• <tr id="yyy80"></tr>
  • <sup id="yyy80"></sup>
  • <tfoot id="yyy80"><noscript id="yyy80"></noscript></tfoot>
  • 99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看 ?

    基于細(xì)菌酯酶活性的疊氮噻唑橙分子設(shè)計與特性驗(yàn)證*

    2013-08-16 05:47:38余以剛黃韻李曉鳳肖性龍吳暉
    關(guān)鍵詞:疊氮噻唑酯酶

    余以剛 黃韻 李曉鳳 肖性龍 吳暉

    (華南理工大學(xué)輕工與食品學(xué)院,廣東廣州510640)

    食源性致病菌檢驗(yàn)的關(guān)鍵是食品中“活”的致病菌的存在性檢測和準(zhǔn)確定量[1].目前用于區(qū)別活菌和死菌的標(biāo)準(zhǔn)主要有:是否可培養(yǎng)、是否有代謝活性以及細(xì)胞膜是否完整.分離培養(yǎng)法對于活的非可培養(yǎng)狀態(tài)的細(xì)菌會出現(xiàn)漏檢[2].EMA/PMA-qPCR活菌檢測技術(shù)利用新型核酸染料EMA(疊氮溴化乙錠)或PMA(疊氮溴化丙錠)滲入膜損傷的細(xì)胞后,與DNA發(fā)生共價結(jié)合,從而抑制膜損傷細(xì)胞DNA在PCR反應(yīng)中的擴(kuò)增[3].該方法實(shí)際上是通過細(xì)胞膜的完整性來對“死”、“活”細(xì)胞進(jìn)行區(qū)分檢測[4].有研究表明,這種活菌PCR技術(shù)在方法和原理上仍存在不足[5-8].細(xì)胞膜損傷可能是細(xì)菌死亡的一種極端表現(xiàn)形式,以細(xì)胞膜的完整性作為區(qū)分死、活菌的檢測標(biāo)準(zhǔn)存在缺陷.因此,建立一套基于生物代謝活性的活菌分析方法,使其既可有效檢測出活菌(包括VBNC菌),又可克服EMA/PMA-qPCR方法在原理上的不足,對于膜完整或膜損傷的死細(xì)胞不檢測,這也符合致病菌檢測的根本要求.

    為了通過細(xì)胞內(nèi)有無代謝活性來區(qū)分活、死菌,達(dá)到更精確的致病菌活菌檢測的目的,筆者設(shè)計了一種對細(xì)菌生物代謝活性敏感的新型噻唑橙熒光染料(簡稱TOMA),它主要由3個功能基團(tuán)構(gòu)成:一是噻唑橙基團(tuán)(使分子可以自由穿透細(xì)胞),二是疊氮基團(tuán)(在光照下與核酸共價結(jié)合后抑制核酸擴(kuò)增),三是連接兩個基團(tuán)并含有一個酯鍵的柔性碳鏈(酯鍵對生物酯酶活性敏感,可被酯酶水解斷裂).TOMA選取了具有細(xì)胞穿透性的菁染料作為DNA結(jié)合基團(tuán),故可進(jìn)入所有細(xì)胞.利用帶酯鍵的碳鏈,可將染料基團(tuán)與疊氮基團(tuán)連接起來,而在酯酶水解作用下,兩個基團(tuán)可相互分離.在活性細(xì)胞內(nèi),TOMA分子中的碳鏈被酶解斷裂,疊氮基團(tuán)從分子上脫落;反之,在無活性的細(xì)胞內(nèi),疊氮基團(tuán)不會脫落,在可見光的作用下與 DNA共價交聯(lián)形成共價化合物,抑制DNA后續(xù)擴(kuò)增.而游離的TOMA分子,其疊氮基團(tuán)因在可見光作用下與水反應(yīng)生成羥胺而被鈍化.因此,結(jié)合TOMA與定量PCR(qPCR)技術(shù)建立新型活菌檢測技術(shù)來區(qū)分活、死菌,將依賴于細(xì)胞體內(nèi)的酯酶活性,而不是細(xì)胞膜完整性,理論上可比以往的活菌檢測技術(shù)更準(zhǔn)確.為建立以“細(xì)菌酯酶代謝活性”作為判斷細(xì)菌存活標(biāo)準(zhǔn)的活菌檢測技術(shù),文中通過人工設(shè)計合成了TOMA分子,并嘗試在實(shí)驗(yàn)室條件下對TOMA分子的預(yù)期功能特性進(jìn)行了體外驗(yàn)證.

