陳素琴王一鳴李洵樺梁秀齡周玨倩方瑩瑩
·論 著·
3個單純型發(fā)作性運(yùn)動誘發(fā)性運(yùn)動障礙家系的致病基因定位
陳素琴*王一鳴*李洵樺△梁秀齡△周玨倩△方瑩瑩△
目的 在3個中國漢族單純型發(fā)作性運(yùn)動誘發(fā)性運(yùn)動障礙 (paroxysmal kinesigenic dyskinesia,PKD)家系中確定其疾病基因所在區(qū)域。 方法 在已知的PKD連鎖區(qū)域 16p12.2-q22.3選取 14個微衛(wèi)星遺傳標(biāo)記對37位家庭成員進(jìn)行基因分型,用Linkage和Genehunter等軟件進(jìn)行連鎖分析并構(gòu)建疾病單倍型。結(jié)果 連鎖分析及單倍型分析將致病基因定位于D16S3133~D16S3044(16p12.1-q12.1)之間11.2 cM的區(qū)域。結(jié)論 3個漢族單純型PKD家系的致病基因被定位于D16S3133~D16S3044(16p12.1-q12.1)之間,與最初的嬰兒驚厥及陣發(fā)性舞蹈手足徐動癥(infantile convulsions and paroxysmal choreoathetosis,ICCA)的位點(diǎn)重疊。
發(fā)作性運(yùn)動誘發(fā)性運(yùn)動障礙 基因定位 連鎖分析
發(fā)作性運(yùn)動誘發(fā)性運(yùn)動障礙 (paroxysmal kinesigenic dyskinesia,PKD,OMIN 128200)是發(fā)作性運(yùn)動障礙(paroxysmal dyskinesia)中最常見的一種,主要表現(xiàn)為突然運(yùn)動誘發(fā)的肌張力障礙、舞蹈、手足徐動等不自主運(yùn)動,發(fā)作持續(xù)時間一般不超過1 min,發(fā)作期間意識清醒,對抗驚厥藥物有良好的反應(yīng)[1]。PKD可以是散發(fā)性或家族性,后者多呈常染色體顯性遺傳,伴外顯不完全。PKD具有臨床表型異質(zhì)性。有些PKD患者伴有嬰兒驚厥、癲癇、偏頭痛或其他神經(jīng)系統(tǒng)疾病。不伴有其他神經(jīng)系統(tǒng)疾病者,稱之為“單純型PKD”。
PKD存在著遺傳異質(zhì)性,已報道的致病基因位點(diǎn)有 3個:位于 16p11.2-q12.1區(qū)域的 EKD1位點(diǎn)[2],位于 16q13-q22.1區(qū)域的 EKD2位點(diǎn)[3],以及可能位于 3q28-29的 EKD3位點(diǎn)[4]。其中,EKD1是最常見的 PKD致病基因位點(diǎn),已有多個不同種族的PKD或嬰兒驚厥及發(fā)作性舞蹈手足徐動癥 (infantile convulsions and paroxysmal choreoathetosis,ICCA,OMIM 602066)和良性家族性嬰兒驚厥 (benign familial infantile convulsions,BFIC,OMIN 605751)家系定位于此[5-13]。目前3個位點(diǎn)的疾病基因均未被克隆。
我們收集到了3個常染色體顯性遺傳的單純型PKD家系,在覆蓋已知的EKD1和EKD2位點(diǎn)范圍選取14個微衛(wèi)星遺傳標(biāo)記(marker)進(jìn)行基因分型,利用Linkage和Genehunter等軟件進(jìn)行參數(shù)和非參數(shù)連鎖分析,并構(gòu)建致病單倍型。
1.1 研究對象 3個中國漢族PKD家系,家系1(圖2A)和2(圖2B)來自廣東,家系3(圖2C)來自湖南。每個家系各有6例PKD患者,家系2中的Ⅱ:9和家系3中的Ⅲ:7為嬰幼兒起病的癲癇患者,但無PKD癥狀。所有PKD患者無合并癲癇及其他神經(jīng)系統(tǒng)疾病,為單純型PKD。3個家系總的男女患者病例為1∶1,遺傳方式為常染色體顯性遺傳。
患者發(fā)病年齡8~18歲,平均為10.8歲;表現(xiàn)為發(fā)作性一側(cè)或雙側(cè)的肢體、軀干、面部異常運(yùn)動,出現(xiàn)四肢舞蹈、手足徐動、顫搐、軀體扭轉(zhuǎn)等。發(fā)作程度不一,嚴(yán)重發(fā)作時四肢及面部異常活動致倒地,輕者僅感覺突然運(yùn)動時一側(cè)肢體瞬間的不自主運(yùn)動。女性癥狀多較男性為輕。發(fā)作時意識清醒。誘發(fā)因素多為突然運(yùn)動、用力、驚嚇等,以靜坐或久站后突然運(yùn)動誘發(fā)最為常見。發(fā)作持續(xù)時間,一般不超過1 min。發(fā)作頻率不定,可有一段時間不發(fā)作或一天發(fā)作數(shù)10次。發(fā)作間期正常。神經(jīng)系統(tǒng)檢查均未發(fā)現(xiàn)陽性體征。先證者頭顱CT或MRI檢查及腦電圖檢查未發(fā)現(xiàn)異常。所有患者均符合Bruno等[1]制定的PKD診斷標(biāo)準(zhǔn)。
