李艷娜,張富源,程偉峰,桑亞新,王向紅,*
(1.河北農(nóng)業(yè)大學食品科技學院,河北保定 071000;2.河北雅果食品有限公司,河北保定 071000)
升麻屬植物為毛茛科多年生草本植物,約有10 余種主產(chǎn)于我國各地[1]。升麻在我國是一種常用中藥,也是藥食同源目錄中的一種食物,為大三葉升麻、興安升麻和升麻的干燥根莖。由于其具備成本較低、毒副作用較小、不易產(chǎn)生耐藥性等優(yōu)點,三個升麻品種均被收錄于2015 年版《中國藥典》[2]。其中,興安升麻又名為苦老芽、窟窿牙,在我國廣泛分布于內(nèi)蒙古、山西、河北、遼寧和黑龍江等地[3]。作為一種藥用植物,興安升麻具有清熱解毒、發(fā)表透疹等功效,常被用于治療咽喉腫痛、風熱頭痛、子宮脫垂等病癥[2]。它又是一種純天然的山野菜,將剛生長出的嫩芽制作后食用,入口微苦、先苦后甜,有良好清熱敗火、抗菌消炎功效,食療效果較好[4-7],具有較高研究價值。
研究發(fā)現(xiàn),升麻屬植物中富含多種活性成分,具有重要的藥理活性功能,如抗病毒、抗炎、抗骨質(zhì)疏松、治療婦女更年期綜合癥等[8-10],在維護人體健康及防治相關(guān)疾病方面具有較高的研究價值。升麻屬植物中酚酸類、萜類等化合物是較好的抗炎活性成分,如阿魏酸、異阿魏酸等。我國每年約有超過1000 萬人遭受皮膚創(chuàng)傷,當皮膚受損后,皮膚的完整性及功能性會受到破壞,迫使血管破裂、引發(fā)炎癥反應(yīng)、造成機體的感染,甚至危及生命[11-12]。因此,作為連接機體與外界環(huán)境的第一關(guān),快速修復(fù)皮膚創(chuàng)傷至關(guān)重要[13]。但是傷口愈合的速度及愈合質(zhì)量會受到諸多因素的影響,其中,傷口炎癥、細菌感染是影響傷口愈合的重要因素之一。前期研究發(fā)現(xiàn),具有良好抗菌消炎作用的興安升麻能夠有效促進傷口愈合,嚴格防止細菌感染[14],但是由于其成分復(fù)雜,對于發(fā)揮藥效活性成分群及作用機制尚不清晰。
網(wǎng)絡(luò)藥理學是一門多學科技術(shù)和內(nèi)容相結(jié)合的交叉學科,通過分析生物網(wǎng)絡(luò)解釋藥物成分與疾病靶點之間的復(fù)雜關(guān)系,并揭示其作用機制[15-16]。Deng等[15]探索了桔梗治療肺癌的潛在作用機制,表明桔梗可能是通過MAPK 和P13K-AKT 等潛在信號通路來治療肺癌?;诰W(wǎng)絡(luò)藥理學研究發(fā)現(xiàn)桃紅四物湯主要通過抑菌作用及改善血液流變學等途徑,治療關(guān)節(jié)置換后假體周圍感染[17]。因此,基于網(wǎng)絡(luò)藥理學方法分析藥物與機體之間的關(guān)系已經(jīng)受到研究者的廣泛關(guān)注,逐漸成為研究熱點,但尚未見與基于網(wǎng)絡(luò)藥理學預(yù)測興安升麻作用機制的相關(guān)研究。
由于興安升麻發(fā)揮促進皮膚傷口愈合功效的活性成分及作用機制尚不明確,本研究以興安升麻為原料,采用醇提法提取生物活性物質(zhì),并通過HPLCMS 技術(shù)分析鑒定興安升麻醇提物的活性化學成分。通過網(wǎng)絡(luò)藥理學進一步分析預(yù)測其促愈作用機制,以期為興安升麻的開發(fā)與應(yīng)用提供參考。
興安升麻(Cimicifuga dahurica(Turcz.) Maxim.) 購于河北省張家口市,多年生草本植物;無水乙醇 純度≥95.0%,天津市富宇精細化工有限公司;乙腈 純度≥99.9%,上海拜力生物科技有限公司;甲酸 色譜純,梯希愛化成工業(yè)發(fā)展有限公司;甲酸銨 純度≥99.9%,西格瑪奧德里奇貿(mào)易有限公司。
RE-52A 型旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀 上海亞榮生化儀器廠;SHB-Ⅲ型循環(huán)水式多用真空泵 保定高新區(qū)陽光科教儀器廠;FD5-2.5 型真空冷凍干燥機 SIM 儀器有限公司;H1850-R 型冷凍離心機 湘儀離心機儀器有限公司;U3000 型液相色譜儀、QE Focus 高分辨質(zhì)譜儀 賽默飛世爾科技有限公司。
1.2.1 興安升麻活性物質(zhì)的提取 將興安升麻凍干,粉碎,過60 目篩。稱取5 g 粉末,加入60 mL 78%乙醇混合均勻,在室溫條件下醇提3 次,每次靜置提取12 h。將醇提液合并、過濾,8000 r/min 離心5 min,收集上清液于37 ℃下旋蒸除去乙醇,再經(jīng)冷凍干燥,最終獲得醇提物干粉。
