網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在中藥研究中的應(yīng)用現(xiàn)狀與思考

謝曉 劉敏 楊敏 劉錢(qián) 田佩靈 曾珊 劉濤

收稿日期：2023-04-14

基金項(xiàng)目：四川省2021—2023年高等教育人才培養(yǎng)質(zhì)量和教學(xué)改革項(xiàng)目（JG20211106）；成都大學(xué)2021—2023年研究生人才培養(yǎng)質(zhì)量和教學(xué)改革項(xiàng)目（cdjgy2022004 ）

作者簡(jiǎn)介：謝曉（2002—），女，從事中藥新藥開(kāi)發(fā)及質(zhì)量再評(píng)價(jià)研究.Email：2941207759@qq.com

通信作者：劉濤（1976—），男，博士，研究員級(jí)高級(jí)工程師，從事中藥再評(píng)價(jià)研究.Email：liutao0578@sina.com劉敏（1981—），女，從事藥物再評(píng)價(jià)研究.Email：752544391@qq.com

摘要：網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)是對(duì)中藥多個(gè)“成分—靶點(diǎn)—通路”進(jìn)行分析，從而預(yù)測(cè)毒性成分和探究毒性機(jī)制的方法.近年來(lái)，網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)應(yīng)用廣泛，對(duì)其研究方法和應(yīng)用現(xiàn)狀進(jìn)行綜述，并對(duì)其面臨的問(wèn)題進(jìn)行討論，以期為網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在中藥中的進(jìn)一步應(yīng)用提供參考.

關(guān)鍵詞：網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)；中藥；應(yīng)用；毒性機(jī)制；毒性成分

中圖分類號(hào)：R285

文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A

0引言

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)可用于中藥毒性成分的預(yù)測(cè)和毒性機(jī)制的探究.網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的提出標(biāo)志著中醫(yī)藥方面的研究在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的基礎(chǔ)上已向生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)等多個(gè)學(xué)科層面邁進(jìn)，促進(jìn)了中醫(yī)藥的發(fā)展.本文以中國(guó)知網(wǎng)、維普資訊和ScienceDirect online數(shù)據(jù)庫(kù)的文獻(xiàn)為基礎(chǔ)，主要對(duì)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在中藥領(lǐng)域的研究方法和應(yīng)用現(xiàn)狀進(jìn)行綜述，擬為認(rèn)識(shí)學(xué)習(xí)和深入研究網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)提供參考依據(jù).

1網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)簡(jiǎn)介

1.1基本定義

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)是一種源于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)，可以對(duì)藥物進(jìn)行多個(gè)“毒性成分—靶點(diǎn)—通路”分析，從而初步揭示藥物毒性機(jī)制的研究技術(shù)，是一種結(jié)合生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)等學(xué)科建立毒性預(yù)測(cè)評(píng)價(jià)模型，初步闡釋毒理性質(zhì)的重要方法［1］.網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)和網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)概念的提出及其相關(guān)領(lǐng)域的研究為網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的發(fā)展提供了全新的思路.為提高中藥的安全性，將網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的“疾病（藥物治療對(duì)象）—基因—疾病靶點(diǎn)—藥物”相互作用網(wǎng)絡(luò)衍生為“毒性（副作用）—基因—毒性靶點(diǎn)—藥物”相互作用網(wǎng)絡(luò)，藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)轉(zhuǎn)變?yōu)槎纠韺W(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)，關(guān)鍵詞從某種“疾病”變成了某種“毒性（副作用）”，從而產(chǎn)生了網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)這一毒理學(xué)分析模型［2］.網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)具有研究成本低、臨床試驗(yàn)成功率高和毒副作用低等特點(diǎn)，可用其解釋中醫(yī)藥的內(nèi)涵，為中醫(yī)藥的現(xiàn)代化發(fā)展做出一定貢獻(xiàn)［3］.網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)技術(shù)主要運(yùn)用了分子相互作用技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)可視化技術(shù)和高通量/高內(nèi)涵技術(shù)等［4-5］，其發(fā)展與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和免疫組學(xué)等息息相關(guān).

