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    細(xì)胞壁轉(zhuǎn)化酶調(diào)控番茄響應(yīng)灰霉菌侵染的轉(zhuǎn)錄組分析

    2024-01-01 00:00:00付蘭平辛曙麗劉永華朱國鵬
    熱帶作物學(xué)報 2024年6期
    關(guān)鍵詞:灰霉病抗病病菌

    摘""要:由死體營養(yǎng)型病菌(necrotrophic"pathogen)灰葡萄孢菌(Botrytis"cinerea)侵染引起的灰霉病是番茄生產(chǎn)上的常見病害,可導(dǎo)致番茄大面積減產(chǎn)甚至絕收。蔗糖分解代謝在植物抗病中發(fā)揮著重要作用,不僅可為植物防御反應(yīng)提供碳骨架和能量,還可通過信號途徑調(diào)控抗病基因的表達(dá)。研究表明,分解蔗糖的細(xì)胞壁轉(zhuǎn)化酶(cell"wall"invertase,"CWIN)可增強(qiáng)植物對死體營養(yǎng)型病害的抗性。然而,目前尚無CWIN對番茄灰霉病抗性影響的相關(guān)研究。本研究以CWIN活性上調(diào)的轉(zhuǎn)基因番茄(RNAi/R)及野生型番茄(WT/W)為材料,對其葉片進(jìn)行灰霉菌(Bc)離體接種,研究CWIN對番茄灰霉病抗性的影響,同時對接種后12、60"h的葉片進(jìn)行取樣,通過轉(zhuǎn)錄組測序初步闡明CWIN調(diào)控番茄灰霉病抗性的分子機(jī)制。結(jié)果表明:(1)提高番茄CWIN活性可增強(qiáng)番茄葉片對灰霉病菌的抗性。(2)KEGG注釋表明,接種12"h的DEGs(W-Bc-12"h-vs-R-Bc-12"h)共獲得5個顯著性富集通路,包括次生代謝物生物合成(biosynthesis"of"secondary"metabolites)、代謝途徑(metabolic"pathways)、DNA復(fù)制(DNA"replication)、淀粉和蔗糖代謝(starch"and"sucrose"metabolism)以及甾族化合物生物合成(steroid"biosynthesis);接種60"h的DEGs(W-Bc-60"h-vs-R-Bc-60"h)則未發(fā)現(xiàn)顯著性富集通路,表明接種早期是CWIN調(diào)控番茄抗病性的關(guān)鍵時期。(3)植物-病原菌互作圖分析表明,參與超敏反應(yīng)和防御相關(guān)基因誘導(dǎo)的富含亮氨酸重復(fù)(LRR)受體類絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶基因FLS2和熱激蛋白基因HSP90在接種后的RNAi葉片中上調(diào),其可能是CWIN增強(qiáng)番茄抗病性機(jī)制中的重要基因。(4)植物激素信號通路和MapMan作圖分析表明,接種后RNAi番茄的抗病激素茉莉酸(JA)和乙烯(ET)信號途徑上調(diào),同時水楊酸(SA)信號途徑減弱,表明其可能共同作用提高RNAi番茄的抗病性。此外,接種后RNAi番茄葉片的生長促進(jìn)激素生長素(IAA)和細(xì)胞分裂素(CTK)信號途徑增強(qiáng),而衰老促進(jìn)激素脫落酸(ABA)信號途徑減弱,這樣可以抑制病菌侵染期間細(xì)胞的死亡,從而阻止死體營養(yǎng)型病菌灰霉病菌從死亡寄主細(xì)胞上獲得必要的養(yǎng)分用于侵染。此外,MapMan作圖還揭示接種后RNAi番茄葉片在細(xì)胞壁增厚、蛋白水解、活性氧(氧化還原狀態(tài)和過氧化物酶)、次生代謝物方面也得到極大的加強(qiáng),這些途徑均有助于提高番茄的抗病性。綜上,提高CWIN活性可增強(qiáng)番茄灰霉病抗性,轉(zhuǎn)錄組分析不僅驗證已有的CWIN抗病分子機(jī)制,如細(xì)胞壁加厚、活性氧積累和超敏反應(yīng)(HR)、抗病激素積累(SA和JA/ET)、病程相關(guān)蛋白(如HSP和PR)和次生代謝物的合成(如植物毒素和多酚等)等,而且還挖掘出一些新的CWIN抗病機(jī)制,包括生長促進(jìn)激素(IAA和CTK)和衰老促進(jìn)激素(ABA)信號途徑和蛋白水解途徑。研究結(jié)果可為下一步利用基因工程、分子育種等現(xiàn)代生物技術(shù)手段提高番茄灰霉病抗性提供理論指導(dǎo)。

    關(guān)鍵詞:細(xì)胞壁轉(zhuǎn)化酶;灰霉菌(Botrytis"cinerea);番茄;轉(zhuǎn)錄組測序;抗病基因中圖分類號:S436.412.13""""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

    Transcriptome"Analysis"of"CWIN-mediated"Tomato"Response"to"the"Infection"of"Botrytis"cinerea

    FU"Lanping1,3,"XIN"Shuli2,"LIU"Yonghua1,3*,"ZHU"Guopeng1,3*

    1."School"of"Horticulture,"Hainan"University"/"Key"Laboratory"for"Quality"Regulation"of"Tropical"Horticultural"Crops"of"Hainan"Province,"Haikou,"Hainan"570228,"China;"2."Agricultural"Service"Center"of"Baoting,"Baoting,"Hainan"572316,"China;"3."Sanya"Nanfan"Research"Institute,"Hainan"University,"Sanya,"Hainan"572022,"China