    1 材料與方法

    1.1 實(shí)驗(yàn)材料

    1.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株與培養(yǎng)條件

    實(shí)驗(yàn)所用菌株為金黃色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)(ATCC6538)、大腸桿菌(Escherichia coli)O157:H7(ATCC6589)以及單增李斯特菌(Listeria monocytogenes)(CMCC34761),均為實(shí)驗(yàn)室保存菌種.

    細(xì)菌培養(yǎng)采用LB液體培養(yǎng)基(蛋白胨10 g/L,酵母提取物 5g/L,NaCl 10 g/L),pH 值調(diào)至 7.0,培養(yǎng)基經(jīng)過121℃、20min滅菌后使用.將細(xì)菌分別接種到30 mL LB液體培養(yǎng)基中,于37℃下180 r/min搖床中過夜培養(yǎng)16 h(OD600≈1).液體培養(yǎng)基中添加1.5%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))的瓊脂粉即得相應(yīng)的固體培養(yǎng)基,用于平板法測可培養(yǎng)菌數(shù).

    1.1.2 試劑及儀器

    所用試劑均為分析純或色譜純;固定化脂肪酶Novozym435(固定化于大孔丙烯酸樹脂,酶活力10U/mg)購自丹麥 NovoNordisk Industries公司;細(xì)菌基因組DNA快速提取試劑盒購自北京艾德萊生物科技有限公司;PCR AmpLification Kit購自TaKaRa公司.

    Waters 1525-ZQ2000型液相質(zhì)譜聯(lián)用儀、高效液相色譜儀、2996 PDA型檢測器,美國沃特世公司生產(chǎn);Bruker Biospin AG AV 600型核磁共振儀,瑞士布魯克拜厄斯賓有限公司生產(chǎn);Laica SP5型激光共聚焦顯微鏡,德國徠卡微系統(tǒng)有限公司生產(chǎn);鹵鎢燈,650W,購自德國Osram公司;臺式高速冷凍離心機(jī),德國艾本德股份有限公司生產(chǎn);水浴鍋購自新加坡雷蒙特實(shí)驗(yàn)設(shè)備公司;ABI7500型熒光定量PCR儀,購自美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司.

    1.2 TOMA染料的合成

    TOMA分子的合成路線如圖1所示,委托上海輝睿生物技術(shù)有限公司合成.目標(biāo)物經(jīng)合成與純化后,使用高分辨質(zhì)譜儀與核磁共振儀對分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行確證,粉末于4℃下避光保存.1H NMR(600MHz,d6-DMSO):δ1.33 ~1.42(m,2H,CH2),1.54 ~ 1.63(m,2H,CH2),1.84 ~ 1.89(m,2H,CH2),2.28 ~2.36(t,2H,CH2),3.38 ~3.43(t,2H,CH2),4.14 ~4.18(t,2H,CH2),4.57 ~4.63(t,2H,CH2),6.92 ~6.96(s,1H,═CH),7.34~7.38(d,1H,Ar-H),7.40~7.44(t,1H,Ar-H),7.57 ~7.63(t,1H,Ar-H),7.72 ~7.76(t,1H,Ar-H),7.77 ~7.80(d,1H,Ar-H),7.95 ~8.01(t,1H,Ar-H),8.04 ~8.08(d,1H,Ar-H),8.11 ~8.14(d,1H,Ar-H),8.62 ~8.66(d,1H,Ar-H),7.87 ~8.83(d,1H,Ar-H).

    圖1 目標(biāo)化合物TOMA的合成路線Fig.1 Synthetic route of target compound TOMA

    1.3 TOMA分子功能驗(yàn)證

    1.3.1 TOMA對細(xì)菌胞膜的穿透性驗(yàn)證

    稱取50mg TOMA粉末溶解于1 mL 20%(體積分?jǐn)?shù))的二甲基亞砜(DMSO)中,得到50 mg/mL的儲備液.向90μL無菌超純水中加入10μL TOMA儲備液,混勻,得到5mg/mL的TOMA工作液.

