病毒蛋白調(diào)控逆轉錄元件Ⅰ型長彌散核元件活性的影響及其意義

趙梓含，王宇 綜述，趙一霏，趙可 審校

吉林大學白求恩第一醫(yī)院轉化醫(yī)學研究院艾滋病與病毒研究所，吉林 長春 130061

逆轉錄元件（retroelements）又稱逆轉錄轉座子（retrotransposons），是一類非常特殊的 DNA 元件［1］。這些元件可以經(jīng)由DNA 到RNA 再到DNA 的方式實現(xiàn)自身的復制，以擴增基因組DNA 上的拷貝數(shù)。這些逆轉錄元件在細胞內(nèi)的拷貝數(shù)非常巨大，以一個人二倍體細胞為例，各種逆轉錄元件占據(jù)基因組DNA全部長度的40%以上。這些逆轉錄元件得以擁有大量拷貝數(shù)的一個原因是其在細胞中長期存在。一方面，逆轉錄元件被發(fā)現(xiàn)在動物、植物、甚至原核細胞中廣泛存在［2?3］?？紤]到真核、原核細胞之間在細胞膜組成、細胞內(nèi)容物、基因組DNA 所在空間及形式方面均存在巨大差異，暗示可能早在寒武紀之前，地球上的細胞中可能就已經(jīng)存在逆轉錄元件了。另一方面，基于核酸序列的進化分析表明，其中多數(shù)逆轉錄元件的進化史均達到幾千萬年以上，某些甚至超過6 億年，真正達到了前寒武紀時期［4］。可以說，逆轉錄元件的進化與地球上整個生物圈的進化息息相關；而更重要的是，逆轉錄元件的復制活性通過改變?nèi)旧|(zhì)結構、重排基因組序列、沉默乃至斷裂舊基因、生成新基因等手段，為生物進化提供了重要的源動力［1］。因此，逆轉錄元件是細胞中重要的組成部分。

近年來，越來越多的證據(jù)則表明，逆轉錄元件的復制過程與細胞內(nèi)天然免疫系統(tǒng)的活化水平存在緊密關聯(lián)，后者則在抵御病毒入侵時發(fā)揮重要功能。因此，參與調(diào)控細胞內(nèi)逆轉錄元件活性可能會成為某些病毒間接調(diào)控干擾素表達的方式。本文首先介紹了Ⅰ型長彌散核元件（long interspersed element?1，LINE?1），一種唯一已知可在人體細胞中自主完成復制的逆轉錄元件，綜述了幾種病毒蛋白對LINE?1 活性的影響及其相關機制，并探討了病毒調(diào)控LINE?1活性可能產(chǎn)生的生理學意義，以期為針對相關感染和疾病的藥物研發(fā)提供支持。

1 逆轉錄元件的介紹

1.1 逆轉錄元件LINE?1 轉座是遺傳重組的一種特殊形式，將某些遺傳元件從一個DNA 位點移動至另一個DNA 位點，這些可移動的遺傳元件稱為轉座子［5］。根據(jù)轉座機制和結構特征對轉座子進行分類，可分為 DNA 和 RNA 轉座子［6?7］。其中 RNA 轉座子又被稱為逆轉錄轉座子或逆轉錄元件，其轉座過程是通過一種特殊的“復制?粘貼”模式，即先將DNA轉錄成RNA，再反轉錄成cDNA，然后插入基因組中的某一新位點，且原位置不被剪切［8］。逆轉錄元件又根據(jù)其是否帶有長末端重復序列，進一步細分為長末端重復序列（long terminal repeat，LTR）逆轉錄元件和非LTR逆轉錄元件。

LINE?1是人體細胞中已知唯一一類具有復制活性的、可自主轉座的非LTR 逆轉錄元件。LINE?1 的插入主要發(fā)生在基因組的非編碼區(qū)［9?10］。在人類基因組上，LINE?1 的拷貝數(shù)約50 萬個，占整個基因組的16.9%［11］。但其中絕大部分在基因組中均已失去復制活性，可能是LINE?1 在復制過程中僅能以較低的效率合成出全長的LINE?1 序列，大部分的復制序列均不完整，失去了再次逆轉座的功能。就結果而言，目前單一人體細胞中僅有80 ~ 150 個拷貝是全長且能夠自我復制的 LINE?1［12］。