    Abstract:"Grey"mold"is"a"common"disease"in"tomato"production"caused"by"Botrytis"cinerea,"a"necrotrophic"pathogen,"which"often"leads"to"dramatic"reduction"of"tomato"yield."Sucrose"catabolism"plays"an"important"role"in"plant"defense"against"pathogen"infection"by"providing"carbon"skeleton"and"energy"for"plant"defense"responses"and/or"regulating"the"expression"of"defense-related"genes"throughnbsp;signaling"pathway."Previous"studies"have"shown"that"cell"wall"invertase"(CWIN),"a"kind"of"sucrose-degrading"enzyme,"can"enhance"plant"resistance"to"several"necrotrophic"pathogens."However,"no"research"has"been"conducted"to"study"the"role"of"CWIN"in"tomato"resistance"to"B."cinerea."In"this"study,"wild"type"tomato"(W)"and"its"transgenic"line"(R)"with"elevated"CWIN"activity"were"used"as"materials"to"study"the"effect"of"CWIN"on"tomato"resistance"to"B."cinerea"(Bc)"via"in"vitro"inoculation."In"addition,"inoculated"leaves"were"sampled"12"h"and"60"h"post"inoculation"(hpi)"for"RNA-Seq"to"elucidate"possible"molecular"mechanisms"underlying"the"regulation"of"CWIN"to"tomato"resistance"against"B."cinerea."The"results"are"as"follows:"(1)"Elevated"CWIN"activity"enhanced"tomato"resistance"to"B."cinerea;"(2)"KEGG"annotation"showed"that"DEGs"(W-Bc-12"h-vs-R-Bc-12"h)"from"12"hpi"were"significantly"enriched"in"five"pathways,"including"biosynthesis"of"secondary"metabolites,"metabolic"pathways,"DNA"replication,"starch"and"sucrose"metabolism,"and"steroid"biosynthesis;"No"significant"enrichment"pathway"was"found"for"DEGs"(W-Bc-60"h-vs-R-Bc-60"h)"from"60"hpi."(3)"By"mapping"DEGs"to"plant-pathogen"interaction"pathway,"it"was"revealed"that"the"LRR-receptor"serine/threonine-like"kinase"gene"FLS2"and"heat"shock"protein"gene"HSP90"involved"in"hypersensitive"response"and"defense-related"gene"induction"were"up-regulated"in"RNAi"leaves"after"inoculation,"indicating"the"two"genes"may"participate"in"the"regulation"of"CWIN"to"tomato"resistance"to"B."cinerea."(4)"The"analysis"of"plant"hormone"signal"transduction"pathways"and"MapMan"mapping"showed"that"the"signal"pathway"of"jasmonic"acid"(JA)"and"ethylene"(ET)"was"enhanced"in"RNAi"leaves"after"inoculation,"while"the"signal"pathway"of"salicylic"acid"(SA)"was"weakened,"indicating"that"the"hormones"might"work"together"to"improve"the"resistance"of"RNAi"tomato"to"B."cinerea."In"addition,"the"signal"transduction"of"growth-promoting"hormone"auxin"(IAA)"and"cytokinin"(CTK)"was"also"enhanced"in"RNAi"leaves"after"inoculation,"but"that"of"senescence-promoting"hormone"abscisic"acid"(ABA)"was"weakened."The"changes"in"signal"pathways"of"IAA,"CTK"and"ABA"could"inhibit"the"cell"death"in"host"during"bacterial"infection,"thus"preventing"the"necrotrophic"pathogen"B."cinerea"from"obtaining"necessary"nutrients"from"the"dead"host"cells"for"its"infection."In"addition,"MapMan"mapping"also"revealed"that"cell"wall"thickening,"proteolysis,"reactive"oxygen"species"(redox"state"and"peroxidases)"and"secondary"metabolites"were"also"greatly"enhanced"in"RNAi"leaves"after"inoculation,"which"all"contribute"to"improving"the"disease"resistance"of"tomato."In"conclusion,"this"study"showed"that"elevated"CWIN"activity"enhanced"tomato"resistance"to"B."cinerea."Transcriptome"analysis"not"only"verified"the"existing"molecular"mechanisms"underlying"the"regulation"of"CWIN"to"plant"resistance"to"microbial"pathogens,"such"as"cell"wall"thickening,"accumulation"of"reactive"oxygen"species"(ROS)"and"hypersensitive"response"(HR),"accumulation"of"resistance"hormones"(SA"and"JA/ET),"biosynthesis"of"pathogenesis-related"protein"(e.g."PR"and"HSP"proteins)"and"secondary"metabolites"(such"as"phytotoxins"and"phenolics),"but"also"revealed"several"possible"new"mechanisms"including"the"signal"transduction"of"growth-promoting"hormone"(IAA"and"CTK)"and"senescence-promoting"hormone"(ABA)"and"proteolysis."This"study"can"provide"theoretical"guidance"for"the"improvement"of"tomato"resistance"to"B."cinerea"by"using"modern"biotechnologies"such"as"genetic"engineering"and"molecular"breeding.

    Keywords:"cell"wall"invertase;"Botrytis"cinerea;"tomato;"RNA-seq;"disease"resistance"gene

    DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2024.06.006

    番茄(Solanum"lycopersicum)是一種重要的蔬菜作物,在世界各地廣泛種植。近10年來我國番茄種植面積和產(chǎn)量均呈不斷上升的趨勢,2021年我國番茄產(chǎn)量達(dá)到0.68億t,約占世界總產(chǎn)量的35.8%,穩(wěn)居世界第一[1]。番茄栽培過程中常有多種病害發(fā)生,嚴(yán)重制約著番茄產(chǎn)量和品質(zhì)的進(jìn)一步提升[2]。其中,番茄灰霉病是一種世界性的真菌病害,尤其是隨著保護(hù)地番茄栽培面積的逐年增加,我國番茄灰霉病的發(fā)生越來越嚴(yán)重和頻繁,經(jīng)常造成大面積減產(chǎn),嚴(yán)重時甚至絕收[3-4]。番茄灰霉病是由灰葡萄孢菌(Botrytis"cinerea)侵染引起[5-6],該病菌是一種廣泛分布的植物真菌病原體,在侵染植物的過程中,因發(fā)病部位會產(chǎn)生大量灰色孢子,形成灰色霉層,因此該病被稱作灰霉病[7]。

    灰霉病主要為害番茄葉片、果實、花、莖、葉等部位[3-4]。盡管生物防治措施已逐漸用于番茄灰霉病的防治,但目前施用化學(xué)殺菌劑仍是防治灰霉病的主要措施[8]。一方面,化學(xué)藥劑防治灰霉病的成本非常高。如歐洲為防治作物灰霉病每年在采購化學(xué)藥劑上的花費高達(dá)5.4億歐元,約占世界殺菌劑市場總額的10%[9]。另一方面,殺菌劑不僅對環(huán)境和人類健康產(chǎn)生危害,長期施用所導(dǎo)致的病菌抗藥性也在一定程度上限制了殺菌劑的防治效果[10]。因此,選育抗病品種是解決番茄生產(chǎn)上灰霉病為害的有效措施之一。由于缺少抗性種質(zhì)資源,導(dǎo)致利用傳統(tǒng)育種手段進(jìn)行番茄灰霉病抗性育種受到限制。因此,有必要通過生理生化和基因工程等研究和技術(shù)手段來克服這一困難。

