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    微小隱孢子蟲(chóng)LAMP檢測(cè)方法的探索*

    2012-09-26 02:55:04史亞?wèn)|董海聚王榮軍張龍現(xiàn)寧長(zhǎng)申菅復(fù)春
    關(guān)鍵詞:孢子染料產(chǎn)物

    史亞?wèn)|,董海聚,王榮軍,張龍現(xiàn),寧長(zhǎng)申,菅復(fù)春

    隱孢子蟲(chóng)是一種腸道原生寄生蟲(chóng),可以引起人和動(dòng)物的隱孢子蟲(chóng)病。該病的最主要癥狀是腹瀉,已被列為世界最常見(jiàn)的6種腹瀉病之一[1],并被世界衛(wèi)生組織(WHO)和美國(guó)疾病控制中心(CDC)列入新發(fā)傳染病。隱孢子蟲(chóng)大小一般為5~8μm,常用的檢測(cè)方法可以分為病原學(xué)檢測(cè)(主要借助顯微鏡)、免疫學(xué)檢測(cè)和分子生物學(xué)檢測(cè)3類(lèi)[2],分子生物學(xué)檢測(cè)因其優(yōu)勢(shì)較多而廣泛應(yīng)用。Noto mi等[3]2000年建立了一種快速、簡(jiǎn)單、靈敏、特異并且低成本的核酸擴(kuò)增方法——環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增法(LA MP),這種新穎的核酸擴(kuò)增方法可以在短時(shí)間內(nèi)簡(jiǎn)單地得出檢測(cè)結(jié)果,這種優(yōu)勢(shì)使其在病原分子檢測(cè)領(lǐng)域得到廣泛地應(yīng)用,如應(yīng)用于病毒、細(xì)菌和寄生蟲(chóng)等病原的檢測(cè)[4-7]。

    1 材料與方法

    1.1 蟲(chóng)種 本實(shí)驗(yàn)室保存的微小隱孢子蟲(chóng)(Cr yptosporidiu m par vu m)、賈第蟲(chóng)(Giar dia sp)、腸阿米巴(Enta moeba sp)、球蟲(chóng)(Ei meria tenell a)和類(lèi)圓線蟲(chóng)(Str ongyloides sp)5種陽(yáng)性樣品。

    1.2 主要試劑和儀器 Bst DNA聚合酶大片段(Bst DNA pol y merase lar ge frag ment)購(gòu)自 NEB公司,三甲銨乙內(nèi)酯(Betaine)購(gòu)自Sig ma公司,Taq DNA聚合酶、DL2000 DNA Mar ker和脫氧核苷三磷酸(d NTP Mixt ure)購(gòu)自Ta Ka Ra公司,MseI內(nèi)切酶購(gòu)自 Fer mentas公司,SYBR Green I(10 000×)購(gòu)自Solarbio公司,E.Z.N.A.?Stool DNA Kit(糞便DNA提取試劑盒)購(gòu)自O(shè)MEGA公司。電熱恒溫水浴鍋(北京市長(zhǎng)風(fēng)儀器儀表公司,型號(hào)HwS24),穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀(北京市六一儀器廠,型號(hào)DYY-5),凝膠成像儀(SYNGENE公司,型號(hào)In-Genius L HR)。

    1.3 DNA的提取 按照E.Z.N.A.?Stool DNA Kit說(shuō)明書(shū)操作,對(duì)保存的不同蟲(chóng)株陽(yáng)性樣品提取DNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

    1.4 引物設(shè)計(jì)選擇及合成 袁忠英等[8]在國(guó)內(nèi)首次報(bào)道用LA MP檢測(cè)牛源隱孢子蟲(chóng)卵囊,其根據(jù)微小隱孢子蟲(chóng)18s r RNA基因序列(Gen Bank登錄號(hào)3873244)設(shè)計(jì)了4條隱孢子蟲(chóng)特異性引物(F3、B3、FIP、BIP)。根據(jù)這4條引物利用Pri mer Explorer V4(htt p://pri merexplorer.jp/elamp4.0.0/index.ht ml)設(shè)計(jì)了2條環(huán)引物(LF、LB,序列見(jiàn)表1)。引物由華大基因合成。

    表1 微小隱孢子蟲(chóng)LAMP引物序列Tab.1 The sequence of LAMP primers for Cr yptosporidium parvum