1.2 LINE?1 的結構功能及其逆轉座機制 LINE?1拷貝全長約6 000 bp，中間包含2 個開放讀框ORF1和ORF2，兩側則分別為具有啟動子功能的5'非編碼區(qū)（5'UTR），以及 1 個帶有 polyA 尾的 3'UTR［13］（圖1A）。ORF1編碼1個大小約40 kD的蛋白，被命名為ORF1p。ORF1p 作為核酸伴侶，可穩(wěn)定新轉錄的LINE?1 RNA［14?15］；ORF2編碼ORF2p，大小約150 kD，提供逆轉錄轉座過程所需的DNA 內(nèi)切酶和逆轉錄酶活性［16］。ORF1p 和 ORF2p 是 LINE?1 逆轉座所必需的兩種蛋白質(zhì)，在翻譯后會與LINE?1 RNA 發(fā)生相互作用，并在其他細胞因子的參與下形成LINE?1 核糖核蛋白復合物（ribonucleoprotein particle，RNP）。LINE?1 RNP 是 LINE?1 發(fā)揮逆轉座活性的基本功能單位［13］。在最近的一項研究中，還發(fā)現(xiàn)LINE?1 RNP可作為內(nèi)源性觸發(fā)器，通過RNA 傳感途徑激活天然免疫系統(tǒng)［17］。

LINE?1 通過靶點介導的逆轉錄過程（target?site primed reverse transcription，TPRT）在基因組中進行復制［18］（圖1 B）。ORF1p保護LINE?1 RNP中的LINE?1 mRNA 免被降解、促進 LINE?1 mRNA 從核糖體上脫離以及輔助 LINE?1 RNP 進入細胞核［14?15］。隨后，LINE?1 RNP 進入細胞核并到達基因組DNA，識別基因組 DNA 中的 TTTTAA 或相似序列，ORF2p 通過其核酸內(nèi)切酶活性識別切割位點5'?TTTT／AA?3'，在A 與T 之間進行剪切，從而產(chǎn)生單鏈DNA 斷裂，暴露出游離的TTTT 序列。這段序列可以與LINE?1?mRNA 上的polyA 序列通過堿基互補的方式結合，然后ORF2p 會利用切口處的TTTT 為引物，以LINE?1 mRNA為模板，逆轉錄產(chǎn)生LINE?1 cDNA。最后以目前尚不清楚的機制整合至基因組，完成逆轉座過程，該過程就是TPRT過程［19?20］。

圖1 LINE?1結構（A）和LINE?1逆轉座復制（B）的示意圖Fig.1 SchematicdiagramofLINE?1structure（A）andLINE?1 retrotransposition cycle（B）

1.3 LINE?1的生物學意義 LINE?1作為人體細胞中唯一具有自主轉座活性的逆轉錄元件，是基因組改變和進化的主要參與者。從LINE?1 的復制過程中對AATTTT 基序的識別可知，在任意單側DNA 鏈上，平均每4 096 個堿基就會包含1 個LINE?1 可識別的位點；且LINE?1 還允許該基序的堿基可以在一定程度上存在變化。相當于LINE?1 在剪切和插入時無論在染色質(zhì)、正反義鏈、還是具體位點的選擇上均是高度隨機的。其可能產(chǎn)生的后果至少包括：①改變基因組結構，如因正反義鏈剪切位置的相近引發(fā)的染色質(zhì)斷裂以及后續(xù)可能產(chǎn)生的重排；②突變基因，如插入蛋白編碼區(qū)從而改變基因的開放閱讀框；③調(diào)節(jié)基因表達，如插入基因上游從而改變相應啟動子的結構和功能。這些結果均可為基因組帶來新的遺傳信息，提供進化的基本動力，在生物進化中具有重要意義。