    分別取500μL新鮮培養(yǎng)的金黃色葡萄球菌、大腸桿菌O157:H7以及單增李斯特菌菌液于1.5 mL離心管中,6000 r/min離心3 min,等體積無菌水重懸.菌液中加入TOMA工作液1μL使菌液中TOMA終濃度為10 μg/mL,充分混勻后,于室溫下暗處孵育10min.將離心管水平放置于冰上,于650W的鹵鎢燈下方20cm處進(jìn)行5min光照,期間輕輕搖晃冰盒保證溶液得到充分照射.陰性對照組使用無菌超純水代替TOMA溶液.

    對經(jīng)TOMA處理后的菌體使用10%(體積分?jǐn)?shù))福爾馬林緩沖液進(jìn)行固定.吸取5 μL固定完畢的菌液,滴在無自發(fā)熒光的載玻片中央,加入甘油封片劑,蓋上蓋玻片后使用透明指甲油封閉.制成樣本后用激光共聚焦顯微鏡觀察結(jié)果(激發(fā)波長488nm,發(fā)射波長520nm,100倍油鏡).

    1.3.2 TOMA對脂肪酶的敏感性驗(yàn)證

    酶處理?xiàng)l件:將0.238 g/L TOMA溶液5 mL(2.5μmoL),于 40℃水浴中預(yù)熱 2min,脂肪酶用量0.5 ~3.5U,充分混勻后,于40℃、150 r/min 黑暗下處理20 min.濾膜過濾,濾液用于高效液相色譜(HPLC)分析檢測水解后產(chǎn)物(避光).HPLC條件:色譜柱采用 Zorbax SB-C18柱(4.6 mm×250 mm,5μm);流動相為水∶乙腈 =60∶40(體積比)的磷酸鹽緩沖液(0.02 mol/L,pH 值 6.99 ~ 7.01);柱溫30℃;流量1mL/min;進(jìn)樣量10 μL;采用 PDA檢測器,激發(fā)波長488nm,發(fā)射波長520nm.對照組中,使用等濃度未經(jīng)酶解的TOMA溶液代替酶解液.結(jié)果以降解率表示,計算公式如下:

    降解率=(酶解前TOMA含量-酶解后TOMA含量)/對照組TOMA含量×100%.其中,TOMA的含量以mg/mL為單位計.

    1.3.3 TOMA對DNA擴(kuò)增的抑制作用驗(yàn)證

    分別取 500 μL金黃色葡萄球菌、大腸桿菌O157:H7、單增李斯特菌菌液于1.5 mL離心管中,6000r/min離心3 min,收集菌體,等體積無菌水重懸.按照細(xì)菌基因組DNA快速提取試劑盒操作說明提取基因組DNA.分別向提取的3種細(xì)菌DNA中加入 TOMA 溶液使終濃度達(dá)到 0.0、0.5、1.0、3.0、5.0、10.0、15.0、20.0 mg/L,充分混勻后于黑暗處靜置5min,然后側(cè)放于碎冰上,在鹵鎢燈下方約20cm處光照5min,使TOMA與DNA交聯(lián),同時鈍化溶液中游離的TOMA分子.將經(jīng)過光照處理的DNA溶液作為實(shí)時熒光定量PCR反應(yīng)模板,考察TOMA對DNA擴(kuò)增的抑制作用.用DNAStar Seqman模塊(美國DNASTAR公司)對上述3種細(xì)菌分別進(jìn)行基因序列比對、用Primer Express 2.0(美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司)設(shè)計引物和探針.引物和探針序列如表1所示.

    表1 引物和探針序列Table 1 Nucleotide sequences of primers and fluorogenic probes

    熒光定量PCR反應(yīng)體系總體積為25 μL,其中含10 ×Buffer 2.5μL、25mmol/L 的Mg2+溶液3.5μL、25mmol/L 的 dNTPs 1 μL、15 μmol/L 的前后引物各1μL、10 μmol/L 的探針 1 μL、模板溶液 2 μL、Taq DNA 聚合酶2.5U、DEPC 水12.5μL.反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性2min,95℃變性5s,然后降溫至60℃并保持40s(收集熒光信號),該過程進(jìn)行40個循環(huán).反應(yīng)結(jié)束后40℃保溫2min.每個熒光定量PCR反應(yīng)各進(jìn)行3次平行實(shí)驗(yàn),計算平均Ct值(熒光信號達(dá)到設(shè)定的閾值所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù))和樣本標(biāo)準(zhǔn)差SD值.

