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    基于多任務(wù)聯(lián)合注意力的結(jié)腸息肉分割網(wǎng)絡(luò)

    2024-02-29 04:40:16郭祥振李思潼盧銳郭森崔學(xué)榮楊鋼
    計(jì)算機(jī)工程 2024年2期
    關(guān)鍵詞:特征融合

    郭祥振,李思潼,盧銳,郭森,崔學(xué)榮,楊鋼

    (1.東北大學(xué)信息科學(xué)與工程學(xué)院,遼寧 沈陽(yáng) 110819;2.東北大學(xué)冶金學(xué)院,遼寧 沈陽(yáng) 110819)

    0 引言

    結(jié)直腸癌(CRC)是消化系統(tǒng)中最常見(jiàn)的惡性腫瘤,位居城市居民腫瘤發(fā)病率的第2 位,病死率的第4 位,并且其發(fā)病率和死亡率逐年上升,甚至在最近幾年內(nèi)呈現(xiàn)年輕化的趨勢(shì)。根據(jù)國(guó)家癌癥中心統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,我國(guó)每年約有超過(guò)100 萬(wàn)的新增病例以及60 萬(wàn)的死亡病例,結(jié)直腸癌新發(fā)人數(shù)占所有新發(fā)惡性腫瘤的9.9%[1]。

    絕大多數(shù)結(jié)直腸癌都由腸道息肉發(fā)展而來(lái),而腸道息肉檢查的最有效方法為腸鏡檢查,醫(yī)生通過(guò)腸鏡可以直觀地看到腸道內(nèi)部,尋找病變區(qū)域,并將其直接切除,使其不再進(jìn)一步惡化癌變。許多研究結(jié)果表明,早期腸鏡檢查能使結(jié)直腸癌發(fā)病率下降30%[2]。然而,由于息肉自身特點(diǎn)以及各種人為主客觀因素的存在,仍然會(huì)存在漏檢、誤檢的現(xiàn)象[3],因此設(shè)計(jì)高性能的息肉分割系統(tǒng)作為輔助診斷工具具有重大意義。

    基于傳統(tǒng)算法的息肉檢測(cè)依賴于手工提取息肉的紋理[4]、顏色和邊界[5]等特征,并將這些特征組合后進(jìn)行建模,用于訓(xùn)練生成分類器來(lái)辨別息肉和周圍組織。但是手工設(shè)計(jì)的特征是借助視覺(jué)系統(tǒng)中的敏感區(qū)域來(lái)提取能夠與腸壁區(qū)分的特征,其準(zhǔn)確性在很大程度上取決于科學(xué)家的經(jīng)驗(yàn)與專業(yè)水準(zhǔn)。MAMONOV 等[5]提出一種二分類策略分離息肉與非息肉組織。該方法從腸鏡每幀圖像中提取息肉紋理和幾何信息,并且借助中通濾波對(duì)圖像進(jìn)行幾何分析,使用最佳擬合球形半徑作為分類器的決策參數(shù)。BERNAL 等[6]提出使用分水嶺算法對(duì)息肉進(jìn)行檢測(cè),該算法利用矩陣分析法計(jì)算得到息肉區(qū)域基于梯度圖像的特征值和特征向量,根據(jù)這些信息將圖片中每個(gè)區(qū)域分成息肉類和非息肉類,進(jìn)而將息肉分割出來(lái)。SASMAL 等[7]提出采用主成分追蹤法(PCP)和活動(dòng)輪廓(AC)模型對(duì)息肉進(jìn)行檢測(cè)分割。上述這些方法提取出的息肉特征無(wú)法有效將背景特征與息肉特征進(jìn)行區(qū)分。因此,在分割結(jié)果上也存在較明顯的局限,誤檢率、漏檢率仍然較高。

    近年來(lái),利用深度學(xué)習(xí)方法進(jìn)行的醫(yī)學(xué)圖像分割[8]和語(yǔ)義分割任務(wù)[9-10]取得了巨大突破,這些方法與傳統(tǒng)方法相比能提取出更加豐富的息肉組織細(xì)節(jié)和語(yǔ)義特征,提高息肉檢測(cè)效果。LONG 等[11]提出的全卷積網(wǎng)絡(luò)(FCN)與RONNEBERGER 等[12]提出的U-Net 網(wǎng)絡(luò)在息肉檢測(cè)任務(wù)中有著較廣泛的應(yīng)用。文獻(xiàn)[13]介紹基于FCN 思路的SegNet 網(wǎng)絡(luò)的特點(diǎn)是在進(jìn)行圖片下采樣時(shí)使用最大索引的方法,并且借助該索引在上采樣過(guò)程中實(shí)現(xiàn)非線性特征,保留細(xì)節(jié)信息并與語(yǔ)義信息相結(jié)合以提升檢測(cè)目標(biāo)邊緣細(xì)節(jié)分割的能力。ZHOU 等[14]借鑒DenseNet 的稠密連接方式將U-Net 各個(gè)層連接起來(lái),使前后每個(gè)模塊之間產(chǎn)生相互作用,并表現(xiàn)出良好的效果。JHA 等[15]提出ResUNet++網(wǎng)絡(luò),是一種結(jié)合殘差連接和U-Net 的網(wǎng)絡(luò),不僅能更有效地解決梯度消失問(wèn)題還能解決語(yǔ)義信息缺失問(wèn)題,從而提高分割準(zhǔn)確率。目前的針對(duì)性設(shè)計(jì)主要依賴于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),但卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的感受野十分有限,不能從全局范圍內(nèi)探索特征關(guān)系,因此無(wú)法提供完整的對(duì)象區(qū)域預(yù)測(cè)。