    1.5 LA MP反應(yīng)和PCR反應(yīng)建立 根據(jù)文獻(xiàn)[3],設(shè)定LA MP反應(yīng)初始體系組成為:FIP和BIP各1.6μmol/L,F(xiàn)3和 B3各0.2μmol/L,1.4 mmol/L d NTP Mixt ure,0.8 mol/L Betaine,20 mmol/L Tris-HCl(p H 8.8),10 mmol/L KCl,10 mmol/L(NH4)2SO4,8 mmol/L Mg SO4,0.1%Tween20,DNA模板2μL,加雙蒸水至25μL。反應(yīng)混合物先在95℃加熱5 min使DNA解鏈,放在冰上冷卻5 min后加8 U Bst DNA聚合酶大片段,然后在65℃孵育1 h,最后在80℃10 min終止反應(yīng)。分別取5μL擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳,觀察結(jié)果。

    根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)[9-10],選擇 LA MP 引物中的 F3和B3作為PCR上下游引物進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增片段大小為193 bp。25μL PCR體系中包括1×PCR Buffer,上下游引物各0.4μmol/L,d NTP Mixt ure 2 mmol/L,Taq DNA 聚合酶0.625 U,2μL模板DNA,加雙蒸水至25μL。反應(yīng)過(guò)程為:95℃變性5 min,95℃45 s,55℃退火45 s,72℃延伸1 min,35個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min。

    1.6 LA MP反應(yīng)的優(yōu)化

    1.6.1 反應(yīng)過(guò)程、時(shí)間、溫度的優(yōu)化 選用同一份微小隱孢子蟲(chóng)陽(yáng)性樣品,做A、B、C 3組擴(kuò)增反應(yīng),每組做3個(gè)重復(fù);并用雙蒸水做空白對(duì)照。其中設(shè)置B組和空白對(duì)照在水浴鍋中95℃反應(yīng)5 min、65℃反應(yīng)60 min、80℃終止反應(yīng)10 min;A組不經(jīng)過(guò)95℃5 min熱變性過(guò)程,C組不經(jīng)過(guò)80℃10 min終止反應(yīng)過(guò)程,其余反應(yīng)條件均相同。

    設(shè)置反應(yīng)溫度分別為60℃、61℃、62℃、63℃、64℃、65℃,觀察對(duì)反應(yīng)結(jié)果的影響,并做陰性對(duì)照,陰性對(duì)照溫度為63℃。

    設(shè)置反應(yīng)時(shí)間分別為20 min、30 min、40 min、50 min、60 min、70 min、80 min、90 min、100 min,并做陰性對(duì)照,陰性對(duì)照反應(yīng)時(shí)間為60 min。

    1.6.2 反應(yīng)體系組成的優(yōu)化 對(duì)體系中的Beta-ine、MgSO4、d NTP Mixt ure濃度,酶工作濃度和外內(nèi)引物比等進(jìn)行優(yōu)化。

    設(shè)置Betaine的終濃度梯度為:0.2 mol/L、0.4 mol/L、0.6 mol/L、0.8 mol/L、1.0 mol/L、1.2 mol/L、1.4 mol/L,陰性對(duì)照的終濃度為0.8 mol/L,其他條件相同。

    設(shè)置 MgSO4的終濃度梯度為:2 mmol/L、4 mmol/L、6 mmol/L、8 mmol/L、10 mmol/L、12 mmol/L、14 mmol/L,陰 性 對(duì) 照 的 終 濃 度 為 8 mmol/L,其他條件相同。

    設(shè)置d NTP Mixture的終濃度梯度為:0.8 mmol/L、1.0 mmol/L、1.2 mmol/L、1.4 mmol/L、1.6 mmol/L、1.8 mmol/L、2.0 mmol/L,陰性對(duì)照的終濃度為1.4 mmol/L,其他條件相同。

    設(shè)置酶的終濃度梯度為:2 U/25μL、4 U/25 μL、6 U/25μL、8 U/25μL、10 U/25μL、12 U/25 μL、14 U/25μL,陰性對(duì)照的終濃度8 U/25μL其他條件相同。

    L MAP反應(yīng)中F3和B3引物的濃度對(duì)反應(yīng)結(jié)果影響很?。?],本研究中固定外引物F3和B3的濃度(0.2μmol/L),把內(nèi)引物FIP和BIP的濃度進(jìn)行梯度優(yōu)化,按外內(nèi)引物比1∶2、1∶4、1∶6、1∶8、1∶10、1∶12、1∶14進(jìn)行,陰性對(duì)照的外內(nèi)引物比為1∶8,其他條件相同。

