基因組研究

科學(xué)院北京基因組研究所宋述慧研究員和鮑一明研究員受邀在國際學(xué)術(shù)期刊The Innovation在線發(fā)表題為“MPoxVR - A comprehensive genomic resource for monkeypox virus variants surveillance”的評論文章，系統(tǒng)比較并介紹了猴痘病毒信息庫MPoxVR的數(shù)據(jù)資源及特色功能。1970年在剛果民主共和國發(fā)現(xiàn)首例猴痘病毒感染者以來，猴痘疫情先后多次在中西非國家爆發(fā)。自2022年5月至今

量學(xué)的煙草基因組研究知識(shí)圖譜分析張玉嬋1，田嘉樹1，王曉麗2，景藝卓1，黃五星1，韓丹1*，許自成11河南農(nóng)業(yè)大學(xué)煙草學(xué)院，河南鄭州 450002；2湖北省煙草公司襄陽市公司，湖北襄陽 441003【目的】明確煙草基因組領(lǐng)域研究現(xiàn)狀、發(fā)展歷程、重點(diǎn)前沿及未來研究的方向?！痉椒ā窟\(yùn)用文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)，結(jié)合CiteSpace文獻(xiàn)可視化軟件，對中國知網(wǎng)（CNKI）和Web of Science兩個(gè)數(shù)據(jù)庫中的煙草基因組研究文獻(xiàn)進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘?！窘Y(jié)果】（1）近年來關(guān)于煙草基

科學(xué)院北京基因組研究所（國家生物信息中心）慈維敏團(tuán)隊(duì)和北京大學(xué)第三醫(yī)院泌尿外科馬潞林團(tuán)隊(duì)合作，解析腫瘤組織和配對癌栓組織的腫瘤生態(tài)系統(tǒng)。該研究通過全景式地刻畫腎透明細(xì)胞癌原發(fā)腫瘤和癌栓的腫瘤微環(huán)境差異，為進(jìn)展期腎癌治療和縮減癌栓提供潛在的治療通路及靶點(diǎn)。該研究還發(fā)現(xiàn)組織駐留型CD8+T細(xì)胞可作為潛在腎癌免疫治療標(biāo)記物，進(jìn)一步為腎癌和癌栓免疫治療提供理論依據(jù)。相關(guān)研究成果以“Decoding the multicellular ecosystem of ve

。至此，古基因組研究新紀(jì)元正式開啟。目前，古基因組數(shù)據(jù)已有六千余個(gè)，但這些數(shù)據(jù)也只能讓我們初步了解人類演化史。受限于保存狀況，目前大部分古基因組數(shù)據(jù)來源于寒冷干燥的地區(qū)，而亞洲南方、非洲、美洲、大洋洲等地區(qū)的古基因組數(shù)據(jù)還較為有限，這個(gè)問題在“年齡”超過三萬年的個(gè)體基因組上尤為突出。因此，未來古DNA領(lǐng)域可以著重對這些地區(qū)進(jìn)行一些有針對性的研究。（Science, 2021, 373(6562)）古基因組數(shù)量

印第安人的基因組研究表明，事實(shí)確實(shí)如此。7月8日，《自然》發(fā)表的一項(xiàng)研究提出了新證據(jù)，證明美洲與波利尼西亞東部在史前時(shí)代即有航海接觸。對現(xiàn)代和古代個(gè)體的遺傳數(shù)據(jù)分析，闡明了波利尼西亞的歷史，幫助解決了一個(gè)長期懸而未決的爭論：美洲原住民對于波利尼西亞人有何影響。在這項(xiàng)研究中，墨西哥生物多樣性基因組學(xué)國家實(shí)驗(yàn)室的Andrés Moreno-Estrada、Alexander Ioannidis和同事分析了800多名波利尼西亞人和美洲原住民的基因組，并推斷二者應(yīng)

和深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所在The Plant Cell 在線發(fā)表了一篇題為“Genetic regulation of ethylene dosage for cucumber fruit elongation”的研究論文，揭示了乙烯劑量依賴的黃瓜果實(shí)伸長的遺傳和分子機(jī)制。在這項(xiàng)研究中，研究人員以2個(gè)黃瓜短瓜材料（sf1突變體和acs2 突變體）為對象，研究了乙烯劑量精細(xì)調(diào)控黃瓜果實(shí)伸長的分子機(jī)制。sf1突變體表現(xiàn)為果實(shí)細(xì)胞分裂減弱并且產(chǎn)生過量乙烯，acs2