    已有研究表明,蔗糖分解代謝在植物抗病中發(fā)揮著重要作用,不僅可以為植物防御反應(yīng)(如細(xì)胞壁加厚、植物毒素合成等)提供所需的碳骨架和能量,而且蔗糖及其分解產(chǎn)生的己糖(葡萄糖和果糖)還可以作為信號分子調(diào)控抗病基因的表達(dá)[11]。植物體內(nèi)有兩大類分解蔗糖的酶,即轉(zhuǎn)化酶(invertase,"INV)和蔗糖合成酶(sucrose"synthase,"Sus)。根據(jù)亞細(xì)胞定位的不同,轉(zhuǎn)化酶可進(jìn)一步細(xì)分為細(xì)胞壁轉(zhuǎn)化酶(cell"wall"invertase,"CWIN)、液泡轉(zhuǎn)化酶(vacuolar"invertase,"VIN)和細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)化酶(cytosolic"invertase,"CIN)[12]。

    目前有關(guān)蔗糖分解代謝和植物抗病性的相關(guān)研究主要集中于CWIN。與其他3種蔗糖分解酶(VIN、CIN和Sus)不同,CWIN在質(zhì)外體空間水解蔗糖,這使CWIN在植物抗病中發(fā)揮著獨特的作用。首先,CWIN通過降低感染部位的蔗糖濃度從而促進(jìn)蔗糖沿濃度梯度從韌皮部向病菌感染部位運(yùn)輸和卸載,為植物防衛(wèi)反應(yīng)提供足夠的糖分供應(yīng)[12-14];其次,CWIN在質(zhì)外體空間分解產(chǎn)生的己糖可以作為信號分子激活植物的防衛(wèi)反應(yīng)。研究表明,植物防御反應(yīng)的啟動主要受質(zhì)外體空間己糖信號的調(diào)控,而不是細(xì)胞內(nèi)的己糖信號[15-16]。最后,病原菌成功侵入植物細(xì)胞之前,需要從植物的質(zhì)外體空間吸收糖分(主要是葡萄糖和果糖)來維持其生長發(fā)育[17-18]。因此,CWIN還可以通過調(diào)控質(zhì)外體空間蔗糖的分解速度和己糖含量來影響病菌的生長發(fā)育。已有研究表明,CWIN在植物抗病中的作用可能受病菌從植物寄主中獲取營養(yǎng)方式的影響,即CWIN可提高植物對死體營養(yǎng)型病菌(necrotrophic"pathogens)的抗性,但會降低其對活體營養(yǎng)型病菌(biotrophic"pathogens)的抗性[11]。

    然而,目前尚無CWIN對番茄灰霉病抗性影響的相關(guān)研究。由于灰霉病菌屬于死體營養(yǎng)性病菌[19],因此推測CWIN可提高番茄對灰霉病的抗性。前人通過RNA干擾(RNAi)技術(shù)下調(diào)番茄CWIN抑制因子基因(INVINH1)的表達(dá)可顯著提高番茄中的CWIN活性[20]。本研究以該轉(zhuǎn)基因番茄(RNAi)及其相應(yīng)的野生型番茄(WT)為材料,闡明CWIN對番茄灰霉病抗性的影響。同時,通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)初步揭示CWIN調(diào)控番茄灰霉病抗性的分子機(jī)制,為下一步利用基因工程、分子育種等現(xiàn)代生物技術(shù)手段提高番茄灰霉病抗性提供理論指導(dǎo)。

    1""材料與方法

    1.1""材料

    供試的野生型番茄(WT)為新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所培育的新番2號品種。利用RNAi技術(shù)下調(diào)WT番茄中CWIN抑制因子基因INVINH1的表達(dá),從而獲得CWIN活性上調(diào)的轉(zhuǎn)基因番茄(RNAi)[20]?;颐共【˙otrytis"cinerea)由海南大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院劉銅教授提供。

    1.2""方法

    1.2.1""番茄種植""各取30粒RNAi和WT種子,首先用70%無水乙醇浸泡并振蕩1"min。用蒸餾水清洗2遍后在0.2%"NaClO溶液中浸泡5"min,再使用蒸餾水清洗5遍。將消毒滅菌后的種子置于底部墊有濕潤濾紙的培養(yǎng)皿內(nèi),于培養(yǎng)箱中避光恒溫(27"℃)催芽5"d。種子露白后,將種子播種于24孔穴盤內(nèi)進(jìn)行育苗,所用基質(zhì)為直徑2~6"mm的蛭石。待子葉出土后,開始澆施1/2濃度的園試配方營養(yǎng)液。將20"d苗齡的番茄幼苗移栽至由土和生物有機(jī)肥組成的混合栽培基質(zhì)中(土肥比為3∶1),按照30"kg/667"m2的規(guī)格施入史丹利復(fù)合肥(N∶P∶K=15∶15∶15)作為基肥[21],然后盆栽于海南大學(xué)園藝學(xué)院實驗基地溫室內(nèi)。

    1.2.2""病菌接種""從移栽5周后的RNAi和WT植株從上往下選取第3、4片大小和形狀一致的復(fù)葉,用蒸餾水清洗干凈后用于灰霉菌接種試驗[21]。灰霉菌接種方法參照LIAN等[22]的方法。首先用SMB液體培養(yǎng)基制備灰霉菌孢子懸浮液,并調(diào)整孢子終濃度至2×104個/mL,然后將葉柄嵌入含有0.8%瓊脂的培養(yǎng)皿中,并保持葉面平整;在每片葉子主脈兩側(cè)各接種3滴孢子懸浮液,每滴約5"μL;密封培養(yǎng)皿避光恒溫(23"℃)培養(yǎng),分別于接種后12、60"h對番茄葉片進(jìn)行病情觀察并取樣。取樣時以接種部位為中心進(jìn)行打孔取樣,圓孔直徑為1"cm,共稱取0.15"g樣品,液氮速凍,置于–80"℃保存,用于后續(xù)總RNA的提取和酶活性測定。每個處理設(shè)置3個生物學(xué)重復(fù)。