    2 結(jié)果與討論

    2.1 TOMA分子表征與預(yù)期特性

    PMA對DNA擴(kuò)增的抑制作用源于分子上連接的疊氮基團(tuán),其在光作用下于原位與DNA發(fā)生共價結(jié)合,使DNA在PCR反應(yīng)中無法進(jìn)行復(fù)制,有效性早已得到廣泛承認(rèn)[9-12].PMA分子完全不具細(xì)胞膜穿透性,但對一些具有可逆性的部分膜損傷細(xì)胞(如存在于環(huán)境樣本中的細(xì)菌)以及部分膜完整的活菌,染料仍會穿透細(xì)胞膜,造成假陰性檢測結(jié)果[13-15].此外,對經(jīng)過紫外照射、冷凍滅菌等方法滅菌后仍保持細(xì)胞膜完整性的死菌,采用基于PMA的活菌PCR方法來評估會造成活細(xì)胞數(shù)目的嚴(yán)重高估,容易對檢測結(jié)果產(chǎn)生誤導(dǎo)[16].文中設(shè)計合成的TOMA是在總結(jié)PMA作用原理的基礎(chǔ)上,利用噻唑橙類菁染料具有細(xì)胞膜通透性的特點(diǎn),將PMA的功能與噻唑橙染料的優(yōu)點(diǎn)進(jìn)行聯(lián)合應(yīng)用.噻唑橙類染料能夠自由滲透細(xì)胞膜,本身無自發(fā)熒光,與核酸結(jié)合后熒光顯著增強(qiáng).目前對這類染料的應(yīng)用主要集中在核酸熒光標(biāo)記定位方面.Carreon等[17]合成了4種結(jié)構(gòu)不一的菁染料,對細(xì)胞線粒體進(jìn)行了成像與定位.與已知的噻唑橙染料的結(jié)構(gòu)相比,TOMA在喹啉環(huán)的一側(cè)通過帶有單個酯鍵的柔性碳鏈連接了疊氮基團(tuán),其相對分子質(zhì)量為474.6,吸收光譜在488nm,發(fā)射光譜在520nm,分子結(jié)構(gòu)經(jīng)高分辨質(zhì)譜儀及核磁共振儀表征無誤.在分子設(shè)計上,TOMA分子柔性碳鏈上的酯鍵更靠近疊氮基團(tuán)(而非噻唑橙基團(tuán)),目的是使成功被水解脫落的疊氮基團(tuán)分子更小,更有利于減小疊氮基團(tuán)脫落后與DNA發(fā)生交聯(lián)的概率.

    TOMA的預(yù)期特性有3個:一是能自由穿透細(xì)胞膜;二是分子中的羧酸酯鍵能被生物體內(nèi)大量存在的酯酶水解;三是未經(jīng)酯酶水解的TOMA分子與DNA結(jié)合并發(fā)生交聯(lián)后,能抑制DNA在PCR反應(yīng)中的擴(kuò)增.

    2.2 TOMA對細(xì)菌的透膜效果

    用Laica SP5激光共聚焦顯微鏡(100倍油鏡,放大1000倍)觀察TOMA穿透細(xì)胞膜與細(xì)菌DNA結(jié)合的效果.結(jié)果顯示TOMA對3種細(xì)菌均具有良好的細(xì)胞膜穿透性,菌體經(jīng)TOMA處理后發(fā)出強(qiáng)烈熒光.使用TOMA對活的大腸桿菌O157:H7處理后的顯微圖像及未經(jīng)TOMA處理的大腸桿菌O157:H7的顯微圖像如圖2所示.

    從圖2可見,菌懸液經(jīng)過TOMA處理后,TOMA透過細(xì)胞膜進(jìn)入菌體,與DNA發(fā)生特異性結(jié)合,所有菌體均產(chǎn)生了強(qiáng)烈綠色熒光,說明連接在TOMA分子上的疊氮基團(tuán)并沒有影響分子與DNA的結(jié)合以及熒光增強(qiáng),TOMA與DNA結(jié)合后產(chǎn)生的熒光強(qiáng)度也沒有因?yàn)榀B氮基團(tuán)的存在而出現(xiàn)明顯下降.未經(jīng)TOMA處理的菌體未檢測出任何熒光.