與此同時，LINE?1 的異常活化也會導致基因組的不穩(wěn)定性，最終引發(fā)多種疾病。1988年的1 例A型血友病是第一個被證實與LINE?1 有關的基因疾病，是由于LINE?1 插入患者X 染色體從而導致血友病發(fā)生［21］。另外，LINE?1 的自主轉座還與癌癥的發(fā)生和發(fā)展密不可分。研究顯示，在多種腫瘤和癌變組織中均發(fā)現(xiàn)了LINE?1表達上調(diào)的證據(jù)，認為LINE?1可能是促進癌癥產(chǎn)生的一個潛在因素［22?23］。通常僅在惡性化程度較高的腫瘤組織中才能檢測出ORF1p的表達，因此，LINE?1 ORF1p 有潛力成為腫瘤惡性程度檢測的分子標志物［24?25］。

LINE?1對免疫系統(tǒng)也具有重要調(diào)控作用。一方面，LINE?1與自身免疫性疾病的發(fā)病相關，會導致系統(tǒng)性紅斑狼瘡、Aicardi?Goutières綜合征（Aicardi?Gou?tières syndrome，AGS）等自身免疫疾病的發(fā)生［26?27］；另一方面，LINE?1 也通過多種途徑引發(fā)細胞的抗病毒天然免疫，由于逆轉錄步驟的存在，LINE?1在復制過程中會同時產(chǎn)生RNA 和DNA，后兩者則會進一步活化細胞內(nèi)的各種RNA 和DNA 感受通路，在調(diào)控固有免疫與適應性免疫中均起到重要作用［28］。LINE?1作為抗病毒免疫反應的內(nèi)源性激活劑，通過環(huán)狀磷酸鳥苷?磷酸腺苷合成酶?干擾素刺激因子（cyc?lic GMP?AMP synthase?stimulator of interferon genes，cGAS?STING）或維甲酸誘導基因蛋白Ⅰ／黑色素瘤分化相關蛋白5?線粒體抗病毒信號蛋白（retinoic acid?inducible protein I／melanoma differentiation?asso?ciated protein 5?mitochondrial antiviral signaling pro?tein，RIG?I／MDA5?MAVS）通路誘導Ⅰ型 IFN 的產(chǎn)生，LINE?1 RNA 激活了IFNβ 介導的固有免疫反應，而后者反過來可以抑制LINE?1［17］。

綜上所述，從最初發(fā)現(xiàn)至今，已有多種人類疾病被歸因于LINE?1介導的逆轉座，因此對于調(diào)控LINE?1活性的研究十分關鍵［29?30］。已經(jīng)有一系列針對宿主抗病毒因子調(diào)控LINE?1活性的研究，如在3'?修復核酸外切酶 1（three?prime repair exonuclease 1，TREX1）基因敲除細胞中，LINE?1活性明顯上調(diào)［31］；一種包含SAM 和HD 結構域的磷酸水解酶蛋白1（SAM and HD domain?containing protein 1，SAMHD1）可通過抑制 LINE?1 ORF2p 的表達來抑制 LINE?1 逆轉座［32］。LINE?1 可激活和調(diào)控細胞的抗病毒天然免疫水平，隨著對LINE?1 活性和細胞IFN 水平的進一步研究，不僅抗病毒因子抑制LINE?1 活性，許多病毒表達的蛋白也參與LINE?1活性的調(diào)控。

2 人類免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus，HIV）蛋白對LINE?1逆轉座活性的影響

艾滋?。ǐ@得性免疫缺陷綜合征，AIDS）被世界衛(wèi)生組織定義為嚴重威脅人類健康的重要疾病之一，是由 HIV 感染導致［33］。HIV 由 2 條長約 9 800 bp完全相同的正義RNA 單鏈構成，其結構除了位于5'和 3'?末端的 LTR 和編碼結構蛋白的gag、pol、env基因外，還包含幾個重疊的讀碼框，分別為tat、rev、nef、vif、vpr、vpu（HIV?2 中的vpx）。這些基因編碼的蛋白對于HIV 在體內(nèi)的感染均是必不可少的，在對抗宿主天然免疫防御的過程中發(fā)揮重要作用［34?35］。而LINE?1 的逆轉座卻會激活天然免疫調(diào)節(jié)，以支持宿主的抗病毒機制。最近的研究發(fā)現(xiàn)，病毒感染會調(diào)節(jié)宿主細胞內(nèi)源性LINE?1的逆轉座水平［36?37］?？紤]到LINE?1的復制可激活細胞內(nèi)IFN 及后續(xù)抗病毒因子的表達，如果HIV 編碼的蛋白具有抑制LINE?1 活性的功能，將是非常合理的。事實上，已經(jīng)有不止一種HIV蛋白被證明是LINE?1調(diào)控因子。