1.2常用研究工具

應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)時(shí)離不開(kāi)各種數(shù)據(jù)庫(kù)、軟件和平臺(tái).網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)常用的研究工具見(jiàn)表1，研究人員應(yīng)根據(jù)其研究?jī)?nèi)容的深度和廣度選擇較為合適的數(shù)據(jù)庫(kù).另外，進(jìn)行毒性預(yù)測(cè)的TOPKAT、Hazard Expert和DEREK等軟件，以及化合物致癌毒性預(yù)測(cè)系統(tǒng)（PSCT）等也是研究人員常用的毒性預(yù)測(cè)工具［4-6］.

1.3研究思路與方法

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)是基于成分、基因、蛋白和通路構(gòu)建的用于尋找單味中藥或方劑中的有毒成分，并闡述有毒單味中藥或方劑的毒性機(jī)制，以及詮釋中藥配伍禁忌的內(nèi)涵等的方法［2］.網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的研究流程主要通過(guò)收集化學(xué)成分、候選毒性化合物、候選化合物靶點(diǎn)與疾病靶點(diǎn)，構(gòu)建“成分—靶點(diǎn)—通路”網(wǎng)絡(luò)，并進(jìn)行GO和KEGG分析.值得一提的是，目前尚未有研究表明網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)具有特有的毒理學(xué)靶點(diǎn).一方面，疾病和毒性（副作用）的靶點(diǎn)會(huì)有重合現(xiàn)象，不同毒性成分對(duì)應(yīng)的基因有重疊，而不同基因?qū)?yīng)的靶點(diǎn)也可能相同，這與不同數(shù)據(jù)庫(kù)的分析方法有差異相關(guān)；另一方面，因?yàn)橹兴幍某煞纸M成較為復(fù)雜，且有效成分的臨床使用與量效有密切關(guān)系，在兩種不同的藥材中同一種成分可能一個(gè)起到治療作用，而另一個(gè)會(huì)產(chǎn)生毒性反應(yīng).簡(jiǎn)而言之，靶點(diǎn)是網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)二者通用的，根據(jù)不同數(shù)據(jù)庫(kù)、篩選條件和分析目的的選擇可得到相應(yīng)的結(jié)果［2-3］.

1.3.1中藥成分收集

中藥富含多種成分，根據(jù)某些毒性反應(yīng)（副作用）相關(guān)的毒性化合物結(jié)構(gòu)的相似性可構(gòu)建“化合物—化合物”網(wǎng)絡(luò)，再加入結(jié)構(gòu)明確的中藥成分進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)分析，與已知毒性化合物處于同一組的則為潛在毒性化合物.常用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)查詢出中藥的所有成分，再以生物利用度OB≥30%及類藥性DL≥0.18的標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行進(jìn)一步篩選與該中藥相關(guān)度較高的化合物［10］，建立“藥材—成分”數(shù)據(jù)庫(kù).其次，利用毒理基因組學(xué)CTD數(shù)據(jù)庫(kù)以“毒性名稱”作為關(guān)鍵詞對(duì)TCMSP得出的成分進(jìn)行毒性查詢，篩選得到候選毒性化合物.

1.3.2毒性靶點(diǎn)篩選

在得到毒性靶點(diǎn)的過(guò)程中，可根據(jù)實(shí)際情況選擇不同的篩選方法.當(dāng)通過(guò)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)探究中藥的毒性及其機(jī)制時(shí)，可采用PubChem數(shù)據(jù)庫(kù)查詢候選毒性成分的代謝物結(jié)構(gòu)，將其作為關(guān)鍵詞在Swiss TargetPrediction數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行搜索，選定物種，得到靶點(diǎn)蛋白和Uniprot ID，以靶點(diǎn)蛋白名稱為關(guān)鍵詞在Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索得到靶點(diǎn)基因［15］.另外，Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)完整性還有待提高，在搜索不到靶點(diǎn)基因時(shí)，可結(jié)合PharmMapper數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行補(bǔ)充完善.在探究中藥某一特定的毒性類型或疾病類型時(shí)，可直接以疾病名稱為關(guān)鍵詞在GeneCards或CTD數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行搜索，根據(jù)相關(guān)性得分選取大于中位數(shù)的毒性靶點(diǎn)［11］.

