鄒 豐, 劉麗江
(江漢大學(xué) 醫(yī)學(xué)院病理學(xué)與病理生理學(xué)教研室, 湖北 武漢 430056)
microRNA(miRNA)是近些年發(fā)現(xiàn)的一類(lèi)具有高度保守特征、 長(zhǎng)度20~25 nt 的非蛋白質(zhì)編碼的單鏈小分子RNA, 其主要功能是通過(guò)兩種方式調(diào)控其靶基因的表達(dá): 誘導(dǎo)靶向mRNA 的降解或者抑制靶向mRNA 的翻譯。 miRNAs 在人類(lèi)基因的總數(shù)預(yù)計(jì)超過(guò)1 000 個(gè), 并調(diào)控約30% 的人類(lèi)基因。 現(xiàn)階段研究也顯示, miRNA 能扮演癌基因或抑癌基因的功能, 其表達(dá)失調(diào)在腫瘤的發(fā)生與轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要的作用, 已成為腫瘤學(xué)研究的熱點(diǎn)之一。 筆者主要對(duì)miRNA 在腫瘤轉(zhuǎn)移中的作用及調(diào)控機(jī)制進(jìn)行綜述。
1993 年, 美國(guó)著名遺傳學(xué)家Lee 等[1]首先在漂亮新小桿線蟲(chóng)(Caenorhabditis elegans)中發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)miRNA, 并命名為lin-4。 它能通過(guò)堿基配對(duì)的方式結(jié)合到靶mRNA, 從而抑制lin-4的翻譯,但并不影響其轉(zhuǎn)錄。 2000 年,Pasquinelli等又在對(duì)線蟲(chóng)發(fā)育調(diào)控研究中發(fā)現(xiàn)了let-7, 從而正式拉開(kāi)了miRNA 研究的序幕[2]。 不久后其他研究者在真核生物種例如擬南芥、 果蠅、 斑馬魚(yú)或人類(lèi)細(xì)胞等中也發(fā)現(xiàn)了大量類(lèi)似的miRNA。 到目前為止, 在人類(lèi)基因中就已發(fā)現(xiàn)的miRNAs 總數(shù)超過(guò)1 000 個(gè)。 研究顯示, 許多心血管疾病和腫瘤的發(fā)生發(fā)展都與miRNA 有著重要的聯(lián)系。miRNA 途徑也已經(jīng)證實(shí)是正常和疾病狀態(tài)下基因調(diào)節(jié)的一個(gè)新的機(jī)制。
miRNA 比較廣泛地存在于多種真核生物中,高度保守性、 組織表達(dá)特異性和時(shí)序表達(dá)特異性是其最重要的3 個(gè)生物學(xué)特性。 各物種之間的miRNA 序列結(jié)構(gòu)均存在高度的進(jìn)化保守性顯示,miRNA 雖然調(diào)控不同種類(lèi)的生物發(fā)育, 但卻有著相同的調(diào)控機(jī)制。 miRNA 的表達(dá)在同一物種的不同組織甚至是發(fā)育的不同階段也存在著明顯的差異。 以上研究結(jié)果顯示, 物種在發(fā)育過(guò)程中最終形成生理差別與miRNA 有著本質(zhì)的聯(lián)系。
miRNA 并不是由其相應(yīng)基因直接編碼形成的。 編碼miRNA 的基因通過(guò)RNA 聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄, 產(chǎn)生原始miRNA 轉(zhuǎn)錄本(pri-miRNA)。 通過(guò)與核糖核酸酶RNAse-Ⅲ酶Drosha 結(jié)合又產(chǎn)生60~70 nt 的呈發(fā)夾結(jié)構(gòu)(hairpin)的miRNA 前體(pre-miRNA)。 接著通過(guò)輸出蛋白(exportin)5 進(jìn)入細(xì)胞漿。 與siRNA 相似, 這些pre-miRNAs 最終被Dicer 裂解產(chǎn)生20~25 nt RNA 雙鏈體, 即成熟miRNA, 整合入RISC 樣復(fù)合物[3-5]。
在生物體內(nèi), miRNA 調(diào)控其靶基因的表達(dá)主要通過(guò)以下兩種方式: 誘導(dǎo)靶向mRNA 的降解或者抑制靶向mRNA 的翻譯[6]。 對(duì)于絕大多數(shù)的植物來(lái)說(shuō), miRNA 可以直接和其靶向mRNA 的3′端形成完全互補(bǔ)或幾乎完全互補(bǔ)的序列, 通過(guò)誘導(dǎo)產(chǎn)生靶向mRNA 的特異性位點(diǎn)的斷裂來(lái)減少其表達(dá); 而對(duì)于動(dòng)物來(lái)說(shuō), miRNA 并不能完全與mRNA 互補(bǔ)配對(duì), 所以miRNA 就主要通過(guò)抑制其靶基因的翻譯來(lái)調(diào)控靶基因的作用。 不過(guò)至今為止, miRNA 與靶基因的具體作用機(jī)制和調(diào)控位點(diǎn)仍不清楚, 需要更進(jìn)一步的研究。