2.1 HIV?1 Nef對LINE?1逆轉座活性的抑制作用

2.1.1 HIV?1 Nef 蛋白的功能 Nef 作為 HIV 蛋白之一，是大小約27 kD 的豆蔻?；亩喙δ艿鞍?，存在于細胞質(zhì)和細胞膜上。此前，人們已知Nef蛋白至少可發(fā)揮4 種功能：①下調(diào)細胞表面CD4 蛋白水平；②下調(diào)細胞表面Ⅰ型組織相容復合物（major histoco?mpatibility class I，MHC?I）水平；③調(diào)控細胞信號傳導及活化［38］；④介導一種抗病毒絲氨酸整合因子（se?rine incorporator，SERINC）家族蛋白的降解［39］。通過這些功能，Nef可顯著提高HIV 子代病毒的產(chǎn)量及對靶細胞的感染性［40］。

2.1.2 HIV?1 Nef通過兩種機制間接抑制LINE?1活性最新研究表明，Nef 還是一種有效的LINE?1 逆轉座的抑制因子［41］。且 Nef 介導的 LINE?1 調(diào)控似乎與上述 4 種功能無關。首先，Nef可抑制 LINE?1 5'UTR 啟動子的活性，降低了LINE?1 RNA逆轉錄和隨后LINE?1蛋白表達的效率。但Nef 并不與LINE?1 5'UTR 發(fā)生直接的接觸。其次，Nef的存在可顯著影響ORF1p與LINE?1 RNA 間的相互作用，從而破壞 LINE?1 RNP的形成或完整性，達到抑制LINE?1 活性的目的。然而，Nef 與 ORF1p 或 LINE?1 RNA 之間同樣不存在結合的現(xiàn)象。表明Nef 對啟動子活性以及RNP 穩(wěn)定性的影響很可能并非特異性的靶向LINE?1，而是具有更廣譜的作用。

研究還發(fā)現(xiàn)，Nef 蛋白序列上第二位的甘氨酸（G2）是其調(diào)控LINE?1 活性所必須的氨基酸殘基［41］。G2 是Nef 蛋白形成豆蔻?；谋匾獨埢?，而豆蔻?；瘎t可以將Nef蛋白插入細胞內(nèi)的各種膜結構上，改變Nef 在細胞內(nèi)的定位。值得注意的是，Nef 調(diào)控LINE?1 活性的兩種機制均需要Nef 形成豆蔻?；慌c之相符的是，G2A突變可嚴重削弱Nef抑制LINE?1復制的能力，同時Nef G2A 突變體也不再能夠有效抑制LINE?1 刺激IFN 產(chǎn)生的現(xiàn)象。結合上述結果，Nef 通過發(fā)生豆蔻酰化將自身定位在細胞內(nèi)的膜結構上，并通過間接機制抑制LINE?1 5'UTR 的啟動子活性并破壞ORF1p與LINE?1 RNA之間的相互作用，最終實現(xiàn)調(diào)控 LINE?1 活性及 LINE?1 介導的固有免疫活化水平。

2.2 HIV?1 Vpr對LINE?1逆轉座活性的抑制作用

2.2.1 HIV?1 Vpr 蛋白功能 Vpr 是 HIV?1 中一種大小約14 kD 的蛋白，通過與HIV 結構蛋白Gag 相互作用被主動包裝進病毒粒子。Vpr 通過不同途徑作用來支持HIV?1 的復制：誘導共濟失調(diào)毛細血管擴張突變基因 Rad3 相關激酶（ataxia?telangiectasia and rRad3?related，ATR）的 DNA 損傷反應（DNA damage response，DDR），從而導致細胞周期停滯在G2 期，進而促進病毒復制；在HIV?1 感染單核細胞衍生的樹突狀細胞（monocyte?derived dendritic cells，MDDC）和巨噬細胞的過程中，如缺乏Vpr，HIV?1 的復制則會減弱［42］。

