辛桂瑜 王麗霞 葉新慧 申魁魁 符欣蕙 李恭賀 張明,2盧晟盛,2 盧克煥,2 鄭喜邦
Klf4(Krüpple like factor 4,Krüpple 樣 因 子 4)是一類含3個鋅指結(jié)構(gòu)的雙向轉(zhuǎn)錄因子。長期以來,由于Klf4在細胞增殖、分化、生長特別是與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展有密切關(guān)系而備受關(guān)注。Klf4可以促進胚胎干細胞的自我更新[1];Sikora 與 Ghosh[2,3]的研究還表明,Klf4具有促進表皮的增殖分化以及抑制膀胱癌等惡性腫瘤發(fā)生等多種功能。Klf4在許多類型的腫瘤中特異性過表達或者缺失,例如,在結(jié)腸癌、小腸癌、膀胱癌、前列腺癌和食道癌等腫瘤中Klf4低表達[4-8],胃癌中Klf4有雜合性缺失的表現(xiàn)[9],而在原發(fā)性乳腺導(dǎo)管癌以及口腔鱗癌中Klf4高表達[10,11]。近年來對干細胞的相關(guān)研究表明,Klf4等因子參與體細胞重編程,并發(fā)揮重要作用[12]。Takahashi 等[13]將 Klf4、 Sox2、Oct4、c-Myc 四 個轉(zhuǎn)錄因子導(dǎo)入小鼠成纖維細胞中,獲得了iPS細胞(induced pluripotent stem cells),這一突破為患者自身遺傳特性的ES細胞獲取提供了新的途徑,也為臨床治療提供了新的研究方向。此后,Takahashi 等[14]用同樣的方法獲得了人類iPS 細胞 。 Hanna 等[15]利用人類鐮狀細胞性貧血的小鼠動物模型,對其導(dǎo)入Klf4、Sox2、Oct4及c-Myc基因,將小鼠皮膚成纖維細胞重編程為自體iPS細胞,并對iPS細胞進行誘導(dǎo)分化,從而得到造血功能正常的前體細胞,進而起到了治療作用。迄今為止,已相繼獲得了獼猴、豬、大鼠和綿羊等物種的iPS細胞[16-19],但是尚未見有關(guān)山羊體細胞重編程的報道。王春生等[20]、楊越飛等[21]對小鼠和綿羊Klf4基因分別進行了原核及真核表達的研究,但山羊Klf4基因的研究未見報道。
本研究旨在克隆山羊Klf4基因,并構(gòu)建其原核表達載體,在大腸桿菌中誘導(dǎo)表達,純化His-Klf4融合蛋白,從而為其多克隆抗體制備奠定基礎(chǔ),也為進一步研究山羊多能干細胞創(chuàng)造良好條件。
1.1.1 菌種與質(zhì)粒 大腸桿菌BL21(DE3)和DH5α,質(zhì)粒pET-30a由本實驗室保存。
1.1.2 主要試劑 TRIzol LS?Regent RNA提取試劑盒購自Invitrogen公司(美國);反轉(zhuǎn)錄試劑盒、T4 DNA連接酶、限制性內(nèi)切酶EcoR I和Hind Ⅲ、pMD18-T載體、IPTG,膠回收試劑盒均購自寶生物工程有限公司(大連);蛋白預(yù)染Marker購自Fermentas公司(立陶宛);DNA Marker 2000購自百維信生物科技有限公司(廈門);EB替代染料(GeneFinder核酸染料),購自康為公司(北京);質(zhì)粒小量提取試劑盒,購自O(shè)mega Bio-Tek公司(美國);鼠源His標簽抗體、山羊抗鼠IgG購自TIANGEN公司(北京)。
1.2.1 目的片段的克隆與測序 根據(jù)GenBank中牛Klf4mRNA序列(NM.001105385.1)設(shè)計一對引物,在引物5'端分別引入EcoR I和Hind Ⅲ酶切位點。引物由Invitrogen公司合成,預(yù)計擴增片段為1 434bp。從山羊生殖脊提取總RNA,再反轉(zhuǎn)錄為cDNA,以cDNA 為模板,進行PCR 擴增。25μL PCR 反應(yīng)體系為 :2×GC Buffer I 12.5μL,dNTPmix 2.5μL,上下游引物各0.5μL,Ex Taq DNA 聚合酶0.15μL, 模 板 cDNA0.75μL, 加 雙 蒸 水 7.25μL。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3min;94℃變性30s,61.6℃退火 90s,72℃延伸1min,共30個循環(huán);72℃延伸10min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳、切膠后,用膠回收試劑盒純化。目的片段與pMD18-T載體16℃連接過夜,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細菌,涂板。挑斑、增菌、小提質(zhì)粒,分別用EcoR I和Hind Ⅲ進行雙酶切鑒定,陽性質(zhì)粒送寶生物工程有限公司測序。