我們對3個家系中的15例PKD患者及22名無PKD癥狀的家系成員,在獲得參與者的知情同意后,采集外周血,進(jìn)行遺傳學(xué)分析。
1.2 基因組DNA的提取 取外周靜脈血10 mL,EDTA抗凝,用QlAamp DNA Blood Maxi Kit(Qiagen,德國)抽提DNA,嚴(yán)格按照說明書操作。-70℃保存DNA。
1.3 基因型分析 選擇14個覆蓋PKD已知位點(diǎn) 16p11.2-q22.1的微衛(wèi)星標(biāo)記 (marker),包括D16S403,D16S3133,D16S3068,D16S3131,D16S3093,D16S3044,D16S3080,D16S3136,D16S419,D16S3034,D16S3140,D16S3057,D16S514和D16S3066。平均相鄰的Marker間距為3.0 cM,部分Marker來自ABI Linkage Mapping Set v2.5 HD5;部分由上海生工合成,合成的引物序列來自UCSC Genome Browser(http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgGateway)。其中ABI Linkage Mapping Set v2.5 HD5的引物,其上游標(biāo)有FAM、VIC或NED不用顏色的熒光染料;而合成的引物,其上游標(biāo)有FAM熒光染料。PCR反應(yīng)在96孔微量板中進(jìn)行,10 μL反應(yīng)體系,采用Touchdown法,在ABI 9700PCR儀上完成。反應(yīng)條件為:95℃5 min;95℃30 s,64℃30 s,每個循環(huán)降低1℃,72℃45 s,10個循環(huán);95℃30 s,55℃30 s,72℃45 s,25個循環(huán)。 PCR產(chǎn)物與去離子甲酰胺及GeneScanTM-500-LIZ按標(biāo)準(zhǔn)體系混勻后,95℃熱變性5 min,迅速置于冰塊上冷卻3 min,由ABI 3100基因分析儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳分離及數(shù)據(jù)收集。應(yīng)用GenesScan Analysis v3.7軟件進(jìn)行分子量內(nèi)標(biāo)GS-500校正,并自動將凝膠圖像轉(zhuǎn)換為數(shù)字信號文件。采用Genotyper Software v2.1軟件將各泳道內(nèi)的PCR產(chǎn)物進(jìn)行等位基因分型。
1.4 連鎖分析 根據(jù)家系成員每個位點(diǎn)的等位基因型,用Linkage軟件(Version 5.1)中的MLINK軟件進(jìn)行兩點(diǎn)連鎖關(guān)系分析[14]。參數(shù)設(shè)置如下:遺傳方式為常染色體顯性遺傳,外顯率分別設(shè)為0.9、0.8或0.7,疾病基因頻率為10-4,男女重組率相同。遺傳標(biāo)記的等位基因頻率設(shè)為1/n,其中n為3個家系中所觀察到的等位基因數(shù)目。利用FASTMAP軟件對兩點(diǎn)連鎖分析的數(shù)據(jù)進(jìn)行多點(diǎn)連鎖分析[15],利用Genehunter軟件(Version 2.1)進(jìn)行多點(diǎn)參數(shù)與非參數(shù)連鎖分析[16],其中遺傳標(biāo)記間的遺傳距離來自Marshfield,sex averaged,linkage map (http://research.marshfieldclinic.org/genet ics/GeneticResearch/compMaps.asp)。用HOMOG軟件進(jìn)行遺傳異質(zhì)性分析[17]。
1.5 單倍型的構(gòu)建 利用 Cyrillic 2.1軟件構(gòu)建單倍型,并按照家系中交換數(shù)最少的原則對單倍型進(jìn)行人工校正。分析單倍型與疾病狀態(tài)共分離的情況,確定所有患者共同攜帶的單倍型。
表1 不同外顯率下3個PKD家系總的兩點(diǎn)LOD值