2.2.2 HIV?1 Vpr抑制LINE?1逆轉座 在之前的報道中，觀察到滯留于G1、S、G2 或 M 期的細胞中LINE?1逆轉座活性被抑制，表明LINE?1 逆轉座需要在正常分裂的細胞中進行。在受阻細胞中，LINE?1 轉錄本的水平普遍顯著減少，轉錄抑制是LINE?1 逆轉座活性減小的主要原因［43］。HIV?1 Vpr 會影響宿主細胞分裂，使宿主細胞周期滯留在G2 或M 期。這似乎與觀察到的Vpr抑制LINE?1復制的現(xiàn)象相吻合。研究發(fā)現(xiàn)，HIV?1 Vpr 并不抑制 LINE?1 的轉錄過程，證明Vpr是在LINE?1完成轉錄后才抑制其活性。表明雖然在停滯的細胞中LINE?1 也可完成轉錄過程，但完整的LINE?1 逆轉座需要在正常分裂的細胞中進行。該研究還發(fā)現(xiàn)，獨立于上述機制之外，Vpr 還可與LINE?1 ORF2p 發(fā)生相互作用并抑制ORF2p 的逆轉錄酶活性。與此同時，與ORF2p的結合還使得Vpr借此附著在LINE?1 RNP上，顯著抑制LINE?1 RNP的功能，進一步抑制LINE?1的逆轉座活性［44］。

2.3 HIV?2 Vpx 對逆轉錄元件 LINE?1 活性的促進作用

2.3.1 HIV?2 Vpx 蛋白功能 Vpx 最早發(fā)現(xiàn)發(fā)現(xiàn)于1988年，是 HIV?2 和某些猴免疫缺陷病毒（simian immunodeficiency virus，SIV）所獨有的［45］。Vpx 通過拮抗宿主限制因子SAMHD1 促進HIV?2 在巨噬細胞、原代CD4+T 細胞和樹突狀細胞等免疫細胞中的復制，并通過不斷增加HIV?2逆轉錄產(chǎn)物cDNA 的積累，突破免疫細胞內(nèi)專有的抗病毒防線［46］。Vpx還是一種天然免疫激活的抑制因子。STING 信號小體通過激活干擾素調(diào)節(jié)因子3（interferon regulatory factor 3，IRF3）或核因子活化 B 細胞 κ 輕鏈增強子（nuclear factor kappa?light?chain?enhancer of activated B cells，NF?κB）來誘導各種天然免疫基因的表達，而Vpx 則可在多種類型的細胞中選擇性地抑制cGAS?STING誘導的NF?κB信號來抑制天然免疫水平［47］。

2.3.2 HIV?2 Vpx 促進 LINE?1 逆轉座活性 目前已有報道認為，Vpx 蛋白可促進LINE?1 的逆轉座活性［48］。此前曾提到，Vpx 通過下調(diào)宿主 SAMHD1 蛋白的表達水平來協(xié)助HIV?2 或SIV 感染巨噬細胞等免疫細胞。作為抗病毒因子的SAMHD1同樣具有調(diào)控 LINE?1 活性的能力。研究證實，SAMHD1 可通過下調(diào)LINE?1 ORF2p 蛋白的表達水平，破壞LINE?1 RNP 的穩(wěn)定性，從而阻斷LINE?1 對基因組的剪切及逆轉錄過程［32］。而通過介導SAMHD1 蛋白的降解，Vpx 也消除了 SAMHD1 對 LINE?1 的抑制，因此間接實現(xiàn)了對LINE?1活性的促進［32］。