現(xiàn)階段研究表明, 正常組織細(xì)胞與腫瘤細(xì)胞之間的miRNA 的表達(dá)具有明顯差異。 對(duì)肺癌、胃癌、 結(jié)腸癌、 胰腺癌、 乳腺癌和前列腺癌等540 個(gè)腫瘤樣本進(jìn)行微陣列芯片的miRNA 表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn), 腫瘤組織有與正常組織相比表達(dá)明顯增高的26 個(gè)miRNA 和表達(dá)明顯降低的17 個(gè)miRNA, 其中尤以miR-20a、 miR-21 和miR-106a 等差異明顯[7]。 miRNA 在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過(guò)程中可能扮演著類(lèi)似癌基因或抑癌基因的作用, 因其大多數(shù)miRNA 的基因定位于腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過(guò)程中相關(guān)性脆性基因位點(diǎn), 例如雜合性或純合性缺失區(qū)、 斷裂區(qū)或擴(kuò)增區(qū)等。 在腫瘤的發(fā)生中表達(dá)水平增多的miRNA 可視為癌基因,表達(dá)水平減少的miRNA 則可看作抑癌基因[8]。
研究表明, 大約50%的miRNA 在基因組上定位于與腫瘤發(fā)生相關(guān)的區(qū)域和脆性位點(diǎn)。 例如miR-15a 和miR-16-1 定位于人類(lèi)染色體的13q14 區(qū)域, 而超過(guò)50%的B 細(xì)胞慢性淋巴型白血病病人(CLL)中就存在這一區(qū)域的缺失。 后又有人證實(shí), miR-15a 和miR-16-1 可以通過(guò)下調(diào)Bcl-2 蛋白的表達(dá)誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡, 因此這兩個(gè)miRNA 的缺失或下調(diào)可以直接導(dǎo)致Bcl-2 蛋白表達(dá)水平升高, 從而促進(jìn)了白血病和淋巴瘤的發(fā)生[9]。 在其他腫瘤類(lèi)型中也存在著miRNA 的異常表達(dá)現(xiàn)象。 此外, 不僅組織和細(xì)胞中的miRNA的表達(dá)可作為疾病分型和診斷的標(biāo)志, 存在于血漿和血清中的miRNA 也可用于疾病的檢測(cè)。
惡性腫瘤的重要生物學(xué)特征之一是腫瘤轉(zhuǎn)移, 這也是惡性腫瘤患者死亡的主要原因。 腫瘤轉(zhuǎn)移與大量蛋白酶、 黏附分子和細(xì)胞因子的表達(dá)及其相應(yīng)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路密切相關(guān), 其具體過(guò)程包括以下幾個(gè)步驟: 首先腫瘤細(xì)胞必須降解細(xì)胞外基質(zhì)和基底膜, 這需要大量的基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)的參與; 接著腫瘤細(xì)胞可以依靠自身的一些運(yùn)動(dòng)和不同黏附分子產(chǎn)生的外力而慢慢脫離原來(lái)的組織, 然后向血管或淋巴管移動(dòng)并附壁;最后腫瘤細(xì)胞游出血管或淋巴管, 形成遠(yuǎn)處組織和器官的轉(zhuǎn)移灶。隨著對(duì)miRNA 研究的深入, 越來(lái)越多的研究揭示出上述許多與腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移的基因均能在不同程度上受到相關(guān)miRNA 的調(diào)控,從而導(dǎo)致腫瘤轉(zhuǎn)移活性的改變, 最終加快或減慢腫瘤細(xì)胞的轉(zhuǎn)移。