2.1 連鎖分析 在兩點(diǎn)連鎖分析中,3個家系總LOD值,在D16S3080處取得最大值,在外顯率為0.9,0.8,0.7,重組率θ=0時分別為3.16,3.08和2.97。 總 LOD 值 大于 2.0的 另 一 Marker為D16S3068,在外顯率為0.9,0.8,0.7,重組率θ=0時分別為2.83,2.69和2.53(表1)。根據(jù)LOD值的評判標(biāo)準(zhǔn),支持D163080和D16S3068與致病基因存在連鎖;而且當(dāng)外顯率為0.9,0.8時,顯著支持D163080與致病基因存在連鎖。位于EDK2位點(diǎn)的Marker DS3140,D16S3057,D16S514和D16S3066在外顯率為0.9,0.8,0.7時LOD值均遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于-2,提示這些位點(diǎn)與致病基因不連鎖。
FASTMAP軟件的多點(diǎn)參數(shù)連鎖分析結(jié)果顯示,外顯率為0.9,0.8及0.7時,其最大LOD值均位于D16S3068~D16S3131之間 (未提供數(shù)據(jù))。GENEHUNTER軟件的多點(diǎn)參數(shù)連鎖分析結(jié)果顯示,外顯率為0.9或0.8時,Marshfield圖譜中的59.68 cM處 (D16S3080位點(diǎn))取得最大LOD值2.54或2.56(未提供數(shù)據(jù));外顯率為0.7時,最大LOD值2.75位于Marshfield圖譜中的D16S3068~D16S3131之間(圖1)。多點(diǎn)非參數(shù)連鎖分析結(jié)果顯示,NPL值在D16S3068~D16S3093之間取得最大NPL值3.85(p=0.002)(圖1),根據(jù)Lander等提出的顯著性連鎖閾值為3.6的標(biāo)準(zhǔn)[18],顯著支持致病基因與該區(qū)域連鎖。用HOMOG軟件進(jìn)行遺傳異質(zhì)性檢驗,未拒絕遺傳同質(zhì)性(未提供數(shù)據(jù))。
2.2 單倍型分析 在上述14個Marker中,選取能夠提供重組交換信息的11個,構(gòu)建單倍型并進(jìn)行分析(圖2)。
圖1 當(dāng)外顯率為0.7時,11個微衛(wèi)星遺傳標(biāo)記在3個PKD家系中的總的多點(diǎn)連鎖分析圖譜。 實(shí)的曲線表示參數(shù)連鎖分析的LOD值,虛的曲線表示非參數(shù)連鎖分析的NPL值,X軸上的數(shù)值表示Marshfield圖譜中的遺傳距離
圖2 PKD家系1~3的系譜及單倍型圖。11個微衛(wèi)星遺傳標(biāo)記在單倍型圖的左側(cè)。 括號里的數(shù)字表示由雙親、同胞及子女推導(dǎo)得到的基因型。黑色柱狀圖表示疾病單倍型;白色柱狀圖表示正常單倍型;斜紋柱狀圖表示可能為疾病或正常單倍型。 右上角上的+表示癲癇患者
家系-1的單倍型分析提示(圖2A),所有患者都攜帶有D16S3068~D16S3034間的3-2-3-1-3-1-2-3單倍型。Ⅲ:2,Ⅲ:3攜帶有該單倍型,Ⅱ:1攜帶有部分該單倍型,但無患病。
家系-2的單倍型分析提示(圖2B),Ⅲ:1發(fā)生了兩次重組。其中的一次重組發(fā)生在D16S3093和D16S3044之間。由于II-2的D16S419和D16S3034為等位基因的純合子,因而另一次重組有2種可能:可能發(fā)生D16S3136和D16S419間,也可能發(fā)生D16S3034和D16S3140之間。所有患者都攜帶有D16S3133~D16S3093間的3-1-2-2單倍型和/或D16S419~D16S3034間3-3單倍型。由于該家系的非參數(shù)連鎖分析的最大 NPL值 3.23位于D16S3133~D16S3093之間(未提供數(shù)據(jù)),并且3個家系總的最大NPL值3.85也位于該區(qū)域,故致病單倍型位于D16S3133~D16S3044之間。Ⅲ:3攜帶有 D16S3133~D16S3093間的 3-1-2-2單倍型,但無患病。
圖3 PKD、ICCA及BFIC在16號染色體區(qū)域的定位圖譜。各條直線對應(yīng)于不同的家系及定位區(qū)域。1:4個ICCA的法國家系[11];2:1個ICCA的中國家系[12];3:7個來自阿根廷和法國的BFIC家系[13];4:8個日本PKD/IC家系[2];5:1個非洲裔美國人PKD家系[5];6:11個多種族的 PKD/IC家系[6];7:1個西班牙 PKD家系[7];8:7個日本PKD家系[8];9:4個中國PKD家系[10];10:1個印度家系的EKD2位點(diǎn)[4];11為本研究中的3個PKD中國家系