近期的研究表明，Vpx 還可能會通過破壞人類中心沉默復合物（the human silencing hub，HUSH）來促進LINE?1 的逆轉座。HUSH 復合物可選擇性地與位于常染色質(zhì)區(qū)域內(nèi)具有復制活性的、全拷貝LINE?1相結合。隨后，HUSH 可通過促進組蛋白H3 發(fā)生K9 位的三甲基化（histone H3K9 trimethylation，H3K9?me3）來沉默LINE?1的轉錄過程，以此限制LINE?1的表達［29］。與此同時，HUSH 還可抑制靈長類免疫缺陷病毒（如HIV?1、HIV?2 和SIV）的逆轉錄。而為了支持病毒的復制，HIV?2 或 SIV 的 Vpx 作為接頭蛋白通過與DDB1和CUL4相關因子1?cullin4A／B（DDB1 and CUL4 associated factor 1?cullin4A／B，DCAF1?CU?L4A／B）E3泛素連接酶相結合的方式，來降解HUSH復合物以增強病毒感染［49?50］。表明對 HUSH 復合物的破壞很可能是Vpx 促進LINE?1 活性的另一種途徑。已有研究顯示，Vpx的表達會導致內(nèi)源性LINE?1 ORF1p表達增強［48］。綜上所述，HIV?2 Vpx確實會促進LINE?1的活性。

3 HBV蛋白對LINE?1活性的影響

3.1 乙型肝炎病毒（hepatitis B virus，HBV）與LINE?1 HBV 感染是引起人類肝細胞癌（hepatocellular carci?noma，HCC）最常見的病因［51］。有研究顯示，LINE?1在肝細胞癌中是一個重要的突變源，可降低體細胞的腫瘤抑制能力［52］。在此基礎上可以推測，如果HBV 可改變LINE?1 的生物學特性，就可能會促進HBV感染的肝細胞病變發(fā)展為肝細胞癌［53］。

有研究發(fā)現(xiàn)，HBV 聚合酶（polymerase，Pol）在調(diào)節(jié)LINE?1 逆轉座方面具有新的功能與活性。HBV Pol 通過與 LINE?1 ORF1p 的相互作用和抑制 LINE?1 5'UTR區(qū)域，來顯著抑制LINE?1逆轉座［54］。另外，還有報道發(fā)現(xiàn)，多種HBV 蛋白均可參與調(diào)節(jié)LINE?1活性，表明LINE?1在HBV 介導的肝細胞癌發(fā)生中起到關鍵作用［52，55］。

3.2 HBx?L1 嵌合轉錄本 HBV 感染的一個關鍵點是將HBV 序列整合至宿主基因組中，這與肝細胞癌的發(fā)生、發(fā)展有直接關系。HBx 是HBV 最重要的整合蛋白［55］，同時與多種宿主因子在腫瘤相關的生物學途徑中密切相關［52］。流行病學研究表明，HBx 是HBV 發(fā)揮作用的核心功能蛋白，其在HBV 感染的肝細胞病變發(fā)展成肝細胞癌的過程中起重要作用［56?57］。最近的測序結果表明，HBV 對于人類基因組的插入并非隨機，其插入位點多位于LINE?1 的重復非編碼序列附近，因此，除直接調(diào)控LINE?1 活性外，HBV 可能還會在其他方面與LINE?1 存在某種關聯(lián)，而HBx極可能是形成這種關聯(lián)的橋梁［53］。

目前有報道發(fā)現(xiàn)，HBx 與 LINE?1 可在基因水平上發(fā)生融合。在HBV 感染過程中，其可將編碼HBx的基因插入至染色體8p11上的LINE?1序列中，產(chǎn)生的HBx?LINE?1 嵌合轉錄本具有致癌性。在對HBV陽性的肝細胞癌細胞株測序時發(fā)現(xiàn)，23.3%的肝細胞癌細胞株中均可檢測到HBx?LINE?1 嵌合轉錄本［52］。Wnt／β?Catenin 信號通路與肝細胞癌的發(fā)生相關［58］。HBx?LINE?1 嵌合轉錄本作為一種長非編碼 RNA 發(fā)揮作用，通過激活 Wnt／β?Catenin 信號通路來促進肝細胞癌的發(fā)展［52］。

