• <tr id="yyy80"></tr>
  • <sup id="yyy80"></sup>
  • <tfoot id="yyy80"><noscript id="yyy80"></noscript></tfoot>
  • 99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看 ?

    檉柳過氧化物酶基因的序列分析及山新楊遺傳轉化研究

    2012-04-29 09:46:57郭曉紅洪艷華韓文革鄭桂萍呂艷東
    湖北農業(yè)科學 2012年3期
    關鍵詞:遺傳轉化檉柳

    郭曉紅 洪艷華 韓文革 鄭桂萍 呂艷東

    摘要:對剛毛檉柳(Tamarix hispida)的過氧化物酶基因(ThPOD)全長序列進行分析,結果表明,該基因全長為1 376 bp,包含一個1 086 bp的開放閱讀框,可編碼361個氨基酸殘基,蛋白分子質量為39.3 ku。根據(jù)ThPOD基因保守序列設計特異引物克隆該基因,并成功構建了pROKⅡ-ThPOD植物過表達載體,利用農桿菌介導法轉化山新楊(Populus davidiana × P. bolleana),經PCR和Northern blot鑒定,初步證明外源基因ThPOD已整合到山新楊的基因組中并在轉錄水平上進行了表達。

    關鍵詞:檉柳(Tamarix hispida);過氧化物酶基因(ThPOD);山新楊(Populus davidiana × P. bolleana);遺傳轉化

    中圖分類號:S793.5;Q554+.6文獻標識碼:A文章編號:0439-8114(2012)03-0615-05

    Sequence Analysis of Peroxidase Gene from Tamarix hispida and Its Transformation Into Populus davidiana ×P. bolleana

    GUO Xiao-hong,HONG Yan-hua,HAN Wen-ge,ZHENG Gui-ping,L?譈 Yan-dong

    (College of Agricultural Sciences, Heilongjiang Bayi Agricultural University,Daqing 163319,Heilongjiang, China)

    Abstract: The sequence of ThPOD gene isolated from Tamarix hispida root cDNA library was analyzed and it was showed that the sequence length of ThPOD was 1 376 kb containing a 1 086 bp ORF. The protein molecular quality of ThPOD was 39.3 ku with 361 amino acids. The gene was cloned from the specific primers designed according to the conserved sequences of ThPOD. Plant over-expression vector pROKⅡ-ThPOD was constructed; And the ThPOD gene was transformed into Populus davidiana × P. bolleana through Agrobacterium-mediated genetic transformation. PCR and Northern blot results showed that ThPOD was integrated into the genome and the transformed gene was expressed at the transcription level.

    Key words: Tamarix hispida; ThPOD; Populus davidiana × P. bolleana; transformation

    過氧化物酶(Peroxidase,POD,EC1.11.1.7)是廣泛存在于動物、植物和微生物體內的一類氧化還原類酶,主要與過氧化氫的清除有關[1]。該酶參與眾多的植物生理過程,在植物的生長發(fā)育、抵御生物和非生物脅迫方面起著一定作用[2-6]。目前,已對模式植物如擬南芥、水稻、煙草等的過氧化物酶的基因序列、表達模式、酶學性質及生理功能等方面進行了研究[7-9],但在木本植物中鮮有報道。

    剛毛檉柳(Tamarix hispida)屬檉柳科檉柳屬,廣泛分布于礫石戈壁、粘土、沙土、流沙及各種不同程度的鹽漬化土壤,具有抗旱、耐鹽堿、耐沙埋、耐貧瘠的特點,是荒漠地區(qū)鹽漬化沙地上良好的固沙造林樹種,也是進行植物抗干旱和耐鹽堿基因克隆的理想材料之一。ThPOD是從NaCl脅迫條件下剛毛檉柳根的cDNA文庫中分離到的編碼過氧化物酶的基因,屬于植物過氧化物酶基因家族成員之一,能夠被干旱、鹽和冷及重金屬(CdCl2)等非生物脅迫因子所誘導,且能保護大腸桿菌細胞免于非生物脅迫[10-12]。本研究對前期研究獲得的ThPOD序列進行了生物信息學分析,并利用農桿菌葉盤法將該基因轉入山新楊(Populus davidiana × P. bolleana),以期為進一步研究過氧化物酶在植物對逆境的響應等的分子調控機理以及利用基因工程技術改良林木品種奠定基礎。