    1.2.3""酶活性測定""參照TOMLINSON等[23]的方法,采用分光光度計法測定番茄葉片中CWIN活性。

    1.2.4""轉(zhuǎn)錄組測序與分析""對未接種(Mock)和接種(Bc)灰霉菌的WT(W)和RNAi(R)番茄葉片在12"h和60"h進(jìn)行取樣,每個處理3個生物學(xué)重復(fù),共24個樣品,然后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序??俁NA的提取純化與質(zhì)量評估、cDNA文庫的構(gòu)建、轉(zhuǎn)錄組測序委托廣州基迪奧生物科技有限公司完成。對下機(jī)的raw"reads利用fastp進(jìn)行質(zhì)控,過濾去除含adapter的reads、去除含N比例大于10%的reads、去除全部均為A堿基的reads、去除低質(zhì)量reads(質(zhì)量值Q≤20的堿基數(shù)占整條read的50%以上),得到clean"reads。利用HISAT2軟件對clean"reads與番茄參考基因組(ITAG4.0,"http://www.sgn.cornell.edu)開展基于參考基因組的比對分析。按照FDRlt;0.05且|log2FC|gt;1的基因為顯著差異基因的篩選標(biāo)準(zhǔn),進(jìn)行差異表達(dá)基因的篩選。通過廣州基迪奧生物科技有限公司提供的在線網(wǎng)站(https://www.omicsmart."com)進(jìn)行差異表達(dá)基因的GO和KEGG富集分析,其中KEGG通路圖是利用pathview在線網(wǎng)站(https://pathview."uncc.edu/analysis)制成,利用MapMan軟件檢測生物脅迫過程中的差異表達(dá)基因。

    1.2.5nbsp;"RNA-seq結(jié)果的qRT-PCR驗證""以轉(zhuǎn)錄組測序使用的總RNA為模板,使用諾唯贊HiScript"Ⅲ"All-in-one"RT"SuperMix"Perfect"for"qPCR(R333)逆轉(zhuǎn)錄試劑盒對RNA樣品進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,使用諾唯贊ChamQ"Universal"SYBR"qPCR"Master"Mix(Q711)試劑盒,通過德國耶拿qTOWER3G定量PCR儀定量分析基因的相對表達(dá)水平。使用NCBI"Primer-Blast工具(https://www.ncbi.nlm.nih."gov/tools/primer-blast/)設(shè)計基因特異性引物對,以番茄a(bǔ)ctin基因作為參照基因、根據(jù)2-ΔΔCT方法計算轉(zhuǎn)錄物的相對表達(dá)水平。qRT-PCR驗證所用到的基因和引物信息見表1。

    1.3""數(shù)據(jù)處理

    利用Excel"2020軟件對酶活性數(shù)據(jù)進(jìn)行作圖并進(jìn)行t-test分析。

    2""結(jié)果與分析

    2.1""WT和RNAi番茄在灰霉病抗性上的差異

    將WT和RNAi番茄葉片接種灰霉病菌后,分別于接種后12、60"h觀察發(fā)病程度的差異。結(jié)果表明,接種后12"h,WT和RNAi番茄葉片均無明顯病斑(圖1A);在接種后60"h,WT和RNAi番茄葉片均出現(xiàn)明顯病斑,但WT葉片的病斑面積明顯大于RNAi葉片(圖1A中箭頭所示)。CWIN活性測定表明,在0"h時RNAi番茄葉片的CWIN活性比WT高73%;而在接種后12、60"h,WT和RNAi的CWIN活性無顯著差異。并且隨著接種時間的延長,WT和RNAi葉片的CWIN活性均呈快速上升的趨勢(圖1B),表明接種灰霉菌可誘導(dǎo)番茄葉片CWIN活性的上升。綜上表明,RNAi番茄葉片中的高CWIN活性可提升番茄對灰霉病的抗性。

    2.2""轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析

    對未接種(Mock)和接種(Bc)灰霉菌的WT(W)和RNAi(R)番茄葉片在12"h和60"h進(jìn)行取樣,然后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。將經(jīng)過質(zhì)控后的數(shù)據(jù)與番茄基因組進(jìn)行比對,其中單一比對結(jié)果的比例是65.43%~95.28%,clean"reads總數(shù)為1"047"124"488;通過對過濾后數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量評估,各樣品Q30堿基百分比≥93.02%,GC含量為41.88%~42.47%(表2),說明測序質(zhì)量較高,數(shù)據(jù)可信度較高。在剔除2個離群樣本后(W-Mock-"12"h-2和W-Bc-60"h-2),樣本間相關(guān)性熱圖分析表明r值均大于0.80(圖2),表明同一處理不同重復(fù)樣品間具有較好的重復(fù)性,可用于后續(xù)分析研究。

    2.3""差異表達(dá)基因(DEGs)分析

    按照FDRlt;0.05和|log2FC|gt;1的雙重標(biāo)準(zhǔn)來篩選顯著差異表達(dá)基因(DEG)。對番茄接種灰霉病菌前后的DEGs(R-Mock-vs-R-Bc和W-Mock-vs-"W-Bc)進(jìn)行分析(圖3A)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與未接種灰霉病菌番茄相比,接種12"h后WT和RNAi番茄的DEGs總數(shù)(上調(diào)和下調(diào))分別為4個和6個,接種60"h的DEGs總數(shù)則分別為76個和163個。與接種早期相比,接種后期番茄葉片的DEGs數(shù)量更多,并且接種后(特別是60"h)RNAi番茄的DEGs數(shù)量明顯高于WT。進(jìn)一步分析表明,與未接種灰霉病菌相比,接種12"h后WT和RNAi番茄葉片上調(diào)的基因數(shù)量分別為1個和3個,接種60"h的上調(diào)基因數(shù)量分別為52個和137個。同樣,與未接種灰霉病菌相比,接種12"h后WT和RNAi番茄葉片下調(diào)的基因數(shù)量均為3個,接種60"h后的下調(diào)基因數(shù)量分別為24個和26個。表明接種病菌后,RNAi番茄上調(diào)的基因數(shù)量多于WT,而二者的下調(diào)基因數(shù)差異不大。因此,接種后WT和RNAi在上調(diào)基因數(shù)量上的差異可能是導(dǎo)致抗病性差異的主要原因。值得注意的是,WT和RNAi葉片上調(diào)DEGs和下調(diào)DEGs在接種12"h和60"h之間均無重疊,均為各自所特有的DEGs,表明番茄葉片在接種灰霉病菌早期和后期的防御機(jī)制存在較大差異。