    噻唑橙類染料表現(xiàn)出與DNA的高結(jié)合率及結(jié)合后熒光強(qiáng)度的顯著增長,使其很適合作為DNA探針[18].TOMA利用了噻唑橙染料可在細(xì)胞中自由擴(kuò)散、通過被動運(yùn)輸透過細(xì)胞膜的特性,因此對活細(xì)胞和死細(xì)胞的DNA和RNA都可以進(jìn)行結(jié)合染色(發(fā)出熒光),對革蘭氏陽性和陰性細(xì)菌的核酸亦均可結(jié)合染色.TOMA自身沒有熒光,是由于次甲基橋鏈兩端的苯并噻唑(頭部)和喹啉環(huán)(尾部)之間的自由旋轉(zhuǎn)造成的,當(dāng)有核酸參與時,頭部與核酸的小溝結(jié)合,尾部插入堿基中,迫使頭部和尾部發(fā)色團(tuán)位置固定,導(dǎo)致熒光強(qiáng)度大大增強(qiáng)[19].因此,通過顯微鏡觀察到,使用TOMA處理后細(xì)菌的菌體發(fā)出熒光,這可作為判斷TOMA成功結(jié)合菌體DNA的標(biāo)準(zhǔn).實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,TOMA分子具有自由穿透細(xì)菌壁膜的特性,能夠成功穿透所有菌體細(xì)胞進(jìn)入菌體內(nèi)與DNA結(jié)合.TOMA對細(xì)胞膜的高穿透性,是利用TOMA建立起一套比PMA-qPCR檢測方法更準(zhǔn)確的活菌檢測技術(shù)的前提.

    圖2 經(jīng)過TOMA處理和未經(jīng)TOMA處理的大腸桿菌O157:H7的熒光顯微圖像Fig.2 Fluorescence images of Escherichia coli O157:H7 with and without TOMA treatment

    2.3 TOMA的酶活敏感性

    TOMA采用帶有對酶活敏感的羧酸酯鍵的柔性碳鏈作為噻唑橙基團(tuán)與疊氮基團(tuán)的連接臂,是因?yàn)轷ッ冈诩?xì)胞內(nèi)普遍大量存在而且種類繁多.脂肪酶屬于酯酶下的一個亞類,基本上存在于所有的生物體中[20],對維持生物體正常的功能運(yùn)轉(zhuǎn)有重要作用.目前已有成熟的基于活細(xì)胞酯酶活性的熒光染色試劑盒上市.如PromoKine公司的Live/Dead Cell Staining試劑盒,采用中性非熒光底物CTOMAein-AM對細(xì)胞進(jìn)行處理,CTOMAein-AM滲透入活性細(xì)胞內(nèi)后,分子的內(nèi)酯鍵(羧酸酯鍵)被非特異性酯酶切斷,生成不能穿過細(xì)胞膜的綠色極性熒光物質(zhì)而被阻留在細(xì)胞體內(nèi)[21].

    在5mL 0.238g/L TOMA溶液中添加不同量的固定化脂肪酶,40℃、150r/min下處理20min后,使用HPLC上機(jī)檢測.TOMA降解率隨脂肪酶用量(以每μmol TOMA中添加的脂肪酶的量計)的變化情況如圖3所示.

    由圖3可見,酶用量在0.2 ~1.0 U之間時,TOMA的降解率隨酶用量增加呈上升趨勢,降解率與酶用量之間成簡單線性關(guān)系;繼續(xù)增加酶用量至1.2、1.4 U,降解率基本不發(fā)生變化,說明過量的脂肪酶并不能提高TOMA的降解效果;而酶量不足會直接影響TOMA的降解效率,這一點(diǎn)與TOMA分子設(shè)計的初衷相符合.因?yàn)楫?dāng)細(xì)菌喪失生物代謝能力時,TOMA在菌體內(nèi)將無法被降解,在后續(xù)的光照中疊氮基團(tuán)在原位與DNA進(jìn)行交聯(lián),從而抑制DNA在PCR反應(yīng)中擴(kuò)增.反之,在具有代謝活性的細(xì)胞中,TOMA中連接噻唑橙基團(tuán)和疊氮基團(tuán)的羧酸酯鍵被水解,疊氮基團(tuán)從分子上脫落,失去后續(xù)與DNA交聯(lián)的能力,對DNA擴(kuò)增無影響.對于VBNC菌,菌體的酶活性可能較低,適當(dāng)延長細(xì)菌與TOMA的孵育時間有助于反應(yīng)完全.此外,從圖3可以看出,本實(shí)驗(yàn)使用的脂肪酶最佳酶用量應(yīng)為1.0U,此時TOMA的降解率達(dá)到83%以上.