    此外,很多研究人員在骨干網(wǎng)絡(luò)和相應(yīng)模塊中引入特征提取和聚合的方法。FAN 等[16]提出的PraNet 網(wǎng)絡(luò),通過(guò)多尺度融合模塊將高級(jí)別特征相融合,根據(jù)這個(gè)組合特征生成全局引導(dǎo)圖,作為下1 個(gè)部分的初始引導(dǎo)區(qū)域,然后利用反向注意力模塊逐層向前挖掘邊緣線索信息以細(xì)化息肉邊界[17]。WEI等[18]提出SANet,針對(duì)息肉顏色分布差異大、尺寸小的特點(diǎn)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì),該方法選擇高級(jí)特征進(jìn)行融合,最高層的卷積特征經(jīng)過(guò)卷積過(guò)濾噪聲干擾,將生成的注意力逐像素相乘到上一層特征中,最終將不同層的特征拼接起來(lái)作為結(jié)果輸出。DONG 等[19]提出Polyp-PVT 網(wǎng)絡(luò),充分利用卷積的局部感受野和平移不變性,以及Transformer[20]的全局注意力機(jī)制,對(duì)圖像進(jìn)行全局的語(yǔ)義建模和特征交互。這些方法存在2 個(gè)主要問(wèn) 題:1)Transformer 的局部特征建模較差,Transformer 模型的不足之處是缺乏對(duì)模型輸出特征中上下文信息的充分利用;2)基于Transformer 的解碼器通常對(duì)具有顯著性差異的特征感興趣,從而忽略一些不易被發(fā)現(xiàn)有價(jià)值的特征。

    針對(duì)上述方法的不足,本文提出一種基于多任務(wù)聯(lián)合注意力的結(jié)腸息肉分割網(wǎng)絡(luò)CPMJA-Net。設(shè)計(jì)級(jí)聯(lián)融合模塊(CFM)和聯(lián)合注意力模塊(JAM),能夠有效解決局部區(qū)域內(nèi)部信息交換缺乏的問(wèn)題,構(gòu)建一種多任務(wù)注意力模塊(MAM),該模塊采用漸進(jìn)式的融合策略將3 個(gè)并行注意力模塊的輸出進(jìn)行融合,充分學(xué)習(xí)圖像中前景和背景之間的差異,進(jìn)而準(zhǔn)確預(yù)測(cè)息肉區(qū)域。

    1 研究方法

    1.1 方法概述

    本文提出的CPMJA-Net 框架遵循編碼器-解碼器結(jié)構(gòu),在編碼器階段利用PVT 網(wǎng)絡(luò)[21]獲得具有全局依賴關(guān)系的多尺度特征,其中有4 層輸出。CPMJA-Net 網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)如圖1 所示。本文將第1 層輸出視為低級(jí)特征,第2 層輸出視為中級(jí)特征,后2 層輸出視為高級(jí)特征。通過(guò)將低級(jí)特征和中級(jí)特征送入級(jí)聯(lián)融合模塊,充分探索局部區(qū)域之間的關(guān)系,增強(qiáng)局部細(xì)節(jié)特征表示。中級(jí)特征和高級(jí)特征經(jīng)過(guò)聚合送入多任務(wù)注意力模塊,從多個(gè)方面探索息肉目標(biāo)和背景之間的關(guān)系,使網(wǎng)絡(luò)關(guān)注息肉目標(biāo)。最后將兩者的輸出經(jīng)過(guò)交互式融合得到輸出結(jié)果。

    使用PVT 網(wǎng)絡(luò)作為backbone,提取輸入息肉RGB 圖片的多層次特征,? 視為低級(jí)特征,視為中級(jí)特征,與視為高級(jí)特征,將這些特征分別送入編碼器中的不同模塊中。

    多任務(wù)注意力模塊的設(shè)計(jì)與每層的輸出相對(duì)應(yīng)。首先高級(jí)特征與中級(jí)特征先進(jìn)行特征融合,然后使每層對(duì)應(yīng)的融合分支送入多任務(wù)注意力模塊。在該模塊中使用3 個(gè)注意力模塊分別計(jì)算前景、背景和整體注意力,以有效提高對(duì)息肉區(qū)域的識(shí)別能力。