1.3.3構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)

當(dāng)通過(guò)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)探究中藥的毒性及其機(jī)制時(shí)，可利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)建立“成分—靶點(diǎn)蛋白”互作網(wǎng)絡(luò)，限定物種為人，得到蛋白互作網(wǎng)絡(luò)；而在探究中藥某一特定的毒性類型或疾病類型時(shí)，可先用Venny網(wǎng)站獲取候選毒性成分與疾病的交集靶點(diǎn)，再導(dǎo)入STRING中得到“靶點(diǎn)—靶點(diǎn)”互作網(wǎng)絡(luò).

1.3.4GO和KEGG分析

利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)交集基因進(jìn)行GO 分類富集分析.分別選擇分子功能、生物學(xué)過(guò)程和細(xì)胞組分分析靠前的結(jié)果.使用DAVID工具進(jìn)行KEGG通路富集分析，使用Omicshare 數(shù)據(jù)庫(kù)將篩選出的KEGG通路信息繪制成氣泡圖，并將所得到的通路均用GraphPad Prism 6.0 繪制柱狀圖［11］.

1.3.5數(shù)據(jù)可視化

將上述獲得的成分、靶點(diǎn)和通路信息導(dǎo)入Cytoscape3.6.0進(jìn)行可視化分析，并獲取網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)，根據(jù)Degree值，選取大于中位數(shù)或大于中位數(shù)2倍的數(shù)值作為關(guān)鍵毒性成分、靶點(diǎn)和通路.

1.3.6數(shù)據(jù)分析

根據(jù)構(gòu)建的“成分—靶點(diǎn)—通路”對(duì)中藥的毒性機(jī)制或中藥配伍內(nèi)涵等進(jìn)行闡釋.

2應(yīng)用現(xiàn)狀

中藥一直被認(rèn)為毒副作用少，療效好，但近年來(lái)相關(guān)報(bào)道發(fā)現(xiàn)，中藥無(wú)論是單用、配伍或是復(fù)方使用都可能對(duì)心臟、肝臟和腎臟等產(chǎn)生一定的毒性［1］，網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的出現(xiàn)對(duì)中藥產(chǎn)生的毒性機(jī)制可進(jìn)行初步闡釋.

2.1在單味中藥中的應(yīng)用

中藥的作用機(jī)制具有多靶點(diǎn)的特點(diǎn)，對(duì)其進(jìn)行毒理機(jī)制研究較困難，而網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的出現(xiàn)解決了這一難題.目前，網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在對(duì)單味中藥的毒性成分篩選，以及單味中藥對(duì)肝臟、心臟和腎臟等毒性機(jī)制探究方面有著廣泛的應(yīng)用.

僅用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)對(duì)單味中藥進(jìn)行探究，研究方法較為單一，數(shù)據(jù)可信度較低，但可初步解釋毒性機(jī)制.例如，李潔等［16-17］篩選出魚(yú)腥草6種毒性成分，表明魚(yú)腥草可能是通過(guò)多信號(hào)通路引發(fā)過(guò)敏反應(yīng)、抑制中樞神經(jīng)系統(tǒng)和影響細(xì)胞凋亡等產(chǎn)生毒性，大黃主要通過(guò)影響鈣離子通道和細(xì)胞凋亡產(chǎn)生毒性.另外，梁雨璐等［11］通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)合歡皮抗焦慮機(jī)制與網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)對(duì)合歡皮產(chǎn)生腎毒性機(jī)制的研究表明，合歡皮的治療機(jī)制與毒性機(jī)制相差較大，提出減少毒性成分皂苷類化合物的同時(shí)，最大限度地保留木脂素類化合物的臨床應(yīng)用思路，以此減少合歡皮的腎毒性，又可以保證其抗焦慮藥效.基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的整合研究，衛(wèi)博文等［18］發(fā)現(xiàn)，雷公藤其毒/效機(jī)制高度一致，發(fā)揮藥效和毒性的成分和靶點(diǎn)都較一致，表明雷公藤既可治療免疫性肝臟損傷也可以產(chǎn)生一定的肝臟毒性，該研究充分闡釋了中藥中“有故無(wú)殞”的內(nèi)涵.

隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)結(jié)合多種技術(shù)如分子對(duì)接、動(dòng)物實(shí)驗(yàn)、代謝組學(xué)、基因轉(zhuǎn)錄組學(xué)、免疫組學(xué)和細(xì)胞實(shí)驗(yàn)等技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證，可以更加準(zhǔn)確地闡釋中藥毒性機(jī)制，又可以評(píng)估網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的預(yù)測(cè)水平.

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)與分子對(duì)接技術(shù)結(jié)合可很好地驗(yàn)證中藥毒性成分與毒性靶點(diǎn)的結(jié)合活性和相互作用能力，提高數(shù)據(jù)的可信等級(jí).例如，郭小紅等［19］基于網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)中的admetSAR 2.0平臺(tái)預(yù)測(cè)鬧羊花中二萜類化合物的毒性，且毒性等級(jí)為“Ⅲ”級(jí)的有11個(gè)，證明毒性成分的官能團(tuán)是鬧羊花毒性大小的決定性因素，并結(jié)合長(zhǎng)期毒性試驗(yàn)和代謝組學(xué)研究表明，鬧羊花對(duì)肝臟、心臟和神經(jīng)有較大的毒性，也與相關(guān)報(bào)道相符，進(jìn)一步驗(yàn)證網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的準(zhǔn)確高效性.此外，楊雪等［20］基于虛擬策略的網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)方法，初步篩選出商陸皂苷甲為商陸中潛在的腎臟毒性成分，并用蛋白質(zhì)印跡法和整體動(dòng)物酶聯(lián)免疫吸附劑測(cè)定法初步預(yù)測(cè)其誘導(dǎo)大鼠腎臟毒性的產(chǎn)生與NFκB信號(hào)、磷酸化IκBα靶蛋白、下游炎癥因子TNFα和IL1β密切相關(guān).孔嬌等［21］針對(duì)八角蓮醇提液所致的肝臟毒性提出“量—權(quán)—證”的研究思路，首次將含量納入網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)靶點(diǎn)篩選，預(yù)測(cè)出的八角蓮肝臟毒性成分更準(zhǔn)確，并且發(fā)現(xiàn)八角蓮對(duì)肝臟細(xì)胞沒(méi)有損傷，主要通過(guò)調(diào)控氧化應(yīng)激、細(xì)胞凋亡和炎癥反應(yīng)對(duì)肝組織有一定程度的損傷.

對(duì)利用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)探究單味中藥毒性機(jī)制較為明確的20余篇文獻(xiàn)進(jìn)行分析，研究結(jié)果見(jiàn)表2，可以發(fā)現(xiàn)，中藥產(chǎn)生的毒性主要是肝臟毒性，而表中的幾種毒性機(jī)制主要集中在調(diào)控氧化應(yīng)激、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡（又稱程序性死亡）的過(guò)程中.肝臟是機(jī)體代謝的主要場(chǎng)所，在藥物的臨床使用中出現(xiàn)肝臟毒性的比率較其他毒性較大.因此，肝臟毒性需引起重視，如何更好地完善肝毒性的評(píng)價(jià)體系是中藥研究中面臨的難題.故可對(duì)上述出現(xiàn)頻率較高的機(jī)制進(jìn)行“對(duì)癥下藥”，減少藥物的毒性.此外，只有少數(shù)研究采用體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)對(duì)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)分析結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證，因此，可考慮建立應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)時(shí)結(jié)合體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的最低標(biāo)準(zhǔn)，以保證研究結(jié)果的質(zhì)量.

