蘇雅拉圖,張永勝,陳宇杰,胡小平,王麗穎,萬 敏,吳柒柱
(1.內(nèi)蒙古民族大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,內(nèi)蒙古 通遼 028000;2.吉林大學(xué)白求恩醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室 ,吉林 長春 130021)
干擾素β(interferon-β,IFN-β)具有廣泛的抗病毒作用,對(duì)一般病毒感染有促進(jìn)機(jī)體恢復(fù)及縮短病程的作用[1-2]。IFN-β對(duì)某些癌細(xì)胞有抑制作用,可下調(diào)細(xì)胞原癌基因的轉(zhuǎn)錄水平,下調(diào)某些生長因子受體表達(dá)[3],對(duì)巨噬細(xì)胞的功能有增進(jìn)作用,并可調(diào)節(jié)T、B淋巴細(xì)胞的功能[4]。利用基因工程下游技術(shù)可以在大腸桿菌中表達(dá)IFN-β,但表達(dá)產(chǎn)物往往是以包涵體形式存在,要通過變復(fù)性過程才可以獲得有活性的IFN-β。一些文獻(xiàn)[5-6]報(bào)道:在研究中存在包涵體無法溶解或溶解效率低的問題。本文作者主要在重組小鼠IFN-β原核表達(dá)載體的構(gòu)建及包涵體溶解效率等技術(shù)方面做了嘗試,以期為篩選適合包涵體溶解的條件提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
Balb/c鼠(昆明鼠)購自吉林大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心。內(nèi)切酶NcoⅠ、HindⅢ和T4DNA連接酶、pMD18-T質(zhì)粒購自寶生物工程有限公司(大連);Taq DNA聚合酶購自Promega公司;DNA回收試劑盒購自北京鼎國生物技術(shù)公司;IPTG購自Sigma公司;pET-28a(+)質(zhì)粒購于美國Novagen公司;JM109菌種和BL21(DE3)菌種由吉林大學(xué)白求恩醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供。
采用primer 5.0軟件設(shè)計(jì)引物。上游引物,5'-CCATGG(NcoⅠ酶切位點(diǎn))GA(調(diào)解堿基錯(cuò)位)ATCAACTATAAGCAGCTC-3′;下游引物,5′-G(調(diào)解 GC比)AAGCTT(HindⅢ酶切位點(diǎn))GTTTTGGAAGTTTCTGGT-3′,由上海生工生物技術(shù)公司合成。
采用新鮮小鼠肝組織提取DNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,電泳回收片段,T-A克隆pMD18-T質(zhì)粒。將重組pMD18-T質(zhì)粒轉(zhuǎn)化JM109感受態(tài)細(xì)胞,菌液移入培養(yǎng)基中,置37℃恒溫箱中過夜。從氨芐青霉素(Amp)抗性LB固體培養(yǎng)基中挑單菌落接種于含5mL LB液體培養(yǎng)基(Amp:75mg·L-1)試管中,37℃、175r·min-1振蕩培養(yǎng)過夜。堿溶解法小量制備質(zhì)粒,由限制性內(nèi)切酶NcoⅠ和HindⅢ雙酶切,電泳,能釋放出目的片段的質(zhì)粒為陽性克隆?;厥漳康钠?,同時(shí)將PET28a空質(zhì)粒NcoⅠ和HindⅢ雙酶切回收。在T4DNA連接酶的作用下將目的片段定向克隆至雙酶切的PET28a空質(zhì)粒中,后將其轉(zhuǎn)化到BL21表達(dá)工程菌。菌液移入KaNa抗性LB固體培養(yǎng)基中,37℃恒溫箱中過夜培養(yǎng)。從KaNa抗性LB固體培養(yǎng)基中挑單菌落接種于含5mL LB液體培養(yǎng)基(Amp:75mg·L-1)試管中,37℃、175r·min-1振蕩培養(yǎng)過夜。堿溶解法小量制備質(zhì)粒,限制性內(nèi)切酶NcoⅠ和HindⅢ雙酶切,產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠中電泳,能釋放出目的片段的質(zhì)粒為陽性克隆。陽性重組質(zhì)粒送上海生工公司測序。將重組IFN-β命名為IFN-β′,并利用 DNA star序列分析軟件分析IFN-β′成熟蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)、等電點(diǎn)及相對(duì)分子質(zhì)量。確定測序結(jié)果與GenBank登錄的小鼠IFN-β的序列信息相符后,用IPTG誘導(dǎo)表達(dá),并SDS-PAGE鑒定。