4 總結與展望

LINE?1 作為人體細胞中唯一已知具有復制活性，可自主轉座的逆轉錄元件，不僅為基因組提供了進化的動力，同時也由于其造成了基因組的不穩(wěn)定性導致多種疾病的產(chǎn)生。LINE?1對于免疫系統(tǒng)也具有重要意義，其中對細胞的抗病毒天然免疫起到關鍵的激活、調(diào)控作用。本文主要闡述了3 種HIV 蛋白 Nef、Vpr 和 Vpx 對 LINE?1 逆轉座活性的影響，以及 LINE?1 與 HBV 蛋白 HBx 形成的特殊的 HBx?L1 嵌合轉錄本。

HIV?1 Nef 和 Vpr 對 LINE?1 逆轉座活性起抑制作用。Nef 通過抑制LINE?1 5'UTR 啟動子的活性和影響ORF1p 與LINE?1 RNA 間的相互作用來達到抑制LINE?1 活性的目的；Vpr 則通過誘導細胞周期停滯和抑制ORF2p 介導的逆轉錄酶活性來抑制LINE?1 逆轉座。一方面，LINE?1 是激活宿主天然免疫的最基本單位，IFN介導的抗病毒反應又是宿主抵抗病毒感染的核心［59］。IFN 能夠誘導干擾素刺激基因（interferon?stimulated genes，ISGs）的表達，產(chǎn)生多種有效的抗病毒限制因子抑制HIV 復制。表明抑制LINE?1 逆轉座活性即為對細胞內(nèi)IFN 水平的抑制，可以一定程度上幫助HIV 逃避宿主天然免疫的防御。另一方面，如果LINE?1 將新的拷貝插入至整合在宿主基因組的HIV?1 基因中或感染細胞生存所必需的基因中，則可能導致HIV?1 無法產(chǎn)生子代病毒或感染細胞被破壞。因此還可推測，抑制LINE?1 的逆轉座活性相當于限制LINE?1 新拷貝的插入，以保護自己的基因組和感染細胞的基因組免受突變。綜上所述，抑制 LINE?1 逆轉座活性對HIV?1 的復制與傳播起促進作用。

然而HIV的感染過程對LINE?1的活性并非是一個抑制的過程。相反，此前有研究認為，HIV 的感染在總體上對LINE?1 的逆轉座是一個促進的作用［60］。表明HIV對LINE?1活性的影響極可能是一種動態(tài)的過程，同時存在促進和抑制的調(diào)控機制。Vpx 促進LINE?1活性的現(xiàn)象正是這一推論的具體體現(xiàn)。HIV?2 Vpx 通過下調(diào)病毒限制性因子SAMHD1 和HUSH復合物來促進LINE?1逆轉座。推測HIV的某個感染或復制步驟需要LINE?1的參與，或者可以受到LINE?1的促進作用。對這一步驟及相關機制的解析有望提供新的抗HIV 藥物的靶點，對于HIV 的預防及治療具有重要意義。

另外，本文還闡述了HBV 抑制LINE?1逆轉座活性，和 LINE?1 與 HBV 蛋白 HBx 相互作用的形式，即形成了特殊的HBx?LINE?1 嵌合轉錄本。需要特別強調(diào)的是，HBx?LINE?1 無需被翻譯成蛋白，僅以長非編碼RNA的形式即可促進癌癥的發(fā)展。雖然HBx?LINE?1 嵌合轉錄本在肝細胞癌發(fā)生、發(fā)展中的確切作用方式尚需更詳細的探究，但LINE?1 的轉錄調(diào)控可能成為治療HBV 相關肝細胞癌的新突破口，為新的治療方法開辟道路。

綜上所述，病毒蛋白與LINE?1 間的相互作用展現(xiàn)出了多種多樣的生物學活性，其中有些會保護宿主抵御病毒的進一步感染，有些則會引起更嚴重的疾病。未來需要以對病毒蛋白調(diào)控LINE?1 活性的機制進行更多更深入的研究，以消除其中的負面作用并增強正面的保護效果為目標，為針對相關感染和疾病的藥物研發(fā)提供新的分子基礎和作用靶點。

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