    總體來看,在2個取樣時期中,共有169個基因在R-Mock-vs-R-Bc中差異表達(dá),80個基因在W-Mock-vs-W-Bc中差異表達(dá)(圖3B),表明灰霉病菌對RNAi番茄基因表達(dá)的影響大于WT番茄。并且R-Mock-vs-R-Bc的DEGs和W-Mock-"vs-W-Bc的DEGs之間重疊的數(shù)量非常少,其中W-Mock-60"h-vs-W-Bc-60"h和R-Mock-60"h-vs-R-"Bc-60"h的DEGs之間僅有19個共同的DEGs,而W-Mock-60"h-vs-W-Bc-60"h和R-Mock-12"h-vs-R-"Bc-12"h的DEGs之間則僅有1個共同的DEG,表明RNAi番茄接種灰霉病菌后出現(xiàn)大量未重疊的DEGs(R-Mock-vs-R-Bc)可能是增強(qiáng)番茄對灰霉病抗性的重要基因。

    為進(jìn)一步發(fā)掘?qū)е翿NAi抗病性增強(qiáng)的DEGs,對接種灰霉病菌后WT和RNAi番茄之間的DEGs進(jìn)行分析(W-Bc-vs-R-Bc)(圖4)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與接種后12"h和60"h的WT相比,RNAi番茄上調(diào)的基因分別有406個和362個,下調(diào)的基因分別有183個和112個(圖4A)。與接種后期(60"h)相比,接種早期(12"h)的DEGs總數(shù)更多,接種12"h和60"h,DEGs數(shù)量分別為589個和474個;并且接種后12"h和60"h,上調(diào)的DEGs數(shù)量均明顯高于下調(diào)DEGs數(shù)量,其中大部分為每個時期所特有的DEGs,只有85個為共同的DEGs(圖4B),表明RNAi番茄葉片在接種灰霉病菌早期和后期的防御機(jī)制存在較大差異。綜上,接種灰霉病菌后WT和RNAi對比(W-Bc-vs-"R-Bc)得到的DEGs數(shù)量(圖4)高于WT接種前后對比(W-Mock-vs-W-Bc)和RNAi接種前后對比(R-Mock-vs-R-Bc)得到的DEGs總數(shù)(圖3)。因此,后續(xù)的轉(zhuǎn)錄組分析僅聚焦于接種灰霉病菌后WT和RNAi對比(W-Bc-vs-R-Bc)得到的DEGs。

    2.4""差異表達(dá)基因的GO富集分析

    利用GO數(shù)據(jù)庫,對上述589個W-Bc-12"h-vs-"R-Bc-12"h的DEGs和474個W-Bc-60"h-vs-R-Bc-"60"h的DEGs進(jìn)行GO富集分析,發(fā)現(xiàn)12"h和60"h的DEGs分別分布在三大類功能注釋中的39個和46個類別。其中,12"h的DEGs在生物學(xué)過程(biological"process,"BP)、分子功能(molecular"function,"MF)和細(xì)胞組分(cellular"component,"CC)中分別有20個、8個和11個類別(圖5A),而60"h的DEGs在上述三大類功能注釋中分別有21個、11個和14個類別(圖5B)。因此,接種12"h和60"h的DEGs均主要集中于BP,其次是CC,第三為MF。進(jìn)一步分析表明,接種12"h的BP包括代謝過程、細(xì)胞過程、單生物過程、應(yīng)激反應(yīng)等詞條,MF包括催化活性、粘合、轉(zhuǎn)運(yùn)活性和核酸結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子活性等詞條,CC包括細(xì)胞、細(xì)胞組分、細(xì)胞器和膜等詞條。值得注意的是,盡管接種60"h和12"h的DEGs在三大類功能注釋中的詞條種類和數(shù)目存在一定的差異,但接種60"h的DEGs在三大類功能注釋中的前5個詞條和接種12"h的完全一致,表明CWIN在接種灰霉病菌早期和后期調(diào)控番茄抗病性的機(jī)理存在一定的相似性。

    2.5""差異表達(dá)基因的KEGG注釋和MapMan圖

    在生物體內(nèi),不同蛋白相互協(xié)調(diào)行使其生物學(xué)功能,基于Pathway的分析有助于更進(jìn)一步了解DEG的生物學(xué)功能,KEGG是有關(guān)Pathway的主要公共數(shù)據(jù)庫[24]。將2.3中的DEGs在KEGG數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行Pathway注釋發(fā)現(xiàn),W-Bc-12"h-vs-R-Bc-12"h的DEGs共富集到85個通路,其中只有5個顯著性富集的通路(圖6A),包括次生代謝物生物合成(biosynthesis"of"secondary"metabolites)、代謝途徑(metabolic"pathways)、DNA復(fù)制(DNA"replication)、淀粉和蔗糖代謝(starch"and"sucrose"metabolism)以及甾族化合物生物合成(steroid"biosynthesis);W-Bc-60"h-vs-R-"Bc-60"h的DEGs共富集到74個通路,但未發(fā)現(xiàn)顯著性富集的通路(圖6B),排名前五的通路分別是次生代謝物生物合成、光合生物碳固定(carbon"fixation"in"photosynthetic"organisms)、氮代謝(nitrogen"metabolism)、其他多糖降解(other"glycan"degradation)和過氧化物酶體(peroxisome)。因此,KEGG分析表明,與CWIN增強(qiáng)番茄對灰霉病抗性密切相關(guān)的通路主要存在于接種早期(12"h),且最顯著富集的通路是次生代謝物生物合成,而在接種后期(60"h)則無顯著富集的通路。

