陳靈芝,王蘭蘭,魏兵強(qiáng)
茄子種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)的建立
陳靈芝,王蘭蘭,魏兵強(qiáng)
(甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所,甘肅蘭州,730070)
采用動(dòng)態(tài)web數(shù)據(jù)庫(kù)的策略,執(zhí)行瀏覽器/服務(wù)器(B/S)的體系結(jié)構(gòu),建立了基于Internet的甘肅茄子種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái),應(yīng)用數(shù)據(jù)庫(kù)查詢茄子種質(zhì)及相關(guān)性狀,有利于茄子種質(zhì)資源綜合評(píng)價(jià)和利用。
茄子;種質(zhì)資源;數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)
茄子品種資源研究是培育優(yōu)良茄子品種的基礎(chǔ),新品種選育成功的關(guān)鍵因素之一就是選擇親本,親本的選配有賴于育種者的學(xué)識(shí)和經(jīng)驗(yàn)以及育種者對(duì)茄子品種資源的綜合評(píng)價(jià)。從大量的茄子品種資源中選擇綜合性狀好、具有某種特殊性狀的資源并非易事,如果利用計(jì)算機(jī)查詢數(shù)據(jù),就能大大提高工作效率[1]。甘肅省農(nóng)科院蔬菜研究所長(zhǎng)期從事茄子新品種選育工作,在育種過(guò)程中,積累了一大批茄子種質(zhì)資源及其相關(guān)的農(nóng)藝、經(jīng)濟(jì)性狀數(shù)據(jù)。為了便于科學(xué)地積累和管理數(shù)據(jù),為茄子育種選配親本提供科學(xué)依據(jù),本研究編制了可用于貯存、管理和綜合查詢各種數(shù)據(jù)的甘肅茄子種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)。
茄子品種資源及各種性狀數(shù)據(jù)來(lái)自甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所收集、保存的茄子品種資源,包括甘肅農(nóng)家品種、各省市的茄子品種、育種中間材料和國(guó)外資源等。
2.1 數(shù)據(jù)庫(kù)總體設(shè)計(jì)方案
利用數(shù)據(jù)庫(kù)管理和應(yīng)用軟件開(kāi)發(fā)系統(tǒng),將甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所所收集的茄子資源歸類整理,建立由種質(zhì)資源數(shù)據(jù)管理、種質(zhì)資源數(shù)據(jù)檢索和種質(zhì)資源互聯(lián)網(wǎng)信息發(fā)布等模塊構(gòu)成的管理平臺(tái),以方便育種過(guò)程中的資源評(píng)價(jià)、篩選,加強(qiáng)相關(guān)育種單位的信息交流。
2.2 數(shù)據(jù)的采集和規(guī)范
在數(shù)據(jù)采集時(shí)根據(jù)茄子資源利用的基本要求,結(jié)合國(guó)家制定的自然科技資源平臺(tái)茄子種質(zhì)資源規(guī)范化標(biāo)準(zhǔn),對(duì)種質(zhì)資源進(jìn)行描述,以茄子種質(zhì)資源的收集、保存、鑒定、評(píng)價(jià)、研究利用為宗旨,實(shí)現(xiàn)茄子種質(zhì)資源的充分共享和可持續(xù)利用。名詞術(shù)語(yǔ)與國(guó)家或國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)保持一致,確保數(shù)據(jù)的規(guī)范性、嚴(yán)密性、科學(xué)性。
2.3 數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)表結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)
首先依據(jù)植物學(xué)分類,結(jié)合收集的資源情況,將茄子資源劃分為三大類,分別是:長(zhǎng)茄、圓茄、矮茄,如圖1。
每個(gè)類型的性狀描述共包括38個(gè)信息,分為4個(gè)部分。第1部分是基本信息,共9項(xiàng),包括統(tǒng)一編號(hào)、品種名稱、譯名、原產(chǎn)地、類型、選育單位、選育方法、選育親本、種子來(lái)源地,從這部分可以了解種質(zhì)資源的基本狀況;第2部分是性狀調(diào)查信息,共22項(xiàng),包括果形(扁圓、圓球、高圓、卵圓、長(zhǎng)卵、短筒、長(zhǎng)筒、長(zhǎng)條、線形)、果長(zhǎng)、果寬、單果質(zhì)量評(píng)價(jià)(大、中、?。⒐敚ò?、平、凸)、果面光澤(無(wú)、有)、商品果色(白、白綠、綠、橘紅、淺紫、鮮紫、紫紅、黑紫)、老熟果色(黃、紅)、果實(shí)彎曲度(U形、鐮刀形、蛇形、微彎、直)、果萼顏色(綠、綠紫、紫)、果肉色(白、黃白、綠白、綠)、花色(白、綠白、淺紫、紫)、主莖色(綠、淺紫、紫、深紫)、莖茸毛(有、無(wú))、葉色(黃綠、淺綠、綠、深綠)、葉形(卵圓、長(zhǎng)卵圓)、株型(直立、半直立、開(kāi)展)、株高、株幅、結(jié)果性(多、中、少)、熟性(早、中、晚)等。第3部分是抗性鑒定結(jié)果表,包括茄子黃萎病、綿疫病、菌核病、炭疽病、抗寒性、抗旱性等。第4部分是多媒體數(shù)據(jù)信息,包括照片等。
2.4 網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)的實(shí)現(xiàn)
遠(yuǎn)程數(shù)據(jù)訪問(wèn)采取動(dòng)態(tài)Web數(shù)據(jù)庫(kù)的策略,瀏覽器/服務(wù)器(B/S)體系結(jié)構(gòu),通過(guò)接口程序?yàn)橛脩籼峁┮环N格式統(tǒng)一、直觀高效、易學(xué)易用、功能完備的人機(jī)交互的圖形界面,使終端用戶無(wú)需安裝客戶端界面程序,在任何一個(gè)地方只要通過(guò)一個(gè)普通的瀏覽器軟件即可實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的訪問(wèn),進(jìn)行數(shù)據(jù)傳輸、檢索與查詢[2]。