    聯(lián)合注意力模塊的設(shè)計(jì)結(jié)合深度學(xué)習(xí)的交互式注意力和殘差連接的思想。根據(jù)這種結(jié)合,JAM 模塊可以同時(shí)接收低級(jí)細(xì)節(jié)特征和高級(jí)預(yù)測(cè)特征,從而能夠更充分捕捉圖像的全局和局部信息。在具體實(shí)現(xiàn)上,交互式注意力機(jī)制采用Self-Attention 的思想,通過(guò)計(jì)算注意力圖來(lái)加權(quán)融合低級(jí)和高級(jí)特征,從而得到更具代表性的融合特征,然后采用卷積操作提取特征間的相關(guān)性,以便挖掘息肉區(qū)域的全局語(yǔ)義特征和線索,同時(shí)也能夠捕捉局部像素之間的聯(lián)系,最后通過(guò)殘差連接輸出結(jié)果。經(jīng)過(guò)這些操作可以進(jìn)一步挖掘息肉區(qū)域的全局語(yǔ)義和局部像素之間的聯(lián)系。

    1.2 級(jí)聯(lián)融合模塊

    低級(jí)特征中包含的細(xì)節(jié)信息對(duì)網(wǎng)絡(luò)分割精度的提升至關(guān)重要,全局上下文和局部特征在息肉檢測(cè)任務(wù)中都發(fā)揮著重要的作用。然而大多數(shù)基于Transformer 的方法存在1 個(gè)共同的問(wèn)題,即:缺乏機(jī)制來(lái)增強(qiáng)局部區(qū)域信息的交換。

    中層輸出特征有助于低層輸出特征細(xì)節(jié)信息的提取,將中層輸出特征與低層輸出特征進(jìn)行交互融合,使網(wǎng)絡(luò)探索局部區(qū)域特征之間的關(guān)系。為實(shí)現(xiàn)2 個(gè)分支信息的傳遞和共享,有效促進(jìn)不同尺度信息之間的互相協(xié)助,本文構(gòu)建級(jí)聯(lián)融合模塊,使低級(jí)特征和中級(jí)特征的內(nèi)部特征進(jìn)行交互和探索,以及補(bǔ)償Transformer 的局部建模能力。

    級(jí)聯(lián)融合模塊由2 個(gè)并行分支組成,分別處理來(lái)自特征提取網(wǎng)絡(luò)前2 層的輸出,同時(shí)在輸入階段將這2 個(gè)分支進(jìn)行交互融合,使特征中每個(gè)對(duì)應(yīng)區(qū)域的局部像素進(jìn)行融合,以增強(qiáng)局部特征表示,然后將這個(gè)融合特征分別在兩者內(nèi)部進(jìn)行加權(quán)融合。具體而言,級(jí)聯(lián)融合模塊分別接收來(lái)自編碼器前2 層的輸出,記為f1和f2,調(diào)整尺寸使f1與f2相同,并將兩者進(jìn)行歸一化,然后對(duì)每個(gè)輸入分別使用2 個(gè)線性映射得 到2 個(gè)降維 后的特 征映射f(v,1),f(k,1)和f(v,2),f(k,2),如式(1)所示:

    級(jí)聯(lián)融合模塊結(jié)構(gòu)如圖2 所示。

    將2 層輸出進(jìn)行特征融合,經(jīng)過(guò)卷積改變維度,再次經(jīng)過(guò)線性映射得到繼承2 個(gè)輸出特征的向量fq,該向量后續(xù)分別與2 個(gè)輸入特征交互,以達(dá)到局部特征增強(qiáng)的作用,其中對(duì)于2 個(gè)特征的操作為并行操作。對(duì)于每個(gè)分支首先將fq經(jīng)過(guò)Softmax 函數(shù)生成權(quán)重矩陣,然后使用主元素相乘方法將與fq進(jìn)行相乘,得到每個(gè)元素都被加權(quán)之后的特征向量,最后對(duì)特征向量進(jìn)行平均池化操作,降低圖像尺寸。其過(guò)程表達(dá)式如式(2)所示:

    將加權(quán)之后的特征和fk進(jìn)行矩陣相乘,探索2種特征之間的相關(guān)性,使用Softmax 函數(shù)生成注意力圖Ta,此時(shí)的注意力圖成為2 層特征的交互注意力。該步驟的計(jì)算式如式(3)所示:

    之后將2 個(gè)并行分支中的Ta分別與fv進(jìn)行交互相乘,使每個(gè)分支都能關(guān)注到對(duì)方的特征,實(shí)現(xiàn)特征互補(bǔ),從而達(dá)到過(guò)濾冗余特征、關(guān)注細(xì)節(jié)特征的目的。使用殘差連接將增強(qiáng)特征與原始特征相結(jié)合,以保留原始信息。該過(guò)程的表達(dá)式如式(4)所示:

    最后將2 個(gè)并行分支進(jìn)行Concat 拼接,再利用卷積操作調(diào)整尺寸,如式(5)所示:

    1.3 多任務(wù)注意力模塊

    注意力機(jī)制通過(guò)對(duì)每個(gè)像素分配不同的注意力權(quán)重,使網(wǎng)絡(luò)更加關(guān)注權(quán)重高的像素。由于息肉的自身特性和內(nèi)窺鏡頭的拍攝角度使得其局部特征分布具有極強(qiáng)的隨機(jī)性,因此要求網(wǎng)絡(luò)對(duì)輸入圖像的不同區(qū)域分配不同的權(quán)重。在大多數(shù)的研究中注意力權(quán)重是通過(guò)掩碼來(lái)形成的,主要思想是通過(guò)計(jì)算得出1 層擁有注意力權(quán)重的矩陣或者向量,再與輸入圖像的通道或者區(qū)域進(jìn)行相乘來(lái)突出重要信息或者抑制干擾和無(wú)關(guān)信息。

    將Self-Attention 機(jī)制引入網(wǎng)絡(luò)中,增強(qiáng)像素的類內(nèi)一致性,使關(guān)鍵信息得以凸顯,干擾信息得以抑制。另外,受多頭Self-Attention 機(jī)制[23]的啟發(fā),本文將注意力模塊分為3 個(gè)部分,分別使用不同的掩碼策略將息肉圖像的前景和背景區(qū)域區(qū)分,并輸入到3 個(gè)部分中完成不同的注意力任務(wù)。多任務(wù)注意力模塊結(jié)構(gòu)如圖3 所示,

    圖3 多任務(wù)注意力模塊結(jié)構(gòu)Fig.3 Structure of multi-task attention module

    1.3.1 前景注意力單元

    該單元的任務(wù)是在輸入特征圖中挖掘前景區(qū)域的相關(guān)性,使網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)前景內(nèi)部之間的關(guān)系,避免內(nèi)部噪聲影響網(wǎng)絡(luò)分割效果。該單元遵循Self-Attention的原理,如式(6)所示:

    其中:AAT表示注意力機(jī)制;Q,K,V分別表示使用3 個(gè)不同的1×1 和3×3 卷積生成的query,key 和value向量;α是1 個(gè)可學(xué)習(xí)參數(shù)。

    在前景注意力單元(FAT)中,將每個(gè)級(jí)別特征輸出的息肉區(qū)域預(yù)測(cè)掩碼圖作為一部分輸入引入到注意力AT 中,作為先驗(yàn)知識(shí)來(lái)調(diào)節(jié)生成的注意力矩陣,以更好地識(shí)別息肉區(qū)域。前景注意力單元結(jié)構(gòu)如圖4 所示。

    圖4 前景注意力單元結(jié)構(gòu)Fig.4 Structure of foreground attention unit

    其表達(dá)式如式(7)所示:

    該單元接收來(lái)自某一層的語(yǔ)義特征圖xinput∈RH×W×C和由該層特征圖得到 的預(yù)測(cè) 掩碼 圖Mf∈RH×W×C,其中H、W為特征圖的長(zhǎng)和寬,C為通道數(shù)。首先通過(guò)對(duì)輸入特征進(jìn)行樣本特征歸一化,然后分別經(jīng)過(guò)并行的3 個(gè)1×1 的卷積和3×3 的深度可分離卷積生成Q、K、V。此時(shí)將輸入的掩碼圖Mf分別與Q和K進(jìn)行逐像素相乘,用于提取預(yù)測(cè)的前景區(qū)域。將兩者結(jié)果相乘再送入Softmax 生成基于前景的attention map。最后將其與V矩陣相乘得到基于前景注意力的加權(quán)特征圖。

    1.3.2 背景注意力單元

    背景注意力單元(BAT)采用與前景注意力單元相同的結(jié)構(gòu),在該單元中同樣接收某一層的語(yǔ)義特征圖xinput∈RH×W×C和由該層特征圖得到的預(yù)測(cè)掩碼圖Mb∈RH×W×C,與前景注意力單元不同的是掩碼圖換成了Mb,這是因?yàn)樵搯卧淖⒁饬C(jī)制在背景區(qū)域進(jìn)行注意力建模,需要引入背景掩碼圖。因此,背景掩碼圖的獲取采用1-Mf的形式以達(dá)到反轉(zhuǎn)的效果,經(jīng)過(guò)同樣的處理,以得到基于背景注意力單元的加權(quán)特征圖。BAT(計(jì)算中用BBAT)的表達(dá)式如式(8)所示:

    此外,該注意力模塊的第3 個(gè)單元為常規(guī)注意力機(jī)制,接收某一層的特征圖,目的是從全局范圍內(nèi)計(jì)算出前景與背景間的關(guān)聯(lián)性,如式(9)所示:

    1.3.3 特征融合方法

    在網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)中,本文在每層輸出特征之后都加入多任務(wù)注意力模塊。為充分利用不同特征信息,采用漸進(jìn)式融合的方式逐步將不同的特征圖進(jìn)行融合,以有效捕捉多個(gè)特征圖中的不同特征,最后輸出1 個(gè)息肉區(qū)域預(yù)測(cè)特征圖。假設(shè)特征提取網(wǎng)絡(luò)的后3 層輸出為fi(i=2,3,4),首先將f2,f3,f4經(jīng)過(guò)特征整合單元生成粗略的區(qū)域預(yù)測(cè)圖D5,將該預(yù)測(cè)圖經(jīng)過(guò)尺寸調(diào)整和Sigmoid 函數(shù)生成掩碼圖P5,作為第1 個(gè)多任務(wù)注意力模塊的掩碼輸入,然后將f4經(jīng)過(guò)卷積調(diào)整維度,作為第1 個(gè)特征圖輸入。將這2 個(gè)輸入經(jīng)過(guò)第1 個(gè)多任務(wù)注意力模塊生成1 個(gè)聯(lián)合前景注意力、背景注意力和全局注意力的特征圖D4,其過(guò)程如式(10)所示:

    其中:MMTA(*)為多任務(wù)注意力模塊。在該模塊中掩碼圖P5輸入到前景注意力單元中,將1-P5輸入到背景注意力單元中。

    將第1 個(gè)多任務(wù)注意力模塊的輸出D4經(jīng)過(guò)上采樣調(diào)節(jié)尺寸使其與f3相同,經(jīng)過(guò)Sigmoid 函數(shù)生成掩碼圖P4,作為第2 部分的掩碼圖輸入,同時(shí)將f4經(jīng)過(guò)上采樣調(diào)整尺寸、卷積提取特征后與f3進(jìn)行逐像素相乘得到。將與f4拼接,經(jīng)過(guò)卷積調(diào)整維度后與D4進(jìn)行逐元素相乘,再與D4相加作為第2 部分的輸入特征。這種融合方式可以增強(qiáng)局部特征的表示,其過(guò)程如式(11)所示:

    其中:upsample(*)為上采樣操作;⊙為哈達(dá)瑪乘積,即矩陣逐元素相乘。

    第3 部分以相同的方法處理D3,同時(shí)將f4與f3分別進(jìn)行上采樣并調(diào)整為與f2尺寸相同,再分別經(jīng)過(guò)卷積與f2進(jìn)行逐像素相乘得到,再將與上一部分Concat 后的特征相拼接,最后用同樣的方法與D3進(jìn)行融合作為多任務(wù)注意力模塊最后部分的特征輸入。該過(guò)程如式(12)所示:

    1.4 聯(lián)合注意力模塊

    為解決早期卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)模型在目標(biāo)檢測(cè)任務(wù)中忽視了低層特征的問(wèn)題,研究人員設(shè)計(jì)特征金字塔網(wǎng)絡(luò)(FPN)[24]結(jié)構(gòu)。該結(jié)構(gòu)通過(guò)逐層融合低層特征,將頂層特征恢復(fù)到原圖大小的過(guò)程中,補(bǔ)充細(xì)節(jié)信息,提高目標(biāo)檢測(cè)的預(yù)測(cè)效果。然而,F(xiàn)PN在進(jìn)行不同層次特征融合時(shí)只采用簡(jiǎn)單的求和或者拼接策略,無(wú)法充分實(shí)現(xiàn)高低層信息互補(bǔ),而且還有可能引入干擾噪聲。

    因此,本文提出一種聯(lián)合注意力機(jī)制,該機(jī)制利用高級(jí)特征的輪廓信息在低級(jí)特征中篩選出有利于邊緣分割的細(xì)節(jié)特征,并將其與息肉輪廓聚合起來(lái),得到更加精確的邊緣分割結(jié)果。聯(lián)合注意力模塊結(jié)構(gòu)如圖5 所示,分別將多任務(wù)注意力模塊輸出特征fM∈RH/8,W/8,C1和級(jí)聯(lián)融合模塊輸出特征fC∈RH/4×W/4×C2作為輸入。

    圖5 聯(lián)合注意力模塊結(jié)構(gòu)Fig.5 Structure of joint attention module

    首先將fC進(jìn)行上采樣操作,使其與fM尺寸相同,再將其經(jīng)過(guò)1×1 的卷積來(lái)調(diào)整維度,使其與fM的通道數(shù)相等,同時(shí)減少網(wǎng)絡(luò)計(jì)算量;然后將fC在通道維度上做Softmax,并且選擇第1 個(gè)通道作為注意力的映射,此時(shí)∈RH/8×W/8×1。該過(guò)程如式(13)所示:

    其中:interpolate 表示雙線性插值法對(duì)圖像進(jìn)行上采樣。

    對(duì)于另外1 個(gè)輸入特征fM具有更高級(jí)的語(yǔ)義特征,首先將fM經(jīng)過(guò)2 個(gè)映射進(jìn)行降維操作,分別得到映射特征Q∈R(H/8×W/8×16)和K∈R(H/8×W/8×16),其映射操作分別為2 個(gè)1×1 的卷積,如式(14)所示:

    將K和進(jìn)行對(duì)應(yīng)元素相乘,然后對(duì)其使用平均池化操作提取特征的平移不變性,使模型對(duì)于輸入圖像的微小平移具有一定的容忍度,此時(shí)得到了特征映射V,V中具有突出的息肉邊界信息。其過(guò)程如式(15)所示:

    將K和V進(jìn)行矩陣相乘,將相乘結(jié)果經(jīng)過(guò)Softmax 建立K與V之間每個(gè)像素的相關(guān)性,從而獲得相關(guān)性注意力圖f。將f與Q相乘得到Q',此時(shí)Q'中每個(gè)元素與f之間建立相關(guān)性,給息肉邊界區(qū)域分配更高的權(quán)重。將Q'經(jīng)過(guò)圖卷積層,從特征圖中每個(gè)節(jié)點(diǎn)的狀態(tài)和節(jié)點(diǎn)之間的關(guān)系中提取特征,并計(jì)算其關(guān)系矩陣,更新節(jié)點(diǎn)狀態(tài),以提高模型的表征能力。這部分的表達(dá)式如式(16)所示:

    其中:?為矩陣相乘;GCN(*)為圖卷積層。

    再利用f和f'相乘,輸出結(jié)果與該節(jié)點(diǎn)的原始特征相結(jié)合,以保留節(jié)點(diǎn)的原始特征信息。之后將其通過(guò)1×1 的卷積層將重構(gòu)的特征圖調(diào)整為原來(lái)的維度,再利用殘差連接將重構(gòu)特征與原始輸入特征fM相加達(dá)到細(xì)化邊緣分割結(jié)果的目的,最后再經(jīng)過(guò)1×1的卷積調(diào)整為1 維,輸出息肉檢測(cè)結(jié)果。該過(guò)程的表達(dá)式如式(17)所示:

    經(jīng)過(guò)聯(lián)合注意力模塊可以有效地聚合高級(jí)特征和低級(jí)特征,將它們以交叉的方式將自己的特征加入到對(duì)方的Token 中,并計(jì)算注意力圖。將每個(gè)注意力圖與對(duì)方的特征序列相乘,使得兩者特征中都包含對(duì)方的特征,從而建立兩者之間的相關(guān)性,實(shí)現(xiàn)相鄰2 層間的局部信息交換,豐富輸出特征的局部表達(dá)。將網(wǎng)絡(luò)的關(guān)注度聚焦到息肉邊界上,同時(shí)利用低級(jí)特征中的詳細(xì)信息來(lái)加強(qiáng)邊緣的分割。

    2 實(shí)驗(yàn)與結(jié)果分析

    2.1 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)集與實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)

    本文在4 個(gè)開(kāi)源數(shù)據(jù)集上對(duì)算法模型進(jìn)行驗(yàn)證,包 括ETIS-LaribPolypDB[25]、CVC-ColonDB[26]、CVC-ClinicDB[27]和Kvasir[28]。數(shù)據(jù)集遵循PraNet 中的劃分方法,其中訓(xùn)練集來(lái)自Kvasir 和CVCClinicDB,分別從中隨機(jī)抽取900 張和550 張樣本,共1 450 張樣本。測(cè)試集選取ETIS-LaribPolypDB、CVC-ColonDB 中的全部樣本、Kvasir 和CVCClinicDB 中剩下的樣本,共有798 張樣本。將圖像尺寸調(diào)整為352×352 像素,并采用隨機(jī)旋轉(zhuǎn)和隨機(jī)垂直翻轉(zhuǎn)的方法擴(kuò)充訓(xùn)練數(shù)據(jù)。

    在PyTorch 深度學(xué)習(xí)框架下進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)搭建、訓(xùn)練和測(cè)試,電腦顯卡為一塊NVIDIA GTX 1080Ti GPU。本文選用廣泛用于Transformer 網(wǎng)絡(luò)的AdamW 優(yōu)化器來(lái)更新權(quán)重,設(shè)置初始學(xué)習(xí)率為1×10-4,學(xué)習(xí)率更新策略采用Poly 策略,總共訓(xùn)練100 個(gè)epoch,batch_size 設(shè)置為4。

    2.2 損失函數(shù)

    本文使用二元交叉熵(BCE)損失和交并比(IoU)損失相結(jié)合的方法來(lái)訓(xùn)練模型。其中,交叉熵?fù)p失反映像素級(jí)別的損失,它對(duì)預(yù)測(cè)圖上的每個(gè)位置獨(dú)立求取損失值,并將這些損失進(jìn)行求和后取均值,如式(18)所示:

    其中:H和W分別表示標(biāo)簽圖的長(zhǎng)度和寬度;S表示息肉預(yù)測(cè)圖的概率分布;G表示息肉真實(shí)標(biāo)簽0或者1。

    IoU 損失函數(shù)是在目標(biāo)檢測(cè)任務(wù)中常見(jiàn)的損失函數(shù),通過(guò)計(jì)算預(yù)測(cè)框與實(shí)際標(biāo)注框之間的重疊區(qū)域面積來(lái)評(píng)估預(yù)測(cè)框的準(zhǔn)確性,可以度量2 個(gè)集合之間的相似性。IoU 損失函數(shù)是基于IoU 指標(biāo)設(shè)計(jì)的,其表達(dá)式如式(19)所示:

    其中:分子部分計(jì)算的是預(yù)測(cè)分割結(jié)果和真實(shí)分割結(jié)果的交集;分母部分計(jì)算的是預(yù)測(cè)分割結(jié)果和真實(shí)分割結(jié)果的并集。

    為了使損失函數(shù)更適合本文任務(wù),在設(shè)計(jì)損失函數(shù)時(shí)采用加權(quán)的方式,使整個(gè)模型計(jì)算的損失函數(shù)更加偏向于息肉邊緣部分。加權(quán)方法是選取某個(gè)像素15 鄰域的像素取平均值,然后再用這個(gè)平均值與該像素作差,計(jì)算該點(diǎn)像素與周圍像素之間的差異。該權(quán)重表達(dá)式如式(20)所示:

    其中:AvgPool(*)為31×31 的平均池化;mask 為息肉真實(shí)分割結(jié)果。

    經(jīng)過(guò)加權(quán),最終的損失函數(shù)計(jì)算式如式(21)所示:

    2.3 評(píng)價(jià)指標(biāo)

    本文采用在息肉檢測(cè)領(lǐng)域中5 種最常見(jiàn)的評(píng)價(jià)指標(biāo)對(duì)算法進(jìn)行評(píng)估,包括mDice(計(jì)算中用mmDice)系數(shù)、平均交并比(mIoU,計(jì)算中用mmIoU)、平均絕對(duì)誤 差(MAE,計(jì)算中 用MMAE)、F-measure 值[29]、S-measure 值[30],其計(jì)算式如下:

    其中:X和Y表示2 個(gè)集合,分別代表息肉預(yù)測(cè)圖和真實(shí)標(biāo)簽圖;n表示數(shù)據(jù)點(diǎn)數(shù)量;Yi表示第i個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的實(shí)際值;Xi表示第i個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)的預(yù)測(cè)值;參數(shù)β2的取值為0.5;參數(shù)α用于權(quán)衡2 種度量的比例;SO和Sr為平衡系數(shù)。

    2.4 消融實(shí)驗(yàn)分析

    為驗(yàn)證級(jí)聯(lián)融合模塊(CFM)、多任務(wù)注意力模塊(MAM)和聯(lián)合注意力模塊(JAM)的有效性,本文進(jìn)行消融實(shí)驗(yàn)。本文實(shí)驗(yàn)以PVT 網(wǎng)絡(luò)作為基線,在此基礎(chǔ)上添加或減去各模塊進(jìn)行實(shí)驗(yàn)對(duì)比。每個(gè)模塊的使用情況用w/o 來(lái)表示,即不加入某模塊時(shí)模型的性能。各模塊消融實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表1所示。

    表1 各模塊消融實(shí)驗(yàn)結(jié)果 Table 1 Ablation experimental results of each module

    從表1 可以看出各個(gè)模塊對(duì)提升模型性能的貢獻(xiàn),PVT 在各個(gè)數(shù)據(jù)集中的指標(biāo)較差,加入其他模塊后性能有所提高,CPMJA-Net將所有模塊都加入模型中,性能達(dá)到最優(yōu)。當(dāng)網(wǎng)絡(luò)移除CFM 后,w/o CFM網(wǎng)絡(luò)在4 個(gè)數(shù)據(jù)集中的表現(xiàn)都有所下降,相比CPMJA-Net,mDice 系數(shù)分 別下降0.7、2.4、1.1 和0.6 個(gè)百分點(diǎn)。移除MAM 模塊后網(wǎng)絡(luò)性能都出現(xiàn)下降情況,相比CPMJA-Net,在所有數(shù)據(jù)集中的mDice和mIoU 最多下降為2.2 和2.6 個(gè)百分點(diǎn)。去除JAM后網(wǎng)絡(luò)的各項(xiàng)指標(biāo)與CPMJA-Net 相比所有指標(biāo)均有明顯下降。

    2.5 比較實(shí)驗(yàn)分析

    本文將CPMJA-Net 和U-Net[12]、UNet++[14]、SFA[31]、PraNet[16]、DCRNet[32]、MSEG[33]、CaraNet[34]、Polyp-PVT[19]和SANet[18]9 種腸道息肉檢測(cè)算法進(jìn)行對(duì)比。

