大。因此生物防治被認為是目前最安全的防治措施,符合環(huán)境保護和有機食品發(fā)展要求。

    香蕉枯萎病的生物防治已成為各國的研究熱點。紫黑鏈霉菌(Streptomyces violaceusniger)[7]、熒光假單胞菌(Pseudomonas fluorescens)[8]、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)[9]被證明對FOC 4具有明顯的抑制作用,Perez-Vicente等[10]研究報道,抗病品種種植與生防菌的施用相結(jié)合,對香蕉枯萎病的防效達95%以上,說明生物防治香蕉枯萎病是完全可行的。本研究是采集香蕉植株根際土壤,分離并篩選出對FOC 4有明顯抑制作用的拮抗菌株,測定各拮抗菌株的發(fā)酵液對FOC 4菌絲生長和孢子萌發(fā)的抑制作用,篩選一株活性最強的拮抗菌株,旨在通過盆栽試驗研究其對香蕉枯萎病的防治效果,并通過形態(tài)特征、培養(yǎng)特征、生理生化特征、細胞壁化學成分分析和16S rDNA 序列及其系統(tǒng)發(fā)育分析等研究對該菌株進行鑒定。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 供試病原菌 香蕉枯萎病病原菌(FOC 4):尖孢鐮刀菌古巴?;? 號生理小種(Fusarium oxysporium f. sp. cubense 4,F(xiàn)OC4),由本實驗室保藏。

    供試香蕉苗:巴西蕉,由中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院種苗組培中心提供。

    1.1.2 樣品采集 供分離的土樣采自海南臨高美臺、南寶蕉園,去除大顆粒石塊和植物殘渣,備用。

    1.1.3 主要培養(yǎng)基 分離放線菌采用高氏一號合成培養(yǎng)基,為抑制細菌與真菌的生長,倒平板前加入0.005%的無菌重鉻酸鉀。

    FOC 4的培養(yǎng)及平板對峙試驗采用PDA培養(yǎng)基。

    拮抗菌的發(fā)酵采用黃豆粉液體培養(yǎng)基(可溶性淀粉20g,酵母粉5g,氯化鈉4g,黃豆粉15g,蛋白胨2g,碳酸鈣4g,pH7.2-7.4,1×105Pa滅菌50min)。

    放線菌的形態(tài)學觀察采用高氏一號瓊脂、酵母膏麥芽汁瓊脂、燕麥片瓊脂、無機鹽淀粉瓊脂、葡萄糖天冬素瓊脂、胨酵母膏鐵瓊脂、酪氨酸瓊脂等7種培養(yǎng)基。

    1.2 方法

    1.2.1 放線菌的分離與篩選

    1.2.1.1 土壤放線菌的分離 稱取土樣10g,加入90mL無菌水,于28℃、200r/min的搖床中充分震蕩30min,取其上清液用無菌水10倍逐級稀釋,依次稀釋成10-2、10-3和10-4濃度,各吸取100μL涂布于加重鉻酸鉀的高氏一號培養(yǎng)基平板上,于28℃恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng),適時挑取不同形態(tài)的菌落進行劃線,純化后保存。

    1.2.1.2 拮抗放線菌的篩選 采用平板對峙法,在無菌環(huán)境下,將培養(yǎng)5-6d的FOC 4(直徑為6mm)靶標菌接種至PDA平板中央,并在距離靶標菌邊緣2.5cm 處接種待測放線菌,以不接放線菌,只接FOC 4的PDA平板作為對照(CK),于28℃恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)5d后,測量各抑菌帶的大小,初篩出對FOC 4有明顯拮抗效果的菌株,連續(xù)接種5代進行復篩,最終篩選出拮抗效果最好的菌株進行下一步試驗。

    1.2.1.3 拮抗放線菌發(fā)酵液對FOC 4抑制作用的測定 拮抗菌發(fā)酵濾液的制備:拮抗菌接種于黃豆粉液體培養(yǎng)基中,28℃、200r/min的搖床中振蕩培養(yǎng)7d,取發(fā)酵液8000r/min離心15min,上清液用微孔濾膜過濾除菌。

    FOC 4孢子懸浮液的制備:將FOC 4接種于PDA固體培養(yǎng)基上,28℃恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng),待菌絲鋪滿平板后,用無菌水配制成1×106cfu/mL孢子懸浮液。

    拮抗放線菌發(fā)酵液對FOC 4菌絲生長的影響[11]:在熔融態(tài)的PDA培養(yǎng)基中加入拮抗菌發(fā)酵濾液,搖勻制成平板。將直徑為6mm的FOC 4靶標菌接種至平板中央,于28℃恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)5d后,觀察FOC 4菌絲的生長情況,并用顯微鏡觀察各處理的FOC 4菌絲形態(tài)變化,以純培養(yǎng)的FOC 4菌落邊緣菌絲為對照,每處理重復3次。

