唐洪文,張 婷,陳鐵壁,譚 超,陳宇光,※
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南長(zhǎng)沙410128;2.湖南省永州市道縣畜牧水產(chǎn)局,湖南永州425302;3.湖南科學(xué)技術(shù)學(xué)院生命科學(xué)與化學(xué)工程系,湖南永州425100)
隨著人們生活水平的不斷提高,保健意識(shí)的增強(qiáng)與消費(fèi)觀念的改變,對(duì)各類肉制品不再是量的需求,而更多的關(guān)注于肉質(zhì)風(fēng)味,產(chǎn)品品質(zhì)與營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。其中研究發(fā)現(xiàn)心臟脂肪酸結(jié)合蛋白(HeartFattyAcidBindingProtein,H-FABP)是影響肌肉脂肪蛋白(IMF)含量的候選基因之一,其肌肉脂肪的含量的多少與肉質(zhì)性狀有著密切的關(guān)系。H-FABP基因是從腸細(xì)胞液成分中分離出來(lái)的小分子細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì),能特異的結(jié)合脂肪酸,可以將脂肪酸從細(xì)胞膜運(yùn)送到三酞甘油及磷脂的合成部位和進(jìn)行β一氧化的場(chǎng)所[1],通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)脂肪酸濃度來(lái)轉(zhuǎn)運(yùn)長(zhǎng)鏈脂肪酸和調(diào)節(jié)脂肪酸代謝平衡[2],主要在骨骼肌、心肌和泌乳的乳腺中表達(dá)[3]。目前關(guān)于H-FABP基因的研究多集中于多態(tài)性、生產(chǎn)性狀與肉質(zhì)性能之間相關(guān)性與差異表達(dá)分析。本文綜述H-FABP基因在動(dòng)物生產(chǎn)中的應(yīng)用情況為生產(chǎn)實(shí)際提供理論參考。
H-FABP基因又稱FABP3,不同物種H-FABP基因都由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子組成,其間距大約為10bp,如圖1所示。外顯子1包含了所2有5’未翻譯序列,并編碼最初的24個(gè)氨基酸;外顯子2和3分別編碼59和34個(gè)氨基酸,外顯子4編碼最后的16個(gè)氨基酸和3’未翻譯的區(qū)域。在不同種物種之間H-FABP基因的編碼區(qū)有很高同源性,這不僅表現(xiàn)在所編碼的氨基酸上,還表現(xiàn)在其DNA序列上。在物種間外顯子具有高度的保守性,分別編碼了24、58、34和17個(gè)氨基酸,三個(gè)內(nèi)含子的大小分別為4.2、2.5和1.5kb,但內(nèi)含子在物種間的差異卻很大[4]。
不同物種間H-FABP基因定位于不同的染色體上,人類的H-FABP基因定位于1號(hào)染色體上[5];豬的H-FABP基因定位于6號(hào)染色體上,擁有1.6kb的上游調(diào)控序列和0.2kb的3’非轉(zhuǎn)錄區(qū),含有4個(gè)外顯子,分別轉(zhuǎn)錄含有24、58、17和17個(gè)氨基酸的多態(tài)片段[6]。鼠的H-FABP基因定位于4號(hào)染色體上[7]。雞的H-FABP基因定位于23號(hào)染色體上,牛定位于2號(hào)染色體上,都由4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子組成。
Gerbens等[8]用PCR-RFLPs技術(shù),發(fā)現(xiàn)了位于5’上游區(qū)的1個(gè)多態(tài)位點(diǎn)HinfI-RFLP以及位于第二內(nèi)含子內(nèi)的2個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)HaeIII-RFLP和MspI-RFLP。張桂香等[9]運(yùn)用PCR-RFLP技術(shù)研究9個(gè)豬種(皖南花豬、二花臉豬、金華豬、小梅山豬、滇南小耳豬、香豬、榮昌豬、北京黑豬和大白豬)H-FABP基因5’-上游區(qū)和第二內(nèi)含子的遺傳變異發(fā)現(xiàn),9個(gè)品種中都在5’-上游區(qū)驗(yàn)證了一個(gè)HinfI-RFLP多態(tài)性位點(diǎn),而在內(nèi)含子發(fā)現(xiàn)了一個(gè)HaeIII-RFLP,但該多態(tài)性位點(diǎn)只存在于皖南花豬和大白豬中,另外還發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的多態(tài)HinfI*酶切點(diǎn),但在所有所測(cè)豬中并沒(méi)發(fā)現(xiàn)MspI-RFLP。