①種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)的環(huán)境設(shè)計(jì) 選用ASP2.0做為平臺(tái)的主導(dǎo)設(shè)計(jì)語(yǔ)言,Access2003做為數(shù)據(jù)庫(kù)的支撐平臺(tái),網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)采用windows2003Server操作系統(tǒng),Internet Information Server5.1提供Web服務(wù),動(dòng)態(tài)網(wǎng)頁(yè)采用MacromediaDreamweaver MX創(chuàng)建ASP程序。
②種質(zhì)資源平臺(tái)的數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu) 利用Access2003軟件,將茄子資源的多種性狀集成在一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中,內(nèi)含多張數(shù)據(jù)表,這種數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)與以前的數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)相比,具有管理集中、維護(hù)方便、數(shù)據(jù)安全等特點(diǎn)。
查詢窗口由以上所列各信息組成,用戶可根據(jù)自己的需要選擇任一入口進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)的訪問(wèn),還可提供多條件的組合查詢,為選擇特定性狀的茄子種質(zhì)提供快速查詢手段,例如用戶想篩選:果長(zhǎng)≥35 cm,單果質(zhì)量≥60 g,果寬≥5 cm的品種,分別在對(duì)應(yīng)的性狀窗口中輸入查詢條件,如圖2,確認(rèn)后,系統(tǒng)就會(huì)給出查詢結(jié)果界面,如圖3。
圖1 數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)主界面
圖2 數(shù)據(jù)查詢界面
圖3 數(shù)據(jù)查詢結(jié)果輸出界面
3.1 存在的問(wèn)題
圖文并茂的數(shù)據(jù)資料可以大大豐富記錄內(nèi)容,也可給人提供最直觀的視覺(jué)效果,育種者結(jié)合田間記載資料,可進(jìn)一步對(duì)材料做出正確客觀的評(píng)價(jià),但由于資料的采集、數(shù)據(jù)錄入是一項(xiàng)費(fèi)時(shí)費(fèi)力的工作,常受經(jīng)費(fèi)、人員等條件限制。另外,建設(shè)種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù),是為了更好地利用種質(zhì)資源,因此,一方面要加強(qiáng)現(xiàn)有種質(zhì)資源的利用,以現(xiàn)有資源為材料,進(jìn)行種質(zhì)創(chuàng)新和新品種選育。另一方面,要不斷豐富種質(zhì)資源庫(kù)和種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù),從而更好地為新品種選育服務(wù)[3]。
3.2 數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)應(yīng)用前景
傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)信息只能以紙介方式管理,查詢檢索時(shí)只能逐頁(yè)、逐行查找[4],極不適應(yīng)育種、生產(chǎn)者對(duì)種質(zhì)信息的獲取和研究需求,種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)促進(jìn)了茄子種質(zhì)信息的共享,擴(kuò)大了信息交流范圍,提高了茄子種質(zhì)的利用效率,在充分發(fā)揮品種資源數(shù)據(jù)信息優(yōu)勢(shì)的基礎(chǔ)上,可更好地為育種工作者和生產(chǎn)部門服務(wù)。
[1]唐榮華,高國(guó)慶.花生種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)建立及應(yīng)用研究[J].中國(guó)油料作物學(xué)報(bào),2001(23):70-72.
[2]郭衛(wèi),王明霞.基于 Internet的蔬菜栽培專家系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)[J].河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2003(26):283-284.
[3]易懋升,黎揚(yáng)輝.紅掌種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)的建立[J].廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),2005(1):8-11.
[4]陳偉英,王曉娟.甘肅省農(nóng)作物種質(zhì)資源數(shù)據(jù)庫(kù)及查詢系統(tǒng)的建立[J].甘肅農(nóng)業(yè)科技,2003(4):22-24.
Establishment of Database of Eggplant Germ Plasm Resource
CHEN Lingzhi,WANG Lanlan,WEI Bingqiang
(Institute of Vegetables,Gansu Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730070)
Use the strategy of dynamic web-database and perform the architecture of Browser/server(B/S)to develop the database platform on eggplant germplasm based on internet technologies.It is favourable to utilize the database for management and comprehesive evaluation of eggplant germplasm.
Eggplant;Germ plasm resource;Database
10.3865/j.issn.1001-3547.2010.10.004
陳靈芝,女,副研究員,主要從事辣椒、茄子育種及栽培工作,電話:0931-7616788,E-mail:gschlzh38@sina.com
王蘭蘭,通信作者,研究員,碩導(dǎo),主要從事辣椒育種及栽培工作
2010-01-06