    拮抗放線菌發(fā)酵液對FOC 4孢子萌發(fā)的影響:將拮抗菌發(fā)酵濾液與FOC 4孢子懸浮液等體積混合均勻并置于玻片上,于溫度為28℃,濕度為80%的人工氣候箱中光照培養(yǎng)24h,每一處理設5個重復。取出玻片在顯微鏡下觀察孢子的萌發(fā)情況(以孢子萌發(fā)的芽管長度達到或超過孢子直徑長度的一半定為萌發(fā))[12],并計算各處理的孢子萌發(fā)率,以無菌水處理為對照(CK),以5次重復的平均值作為測定結(jié)果。

    孢子萌發(fā)抑制率(%)=[(對照孢子萌發(fā)率-處理孢子萌發(fā)率)/對照孢子萌發(fā)率]×100%

    1.2.2 拮抗放線菌1-g-59對香蕉枯萎病的盆栽效果測定 試驗設3個處理:①處理1,清水;②處理2,接種病原菌+拮抗放線菌1-g-59發(fā)酵液;③處理3,接種病原菌。每處理15株香蕉苗,重復3次。

    拮抗菌發(fā)酵液與病原菌孢子懸浮液的制備方法同1.2.1.3。

    采用蘸根浸菌法接種[13]:用針刺傷香蕉組培苗的根尖,再將根浸沒于1×106cfu/mL的孢子懸浮液中,30min后移栽于盆缽中,并將剩余的病原菌孢子懸浮液澆入栽有香蕉幼苗的土壤中,接種后置于室溫、自然光照條件下培養(yǎng),常規(guī)的水肥管理。接種病原菌10d后,處理2施用拮抗菌發(fā)酵液,每株灌注100mL。

    病情分級:0級為無癥狀;1級為整株無變黃葉片;2級為1-2片葉萎蔫;3級為全株1/3-1/2葉片萎蔫;4級為全株1/2-3/4葉片萎蔫;5級為全株3/4以上葉片萎蔫或死亡。

    DSI=∑(病害的級別×該級別的植株數(shù))/供試植株數(shù)

    相對防治效果(%)=[(對照病情指數(shù)- 處理病情指數(shù))/對照病情指數(shù)]×100%

    1.2.3 拮抗菌株的鑒定

    1.2.3.1 形態(tài)特征 采用平皿插片法[14],將菌株1-g-59接種于高氏一號固體培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)14d,取插片用臺式掃描電鏡進行菌株形態(tài)觀察。

    1.2.3.2 培養(yǎng)特征 參照《放線菌的分類和鑒定》[15]和《鏈霉菌鑒定手冊》[16]中的方法。將菌株1-g-59和Streptomyces lunalinharesiiRCQ1071T分別接種于高氏一號瓊脂、酵母膏麥芽汁瓊脂、燕麥片瓊脂、無機鹽淀粉瓊脂、葡萄糖天冬素瓊脂、胨酵母膏鐵瓊脂、酪氨酸瓊脂等7種培養(yǎng)基中,28℃下培養(yǎng)7-10d,觀察菌絲體的顏色及可溶性色素情況。

    1.2.3.3 細胞壁化學成分分析 采用Hasegawa等[17]薄板層析法對菌株1-g-59進行全細胞水解液的氨基酸和糖型分析。

    1.2.3.4 生理生化特征 參照《放線菌的分類和鑒定》和《鏈霉菌鑒定手冊》中的方法觀察菌株1-g-59和Streptomyces lunalinharesiiRCQ1071T的生理生化特性,進行明膠液化、鼠李糖、L-酪氨酸、木糖、棉子糖、L-阿拉伯糖、精氨酸、蛋氨酸、淀粉酶水解、脲酶、H2S的產(chǎn)生等方面的檢測。

    1.2.3.5 16S rDNA 序列測定及其系統(tǒng)發(fā)育分析 基因組DNA提取參照姜淑梅[18]的方法。根據(jù)放線菌16S rDNA 的結(jié)構(gòu)特點,PCR 擴增選用通用引物27F :5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3',1492R :5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3'。反應體系 50μL :1μL 模板、1μL 引物 1492R 、1μL 引物 27F、25μL PCR mastermix、22μL ddH2O)。PCR 擴增程序 :94℃預變性5min;94℃變性1min,55℃退火1min,72℃延伸1.5min,35個循環(huán);72℃終延伸10min,4℃保存。取50μL PCR產(chǎn)物用1%的瓊脂糖凝膠進行電泳檢測,在紫外燈下觀察、并拍照保存。