家系3的單倍型分析提示 (圖2C),3例患者都攜帶有D16S403與D16S3140間的3-3-2-3-2-2-4-1-2-4-3單倍型。Ⅲ:7為癲癇患者,也攜帶有該單倍型,但無PKD癥狀。
在本研究中,3個家系中攜帶有致病單倍型的個體共有21例,有PKD表型的只有15例,外顯率為71.4%。故在連鎖分析時,外顯率設(shè)置為0.7比較合理。結(jié)合單倍型分析和連鎖分析結(jié)果,致病基因所在單倍型區(qū)域為 D16S3133~D16S3044間。
PKD具有臨床表型和遺傳異質(zhì)性。有些PKD患者伴有嬰兒驚厥、癲癇、偏頭痛或其他神經(jīng)系統(tǒng)疾病。由于基因定位于相同的區(qū)域,ICCA和BFIC被認(rèn)為與PKD是同一疾病的不同臨床表現(xiàn)。
家族性PKD多呈常染色體顯性遺傳,伴外顯不完全。目前為止,已報道的PKD致病基因位點(diǎn)有3個:位于16p11.2-q12.1區(qū)域的EKD1位點(diǎn)[2],位于16q13-q22.1區(qū)域的EKD2位點(diǎn)[3],以及可能位于3q28-29的EKD3位點(diǎn)[4]。其中,EKD1是最常見PKD致病基因位點(diǎn),已有多個不同種族的PKD或ICCA或BFIC定位于此[2,5-13](圖3)。
本研究中的3個家系符合常染色體顯性遺傳,且為不伴嬰兒驚厥、癲癇和偏頭痛等其他神經(jīng)系統(tǒng)疾病,屬于單純型PKD。在兩點(diǎn)連鎖分析中,3個家系總的LOD值,在D16S3080處取得最大值2.97(在外顯率為0.7,重組率θ=0時);在外顯率為0.7,重組率θ=0時D16S3068處的LOD值為2.53 (表1)。多點(diǎn)參數(shù)和非參數(shù)連鎖分析結(jié)果提示,最大的LOD值2.75和最大的NPL值3.85都位于D16S3068位點(diǎn)附近。單倍型分析時,家系2中的Ⅲ:1在研究區(qū)域內(nèi)發(fā)生了兩次重組交換,使最大致病基因所在區(qū)域大大縮窄,其中一次的重組位點(diǎn)有兩種可能:位于D16S3133~D16S3044之間,或位于D16S3136與D16S3140之間。而兩點(diǎn)連鎖分析、多點(diǎn)參數(shù)和非參數(shù)連鎖分析的結(jié)果均支持致病基因所在單倍型區(qū)域位于 D16S3133~D16S3044之間。
D16S3133~D16S3044區(qū)域 位于 16p12.1-q12.1,屬于EDK1位點(diǎn)。其Marshfield圖譜的遺傳圖距為11.52 cM,UCSC物理距離為22.7 Mb。該區(qū)域與已報道的PKD位點(diǎn)都有部分的重疊,但在16q端比目前已報道的位點(diǎn)[2,5-10,12-13]更靠近著絲粒(圖3)。該區(qū)域與1997年Szepetowski P等[11]報道的4個來自法國西北部的ICCA家系的致病基因所在區(qū)域D16S401~D16S517重疊。該4個家系的特點(diǎn)是:患者在3~12個月時出現(xiàn)無熱性嬰兒驚厥(infantile convulsion,IC),預(yù)后良好,使用抗驚厥藥后無復(fù)發(fā);其后多數(shù)在5~19歲出現(xiàn)發(fā)作性舞蹈手足徐動癥,家系中大部分患者同時具有嬰兒驚厥和發(fā)作性舞蹈手足徐動癥癥狀。本研究的結(jié)果支持了ICCA與PKD可能是同一致病基因的不同臨床表現(xiàn)的觀點(diǎn)。
由于PKD外顯不完全,在參數(shù)連鎖分析中,不同的外顯率會影響分析結(jié)果。本研究中攜帶有致病單倍型的個體共有21例,有PKD表型的只有15例,外顯率為71.4%。外顯率取0.7時,本研究的多點(diǎn)非參數(shù)連鎖分析的最大NPL值與多點(diǎn)參數(shù)連鎖分析的最大LOD值及所在區(qū)域基本吻合。故外顯率設(shè)置為0.7時,連鎖分析的結(jié)果更有參考意義。
PKD的發(fā)病被認(rèn)為有性別差異。在8個日本PKD家系中,男女患病率為2∶1,男女外顯率的比例分別為0.94和0.74[2]。本研究中男女患者數(shù)目相同,但女性癥狀多較男性為輕,輕者僅感覺突然運(yùn)動時一側(cè)肢體瞬間的不自主運(yùn)動。這表明,可能存在一個性別依賴的修飾因子影響PKD突變基因的敏感性[2]。