2004 年Calin 等第一次為miRNA 與腫瘤轉(zhuǎn)移的相關(guān)性提供了直接證據(jù), 之后大量的miRNA 被報(bào)道與消化系統(tǒng)腫瘤、 呼吸系統(tǒng)腫瘤、泌尿系統(tǒng)腫瘤與乳腺癌及其轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。 目前許多研究顯示miR-21 在多種消化道腫瘤中高表達(dá), 并參與腫瘤浸潤(rùn)轉(zhuǎn)移[10-11]。 miR-21 具有原癌基因活性, 其位于染色體的脆性區(qū)域17q23.2。程序細(xì)胞死亡蛋白4(PDCD4)能與轉(zhuǎn)錄起始因子eIF4A、 eIF4G 相互作用而抑制基因轉(zhuǎn)錄; 人類(lèi)第10 號(hào)染色體缺失的磷酸酶及張力蛋白同源的基因(PTEN)通過(guò)編碼磷酸化酯酶, 使3、 4、 5-三磷酸磷脂酰肌醇(PIP3)去磷酸化, 從而負(fù)性調(diào)控磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)細(xì)胞通路來(lái)增加腫瘤細(xì)胞的凋亡來(lái)抑制腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)[12]。 在極具侵襲性的肝癌細(xì)胞中, miR-21 的表達(dá)比正常肝細(xì)胞要多出9 倍, 與此伴隨的還有PTEN 表達(dá)的減少和PI3K 表達(dá)的增多。 在乳腺癌細(xì)胞中轉(zhuǎn)染低表達(dá)miR-21 的研究中發(fā)現(xiàn), miR-21 的表達(dá)減少的腫瘤細(xì)胞的侵襲能力明顯要低于對(duì)照組的腫瘤細(xì)胞[13]。 因此miR-21 可以通過(guò)調(diào)控PDCD4 和PTEN 來(lái)介導(dǎo)腫瘤轉(zhuǎn)移的發(fā)生。
在過(guò)表達(dá)let-7 的鼠的肺癌細(xì)胞系中, 高遷移率組A 蛋白(HMGA2) 的表達(dá)水平明顯下調(diào),提示let-7 可能通過(guò)HMGA2 靶基因調(diào)控肺癌細(xì)胞的遷移能力[14-15]; 另一方面, 通過(guò)上調(diào)非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞系A(chǔ)549 中的miR-200c 的表達(dá)水平后, 鋅指結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄因子8(TCF8)的作用缺失,E 鈣黏蛋白(E-cadherin) 的表達(dá)水平受到抑制,細(xì)胞形態(tài)改變, 黏附能力下降, 提示miR-200c具有調(diào)控肺癌細(xì)胞侵襲表型轉(zhuǎn)化的作用[16]; 信號(hào)接頭蛋白(Crk)是一種能整合蛋白等多種分子的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路而改變細(xì)胞的黏附、 擴(kuò)增和遷移能力的蛋白, 其介導(dǎo)肺癌細(xì)胞的黏附、 遷移和侵襲是由miR-126 參與調(diào)控的[17]。
在前列腺腫瘤的miRNA 研究中發(fā)現(xiàn), miR-224 幾乎都在神經(jīng)管周?chē)那傲邢侔┘?xì)胞中表達(dá)。 其調(diào)控基因大部分都是編碼與細(xì)胞代謝相關(guān)的金屬硫蛋白和線粒體相關(guān)蛋白, 從而推斷miR-224 的表達(dá)是通過(guò)改變細(xì)胞代謝和線粒體的功能來(lái)影響腫瘤細(xì)胞的周?chē)窠?jīng)浸潤(rùn)[18]。 子宮頸癌的研究顯示, miR-127 的表達(dá)與腫瘤的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān)[19]。 而膀胱癌的miRNA 研究揭示,miR-223、 miR-26b 和miR-221 的表達(dá)明顯上調(diào), miR-20b 與腫瘤的分期與轉(zhuǎn)移呈負(fù)相關(guān)[20]。
miR-10b 位于同源框蛋白(HOXD)基因家族簇中, 在轉(zhuǎn)移性乳腺癌表達(dá)明顯增高[21]。 構(gòu)建過(guò)表達(dá)miR-10b 的乳腺癌細(xì)胞系SUM159, 并將其注射至小鼠乳房的脂肪細(xì)胞中, 形成的腫瘤的侵襲性要明顯高于注射對(duì)照SUM159 細(xì)胞組的小鼠。 利用miR-10b 抑制劑可以顯著降低miR-10b的表達(dá)和增加其靶基因HOXD-10 的表達(dá), 雖然不能直接抑制小鼠乳腺癌細(xì)胞的生長(zhǎng), 但卻能明顯抑制其向肺部的轉(zhuǎn)移, 提示miR-10b 的表達(dá)與腫瘤轉(zhuǎn)移是呈正相關(guān)的[22]。