    體外實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,TOMA分子中的酯鍵設(shè)計達(dá)到了預(yù)期目的.實(shí)驗(yàn)中TOMA分子上連接的酯鍵對酯酶活性表現(xiàn)敏感,可在短時間內(nèi)被脂肪酶水解,使疊氮基團(tuán)脫落.而酯酶在活細(xì)胞內(nèi)大量存在,因此,利用TOMA判斷細(xì)胞是否具有生物代謝活性是可行的.設(shè)計TOMA分子,是希望通過細(xì)胞生物代謝活性的有無,選擇性地抑制無代謝活性的細(xì)菌的DNA擴(kuò)增,從而達(dá)到對活菌進(jìn)行定量檢測的目的.

    然而,不同屬不同株的細(xì)菌體內(nèi)表達(dá)的酶類與酶量之間有差異,不同存活狀態(tài)下細(xì)菌代謝活力也不盡相同.因此,對食源性致病菌體內(nèi)酯酶種類、活性進(jìn)行鑒定和測定后,探索幾種典型食源性致病菌在不同存活狀態(tài)下酯酶代謝活性水平的差異特征,從而進(jìn)一步優(yōu)化TOMA的使用方法,是下一步研究的方向.

    2.4 TOMA對DNA擴(kuò)增的抑制效果

    TOMA分子中的疊氮基團(tuán)與EMA/PMA中的疊氮基團(tuán)相同.當(dāng)分子在水溶液狀態(tài)下被光照時,疊氮基團(tuán)迅速失去自由氮產(chǎn)生活性氮烯,與水形成羥胺衍生物,當(dāng)分子處于與DNA結(jié)合狀態(tài)而非游離狀態(tài)時,由于氮烯對DNA的進(jìn)攻,分子的疊氮基團(tuán)與DNA形成共價鍵,從而在原位生成共價復(fù)合物[22].與疊氮基團(tuán)共價結(jié)合后的DNA無法參與PCR擴(kuò)增.

    TOMA濃度對DNA擴(kuò)增的影響如圖4所示.由圖4可見,3種細(xì)菌的DNA在PCR反應(yīng)中的Ct值均隨著TOMA濃度的增大而顯著增大,表明TOMA與DNA結(jié)合后,分子上的疊氮基團(tuán)對DNA擴(kuò)增的抑制效果明顯,并且抑制效果與TOMA濃度呈正相關(guān).使用低濃度(0.5、1.0 mg/L)TOMA 處理的 DNA溶液,其PCR反應(yīng)后的Ct值與TOMA濃度為0的DNA溶液的相比增幅不大,說明使用過低濃度的TOMA對DNA擴(kuò)增的影響不大,因此,采用低濃度的TOMA在活菌檢測中可能會造成假陽性的結(jié)果.實(shí)驗(yàn)中TOMA濃度為10.0 mg/L時,TOMA對DNA的抑制作用明顯,此時Ct值達(dá)到36左右,繼續(xù)增大TOMA濃度至15.0 mg/L對Ct值僅有輕微影響.而當(dāng)TOMA濃度達(dá)到20.0mg/L時,整個PCR反應(yīng)過程無檢出,推測可能過高濃度的TOMA會對PCR反應(yīng)有抑制作用.實(shí)驗(yàn)表明,TOMA分子中連接的疊氮基團(tuán)在光照下能成功對DNA進(jìn)行共價交聯(lián)作用,在合適的濃度條件下能充分抑制DNA在PCR反應(yīng)中的擴(kuò)增.