曹紅鶴等[10]進(jìn)一步確定了3個(gè)酶切位點(diǎn)(5’-上游區(qū)HinfI-RFLP、內(nèi)含子2的HaeIII-RFLP和Hinf I*-RFLP)并對(duì)每個(gè)多態(tài)片段進(jìn)行克隆測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),5c-上游區(qū)HinfI-RFLP是由于1324位的堿基發(fā)生了T到C的突變;在內(nèi)含子2中,Hae III-RFLP變異酶切位點(diǎn)在1811位,發(fā)生了C→G的突變引起;HinfI*-RFLP是由于1970位發(fā)生了T到C的堿基替換。朱弘焱等[11]檢測(cè)遼寧種豬(東北荷包豬、大白豬、長(zhǎng)白豬和杜洛克豬)H-FABP的多態(tài)性位點(diǎn)發(fā)現(xiàn),HinfI和HaeIII酶切點(diǎn)都顯示多態(tài)性,且優(yōu)勢(shì)基因型分別為HH和dd型,其中分析荷包豬H-FABP基因5’-上游區(qū)和第二內(nèi)含子多態(tài)性,結(jié)果顯示H和d基因的頻率較高。周全勇等[12]運(yùn)用PCR-RFLP技術(shù)對(duì)玉山黑豬多態(tài)性進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),在HinfI位點(diǎn)上玉山黑豬H-FABP基因表現(xiàn)多態(tài)性,在HaeIII位點(diǎn)上為單一等位基因。
豬肌內(nèi)脂肪(intramuscularfat,IMF)含量是豬肉品質(zhì)的重要性狀之一。H-FABP基因作為IMF候選基因,其遺傳變異影響了豬肉肌肉脂肪含量及豬肉品質(zhì)。龐衛(wèi)軍等[13]對(duì)西部地區(qū)主要豬種和野豬的H-FABP基因研究表明,同一豬種的不通基因型間IMF含量存在差異,9種基因型對(duì)IMF含量均存在影響,HH>Hh>hh,DD
不同H-FABP基因的基因型對(duì)豬的生長(zhǎng)性能存在一定影響。劉劍鋒等[18]對(duì)中畜黑豬1系研究發(fā)現(xiàn),在HinfI-RFLP位點(diǎn)上,HH和hh2種基因型間170日齡體重差異顯著,在其他位點(diǎn)上未發(fā)現(xiàn)生長(zhǎng)性能間的顯著差異。林萬(wàn)華等[19]的研究報(bào)道,20日齡的二花臉豬H-FABP基因,HH、Hh和hh3種基因型間體重差異顯著;在不同基因型間,每個(gè)日齡組的肌肉組織學(xué)性狀值表現(xiàn)為差異不顯著。曲亮等[20]的試驗(yàn)分析H-FABP基因的3個(gè)變異位點(diǎn)對(duì)胴體性狀的影響,結(jié)果顯示只有HinfI位點(diǎn)對(duì)蘇淮豬胴體性狀影響顯著,HH基因型個(gè)體的瘦肉率最高,hh基因型個(gè)體的背膘最厚;分析3個(gè)變異位點(diǎn)單倍體發(fā)現(xiàn),HH-DD-AA型和HH-Dd-Aa型的瘦肉率超過(guò)60%,同時(shí),hh-DD-AA型背膘最厚,瘦肉率最低,與HH-DD-AA相比,預(yù)示H等位基因能明顯提高瘦肉率等性狀。為提高胴體性狀,在育種工作中可以重點(diǎn)選留HH型個(gè)體繁殖后代。
王彥等[21]通過(guò)運(yùn)用PCR-RFLP技術(shù)分析雞的H-FABP基因發(fā)現(xiàn)在引物1260位點(diǎn)處有一個(gè)C到T的單堿基突變和在2765位點(diǎn)處的一個(gè)A到G的單堿基突變,產(chǎn)生了3種基因型:AA、AB、BB。結(jié)果在T260C位點(diǎn)上,所有雞的品種中AA基因型的IMF含量顯著高于BB基因型個(gè)體;而在不同品種中,AA和BB基因型只對(duì)封開(kāi)杏花雞和嶺南黃雞II號(hào)的IMF含量有顯著影響,對(duì)其他品種雞的IMF含量都無(wú)顯著影響。朱祥云等[22]以H-FABP為候選基因,運(yùn)用PCR-SSCP方法對(duì)6周零3個(gè)群體的北京鴨進(jìn)行SNP分析發(fā)現(xiàn),H-FABP基因第3內(nèi)含子的第156個(gè)堿基處發(fā)生1個(gè)C到G的突變,該突變對(duì)Z4群體胴體質(zhì)量、皮脂質(zhì)量、皮脂率和全凈膛質(zhì)量有顯著影響,因此H-FABP基因可以作為北京鴨Z4群體屠宰性能的候選基因應(yīng)用于選育工作中。游小燕等[23]對(duì)雞的H-FABP基因采用PCR-SSCP研究推測(cè),H-FABP基因很大程度上影響雞的屠宰性能或與控制屠宰性能的主基因連鎖。