1.2.2 信號肽預(yù)測 用DNAStar軟件比較山羊與綿羊、牛、中國水牛、野豬Klf4核苷酸序列同源性;借助SignalP4.0在線軟件(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)預(yù)測Klf4編碼蛋白是否存在信號肽。
1.2.3 山羊Klf4原核表達載體構(gòu)建和鑒定 選擇測序正確的pMD18-T-Klf4陽性質(zhì)粒,用EcoRI和HindⅢ分別將pMD18-T-Klf4與表達載體pET-30a進行雙酶切,膠回收Klf4目的片段和線性化的pET-30a載體,用T4DNA連接酶16℃連接過夜。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細菌,挑斑、增菌、小提質(zhì)粒和雙酶切鑒定。陽性質(zhì)粒送寶生物工程有限公司測序。
1.2.4 重組質(zhì)粒在大腸桿菌中的誘導(dǎo)表達 經(jīng)鑒定與測序,將閱讀框正確的重組質(zhì)粒pET30a-Klf4轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21感受態(tài)細胞,涂板、挑斑并加入含氨芐青霉素(終濃度100μg/mL)的LB培養(yǎng)基中,37℃搖床振蕩培養(yǎng)過夜,取重組菌按1∶100體積比轉(zhuǎn)接入含氨芐青霉素的5mL LB 培養(yǎng)基中,220r/min,37℃ 振蕩培養(yǎng)至 OD600nm=0.4-0.6時,加入終濃度為1mol/L 的 IPTG,37℃誘導(dǎo)表達4h。收集2mL菌液以12000r/min離心4min,沉淀用80μL PBS(pH7.4)懸浮,加入 5×SDS-Loading Buffer 20μL,混勻后置冰上10min,煮沸10min,12000r/min離心5min,取10μL上清進行SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍染色確定目的蛋白是否表達。
1.2.5 融合蛋白Western blotting檢測 取上述蛋白樣品進行SDS-PAGE電泳。以濕轉(zhuǎn)法將目的蛋白轉(zhuǎn)到NC(硝酸纖維素)膜上,用TBST配制的5%脫脂奶粉室溫封閉2-3h。加入鼠源His標簽抗體(1∶2000)4℃孵育過夜后用TBST漂洗3次,每次10min。加入山羊抗鼠IgG(1∶2000),室溫孵育1-1.5h,用TBST 漂洗3次,每次10min。洗膜后用化學(xué)發(fā)光劑A、B各250μL滴至保鮮膜上混勻,將NC膜的蛋白面朝下,覆蓋在顯色劑上作用5min,吸取多余的顯色劑,NC膜蛋白面朝上,包裹后固定在暗盒內(nèi),壓X光膠片,曝光。經(jīng)顯影、定影,用預(yù)染蛋白Marker判定目的蛋白的相對分子質(zhì)量。
1.2.6 融合蛋白的純化 將誘導(dǎo)表達成功的重組菌液按1∶100比例轉(zhuǎn)接5mL LB液體培養(yǎng)基中,37℃振搖培養(yǎng)過夜?;罨木喊?∶200比例轉(zhuǎn)接500mL含氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)至OD600nm值達到0.4-0.6時,加入IPTG,37℃繼續(xù)誘導(dǎo)4h。以5000r/min 4℃離心8min,收集菌體沉淀并稱重。隨后的蛋白純化按照 Ni-NTA argrose使用說明進行。每1g濕重沉淀加5mL的Buffer B 制成懸浮液;置于室溫下180r/min搖床振搖1h后超聲波破碎10min,以12000r/min 4℃離心20min,取其上清,用0.45μm濾器過濾后緩慢加入含Ni-NTA argrose的純化柱中,室溫下慢速搖動混勻2h,靜置后過柱;用2倍柱床體積Buffer C洗滌3次,用2倍柱床體積 Buffer E洗脫His-Klf4融合蛋白。分別收集少量裂解液上清、沉淀、過柱液、Buffer C和Buffer E洗脫液進行SDS-PAGE分析。純化的蛋白冷凍干燥保存于-80℃冰箱待用。
提取的山羊生殖脊總RNA經(jīng)反轉(zhuǎn)錄,以cDNA為模板,PCR擴增后,產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳進行檢測。在紫外燈下觀察,可發(fā)現(xiàn)在約1500bp處有一特異性條帶(圖1),與預(yù)期結(jié)果相符。
圖1 山羊Klf4 RT-PCR產(chǎn)物凝膠圖