1.2.2 化學成分的鑒定 通過HPLC-MS 檢測,根據(jù)精確分子量及數(shù)據(jù)庫篩選分析興安升麻醇提物的化學成分,并應(yīng)用面積歸一法進行定量[18]。
1.2.2.1 色譜條件 采用ACQUITY UPLC? HSS T3(2.1 mm×150 mm,1.8 μm)色譜柱,自動進樣器溫度設(shè)為8 ℃,以0.25 mL/min 的流速,40 ℃的柱溫,進樣2 μL 進行梯度洗脫,流動相為正離子0.1%甲酸水(C)-0.1%甲酸乙腈(D);負離子5 mmol/L 甲酸銨水(A)-乙腈(B)。
1.2.2.2 質(zhì)譜條件 儀器使用電噴霧離子源(ESI),正負離子電離模式,正離子噴霧電壓為3.50 kV,負離子噴霧電壓為2.50 kV,鞘氣30 arb,輔助氣10 arb。毛細管溫度325 ℃,以分辨率70000 進行全掃描,掃描范圍81~1000 aum。
1.2.3 靶點的篩選及預(yù)測 利用Pubchem 數(shù)據(jù)庫獲取興安升麻化學成分的結(jié)構(gòu),將其導入SwissADME數(shù)據(jù)庫,以“胃腸道吸收為高且類藥性滿足兩個條件”為標準,并結(jié)合文獻篩選出有效成分,并根據(jù)靶點可能性通過SwissTargetPrediction 數(shù)據(jù)庫篩選及預(yù)測有效成分的潛在靶點,再利用UniProt 蛋白數(shù)據(jù)庫篩選出具有相應(yīng)基因的有效靶點。以“皮膚傷口(skin wound)”為關(guān)鍵詞,通過GeneCards、OMIM及DrugBank 數(shù)據(jù)庫搜索與此相關(guān)的疾病靶點。將其與興安升麻的有效靶點進行匹配,得到興安升麻促進皮膚傷口愈合的相關(guān)靶點。
1.2.4 “藥物-成分-疾病-靶點”網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建 采用Cytoscape3.9.0 軟件構(gòu)建“藥物-成分-疾病-靶點”網(wǎng)絡(luò),并進行可視化分析。其中,節(jié)點分別代表藥物、有效成分、皮膚傷口及靶點,邊代表節(jié)點之間的相互關(guān)系。
1.2.5 蛋白互相作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建 將交集靶點導入String 數(shù)據(jù)庫,進行蛋白互相作用分析,以得分≥0.7 為標準篩選相互作用關(guān)系,并根據(jù)degree 值篩選出前20 個靶點作為核心靶點;將其導入Cytoscape軟件,構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖。
1.2.6 生物功能的分析 利用DAVID 數(shù)據(jù)庫對核心靶點進行GO 和KEGG 富集分析,得到興安升麻促進皮膚傷口愈合的主要作用通路;并將結(jié)果導入微生信平臺構(gòu)建富集分析結(jié)果圖。
對高分辨質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行分析,通過Proteowizard 軟件將獲得的原始數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成mzXML 格式,利用XCMS 程序包進行峰識別、峰過濾、峰對齊。根據(jù)精確分子量(分子量誤差為≤30 ppm)、保留時間等進行物質(zhì)鑒定,后續(xù)根據(jù)MS/MS 碎片模式對HMDB、METLIN、Massbank、LipidMaps、mzClound、以及帕諾米克自建標準品數(shù)據(jù)庫確認注釋獲得活性物質(zhì),并采用面積歸一化法測定各成分的相對含量。通過數(shù)據(jù)庫篩選并預(yù)測成分、疾病靶點相關(guān)信息,利用Cytoscape3.9.0 軟件、微生信平臺分析篩選結(jié)果并繪圖。