2.2在中藥配伍中的應(yīng)用

目前，網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在中藥配伍中的應(yīng)用主要是闡述機(jī)制，為揭示中藥配伍禁忌起到參考作用.淫羊藿和補(bǔ)骨脂2味藥單用已被證實(shí)有一定的肝臟毒性，有研究發(fā)現(xiàn)，二者的聯(lián)用會(huì)加重肝臟毒性，如壯骨關(guān)節(jié)丸和仙靈骨葆膠囊.淫羊藿和補(bǔ)骨脂除了自身的多個(gè)成分具有肝臟毒性外，還通過(guò)NLRP3炎癥小體為聯(lián)系紐帶，以自身活性成分協(xié)同毒性成分誘發(fā)NLRP3炎癥小體持續(xù)活化.此外，時(shí)瀟麗等［37］發(fā)現(xiàn)，補(bǔ)骨脂和淫羊藿配伍毒性加劇的機(jī)制是通過(guò)關(guān)鍵毒性成分與核心靶點(diǎn)相互作用與肝臟細(xì)胞中部分蛋白氧化磷酸化及相互結(jié)合等.

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的應(yīng)用可解釋中藥配伍減少藥物毒性的原因.研究發(fā)現(xiàn)，結(jié)合網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)和藥物動(dòng)力學(xué)得到淫羊藿的毒性成分以黃酮類化合物為主，而淫羊藿和女貞子配伍能夠顯著減少淫羊藿中5種黃酮類成分在體內(nèi)的富集，可減少其毒性［30］.柴胡中的毒性成分為柴胡皂苷和揮發(fā)油，柴胡與甘草、白芍、當(dāng)歸和黃芩的關(guān)聯(lián)程度較高，通過(guò)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)得出共有的肝臟毒性靶點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)甘草、白芍、當(dāng)歸和黃芩4味中藥均參與阿爾茨海默病與化學(xué)致癌DNA加合物等通路，與PTGS2相互作用密切，這4味中藥常與柴胡配伍“相殺”減輕柴胡的肝臟毒性［38］，上述靶點(diǎn)通路可能是配伍時(shí)拮抗肝臟毒性的潛在靶點(diǎn)和通路.通過(guò)配伍，2種藥物的共同靶點(diǎn)作用于同一個(gè)信號(hào)通路但二者的作用相互拮抗，則可以減輕甚至阻斷毒性成分和毒性靶點(diǎn)在共同信號(hào)通路的作用，這是減少中藥肝臟毒性的一種思路.

2.3其他應(yīng)用

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在中藥中的常見(jiàn)研究思路通常為有毒成分的預(yù)測(cè)，中藥毒性機(jī)制的闡述，中藥配伍禁忌理論內(nèi)涵的解釋，中醫(yī)與西醫(yī)的相互解釋.由于中藥成分的復(fù)雜和網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的局限性，對(duì)于復(fù)方中藥的相關(guān)毒性研究結(jié)果具有爭(zhēng)議，因此相關(guān)研究較少.隨著網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在中藥研究中的廣泛應(yīng)用，可用來(lái)區(qū)分寒性藥物和熱性藥物.寒性藥物和熱性藥物的關(guān)鍵靶蛋白在生物通路、作用疾病及毒理作用上存在差異，林林［39］和梁非［40］通過(guò)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)發(fā)現(xiàn)，促進(jìn)或抑制細(xì)胞的生長(zhǎng)率和增殖率相關(guān)基因，以及能量代謝相關(guān)基因的表達(dá)是區(qū)分2種藥物的關(guān)鍵所在.此外，可通過(guò)挖掘單味藥物的藥理作用，并基于單味藥物的藥理作用開(kāi)展方劑藥理作用研究，以特定疾病為例，用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)評(píng)估其毒性大小，驗(yàn)證方劑治療疾病的合理性.