    1.6.3 添加環(huán)引物對(duì)反應(yīng)的影響 反應(yīng)體系中添加環(huán)引物(LF、LB各0.8μmol/L,25μL體系),設(shè)置反應(yīng)時(shí)間分別為10 min、20 min、30 min、40 min、50 min、60 min、70 min、80 min、90 min,其他條件不變。

    1.7 LA MP特異性試驗(yàn) 分別選用微小隱孢子蟲(chóng)、賈第蟲(chóng)、腸阿米巴、球蟲(chóng)、類(lèi)圓線蟲(chóng)DNA作為模板進(jìn)行LA MP反應(yīng),并用雙蒸水做空白對(duì)照,每個(gè)體系模板量為2μL,其他條件相同。

    1.8 LA MP敏感性試驗(yàn) 對(duì)經(jīng)蔗糖梯度濃集并計(jì)數(shù)的100萬(wàn)微小隱孢子蟲(chóng)卵囊(100μL,1 000萬(wàn)/m L)提取DNA,把DNA分別稀釋為原液的10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6倍(相當(dāng)于5×102、5×101、5×100、5×10-1、5×10-2、5×10-3個(gè)卵囊/μL,原液相當(dāng)于5×103個(gè)卵囊/μL);用這些梯度DNA樣品來(lái)檢測(cè)LA MP方法的敏感性,并和常規(guī)PCR方法比較。

    1.9 產(chǎn)物酶切試驗(yàn) 對(duì)LA MP擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行MseI酶消化,30μL反應(yīng)體系成分為:10μL LA MP擴(kuò)增產(chǎn)物,1μL MseI酶,2μL10×Buffer R(隨酶提供),加雙蒸水至30μL。65℃孵育10 h。取5μL消化后產(chǎn)物2.0%瓊脂糖凝膠電泳(低電壓),觀察結(jié)果。

    1.10 LA MP產(chǎn)物的檢測(cè)方法的比較 本研究選用的LA MP產(chǎn)物檢測(cè)方法有:1.凝膠電泳;2.可見(jiàn)光下直接觀察濁度;3.3 000 r/min離心2 min,觀察沉淀;4.添加1μL1000×SYBR Green I顯色后直接光觀察;5.添加1μL 1000×SYBR Green I顯色紫外成像觀察。

    2 結(jié) 果

    2.1 反應(yīng)過(guò)程、時(shí)間、溫度的優(yōu)化結(jié)果 A、B、C3組擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)電泳后,均出現(xiàn)LA MP特征性梯形條帶,95℃5 min熱變性過(guò)程和80℃10 min終止反應(yīng)過(guò)程對(duì)擴(kuò)增反應(yīng)影響不大,陰性對(duì)照無(wú)條帶,見(jiàn)圖1??梢?jiàn)熱變性和酶失活這兩個(gè)過(guò)程對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果影響不明顯。這和Kentar o等[11]報(bào)道的用濁度儀檢測(cè)LA MP擴(kuò)增熱變性和非熱變性模板的結(jié)果相一致。因此,在檢測(cè)樣品較多、現(xiàn)場(chǎng)臨床檢測(cè)等情況下可以省去這兩個(gè)過(guò)程以節(jié)省時(shí)間。

    最佳反應(yīng)溫度為63℃,見(jiàn)圖2。擴(kuò)增反應(yīng)在50 min時(shí)出現(xiàn)清晰條帶,確定最佳反應(yīng)時(shí)間為60 min,見(jiàn)圖3。

    圖1 不同反應(yīng)過(guò)程對(duì)LAMP的影響Fig.1 Effect of different reaction process on the LAMP M:DL2000 DNA marker;1-3(A):65℃for 60 min,80℃for 10 min;4-6(B):95℃for 5 min,65℃for 60 min,80℃for 10 min;7-9(C):95℃for 5 min,65℃for 60 min;10:Negative control

