李佩波,蔡敏泓,黃永茂,林 雁,鄒永勝,鐘 利,陳 楓,陳 莊,向成玉
(瀘州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院感染科,四川 瀘州 646000)
大腸埃希菌屬于腸桿菌科,為革蘭陰性短桿菌,屬于條件致病菌,是臨床上常見的細(xì)菌感染之一。近年來,隨著β-內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類、喹諾酮類等抗菌藥物在臨床上廣泛應(yīng)用、不合理使用以及濫用,導(dǎo)致細(xì)菌出現(xiàn)了不同程度的耐藥,甚至出現(xiàn)了交叉耐藥和多重耐藥的特點(diǎn)[1]。Ⅰ類整合子在大腸埃希菌中廣泛存在,整合子相關(guān)耐藥基因在該菌耐藥性的形成和播散中發(fā)揮重要作用[2]。近年來研究發(fā)現(xiàn)大腸埃希菌耐藥情況嚴(yán)重,尤其是產(chǎn)ESBLs酶菌株更突出[3]。本研究對臨床分離的71株大腸埃希菌進(jìn)行耐藥分析、ESBLs鑒定和Ⅰ類整合子遺傳標(biāo)記檢測,并探討其相關(guān)性,現(xiàn)報道如下。
1.1 材料 實(shí)驗(yàn)菌株:71株大腸埃希菌臨床分離株(不含同一病例相同部位重復(fù)分離株)來自瀘州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院2007年10月至2008年10月期間感染大腸埃希菌的患者。其中呼吸道感染29例,泌尿系統(tǒng)感染18例,外科切口感染14例,全身感染8例,其他2例;全部菌株均重新經(jīng)VITEK系統(tǒng)(BioMerieux,法國)鑒定確認(rèn)。標(biāo)準(zhǔn)菌株:大腸埃希菌 ATCC 25922,購自國家臨床檢驗(yàn)中心。
1.2 方法
1.2.1 藥物敏感試驗(yàn) 采用美國全國臨床檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)委員會(NCCLS)推薦的紙片擴(kuò)散法(K-B法)進(jìn)行臨床常用3類6種(LVE、CIP、FOX、S、A)抗菌藥物的敏感性檢測,并根據(jù) NCCLS 2006要求進(jìn)行敏感性判斷。
1.2.2 ESBLs鑒定 初步篩選試驗(yàn):選用頭孢噻肟、頭孢他啶、氨曲南、頭孢曲松藥敏紙片(杭州天和微生物試劑公司)對71株大腸埃希菌進(jìn)行產(chǎn)ESBLs篩選試驗(yàn),凡頭孢他啶的抑菌環(huán)直徑小于或等于22mm,頭孢曲松小于或等于25mm,氨曲南或頭孢噻肟小于或等于27mm,則提示為可疑產(chǎn)ESBLs菌株。紙片確認(rèn)試驗(yàn):將初篩可疑產(chǎn)ESBLs菌株同時用頭孢他啶和頭孢他啶加克拉維酸、頭孢噻肟和頭孢噻肟加克拉維酸作藥敏試驗(yàn),對任何一組藥物,加克拉維酸前后抑菌環(huán)直徑相差大于或等于5mm可確認(rèn)為產(chǎn)ESBLs菌株。
1.2.3 PCR技術(shù)檢測基因 采用Biospin細(xì)菌基因組DNA試劑盒(上海生工生物技術(shù)公司)提取大腸埃希菌DNA。根據(jù)Ⅰ類整合子遺傳標(biāo)記qacE△sul1設(shè)計引物(上海生工生物技術(shù)公司提供)。上游引物基因序列P1:TAG CGA GGG CTT TAC TAA GC;下游引物基因序列P2:ATT CAG AAT GCC GAA CAC CG。
以提取的大腸埃希菌DNA為反應(yīng)模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。所有PCR反應(yīng)體系均為25μL,其中2×Taq PCR MasterMix組成包括:0.1U/μL聚合酶,500mmol/L dNTP,20mmol/L Tris-HCl(pH 8.3),100mmol/L KCl,3mmol/L MgCl2等。PCR擴(kuò)增條件:94℃預(yù)變性3min,94℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸60s,共30個循環(huán),然后72℃延伸5min。將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳、紫外線檢測儀觀察結(jié)果,并將擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海生工生物技術(shù)公司進(jìn)行基因測序。
1.3 統(tǒng)計學(xué)處理 所有實(shí)驗(yàn)結(jié)果均采用SPSS13.0錄入建立數(shù)據(jù)庫并行統(tǒng)計分析,統(tǒng)計方法采用χ2檢驗(yàn)。當(dāng)T<1或N<40時用確切概率法計算P值;若1≤T<5且N≥40時用連續(xù)校正法處理。