    1材料與方法

    1.1材料和試劑

    根癌農桿菌(Agrobacterium tumefaciens)EHA105、大腸桿菌(Escherichia coli)JM109菌株為東北林業(yè)大學林木遺傳育種國家重點實驗室保存;植物表達載體pROKⅡ由山東農業(yè)大學張慧教授惠贈;pMD18T- ThPOD質粒、pET32a-ThPOD質粒由東北林業(yè)大學林木遺傳育種國家重點實驗室姜靜教授惠贈;限制性內切酶BamHⅠ和SacⅠ、Ex Taq、T4 DNA Ligase等購自MBI,質粒(小量)提取試劑盒、膠回收試劑盒購自上海華舜生物工程有限公司,DNA Marker DL 2000購自寶生物工程(大連)有限公司。卡那霉素(Kanamycin Sulfate,Km)購自Sigma公司,其他化學試劑等購自國內生產廠家,均為分析純。

    1.2方法

    1.2.1ThPOD序列生物信息學分析用NCBI的ORF(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)軟件尋找ThPOD的開放閱讀框;采用ExPASy的ProtParam Tool(http://www.expasy.ch/tools/protparam.html)分析ThPOD的理化性質;用Prosite軟件(http://au.expasy.org/pro-site)預測編碼蛋白的特定功能位點;Predictprotein預測ThPOD氨基酸序列的二級結構(http://www.predictprotein.org);用Signal P 3.0 Server(http://www.cbs.dtu.dk/services/Signal P)進行蛋白質序列中信號肽的預測分析。

    1.2.2ThPOD基因的分離根據(jù)已獲得的ThPOD基因保守序列,利用Oligo6.0軟件設計一對PCR特異擴增引物擴增ThPOD的開放閱讀框,由上海英駿生物技術有限公司合成。上下游引物序列分別為:上游引物5′-ATCGGGATCCATGGCCTTCAAGATCA

    TCAGCAGT-3′,下游引物5′-GAGCTCTTAGTATTC

    TGACCGCCTTCCATAC-3′(劃線部分分別為Bam HⅠ和SacⅠ的酶切位點)。PCR反應體系為20 μL,包括10×PCR Buffer 2 μL、2.5 mmol/L dNTPs、10 U/μL ExTaq、上下游引物各5 mol/L、模板pMD18T-ThPOD 60 ng。PCR擴增條件為:94 ℃預變性3 min;94 ℃變性30 s,56 ℃退火45 s,72 ℃延伸60 s,30個循環(huán);72 ℃,7 min。

    1.2.3植物表達載體的構建及鑒定質粒pMD18T-ThPOD經限制性內切酶BamHⅠ和SacⅠ消化后回收小片段,植物表達載體pROKⅡ經BamHⅠ和SacⅠ消化后回收大片段,將兩個片段經T4連接酶連接。連接產物轉化大腸桿菌JM109感受態(tài)細胞,在含50 mg/L Km的LB平板上篩選陽性菌落,堿裂解法提取質粒,利用PCR、酶切及測序進一步確認目的片段是否連接到pROKⅡ載體上。將PCR擴增、酶切鑒定均為陽性及測序正確的質粒命名為pROKⅡ-ThPOD。重組質粒pROKⅡ-ThPOD通過電擊法轉入根癌農桿菌EHA105感受態(tài)細胞,在含有50 mg/L Rif和50 mg/L Km的YEB平板上篩選陽性克隆,使用堿裂解法提取質粒并進行酶切鑒定。