    2.2 反應(yīng)體系優(yōu)化結(jié)果 體系中 Mg SO4、d NTP Mixture、酶的最佳濃度分 別 為 8 mmol/L、0.8 mmol/L、8 U/25μL。外內(nèi)引物最佳比為1∶6,由于外引物對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果影響很?。?],所以實(shí)驗(yàn)中固定外引物濃度,對(duì)內(nèi)引物濃度進(jìn)行優(yōu)化。Betaine的濃度在1.0 mol/L以下幾個(gè)濃度均展現(xiàn)了較清晰的條帶,也有報(bào)道[12]不添加Betaine成功擴(kuò)增的,但Notomi等[3]報(bào)道反應(yīng)體系中有0.5~1.5 mol/L Beta-ine存在的情況下,Betaine會(huì)促進(jìn)DNA雙鏈解鏈,同時(shí)會(huì)使堿基的堆積和非特異性擴(kuò)增減少,最終提高反應(yīng)效率。因此,我們選用0.8 mol/L作為Betaine最佳濃度,分別見(jiàn)圖4、5、6。

    圖2 溫度對(duì)LAMP的影響Fig.2 Effect of temperature on the LAMP M:DL2000 DNA marker;1:60℃;2:61℃;3:62℃;4:63℃;5:64℃;6:65 ℃;7:Negative control,63℃

    圖3 反應(yīng)時(shí)間對(duì)LAMP的影響Fig.3 Effect of reaction time on the LAMP M:DL2000 DNA mar ker;1:20 min;2:30 min;3:40 min;4:50 min;5:60 min;6:70 min;7:80 min;8:90 min;9:100 min;10:Negative control,60 min

    圖4 Betaine濃度對(duì)LAMP的影響Fig.4 Effect of Betaine concentration on the LAMP M:DL2000 DNA Mar ker;1:0.2 mol/L;2:0.4 mol/L;3:0.6 mol/L;4:0.8 mol/L;5:1.0 mol/L;6:1.2 mol/L;7:1.4 mol/L;8:Negative control,0.8 mol/L

    2.3 環(huán)引物的效果 反應(yīng)體系中添加環(huán)引物后,LA MP出現(xiàn)清晰條帶的時(shí)間縮短到了20 min,見(jiàn)圖7。Naga mine等[13]第一次報(bào)道使用環(huán)引物來(lái)加速LA MP反應(yīng)過(guò)程,使用環(huán)引物的LA MP反應(yīng)時(shí)間會(huì)比未使用環(huán)引物的LA MP反應(yīng)大大縮短。如此短的反應(yīng)時(shí)間將有利于該方法用于臨床快速檢測(cè)。

    圖5 酶的濃度對(duì)LAMP的影響Fig.5 Effect of the enzyme concentr ation on the LAMP M:2 000 bp DNA mar ker;1:2 U/25μL;2:4 U/25μL;3:6 U/25μL;4:8 U/25μL;5:10 U/25μL;6:12 U/25μL;7:14 U/25μL;8:Negative control,8 U/25μL

    圖6 外內(nèi)引物比對(duì)LAMP的影響Fig.6 Effect of ratio of outer and inner primer on the LAMP M:2 000 bp DNA mar ker;1:1/2;2:1/4;3:1/6;4:1/8;5:1/10;6:1/12;7:1/14;8:Negative control,1/8

    圖7 LAMP使用環(huán)引物的反應(yīng)時(shí)間Fig.7 The reaction ti me of using loop pri mers on the LAMP M:DL2000 DNA marker;1:10 min;2:20 min;3:30 min;4:40 min;5:50 min;6:60 min;7:70 min;8:80 min;9:90 min

    圖8 LAMP和PCR的靈敏度試驗(yàn)Fig.8 Detection li mit of LAMP and PCR M:DL2000 DNA marker;1:5×10 3 oocysts/μL;2:5×10 2 oocysts/μL;3:5×10 1 oocysts/μL;4:5×10 0 oocysts/μL;5:5×10-1 oocyst/μL;6:5×10-2 oocyst/μL;7:5×10-3 oocyst/μL;8:Negative control

    2.4 敏感性試驗(yàn)結(jié)果與分析 從圖8中看出使用相同模板,LA MP的檢測(cè)限度是5×100個(gè)卵囊/μL(圖8 A),而PCR的檢測(cè)限度是5×102個(gè)卵囊/μL(圖8B)。在LA MP的產(chǎn)物中添加染料SYBR Green I也得到了同電泳一樣的結(jié)果(圖8C)。

    2.5 特異性試驗(yàn)結(jié)果與分析 特異性試驗(yàn)如圖9所示,僅微小隱孢子蟲(chóng)出現(xiàn)LAMP特異梯狀條帶,賈第蟲(chóng)、腸阿米巴、球蟲(chóng)、類(lèi)圓線蟲(chóng)及雙蒸水無(wú)特異梯狀條帶,特異性好。