發(fā)顏色的全基因組研究，由中國科學(xué)院、倫敦國王學(xué)院、荷蘭伊拉斯姆斯大學(xué)聯(lián)合其他國家的研究人員合作進(jìn)行?？茖W(xué)家通過問卷和專家評估結(jié)合的方式，精確量化了近30萬人的頭發(fā)顏色狀況，并分析了800多萬個(gè)遺傳位點(diǎn)和頭發(fā)顏色的關(guān)系，最終新發(fā)現(xiàn)超過100個(gè)新的遺傳位點(diǎn)和頭發(fā)顏色存在顯著關(guān)聯(lián)。該研究的共同第一作者、中科院北京基因組研究所的劉凡研究員說，此發(fā)現(xiàn)深入解析了頭發(fā)顏色的遺傳力，揭開人類色素表型表達(dá)變異的分子基礎(chǔ)。基于新發(fā)現(xiàn)位點(diǎn)的人類頭發(fā)顏色預(yù)測有更高的準(zhǔn)確性，在法醫(yī)

華大公司的基因組研究所培育出了一種微型豬。它們由小品種的巴馬豬基因改造而來，體重15公斤，與中型犬差不多大，一開始它們是作為人體疾病的動(dòng)物模型而培育的。專家預(yù)計(jì)這些微型豬的售價(jià)每頭最少要1萬元。為了培育這種微型的巴馬豬，科學(xué)家通過干擾基因生長因子的表達(dá)克隆出公豬，再將之與母豬進(jìn)行交配。相比之下，原來的巴馬豬重量在35～50公斤之間，而家養(yǎng)的豬體重一般都超過110公斤。在不久的將來，通過基因編輯技術(shù)，購買微型豬的消費(fèi)者或許還能選擇不同的膚色和樣式。（資料來源

中科院北京基因組研究所楊猛團(tuán)隊(duì)歷時(shí)5年攻關(guān)，破譯了橡膠樹全基因組，發(fā)現(xiàn)了一個(gè)可能促使橡膠樹進(jìn)化出高產(chǎn)膠特性的基因組，并提出了乙烯刺激增產(chǎn)機(jī)制的新觀點(diǎn)。2016年5月23日國際植物學(xué)頂級期刊《Nature Plants》（《自然-植物》）在線發(fā)表了唐朝榮團(tuán)隊(duì)的研究成果。2016年6月2日出版的最新一期《Nature》（《自然》）雜志在研究亮點(diǎn)欄目中也介紹了該研究成果，體現(xiàn)了國際學(xué)術(shù)權(quán)威對該項(xiàng)成果的關(guān)注。唐朝榮博士表示，橡膠樹產(chǎn)膠潛力的發(fā)掘空間很大，即使是產(chǎn)量

院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所、中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育研究所以及英國《自然·遺傳學(xué)》雜志等單位共同主辦，國內(nèi)外300多名知名學(xué)者圍繞農(nóng)業(yè)基因組學(xué)、種子資源與育種等展開學(xué)術(shù)交流。中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所所長錢前研究員介紹說，我國已經(jīng)完成水稻、小麥、玉米及黃瓜等大概70%～80%重要的作物基因組測序完成，初步掌握了這些作物遺傳基因的功能性狀，研究水平已走在國際前列。

院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所、中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育研究所以及英國《自然·遺傳學(xué)》雜志等單位共同主辦，國內(nèi)外300多名知名學(xué)者圍繞農(nóng)業(yè)基因組學(xué)、種子資源與育種等展開學(xué)術(shù)交流。中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所所長錢前研究員介紹說，我國已經(jīng)把水稻、小麥、玉米以及黃瓜等大概70%～80%重要的作物基因組測序完成，初步掌握了這些作物遺傳基因的功能性狀，研究水平已走在國際前列。