    1.2.4農桿菌介導的山新楊遺傳轉化菌種的活化和工程菌液的制備按文獻[13]所述方法進行,參照文獻[14,15]的方法進行遺傳轉化。

    1.2.5轉基因山新楊植株的檢測①DNA提取及PCR的檢測。取轉化的山新楊植株幼嫩葉片,CTAB法提取總DNA。10 μL PCR反應體系包括:10×PCR Buffer 1.0 μL,MgCl2 0.6 μL,上下游引物(5 mmoL/L)各1.0 μL,dNTPs(2.5 mmoL/L)0.8 μL,Ex Taq(10 U/μL)0.2 μL,模板DNA(50 ng)1.0 μL。PCR反應程序為:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性40 s,56 ℃退火40 s,72 ℃延伸1 min,30個循環(huán);72 ℃保溫7 min。PCR 產物用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,以pROKⅡ-ThPOD質粒為陽性對照,以未經轉化的山新楊植株試管苗總DNA為陰性對照,同時設純水對照,對轉化再生植株進行PCR擴增檢測。②Northern印跡雜交檢測。采用SDS法[16]提取轉基因和非轉基因對照山新楊的總RNA,在0.8%的甲醛變性膠上進行電泳,采用虹吸法將RNA轉移到尼龍膜上,按標準的Northern印跡法進行雜交和檢測[17]。

    2結果與分析

    2.1檉柳ThPOD基因生物信息學分析

    2.1.1cDNA及氨基酸序列分析ThPOD全長為1 376 bp,其中5端非翻譯區(qū)163 bp,3端非翻譯區(qū)96 bp,1 347-1 376位為Poly(A)尾(圖1)。開放閱讀框編碼由361個氨基酸殘基組成的多肽。氨基酸序列的分子量為39.3 ku,理論等電點為6.59。編碼的蛋白為酸性蛋白質。負電荷殘基(Asp+Glu)數(shù)為35,正電荷殘基(Arg+Lys)數(shù)為34個,不穩(wěn)定系數(shù)為37.17,為穩(wěn)定的蛋白質。

    2.1.2ThPOD二級結構的預測和分析用SOPMA預測ThPOD氨基酸序列的二級結構(圖2),α-螺旋和不規(guī)則卷曲是ThPOD主要的結構元件,而β-轉角和延伸鏈則散布于整個蛋白質中。統(tǒng)計表明,ThPOD的二級結構由39.61%的α-螺旋、39.34%的不規(guī)則卷曲、16.07%的延伸鏈和4.99%的β-轉角組成。與豇豆、菠菜、煙草、大戟屬和擬南芥POD的二級結構相同,這說明POD的二級結構是高度保守的,與劉穩(wěn)等[18]報道的結果一致。

    2.1.3其他預測結果SMART和ScanProsite分析結果表明,ThPOD還具有過氧化物酶超家族的其他特征基序,如4個保守的二硫化物橋(51-132,84-89,138-333,218-245)和2個保守的鈣綁定位點(212,265)。除此之外,該基因包含4個N-糖基化位點(110-113,NLTL;186-189,NATT;252-255,NTTV;301-304:NQSL),4個蛋白激酶C磷酸化位點(112-114,TLR; 233-235,TDK; 290-292,TTK; 340-342,SFK),6個酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點(137-140,SCAD; 254-257, TVLD; 280-283, TSDE; 281-284,SDED; 325-328,TQQE; 345-348,SVVD),2個氨基化位點(162-165,LGRR;355-358,YGRR),一個依賴于cAMP和cGMP的蛋白激酶磷酸化位點(164-167,RRDS)和5個肉豆蔻?;稽c(41-46,GLSWSF;71-76,GQAAGL;88-93,GCDGSV;219-224,GSFTNW;277-282,GLFTSD)。此外,該基因所編碼的蛋白為分泌型蛋白且有信號肽。

    2.2ThPOD基因開放閱讀框的獲得

    以質粒pMD18T-ThPOD為模板,用設計的特異引物進行PCR,擴增出長約1 086 bp的DNA片段(圖3),與預期的片段長度相符,陰性對照沒有擴增出條帶,初步確定獲得的片段為ThPOD基因的開放閱讀框。

