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    NOS2A基因啟動(dòng)子區(qū)基因多態(tài)性與缺血性腦卒中關(guān)系的研究

    2012-11-17 07:15:24闞春燕杜丹華
    關(guān)鍵詞:一氧化氮等位基因基因型

    闞春燕, 高 鵬, 袁 冬, 杜丹華, 吳 江

    缺血性腦卒中(ischemic stroke,IS)是致殘率和致死率最高的常見(jiàn)疾病之一[1]。而動(dòng)脈粥樣硬化(Atherosclerosis,AS)斑塊破裂和血栓形成是導(dǎo)致急性心腦血管事件的主要原因。

    近年來(lái),研究者認(rèn)識(shí)到動(dòng)脈粥樣硬化是由多種炎性細(xì)胞因子參與的血管慢性炎癥反應(yīng)過(guò)程,炎癥反應(yīng)和AS的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[2]。由iNOS催化產(chǎn)生的NO是機(jī)體慢性炎癥反應(yīng)的重要參與因子之一[3],可引起血管內(nèi)皮損傷、促進(jìn)血管壁的炎癥反應(yīng),還可氧化LDL形成ox-LDL,促進(jìn)動(dòng)脈粥樣硬化的發(fā)生發(fā)展,導(dǎo)致粥樣斑塊的不穩(wěn)定[4]。因此,我們對(duì)編碼iNOS的NOS2A基因多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè),探討其與缺血性腦卒中的關(guān)系。

    1 資料與方法

    1.1 研究對(duì)象 選取吉林大學(xué)第一醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科2009年~2010年的住院患者324例作為病例組,其中男234 例,女90 例,平均年齡(57.1 ±10.1)歲,經(jīng)神經(jīng)科檢查、頭部CT或頭部MRI明確腦卒中診斷,并除外房顫、腫瘤等栓子來(lái)源的腦栓塞性疾病,除外肝腎功能不全及血液系統(tǒng)疾病。由患者本人或其家屬提供患者的臨床癥狀及既往病史。對(duì)照組來(lái)自吉林大學(xué)第一醫(yī)院體檢中心的健康體檢者,共455例,其中男319例,女136例,平均年齡(50.7±8.8)歲。入組對(duì)象簽署知情同意書(shū),并采集全血用于DNA提取。

    1.2 選擇 NOS2A啟動(dòng)子區(qū)-969G/C,-1173C/T的兩個(gè)位點(diǎn)為遺傳標(biāo)記,通過(guò)對(duì)NOS2A啟動(dòng)子區(qū)進(jìn)行全長(zhǎng)測(cè)序以分析這兩個(gè)位點(diǎn)的基因型。

    1.3 實(shí)驗(yàn)方法 (1)標(biāo)本采集:抽取患者、對(duì)照者空腹外周靜脈血置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?2)基因組DNA的提取:采用Wizard基因組DNA提取試劑盒(美國(guó)Promega公司)抽提基因組DNA。(3)基因組DNA濃度與純度測(cè)定:用ND-1000紫外/可見(jiàn)光分光光度計(jì)(NanoDrop,美國(guó))進(jìn)行定量測(cè)定,調(diào)整模板DNA濃度在25~50ng/μl。(4)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR):基因引物由上海生工生物工程技術(shù)有限公司合成,其核苷酸序列如下:上游引物:5’-AAAACCCTCTCAAAACAGC-3’;下游引物:5’-TTGGTAGAGACTGGGTTTCA-3’。 反 應(yīng) 體 系(20μl):DNA 模板 2μl、10 × buffer 2μl、dNTP 1μl、PCR 引物2μl(上游引物、下游引物各 1μl、TaqDNA聚合酶 0.15μl、ddH2O 12.85μl)。PCR 反應(yīng)條件:預(yù)變性 95℃5min,變性 94℃30s,退火 66℃40s,延伸72℃1min30s,共進(jìn)行 38個(gè)循環(huán),最后延伸 72℃10min。(5)PCR產(chǎn)物的檢測(cè):取PCR擴(kuò)增產(chǎn)物2μl進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳,JS-380A凝膠成像系統(tǒng)(上海培清科技有限公司)下觀察結(jié)果。(6)PCR產(chǎn)物回收純化:PCR產(chǎn)物轉(zhuǎn)移到AcroPrep 384濾板上進(jìn)行濃縮純化。(7)PCR產(chǎn)物測(cè)序:將已純化的基因組DNA樣本經(jīng)熱循環(huán)處理后于ABI 3730 DNA Analyzer(ABI,美國(guó))進(jìn)行掃描測(cè)序。

    1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用擬和優(yōu)度檢驗(yàn)分析病例組和對(duì)照組基因型頻率的分布是否符合Hardy-Weinberg(H.W)平衡;UNPHASED遺傳學(xué)軟件應(yīng)用cocaphase對(duì)等位基因頻率進(jìn)行分析,SPSS 15.0軟件應(yīng)用卡方檢驗(yàn)對(duì)基因型頻率進(jìn)行分析。

    2 結(jié)果

    2.1 -969G/C、-1173C/T不是中國(guó)北方漢族人的SNP位點(diǎn) 通過(guò)對(duì)NOS2A基因啟動(dòng)子區(qū)的測(cè)序,發(fā)現(xiàn)-969G/C、-1173C/T不是中國(guó)北方漢族人的SNP位點(diǎn),NOS2A-969C位點(diǎn)的等位基因均為 T,NOS2A-1173C位點(diǎn)的等位基因均為G。