會(huì) ——以基因組研究為例對于中國來說非常重要的一點(diǎn)就是注重發(fā)展基礎(chǔ)科學(xué)，而不是一味地強(qiáng)調(diào)應(yīng)用科學(xué)。如果中國有強(qiáng)大的基礎(chǔ)科學(xué)研究，那么中國就有無窮的潛力?；A(chǔ)科學(xué)的重要性不言而喻，比如生物基礎(chǔ)科學(xué)可以讓人們清楚人類疾病發(fā)生的基因原因。基因組研究僅僅剛開始，我們還需要研究基因組與整個(gè)生理學(xué)的關(guān)系，這需要數(shù)年時(shí)間，是基因組研究的一個(gè)好機(jī)會(huì)。讓我驚訝的是，其他國家的政府，比如美國、歐洲并沒有意識(shí)到我們所面臨的巨大機(jī)會(huì)。幸運(yùn)的是中國正在逐漸加大對基礎(chǔ)科學(xué)的研究投入，

共同啟動(dòng)驢基因組研究項(xiàng)目。該研究將繪制驢基因組精細(xì)圖譜，從分子水平上解碼阿膠特殊藥效的成因，鑒定出影響驢皮、肉、奶、生長速度、繁殖力等性狀的DNA標(biāo)記，通過基因測序培育優(yōu)質(zhì)毛驢。啟動(dòng)大會(huì)上，東阿阿膠與山東省農(nóng)科院、華大基因三方簽訂了“驢基因組研究協(xié)議”。自2002年起，東阿阿膠先后在新疆、內(nèi)蒙古、甘肅等地陸續(xù)建立了20個(gè)毛驢藥材養(yǎng)殖示范基地，今年8月，又會(huì)同26家單位成立了“國家驢產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟”。目前，位于東北的百萬頭毛驢養(yǎng)殖項(xiàng)目也已初步啟動(dòng)。

澳大利亞的基因組研究機(jī)構(gòu)■劉晴近日，受到基因組數(shù)據(jù)集持續(xù)高速增長的驅(qū)動(dòng)，澳大利亞基因組研究機(jī)構(gòu)正在它的整個(gè)網(wǎng)絡(luò)中部署一個(gè)高性能的博科10GbE核心網(wǎng)絡(luò)，其中墨爾本節(jié)點(diǎn)將率先采用新的博科交換基礎(chǔ)架構(gòu)。澳大利亞非營利組織——基因組研究機(jī)構(gòu)（AGRF）是澳大利亞最大的基因組服務(wù)提供者，在布里斯班、悉尼、墨爾本、阿德萊德和珀斯都設(shè)有實(shí)驗(yàn)室，每個(gè)實(shí)驗(yàn)室為全國性的先進(jìn)設(shè)備、技術(shù)和專業(yè)知識(shí)網(wǎng)絡(luò)提供一個(gè)網(wǎng)關(guān)。AGRF利用尖端技術(shù)，為學(xué)術(shù)、應(yīng)用研究和商業(yè)市場提供合約制的基因

中國微生物基因組研究作者：喻子牛，邵宗澤，孫明ISBN：9787030357236定價(jià)：190開本：16裝幀：平裝頁碼：692初版時(shí)間：2012-10-1專業(yè)分類：微生物學(xué)讀者對象：《中國微生物基因組研究》內(nèi)容屬微生物學(xué)科前沿領(lǐng)域，可供從事醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、工業(yè)、環(huán)境、生態(tài)、動(dòng)物醫(yī)學(xué)、植物病原微生物研究的研究人員、教師和研究生參考。內(nèi)容介紹《中國微生物基因組研究》由我國從事微生物基因組研究的專家們結(jié)合自己的研究領(lǐng)域撰寫的綜述論文組成，反映了我國微生物基因組研究的

科學(xué)院北京基因組研究所孫英麗研究員。孫英麗，中國科學(xué)院北京基因組研究所“百人計(jì)劃”研究員、博士生導(dǎo)師，研究方向包括癌癥表觀基因組和癌癥基因組的研究、腫瘤細(xì)胞中表觀遺傳調(diào)控和DNA通路損傷修復(fù)通路的關(guān)系研究、針對腫瘤細(xì)胞特異表觀遺傳調(diào)控的藥物設(shè)計(jì)和篩選、針對腫瘤細(xì)胞DNA通路的藥物設(shè)計(jì)和篩選。2000年獲得北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士學(xué)位之后，她先后在麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院從事博士后研究和講師工作，進(jìn)行腫瘤與細(xì)胞凋亡、DNA損傷修復(fù)的研究。2010年回國后