現(xiàn)有研究顯示, 上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化 (epithelialmesenchymal transition, EMT)是腫瘤轉(zhuǎn)移的重要機(jī)制之一。 其整個(gè)過(guò)程受機(jī)體發(fā)育過(guò)程的一系列轉(zhuǎn)錄因子, 如TWIST1、 Snail 和Slug 等的調(diào)控。EMT 發(fā)生后引起的重要改變就是E-鈣黏蛋白的損失。 作為細(xì)胞黏附的主要蛋白質(zhì), E-cadherin在抑制腫瘤的浸潤(rùn)與轉(zhuǎn)移中發(fā)揮著及其重要的作用[23]。 一些鋅指蛋白的轉(zhuǎn)錄因子如Snail、 Slug、ZEB1 和ZEB2 等都參與了EMT 的發(fā)生。 miR-200 家族已被證實(shí)作為一個(gè)關(guān)鍵因子參與調(diào)控E-cadherin 的表達(dá)[24]。 鋅指蛋白ZEB 家族在侵襲的間質(zhì)細(xì)胞里高表達(dá), 在無(wú)侵襲性的上皮細(xì)胞里, miR-200 可以抑制ZEB 的表達(dá), 同時(shí)ZEB又能反過(guò)來(lái)抑制miR-200 的表達(dá)[25]。 通過(guò)調(diào)控E-cadherin 的表達(dá)已經(jīng)能夠作為腫瘤治療的一種新思路, 其中與miR-200 和ZEB 的關(guān)系密不可分。除了miR-200 外, miR-101 也在EMT 中扮演著主要的角色。 與前者不同的是, miR-101 的相關(guān)通路是EZH2 基因 (Enhancer of Zeste Homolog)。 EZH2 基因可以通過(guò)基因沉默機(jī)制(沉默E-cadherin) 改變細(xì)胞的記憶系統(tǒng)并調(diào)控轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)惡性腫瘤的形成[26]。 有文獻(xiàn)指出, miR-101能夠抑制EZH2 的表達(dá), 并可在臨床上作為前列腺癌惡性度的標(biāo)志之一[27]。
miRNA 作為一類(lèi)內(nèi)源性非編碼的小RNA,不僅參與機(jī)體的生長(zhǎng)發(fā)育等正常的生理過(guò)程, 還在多種病理過(guò)程尤其是腫瘤的發(fā)生、 發(fā)展和轉(zhuǎn)移中扮演重要的角色。 雖已證實(shí)miRNA 與腫瘤轉(zhuǎn)移及相關(guān)信號(hào)通路有關(guān), 但其具體的調(diào)控機(jī)制包括靶基因的預(yù)測(cè)和被調(diào)控通路等均不完全清楚。相信隨著今后相關(guān)研究的深入, miRNA 可為腫瘤轉(zhuǎn)移的早期診斷、 預(yù)后監(jiān)測(cè)和生物分子標(biāo)記的靶向治療帶來(lái)一片廣闊的前景。
[1] Lee R C,F(xiàn)einbaum R L,Ambros V. The celegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with an tisense complem entarity to lin-4[J]. Cell, 1993,75(5):843-854.
[2] Reinhart B J,Slack F J,Basson M,et al. The 21 mucleotide let-7 RNA regulates developmental timing in Caenorh abdit is elegans[J].Nature,2000,403(6772):901-906.
[3] Lee Y,Kim M,Han J,et al. MicroRNA genes are transcribed by RNA polymerase II[J]. EMBO J,2004,23(20):4051-4060.
[4] Han J, Lee Y, Yeom K H,et al. Molecular basis for the recognition of primary microRNAs by the Drosha-DGCR8 complex[J]. Cell,2006,125(5):887-901.
[5] Couzin J. MicroRNAs make big impression in disease after disease [J]. Science,2008,319 (5871):1782-1784.
[6] Wu L,F(xiàn)an J,Belasco J G. MicroRNAs direct rapid dead enylation mRNA[J]. Proc Natl Acad Sci,2006,103(11):4034-4039.