    圖4 TOMA濃度對DNA擴(kuò)增的影響Fig.4 Effect of TOMA concentration on DNA amplification

    3 結(jié)語

    文中設(shè)計合成了一種新型噻唑橙衍生物TOMA,并分別從3個方面對TOMA的預(yù)期特性進(jìn)行驗(yàn)證.結(jié)果表明:連接疊氮基團(tuán)的TOMA分子可以自由透過細(xì)菌的細(xì)胞膜;TOMA分子上的酯鍵能在酶作用下被快速高效降解;TOMA分子對DNA擴(kuò)增具有明顯的抑制作用.TOMA分子的預(yù)期功能特性在體外實(shí)驗(yàn)中得到了初步證實(shí),為進(jìn)一步運(yùn)用TOMA對細(xì)菌進(jìn)行活菌檢測研究提供了重要參考.后續(xù)研究中,擬將TOMA與實(shí)時熒光PCR技術(shù)結(jié)合起來,利用死/活細(xì)菌體內(nèi)生物活性的差異來對致病菌進(jìn)行快速有效的檢測.由于TOMA對細(xì)菌體內(nèi)的生物活性敏感度高,TOMA應(yīng)用在致病菌活菌檢測技術(shù)中能同時克服傳統(tǒng)qPCR法假陰性和PMA-qPCR法假陽性的缺點(diǎn),有效識別VBNC菌、非膜損傷死菌等,為致病菌活菌檢測手段提供新的方向.

    [1]Riedy M C,Muirhead K A,Jensen C P,et al.Use of a photolabeling technique to identify nonviable cells in fixed homologous or heterologous cell populations[J].Cytometry,1991,12(2):133-139.

    [2]Marouani-Gadri N,F(xiàn)irmesse O,Chassaing D,et al.Potential of Escherichia coli O157:H7 to persist and form viable but non-culturable cells on a food-contact surface subjected to cycles of soiling and chemical treatment[J].International Journal of Food Microbiology,2010,144(1):96-103.

    [3]Nogva H K,Dromtorp S M,Nissen H,et al.Ethidium monoazide for DNA-based differentiation of viable and dead bacteria by 5'-nuclease PCR [J].BioTechniques,2003,34(4):804-813.

    [4]Rudi K,Moen B,Dr?mtorp S M,et al.Use of ethidium monoazide and PCR in combination for quantification of viable and dead cells in complex samples[J].Applied and Environmental Microbiology,2005,71(2):1018-1024.

    [5]Nocker A,Sossa-Fernandez P,Burr M D,et al.Use of propidium monoazide for live/dead distinction in microbial ecology [J].Applied and Environmental Microbiology,2007,73(16):5111-5117.

    [6]Pisz J M,Lawrence J R,Schafer A N,et al.Differentiation of genes extracted from non-viable versus viable micro-organisms in environmental samples using ethidium monoazide bromide[J].Journal of Microbiological Methods,2007,71(3):312-318.

    [7]Varma M,F(xiàn)ield R,Stinson M,et al.Quantitative real-time PCR analysis of total and propidium monoazide-resistant fecal indicator bacteria in wastewater[J].Water Research,2009,43(19):4790-4801.

    [8]Wagner A O,Malin C,Knapp B A,et al.Removal of free extracellular DNA from environmental samples by ethidium monoazide and propidium monoazide[J].Applied and Environmental Microbiology,2008,74(8):2537-2539.

    [9]Agustí G,Codony F,F(xiàn)ittipaldi M,et al.Viability determination of Helicobacter pylori using propidium monoazide quantitative PCR [J].Helicobacter,2010,15(5):473-476.

    [10]Rawsthorne H,Dock C N,Jaykus L A.PCR-based method using propidium monoazide to distinguish viable from nonviable Bacillus subtilis spores[J].Applied and Environmental Microbiology,2009,75(9):2936-2939.

    [11]Vesper S,McKinstry C,Hartmann C,et al.Quantifying fungal viability in air and water samples using quantitative PCR after treatment with propidium monoazide(PMA)[J].Journal of Microbiological Methods,2008,72(2):180-184.

    [12]Andorrà I,Esteve-Zarzoso B,Guillamón J M,et al.Determination of viable wine yeast using DNA binding dyes and quantitative PCR [J].International Journal of Food Microbiology,2010,144(2):257-262.