菌液11000r·min-1離心10min,沉淀加入溶解液(Tirs 20mmol · L-1,NaCl 500mmol·L-1,尿素8mol·L-1,pH 7.8)攪拌均勻后4℃冰箱過夜。次日取混合液100μL,11000r·min-1離心10min,將沉淀和上清分離,沉淀加入100μL祛離子水混勻后,上清與沉淀各加5×非還原Buffer 25μL沸煮5min,離心。經(jīng)15%SDS-PAGE檢測。因IFN-β′蛋白以包涵體形式表達(dá),所以在進(jìn)行此重組蛋白的復(fù)性和純化過程中要求先對(duì)包涵體進(jìn)行溶解。傳統(tǒng)方法溶解IFN-β′蛋白包涵體,以1g菌∶5mL溶解液混勻,超聲波破菌(工作5s,間隔5s,60次),4℃過夜,次日15%SDS-PAGE檢測。本研究對(duì)比了不同溶解液成分、不同pH環(huán)境、不同干菌與溶`解液比例、不同溶解溫度、不同溶解時(shí)間等主要因素對(duì)包涵體溶解效果的影響。同時(shí)觀察不同包涵體洗滌液對(duì)包涵體溶解效果的影響(洗滌液1:Tris 50mmol·L-1,pH 7.8; 洗滌液2:Tris 50mmol·L-1,尿素2mol·L-1,TritonX-1001/50,pH 7.8)。
利用DNA star預(yù)測到IFN-β′成熟蛋白的等電點(diǎn)(pI)為9.67,相對(duì)分子質(zhì)量為21300。重組蛋白氨基酸序列中含有1個(gè)半胱氨酸。用限制性內(nèi)切酶NcoⅠ和HindⅢ雙酶切重組質(zhì)粒pET/IFN-β,1%瓊脂糖電泳顯示在486bp處有條帶產(chǎn)生,證明IFN-β基因插入 pET-28a(+)質(zhì)粒的 NcoⅠ 和HindⅢ酶切位點(diǎn)間。見圖1。
圖1 雙酶切pET-28a的瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.1 Agarose gel electrophoregram of pET-28adigested by enzyme
用相同濃度IPTG誘導(dǎo)不同時(shí)間(圖2A)及不同IPTG濃度誘導(dǎo)相同時(shí)間(圖2B)對(duì)目的蛋白表達(dá)量均有影響。目的蛋白表達(dá)量與誘導(dǎo)時(shí)間有關(guān);由于IPTG可循環(huán)使用,且0.06~0.40mmol·L-1的IPTG濃度所表達(dá)的產(chǎn)量基本相同,為了減少IPTG對(duì)菌體的傷害,并且考慮操作方便,在實(shí)驗(yàn)中用0.1mmol·L-1IPTG誘導(dǎo)。
應(yīng)用超聲方法裂解經(jīng)0.1mmol·L-1IPTG誘導(dǎo)的E.coli菌體,檢測是否有可溶性的IFN-β′蛋白表達(dá)。SDS-PAGE分析顯示:IFN-β′蛋白不以可溶性形式表達(dá)(圖3A)。改變誘導(dǎo)條件為18℃、150r·min-1過夜誘導(dǎo)12h,SDS-PAGE分析顯示:IFN-β′蛋白仍然以包涵體形式表達(dá)(圖3B)。
2.4.1 傳統(tǒng)方法溶解包涵體蛋白 用傳統(tǒng)方法溶解IFN-β′蛋白包涵體后,SDS-PAGE分析顯示:IFN-β′蛋白不能被溶解。見圖4。
圖2 表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE電泳圖Fig.2 SDS-PAGE electrophoregram of expression product
圖3 可溶性IFN-β′蛋白表達(dá)的SDS-PAGE電泳圖Fig.3 SDS-PAGE electrophoregram of soluble IFN-β′protein expression
2.4.2 使用不同pH值溶解液包涵體蛋白溶解情況 改變?nèi)芙庖簆H值溶解IFN-β′蛋白包涵體,SDS-PAGE檢測結(jié)果顯示:改變包涵體溶解液pH值對(duì)IFN-β′蛋白包涵體的溶解無明顯影響。見圖5。
2.4.3 溶解液中加入DTT時(shí)包涵體蛋白溶解情況 在溶解液中加入DTT溶解IFN-β′蛋白包涵體,SDS-PAGE檢測結(jié)果顯示:溶解液中加入DTT對(duì)IFN-β′蛋白包涵體的溶解無明顯影響。見圖6。
圖4 包涵體溶解SDS-PAGE電泳圖Fig.4 SDS-PAGE electrophoregram of dissolved inclusion body
圖5 不同pH值溶解液溶解包涵體的SDS-PAGE電泳圖Fig.5 SDS-PAGE electrophoregram of lysis inclusion body in solutions with different pH values
圖6 溶解液中加入DTT后SDS-PAGE電泳圖Fig.6 SDS-PAGE electrophoregram of lysis precipitation added with DDT