    2.3ThPOD基因植物表達載體的構建及鑒定

    PCR產物及pROKⅡ載體經BamHⅠ和SacⅠ進行雙酶切后,連接并轉化E. coli JM109,在含有50 μg/mL Km的平板上挑取陽性菌落,LB液體培養(yǎng)基培養(yǎng)并抽提質粒,利用特異引物進行PCR擴增,質粒擴增結果與以pMD18T-ThPOD質粒為模板擴增得到的片段大小一致(圖略);同時利用BamHⅠ和SacⅠ對質粒進行雙酶切,結果顯示在1 086 bp處有一特異片段(圖4),表明目的片段已成功地插入表達載體。經序列測定證實插入片段為ThPOD開放閱讀框序列,且序列完全、正確。

    2.4農桿菌介導的山新楊遺傳轉化

    采用電轉化法將pROKⅡ-ThPOD載體直接轉化農桿菌EHA105,用ThPOD基因的特異引物PCR擴增鑒定農桿菌質粒中目的基因的存在。從圖5可知農桿菌質粒與大腸桿菌質粒PCR結果相一致,說明植物表達載體pROKⅡ-ThPOD已轉化到農桿菌中。經愈傷誘導、共培養(yǎng)、篩選、預分化、分化得到17株轉基因山新楊苗。

    2.5轉基因山新楊的檢測

    用CTAB法提取17株轉基因植株及非轉基因對照植株的基因組DNA,以此為模板,用ThPOD基因開放閱讀框的特異引物進行PCR擴增,檢測ThPOD是否整合到了山新楊基因組中。以非轉化植株和純水做陰性對照,所得瓊脂糖凝膠電泳結果見圖6。從圖6可以看出,17個卡那霉素抗性植株中有14株可以擴增出目的條帶,而非轉化植株和純水陰性對照中均沒有擴增出產物,結果初步證明已獲得14株含外源ThPOD基因的山新楊轉化植株,將其分別命名為TL1-TL14。

    為檢測陽性轉基因植株在轉錄水平的表達,以非轉基因山新楊植株為陰性對照,對陽性轉基因植株進行Northern blot分析。采用CTAB法提取轉基因(TL1,TL3,TL5,TL8,TL12)和非轉基因山新楊葉片總RNA,用DNaseⅠ消化后經凝膠電泳檢測符合實驗要求(圖7)。采用DIG標記的ThPOD的特異性探針進行Northern blot,結果表明檉柳ThPOD在轉基因山新楊植株的葉片中進行了轉錄,非轉基因植株未出現(xiàn)雜交信號。

    3結論與討論

    過氧化物酶目前已在棉花[19]、小麥[20]、甘薯[21]、針葉樹[22]等植物中分離。在高等植物中,過氧化物酶是被多基因家族編碼的,過氧化物酶超家族的所有成員均參與以過氧化氫作為電子受體的多步氧化反應,該類酶主要存在于植物的細胞外和液泡膜空間,參與過氧化氫的脫毒、植物激素代謝、木質素的生物合成和脅迫反應[1]。研究表明ThPOD響應于鹽、冷、干旱、重金屬脅迫及ABA處理,與植物抗逆性的調控相關。因此可以推斷ThPOD是一個與逆境脅迫相關的基因[11,12]。生物信息學分析表明,ThPOD基因具有過氧化物酶超家族的特征基序,其二級結構也是高度保守的。