    電泳完成后的凝膠,經(jīng)拍照保存后,對大小約為1500bp的條帶進行切膠回收?;厥掌窝b入2mL無菌離心管中,用愛思進生物技術(shù)有限公司提供的AxyPrep DNA 凝膠回收試劑盒進行回收得到DNA?;厥盏玫降腄NA用寶生物工程有限公司提供的pMD18-T Vector 進行克隆。將樣品送至北京六合華大基因科技股份有限公司進行測序。

    經(jīng)測序獲得拮抗放線菌1-g-59的16S rDNA序列,將該序列通過Blast程序與GenBank中核酸數(shù)據(jù)進行比對分析(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi),采用BioEdit、Mega5.0等軟件對菌株進行系統(tǒng)發(fā)育分析,采用鄰接法(Neighbour-joining,NJ法)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

    2 結(jié)果

    2.1 放線菌的分離與篩選

    共分離出117株放線菌,采用平板對峙法進行復篩,最終篩選出對FOC 4拮抗效果較強的5株放線菌(表1)。

    表1 五株放線菌的拮抗效果

    2.2 5株拮抗放線菌發(fā)酵液對FOC 4抑制作用的測定

    2.2.1 對FOC 4菌絲生長的影響 觀察培養(yǎng)5d的FOC 4菌絲,發(fā)現(xiàn)經(jīng)不同拮抗菌發(fā)酵濾液處理,F(xiàn)OC 4菌絲生長均受到不同程度的抑制,F(xiàn)OC 4直徑均<1.0cm,混-g2-65B發(fā)酵濾液使FOC 4菌絲變?yōu)樽仙?-M-03B發(fā)酵濾液使帶靶標菌的培養(yǎng)基塊變黑,而1-g-59發(fā)酵液處理的FOC 4菌絲幾乎消失,靶標菌的培養(yǎng)基塊變?yōu)楹谏?,且培養(yǎng)基塊底部有淺黃色黏性分泌物產(chǎn)生。此外,顯微鏡觀察發(fā)現(xiàn)1-g-59發(fā)酵液處理的FOC 4菌絲體畸形、分枝增多、菌絲破裂、消解;而對照FOC 4菌絲細長、光滑、均勻。

    2.2.2 對FOC 4孢子萌發(fā)抑制作用的測定 結(jié)果表明,對照組(CK)的FOC 4孢子萌發(fā)率達92%,經(jīng)拮抗菌發(fā)酵液處理的FOC 4孢子萌發(fā)均受到不同程度的抑制,混-g2-25A發(fā)酵液處理的FOC 4孢子萌發(fā)率達88%,抑制率為4.3%;混-g2-65、3-M-03B、混-g2-65B這3株拮抗菌發(fā)酵液處理的FOC 4孢子萌發(fā)率均小于6.25%,抑制率均大于93.2%;而1-g-59發(fā)酵液處理的FOC 4孢子萌發(fā)率為0,抑制率達100%。圖1為對照組(CK)和1-g-59發(fā)酵液處理的FOC 4孢子萌發(fā)情況。

    圖1 1-g-59發(fā)酵液對FOC 4孢子萌發(fā)的影響

    2.2.3 拮抗放線菌1-g-59發(fā)酵液對香蕉枯萎病的盆栽效果測定 移栽14d后,處理3(只接種病原菌)的植株出現(xiàn)黃葉,28d后處理3的植株出現(xiàn)假莖開裂,45d后處理3的蕉苗發(fā)病嚴重,有的植株枯死,病情指數(shù)為4.24;處理1(清水)的植株均健康生長;處理2(病原菌+發(fā)酵液)病情指數(shù)為1.49,防治效果為64.9%(表2)。結(jié)果表明,拮抗放線菌1-g-59發(fā)酵液對香蕉枯萎病有一定的防治效果。

    表2 1-g-59發(fā)酵液對香蕉枯萎病的盆栽防治效果

    2.2.4 拮抗放線菌1-g-59的分類鑒定

    2.2.4.1 形態(tài)學特征 菌株1-g-59在高氏一號培養(yǎng)基上培養(yǎng)5d后菌落呈灰白色,單菌落成不規(guī)則的圓形,表面干燥、有皺紋?;鶅?nèi)菌絲黃褐色,氣生菌絲灰白色,無可溶性色素。通過臺式掃描電鏡觀察,發(fā)現(xiàn)該菌株氣生菌絲發(fā)達,非輪生,孢子成直或柔曲的鏈,氣生菌絲形成孢子鏈,孢子為圓柱狀(圖2)。

    圖2 菌株1-g-59的孢子鏈照片(6400×)