SwissTargetPrediction 數(shù)據(jù)庫(http://swisstargetprediction.ch/);SwissADME 數(shù) 據(jù) 庫(http://www.swissadme.ch/);PubChem 數(shù)據(jù)庫(http://pubmed.cn/);UniProt 數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/);GeneCards 數(shù) 據(jù) 庫( https://www.genecards.org/) ;OMIM 數(shù)據(jù)庫(https://www.omim.org/);DrugBank數(shù) 據(jù) 庫(https://go.drugbank.com/);String 數(shù) 據(jù) 庫(https://www.omim.org/);DAVID 數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/);Cytoscape3.9.0 軟件;微生信平臺(http://www.bioinformatics.com.cn/en)。
本研究從興安升麻中共鑒定出125 種化學成分(表1),其中萜類(24.05%)、苯丙素類(23.23%)和酮類(20.61%)化合物占比較高,另外還鑒定到酚類(6.69%)、生物堿類(5.16%)、糖類(3.03%)、醌類(1.98%)、香豆素類(1.60%)和木脂素類(1.01%)等化合物。共有21 種化學成分相對含量大于1%,主要包括隱綠原酸(10.52%)、綠原酸(10.27%)、白術(shù)內(nèi)脂III(8.46%)、莪術(shù)二酮(5.10%)、5-羥甲基糠醛(4.77%)、高車前素(4.73%)等,其中隱綠原酸、綠原酸為苯丙素類化合物,白術(shù)內(nèi)脂III 與莪術(shù)二酮為萜類化合物;升麻屬植物主要生物活性成分為苯丙素類化合物、三萜皂苷或其苷元,以及色酮類、生物堿類、糖類、含氮化合物等[19-21]。多酚類、酮類、生物堿類等部分化合物具有顯著的抗炎功效,能夠在傷口愈合過程中發(fā)揮作用[22-23]。
表1 興安升麻醇提物化學成分Table 1 Chemical compositions of alcohol extracts from Cimicifuga dahurica (Turcz.) Maxim.
對興安升麻活性成分的定性定量分析并不能確切證明其療效,也難以確定發(fā)揮治療功效的有效成分及作用機制,因此基于網(wǎng)絡(luò)藥理學進行靶點篩選及預(yù)測,進而分析其促愈作用機制。
2.2.1 化學成分靶點篩選及預(yù)測結(jié)果 對興安升麻的125 種化學成分進行類藥性篩選,并查閱文獻[24-25],保留可能與“促進皮膚傷口愈合”相關(guān)性較高的化學成分,最終篩選共得到99 種有效成分,并篩選及預(yù)測到860 個目標靶點。
2.2.2 疾病靶點篩選及預(yù)測結(jié)果 以“skin wound”為關(guān)鍵詞,利用GeneCards、OMIM 和DrugBank 數(shù)據(jù)庫分別篩選出622、215 和44 個疾病靶點,經(jīng)整理去重后獲得804 個相關(guān)靶點。
2.2.3 成分-疾病交集靶點篩選結(jié)果 由圖1 可知,興安升麻有效成分靶點與皮膚傷口靶點取交集后共得到159 個交集靶點,其為興安升麻促進皮膚傷口愈合的相關(guān)靶點。
圖1 “成分-疾病”靶點Veen 圖Fig.1 Veen diagram of "component-disease" targets
對興安升麻有效成分進行編碼(表2),將藥物、成分、疾病及靶點關(guān)系導入Cytoscape3.9.0 構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)圖。如圖2 所示,去除相互作用較弱的游離點,圖中共有256 個節(jié)點,粉色箭頭狀節(jié)點代表興安升麻,紫色圓形節(jié)點代表95 種有效成分,綠色箭頭狀節(jié)點代表皮膚傷口,藍色圓形節(jié)點代表159 個靶點;1049條邊代表節(jié)點之間的相互關(guān)系。分析發(fā)現(xiàn),興安升麻中不同的有效成分可作用于一個或多個靶點,說明興安升麻的多成分、多靶點作用于促進皮膚傷口愈合的特性。以Degree 值為判斷標準(Degree 值≥25),前20 種與靶點相關(guān)性較強的興安升麻莖葉有效成分包括:橘皮素、山姜素、5-去甲川陳皮素、高車前素、甘草查爾酮B、內(nèi)華達素、甜橙黃酮、艾黃素、金腰乙素、異澤蘭黃素、異鼠李素、柳穿魚素、大黃素-甲醚、芥子酸、蔓荊子黃素、美迪紫檀素、紫膠桐酸、二氫白藜蘆醇、木蘭花堿、木香內(nèi)酯,這些物質(zhì)大多數(shù)為酮類化合物,還有少量的苯丙素類、生物堿類及酚類化合物。以Degree 值為判斷標準(Degree 值≥18),前20 個與興安升麻莖葉有效成分相關(guān)性較強的靶點包括:CYP19A1、EGFR、MMP13、MMP2、ABCB1、 MMP12、 PTGS2、 MMP9、 TYR、 MET、ALOX5、CYP1B1、ESR1、MMP1、TERT、KDR、SRC、MMP8、F2、AR。其中,EGFR、KDR、F2 靶點可能在此過程中發(fā)揮重要作用。