    對過氧化物酶基因進行基因工程研究已經取得了一定的成果。Kim等[23]通過農桿菌介導法將甜薯過氧化物酶基因(swpa4)轉入煙草植株中,轉基因植株過氧化物酶活性是對照植株酶活的50倍,該基因的過表達能夠提高煙草對鹽脅迫、氧化脅迫以及干旱脅迫的耐性,并推測該基因在過氧化氫調控的脅迫響應信號通路中可能起到一個有利的防御信號的作用??梢姴捎没蚬こ淌侄?,通過過量表達可清除活性氧自由基的抗氧化解毒酶,可以提高植物抗氧化脅迫的能力,繼而提高植物耐性。本研究將克隆獲得的ThPOD基因開放閱讀框構建到植物表達載體pROKⅡ中CaMV35S啟動子的下游,構建了ThPOD基因過表達載體,通過農桿菌介導法轉化山新楊,共獲得17個卡那霉素抗性植株,PCR檢測結果顯示其中14個轉化植株為陽性,從中選?。祩€轉化子進行Northern blot鑒定,結果證實ThPOD基因已經整合到山新楊基因組中并能夠轉錄出mRNA。本研究為進一步研究該基因的生物學功能,并深入了解過氧化物酶在植物對逆境的響應等方面的分子調控機理以及利用基因工程技術改良林木品種奠定了基礎。

    參考文獻:

    [1] PASSARDI F, COSIO C, PENEL C, et al. Peroxidases have more functions than a Swiss army knife[J]. Plant Cell Reports,2005,24(5):255-265.

    [2] PASSARDI F, PENEL C, DUNAND C. Performing the paradoxical:How plant peroxidases modify the cell wall[J]. Trends in Plant Science,2004,9(11):534-540.

    [3] L PEZ-SERRANO M, FERN NDEZ M D, POMAR F, et al. Zinnia elegans uses the same peroxidase isoenzyme complement for cell wall lignification in both single-cell tracheary elements and xylem vessels[J]. Journal of Experimental Botany,2004, 55(396):423-431.

    [4] RANIERI A, PETACCO F, CASTAGNA A, et al. Redox state and peroxidase system in sunflower plants exposed to ozone[J]. Plant Science,2000,159(1):159-167.

    [5] DELANNOY E, JALLOUL A, ASSIGBETSE K, et al. Activity of class III peroxidases in the defense of cotton to bacterial blight[J]. Molecular plant-microbe Interactions,2003,16(11):1030-1038.

    [6] DOWD P F, JOHNSON E T. Association of a specific cationic peroxidase isozyme with maize stress and disease resistance responses, genetic identification, and identification of a cDNA coding for the isozyme[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry,2005,53(11):4464-4470.

    [7] MARJAMAA K, HILD N K, KUKKOLA E, et al. Cloning, characterization and localization of three novel class III peroxidases in lignifying xylem of Norway spruce (Picea abies)[J]. Plant Molecular Biology,2006,61(4):719-732.

    [8] HIRAGA S, YAMAMOTO K, ITO H, et al. Diverse expression profiles of 21 rice peroxidase genes[J]. FEBS Letters,2000,471(2-3):245-250.

    [9] VAL RIO L, DE MEYER M, PENEL C, et al. Expression analysis of the Arabidopsis peroxidase multigenic family[J]. Phytochemistry, 2004,65(10):1331-1342.

    [10] 李慧玉,劉桂豐,劉菲菲,等. 檉柳cDNA文庫的構建及ThAQP基因的表達[J]. 西北農林科技大學學報(自然科學版), 2011,38(7):161-166.

    [11] GUO X H, JIANG J, WANG B C, et al. ThPOD3, a truncated polypeptide from Tamarix hispida, conferred drought tolerance in Escherichia coli[J]. Molecular Biology Reports, 2010,37(3):1183-1190.

    [12] GAO C,WANG Y,LIU G,et al. Cloning of ten peroxidase (POD) genes from Tamarix hispida and characterization of their responses to abiotic stress[J]. Plant Molecular Biology Reporter, 2010,28(1):77-89.

    [13] DREW M, SAKER L. Nutrient supply and the growth of the seminal root system in barley.Ⅱ. Localized, compensatory increases in lateral growth and rates of nitrate uptake when nitrate supply is restricted to only part of the root system [J]. Journal of Experimental Botany,1975,26(1):79-90.

    [14] 楊傳平,劉桂豐,梁宏偉,等. 耐鹽基因Bet-A轉化小黑楊的研究[J]. 林業(yè)科學,2001,37(6):34-38.

