許嘉文
(華東理工大學(xué)魯華生物技術(shù)研究所,上海 200237)
許多植物都可以產(chǎn)生被稱為核糖體蛋白失活蛋白(RIPs)的蛋白毒素,RIPs 的主要功能是作為保護(hù)免受微生物入侵的工具[1]。蓖麻毒素是二型核糖體蛋白失活蛋白的一種,由二硫鍵連接的A 鏈和B 鏈組成。蓖麻毒素被細(xì)胞內(nèi)吞后,絕大多數(shù)內(nèi)化的蓖麻毒素被轉(zhuǎn)運回細(xì)胞表面,剩余部分被運送到溶酶體并被降解,最終只有很小一部分被運輸?shù)礁郀柣w網(wǎng)絡(luò)[2]。而蓖麻毒素A鏈需要穿過細(xì)胞膜,通過逆向轉(zhuǎn)運途徑進(jìn)入胞漿中才能發(fā)揮毒性用,導(dǎo)致細(xì)胞凋亡。因此蛋白毒素在胞內(nèi)的定位是展現(xiàn)其細(xì)胞毒性的關(guān)鍵[3]。研究人員在蛋白質(zhì)末端添加短肽改善其穿膜或定位能力,這種短肽被稱為信號肽。
KDEL 是一種最常見的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位肽,由四個氨基酸殘基組成,通常存在于哺乳動物和植物細(xì)胞中,一般只有在蛋白質(zhì)的C 端才能發(fā)揮蛋白質(zhì)的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位作用。而DEKKMP 是 E3/19K 蛋白的C 端末尾的6 位殘基,同樣也是一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)保留信號。如今更多的新型穿膜肽正在被發(fā)現(xiàn),其中一種很有潛力的穿模肽來自乙型肝炎病毒(HBV)編碼的X 蛋白。Xentry 由X 蛋白中的7 個氨基酸殘基組成,序列為LCLRPVG,該短肽能夠滲透多種癌細(xì)胞系,包括HepG2、H441、BT474[4]。由于許多不同的細(xì)胞類型表達(dá)多配體蛋白聚糖,特別是高水平表達(dá)多配體蛋白聚糖的上皮細(xì)胞,Xentry 可用于將藥物遞送至疾病治療中的組織。[5]
蓖麻毒素作為抗腫瘤藥物,已被研究人員廣泛而深入地研究,其抗腫瘤作用已在許多實驗?zāi)P椭械玫阶C實,如人腫瘤細(xì)胞移植到裸鼠體內(nèi)的實驗[6],但是蓖麻毒素自身對腫瘤細(xì)胞并沒有特異性,使用蓖麻毒素同樣會殺傷正常細(xì)胞。為了解決蓖麻毒素對腫瘤細(xì)胞的特異性問題,近年來蓖麻毒素和其A 鏈被用于合成靶向性腫瘤治療的免疫毒素,并顯示出良好的特異性抗癌活性[7]。
本實驗利用內(nèi)質(zhì)網(wǎng)定位信號肽,使單鏈A 鏈蓖麻毒素在沒有B 鏈的輔助下依舊能夠高效逆向運輸,細(xì)胞內(nèi)化蓖麻毒素后將蓖麻毒素快速引導(dǎo)至內(nèi)質(zhì)網(wǎng),從而增強細(xì)胞毒性。同時利用4D5 scFv 對特定腫瘤細(xì)胞的高特異性,減輕其對正常細(xì)胞的殺傷力。由于蓖麻毒素和4D5 連接后蛋白分子量較大,在細(xì)胞內(nèi)化過程中不易被細(xì)胞攝入,所以在蛋白中插入一段穿膜肽以輔助蛋白毒素的內(nèi)化。通過以上改造,希望構(gòu)建的蛋白毒素能用于臨床腫瘤治療。
使用Snapgene 軟件,依據(jù)PCR 和重疊PCR 的原理設(shè)計引物。
2.2.1 PCR 反應(yīng)
質(zhì)粒pET-28a-SUMO-RTA-KDEL(質(zhì)粒1)、pET-28a-SUMO-RTA-4D5-KDEL(質(zhì)粒2)由實驗室保存,用來作為本實驗的PCR 模板;使用設(shè)計好的引物S1primer,primer2 和質(zhì)粒1 進(jìn)行PCR,獲得SUMO-RTA-KDEL3(RK3)片段;使用設(shè)計好的引物S1primer,primer3 和質(zhì)粒2進(jìn)行PCR,獲得SUMO-RTA-4D5-KDEL3(R4K3)片段;使用設(shè)計好的引物S1primer,primer4 和質(zhì)粒2 進(jìn)行PCR,獲得SUMO-RTA-4D5-DEKKMP(R4D)片段;將上述PCR 反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行核酸電泳驗證,并使用OMEGA 公司的Cycle Pure試劑盒回收PCR 片段。