    2.2.4.2 培養(yǎng)特征 由表3可以看出,菌株1-g-59在7種培養(yǎng)基中均能生長,但在無機鹽淀粉瓊脂和甘油天門冬酰胺瓊脂培養(yǎng)基上生長得慢,產(chǎn)孢較少;在不同培養(yǎng)基上,基內(nèi)菌絲顏色有黃褐色、灰黃色、灰色;氣生菌絲有灰色、灰白色、白色;在7種培養(yǎng)基中均不產(chǎn)生可溶性色素。

    表3 菌株1-g-59在不同培養(yǎng)基上的生長特征

    2.2.4.3 細胞壁化學成分 菌株1-g-59全細胞水解液中含有L,L-DAP和甘氨酸,細胞壁屬于I型,無特征性糖,糖型C,進一步驗證菌株1-g-59為鏈霉菌屬。

    2.2.4.4 生理生化特征 由表4可以看出,菌株1-g-59能利用L-酪氨酸木糖、L-阿拉伯糖、鼠李糖、精氨酸、蛋氨酸;不能利用棉子糖;水解淀粉能力弱;明膠液化。菌株1-g-59與Streptomyces lunalinharesii的生理生化特征基本相同。

    表4 菌株與Streptomyces lunalinharesii表型特征的比較

    2.2.4.5 16S rDNA序列測定及其系統(tǒng)發(fā)育分析 將菌株1-g-59的16S rDNA進行PCR擴增得到一條1500bp左右的條帶,經(jīng)序列測定,其大小為1576bp。將其DNA序列與NCBI數(shù)據(jù)庫中相應的DNA序列進行BLAST相似性分析,結(jié)果表明,與菌株1-g-59的16S rDNA同源性較高的均為鏈霉菌,其中與之同源性最高的是Streptomyces lunalinharesiiRCQ1071T,相似性達99.26%。根據(jù)序列同源性從高到低的原則,挑取11株菌株的16S rDNA序列,運用BionEdit、Mega5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖3),菌株 1-g-59與Streptomyces lunalinharesiiRCQ1071T處于同一分支,親緣關(guān)系最近。

    圖3 依據(jù)16S rDNA 序列構(gòu)建菌株1-g-59與鏈霉菌屬相關(guān)種的系統(tǒng)發(fā)育樹

    3 討論

    近年來土傳病害的防治研究在中國發(fā)展很快,尤其是在水稻、小麥和油菜方面,已有防治稻瘟病、紋枯病、菌核病等病害的生物農(nóng)藥相繼問世[19]。但香蕉枯萎病的生物防治研究起步較晚,目前還沒有成功的商業(yè)化產(chǎn)品。本研究從蕉園的根際土壤中分離出117株放線菌,通過篩選獲得5株對FOC 4具有較強拮抗效果的放線菌,其中菌株1-g-59的拮抗效果最強,對FOC 4的菌絲生長和孢子萌發(fā)的抑制作用最大,其發(fā)酵液處理的靶標菌培養(yǎng)基塊底部有淺黃色黏性分泌物產(chǎn)生,這有可能是拮抗菌發(fā)酵液產(chǎn)生的具有抑制FOC 4菌絲生長的分泌物,其成分有待進一步研究。菌株1-g-59發(fā)酵液能使FOC 4菌絲體畸形、分枝增多、菌絲破裂、消解,還能有效地抑制FOC 4孢子萌發(fā),這與文獻報道[20,21]生防菌的作用機制一致;且其發(fā)酵液對香蕉枯萎病的盆栽防治效果達64.9%,說明該菌株可能產(chǎn)生對FOC4有拮抗效果的活性物質(zhì),具有較好的開發(fā)價值。

    菌株1-g-59具有典型的鏈霉菌特征,16S rDNA序列分析表明菌株1-g-59與Streptomyces lunalinharesiiRCQ1071T序列相似性達99.26%,在系統(tǒng)發(fā)育樹上處于同一分支,親緣關(guān)系最近,且經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)二者的形態(tài)特征、培養(yǎng)特征、生理生化特征基本相同[22],因此鑒定菌株1-g-59為Streptomyces lunalinharesii。

    本研究為該菌株今后的應用、香蕉枯萎病的生防菌制劑的開發(fā)奠定了基礎,該菌株的抑菌活性成分以及其抑菌機理還有待進一步的深入研究。

    4 結(jié)論

    通過分離和篩選獲得5株對FOC 4具有拮抗作用的放線菌,其中以菌株1-g-59活性最強。菌株1-g-59發(fā)酵液能使FOC 4菌絲全部消失,且其對FOC 4孢子萌發(fā)的抑制率達100%。菌株1-g-59發(fā)酵液對香蕉枯萎病的盆栽防治效果達64.9%。鑒定菌株1-g-59為Streptomyces lunalinharesii。

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