2.1 藥物敏感試驗(yàn)結(jié)果 71株臨床分離的大腸埃希菌對6種抗生素耐藥情況分別為:左氧氟沙星45株、環(huán)丙沙星51株、頭孢噻肟44株、頭孢西丁9株、鏈霉素41株、阿米卡星6株。其中耐藥率最高為環(huán)丙沙星72.86%,最低為阿米卡星8.57%。不同耐藥模式中以耐多藥最多為45株(64.29%),全敏最少為7株(9.86%)。
2.2 ESBLs鑒定結(jié)果 產(chǎn)ESBLs酶表型篩選試驗(yàn)初步篩出55株(77.46%),可疑產(chǎn)ESBLs菌株。通過進(jìn)一步確認(rèn)試驗(yàn)在58株疑產(chǎn)ESBLs菌株中共檢出產(chǎn)ESBLs菌35株(49.30%)。
2.3 大腸埃希菌中整合子遺傳標(biāo)記基因的PCR法檢測情況
2.3.1 整合子遺傳標(biāo)記在不同耐藥模式中檢出結(jié)果見表1。
表1 各種耐藥模式中整合子遺傳標(biāo)記基因陽性率比較
2.3.2 整合子遺傳標(biāo)志在產(chǎn)ESBLs酶菌株中檢出結(jié)果 見表2。
表2 產(chǎn)ESBLs酶大腸埃希菌不同耐藥模式中整合子遺傳標(biāo)記檢出情況
2.3.3 整合子遺傳標(biāo)記在非產(chǎn)ESBLs酶大腸埃希菌中檢出結(jié)果 見表3。
表3 非產(chǎn)ESBLs酶菌株不同耐藥模式中整合子遺傳標(biāo)記基因陽性率的比較
2.4 整合子遺傳標(biāo)記qacE△sul1電泳圖片和基因測序結(jié)果
將本實(shí)驗(yàn)中Ⅰ類整合子遺傳標(biāo)記(qacE△sul1)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物序列測序后的基因在BLAST上進(jìn)行比對發(fā)現(xiàn)與基因庫中已登陸的基因相同,整合子遺傳標(biāo)記qacE△sul1電泳圖見圖1。
圖1 整合子遺傳標(biāo)記qacE△sul1電泳圖
本研究中菌株對左氧氟沙星、環(huán)丙沙星、頭孢噻肟、鏈霉素耐藥情況嚴(yán)重,尤其是在多耐藥模式中更為突出,以CTX+LVE/CIP+S模式常見。但對頭孢西丁和阿米卡星仍有較高的敏感性,這與頭孢西丁對β-內(nèi)酰胺酶高度穩(wěn)定,阿米卡星對氨基糖苷類鈍化酶穩(wěn)定的抗菌作用特點(diǎn)有關(guān)。
大腸埃希菌產(chǎn)ESBLs在不同國家的檢出有明顯差異,如土耳其大腸埃希菌的ESBLs發(fā)生率僅為12%[3];而國內(nèi)近5年大腸埃希菌產(chǎn)ESBLs菌株檢出率從46.0% 上升至63.4%,呈逐年增高的趨勢[5]。CTX-M(以高度水解頭孢噻肟為特征已dn為國內(nèi)外流行最廣的ESBLs[6])。本研究中大腸埃希菌ESBLs檢出率為49.30%(36株),與文獻(xiàn)所報道基本一致。
基因盒-整合子系統(tǒng)多見于革蘭陰性桿菌,以腸桿菌、銅綠假單胞菌為主,是細(xì)菌尤其是革蘭陰性菌多重耐藥快速發(fā)展的重要原因[7]。依據(jù)整合酶基因序列的不同,將整合子分為6類,亦有文獻(xiàn)報道為8類[8],目前報道較多的僅有4類。Ⅰ~Ⅲ類整合子已被證明與細(xì)菌耐藥性有關(guān),為耐藥整合子,其中第Ⅰ、Ⅱ類整合子是最常見捕獲和表達(dá)耐藥基因的整合子[9]。近年來,國外大量文獻(xiàn)報道整合子可介導(dǎo)病原體各種藥基因獲得整合子病原菌可表現(xiàn)為多藥耐藥[10-13]。QacE△1-sul1是Ⅰ類整合子的遺傳標(biāo)記,實(shí)質(zhì)是qacE△1基因和sul1基因組成的重疊基因,位于Ⅰ類整合子3′保守區(qū)。Dahmen等[14]研究提示:6種不同腸桿菌中I類整合子基因具有較高的檢出率,整合子遺傳標(biāo)記以sul1常見,sul1和sul2的重疊顯現(xiàn)明顯。有學(xué)者對血培養(yǎng)中的大腸埃希菌進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),幾乎有一半菌株中整合子及Sul基因陽性,其中以經(jīng)典類整合子qacE△1-sul1最多。
本研究結(jié)果提示,Ⅰ類整合子在大腸埃希菌中有高的檢出率(78.57%),與文獻(xiàn)報道相近。實(shí)驗(yàn)結(jié)果提示:大腸埃希菌產(chǎn)ESBLs酶且整合子陽性者,出現(xiàn)耐藥概率比單純攜帶整合子或者產(chǎn)ESBLs酶的菌株要大,尤其在多耐藥模式中更為明顯。
[1]李佩波,黃永茂.大腸埃細(xì)菌耐藥及機(jī)制研究進(jìn)展[J].西南軍醫(yī),2011,13(1):95-97.