H-FABP基因多態(tài)性對(duì)IMF含量存在顯著影響,H-FABP基因mRNA表達(dá)水平對(duì)IMF含量也影響顯著。李文娟等[24]的研究表明,隨著雞日齡的增長(zhǎng),H-FABP基因mRNA表達(dá)量顯著降低,且白萊航雞、北京油雞和AA雞群體的H-FABP基因mRNA表達(dá)水平與屠體重及IMF含量呈現(xiàn)顯著的負(fù)相關(guān)。屠云潔等[25]對(duì)鹿苑雞和隱性白羽雞H-FABP基因研究也發(fā)現(xiàn)H-FABP基因mRNA表達(dá)水平與IMF含量呈顯著負(fù)相關(guān)。而H-FABP基因mRNA表達(dá)水平受環(huán)境和個(gè)體因素的影響,實(shí)際應(yīng)用中應(yīng)綜合考慮。
周國(guó)利等[26]對(duì)魯西黃牛H-FABP基因研究表明,BB基因型對(duì)牛肉嫩度的剪切力值有較大的影響,BB型所對(duì)應(yīng)的WBS值顯著高于AA和AB,而WBS值越高,肉質(zhì)性狀越差。AA、AB和BB3種基因型對(duì)大理石紋影響不顯著;為了加快肉牛肉品質(zhì)的遺傳發(fā)展,在育種工作中可以通過(guò)選擇A等位基因或純合子AA基因型個(gè)體作為輔助選擇的依據(jù)。余剛等[27]對(duì)陜北白絨山羊H-FABP基因研究發(fā)現(xiàn),H-FABP基因外顯子2的第22位存在G到C的基因突變,造成的3種不同基因型對(duì)胴體性狀的影響。其中AA型個(gè)體具有顯著的脂肪沉積能力,AB型基因在胸圍等性狀上可能是有利基因型。曹健[28]對(duì)耗牛H-FABP基因研究得出,H-FABP突變影響甘南閹耗牛眼肌面積和胴體重。王蘭萍等[29]運(yùn)用PCR-SSCP技術(shù)對(duì)黃淮山羊H-FABP基因進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),黃淮山羊只存在一個(gè)突變位點(diǎn),其中兩個(gè)基因型GG和GC,GC型個(gè)體的IMF含量顯著高于GG,在背最長(zhǎng)肌、胸肌和腿肌間,GC型個(gè)體的IMF含量同樣顯著高于GG。由此可以推測(cè)GC基因型可能是黃淮山羊IMF含量性狀的有效標(biāo)記基因型。謝一妮[30]對(duì)4個(gè)成年山羊群體進(jìn)行H-FABP基因研究發(fā)現(xiàn)2個(gè)酶切點(diǎn)Hae III和SauI共得到6種基因型,其中B和D等位基因?yàn)閮?yōu)勢(shì)基因,對(duì)IMF含量有一定影響。陳春華等[31]對(duì)隴東地方牛和西雜肉牛作H-FABP基因分析發(fā)現(xiàn)了C1006G突變位點(diǎn)及基因型GG/GC/CC,其中GC和CC基因型對(duì)牛肉滴水損失有顯著影響。
在對(duì)肉品質(zhì)要求不斷提高的今天,研究學(xué)者對(duì)H-FABP基因的研究熱度持續(xù)高漲。從目前的研究結(jié)果來(lái)看,前人研究主要集中在H-FABP基因5’上游區(qū)和第二內(nèi)含子區(qū)的突變位點(diǎn),以及突變位點(diǎn)所造成的不同的基因型及基因頻率對(duì)動(dòng)物各種性能的影響,包括IMF含量,生產(chǎn)性能,胴體性狀,大理石花紋,剪切力、眼肌面積、背膘厚等。另外加上供試群體品種多樣以及對(duì)供試群體的選擇、樣本含量的大小存在的局限性,現(xiàn)今對(duì)候選基因內(nèi)多態(tài)性的研究還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠;需要后人前仆后繼,擴(kuò)大群體規(guī)模,聯(lián)合更多的相關(guān)候選基因和DNA標(biāo)記基因來(lái)進(jìn)行分析,尋求與動(dòng)物生產(chǎn)緊密連鎖的遺傳標(biāo)記,以便在動(dòng)物育種生產(chǎn)實(shí)踐的標(biāo)記輔助選擇中發(fā)揮遺傳改良作用。雖然,分子遺傳標(biāo)記已經(jīng)廣泛用于畜禽的育種工作中,為畜禽遺傳改良帶來(lái)了福音,但對(duì)H-FABP基因的研究方法普遍是進(jìn)行PCR-SSCP反應(yīng)或是PCR-RFLP反應(yīng),之后根據(jù)電泳圖譜中的條帶類型對(duì)所研究的試驗(yàn)對(duì)象進(jìn)行基因分型,然后再分析其基因型與某一性狀的遺傳相關(guān)性。研究方法仍然需要進(jìn)一步的創(chuàng)新和改進(jìn),我們?nèi)杂写罅康墓ぷ餍枰^續(xù)開(kāi)展。
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