3結(jié)語(yǔ)

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研究成本低，涉及學(xué)科廣，促進(jìn)了中藥的發(fā)展，在探究中藥毒性機(jī)制方面具有重要意義.但網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)預(yù)測(cè)毒性成分具有一定的局限性：1）中藥結(jié)構(gòu)不穩(wěn)定，在配伍或是復(fù)方中可能會(huì)產(chǎn)生新的物質(zhì)，而網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)在探究毒性機(jī)制的過(guò)程中是將單味中藥的毒性成分和毒性靶點(diǎn)進(jìn)行篩選后簡(jiǎn)單疊加，表明網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)預(yù)測(cè)非單味中藥的毒性成分和機(jī)制不一定準(zhǔn)確.2）目前，有文獻(xiàn)報(bào)道，確切毒性成分未出現(xiàn)在網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)預(yù)測(cè)的范圍內(nèi)里，而預(yù)測(cè)出的某些毒性成分還尚未有文獻(xiàn)研究，因此，需結(jié)合后期實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證才能更準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)中藥的毒性機(jī)制.3）目前，網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)面臨數(shù)據(jù)庫(kù)不完善、篩選成分標(biāo)準(zhǔn)不統(tǒng)一（且沒(méi)有考慮劑型）和數(shù)據(jù)分析結(jié)果不準(zhǔn)確等問(wèn)題，且絕大多數(shù)數(shù)據(jù)庫(kù)是國(guó)外研發(fā)的，國(guó)內(nèi)研發(fā)的還比較少.4）利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選出的活性成分并不是中藥材現(xiàn)行標(biāo)準(zhǔn)中的主要質(zhì)控成分或藥材中含量較高的成分，如何評(píng)價(jià)和處理這一差異是一難題.同時(shí)，網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選出的部分活性成分存在相似度高的問(wèn)題［41］.5）網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選得到的有效成分只能定性，不能體現(xiàn)其在中藥材中的含量，篩選得到的有效成分是否可以在臨床使用中達(dá)到“量—效”關(guān)系而發(fā)揮作用還有待進(jìn)一步研究.其次，不同部位的藥材成分含量可能不同，比如藥用部位和非藥用部位［41］，在數(shù)據(jù)庫(kù)中不能得以體現(xiàn).

網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)單用數(shù)據(jù)可靠等級(jí)較低，同時(shí)其以已有數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ)進(jìn)行研究，其結(jié)果受所用數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性的影響 .因此，對(duì)于研究結(jié)果，應(yīng)靈活結(jié)合多項(xiàng)技術(shù)進(jìn)行體內(nèi)與體外試驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證，從而提高可靠性.將網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)、質(zhì)量標(biāo)志物和代謝組學(xué)結(jié)合，可更準(zhǔn)確地推斷出毒性成分，為中藥的毒性機(jī)制和安全性評(píng)價(jià)提供基礎(chǔ)，此外，可參考于瑞等［42］整理的毒性預(yù)測(cè)評(píng)價(jià)模型.利用網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)研發(fā)出更多的新藥，并且提高中藥的安全性是科研人員面臨的難題.目前，“網(wǎng)絡(luò)靶標(biāo)”理論已成為網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的核心理論，網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)解析藥物及治療對(duì)象之間的分子關(guān)聯(lián)規(guī)律，其研究理念與中醫(yī)藥學(xué)的整體論思想不謀而合，被廣泛應(yīng)用于藥物和中藥活性化合物的發(fā)現(xiàn)、整體作用機(jī)制闡釋、藥物組合和方劑配伍規(guī)律解析等方面，為臨床安全用藥、新藥的研發(fā)和中藥復(fù)雜體系的研究提供了思路和支撐.相信后續(xù)通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的相關(guān)研究思路，對(duì)網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)的研究也更加深入，并逐步解決上述面臨的難題，力爭(zhēng)將網(wǎng)絡(luò)毒理學(xué)存在的價(jià)值發(fā)揮到極致，提高中藥的安全性.

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