    為進(jìn)一步鑒定出與灰霉病抗病性密切相關(guān)的DEGs,嘗試將所有DEGs整合到植物-病原菌互作中(圖7)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),接種后12"h和60"h的DEGs主要富集到4個通路中,包括超敏反應(yīng)(hypersensitive"response)、細(xì)胞壁增強(qiáng)(cell"wall"reinforcement)、氣孔關(guān)閉(stomatal"closure)和防御相關(guān)基因誘導(dǎo)(defense-related"gene"induction)。與WT相比,接種12"h的RNAi番茄的超敏反應(yīng)和胞壁增強(qiáng)通路中的的鈣依賴蛋白激酶基因CDPK(Solyc02g083850.3)以及防御相關(guān)基因誘導(dǎo)通路中的基因Pti5(Solyc02g077370.1)、Rd19(Solyc01g110110.3)和PR1(Solyc01g106605.1、Solyc01g106620.2和Solyc09g007010.1),其表達(dá)下調(diào),而同時參與超敏反應(yīng)和防御相關(guān)基因誘導(dǎo)通路的基因FLS2(Solyc02g072440.4)表達(dá)上調(diào)。接種60"h時,RNAi番茄中與超敏反應(yīng)有關(guān)的熱激蛋白基因HSP90(Solyc07g047790.3)表達(dá)上調(diào),而氣孔關(guān)閉和細(xì)胞壁增強(qiáng)基因CaLM/CML(Solyc03g118810.1)、防御相關(guān)基因誘導(dǎo)基因Rd19(Solyc01g110110.3)則表達(dá)下調(diào)。綜上,所有1063個DEGs中僅有9個基因富集到植物-病原菌互作通路中,表明這些基因可能在CWIN增強(qiáng)番茄對灰霉病抗性過程中發(fā)揮著重要的作用。

    植物激素(如水楊酸和茉莉酸等)在植物抗病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用[25]。通過將相關(guān)DEGs整合到植物激素信號通路中(圖8),發(fā)現(xiàn)與WT相比,接種灰霉病菌后RNAi番茄的1個生長素內(nèi)向轉(zhuǎn)運(yùn)載體基因Aux1(Solyc10g055260.2,"auxin"influx"carrier)和5個生長素響應(yīng)蛋白基因Aux/"IAA(Solyc01g097290.4、Solyc06g053830.3、Solyc08g021820.3、Solyc09g083280.3、Solyc09g"083290.3,"auxin-responsive"protein)、2個生長素響應(yīng)基因GH3(Solyc07g054580.3、Solyc10g008520.3,"auxin"responsive"GH3"gene"family)的表達(dá)均上調(diào),只有1個生長素響應(yīng)因子基因ARF(Solyc04g"081240.2,"auxin"response"factor)的表達(dá)下調(diào),但ARF是生長素信號途徑中的負(fù)調(diào)控因子[26-27]。

    和生長素信號途徑類似,接種灰霉病菌后RNAi番茄的細(xì)胞分裂素信號途徑也呈現(xiàn)上調(diào)趨勢,包括2個細(xì)胞分裂素受體基因CRE1(Solyc04g008110.3、Solyc04g008110.3,"cytokinin"receptor)、2個AHP基因(Solyc01g098400.3、Solyc08g066350.2,"histidine-containing"phosphotransfer"protein)和1個A-ARR基因(Solyc05"g006420.3,"two-component"response"regulator"ARR-A"family)的表達(dá)均上調(diào)。此外,乙烯信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑的1個EIN3基因(Solyc01g006650.2,"ethylene-insensitive"protein"3)和1個乙烯響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子基因ERF1/2(Solyc05g051180.3,"ethylene-"responsive"transcription"factornbsp;1)的表達(dá)同樣上調(diào)。

    方框被分成2個部分,左側(cè)表示W(wǎng)-Bc-12"h-vs-R-Bc-12"h,右側(cè)表示W(wǎng)-Bc-60"h-vs-R-Bc-60"h。灰色框或無顏色填充框表示沒有為該KO(KEGG"Ontology)項分配DEG。顏色漸變代表log2倍率,紅色代表上調(diào),綠色代表下調(diào)。

    值得注意的是,RNAi番茄的脫落酸信號途徑的1個PP2C基因(Solyc07g040990.4,"protein"phosphatase"2C)的表達(dá)出現(xiàn)下調(diào),這可能會導(dǎo)致病菌侵染期間氣孔關(guān)閉受阻,這與植物病原菌互作通路分析(圖7)得到的結(jié)果相同。最后,水楊酸信號途徑上游的1個TGA基因(Solyc05g"009660.4,"transcription"factor)的表達(dá)上升,但下游3個PR-1基因(Solyc01g106605.1、Solyc01g"106620.2、Solyc09g007010.1,"pathogenesis-related"protein"1)的表達(dá)下降,表明RNAi番茄葉片中的水楊酸信號途徑總體呈減弱的趨勢??傮w而言,與WT相比,接種后RNAi番茄葉片中的生長素、細(xì)胞分裂素、乙烯信號途徑增強(qiáng),而脫落酸和水楊酸信號途徑則減弱。

    為進(jìn)一步鑒定番茄對灰霉病抗性相關(guān)的DEGs,利用MapMan軟件對上述DEGs進(jìn)行生物脅迫相關(guān)基因分析(圖9)。在激素信號方面,RNAi番茄在生長素和乙烯信號途徑方面得到增強(qiáng),在脫落酸信號途徑上減弱,這和植物激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路圖的分析結(jié)果一致。此外,MapMan圖還揭示出RNAi番茄在油菜素內(nèi)酯和茉莉酸途徑上也得到增強(qiáng),而這2種激素信號途徑的增強(qiáng)也有助于提高植物的抗病性[25]。

    此外,RNAi番茄在細(xì)胞壁合成、蛋白水解、氧化還原狀態(tài)、過氧化物酶、抗病信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、次生代謝物方面也得到極大的加強(qiáng),特別是次生代謝物相關(guān)基因的上調(diào)與KEGG分析結(jié)果一致(圖6)。值得注意的是,和植物抗病密切相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子MAPK和WRKY出現(xiàn)下調(diào)或者未富集到的情況,這和前人的研究結(jié)果[28]并不相同,表明MAPK和WRKY并未參與防御反應(yīng),CWIN對番茄灰霉病抗性的調(diào)控具有其特有的機(jī)制。

    2.6""RNA-seq數(shù)據(jù)的qRT-PCR驗證

    為驗證RNA-seq數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性,選取10個DEGs(表1),并使用與RNA-seq相同的總RNA進(jìn)行qRT-PCR試驗。結(jié)果表明,qRT-PCR相對表達(dá)量的對數(shù)值與RNA-seq分析的log2FC趨勢一致(圖10),表明本研究的RNA-seq數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可靠。