    2.6 酶切后電泳結(jié)果與分析 LA MP產(chǎn)物經(jīng)Mse I酶消化理論上會(huì)產(chǎn)生111 bp、65 bp、46 bp 3個(gè)片段,在電泳圖上100 bp附近及下方出現(xiàn)3個(gè)亮帶,與預(yù)期結(jié)果一致,見(jiàn)圖10。

    圖9 LAMP的特異性試驗(yàn)結(jié)果M:2 000 bp DNA mar ker;1:微小隱孢子蟲(chóng);2:賈第蟲(chóng);3:腸阿米巴;4:球蟲(chóng);5:類(lèi)圓線蟲(chóng);6:雙蒸水Fig.9 The result of LAMP specificity test M:2 000 bp DNA mar ker;1:C.par vu m;2:Giar dia sp;3:Entamoeba sp;4:Ei meria tenell a;5:Strongyloides sp;6:Double distilled water

    圖10 LAMP產(chǎn)物酶切圖M:2 000 bp DNA mar ker;1:LA MP產(chǎn)物酶切后Fig.10 Restriction fragments from LAMP products M:2 000 bp DNA mar ker;1:The LA MP pr oducts after restriction digestion

    圖11 LAMP產(chǎn)物的不同鑒定方法A:直接觀察濁度;B:離心后觀察沉淀;C:添加染料后直接觀察;D:添加染料后紫外成像觀察Fig.11 The different methods for accrediting the LAMP products A:Direct obser vation on the t ur bidity;B:Direct observation after centrif uging;C:Direct observation after staining;D:Direct observation by UV after staining.

    2.7 LA MP產(chǎn)物的檢測(cè)方法比較結(jié)果

    2.7.1 LA MP產(chǎn)物直接電泳,該方法靈敏度高,但需電泳設(shè)備,且消耗一定的時(shí)間。

    2.7.2 可見(jiàn)光下直接觀察濁度,陽(yáng)性和陰性的濁度不易區(qū)分,只有當(dāng)反應(yīng)產(chǎn)物量大時(shí)才易區(qū)分,見(jiàn)圖11 A。

    2.7.3 擴(kuò)增產(chǎn)物在3 000 r/min離心2 min,觀察沉淀,陽(yáng)性反應(yīng)管中觀察到有白色沉淀附著在反應(yīng)管底部,而且較清晰;陰性未見(jiàn),見(jiàn)圖11B;

    2.7.4 在LA MP反應(yīng)后在管中添加SYBR Green I顯色后直接光觀察,看到陽(yáng)性(亮綠色)和陰性(橙色)對(duì)比鮮明,這種顯色可以在數(shù)秒內(nèi)完成,見(jiàn)圖11C。

    2.7.5 LA MP擴(kuò)增產(chǎn)物添加SYBR Green I顯色后紫外成像觀察,陽(yáng)性樣品產(chǎn)物呈現(xiàn)了較亮熒光,陰性則較暗,此法需紫外成像儀或紫外燈見(jiàn)圖11D。通過(guò)這幾種檢測(cè)方法的比較,作者認(rèn)為凝膠電泳、反應(yīng)產(chǎn)物離心后觀察沉淀和紫外成像更適合實(shí)驗(yàn)室檢測(cè),而添加染料后直接觀察比較適合臨床快速檢測(cè)。

    3 討 論

    本研究在前人工作的基礎(chǔ)上,設(shè)計(jì)了環(huán)引物,使反應(yīng)時(shí)間大大縮短,建立了快速檢測(cè)微小隱孢子蟲(chóng)的LA MP檢測(cè)方法。經(jīng)過(guò)反應(yīng)體系和反應(yīng)條件的優(yōu)化,該方法可以對(duì)DNA樣品實(shí)現(xiàn)20 min內(nèi)檢測(cè),LA MP的檢測(cè)限度是5×100個(gè)卵囊/μL,和Karanis等[14]的報(bào)道相一致,但又比Ino mata等[15]報(bào)道的RT-LA MP低一些,考慮可能是擴(kuò)增位點(diǎn)不同及定量方法不同的影響;LA MP檢測(cè)微小隱孢子蟲(chóng)的靈敏度比常規(guī)PCR高100倍,100倍靈敏度的差異和Iseki等[16]報(bào)道的一致,但比 Karanis等[14]報(bào)道的差異小。凝膠電泳、反應(yīng)產(chǎn)物離心后觀察沉淀和紫外成像觀察適合實(shí)驗(yàn)室使用,而添加染料直接觀察更適合臨床或野外條件下判讀結(jié)果。