根據(jù)興安升麻促進皮膚傷口愈合的作用靶點,結(jié)合他們之間的蛋白相互作用,利用Cytoscape3.9.0構(gòu)建交集靶點的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)圖。如圖3a 所示,圖中共有150 個節(jié)點代表不同靶點,1300 條邊代表靶點間的相互關(guān)系,圖中節(jié)點由大到小、顏色由紫到黃代表節(jié)點degree 值逐漸減小。如圖3b 所示,排名前20 的PPI 核心靶點依次為:SRC、STAT3、EGFR、HRAS、TP53、AKT1、MAPK3、CTNNB1、PIK3R1、VEGFA、TNF、PIK3CA、MAPK1、JUN、IL1B、NRAS、MAPK8、RELA、MMP9、PTK2,這些靶點可能在興安升麻促進皮膚傷口愈合靶標網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮重要作用。
圖3 “成分-疾病”PPI 分析網(wǎng)絡(luò)圖(a)和核心靶點網(wǎng)絡(luò)圖(b)Fig.3 Network diagram (a) and core target network diagram (b) of the PPI analysis of ''component-disease''
如圖4 所示,對核心靶點進行GO 富集分析,選取顯著性較強的前15 條相關(guān)聯(lián)術(shù)語做可視化分析,從左到右P值逐漸增大、顯著性逐漸減弱;柱狀圖的長度越長,富集的差異基因數(shù)量越多。
圖4 核心靶點GO 富集分析圖Fig.4 GO enrichment analysis of core targets
結(jié)果表明,在生物過程方面,共有221 條相關(guān)聯(lián)術(shù)語,主要參與蛋白質(zhì)磷酸化的正調(diào)控(positive regulation of protein phosphorylation)、ERBB2 信號通路(ERBB2 signaling pathway)、Fc-ε受體信號通路(Fc-epsilon receptor signaling pathway)、凋亡過程的負調(diào)控(negative regulation of apoptotic process)、表皮生長因子受體信號通路(epidermal growth factor receptor signaling pathway)等過程;在細胞組件方面,共有29 條相關(guān)聯(lián)術(shù)語,主要存在于胞漿(cytosol)、細胞核(nucleus)、粘著斑(focal adhesion)、蛋白質(zhì)復(fù)合物(protein complex)、細胞膜(caveola)等組件中;在分子功能方面,共有44 條相關(guān)聯(lián)術(shù)語,主要涉及相同的蛋白質(zhì)結(jié)合(identical protein binding)、激酶活性(kinase activity)、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合(transcription factor binding)、蛋白磷酸酶結(jié)合(protein phosphatase binding)、酶結(jié)合(enzyme binding)等分子功能。
將核心靶點進行KEGG 通路富集分析,共富集到106 條相關(guān)聯(lián)通路,如圖5 所示,選取顯著性較強的前20 條通路做可視化分析,顏色由粉到藍代表P值逐漸增大、顯著性逐漸減弱;圓形圖越大,富集的差異基因個數(shù)越多。