    [15] 徐晨曦,姜靜,李俊濤,等. 幾種抗生素對山新楊離體葉片不定芽再生的影響[J]. 東北林業(yè)大學學報,2007,35(1):28-30.

    [16] 王玉成,楊傳平,姜靜. 紫丁香、糖槭總RNA的快速提取方法[J]. 東北林業(yè)大學學報, 2001,29(6):90-91.

    [17] AUSUBEL F M, KINGSTON R E, SEIDMAN J,et al. 精編分子生物學實驗指南[M]. 顏子穎,王海林譯. 北京:科學出版社,2005.

    [18] 劉穩(wěn),李楊,高培基. 過氧化物酶研究進展[J]. 纖維素科學與技術,2000,8(2):50-64.

    [19] 郭媖,郭旺珍,張?zhí)煺妫?兩個陸地棉過氧化物酶cDNA的克隆和鑒定[J]. 作物學報,2007,33(6):891-897.

    [20] LIU G, SHENG X, GREENSHIELDS D L, et al. Profiling of wheat class III peroxidase genes derived from powdery mildew-attacked epidermis reveals distinct sequence-associated expression patterns[J]. Molecular Plant-Microbe Interactions,2005,18(7):730-741.

    [21] PARK S Y, RYU S H, JANG I C, et al. Molecular cloning of a cytosolic ascorbate peroxidase cdna from cell cultures of sweetpotato and its expression in response to stress[J]. Molecular Genetics and Genomics,2004,271(3):339-346.

    [22] GUNNAR FOSSDAL C, SHARMA P, L NNEBORG A. Isolation of the first putative peroxidase cDNA from a conifer and the local and systemic accumulation of related proteins upon pathogen infection[J]. Plant Molecular Biology, 2001,47(3):423-435.

    [23] KIM Y H, KIM C Y, SONG W K, et al. Overexpression of sweetpotato swpa4 peroxidase results in increased hydrogen peroxide production and enhances stress tolerance in tobacco[J]. Planta, 2008,227(4):867-881.

    (責任編輯向闈)

    收稿日期:2011-08-12

    基金項目:黑龍江省教育廳科學技術研究面上項目(11551318);黑龍江八一農墾大學博士啟動基金(B2010-5)

    作者簡介:郭曉紅(1980-),女,黑龍江寧安人,講師,博士,主要從事植物分子生物學研究,(電子信箱)dongjingcheng2002@yahoo.com.cn;

    通訊作者,呂艷東,副研究員,博士,主要從事植物基因工程及水稻節(jié)水灌溉研究,(電子信箱)luyandong336@sohu.com。

    猜你喜歡
    遺傳轉化檉柳
    檉柳不同種(品種)在秦皇島地區(qū)的引種適生性分析
    檉柳盆景欣賞
    花卉(2017年7期)2017-11-15 08:53:36
    檉柳盆景欣賞
    花卉(2017年7期)2017-07-20 11:10:39
    高削坡高陡坡檉柳扦插生態(tài)實驗研究
    轉檉柳冷適應蛋白基因水稻的獲得及抗冷性分析
    HPLC法測定蒙藥材檉柳中綠原酸的含量
    多毛番茄冷誘導轉錄因子CBF1轉化番茄的研究
    番茄黃化曲葉病毒Rep基因植物表達載體的構建及對番茄的遺傳轉化
    蘸花法在植物遺傳轉化上的應用研究進展
    農桿菌介導的旱稻遺傳轉化主要影響因素
    彭阳县| 宜春市| 清新县| 昭觉县| 青浦区| 珲春市| 蓬溪县| 青浦区| 类乌齐县| 孟津县| 太湖县| 陕西省| 故城县| 巴南区| 晋江市| 洪湖市| 望奎县| 商城县| 祁东县| 马鞍山市| 宝丰县| 峨山| 德令哈市| 甘德县| 河西区| 原平市| 海门市| 综艺| 农安县| 陈巴尔虎旗| 巫山县| 策勒县| 岱山县| 萨嘎县| 慈利县| 静宁县| 嘉兴市| 郓城县| 贵南县| 洞头县| 新竹县|