    LAMP經(jīng)過(guò)近十幾年的發(fā)展,在分子檢測(cè)領(lǐng)域發(fā)展迅速,它操作簡(jiǎn)單、結(jié)果可直接判斷,這些優(yōu)勢(shì)使其成為臨床疾病快速檢測(cè)的佼佼者。但也遇到一些問(wèn)題:該方法靈敏性高容易產(chǎn)生污染,這主要是針對(duì)LA MP產(chǎn)物開(kāi)蓋判斷結(jié)果來(lái)說(shuō)的,適當(dāng)?shù)闹甘緞┛梢越鉀Q這個(gè)問(wèn)題,隨著研究的深入,一些研究者設(shè)計(jì)了巧妙的方法改善和提高LAMP方法的實(shí)用性。Tao等[17]介紹了一種獨(dú)特的方法來(lái)指示LA MP結(jié)果,選用的染料為SYBR Green I,其先將一定量染料加到特制的蠟丸(熔點(diǎn)85℃)內(nèi),在反應(yīng)前把蠟丸放入反應(yīng)管里,反應(yīng)過(guò)程中蠟丸不會(huì)溶解,反應(yīng)后把反應(yīng)管加熱到85℃,蠟丸溶解,同時(shí)染料與擴(kuò)增產(chǎn)物接觸,這樣既解決了染料提前加入抑制擴(kuò)增反應(yīng)的問(wèn)題,又解決了反應(yīng)后開(kāi)蓋加染料容易污染的問(wèn)題。蠟丸的使用是一個(gè)進(jìn)步,但這樣增加了成本且多了一步加熱過(guò)程,它還有改進(jìn)的地方,我們可以借鑒使用蠟丸的經(jīng)驗(yàn)設(shè)計(jì)更巧妙的方法。Hatano等[18]報(bào)道了在一種便攜保溫袋中進(jìn)行LA MP擴(kuò)增,結(jié)果非??煽?,這種保溫袋可在30 min內(nèi)從初始溫度(環(huán)境溫度)達(dá)到60℃,并可在60℃持續(xù)90 min。這種保溫袋是一次性使用的,它可以在4℃~37℃的外界溫度中穩(wěn)定工作,如果把它放到一個(gè)泡沫塑料盒內(nèi),效果更好,而且它們花費(fèi)較低。其研究中,分別用保溫袋和常規(guī)加熱裝置進(jìn)行LA MP檢測(cè),其檢測(cè)限度差異不明顯。這種保溫袋不需要電力就可以工作,在一些不發(fā)達(dá)或電力不充足地區(qū)的進(jìn)行疾病檢測(cè)非常實(shí)用,而且移動(dòng)性、限時(shí)性很強(qiáng)。

    LAMP的優(yōu)勢(shì)就在于快速、簡(jiǎn)便,該方法的成功應(yīng)用受以下幾個(gè)因素的影響:第一,高效、特異的指示劑對(duì)于LA MP的結(jié)果判斷尤其重要,目前報(bào)道的指示劑染料有SYBR Green I、溴化乙錠、鈣黃綠素、羥基萘酚藍(lán)等[19-21],基本上可以滿足非凝膠電泳方法的結(jié)果判斷;第二,影響LA MP結(jié)果的關(guān)鍵因子是引物的設(shè)計(jì)和選擇,對(duì)于未驗(yàn)證過(guò)的病原種類(lèi)檢測(cè),引物應(yīng)驗(yàn)證后才能使用;第三,DNA的快速提取可為L(zhǎng)A MP方法檢測(cè)的過(guò)程節(jié)省時(shí)間,因此快速、簡(jiǎn)單的DNA提取方法也是LA MP臨床快速檢測(cè)應(yīng)用的一個(gè)關(guān)鍵因子,目前細(xì)菌方面通過(guò)加熱和離心基本可實(shí)現(xiàn)快速、簡(jiǎn)便地提取DNA。隨著相關(guān)技術(shù)的發(fā)展,LA MP在疾病現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)方面將會(huì)發(fā)揮越來(lái)越大的作用。

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