    3""討論"

    已有研究表明,CWIN可提高植物對死體營養(yǎng)型病菌的抗性,但會降低植物對活體營養(yǎng)型病菌的抗性[11]。如超表達(dá)CWIN基因的水稻對死體營養(yǎng)型細(xì)菌病菌Xanthomonas"oryzae"pv."oryzae和真菌病菌Magnaporthe"oryzae的抗性均明顯增強(qiáng)[29]。通過RNA干擾技術(shù)抑制煙草中CWIN的表達(dá)則導(dǎo)致植株對死體營養(yǎng)型卵菌病原菌Phytophthora"nicotianae的抗性降低[30]。與此相反,CWIN可降低植物對活體營養(yǎng)型病菌的抗性。如番茄CWIN基因LIN8的沉默不僅未降低番茄植株的抗性,反而增加了其對活體營養(yǎng)型細(xì)菌病菌Xanthomonas"campestris"pv."vesicatoria的抗性[31]。同樣,通過超表達(dá)CWIN抑制因子的方法降低CWIN的活性導(dǎo)致擬南芥對活體營養(yǎng)型真菌病菌Plasmodiophora"brassicae抗性增加[32]?;颐共∈欠焉a(chǎn)中常見的病害,灰霉病菌屬于死體營養(yǎng)性病菌[19],推測CWIN活性的升高會增強(qiáng)番茄對灰霉病的抗性。通過灰霉病菌離體接種試驗研究表明,提高CWIN活性確實可顯著增強(qiáng)番茄對灰霉病的抗性。對番茄葉片CWIN活性的測定表明,接種0"h,RNAi番茄葉片的CWIN活性顯著高于WT。接種12、60"h后,2種基因型番茄葉片的CWIN活性受灰霉菌的誘導(dǎo)均呈快速上升趨勢,導(dǎo)致CWIN活性在RNAi和WT上的差異消失。因此,RNAi和WT的抗病性差異主要是由于接種早期的CWIN活性差異導(dǎo)致的。此結(jié)果和前人研究結(jié)果[33-34]一致,即接種病菌后CWIN活性上升早有利于提高植物的抗病性,而CWIN活性上升晚則不利于增強(qiáng)其抗病性。

    對2種基因型番茄接種和未接種灰霉菌12、60"h的葉片進(jìn)行取樣和轉(zhuǎn)錄組測序后,分別對接種前后番茄的DEGs(W-Mock-vs-W-Bc和R-Mock-vs-R-Bc)及其接種后2種基因型番茄的DEGs(W-Bc-vs-R-Bc)進(jìn)行分析,分析結(jié)果均顯示:接種12、60"h的DEGs之間的重疊數(shù)量非常少,這表明番茄葉片在接種早期和接種后期的防御反應(yīng)存在較大差異。不同的是前者分析表明,接種后期(60"h)番茄葉片的DEGs數(shù)量大幅高于接種早期(12"h),而后者分析表明,接種早期(12"h)DEGs總數(shù)明顯高于接種后期(60"h)??紤]到接種早期是病菌侵染的關(guān)鍵時期且2種基因型番茄的CWIN活性差異僅存在于接種早期,因此對接種早期更多數(shù)量的DEGs分析有助于闡明CWIN調(diào)控灰霉病抗性的分子機(jī)制并挖掘關(guān)鍵抗病基因。據(jù)此后續(xù)的轉(zhuǎn)錄組分析僅聚焦于W-Bc-vs-R-Bc分析得到的DEGs。

    對DEGs(W-Bc-vs-R-Bc)的KEGG注釋表明,接種灰霉病菌12"h的DEGs共富集到85個通路上,其中只有5個顯著性富集的通路,包括次生代謝物生物合成(biosynthesis"of"secondary"metabolites)、代謝途徑(metabolic"pathways)、DNA復(fù)制(DNA"replication)、淀粉和蔗糖代謝(starch"and"sucrose"metabolism)以及甾族化合物生物合成(steroid"biosynthesis);雖然接種60"h的DEGs共富集到74個通路,但并未發(fā)現(xiàn)顯著性富集的通路。KEGG注釋表明,與CWIN增強(qiáng)番茄對灰霉病抗性密切相關(guān)的DEGs可能主要存在于接種早期,這與接種后12"h比60"h具有更多數(shù)量的DEGs分析結(jié)果一致。

    上述KEGG注釋雖然發(fā)現(xiàn)5個DEGs顯著富集的通路,但這些通路中的基因并不是均與植物的抗病性相關(guān),因此繼續(xù)進(jìn)行植物-病原菌互作圖分析,以鑒定出和番茄抗病性密切相關(guān)的基因。結(jié)果發(fā)現(xiàn),有9個DEGs富集到4類通路中,其中值得關(guān)注的是同時參與超敏反應(yīng)和防御相關(guān)基因誘導(dǎo)的基因FLS2(Solyc02g072440.4)以及參與與超敏反應(yīng)有關(guān)的熱激蛋白基因HSP90(Solyc07g047790.3),與接種后的WT相比,這2個基因在接種后的RNAi番茄中均顯著上調(diào)。研究表明,F(xiàn)LS2是富含亮氨酸重復(fù)(LRR)受體類絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(LRR-receptor"serine/"threonine-like"kinase),是植物的先天性免疫系統(tǒng)的重要組成部分,構(gòu)成植物防御病原微生物感染的第一道防線,同時對系統(tǒng)獲得性抗性(SAR)的激活也有重要的影響[35-36]。此外,超敏反應(yīng)是植物抵抗病菌侵染最有效和最直接的抗性反應(yīng)之一[37],而HSP90基因作為超敏反應(yīng)的下游成分,可通過激活植物的超敏反應(yīng)來提高植物的抗病性[38]。因此,F(xiàn)LS2和HSP90這2個基因可能是CWIN增強(qiáng)番茄對灰霉病抗性途徑中的重要基因。