2.4.4 包涵體洗滌后溶解效果 為防止菌體碎片對(duì)溶解液溶解包涵體產(chǎn)生影響,裂解包涵體前使用包涵體洗滌液進(jìn)行洗滌,純化的包涵體再經(jīng)溶解液溶解,SDS-PAGE檢測結(jié)果顯示:包涵體經(jīng)洗滌后不能被溶解液所溶解。見圖7。
圖7 包涵體洗滌后溶解SDS-PAGE電泳圖Fig.7 SDS-PAGE electrophoregram of the inclusion body after washing and dissolving
2.4.5 尿素溶解液溶解包涵體SDS-PAGE檢測結(jié)果 因采用8mol·L-1尿素不能溶解IFN-β′蛋白包涵體,因此嘗試用10mol·L-1尿素的溶解液來裂解蛋白包涵體,SDS-PAGE檢測結(jié)果顯示:含有10mol·L-1尿素濃度的溶解液亦不能溶解此包涵體。見圖8。
圖8 10mol·L-1尿素溶解液溶解包涵體SDS-PAGE電泳圖Fig.8 SDS-PAGE electrophoregram of inclusion body dissolved with 10mol·L-1 urea solution
2.4.6 使用不同比例溶解液包涵體蛋白溶解情況
考慮到溶解包涵體蛋白濃度和溫度對(duì)包涵體的溶解有一定影響,因此嘗試增加溶解液的比例,溶解液比例增加至1g菌∶20mL溶解液,并且分別在室溫和37℃溫度下觀察包涵體溶解情況,SDSPAGE檢測結(jié)果顯示:溫度對(duì)包涵體溶解幾乎無影響,而增加溶解液比例能溶解部分IFN-β′蛋白包涵體。見圖9。
圖9 不同比例溶解液溶解包涵體SDS-PAGE電泳圖Fig.9 SDS-PAGE electrophoregram of inclusion body dissolved with different proportions of solution
包涵體主要是由于在重組蛋白的表達(dá)過程中缺乏某些蛋白質(zhì)折疊的輔助因子,而無法形成正確的次級(jí)鍵等原因形成的[7];也可能是外源基因合成速度太快,沒有足夠的時(shí)間進(jìn)行折疊,二硫鍵不能正確的配對(duì),使過多的蛋白間發(fā)生非特異性結(jié)合,蛋白質(zhì)無法達(dá)到足夠的溶解度[8]。IFN-β的表達(dá)產(chǎn)物往往以包涵體形式存在,要通過變復(fù)性過程才可以獲得有活性的IFN-β。Li等[9]比較了7mol·L-1鹽酸 胍、8mol·L-1尿 素、2%Sarkosyl與2mol·L-1尿素加pH值的變性液對(duì)rhG-CSF包涵體蛋白的溶解和復(fù)性的影響,結(jié)果顯示:高pH值環(huán)境能有效溶解該蛋白,低濃度的尿素具有協(xié)同作用。Singh等[10]研究了含有不同羥基的醇類對(duì)hGH包涵體蛋白的溶解,結(jié)果表明:6mol·L-1正丙醇加2mol·L-1尿素的溶解效果最好。2011年Yang等[11]用這種兩步變性一步復(fù)性方法對(duì)91種包涵體從進(jìn)行變復(fù)性,其中76%的蛋白平均復(fù)性率高于75%。本文作者在實(shí)驗(yàn)中嘗試了更換溶解液、改變尿素濃度、改變?nèi)芙猸h(huán)境、調(diào)整溶解液pH值、調(diào)整誘導(dǎo)表達(dá)時(shí)間等方法,但蛋白包涵體仍難以被溶解;在使用1g菌加20mL溶解液時(shí)發(fā)現(xiàn)包涵體有溶解,結(jié)果表明:增加溶解液比例可以提高包涵體的溶解率。
研究[12]顯示:低溫誘導(dǎo)表達(dá)可提高可溶性目的蛋白產(chǎn)量;Yang等[13]認(rèn)為:低溫能降低蛋白質(zhì)合成的速率,改變多肽折疊的動(dòng)力學(xué),從而導(dǎo)致正確折疊的蛋白增加。也有研究[14-15]顯示:可能在較低溫度下,與蛋白折疊和蛋白聚合相關(guān)的蛋白的表達(dá)更有利于菌體形成穩(wěn)定的可溶性蛋白。
本研究中蛋白在低溫過夜誘導(dǎo)時(shí)未出現(xiàn)可溶性表達(dá),這可能與蛋白本身特性有關(guān)。不同的菌株其最佳誘導(dǎo)表達(dá)時(shí)間是不同的,即便是同一種菌株,在細(xì)菌生長密度和蛋白表達(dá)條件不一樣的時(shí)候其最佳表達(dá)時(shí)間也會(huì)有所差別。誘導(dǎo)時(shí)間過短,表達(dá)水平下降;誘導(dǎo)時(shí)間過長,由于培養(yǎng)基的消耗,使細(xì)菌老化,也會(huì)導(dǎo)致表達(dá)量的降低。采用不同濃度的IPTG、37℃誘導(dǎo)相同時(shí)間發(fā)現(xiàn):IPTG濃度在0.1~1.0mmol·L-1之間表達(dá)量相同。
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