    [13]Fittipaldi M,Nocker A,Codony F.Progress in understanding preferential detection of live cells using viability dyes in combination with DNA amplification[J].Journal of Microbiological Methods,2012,91(2):276-289.

    [14]Kralik P,Nocker A,Pavlik I.Mycobacterium avium subsp paratuberculosis viability determination using F57 quantitative PCR in combination with propidium monoazide treatment[J].International Journal of Food Microbiology,2010,141(Suppl 1):S80-S86.

    [15]Liang N,Dong J,Luo L,et al.Detection of viable Salmonella in lettuce by propidium monoazide real-time PCR[J].Journal of Food Science,2011,76(4):M234-M237.

    [16]Nocker A,Sossa K E,Camper A K.Molecular monitoring of disinfection efficacy using propidium monoazide in combination with quantitative PCR [J].Journal of Microbiological Methods,2007,70(2):252-260.

    [17]Carreon J R,Stewart K M,Mahon Jr K P,et al.Cyanine dye conjugates as probes for live cell imaging [J].Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters,2007,17(18):5182-5185.

    [18]Isacsson J,Westman G.Solid-phase synthesis of asymmetric cyanine dyes[J].Tetrahedron Letters,2001,42(18):3207-3210

    [19]陳秀英,牛艷明,郭琳,等.噻唑橙核酸熒光探針的合成及光譜性質(zhì)研究[J].化學(xué)研究與應(yīng)用,2010,22(10):1267-1271.Chen Xiu-ying,Niu Yan-ming,Guo Lin,et al.Synthesis and spectral properties of thiazole orange compounds as DNA fluorescent probes[J].Chemical Research and Application,2010,22(10):1267-1271.

    [20]Svendsen A.Lipase protein engineering[J].Biochimica et Biophysica Acta(BBA)-Protein Structure and Molecular Enzymology,2000,1543(2):223-238.

    [21]Grieshaber P,Lagrèze W A,Noack C,et al.Staining of fluorogold-prelabeled retinal ganglion cells with cTOMAein-AM:a new method for assessing cell vitality[J].Journal of Neuroscience Methods,2010,192(2):233-239.

    [22]Coffman G L,Gaubatz J W,Yielding K L,et al.Demonstration of specific high affinity binding sites in plasmid DNA by photoaffinity labeling with an ethidium analog[J].Journal of Biological Chemistry,1982,257(22):13205-13207.

    猜你喜歡
    疊氮噻唑酯酶
    基于苯并噻唑用作分析物檢測的小分子熒光探針
    云南化工(2021年7期)2021-12-21 07:27:22
    地黃梓醇和乙酰膽堿酯酶作用的分子動力學(xué)模擬
    降低乏燃料后處理工藝中HN3 含量的方法研究
    蜈蚣草化學(xué)成分及抑制乙酰膽堿酯酶生物活性研究
    新的藥根堿三唑的合成與抗菌以及乙酰膽酯酶抑制活性評價
    兩種不同結(jié)構(gòu)納米疊氮化銅的含能特性研究
    火工品(2018年1期)2018-05-03 02:27:56
    齊多夫定生產(chǎn)中疊氮化工藝優(yōu)化
    3-疊氮基丙基-β-D-吡喃半乳糖苷的合成工藝改進(jìn)
    高效液相色譜法同時測定反應(yīng)液中的苯并噻唑和2-巰基苯并噻唑
    二咖啡酰奎寧酸與人血漿阿司匹林酯酶的分子對接
    中成藥(2014年9期)2014-02-28 22:28:55
    水城县| 策勒县| 东兰县| 丹巴县| 广宁县| 陕西省| 宾阳县| 榆林市| 泰来县| 晋中市| 禄劝| 陈巴尔虎旗| 宜兰市| 常山县| 宜昌市| 泽州县| 湘阴县| 格尔木市| 巴塘县| 宁海县| 新建县| 惠州市| 霍山县| 三原县| 凭祥市| 娄底市| 库尔勒市| 斗六市| 高尔夫| 伊金霍洛旗| 中牟县| 五常市| 溧阳市| 北宁市| 通辽市| 北京市| 睢宁县| 鄱阳县| 金坛市| 黄石市| 错那县|