[2]Diaz-Mejta JJ,Amabile-Cuevas CF,Rosas I,et al.An analysis of the evolutionary relationships of integron integrases,with emphasis on the prevalence of class 1integrons in Escherichia coli isolates from clinical and environmental origins[J].Microbiology,2008,154(1):94-102.
[3]褚云卓,田素飛,王玉玨,等.產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌的臨床調(diào)查中[J].國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué),2009,13(10):1423-1425.
[4]Qzqunes I,Erben N,Kiremitci A,et al.The prevalence of extended-spectrum beta-latamase-producing Escherchia coli and Klebsiella pneumoniae in clinical isolates and risk factors[J].Scan Med J,2006,27(5):608-612.
[5]戰(zhàn)榕,陳 菁,黃心宏,等.2004~2009年我院常見病原菌的耐藥性變遷分析[J].福建醫(yī)科大學(xué)學(xué)報,2010,44(3),205-209.
[6]Livermore DM,Hawkey PM.CTX-M:changing the faue of ESBls in the UK[J].J Amimicrob Chemother,2005,56(3):451-454.
[7]吳志鵑,黃永茂.基因盒-整合子系統(tǒng)介導(dǎo)細(xì)菌多重耐藥的研究進(jìn)展[J].國外醫(yī)藥抗生素分冊,2010,31(1):34-37.
[8]Barlow RS,Pemberton JM,Desmarchelier PM,et al.Isolation and characterization of integron-containing bacteria without antibiotic selection.[J]Antimicrob Agents Che-mother,2004,48(3):28-38.
[9]Weldhagen GF.Integrons andβ-lactamases-a novel perspective on resistance[J].Int J Antimicrob Agents,2004,23(6):556-562.
[10]林寧,孫海平.多藥耐藥大腸埃細(xì)菌整合子、轉(zhuǎn)座子遺傳標(biāo)記研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2008,18(10):1361-1363.
[11]Kang SG,Lee DY,Mshin SJ,et al.Changes in patterns of an timicorobiol susceptibility and class I grom carriage anong Escheriehia coli isolates[J].J Vet Sec,2005,6(3):201-205.
[12]Doi Y,Adams JM,Yamane K,et al.Identification of 16s RNA methlase-producing acinetobacter baumannii clinican strains in North America[J].Antimicrob Agents Chemother,2007,51(11):4209-4210.
[13]糜祖煌,秦玲.多耐藥鮑氏不動桿菌5類抗菌藥物機(jī)制研究[J].中華醫(yī)院感染學(xué)雜志,2008,18(7):901-904.
[14]Dahmen S,Mansour W,Boujuafar N,et al.Distribution of cotrimoxazole resistance genes associated with class 1integrons in clinical isolates of enterobacteriaceae in a university hospital in tunisia[J].Microb Drug Resist,2010,16(1):43-47.