    2.5.1 定量比較

    表2 和表3 所示為CPMJA-Net 模型與其他腸道息肉檢測(cè)算法在4 個(gè)主流數(shù)據(jù)集上mDice 系數(shù)、mIoU、Fβ、S和MAE 等指標(biāo)的對(duì)比,其中,加粗表示最優(yōu)數(shù)據(jù),下劃線代表次優(yōu)數(shù)據(jù)。從表2 和表3 可以看出,CPMJA-Net 在4 個(gè)數(shù)據(jù)集上性能都表現(xiàn)為最優(yōu),與每個(gè)數(shù)據(jù)及次優(yōu)的算法相比,CPMJA-Net的mDice 系 數(shù)在Kvasir、CVC-ClinicDB、CVC-ColonDB和ETIS 數(shù)據(jù)集分別提升0.7、0.8、0.4、0.4 個(gè)百分點(diǎn),mIoU 也分別提升1.6、1.2、0.6 和0.5 個(gè)百分點(diǎn),MAE 值分別降低0.3、0、0.2 和0.2 個(gè)百分點(diǎn)。綜合考慮所有數(shù)據(jù)集的上述5 個(gè)評(píng)價(jià)指標(biāo),本文算法性能優(yōu)于其他算法。

    表2 不同算法在Kvasir 和CVC-ClinicDB 數(shù)據(jù)集上的評(píng)價(jià)指標(biāo) Table 2 Evaluation indexes among different algorithms on Kvasir and CVC-ClinicDB datasets

    表3 不同算法在CVC-ColonDB 和ETIS 數(shù)據(jù)集上的評(píng)價(jià)指標(biāo) Table 3 Evaluation indexes among different algorithms on CVC-ColonDB and ETIS datasets

    2.5.2 定性比較

    圖6 所示為CPMJA-Net 與其他算法在不同場(chǎng)景腸道息肉下的分割結(jié)果。從圖6 可以看出,CPMJA-Net 不僅可以準(zhǔn)確識(shí)別息肉區(qū)域,而且能夠保留相對(duì)細(xì)致的邊緣輪廓。相比之下,其他算法的預(yù)測(cè)圖像在前景和背景交界區(qū)域的像素存在模糊現(xiàn)象,無(wú)法顯示出清晰的輪廓。在前景和背景比較相似的情況下,其他算法檢測(cè)出的息肉區(qū)域不完整,而本文算法能將息肉完整地分割出來(lái)。此外,CPMJA-Net 也可以檢測(cè)出小型息肉,說(shuō)明對(duì)于小目標(biāo)的檢測(cè)也是適用的。綜上所述,CPMJA-Net在腸道息肉分割方面具有較優(yōu)的檢測(cè)性能和魯棒性,能夠更準(zhǔn)確地區(qū)分邊界上的像素,并還原出更清晰的邊緣。

    圖6 不同算法的預(yù)測(cè)結(jié)果圖對(duì)比Fig.6 Comparison of prediction results images among different algorithms

    通過(guò)上述比較可以看出,CPMJA-Net具有較優(yōu)的分割性能,此前表現(xiàn)最好的Polyp-PVT,由于CAM 模塊存在特征融合的局限性以及高階特征和低階特征明顯的差異性,使得其仍然有提升的空間,而CPMJANet的CFM 和JAM 模塊可以有效解決此問(wèn)題。

    3 結(jié)束語(yǔ)

    本文提出一種新的息肉檢測(cè)算法CPMJA-Net,解決過(guò)分割和注意力機(jī)制不足的問(wèn)題,提升解碼器的細(xì)節(jié)恢復(fù)能力,有助于獲得邊緣清晰的息肉檢測(cè)結(jié)果。級(jí)聯(lián)融合模塊將低級(jí)特征和中級(jí)特征進(jìn)行交互融合,探索兩者特征之間的高階關(guān)系,并通過(guò)殘差連接保留豐富的細(xì)節(jié)信息和語(yǔ)義信息,增強(qiáng)基于Transformer 網(wǎng)絡(luò)在對(duì)象分割任務(wù)中的局部特征表示能力。多任務(wù)注意力模塊將注意力分為前景、背景和偽裝區(qū)域,通過(guò)漸進(jìn)式融合方式將不同特征圖逐步進(jìn)行融合,最后輸出1 個(gè)息肉區(qū)域預(yù)測(cè)特征圖,有效地捕捉多個(gè)特征圖中的不同特征,降低模型復(fù)雜度,同時(shí)也可以減少噪音和冗余信息的干擾。聯(lián)合注意力模塊把高級(jí)特征和低級(jí)特征以交叉的方式進(jìn)行融合,實(shí)現(xiàn)相鄰2 層間的局部信息交換,豐富輸出特征的局部表達(dá)。在4 個(gè)數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,與U-Net、U-Net++、SFA 等網(wǎng)絡(luò)相比,CPMJA-Net具有較優(yōu)的魯棒性和分割精度。下一步將對(duì)基于視頻的息肉分割技術(shù)進(jìn)行研究,以處理帶有時(shí)間維度的動(dòng)態(tài)醫(yī)學(xué)影像,更準(zhǔn)確地定位和描述息肉的形態(tài)、大小、位置等信息。

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