[7] Volinia S, Calin G A, Liu C G, et al. A microRNA expression signature of human solid tumor defines cancer gene target[J]. Proc Natl Acad Sci,2006,103(7):2257-2261.
[8] Calin G A,Sevignani C,Dumitru C D,et al. Human microRNA genes are frequently located at fragile sites and genomic regions in volved in cancers[J].Proc Natl Acad Sci, 2004,101(9):2999-3004.
[9] Cimmino A,Calin G A,F(xiàn)abbri M,et al. MiR-15 and miR-16 induce apoptosis by targeting BCL2[J].Proc Nail Acad Sci USA,2005,102(39):13944-13949.
[10] Asangani I A, Rasheed S A, Nikolova D A, et al. MicroRNA-21 (miR-21) post-transcriptionally downregulates tumor suppressor Pdcd4 and stimulates invasion, intravasation and metastasis in colorectal cancer[J].Oncogene,2008,27(15):2128-2136.
[11] Reis P P,Tomenson M,Cervigne N K,et al. Programmed cell death 4 loss increases tumor cell invasion and is regulated by miR-21 in oral squamous cell carcinoma[J].Mol Cancer,2010,9:238.
[12] Meng F,Henson R,Wehbe-Janek H,et al. MicroRNA-21 regulates expression of the PTEN tumor suppressor gene in human hepatocellular cancer [J]. Gastroenterology,2007,133(2):647-658.
[13] Song B,Wang C,Liu J,et al. MicroRNA-21 regulates breast cancer invasion partly by targeting tissue inhibitor of metalloproteinase 3 expression[J]. J Exp Clin Cancer Res,2010,29:29.
[14] Mayr C,Hemann M T,Bartel D P. Disrupting the pairing between let-7 and Hmga2 enhances oncogenic transformation[J]. Science, 2007,315(5818):1576-1579.
[15] Johnson S M, Grosshans H, Shingara J, et al. RAS is regulated by the let-7 microRNA family [J]. Cell,2005,120(5):635-647.
[16] Hurteau G J,Carlson J A,Spivack S D,et al. Overexpress ion of the microRNA hsa-miR-200c leads to reduced expression of transcription factor 8 and increased expression of Ecadherin[J].Cancer Res,2007,67(17):7972-7976.
[17] Crawford M,Brawner E,Batte K,et al. MicroRNA-126 inhibits invasion in non small cell lung carcinoma cell lines[J]. Biochem Biophys Res Commun, 2008,373(4):607-612.
[18] Prueitt R L,Yi M,Hudson R S,et al. Expression of microRNAs and protein coding genes associated with perineural in vasion in prostate cancer[J]. Prostate,2008,68(11):1152-1164.
[19] Lee J W,Choi C H,Choi J J,et al. Altered MicroRNA expression in cervial carcinomas[J]. Clin Cancer Res,2008,14 (9):2535-2542.
[20] Gottardo F,Lin C G,F(xiàn)ettacin M,et al.Micro-RNA profiling in kidney and bladder cancers[J]. Urol Oncol,2007,25(5):387-392.
[21] Ma L.Role of miR-10b in breast cancer metastasis[J].Breast Cancer Res,2010,12(5):210.
[22] Ma L,Teruya-Feldstein J,Weinverg R A. Tumour invasion and metastasis initiated by microRNA-10b in breast cancer[J]. Nature,2007,449(7163):682-688.
[23] Baranwal S,Alahari S K. Molecular mechanisms controlling E-cadherin expression in breast cancer [J].Biochem Biophys Res Commun,2009,384(1):6-11.
[24] Korpal M,Kang Y. The emerging role of miR-200 family of microRNAs in epithelialmesenchymal transition and cancer metastasis[J]. RNA Biol,2008,5(3):115-119.
[25] Gregory P A,Bert A G,Paterson E L,et al. The miR-200 family and miR-205 regulate epithelial to mesenchymal transition by targeting ZEB1 and SIP1[J].Nat Cell Biol,2008,10(5):593-601.
[26] Cao Q,Yu J,Dhanasekaran S M,et al. Repression of E-cadherin by the polycomb group protein EZH2 in cancer[J].Oncogene,2008,27(58):7274-7284.
[27] Varambally S,Cao Q,Mani R S,et al. Genomic loss of microRNA-101 leads to overexpression of histone methyltransferase EZH2 in cancer[J]. Science, 2008,322(5908):1695-1699.