結(jié)果顯示,富集到的相關(guān)信號通路主要包括癌癥中的蛋白多糖(Proteoglycans in cancer)、乙型肝炎(Hepatitis B)、癌癥的途徑(Pathways in cancer)、ErbB 信號通路(ErbB signaling pathway)、丙型肝炎(Hepatitis C)、胰腺癌(Pancreatic cancer)、催乳素信號通路(Prolactin signaling pathway)、子宮內(nèi)膜癌(Endometrial cancer)、前列腺癌(Prostate cancer)、VEGF 信號通路(VEGF signaling pathway)、粘著斑(Focal adhesion)、雌激素信號通路(Estrogen signaling pathway)、TNF 信號通路(TNF signaling pathway)等。認為經(jīng)興安升麻介導后,VEGF、EGFR 和TNF 信號通路可能通過調(diào)控相關(guān)因子和蛋白的表達,在促進皮膚傷口愈合方面發(fā)揮重要作用。
圖5 核心靶點KEGG 富集分析圖Fig.5 KEGG enrichment analysis of core targets
興安升麻在我國資源豐富,種植廣泛,作為一種藥食同源植物在河北地區(qū)深受人們喜愛。前期研究發(fā)現(xiàn),興安升麻能夠有效促進皮膚傷口愈合[14]。皮膚創(chuàng)傷修復(fù)是一項復(fù)雜而精密的動態(tài)過程,利用信號網(wǎng)絡(luò)進行精準的執(zhí)行和調(diào)控;而網(wǎng)絡(luò)藥理學是一個基于信息檢索、數(shù)據(jù)分析及網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建的領(lǐng)域。因此本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學進一步分析了興安升麻對皮膚傷口的促愈機制,發(fā)現(xiàn)興安升麻的多成分、多靶點作用于促進皮膚傷口愈合的特性;其中橘皮素、山姜素、5-去甲川陳皮素等成分可能在促進皮膚傷口愈合過程中發(fā)揮重要作用。已有研究證實以橘皮素為主要多酚物質(zhì)的小花山奈具有抗氧化和抗炎活性,能夠抗皮膚炎癥[26];山姜素能夠有效減輕潰瘍性結(jié)腸炎小鼠腸道炎癥,并改善小鼠腸上皮屏障功能[27];5-去甲川陳皮素也具有抗炎活性,能夠抑制小鼠耳部炎癥的形成及損傷[28]?!八幬?成分-疾病-靶點”分析發(fā)現(xiàn)EGFR、KDR、F2 靶點也在此過程中發(fā)揮重要作用。EGFR 基因提供了制造表皮生長因子受體的受體蛋白的指令,能夠促進細胞的生長繁殖[29];KDR 基因所編碼的蛋白VEGFR-2,是血管生長因子重要信號轉(zhuǎn)導的重要受體,具有調(diào)控血管內(nèi)皮細胞增生、趨化內(nèi)皮細胞和增加血管通透性等功能[30];F2 基因提供了制造凝血酶原的蛋白質(zhì)的指令,對細胞生長和分裂、組織修復(fù)和新血管形成、血液凝固具有重要作用[31]。通過靶點與疾病的相關(guān)分析,認為VEGF、EGFR 和TNF 信號通路可能通過調(diào)控相關(guān)因子和蛋白的表達,在促進皮膚傷口愈合方面發(fā)揮重要作用。VEGF信號通路是調(diào)控心血管生成的重要信號通路,調(diào)控與新血管生成相關(guān)的下游基因,促進血管內(nèi)皮細胞的增殖、遷移、存活,控制心血管的生成,促進皮膚傷口愈合[32-33]。EGFR 信號通路可以促進表皮細胞、成纖維細胞的增殖和其他生長因子的合成,進而加速皮膚傷口表皮的愈合與再生[34-35]。TNF 信號通路通過調(diào)控炎癥因子和相關(guān)蛋白的表達,進而實現(xiàn)傷口清創(chuàng)及愈合[36]。
本研究通過HPLC-MS 檢測興安升麻醇提物的化學成分,從中共鑒定出125 種化學成分,其中包括大量萜類、苯丙素類、酮類、酚類化合物,以及生物堿類、糖類、醌類、香豆素類和木脂素類等化合物,且隱綠原酸、綠原酸、白術(shù)內(nèi)脂III 為含量最高的三種活性成分。進一步基于網(wǎng)絡(luò)藥理學預(yù)測其促愈保護作用,結(jié)果表明興安升麻中的活性成分可作用于一個或多個靶點,EGFR、KDR、F2 等重要靶點及橘皮素、山姜素、5-去甲川陳皮素等活性成分可能在此過程中發(fā)揮重要作用,說明興安升麻多成分、多靶點作用于促進皮膚傷口愈合的特性;經(jīng)興安升麻介導后,VEGF、EGFR 和TNF 信號通路可能通過調(diào)控相關(guān)因子和蛋白的表達,發(fā)揮對皮膚傷口的促愈作用。本研究結(jié)果明確了興安升麻的活性成分,并基于網(wǎng)絡(luò)藥理學分析了其對皮膚傷口的促愈作用機制,為后續(xù)對興安升麻的開發(fā)與應(yīng)用提供理論支撐。