PKD的病因及發(fā)病機(jī)制至今不清楚。有些學(xué)者認(rèn)為PKD是一種反射性癲癇[19]。PKD家系中癲癇患病率明顯高于一般人群,有報道PKD合并癲癇的發(fā)生率為8%[20]。本研究的3個家系中有2例嬰幼兒起病的癲癇患者,都不合并PKD,但其中一人(家系3的Ⅲ:7)攜帶有PKD的致病單倍型。該結(jié)果提示,PKD可能與癲癇有共同的發(fā)病基礎(chǔ)。也有學(xué)者認(rèn)為PKD源于基底節(jié)功能障礙[21]。雖然這些爭論還在繼續(xù),但許多證據(jù)表明,PKD可能是一種離子通道?。?2]。而16號染色體性著絲粒區(qū)域有一基因簇編碼溶質(zhì)載體,包括 Na+/Cl-、K+/Cl-通道,Na+/H+和神經(jīng)遞質(zhì)通道,而且這些基因大多數(shù)位于ICCA及PKD區(qū)域。因此位于16號染色體著絲粒周圍區(qū)域編碼或控制離子通道功能的基因被認(rèn)為是PKD、ICCA和BFIC等候選基因[23]。目前已在一些 PKD家系中排除了部分候選基因[8,9,24],甚至在一例ICCA患者中發(fā)現(xiàn)位于 16p11.2的 0.6 Mb的微缺失[25]。PKD致病基因區(qū)域的進(jìn)一步縮窄、致病基因區(qū)域(尤其是16p11.2微缺失區(qū)域)其他基因的克隆及對其他候選基因的突變篩查,有望找到PKD的致病性突變。PKD致病基因及基因功能的闡明將解開PKD臨床癥狀復(fù)雜多樣及遺傳異質(zhì)性之謎。
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Mapping of the gene responsible for pure paroxysmal kinesigenic dyskinesia in three Chinese Han families.
CHEN Suqin,WANG Yiming,LI Xunhua,LIANG Xiuling,ZHOU Jueqian,F(xiàn)ANG Yingying.Department of Neurology,the First Affiliated Hospital,Sun Yat-Sen University,Guangzhou 510089,China.Tel:020-87755766.
Objective To map the gene responsible for pure paroxysmal kinesigenic dyskinesia in three Chinese Han families.Methods Fourteen microsatellite markers flanking 16p12.2-q22.3 were selected for genotyping in 37 family members.Parameter and non-parameter analysis were performed using Linkage and Genehunter softwares and haplotypes were constructed.Results A maximum two-lod score 2.97 at D16S3080 (θ=0) and 2.53 at D16S3068(θ=0)were obtained when penetrance set to 0.7.A maximum multi-lod score 2.75 and maximum NPL score 3.85(P=0.002) were obtained at D16S3068~D16S3131.Haplotype analysis localized PKD to the region D16S3133~D16S3044(16p12.1-q12.1).Conclusions The gene responsible for PKD in three Chinese Han families was mapped to 16p12.1-q12.1, which was the same as the original ICCA (infantile convulsions and paroxysmal choreoathetosis)region.
Paroxysmal kinesigenic dyskinesia Gene mapping Linkage analysis
R744
A
2010-10-09)
(責(zé)任編輯:李 立)
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