成的“番茄基因組研究國際協(xié)作組”，經(jīng)過8年多的艱苦努力，完成了對栽培番茄全基因組的精細(xì)序列分析。該成果于2012年5月31日以封面文章發(fā)表在國際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《自然（Nature）》上。茄科植物包含了世界上最多最重要的蔬菜作物，在世界農(nóng)業(yè)中的地位僅次于禾本科和豆科，選擇代表蔬菜和水果果實(shí)發(fā)育和成熟過程的模式植物并對其基因組進(jìn)行精細(xì)序列分析是我國乃至世界農(nóng)業(yè)的迫切需求。而番茄作為茄科植物的代表，是研究果實(shí)發(fā)育和成熟過程的經(jīng)典模式植物。此次科學(xué)家通過國際合作獲得

00個(gè)番茄基因組研究計(jì)劃”，這是中荷科學(xué)家在基因組學(xué)領(lǐng)域攜手合作的又一重要研究項(xiàng)目，該項(xiàng)目將由來自中國和荷蘭的多家科研機(jī)構(gòu)或企業(yè)共同完成。該研究項(xiàng)目計(jì)劃用1年的時(shí)間完成100個(gè)番茄基因組的測序和組裝工作，并基于測序所獲得的大量的數(shù)據(jù)進(jìn)行信息分析和深度挖掘，解析番茄基因組序列，為培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗病蟲害等優(yōu)良性狀的新品種奠定堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。據(jù)了解，該項(xiàng)目預(yù)計(jì)花費(fèi)100萬歐元并于2011年5月中旬正式啟動(dòng)。簽約儀式上，雙方還就100個(gè)番茄基因組學(xué)研究與市場轉(zhuǎn)化、植

度國家植物基因組研究所培育出一種轉(zhuǎn)基因土豆，其蛋白質(zhì)和氨基酸含量均明顯高于普通土豆。莧菜是一種種子很小的闊葉植物，AMA1（Amaranth Albumin 1）可以使莧菜及其種子富含蛋白質(zhì)以及幾種基本氨基酸。研究人員將AMA1基因植入幾種土豆的基因組中，終于在兩年后培育出一種富含蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)基因土豆。由于莧菜屬于可食用植物，該種轉(zhuǎn)基因土豆可能相對容易被人體接受，其蛋白質(zhì)含量比普通土豆高35%～60%，賴氨酸、酪氨酸以及硫的含量也有顯著提高。研究人員用轉(zhuǎn)基因

中科院北京基因組研究所與浪潮宣布,為加速我國基因科學(xué)研究的進(jìn)程,他們將共同研制國產(chǎn)第三代基因測序儀,預(yù)計(jì)3年內(nèi)問世。這一重大裝備的成功研制,不僅將填補(bǔ)我國在基因測序基礎(chǔ)裝備領(lǐng)域的空白,同時(shí)也將使國內(nèi)生命科學(xué)研究機(jī)構(gòu)能夠獲得低成本、高效率的測序工具,加速我國基因戰(zhàn)略的發(fā)展。據(jù)介紹,第三代基因測序儀,將由中科院北京基因組研究所與浪潮“高效能服務(wù)器和存儲(chǔ)技術(shù)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”成立的“中科院北京基因組所-浪潮基因組科學(xué)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室”聯(lián)合各領(lǐng)域科研力量承擔(dān)研發(fā)工作。當(dāng)前

獻(xiàn)的第三大基因組研究成果。這也是迄今為止我國科學(xué)家利用霰彈法測序完成的最大的生物種基因組，共注釋獲得了16948個(gè)完整基因，7285個(gè)基因片斷。根據(jù)生物信息學(xué)的分析推斷，家蠶約有兩萬個(gè)基因，其中約6000個(gè)基因?yàn)樾掳l(fā)現(xiàn)。家蠶全基因組有4億5千萬個(gè)堿基對，約為人類全基因組的七分之一，略大于水稻基因組，但科研人員僅用了5個(gè)多月的時(shí)間就完成了從cDNA文庫構(gòu)建到測序和組裝“框架圖”的所有工作，創(chuàng)下了基因組研究的最快紀(jì)錄，并且優(yōu)化了基因組測序技術(shù)，大幅度降低了研究