表1 引物
以質(zhì)粒2 為模板,分別使用設(shè)計好的引物S1primer,primer5 和primer6,primer4 進(jìn)行PCR,獲得SUMO-Xentry和Xentry-RTA-4D5-DEKKMP;對PCR 產(chǎn)物核酸電泳,并用OMEGA 公司的Gel Extraction 試劑盒切膠回收目標(biāo)片段。
以回收的PCR 產(chǎn)物為重疊PCR 模板,加入S1 primer,primer4,PCR獲得SUMO-Xentry-RTA-4D5-DEKKMP(XR4D),進(jìn)行核酸電泳驗證并用OMEGA 公司的Cycle Pure 試劑盒純化。
2.2.2 PCR 產(chǎn)物的連接
將上述所有PCR 產(chǎn)物和pET-28a 用限制性核酸內(nèi)切酶Nco Ⅰ和Xho Ⅰ在37℃下水浴酶切2 小時。使用T4 連接酶將回收的PCR 酶切產(chǎn)物與酶切pET-28a 質(zhì)粒連接,22℃,4h 或16℃過夜。
將由PCR 連接的產(chǎn)物及DH5α 感受態(tài)細(xì)胞冰浴10 min 使其融化。再將10μL 的PCR 連接產(chǎn)物加入DH5α,并繼續(xù)冰浴30min。后迅速以42℃金屬浴熱激90s,并及時放回冰浴,持續(xù)降溫2min。最后加入1mL 的普通LB 培養(yǎng)基,于37℃孵育1h。孵育完成后,4000rpm離心90s,棄去上清,加入150μL 的普通LB 培養(yǎng)基重懸菌體,然后將其涂布在含有卡那抗性的LB 培養(yǎng)基平板上,于37℃搖床倒置,過夜培養(yǎng)。本實驗采取菌落PCR 以及核酸電泳驗證轉(zhuǎn)化結(jié)果,將PCR 產(chǎn)物進(jìn)行核酸電泳,并觀察電泳結(jié)果,若電泳結(jié)果顯示PCR 產(chǎn)物大小與目的片段大小一致,則表明重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化初步成功。將驗證成功的菌液加入0.5mL 的含有卡那霉素的LB培養(yǎng)基中后,置于37℃搖床中培養(yǎng)6h 并測序。使用試劑盒將測序正確的菌液培養(yǎng)并抽提質(zhì)粒,將質(zhì)粒轉(zhuǎn)化入BL21 感受態(tài)細(xì)胞中,獲得重組表達(dá)菌株。
取1.5 mL 菌液分別加入3 個200mL 卡那抗性的LB搖瓶中,37℃搖床中培養(yǎng)4 小時,加入50μL 1M 的IPTG誘導(dǎo),放入18℃搖床中誘導(dǎo)表達(dá),誘導(dǎo)時間為16h~20h左右。
2.5.1 鎳柱純化
誘導(dǎo)表達(dá)結(jié)束后,去除上清LB 培養(yǎng)基,加入40mL PBS 緩沖液重懸菌體,利用超聲破碎儀進(jìn)行細(xì)胞破碎,并取上清倒入干凈的離心管。將上清先通過0.45nm 孔徑的濾膜過濾,然后將上清通過鎳柱使其與鎳柱結(jié)合。分別用50mM、100mM、200mM 以及500mM 濃度的咪唑溶液對鎳柱洗脫,并收集洗脫液。分別將上樣流穿液和各濃度咪唑洗脫液取出30μL,加入10μL4×蛋白上樣緩沖液,制成蛋白樣。SDS-PAGE 電泳檢驗?zāi)繕?biāo)蛋白所在洗脫區(qū)間。
2.5.2 透析、濃縮、SUMO 酶切和再純化