    2.2 腦卒中組與對(duì)照組rs2779248位點(diǎn)Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn) 我們?cè)贜OS2A基因啟動(dòng)子區(qū)檢測(cè)到了rs2779248位點(diǎn),并對(duì)該位點(diǎn)在腦卒中組與對(duì)照組的等位基因及基因型頻率進(jìn)行了比較。擬和優(yōu)度檢驗(yàn)表明病例組(χ2=0.015,P=0.903)和對(duì)照組(χ2=3.141,P=0.076)rs2779248 的基因型分布均未偏離H-W平衡。

    2.3 腦卒中組與對(duì)照組rs2779248位點(diǎn)等位基因頻率比較 腦卒中組與對(duì)照組rs2779248位點(diǎn)等位基因頻率比較無(wú)明顯差異(P=0.889,χ2=0.019,見(jiàn)表1)。

    2.4 腦卒中組與對(duì)照組rs2779248位點(diǎn)基因型頻率比較 腦卒中組與對(duì)照組rs2779248位點(diǎn)基因型頻率比較無(wú)明顯差異(P=0.889,χ2=0.019,見(jiàn)表2)。

    表1 腦卒中組與對(duì)照組rs2779248位點(diǎn)等位基因頻率比較

    表2 腦卒中組與對(duì)照組rs2779248位點(diǎn)基因型頻率比較

    3 討論

    一氧化氮(nitric oxide,NO)是生物體內(nèi)一種重要的信號(hào)分子,它是由一氧化氮合酶(nitric oxide synthase,NOS)催化 L-精氨酸(L-arginin)轉(zhuǎn)化而成[5],而NOS又分為誘導(dǎo)型一氧化氮合酶、內(nèi)皮型一氧化氮合酶以及神經(jīng)元型一氧化氮合酶3個(gè)亞型[6]。在動(dòng)脈粥樣硬化血管平滑肌細(xì)胞中iNOS表達(dá)及活性增加,可誘導(dǎo)產(chǎn)生大量的NO自由基,引起過(guò)氧化亞硝酸鹽形成增多、活性增加,導(dǎo)致脂質(zhì)過(guò)氧化和血管損傷,進(jìn)而引起血管內(nèi)皮功能障礙、炎性介質(zhì)釋放,加重血管炎癥反應(yīng),從而促進(jìn)動(dòng)脈粥樣硬化的發(fā)展。而動(dòng)脈粥樣硬化又是腦卒中發(fā)病的重要病理生理基礎(chǔ),因此我們將編碼iNOS的NOS2A基因作為候選基因。

    NOS2A 基因定位于17q11.2-q12,全長(zhǎng)37kb,包含26個(gè)外顯子和25個(gè)內(nèi)含子。已有研究表明iNOS基因多態(tài)性與潰瘍性結(jié)腸炎、克羅恩病、風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、前列腺癌、胃癌等多種炎癥及免疫調(diào)節(jié)反應(yīng)相關(guān)疾病有關(guān)[7]。針對(duì)NOS2A基因進(jìn)行的基因治療可明顯減小心肌梗死的體積[8]。杜丹華等對(duì)NOS2A基因多態(tài)性與腦卒中合并冠心病的關(guān)系進(jìn)行了檢測(cè),發(fā)現(xiàn)rs28944190位點(diǎn)C等位基因與腦卒中合并冠心病的發(fā)生存在相關(guān)性[9]。Hobbs等在坦桑尼亞和肯尼亞進(jìn)行的研究證實(shí)NOS2A基因啟動(dòng)子區(qū)-969G/C、-1173C/T變異可減輕瘧疾感染后癥狀的嚴(yán)重程度[10,11]。NOS2A 啟動(dòng)子區(qū)變異與原發(fā)性高血壓有關(guān)[5]。此外NOS2A基因是炎癥反應(yīng)通路中的一個(gè)關(guān)鍵基因。因此我們選擇NOS2A基因?yàn)楹蜻x基因,以-969G/C、-1173C/T位點(diǎn)為候選位點(diǎn),采用啟動(dòng)子區(qū)全長(zhǎng)測(cè)序的方法探討NOS2A基因啟動(dòng)子區(qū)基因多態(tài)性與缺血性腦卒中的關(guān)系。我們發(fā)現(xiàn)NOS2A-969G/C、-1173C/T位點(diǎn)在中國(guó)北方漢族人中不存在變異,說(shuō)明SNPs在不同種族間存在差異。我們?cè)贜OS2A啟動(dòng)子區(qū)檢測(cè)到了rs2779248位點(diǎn),關(guān)聯(lián)分析表明rs2779248位點(diǎn)與缺血性腦卒中無(wú)相關(guān)性。提示NOS2A基因啟動(dòng)子區(qū)與缺血性腦卒中的發(fā)病無(wú)明顯相關(guān)。

    雖然本研究未發(fā)現(xiàn)NOS2A基因啟動(dòng)子區(qū)的常見(jiàn)變異與缺血性腦卒中的相關(guān)性,但在中國(guó)北方漢族人群NOS2A基因與高血壓、缺血性腦卒中嚴(yán)重程度等的關(guān)系還需要進(jìn)一步的探討。

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