將重組質(zhì)粒pMD18-T-Klf4用EcoR I和Hind Ⅲ進行雙酶切以及1%瓊脂糖凝膠電泳,得到約1500bp目的條帶(圖2),與預(yù)期結(jié)果相符。測序結(jié)果表明Klf4基因的閱讀框由1 434 個核苷酸組成,共編碼478個氨基酸(圖3)。用DNAStar軟件將該基因核苷酸序列分別與綿羊、牛、中國水牛、野豬Klf4進行核苷酸序列同源性比較,結(jié)果(表1)分別為98.5%、98.2%、98.0%和 94.2%。 經(jīng) 過 SignalP 4.0在線分析,山羊Klf4編碼蛋白不存在信號肽(圖4),全長序列可用于原核表達。
圖2 山羊pMD18-T-Klf4雙酶切鑒定
圖3 山羊Klf4基因的測序結(jié)果
表1 山羊Klf4基因核苷酸序列與其他物種的Klf4序列同源性比較(%)
圖4 山羊Klf4基因信號肽分析
將原核表達質(zhì)粒pET30a-Klf4進行EcoR I和Hind Ⅲ雙酶切以及1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,得到目的片段約為1500bp(圖5),與預(yù)期結(jié)果相符。結(jié)果表明pET30a-Klf4重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。
圖5 重組質(zhì)粒pET30a-Klf4酶切鑒定
SDS-PAG電泳表明,重組質(zhì)粒pET30a-Klf4在大腸桿菌BL21中得到表達,表達的His-Klf4融合蛋白分子量約為52kD(圖6),與理論值相符。免疫印跡檢測結(jié)果(圖7)也與SDS-PAGE電泳結(jié)果相一致,在分子量約52kD 處有特異性條帶,說明目的蛋白確實為His-Klf4融合蛋白,融合基因閱讀框正確。在變性條件下,用鎳離子金屬螯合親和層析法純化His-Klf4融合蛋白,經(jīng)SDS-PAGE分析(圖8),純化產(chǎn)物呈單一條帶,與上述預(yù)期結(jié)果一致,證明獲得了His-Klf4融合蛋白。
圖6 pET30a-Klf4表達產(chǎn)物SDS-PAGE分析
圖8 His-Klf4純化產(chǎn)物SDS-PAGE分析
獲得純化的Klf4轉(zhuǎn)錄因子蛋白,必須要建立最佳的原核表達體系,而表達載體的選擇又是關(guān)鍵的因素之一。在本研究中,我們之前選用pRSET-A作為表達載體,但最終獲得的重組蛋白表達量不高,改用pET-30a后,獲得了表達效率較高的重組蛋白。這是因為pET-30a具有功能強大的T7啟動子,而T7 RNA聚合酶具有較高的選擇性與活性,大多數(shù)的細胞資源在誘導(dǎo)充分時都可被用于目的基因的表達,因此可以獲得高效表達的重組蛋白[22,23]。另外,pET-30a載體含有的6×His Tag可作為純化的標志,His融合蛋白經(jīng)過Ni-NTA argrose層析柱可以進一步純化。
圖7 融合蛋白His-Klf4的Western blotting檢測
本研究構(gòu)建的重組質(zhì)粒pET30a-Klf4在宿主菌BL21中經(jīng)IPTG誘導(dǎo)獲得高效表達。本研究表明,1mmol/L IPTG 37℃誘導(dǎo)4h,表達效果較好。經(jīng)可溶性分析,目的蛋白以包涵體的形式存在,用8mol/L尿素在變性條件下進行純化,結(jié)果比較滿意。但在進行His-Klf4融合蛋白的純化過程中,目的蛋白與鎳離子親和層析柱結(jié)合不穩(wěn)定。針對此種情況,改變了多種條件,最終發(fā)現(xiàn)在裂解液中加入10%甘油并把pH調(diào)至7.4后蛋白能與鎳離子親和層析柱較好地結(jié)合,這是由于菌液進行超聲裂解之后pH有所下降,當(dāng)pH在4.5-5.3時組氨酸殘基質(zhì)子化,蛋白無法與鎳離子進行結(jié)合。在目的蛋白的洗脫過程中,目的蛋白洗脫量過低,洗脫液中含有大量雜蛋白。在裂解液中加入吐溫、Triton等表面活性劑,減少了雜蛋白與層析柱的非特異性結(jié)合,并且根據(jù)目的蛋白等電點(pH8.0)改變雜蛋白洗脫液pH值,最終用pH值5.0的洗脫液洗脫目的蛋白,獲得了較好的純化效果。
總之,本研究克隆了山羊Klf4基因,成功構(gòu)建原核表達載體,通過誘導(dǎo)表達和純化獲得了山羊His-Klf4的融合蛋白,為山羊多能干細胞的研究奠定了基礎(chǔ)。
利用RT-PCR方法從山羊原始生殖嵴中成功克隆了Klf4基因,構(gòu)建了原核表達質(zhì)粒pET30a-Klf4,通過原核表達技術(shù)成功獲得了純化的山羊His-Klf4融合蛋白。
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