用SUMO 蛋白酶對目的蛋白進(jìn)行酶切,以獲得單獨的RK3、R4K3、R4D 和XR4D 蛋白。蛋白透析液采用20 mM 的PBS 緩沖液,將純化的蛋白裝在透析袋中用夾子夾好,然后放在PBS 緩沖液中進(jìn)行透析。將蛋白通過10kDa 的超濾膜濃縮至10mL,并加入1mL 的SUMO 酶4℃過夜酶切。酶切產(chǎn)物通過鎳柱純化,并進(jìn)行蛋白電泳檢測純化結(jié)果。
采用MTT 法檢測目的蛋白對正常細(xì)胞及SKOV3 腫瘤細(xì)胞的毒性。先將80%鋪板率的細(xì)胞消化,制成單個懸浮的細(xì)胞液,再用血球計數(shù)板計數(shù)10μL 的細(xì)胞液。將細(xì)胞懸浮液稀釋到每1mL 含1×105 個細(xì)胞,每孔100μL 接種到96 孔板上,在37℃、5%CO2的環(huán)境下培養(yǎng)24h,讓細(xì)胞貼壁。細(xì)胞貼壁后,去除孔板中的完全培養(yǎng)基,用維持培養(yǎng)基將蛋白稀釋成不同濃度,加入孔板中培養(yǎng)72h。每孔加入10μL MTT 溶液,再培養(yǎng)4h。棄去上清液,每孔加入100μL 二甲基亞砜,在酶標(biāo)儀上振蕩5min,然后讀取490nm 處的吸光度。然后再棄去上清,每孔加入100μL DMSO 溶液,在酶標(biāo)儀上震蕩5min 后,使用酶標(biāo)儀測定490nm 處的吸光度。
由表2 的實驗結(jié)果可知,RK3 蛋白對H460 細(xì)胞和SKOV3 細(xì)胞有相似的抑制率,RK3 對正常細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞均有一定的殺傷性且對正常細(xì)胞殺傷性略大于腫瘤細(xì)胞。R4K3 蛋白對正常細(xì)胞H460 幾乎沒有殺傷性,但對SKOV3 腫瘤細(xì)胞具有顯著的抑制能力。
表2 不同蛋白對H460 和SKOV3 的細(xì)胞抑制率
R4D 蛋白對正常細(xì)胞H460 幾乎沒有殺傷性,但對SKOV3腫瘤細(xì)胞具有顯著的抑制能力。與R4K3蛋白相比,R4D 蛋白對細(xì)胞的抑制能力基本相同。
XR4D 蛋白對正常細(xì)胞H460 幾乎沒有殺傷性,但對SKOV3 腫瘤細(xì)胞具有顯著的抑制能力。與R4K3 和R4D蛋白相比,R4D 蛋白對細(xì)胞的抑制能力基本相同,但達(dá)到最大抑制效果所需的蛋白濃度有所下降。
4D5 scFv 片段在提高蛋白毒素對腫瘤細(xì)胞的特異性方面有顯著的功效。但同時由于4D5 scFv 片段蛋白較大,可能是導(dǎo)致含有該片段的蛋白毒素相較于RTAKDEL 對腫瘤細(xì)胞殺傷性有所下降的原因。帶有Xentry穿膜肽的蛋白毒素由于其穿膜能力較強,所以達(dá)到最大毒性所需要的蛋白濃度相較沒有穿膜肽的蛋白毒素更低。帶有KDEL3 或DEKKP 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)保留信號肽的蛋白毒素在蛋白毒性上相較于沒有內(nèi)質(zhì)網(wǎng)保留信號肽的RTA蛋白更強,說明內(nèi)質(zhì)網(wǎng)保留信號肽可以增強蓖麻毒素的細(xì)胞毒性。
蓖麻毒素A 鏈?zhǔn)敲庖叨舅氐难芯繜狳c,本實驗通過添加4D5 scFv 片段提高了RTA 蛋白對腫卵巢癌瘤細(xì)胞的特異性,通過添加內(nèi)質(zhì)網(wǎng)保留信號KDEL、KDEL3、DEKKMP 提高了其蛋白毒性,通過添加Xentry 穿膜肽降低了達(dá)到最大細(xì)胞抑制率所需的蛋白濃度。但是DEKKMP 和Xentry 的作用機(jī)理并沒有進(jìn)行深入探究,雖然已有文獻(xiàn)對這兩個信號肽做出機(jī)理的解釋,但都并非是在RTA 蛋白毒素方面的研究。在今后的實驗中,可以嘗試?yán)昧魇郊?xì)胞儀測量細(xì)胞凋亡的早期和晚期比例,同時用激光共聚焦法觀察DEKKMP 和Xentry 影響下的RTA 蛋白在細(xì)胞中的分布,以進(jìn)一步研究其作用機(jī)理。