    植物激素如水楊酸(SA)和茉莉酸(JA)在植物抗病中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用[25]。通過繼續(xù)將相關(guān)DEGs整合到植物激素信號通路中,發(fā)現(xiàn)與WT相比,接種灰霉病菌后RNAi番茄的生長素(IAA)、細(xì)胞分裂素(CTK)和乙烯(ET)信號途徑增強(qiáng),而脫落酸(ABA)和SA信號途徑則減弱。生物脅迫相關(guān)基因的MapMan作圖分析也部分驗證了上述結(jié)果,即接種灰霉病菌后RNAi番茄在IAA和ET信號途徑得到增強(qiáng),而ABA信號途徑減弱。此外,MapMan作圖還發(fā)現(xiàn)RNAi番茄在油菜素內(nèi)酯(BR)和茉莉酸(JA)途徑上也得到增強(qiáng)。

    植物激素在廣義上也屬于次生代謝物,因此該結(jié)果和KEGG注釋得到結(jié)果一致,即次生代謝物生物合成是富集到的顯著性最高的通路。在植物激素中,SA和JA/ET因其在植物抗病中的重要作用而被稱作抗病相關(guān)激素,其中SA可增強(qiáng)植物對活體營養(yǎng)型病菌(如Pst"DC3000)的抗性,而JA/ET可增強(qiáng)植物對死體營養(yǎng)型病菌(如灰霉病菌)的抗性,且SA和JA/ET之間存在拮抗作用[25,"39]。因此,接種灰霉病菌后RNAi番茄中JA和ET信號途徑的上調(diào)可增加番茄對灰霉病的抗性,同時SA信號途徑的減弱也可進(jìn)一步增強(qiáng)JA/ET信號途徑的作用。IAA和CTK被稱作生長促進(jìn)激素,而ABA屬于衰老促進(jìn)激素[40]。接種后,RNAi番茄葉片中的IAA和CTK信號途徑增強(qiáng),而ABA信號途徑減弱,這樣可以抑制病菌侵染期間細(xì)胞的死亡,從而阻止灰霉病菌從死亡細(xì)胞上獲得必要的養(yǎng)分供應(yīng)用于侵染番茄。雖然在正常生長發(fā)育條件下,乙烯也屬于衰老相關(guān)激素,但在病菌脅迫下,乙烯信號途徑的主要作用是增強(qiáng)植物的抗病性[25,"40]??傊?,CWIN轉(zhuǎn)化酶可通過調(diào)控植物激素信號途徑來增強(qiáng)番茄對灰霉病的抗性。此外,MapMan圖還揭示接種灰霉病菌后RNAi番茄在細(xì)胞壁代謝、蛋白水解、活性氧(氧化還原狀態(tài)和過氧化物酶)、次生代謝物方面也得到極大的加強(qiáng),其中次生代謝物相關(guān)基因的上調(diào)和KEGG分析結(jié)果一致,而這些途徑也均有助于增強(qiáng)植物的抗病能力[41-42]。

    以往有關(guān)CWIN調(diào)控植物抗病性的研究主要通過組織學(xué)、生理生化、qRT-PCR等方法[29-32],尚無采用轉(zhuǎn)錄組測序方法進(jìn)行研究的報道。已有研究結(jié)果表明,CWIN主要通過激活植物防御反應(yīng)來提高植物對死體營養(yǎng)型病害的抗性,包括細(xì)胞壁加厚(如胼胝質(zhì)合成)、活性氧積累和超敏反應(yīng)(HR)、抗病激素的積累(主要是水楊酸、茉莉酸和乙烯)、病程相關(guān)蛋白(如PR蛋白)和次生代謝物的合成(如植物毒素和多酚等)、氣孔關(guān)閉等[41-42]。本研究轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果不僅部分驗證了已有研究結(jié)果,而且還發(fā)現(xiàn)CWIN調(diào)控番茄對灰霉病的抗性新機(jī)制和新途徑。如在植物激素信號途徑方面,除了發(fā)現(xiàn)抗病激素水楊酸、茉莉酸和乙烯外,還發(fā)現(xiàn)生長素、細(xì)胞分裂素和脫落酸信號途徑也參與了CWIN對植物抗病性的調(diào)控。此外,大量蛋白水解相關(guān)基因在RNAi番茄中顯著上調(diào),鑒于灰霉病菌的致病因子包含了多種酶,如天冬氨酸蛋白酶、多聚半乳糖醛酸酶和漆酶[43-44],同時灰霉病還可分泌大量寄主降解酶[45]。因此,RNAi番茄很可能通過上調(diào)蛋白水解相關(guān)基因的表達(dá)來防御灰霉病菌的侵染。

    此外,本研究還發(fā)現(xiàn)有些抗病機(jī)制與已有研究結(jié)果不同。首先,前人研究表明,CWIN可通過減小氣孔的開度來防治病菌通過氣孔侵染植物,從而提高植物的抗病能力[41-42]。然而,本研究表明,促進(jìn)氣孔關(guān)閉的基因CaLM/CML和PP2C的表達(dá)在RNAi番茄中下調(diào),這可能會抑制氣孔在病原菌侵染時的關(guān)閉,從而導(dǎo)致發(fā)病加重,但實際情況卻是RNAi番茄的抗性增強(qiáng)。其原因可能是本研究在離體條件下進(jìn)行,如果植物氣孔關(guān)閉幅度過大則葉片可能會因為不能進(jìn)行正常光合作用從而導(dǎo)致葉片的糖分供應(yīng)減少,而RNAi番茄適當(dāng)增加氣孔的開度可為防御反應(yīng)提供更多的糖分供應(yīng),從而有助于提高番茄的抗病能力。其次,與植物抗病密切相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子MAPK和WRKY出現(xiàn)下調(diào)或者未富集到的情況,這與前人研究結(jié)果[28]并不相同。這些證據(jù)表明,CWIN調(diào)控番茄-灰霉病菌互作的機(jī)制有其獨特之處,可能與其他植物-病菌互作體系(pathosystem)不同。

    總之,本研究不僅表明提高番茄的CWIN活性可顯著增強(qiáng)番茄對灰霉病的抗性,而且通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)系統(tǒng)研究了CWIN增強(qiáng)番茄抗病性的分子機(jī)制,不僅驗證了已有的CWIN抗病機(jī)制,而且還挖掘出一些新的CWIN抗病機(jī)制,這將為下一步利用基因工程、分子育種等現(xiàn)代生物技術(shù)手段提高番茄對灰霉病的抗性提供理論指導(dǎo)。

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